BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481113
Length=2837
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G22530.1 | Symbols: | Alkaline-phosphatase-like family prot... 4167 0.0
> AT2G22530.1 | Symbols: | Alkaline-phosphatase-like family protein
| chr2:9572796-9577441 REVERSE LENGTH=3052
Length=3052
Score = 4167 bits (2256), Expect = 0.0
Identities = 2499/2618 (95%), Gaps = 10/2618 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 225 GGTTATTGATGGGCTTCCTGCGGAGTTCGTTCTTGGGAAAGATGGTAAACCTCCATG-GA 283
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 273 GGTTATTGATGGGCTACCTGCGGAGTTCGTTCTTGGGAAAGATGGTAAACCTCCA-GAGA 331
Query 284 AGGTATGGAAAGAGTCTATGCCTTATACTCAGTCATTGTTGGCTAATGGAGATGCTATTG 343
|||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 332 AGGTTTTGAAAGAGTCTATGCCTTATACTCAGTCACTGTTAGCTAATGGAGATGCTATTG 391
Query 344 GTTACCATGCTAAAGCAGCTCCTCCAACTGTTACAATGCCGAGATTGAAGGCAATGGTTT 403
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||
Sbjct 392 GTTACCATGCTAAAGCAGCTCCTCCAACTGTTACCATGCCGAGGTTAAAGGCAATGGTTT 451
Query 404 CTGGGGCAATTGGTGGTTTCTTGGATGTGGCTTTTAATTTTAACACACAAGCTCTCTTAG 463
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 CTGGGGCAATTGGTGGTTTCTTGGATGTTGCTTTTAATTTTAACACACAAGCTCTCTTAG 511
Query 464 ATGACAACCTTCTTGGTCAATTTTTCAGGATTGGTTGGAAAATGGTGATGCTCGGTGATG 523
|||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 ATGATAATATTCTTGGTCAGTTTTTCAGGATTGGTTGGAAAATGGTGATGCTCGGTGATG 571
Query 524 AGACCTGGCTCAAGTTATTTCCAGGGCTATTTATGAGACATGACGGTGTTAGCAGTTTCT 583
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 AGACGTGGCTCAAGTTATTTCCAGGGCTATTTATGAGACATGACGGTGTTAGCAGTTTCT 631
Query 584 TTGTCAAAGATACAGTACAGGTAGACAGAAATGTTTCTCGACACTTACCCGATGAGCTTA 643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 632 TTGTCAAAGATACAGTACAGGTAGACAGAAATGTTTCTCGACACTTGCCCGATGAGCTAA 691
Query 644 ACAGTGATGACTGGAATCTCTTGATCCTTCATTACCTTGGTTTGGATCACGTTGGACATA 703
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 692 ACAGTGATGATTGGAATCTCTTGATCCTTCATTACCTTGGTTTAGATCACGTTGGACATA 751
Query 704 CTGGCGGCCGTAACAGCCCCTTGATGCCTGCAAAACTAAAAGAAATGGATGATATAGTTA 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 CTGGCGGCCGTAACAGCCCCTTGATGCCTGCAAAACTTAAAGAAATGGATGATATAGTTA 811
Query 764 GAACAATGCATTTAAGAGCCATGATGAATCGCAGCCATGATCAAGGACAGACTCTTCTGA 823
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 GAACAATGCATTTAAGAGCCATGATGGATCGCAGCCATGATCAAGGACAGACTCTTCTGA 871
Query 824 TAATAGTCAGTGATCATGGCATGACTGAGAATGGAAACCACGGAGGGTCTTCATATGAAG 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 872 TAATAGTCAGTGATCATGGCATGACTGAGAATGGAAATCACGGAGGGTCGTCATATGAAG 931
Query 884 AAACTGACTCGTTAATGCTCTTTATTGGCTTTAATAGCAATATTTTTTACTATGCTTCAG 943
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 932 AAACTGACTCCTTAATGCTCTTTATTGGCTTGAATAGCAATATTTCTGACTATGCTTCAG 991
Query 944 CTACCAATAATGTAGCTTTCCAGGTAGATTTGGCGCCAACTTTAGCTCTTCTATTTGGTG 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 CTACCAATAATGTAGCTTTCCAGGTAGATTTGGCGCCAACTTTAGCTCTTCTATTTGGTG 1051
Query 1004 TGCCTATCCCAAAGAACAACGTTGGCGTCCTTGTCCCAGGAACACT-TAGTTCTTTAAGA 1062
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1052 TGCCGATCCCAAAGAACAATGTTGGAGTCCTTGTCCCAGGAACACTCT-GTTCTTTAAGA 1110
Query 1063 GATTTTGAGCAACTACGGGCACTAGAACTGAATTCATGGCAGTTACTCAGACTTATGCAA 1122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1111 GATTTTGAGCAACTACGGGCACTAGAACTGAATTCATGGCAGTTACTCAGACTTATGCTA 1170
Query 1123 GCACAGATACAAAATTCCTCGTTTCCAGGCTTCTCCTGCAATTGCTTCCTTGATGGAACT 1182
||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 GCACAGATACAAAGTTCTTCGTTTCCACGCGTCTCCTGCAATTGCTTCCTTGATGGAACT 1230
Query 1183 TGTGAGGGCCTTGAATTGGATATTAGTGAGTGTTCTGGGGATAAAGAGAAACAACTTATT 1242
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 TGTGAGGGTCTTGATTTGGATATTAGTGAGTGTTCTGGGGATAAAGAGAAACAACTTATT 1290
Query 1243 TGCTTATTTAGGAATGCTGCTGTTCTCCATGGCATTTGGAAGTCCAAGAAATCAACAGAG 1302
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 TGCTTGTTTAGGAATGCTGCTGCCCTCCATGGCATTTGGAAGTCCAAGAAATCAACAGAG 1350
Query 1303 TCGTCTAGTGCCATGGAAGATTTCAGCAGAGCTTTAGATGCATATAACACCTTCTTGAAA 1362
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 TCGTCTAGTACCATGGAAGATTTCAGCAGAGCTTTAGATGCATATAACACCTTCTTGAAA 1410
Query 1363 ACTGCAAGTGAGTGGTTAGCAAGCAAAACCACTGAAAAACCTGTTCTCTTACTCGGTCTT 1422
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 ACTGCAAGTGAGTGGTTAGCAAGCAAAACCACGGAGAAACCTGTTCTCTTACTCGGTCTT 1470
Query 1423 GGAGTGAGTGCCATGCTTATTTCATGCTTCATCTGTGCCACTGTCTTTCTGTCTTTATTC 1482
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1471 GGAGTGAGTGCCATGCTTCTGTCATGCTTCATCTGTGGTACTGTCTTTCTGTCCTTATTC 1530
Query 1483 AAAGATGTTTACCATGAGCCCAAGGATCA-GGTCTGCAGTTTGAGTTATTTGTTGAATTT 1541
||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1531 AAAGAGGTTTACCATGAGCCCAAGGAT-AGGGTCTGCAGTTTGAGTAATTTGTTGAATTT 1589
Query 1542 AGAAGAGATGTTCATTTTTGCTCTTCTTTTGATCCTTGTTATAAGCATGGGATCTAGTTC 1601
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 AGAAGAGGTGTTCATTTTTGCTCTTCTTTTGATACTTGTTATAAGCATGGGATCTAGTTC 1649
Query 1602 AATGGTGGAAGAAGAGCATTATATATGGCATTTCATGGTATCAACATTTTATCTTCTGTT 1661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1650 AATGGTGGAAGAAGAGCATTATATATGGCATTTCATGGTATCAACATTCCATCTTCTGTT 1709
Query 1662 ACTCTTCAAGACAGCAAAGTCATTCAATTTTTCCGAGGGGATGAACATACTCAGAGACTT 1721
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1710 ACTCTTCAAGACAGCGAAGTCATTCAAAATTTCCAAGGGGATGAACATTCTCAGAGACTT 1769
Query 1722 TAAATTCGGTTCTATCTTCTCGCTTCTTATTTCTGGTAGACTACTGAGAGGTTGGCATCA 1781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 TAAATTCGGTTCTATCTTCTCGCTTCTTATTTCTGGTAGACTACTGAGAGGTTGGCATCA 1829
Query 1782 AGGGGGCGTGAACTGGACTTACCTTCCTGATATTTCGAAGTGGCTACAGCAAGCTGGCAG 1841
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1830 AGGGGGCGTGAACTGGACTTACCTTCCTGATATTTCTAAGTGGCTAGTGCAAGGTGGCAG 1889
Query 1842 TGGTTATGTGAAATGGATTCAGCTAATCTCAA-ACTTCCTTGTTATTGTTCTAGGACTAT 1900
|||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1890 TGGTTATGTGAAATGGATTCAGCTAATCTCAATAAT-CCTAGTTATTGGTCTAGGACTAT 1948
Query 1901 ATACTCTCTTTCGAACAGAATCGAATAGAAAAAGTGTTCGCATCCTAGCATTTGGTTTCT 1960
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1949 ATACTCTCTTTCGAACAGGATCGAATAGAAAAGGTGTTCGCATCCTAGCATTTGGTTTCT 2008
Query 1961 CAGCTTGTGGGTTCCTAATCTTGCTGCATGCT-GGGAGATATCAGGATGAAATGTCGACC 2019
|| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2009 CAACTTGTGGGTTCCTAGTCTTGCTGCATG-TAGGGAGATATCAGGATGAACTGTCAACC 2067
Query 2020 GATTTTGGAGCCACTGTCACAGTAAAAGTTATTTATTATCTTCTATCTATATCTGCCATT 2079
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2068 GGTTTTGGAGCCACTGTCACAGTAAAAGTTATTTATTATCTTCTATCTATATCTTCCATT 2127
Query 2080 GGAGCTTCTTTGGTTTTGCCATGGTCTGCGCTAAACAAAGACAAGTCCTTTCTAGCTGAT 2139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 GGAGCTTCTTTGGTTTTGCCATGGTCTGCGCTAAACAAAGACAAGTCCTTTCTAGCTGAA 2187
Query 2140 GTAGGTGATTGCTTGTATTCGATTGGCTCTGCATACATACTTTGTTGGTGTCTTCTACAG 2199
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2188 GTAGGTGATTGCTTGTATTTGATTGGCTCTGCGTACATACTTTGCTGGTGTCTTCTACAG 2247
Query 2200 CTACTTCTCCAACAACCGATCAACTCGGGGCCCATACTTTTGCTGCTCCTCCAAATCTTA 2259
| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 CAACTTCTCCAACAACCAATCAACTCGGGCCCCATACTTTTGCTGCTCCTCCAAATCTTA 2307
Query 2260 GCAATTTTATGTCTTTCTTCTAATGATTTGCAAGTCAACGAATGGGTTGAGATTGCTGCA 2319
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||
Sbjct 2308 GCAATTTTATGTCTTTCTTCTAGTGATTTTCAAGTTAATGAATGGGTCGAGATTACTGCA 2367
Query 2320 CTCTACTACATGGGAATGGCAGGTCACTTTGCTCTTGGAAACAGCAACACTTTAGCGACC 2379
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2368 CTCTATTACATGGGAATGGCAGGTCACTTTGCTCTTGGAAACAGCAACACTTTAGCAACA 2427
Query 2380 ATCGATGTTGCTGGTGCTTTTATCGGAATCTCTAGTCATTCTACAATACTCTCTGGGATA 2439
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2428 ATCGATGTTGCTGGTGCTTTTATCGGAATCTCTAGTCATTCTACAATACTCTCTGGGATC 2487
Query 2440 TTGATGTTCATGATCACCTATGCATCTCCCATGCTGTTCCTTCTATCATTGGTGATGTAC 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 2488 TTGATGTTCATGATCACCTATGCATCTCCCATGCTGTTCCTTCTATCCCTCGTCATGTAC 2547
Query 2500 ATTGGTGCAAAGCTAAGAAACCACTCACACTCAACAATATCAACTCACCCAGAAACGAGT 2559
||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2548 ATTGGTGCAAATCTTAGAAACCACTCAAACTCAACAATATCAACTCACCGGGAAACGAGT 2607
Query 2560 CTTGGACAAATTTTGAAGCTAAAGCTCGGGTTCCCTTGCCTTGTTCCGCTCTGCATCAAC 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2608 CTTGGACAAATTTTGAAGCTAAAGCTCGGGTTCCCTTGCCTTGTTCCGCTCTGCATCAAC 2667
Query 2620 TCAATACTCTTAACCGCATATACTGTCGTCTTGTTACTCATGAGGAATCACCTCTTTGTG 2679
||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2668 TCAATACTCTTGACCGCATATACTGTGGTCTTACTACTCATGAGAAATCACCTCTTTGTA 2727
Query 2680 TGGAGCGTCTTCTCTCCCAAGTACCTATATGTGTGTGCAACCACTCTGTGCACATACATC 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2728 TGGAGCGTCTTCTCTCCCAAGTACCTATATGTGTGTGCAACCACTCTGTGCACATACATC 2787
Query 2740 GGAGTTTGTATAGTCGCTGCTACTGTAACCTACACTTTCTCTGTCACTACCTTCCTTAAA 2799
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2788 GGAGTTTGTATCGTCGCAGCTACTGTAACCTACACTTTCTATGTCACTACCTTCCTTAGA 2847
Query 2800 AGCAATCGCACAAGACACAACAACTCGTAGTTATGGTC 2837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2848 AGCAATCGCACAAGACACAACAACTCGTAGTTATGGTC 2885
Score = 337 bits (182), Expect = 4e-91
Identities = 210/224 (94%), Gaps = 0/224 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 GACGACGGCGATGACTTGTACGAGACTGACGATTTTTACGGTGGCTGGGATATTTCTTCA 62
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||
Sbjct 6 GACGGCGGCGATGACTTGTACGAGACTGACGATATTTACGGTGGCCGGAATATTACTTCA 65
Query 63 GATTATCGGCCTCTCCATTTTTGTATTCGGTTTCTTCCCCGTCAAGCCGACTCTCTCCGG 122
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 GATTATTGGCCTCTCCATTTTCGTATTCGGTTTCTTCCCCGTCAAGCCGACTCTCTCCGG 125
Query 123 TGTCAGTGGCTCGGAGAGCTATCGAGATCCTTTCTGTGATTCTTCTCCGATTTCGAACGA 182
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 126 CGTCAGTGGCTCGGAGAGCTATCGAGATCCATTCTGTGATTCTTCTCTGATTTCGAACGA 185
Query 183 ATCGGAGCTTCATCATCCTGATAAACTGAAATTGCTCTACCAGG 226
|||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||
Sbjct 186 ATCGGAGCTTCATCATCCAGAGAAACTGAGATTGCTGTACCAGG 229
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 140969109830
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5