BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481465
Length=3453
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G26080.1 | Symbols: AtGLDP2, GLDP2 | glycine decarboxylase P... 5090 0.0
AT4G33010.1 | Symbols: AtGLDP1, GLDP1 | glycine decarboxylase P... 3133 0.0
> AT2G26080.1 | Symbols: AtGLDP2, GLDP2 | glycine decarboxylase
P-protein 2 | chr2:11109003-11113828 REVERSE LENGTH=3504
Length=3504
Score = 5090 bits (2756), Expect = 0.0
Identities = 3081/3239 (95%), Gaps = 18/3239 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCTCTCAGATTTGCA--t-ttttttCTT-CTTT-GTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 55
|||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5 CTCTCTCAGATTTGCATTTGTTTTTTTTTGGTTTGGTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 64
Query 56 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCCAAT 115
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 65 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCGAAT 124
Query 116 CCTCTTC-TCTCCCGGCGACGACGGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 174
|||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 CCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 183
Query 175 TTTCTCCATCACCGTCGTGATGTCTCTGGATCGACTTTCACCACCTCCGGTAGAAATCAA 234
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 184 TTTCTCCATCGCCGTCGTGATGTCTCTGGATCGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAA 243
Query 235 CA--A-ACACGATCAATCTCCGTCGATGCGTTAAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGT 291
|| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 CACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGCGTTGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGG 303
Query 292 CACAACTCTGCTACACCGGAGGAACAAACACAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATCAT 351
|||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 304 CACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAGCTCAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATAAT 363
Query 352 CTCAACACGTTGATTGATTCAACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTC 411
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CTCAACACGTTGATTGATTCGACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTT 423
Query 412 TCTGGGAAATTTGATGAAGGATTAACAGAGAGTCAGATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 471
|| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 TCCGGGATATTTGATGAAGGATTAACGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 483
Query 472 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCATTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 531
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 543
Query 532 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATTATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 591
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATAATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 603
Query 592 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGGCTTGAATCTTTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 651
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 663
Query 652 ACTGATCTTACCGGTTTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCT 711
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 ACTGATCTCACCGGTCTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCG 723
Query 712 GCGGAAGCGATGGCTATGTGTAATAATA-TCTTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 770
|||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 GCGGAAGCAATGGCGATGTGTAATAATATTC-TAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 782
Query 771 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACGATTGATGTTTGCAAGACTAGAGCGGATGGTTTCGA 830
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 783 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACTATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGATGGTTTCGA 842
Query 831 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATCTTAAGGATGTGGATTATAGCTCGGGGGATGTGTGTGG 890
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 843 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATATTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGG 902
Query 891 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGTGAAGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 950
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 903 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 962
Query 951 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTGATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACAAT 1010
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 963 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGAT 1022
Query 1011 GTTGAAACCGCCGGGGGAGTTTGGGGCTGATATTGTCGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1070
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 GTTGAAACCGCCGGGTGAGTTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1082
Query 1071 TGTTCCCATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1130
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 TGTTCCGATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1142
Query 1131 GAGAATGATGCCTGGGAGAATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1190
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 GAGAATGATGCCTGGGAGGATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1202
Query 1191 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGTAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1262
Query 1251 CTGTACCGCTCAGGCATTGCTTGCAAACATGACTGCCATGTATGCTGTCTATCATGGACC 1310
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1263 CTGTACCGCTCAGGCCTTGCTTGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACC 1322
Query 1311 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTAGCTGGTGTATTTACTTTAGG 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||
Sbjct 1323 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGG 1382
Query 1371 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1442
Query 1431 TACGGT-TTCGGATGC-ACATGCAATTGTTGATGCGGCTGCCAAAAAAGAGATCAATTTG 1488
||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 1443 TAC-ATGTTCAGATGCAAC-TGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAGGAGATCAATTTG 1500
Query 1489 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGCGTTT-GATGAAACAACCACCTTGGATGA 1547
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGC-TTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGA 1559
Query 1548 TGTCGACAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCCGGCAGGCCGGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1607
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TGTCGATAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1619
Query 1608 TCTCGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCTTCTAGCTTAACAAGACAGAGCCCTTATCT 1667
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1620 TCTTGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCT 1679
Query 1668 GACCCACCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTACTTAGGTACATCCACAA 1727
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1680 GACCCATCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAA 1739
Query 1728 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTAGGATCATGTACAAT 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 1740 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGGATCTTGTACGAT 1799
Query 1788 GAAATTGAATGCCACGACCGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1847
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 GAAATTGAATGCCACCACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1859
Query 1848 CCCTTTTGCTCCTGTAGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACAAACTTGGGTGA 1907
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1860 CCCTTTTGCTCCTGTTGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAATTTGGGTGA 1919
Query 1908 GCTCTTGTGTACTATCACTGGGTTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1967
|||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GCTCTTATGTACGATCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1979
Query 1968 TGGCGAGTATGCCGGGCTCATGGTTATTCGTGCATATCATATGTCAAGAGGAGATCATCA 2027
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1980 TGGCGAGTACGCCGGGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCA 2039
Query 2028 CCGAAATGTATGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCTAT 2087
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2040 CAGAAATGTGTGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCAT 2099
Query 2088 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATTAACATCGAAGA 2147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGA 2159
Query 2148 GTTGAGGAAAGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2207
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 GTTGAGGAACGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2219
Query 2208 GTCAACCCATGGAGTTTATGAAGAGGGTATCGATGAGATTTGCAACATAATTCATGAAAA 2267
|| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TTCCACCCATGGAGTCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAA 2279
Query 2268 TGGAGGCCAAGTTTATATGGACGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGGTTGACAAGCCC 2327
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2280 TGGAGGCCAAGTTTATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCC 2339
Query 2328 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAAACCTTCTGTATCCCTCA 2387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCA 2399
Query 2388 CGGAGGTGGAGGTCCCGGTATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2447
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 CGGAGGTGGAGGTCCCGGAATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2459
Query 2448 ACCTTCTCACCCTGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGTT 2507
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2460 ACCTTCTCACCCAGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGCT 2519
Query 2508 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTAATCTTGCCCATCTCTTATACATA 2567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||
Sbjct 2520 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTA 2579
Query 2568 CATTGCCATGATGGGATCTGGGGGACTCACAGACGCCTCAAAGATCGCAATTTTGAATGC 2627
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2580 CATTGCCATGATGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGC 2639
Query 2628 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTATTCCGTGGTGTCAATGG 2687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2640 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGG 2699
Query 2688 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2759
Query 2748 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGGCTGATGGATTATGGGTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2807
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2819
Query 2808 GCCTGTCCCTGGAACACTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2867
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 GCCTGTCCCTGGAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2879
Query 2868 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGACGAAATTTCCCAGATTGAGAAAGGAAA 2927
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2880 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAA 2939
Query 2928 CGCAGATCCTAACAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCTCCTTCATTGCTGATGGC 2987
||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2940 CGCAGATCCAAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGC 2999
Query 2988 AGACACATGGAAAAAGCCGTATTCCCGTGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3047
||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3000 AGATACATGGAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3059
Query 3048 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGCGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3107
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3119
Query 3108 GGTGTGTACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCCGCAGTGTCTGCTTAAAT 3167
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3120 GGTGTGCACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTTAAAT 3179
Query 3168 TAAGCCACTATAAAGCGATTTGCACTCGCACCAGAAGCCACAATGAAGCGATTCGGACT 3226
|||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3180 GAAGCCACTATGAAGCGATTCGCACTCGCACCAAAACCCACAATGGGGCGATTCGGACT 3238
Score = 327 bits (177), Expect = 3e-88
Identities = 212/229 (93%), Gaps = 1/229 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3226 TTTACTTCTCTTCCCAGTCTCATCATCACTTTCACTTTCATTTCCTGTACAATGTACATA 3285
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3272 TTTACTTCTCTTCCCAGCCTCATCATCACTTTCACTTTCACTTCCTGTACAATGTACATA 3331
Query 3286 CGTAGTCCTAAGTTCT-CCCTCATTTATCTAATAATTTACATTTCTATATATTCCACTTT 3344
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3332 CGTAGTCCTAAGTTCTTCCCTCATTTATTTAATAAAATACATTTCTTTATGTTCCACTTT 3391
Query 3345 CTTTTACTTTTAACATTCGATTCGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGACA 3404
||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3392 CTTATACGTATAACATTCCATTTGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGCCA 3451
Query 3405 TATGGTCTCTTTGGAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTGTTGTTTCA 3453
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3452 TATGATCTCTTTGAAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTATTGTTTCA 3500
> AT4G33010.1 | Symbols: AtGLDP1, GLDP1 | glycine decarboxylase
P-protein 1 | chr4:15926670-15931332 REVERSE LENGTH=3478
Length=3478
Score = 3133 bits (1696), Expect = 0.0
Identities = 2688/3163 (85%), Gaps = 84/3163 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 34 ATGGAGCGTGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACA 93
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 183 ATGGAGCGCGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAAACGTCTCGTTAACGACACA 242
Query 94 AAACGCCACCGTAACGGC-CAATCCTCTTCTCTCC-CG-GCGACGACGGTTACTCCCTCA 150
||||| ||||||||| || || | | ||| || | | | || | |||| |
Sbjct 243 AAACGACACCGTAAC-GCTGAA-ACAC--CTCACCTTGTTCCTC-AC-G---CTCCGGCG 293
Query 151 AGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC-TT--TCTCCATCACCGTCGTGATGTCTCTGGATCG 207
||||||||||| ||| | ||| || || |||||| | || || || ||| | ||
Sbjct 294 AGGTATGTCTCTTCCCTTTCC-CCTTTCATCTCCA-C-CCCTC--GA----TCT-G-TCA 342
Query 208 ACTTTCAC--C-ACCTCCGGTAGAAATCAACAAACACGATCAATCTCCGTCGATGC-GTT 263
|| ||| | | | ||| || | || || || || || |||||||||||||| |||
Sbjct 343 AC-CACACGGCGGCTTTCGGGAGGCACCAGCAGACGCGTTCCATCTCCGTCGATGCTGTT 401
Query 264 AAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGTCACAACTCTGCTACACCGGAGGAACAAACACA 323
||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||
Sbjct 402 AAA-CCCAGCGATACTTTCCCTCGTCGTCACAACTCTGCAACACCAGACGAACAAACCCA 460
Query 324 GATGGC-GAATTACTGCGGATTCGATCATCTC-A-ACACGTTGATTGATTCAACTGTTCC 380
||||| |||| ||| || || || ||| || | ||| | || ||| | || || ||
Sbjct 461 CATGGCTAAATT-CTGTGGCTTTGACCATATCGATTCAC--TCATCGATGCTACGGTGCC 517
Query 381 GAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTCTCTGGGAAATTTGATGAAGGATTAACAGA 440
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||| ||
Sbjct 518 CAAATCGATTCGATTAGATTCCATGAAGTTCTC---CAAATTCGACGCTGGTTTAACCGA 574
Query 441 GAGTCAGATGATTGAGCATATGAG-TGATTTAGCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCAT 499
||| || |||||| | || ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 575 GAGCCAAATGATTCAACACATG-GTTGATTTAGCTTCCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCT 633
Query 500 TCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTTCCTCCTGTGATTTTGCGTAATATTATGG 559
|||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| || ||||
Sbjct 634 TCATCGGGATGGGTTACTACAACACTCATGTCCCTACTGTCATTCTCCGTAACATCATGG 693
Query 560 AGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCTTATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGGC 619
||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |
Sbjct 694 AGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATCAAGCTGAGATCTCTCAAGGTCGTC 753
Query 620 TTGAATCTTTGCTCAATTACCAGACGGTTATTACTGATCTTACCGGT-TTACCGATGTCG 678
| ||||| | ||||||| |||||| || || || ||||| || ||| || || |||||
Sbjct 754 TCGAATCGCTCCTCAATTTCCAGACCGTGATCACAGATCTCACGGGTCTT-CCTATGTCC 812
Query 679 AACGCTTCG-TTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCTGCGGAAGCGATGGCTATGTGTAATAA 737
|| || ||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||
Sbjct 813 AATGCGTCGCTT-CTGGATGAAGGCACTGCTGCTGCGGAGGCAATGGCCATGTGTAACAA 871
Query 738 TA-TCTTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTATTGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACGA 796
| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 872 CATTCTT-AAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTCATTGCTAGTAACTGTCACCCTCAGACTA 930
Query 797 TTGATGTTTGCAAGACTAGAGCGGAT-GGTTTCGATTTGAAAGTTGTGACGGT-TGATCT 854
|||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 931 TTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTT-GATTTGAAAGTTGTCAC-CTCTGATCT 988
Query 855 TAAGGATGTGGATTATAGCTCGGGGGATGTGTGTGGAG-TGTTGGTTCAGTATCCGGGGA 913
||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| | | || ||||||||||| || |
Sbjct 989 TAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTCTT-GTTCAGTATCCTGGTA 1047
Query 914 CTGAAGGTGAAGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTTA 973
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 CTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTTA 1107
Query 974 AGGTTGTGATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACAATGTTGAAACCGCCGGGGGAGTTTG 1033
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || || ||||
Sbjct 1108 AGGTTGTGATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACTGTGTTGAAACCTCCTGGAGAATTTG 1167
Query 1034 GGGCTGATATTGTCGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGGTGTTCCCATGGGTTATGGTGGTC 1093
|||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1168 GGGCGGATATTGTTGTTGGCTCTGCTCAAAGGTTTGGTGTTCCGATGGGTTATGGTGGTC 1227
Query 1094 CTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGAATTA 1153
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1228 CTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGATTA 1287
Query 1154 TTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTTGCGTATGGCTATGCAGACTAGGG 1213
||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1288 TTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTATGGCTATGCAGACTAGAG 1347
Query 1214 AACAGCATATCCGTAGGGATAAAGCTACCAGCAACATCTGTACCGCTCAGGCATTGCTTG 1273
|||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 1348 AACAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTACTGCTCAAGCGTTGCTTG 1407
Query 1274 CAAACATGACTGCCATGTATGCTGTCTATCATGGACCAGAAGG-CTTAAAATCTATTGCA 1332
| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||||||||||
Sbjct 1408 CCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAGGTCT-AAAATCTATTGCC 1466
Query 1333 CAACGGGTTCATGGTCTAGCTGGTGTATTTACTTTAGGATTGAAGAAACT-GGGAACTGC 1391
|| || || |||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || || ||| |||
Sbjct 1467 CAGCGTGTCCATGGTCTCGCTGGTATATTTTCCTTAGGGTTGAACAAGCTTGGGGT-TGC 1525
Query 1392 ACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGTTACG-GTTTCGGATGCACATG 1450
| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||
Sbjct 1526 AGAAGTTCAAGAACTTCCTTTCTTTGACACTGTTAAAATTAAGTGTT-CGGATGCACATG 1584
Query 1451 CAATTGTTGATGCGGCTGCCAAAAAAGAGATCAATTTGCGTCTTGTGGACTCCAAC-ACT 1509
|||||| |||||| ||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||| ||| |||
Sbjct 1585 CAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTGTGGACTC-AACCACT 1643
Query 1510 ATTACTG-TTGCGTTTGATGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACAAACTTTTTGAAGT 1568
||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1644 ATTACTGCTTCC-TTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTTCAAAGT 1702
Query 1569 TTTTGCTTCCGGCAGGCCGGTTCAATTCACGGCTGAGTCTCTCGCACCGGAGTTTAACAA 1628
||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct 1703 TTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCACCCGAGGTTCAGAA 1762
Query 1629 TGCTATTCCTTCTAGCTTAACAAGACAGAGCCCTTATCTGACCCACCCAATCTTCAACAT 1688
| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1763 TTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACCCAATCTTCAACAT 1822
Query 1689 GTACCACACGGAGCATGAGTTACTTAGGTACATCCACAAGTTACAAAATAAAG-ATCTAT 1747
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1823 GTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGTC-AAAGGATCTAT 1881
Query 1748 CATTGTGCCACAGCATGATTCCACTAGGATCATGTACAATGAAATTGAATGCCACGACCG 1807
|| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| | ||||| || || |
Sbjct 1882 CACTGTGCCACAGCATGATTCCGTTGGGATCTTGTACGATGAAACTAAATGCAACAACTG 1941
Query 1808 AAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCACCCTTTTGCTCCTGTAGAAC 1867
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1942 AAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACTGACATTCACCCTTTTGCTCCTGTTGAAC 2001
Query 1868 AAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTT-ACAAACTTGGGTGAGCTCTTGTGTACTATCACT 1926
|||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2002 AAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGA-AAATTTGGGTGACCTCTTGTGTACGATCACT 2060
Query 1927 GGGTTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGCTGGCGAGTATGCCGGGCTC 1986
||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2061 GGGTTTGACTCTTTCTCGTTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGTATGCCGGGCTT 2120
Query 1987 ATGGTTATTCGTGCATATCATATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATGTATGCATCATA 2046
|||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 2121 ATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGTAATGTGTGTATCATA 2180
Query 2047 CCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCTATGTGCGGAATGAAAATTGTT 2106
||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 2181 CCTGTCTCTGCACACGGTACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGGATGAAAATTATT 2240
Query 2107 GCCGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATTAACATCGAAGAGTTGAGGAAAGCCGCCGAA 2166
| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |||
Sbjct 2241 ACAGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATTAACATTGAGGAGGTGAGAAAAGCTGCAGAA 2300
Query 2167 GCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCCGTCAACCCATGGAGTTTAT 2226
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct 2301 GCCAACAAAGACAACTTAGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAGTCTAT 2360
Query 2227 GAAGAGGGTATCGATGAGATTTGCAACATAATTCATGAAAATGGAGGCCAAGTTTATATG 2286
|||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 2361 GAAGAGGGCATCGACGAGATTTGCAACATAATACACGAAAATGGAGGTCAAGTGTACATG 2420
Query 2287 GACGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGGTTGACAAGCCCTGGTTTTATTGGAGCGGAT 2346
|| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACGAGCCCTGGTTTTATTGGAGCGGAT 2480
Query 2347 GTTTGCCATCTCAATCTCCACAAAACCTTCTGTATCCCTCACGGAGGTGGAGGTCCCGGT 2406
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||
Sbjct 2481 GTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGTCCTGGT 2540
Query 2407 ATGGG-CCCTATCGGTGTGAAGCAA-CATTTGGCTCCATTCCTACCTTCTCACCCTGTGA 2464
||||| ||| || ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 2541 ATGGGTCCC-ATTGGTGTGAAG-AATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTCACCCCGTGA 2598
Query 2465 TACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGTTGGGAACCATTTCTGCAG 2524
|||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| | || || || |
Sbjct 2599 TACCGACTGGTGGTATCCCACAACCCGAGAAGACAGCACCTTTGGGTGCAATATCCGCTG 2658
Query 2525 CACCATGGGGGTCTGCGCTAATCTTGCCCATCTCTTATACATACATTGCCATGATGGGAT 2584
|||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2659 CACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCTATATCTTATACTTACATTGCCATGATGGGAT 2718
Query 2585 CTGG-GGGACTCACAGACGCCTCAAAGATCGCAATTTTGAATGCTAACTACATGGCAAAG 2643
|||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2719 CTGGTGGG-CTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACATGGCAAAG 2777
Query 2644 CGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTATTCCGTGGTGTCAATGGAACAGTCGCTCACGAA 2703
|| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||
Sbjct 2778 CGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAACGGAACAGTAGCACACGAA 2837
Query 2704 TTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGAACCAGAGGATGTGGCC 2763
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2838 TTCATCATAGACTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAACCAGAGGATGTGGCG 2897
Query 2764 AAACGGCTGATGGATTATGGGTTCCATGGACCGACAATGTCTTGGCCTGTCCCTGGAACA 2823
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 AAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCCCTGGAACT 2957
Query 2824 CTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGATAGGTTCTGTGATGCT 2883
|||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||
Sbjct 2958 CTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCTGCGATGCT 3017
Query 2884 CTCATCTCGATCAGGGACGAAATTTCCCAGATTGAGAAAGGAAACGCAGAT--CCTAACA 2941
||||| || |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||| || | |
Sbjct 3018 CTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCC-AG-A 3075
Query 2942 ACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCTCCTTCATTGCTGATGGCAGACACATGGAAAA 3001
|||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3076 ACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCCCCATCGTTGCTAATGGCAGACACATGGAAAA 3135
Query 3002 AGCCGTATTCCCGTGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCGCTCCTCCAAGTTCT 3061
|||||||||| || || || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3136 AGCCGTATTCTCGAGAGTATGCTGCTTTCCCTGCGCCTTGGCTCCGCTCCTCCAAGTTCT 3195
Query 3062 GGCCCACTACAGGGCGCGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCTGGTGTGTACTCTCC 3121
||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||
Sbjct 3196 GGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGCACTCTCC 3255
Query 3122 AACCGGCGAACGAAGAACAGG-CTGCAGCCGCAGTGTCTGCTT 3163
|| | | |||||||| | | ||||| |||||||||||||
Sbjct 3256 TCCCAGAG---GAAGAACAAGTC-GCAGCTGCAGTGTCTGCTT 3294
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 171871946718
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5