BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481065
Length=4298
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G22010.2 | Symbols: RKP | related to KPC1 | chr2:9363109-936... 6804 0.0
> AT2G22010.2 | Symbols: RKP | related to KPC1 | chr2:9363109-9369461
REVERSE LENGTH=5143
Length=5143
Score = 6804 bits (3684), Expect = 0.0
Identities = 4156/4372 (95%), Gaps = 79/4372 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 tctctctctctctctctctTCGAGG-AG--GAAG---aaaaaa-aaGCGAAAAGTCTTCT 53
||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 165 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCGAGGAAGAAGAAGAAAAAAAAAGAAGCGAAAAGTCTTCT 224
Query 54 CCtttttttATTTATTTGAAAAACCCTAACACGAGTCCGCCGTCTTTGGTCTGAAGAATC 113
|| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 225 CC-TGTTTAATTTATTTGAAAAACCCTAGCACAAGTCCGCCGTCTTTGGTTTGAAGAATC 283
Query 114 TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCG-TTTTGATGTCAATTTCTCCGCTTT 172
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 284 TGGGTATTGATTGATTTTGGCTTCTGGGTTAATCGCTTTTCATGTCAATTTCTCCGCTTT 343
Query 173 TCTGAATCATTTTCGAATCGTGTCTGATGAGTTCTTGATG-A-AGATTCAGACTTTGGTT 230
|||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||
Sbjct 344 TCTGAATCATTTTCGAATTGTCTCTGATGAGGTCTCGTTGAATAGATACAGACTTTGGTT 403
Query 231 CTCTTGTAATTGATCAT-TT---A-CGTGTTTGATTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA 285
|||||||||||| | | || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 CTCTTGTAATTGGTTGTGTTGAAAGCGCGTTTGGTTCACAATCAATGCCATATGGCTGAA 463
Query 286 GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464 GACAGCCTACGGGTTGGTATGATTTCATCTGGTTTGGCTGTTTTACTGAATGGTGAAGAT 523
Query 346 GCTAAAGAGAATTCGTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG 405
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 GCTAAAGAAAATTCCTCGAAAGCTCGTATTGTTCCACATTTTGATTATTCTGGTCACCGG 583
Query 406 CCTTTAGAACGGACTATCGAATTTATATTTGGTCTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG 465
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CCTTTAGAACGGACTATCGAATTCATATTTGGTTTAGCAGAAAAGTCGGTTGGTCCATTG 643
Query 466 GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCCGTGATTAAGAATCAGTTTTCGAAGCTT 525
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 644 GATGGTCAAGTAGACAGTAGCTTGATTAGAGCTGTGATTAAGAATCAGTTCTCGAAGCTT 703
Query 526 CATGGTGAATTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT 585
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704 CATGGTGATTTGGATGTTTCAGTTAGTCAGAGAGAAGGAATCAGTGTAGTTCATCATGGT 763
Query 586 GTTGGACCTCCTGTTGTTGGCCTTGAAGAGTATAGCTTATGTGGTGATATCAGGATTGTG 645
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 GTTGGACCTCCTATTGTTGGCCTTGAAGAGTTTAGCATATGTGGTGATATCAGGATTGTG 823
Query 646 AAGCCACCTCTTGTGTTGGAGAGCTTAGCACTATTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT 705
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 AAGCCACCTCTTGTATTGGAGAGCTTAGCACTTTTCAGTAGCGCCAGGGCTAATGCTTGT 883
Query 706 ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 ATTTGGAAAGGAAAATGGATGTATGAAGTCGCTTTAGAGACCTCGGGAATTCAACAACTT 943
Query 766 GGATGGGCAACACTTGCTTGTCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT 825
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 GGATGGGCAACACTTGCTTGCCCTTTCACTGACCAGAAAGGTGTGGGTGATGCTGATGAT 1003
Query 826 TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAGGCTGAACCTTATGGT 885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1004 TCATATGCTTTTGATGGTCGAAGGGTAAGCAAATGGAACAAGGAAGCTGAACCTTATGGT 1063
Query 886 CAATCATGGGTAGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATA 945
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 CAATCATGGGTTGCTGGGGATGTCATCGGTTGCTGCATAGATTTGAACTGTGATGAGATT 1123
Query 946 TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGTGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA 1005
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 TACTTCTACAGGAATGGTGTCTCCCTCGGGGCTGCATTTACTGGTATTAGAAAACTTGGA 1183
Query 1006 CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CCTGGATTTGGGTATTACCCTGCTATATCTCTCTCCCAAGGTGAGAGATGCGAGTTAAAT 1243
Query 1066 TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGAAGGCTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 TTCGGCGCTTACCCGTTTAAGTACCCTGTTGACGGTTTCCAACCTCTTCAAGAAGCTCCA 1303
Query 1126 CCTCGATTTTCTTTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA 1185
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 ACTCGATTTTCATTTGCAACAGAGCTACTACGATGCTTCTCAAGACTGCTGGATAGGCCA 1363
Query 1186 GACCGCTCGTTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCGGTTGAAGAACTC 1245
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 1364 GACCGCTCATTGGCTGATACATTAAGTCGACTGAGGAGATTTGCCTCAGTCGAAGAACTC 1423
Query 1246 TTTTCCCCTGTTTCCTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTACATACTTGAACAAGACCCT 1305
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1424 TTTTGCCCTGTTTCGTCTGCCATATGTGATGAGTTCTTTTATATACTTGAGCAAGACCCT 1483
Query 1306 TTGTTGCCTGAGTACTTGGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGATTTTCAGA 1365
|||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1484 TTGTTGGCGGAGTACTTAGGACGGGGTGCATTTCTGTCATTCCTCTTGGAGACTTTCAGA 1543
Query 1366 TCCCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGCTTCTTGAGTTC 1425
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1544 ACTCAAGCACCGCATGATTCGTCAAGTTTAGACAAAGTTCTTGATGTGTTTCTTGAGTTC 1603
Query 1426 CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1604 CCACAATCTCATTTGATCTTTGAGCATGTAGTAAACGCTCTGGCTTGTGGCTGCAAAACA 1663
Query 1486 GCGACACTGATTCTAACCGAATGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTTGCGCTGGCT 1545
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1664 GCGACACTGATTTTAACCGAGTGTCCATACTCCGGACCTTATCCCTATCTGGCGCTGGCT 1723
Query 1546 TGTCATTTGTTAAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG 1605
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 TGTCATTTGTTTAAACGGGAAGAATTGATGGTACAATGGTGGAGATCTTTGCATTTCGAG 1783
Query 1606 TTTTTGTTTGAAGCTTTCTTGTCATGTAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCAGTTA 1665
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1784 TTTTTGTTTGAAGGTTTCTTGTCATGCAGGAGTTCCAACAAGCATGACTTACAGCACTTA 1843
Query 1666 ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCCACGAGAGTAGCATGGGA 1725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1844 ATGCCTGTTGTTTGGTGGCCTGGATCCTCTGAAGATATATCCTACGAGAGTAGCATGGGA 1903
Query 1726 TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1904 TTTACGATCTCCGCTCTCTCTGAAGCCATTAACAAGATTGAGGAGAAGCAGAGGAACCTC 1963
Query 1786 TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTAACACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCG 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1964 TGTCTCTTGGTCATACAATTCATACCACCTGTATCACCTCCCCAGCTTCCTGGTTCAGCT 2023
Query 1846 TTCCGCGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC 1905
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2024 TTCAGGGGATTCCTACAGAACCTTTTATTGAAGAACAGAGGCGCAGATAGGACTCTGGCC 2083
Query 1906 CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCAGTTCTTGTCTCTCTGTTCTCAGTTATACTCCATTTT 1965
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2084 CCTTCTGGAGTTACACGCAATTCGGTTCTTGTCTCTTTGTTCTCAGTTATACTCCACTTC 2143
Query 1966 TTGTCAGAAGGTTTCGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT 2025
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 TTGTCAGAAGGTTTTGCAATGCTGAAGAGTAGTGAAGCCGTCCATCACAATGTTGGTTTT 2203
Query 2026 CTTCACAGAGGTGGACAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT 2085
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204 CTTCACAGAGGTGGTCAGCAGAAGTTTCCATTGAGTTTGTTTCTTAAAAATGATCCACAT 2263
Query 2086 CGAGCTGATATCACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA 2145
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264 CGCGCTGATATTACTAGGCTTGGCGGGCTATTTAGTCATATATCGAAGTCCTACCCCACA 2323
Query 2146 GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2324 GATGATCAAGAAGAAGAAATAATGCGGTGGGAAGAAGGTTGTATGGATGATGAACAGAAT 2383
Query 2206 AGAGTAACTCACGCGACTGATCAGAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT 2265
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384 AGAGTAACTCACGCGACTGAGCAAAAGCCATGCTGTTGCTTAGCTTATGATACCGATCTT 2443
Query 2266 ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 ACTAAATCCTTGAAGGATCGAGGAAAAAATACTGCTCAAAGTTCTCGTGGTCGATGCAGT 2503
Query 2326 TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCAAGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA 2385
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 TCCATTCCTGAGAGATCCTCTCATGTTGCTGCAGAATGTAGTGCTGGAAGTTTCAGTGAA 2563
Query 2386 GAAATAGAGGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA 2445
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 GAAATAGACGACAAACCTAGCACAAGTAATCAGTCTGACCCTGACTTTGGTTATCGTCCA 2623
Query 2446 GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 GTAAGATTTATGCGGACTGCACTTCAAGAGAGTAGAATCTCATCTGCTATACTAAGCGAA 2683
Query 2506 GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG 2565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684 GAAGAACTATTGGATGCTCTATTGCTATTATACCATATTGCTGTTGCTCCAAATTTTAAG 2743
Query 2566 CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAAACGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT 2625
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2744 CAGGCATCATATTACATGTCTCACCAATCGCAATCAATATCACTTCTTGAAGAAACTGAT 2803
Query 2626 AAACAGATAAGAGAGCGGGCTTCTAGTGACCAATTAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC 2685
|||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804 AAACAGATAAGAGAACGGGCTTCTTGTGACCAAATAAAGCGCTTGAAGGAAGCTCGCAAC 2863
Query 2686 AACTACAAGGAAGACGTGATGGAGTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG 2745
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2864 AACTACAAAGAAGACGTGATGGACTGTGTTAGACATTCCGCATGGTTCCGCATCTCATTG 2923
Query 2746 CTCTCTCGATGGAAGCAAAGAGGAATGTACGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT 2805
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2924 TTCTCTCGATGGAAGCAAAGGGGAATGTATGCATTGTGCATGTGGGTTGTACAGCTACTT 2983
Query 2806 CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACGTTGAATCT 2865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2984 CTGGTTCTCAGCAAAATGGATTCTGTGTTTGTTTATATTCCAGAGTTCTACCTTGAATCT 3043
Query 2866 TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTCCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCCTCAACAACA 2925
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3044 TTGGTAGACTGTTTCCATGTGCTTCGCAAGAGCGATCCTCCGTTTGTCCCATCAACAACA 3103
Query 2926 TTTATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAATGATTCA 2985
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3104 TTCATCAAACAAGGACTTTCATCATTTATCACTTTCGTAGTTACACACTTCAACGATTCA 3163
Query 2986 AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATTTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG 3045
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3164 AGGATATCGAATACAGATCTTAAAGATCTACTTCTCCAGTCAATATCCGTCCTGGTACAG 3223
Query 3046 TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTAAACACATGCCTGCA 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3224 TACAAAGAGTACTTGGAAGCTTTCGAGAACAATGAGGCAGCTACTCGACACATGCCTGCA 3283
Query 3106 GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT 3165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 GCACTACTGGCAGCGTTTGACAACAGATCTTGGATCCCTGTCACAAATATATTTCTTCGT 3343
Query 3166 CTTTGCAAAGGTTCTGGCTTTAGTTCTTTAAAGAACGGGGAGTCTTCGGTTTCATCTACT 3225
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||
Sbjct 3344 CTTTGCAAAGGTTCTGGGTTTAGTTCTTTAAAGAACGGAGAGTCTTCGTTTTCGTCTACT 3403
Query 3226 GTTTTCCAGGTGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTGTCTACTTTT 3285
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3404 GTTTTCCAGGCGCTTCTACGAGATGCTTGTATCAATGATGGTGAATTACTTTCTACTTTT 3463
Query 3286 CTTAACCGGCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATTACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA 3345
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 CTTAACCGTCTATTCAACACACTGAGCTGGACCATCACTGAATTTTCTGTCTCGGTGCGA 3523
Query 3346 GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAACAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT 3405
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 GAAATGCAAGAAAAGTATCAGGTAATGGAGTTTCAGCAAAGGAAATGTTGTGTGATATTT 3583
Query 3406 GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGAGTCTTAGAGTTCTGCACTTACGCAATACCACAAGCA 3465
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3584 GAGCTTTCAAGCAATCTCGCAAGGGTCTTAGAATTCTGCACTTACGCAATGCCACAAGCA 3643
Query 3466 TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTTATCTTG 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3644 TTTCTTGCTGGGACTGACACGAATCTTCGTAGGCTCACTGAGTTGATTCTTTTCATCTTG 3703
Query 3526 AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCT----GTCA---C--TTAGA 3576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 3704 AATCACATGACCTCAGCAGTAGATGACGAGTTCTTTGATCTATCTGTCAGGTCACTTAGA 3763
Query 3577 CGGCAAGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGGTCTTATTAGCTCCTTTGGTGGGT 3636
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3764 CGGCAGGGACAACCTTCAGAGAAAGTTAGCCGAGGGATCTTATTAGCTCCTTTGGTTGGT 3823
Query 3637 ATAATCTTGAATCTTTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCGAAGCAACA---TGATGTA 3693
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3824 ATAATCTTGAATCTCTTGGAGGCTAGTGAAGACTCAAAACCAAAGCAACAACATGATGTA 3883
Query 3694 ATTGGTCTTTTTGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTGTATTACGGGTTTCAATATCTC 3753
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 3884 ATTGGTCTTTTCGCAAGCATGGACTGTCCCGATACAGTCTATTACGGGTTTCAGTATCTC 3943
Query 3754 TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCGTATGTAAAGAAACTTGGA 3813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3944 TTGGAATATAATTGGGACGGTTGTGTAAGCGGGGATGATGCCTATGTAAAGAAACTTGGA 4003
Query 3814 CAACTTGAGAACTTCTTGAACAATCTCATAAACCGGGCGTCATCGCAAGAACCCGAAGGA 3873
|| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 4004 CAGCTTGAGAACTTCTTGAGCCATCTCATAAACCGGGCTTCATCGCAAGAACCCGAAAGA 4063
Query 3874 AAAGAAGAG-CTGTTCAACAAAGACATGACGGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG 3932
||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4064 AAAGAAGAGTCA-TTCAACAAAGACACGACAGATATAGAAGACAACACTTGCTGTATCTG 4122
Query 3933 CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCATGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG 3992
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4123 CTACGCGGGGGAGGCTAATGCAATGATTGCTCCGTGTTCACATCGATCATGTTATGGCTG 4182
Query 3993 CATAACTAGACATCTTCTCAATTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA 4052
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4183 CATAACTAGACATCTTCTCAACTGTCAGAGATGTTTTTTCTGCAATGCTACGGTGATAGA 4242
Query 4053 CGTTATAAGAGACAAAGAAGTAGAAGA---------CGATGATGATCACAAAAGAAGCAC 4103
||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4243 TGTTATAAGAGATAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGACGATGATGGTCACAAAAGAAGCAC 4302
Query 4104 CTGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACA------------------CA--GAAGGAAAGAT 4143
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 4303 ATGAAGCTCGGGTTAGTTGCGGTTACAGGTTGTTGATGTAGTAGACACAGAAGGAAAGAT 4362
Query 4144 CTTTAGGATGGGGAGCAAAGGAAGAAGGATTATAGATTTTTATAGGATAAATAAGAAACA 4203
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
Sbjct 4363 CTTTAGGATGGG-AGCAAAGGAAGAAGGATTATATAGATTTATAGGATAAATAAGAAA-A 4420
Query 4204 AAAAGAAA-AA-CAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAGGACCTGGTCTTGTG-T-T-T---- 4254
|| | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |
Sbjct 4421 AACACAAACAAACAAAGGTCTGTGATAATTTTGTAG-ACCTGGTCTTGTGATCTCTAGGC 4479
Query 4255 -T-T-T-----CTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATGAATTAAAGGCTC 4298
| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4480 CTCTCTTTTTTCTTGTATATATGAGAATGAAATGGAAATTATTTAAAGGCTC 4531
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214263013553
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5