BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481491
Length=3152
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G26330.1 | Symbols: ER, QRP1 | Leucine-rich receptor-like pr... 4935 0.0
> AT2G26330.1 | Symbols: ER, QRP1 | Leucine-rich receptor-like
protein kinase family protein | chr2:11208183-11213971 REVERSE
LENGTH=3191
Length=3191
Score = 4935 bits (2672), Expect = 0.0
Identities = 2984/3134 (95%), Gaps = 23/3134 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 30 AAAACGCAGTCGTTTTGAGACTGTGTCTGAGAGAAAATGGCTCTGTTTCGAGATGTTGTT 89
|||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 44 AAAACGCAGTCGTTTTAAGACTGTG--TGTGAG-AAATGGCTCTGTTTAGAGATATTGTT 100
Query 90 CTT-TTGGGTTTTCT-TATCTGTTTGAGCTTAGTGGCTACTGTGAATTCTGACGAGGGAG 147
||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||
Sbjct 101 CTTCTTGGG-TTTCTCT-TCTGCTTGAGCTTAGTAGCTACTGTGACTTCAGAGGAGGGAG 158
Query 148 CAACGTTGCTGGAGATTAAGAAGTCATTCAAAGATGTAAACAATGTTCTTTATGACTGGA 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 159 CAACGTTGCTGGAGATTAAGAAGTCATTCAAAGATGTGAACAATGTTCTTTATGACTGGA 218
Query 208 CAGCTTCACCTTCTTCCGACTATTGTGTCTGGAGAGGTGTGACTTGTGAAAATGTCACCT 267
|| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 219 CAACTTCACCTTCTTCGGATTATTGTGTCTGGAGAGGTGTGTCTTGTGAAAATGTCACCT 278
Query 268 TCAATGTTGTTGCTCTTAATTTGTCAGATTTGAATCTTGATGGAGAAATCTCACCTGCTA 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 279 TCAATGTTGTTGCTCTTAATTTGTCAGATTTGAATCTTGATGGAGAAATCTCACCTGCTA 338
Query 328 TTGGAGATCTCAAGAGTCTCTTGTCAATTGATCTGCGAGGTAATCGTTTGTCTGGGCAAA 387
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 339 TTGGAGATCTCAAGAGTCTCTTGTCAATTGATCTGCGAGGTAATCGCTTGTCTGGACAAA 398
Query 388 TCCCTGATGAGATTGGAGACTGTTCTTCTTTGCAAAACTTGGACTTGTCCTTCAATGAAT 447
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 399 TCCCTGATGAGATTGGTGACTGTTCTTCTTTGCAAAACTTAGACTTATCCTTCAATGAAT 458
Query 448 TAAGTGGTGATATACCGTTTTCGATTTCGAAGTTGAAGCAACTTGAGCAGCTGATTCTGA 507
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459 TAAGTGGTGACATACCGTTTTCGATTTCGAAGTTGAAGCAACTTGAGCAGCTGATTCTGA 518
Query 508 AGAATAACCAATTGATAGGACCAATCCCTTCAACGCTTTCGCAGATTCCAAACCTGAAAA 567
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAATAACCAATTGATAGGACCGATCCCTTCAACACTTTCACAGATTCCAAACCTGAAAA 578
Query 568 TTCTGGACCTGGCACAGAATAAACTCAGTGGTGAGATACCAAGACTTATATACTGGAATG 627
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 579 TTCTGGACTTGGCACAGAATAAACTCAGTGGTGAGATACCAAGACTTATTTACTGGAATG 638
Query 628 AAGTTCTTCAGTATCTTGGGTTGCGAGGAAACAACTTGGTCGGTAACATTTCTCCAGATT 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 AAGTTCTTCAGTATCTTGGGTTGCGAGGAAACAACTTAGTCGGTAACATTTCTCCAGATT 698
Query 688 TGTGTCAGCTGACAGGTCTTTGGTATTTTGACGTGAGAAACAACAGTTTGACGGGTAGTA 747
||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 699 TGTGTCAACTGACTGGTCTTTGGTATTTTGACGTAAGAAACAACAGTTTGACTGGTAGTA 758
Query 748 TCCCTGAGACGATAGGAAATTGCACTGCCTTCCAGGTTTTGGACTTGTCCTACAATCAGC 807
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 TACCTGAGACGATAGGAAATTGCACTGCCTTCCAGGTTTTGGACTTGTCCTACAATCAGC 818
Query 808 TAACTGGTGAGATCCCATTTGACATCGGCTTCCTTCAAGTTGCAACATTATCATTGCAAG 867
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 819 TAACTGGTGAGATCCCTTTTGACATCGGCTTCCTGCAAGTTGCAACATTATCATTGCAAG 878
Query 868 GCAATCAGCTTTCTGGGAAGATTCCATCAGTGATTGGTCTCATGCAAGCCCTTGCAGTGT 927
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 879 GCAATCAACTCTCTGGGAAGATTCCATCAGTGATTGGTCTCATGCAAGCCCTTGCAGTCT 938
Query 928 TAGATCTAAGTGGCAACTTGTTGAGTGGACCTATTCCTCCGATTTTGGGAAATCTGACTT 987
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||
Sbjct 939 TAGATCTAAGTGGCAACTTGTTGAGTGGATCTATTCCTCCGATTCTCGGAAATCTTACTT 998
Query 988 TCACCGAGAAATTGTATTTGCACAGTAACAAGCTGACTGGTTCAATTCCACCTGAGCTTG 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 999 TCACCGAGAAATTGTATTTGCACAGTAACAAGCTGACTGGTTCAATTCCACCTGAGCTTG 1058
Query 1048 GAAACATGTCAAAACTCCATTACCTGGAACTCAACGATAATCATCTCACGGGTCATATAC 1107
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059 GAAACATGTCAAAACTCCATTACCTGGAACTCAATGATAATCATCTCACGGGTCATATAC 1118
Query 1108 CACCGGAGCTTGGGAAGCTTACTGACTTGTTTGATCTGAATGTGGCCAACAATGATCTAG 1167
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1119 CACCAGAGCTTGGGAAGCTTACTGACTTGTTTGATCTGAATGTGGCCAACAATGATCTGG 1178
Query 1168 AAGGACCTATACCTGATCATCTGAGCTCCTGCACAAACCTAAATAGCTTAAATGTTCACG 1227
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1179 AAGGACCTATACCTGATCATCTGAGCTCTTGCACAAATCTAAACAGCTTAAATGTTCATG 1238
Query 1228 GGAACAAGTTTAGCGGCACCATACCTCGAGCATTTCAAAAGCTAGAGAGCATGACTTACC 1287
||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1239 GGAACAAGTTTAGTGGCACTATACCCCGAGCATTTCAAAAGCTAGAAAGTATGACTTACC 1298
Query 1288 TTAATCTGTCCAACAACAATATCAAAGGTCCAATCCCGGTTGAGCTATCTCGTATCGGTA 1347
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 TTAATCTGTCCAGCAACAATATCAAAGGTCCAATCCCGGTTGAGCTATCTCGTATCGGTA 1358
Query 1348 ACTTAGATACATTGGATCTTTCCAACAACAAGATAAATGGCATCATTCCTTCTTCCCTTG 1407
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1359 ACTTAGATACATTGGATCTTTCCAACAACAAGATAAATGGAATCATTCCTTCTTCCCTTG 1418
Query 1408 GTGATTTGGAGCATCTTCTCAAGATGAACTTGAGCAGAAATCATATAACCGGTGTAGTTC 1467
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1419 GTGATTTGGAGCATCTTCTCAAGATGAACTTGAGTAGAAATCATATAACTGGTGTAGTTC 1478
Query 1468 CAGGCGACTTTGGAAATCTAAGAAGCATCATGGAAATAGATCTTTCAAATAATGATATCT 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 CAGGCGACTTTGGAAATCTAAGAAGCATCATGGAAATAGATCTTTCAAATAATGATATCT 1538
Query 1528 CGGGCCCAATTCCAGAAGAGCTTAACCAATTGCAGAATATTGTTTTGCTGAGACTGGAAA 1587
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1539 CTGGCCCAATTCCAGAAGAGCTTAACCAATTACAGAACATAATTTTGCTGAGACTGGAAA 1598
Query 1588 ATAATAACTTAACTGGTAATGTTGGTTCATTAGCCAACTGCCTCAGCCTGACTGTATTGA 1647
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 1599 ATAATAACCTGACTGGTAATGTTGGTTCATTAGCCAACTGTCTCAGTCTCACTGTATTGA 1658
Query 1648 ATGTATCTCACAACAACCTTGTAGGCGATATCCCTAAGAACAATAACTTTTCAAGATTTT 1707
|||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1659 ATGTATCTCATAACAACCTCGTAGGTGATATCCCTAAGAACAATAACTTCTCAAGATTTT 1718
Query 1708 CACCAGACAGCTTCATTGGCAATCCTGGTCTTTGCGGTAGTTGGCTAAACTCACCCTGTC 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1719 CACCAGACAGCTTCATTGGCAATCCTGGTCTTTGCGGTAGTTGGCTAAACTCACCGTGTC 1778
Query 1768 ATGATTCTCGTCCAACTGTACGAGTGTCAATCTCTAGAGCAGCTATTCTTGGAATAGCTA 1827
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779 ATGATTCTCGTCGAACTGTACGAGTGTCAATCTCTAGAGCAGCTATTCTTGGAATAGCTA 1838
Query 1828 TTGGGGGACTTGTGATCCTTCTCATGGTCTTAATAGCAGCTTGTCGGCCGCATAATCCTC 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1839 TTGGGGGACTTGTGATCCTTCTCATGGTCTTAATAGCAGCTTGCCGACCGCATAATCCTC 1898
Query 1888 CTCCAGTTCTTGATGGATCACTTGACAAACCAGTAACCTATTCAACCCCGAAGCTCGTCA 1947
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||
Sbjct 1899 CTCCTTTTCTTGATGGATCACTTGACAAACCAGTAACTTATTCGACACCGAAGCTCGTCA 1958
Query 1948 TCCTTCATATGAACATGGCACTCCACGTTTACGAGGATATCATGAGAATGACAGAGAATC 2007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 TCCTTCATATGAACATGGCACTCCACGTTTACGAGGATATCATGAGAATGACAGAGAATC 2018
Query 2008 TTAGTGAGAAGTACATCATTGGGCATGGAGCATCAAGCACTGTATACAAATGTGTTTTGA 2067
| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 TAAGTGAGAAGTATATCATTGGGCACGGAGCATCAAGCACTGTATACAAATGTGTTTTGA 2078
Query 2068 AGAACTGCAAACCGGTTGCAATTAAGCGGCTTTACTCTCACAACCCACAGTCAATGAAAC 2127
|||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 AGAATTGTAAACCGGTTGCGATTAAGCGGCTTTACTCTCACAACCCACAGTCAATGAAAC 2138
Query 2128 AGTTTGAGACCGAACTCGAGATGCTAAGTAGCATCAAGCACAGAAATCTTGTGAGCCTAC 2187
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 AGTTTGAAACAGAACTCGAGATGCTAAGTAGCATCAAGCACAGAAATCTTGTGAGCCTAC 2198
Query 2188 AAGCCTATTCTCTCTCTC-CATTGGGGAGTCTCCTGTTCTATGACTATTTGGAAAATGGT 2246
|||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 AAGCTTATTCCCTCTCTCAC-TTGGGGAGTCTTCTGTTCTATGACTATTTGGAAAATGGT 2257
Query 2247 AGCCTCTGGGATCTTCTTCACGGCCCTACGAAGAAAAAGACTCTTGATTGGGACACACGG 2306
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2258 AGCCTCTGGGATCTTCTTCATGGCCCTACGAAGAAAAAGACTCTTGATTGGGACACACGG 2317
Query 2307 CTCAAGATAGCATATGGTGCAGCACAAGGTTTAGCTTATCTACACCATGACTGTAGTCCA 2366
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2318 CTTAAGATAGCATATGGTGCAGCACAAGGTTTAGCTTATCTACACCATGACTGTAGTCCA 2377
Query 2367 AGGATAATTCACAGAGATGTGAAGTCGTCCAACATTCTCTTGGACAAGGACTTAGAGGCT 2426
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2378 AGGATCATTCACAGAGACGTGAAGTCGTCCAACATTCTCTTGGACAAAGACTTAGAGGCT 2437
Query 2427 CGTTTAACAGATTTCGGAATCGCGAAAAGCTTGTGTGTGTCAAAGTCACATACTTCTACT 2486
||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2438 CGTTTGACAGATTTTGGAATAGCGAAAAGCTTGTGTGTGTCAAAGTCACATACTTCAACT 2497
Query 2487 TACGTAATGGGCACGATTGGTTACATAGACCCCGAGTATGCTCGCACTTCACGTCTCACC 2546
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2498 TACGTGATGGGCACGATAGGTTACATAGACCCCGAGTATGCTCGCACTTCACGGCTCACT 2557
Query 2547 GAGAAATCCGATGTCTACAGTTATGGAATAGTGCTGCTTGAGTTGTTAACCAGAAGGAAA 2606
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2558 GAGAAATCCGATGTCTACAGTTATGGAATAGTCCTTCTTGAGTTGTTAACCCGAAGGAAA 2617
Query 2607 GCCGTCGATGACGAATCCAATATCCACCATCTGATAATGTCAAAGACGGGGAACAATGAA 2666
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 GCCGTTGATGACGAATCCAATCTCCACCATCTGATAATGTCAAAGACGGGGAACAATGAA 2677
Query 2667 GTGATGGAAATGGCAGATCCAGACATCACATCGACGTGTAAGGATCTCGGTGTTGTGAAG 2726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2678 GTGATGGAAATGGCAGATCCAGACATCACATCGACGTGTAAAGATCTCGGTGTGGTGAAG 2737
Query 2727 AAAGTTTTCCAACTGGCACTTTTATGCACCAAAAGACAGCCGAATGATCGACCCACAATG 2786
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 AAAGTTTTCCAACTGGCACTCCTATGCACCAAAAGACAGCCGAATGATCGACCCACAATG 2797
Query 2787 CACCAAGTGACTCGTGTCCTCGGCAGCTTCATGCTGTCGGAACAACCACCTGCTGCGACA 2846
||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2798 CACCAGGTGACTCGTGTTCTCGGCAGTTTTATGCTATCGGAACAACCACCTGCTGCGACT 2857
Query 2847 GACACTTCAGCAACGCTGGCTGGTTCGTGCTACGTCGATGAGTATGCAAATCTCAAGACT 2906
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2858 GACACGTCAGCGACGCTGGCTGGTTCGTGCTACGTCGATGAGTATGCAAATCTCAAGACT 2917
Query 2907 CCTCATTCTGTCAATTGCTCTTCCATGAGTGCTTCTGATGCTCAGCTGTTTCTTCGGTTT 2966
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2918 CCTCATTCTGTCAATTGCTCTTCCATGAGTGCTTCTGATGCTCAACTGTTTCTTCGGTTT 2977
Query 2967 GGACAAGTTATTTCTCAGAACAGTGAGTAGTTTTTC-TTAGGAGGAGAATCTTTAAAACG 3025
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 GGACAAGTTATTTCTCAGAACAGTGAGTAGTTTTTCGTTAGGAGGAGAATCTTTAAAACG 3037
Query 3026 GTATCGTTTT-GTTGCGTTAAGCAGGCTGTTAGAAAA-TTAATGTCACATGTaaaaaaaT 3083
||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |
Sbjct 3038 GTATC-TTTTCGTTGCGTTAAGC----TGTTAGAAAAATTAATGTCTCATGTAAAGTA-T 3091
Query 3084 TATGCACTGCCTTGTTATTATTAGACAAGTGTGTG-----AATATATCCTCAGACTGGCA 3138
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 3092 TATGCACTGCCTTATTATTATTAGACAAGTGTGTGGTGTGAATATGTCTTCAGACTGGCA 3151
Query 3139 CTTAGACTTCCTAT 3152
||||||||||||||
Sbjct 3152 CTTAGACTTCCTAT 3165
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 156771696875
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5