BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481550
Length=5887
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G26780.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr2... 7902 0.0
> AT2G26780.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr2:11410076-11423776
FORWARD LENGTH=5708
Length=5708
Score = 7902 bits (4279), Expect = 0.0
Identities = 4641/4809 (97%), Gaps = 52/4809 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1106 GCACTACAGGCACTGAAAATGTTGCTCCGGAACATAATGTAGCTCCAGGAAATATATCCT 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 GCACTACAGGCACTGAAAATGTTGCTCCGGAACATAATGTAGCTCCAGGAAATATATCCT 971
Query 1166 TGAAAATGAAGCTCATGTCTGGTTTCTGTCGGTCCATTGCAGCTGCAAATAGTTTTCCTG 1225
||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 TGAAAATGAAGCTCATGTCTGGTTTCTGTCGTTCTATCGCAGCTGCAAATAGTTTTCCTG 1031
Query 1226 CAACATTGCAGTGCATATTTGGCTGCATGTATGGAAGTGGAACAACCTTAAGGCTAAAGC 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 CAACATTGCAGTGCATATTTGGCTGCATGTATGGAAGTGGAACAACCTTAAGGCTAAAGC 1091
Query 1286 AAATGGGAATGGAGTTCACCGTGTGGGTTTTTAAGCATGGGAAGATAGATCAGTTGAAAC 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092 AAATGGGAATGGAGTTCACCGTGTGGGTTTTTAAGCATGGGAAGATAGATCAGTTGAAAC 1151
Query 1346 TTATGGGACCTGTTATACTGAATGCTATTCTAAAAATGCTTGATGG-TTCTACAGGCTCA 1404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1152 TTATGGGACCTGTTATACTGAATGCTATTCTAAAAATGCTTGATGGTTTC-ACAGGCTCA 1210
Query 1405 GAAACAGATGCTCTATCAAGGGAGACCAAAATATTTTCTTTTCAAGCTATTGGTTTACTT 1464
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211 GAAACAGATGCTCTATCGAGGGAGACCAAAACATTTTCTTTTCAAGCTATTGGTTTACTT 1270
Query 1465 GCACAACGTTTGCCCCAGCTTTTTAGAGAAAAGACTGAAATGGCTGTTCGTCTTTTTGAT 1524
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271 GCACAACGTTTGCCTCAGCTTTTTAGAGAAAAGACTGAAATGGCTGTTCGTCTTTTTGAT 1330
Query 1525 GCGCTGAAGTTAGAAACCCAATCTCTTCGTTCAACCATCCAGGAGGCAATAATTTCTCTT 1584
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1331 GCGCTGAAATTAGAAACCCAATCTCTTCGTTCAACCATCCAGGAGGCAATAGTTTCTCTT 1390
Query 1585 GCTGCTGCATACAAGGACGCCCCAGAGAATATTCTCAGAGACTTAGAGGTGCTTCTGCTA 1644
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1391 GCTGCTGCATACAAGGACTCCCCAGAGAATATTCTCAGAGACTTGGAGGTGCTTCTGCTA 1450
Query 1645 GCAAATTCTCTGGCGGGGTTTATAAAATCTAGTATCTTTATGGCTTATATTGACCAGGAA 1704
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1451 GCAAATTCTCTGGCGGGGTTTATAAAGTCTAGTATCTTTATTGCTTCTATTGACCAGGAA 1510
Query 1705 CAAAATGAAGCTCGCTTTTGTGCTTTGCGATGGGCAACTTCTTTGTATAATTCACAACAT 1764
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1511 CAAAATGAAGCTCGCTTTTGTGCTTTACGATGGGCAACTTCTTTGTATAATTCACACCAT 1570
Query 1765 TGTCCAAGTCTCTATATTTGCATGCTGAGCGCAGCAGATCCGAAGCTAGATATAAGGGAA 1824
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571 TGTCCAAGTCTCTATATTTGCATGCTGAGTGCAGCAGATCCGAAGCTAGATATAAGGGAA 1630
Query 1825 ATAGCACTCGAAGGACTCTTTCTGAAAGAAGAAGGTCGCAGTATAGTCTCTAATCATGAC 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631 ATAGCACTCGAAGGACTCTTTCTGAAAGAAGAAGGTCGCAGTATAGTCTCTAATCATGAC 1690
Query 1885 CATAAATACCCAAAATTTAATGAGATGCTGGAGTACATTCTCAAGCAACAGCCAAAACTG 1944
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 CATAAGTACCCAAAATTTATTGAGATGCTGGAGTACATTCTCAAGCAACAGCCAAAACTG 1750
Query 1945 GTAGATTCTTCAGAAATGAGAAGCCAGAAGCTTCTCTTTCCCTCGCAAGTATATCTGGTC 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1751 TTAGATTCTTCAGAAATGAGAAGCCAGAAGCTTCTCTTTCCCTCGCAAGTCTATCTGGTC 1810
Query 2005 ATGATAAAGTTTTTAGTGAAGTGTTTTGAGTTAGAGATGGAGGAGAGCAATACCCAGGCA 2064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1811 ATGATAAAGTTTTTAGTGAAGTGTTTTGAGTTAGAGATGGAGGAGAGCAATACCCAGGCT 1870
Query 2065 GTAGGGACTGAATTTTTGGATTCGGCACAAAAAATGTGTTCTTTGTTGGAACATTCCTTG 2124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1871 GTAGGGACTGAATTTTTGGATTCGGCACAAAAAATGTGTTCGTTGTTGGAACATTCCTTG 1930
Query 2125 GCATTCGAAGGCTCGGCTGAACTGCATGCTTGTGCTTCTAAAGCATTGGTTTCAGTTGGC 2184
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931 GCATTCGAAGGCTCGGCTGAACTACATGCTTGTGCTTCTAAAGCATTGGTTTCAGTTGGC 1990
Query 2185 TCTTACCTTCCGGAGATGGTTGAACTTTACTTTTCCCGAAAAATTGTGTGGCTAAGAAGT 2244
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 TCTTACCTTCCGGAGATGGTTGAACTTTACTTCTCCCGAAAAATTGTGTGGCTAAGAAGT 2050
Query 2245 CTGCTTAGTCATACAGACTTGAGTACTCGTGAATCTGTATCACGATTACTCGGAATGGCA 2304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051 CTGCTTAGTCATACAGACTTGAGTACTCGTGAATCTGTATCACGATTACTCGGAATGGCA 2110
Query 2305 TCCTGTGCTCTGTCTGATGCTGAATCATGTTCCTTGCTCTCTGAATTGATATCTTCAATT 2364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 TCCTGTGCTCTGTCTGATGCTGAATCATGTTCCTTGCTCTCTGAATTGATATCTTCAATT 2170
Query 2365 TCCCAACCGCAGAAGTTAAGGTTTGAGGCACAGCATGGGGGATTATGCGCTGTAGGATTT 2424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2171 TCCCAACCGCAGAAGTTAAGGTTTGAGGCACAGCATGGGGGATTATGCGCTGTAGGATTT 2230
Query 2425 GTTTCAGCACACTGTTTACATAGAATCCCCACTGTTTCTGAAGCAGTTACTCAAAATGCG 2484
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2231 GTATCAGCACACTGTTTACATAGGATCCCCACTGTTTCTAAAGCAGTTACTCAAAATGCG 2290
Query 2485 GTTAAA-TGTTTGGGGGATGTTGTTAATTTAGAGACTGCACCACTGGCTTCTGTTGCTAT 2543
|| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 GT-AAAGTATTTGGTGGAAGTTGTTAATTTAGAGACTGCACCACTGGCTTCTGTTGCTAT 2349
Query 2544 GGAAGCTCTGGGTCATATTGGGATTTGTGGCGCATTACCTCTT-CTTGTTAATGATTCTA 2602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 2350 GGAAGCTCTGGGTCATATTGGGATTTGTGGCGCATTACC-CTTTCTTGTTAATGATTCTA 2408
Query 2603 GTCCAGGGACTCAAGTGCTGGAAGTTCTTCAAGAAAGATTGAGCAAGCTACTCTCTGGTG 2662
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2409 GTCCAGGGACTCAAGTGCTGGAAATTCTTCAAGAAAGATTGAGCAAGCTACTCTCTGGTG 2468
Query 2663 ATGATATAAAATCAGTTCAGAAAATTGCTCTTTCTCTTGGACATATCTGTTCAAATGAAA 2722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469 ATGATATAAAATCAGTTCAGAAAATTGCTCTTTCTCTTGGACATATCTGTTCAAATGAAA 2528
Query 2723 CGTCATCTTCGCACTTGAAAATAGCGCTTGATCTTTTATTTAGCCTTTCACGGTCAAAGG 2782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2529 CGTCATCTTCGCACTTGAAAATAGCGCTTGATCTTTTATTTAGCCTTTCACGGTCAAAGG 2588
Query 2783 CTGAAGAAATTTTGTTTGCTGCGGGTGAGGCGCTATCTTTCCTCTGGGGTGGTGTACCAG 2842
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 CTGAAGAAATTTTGTTTGCTGCTGGTGAGGCGCTATCTTTCCTCTGGGGTGGTGTACCAG 2648
Query 2843 TTACTGCTGATATGATTCTGAAAACTAATTATACTTCTCTTTCGACGGACTCAAATTTTC 2902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2649 TTACTGCTGATATGATTCTGAAAACTAATTATACTTCTCTTTCGACGGACTCAAATTTTC 2708
Query 2903 TGATGAAAGAAGTTAAATCTTTGTCTGATGTCAAAACTGATACTGAGGAAGATAGCCGTA 2962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 TGATGAAAGAAGTTAAATCTTTGTCTGATGTCAAAACTGATACTGAGGAAGATAGCCGTA 2768
Query 2963 CCATAACCAGAGAAACAATTACTGGAAAACTCTTTGACACTCTTCTGTATAGTAGCAGGA 3022
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2769 CCACAACCAGAGAAACAATTACTGGAAAACTCTTTGACACTCTTCTGTATAGTAGCAGGA 2828
Query 3023 AGGAGGAACGATGTGCTGGAACTGTGTGGATGCTGTCTTTGACCATGTACTGTGGCCAGC 3082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829 AGGAGGAACGATGTGCTGGAACTGTGTGGATGCTGTCTTTGACCATGTACTGTGGCCAGC 2888
Query 3083 AGCCATCAATCCAAATAATGCTTCCTAAAATCCAGGAAGCTTTCTCACATTTGTTAGGTG 3142
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2889 AGCCATCAATCCAACTAATGCTTCCAAAAATCCAGGAGGCTTTCTCACATTTGTTAGGTG 2948
Query 3143 ACCAGAATGAACTTACACAGGAGCTGGCATCCCAGGGCATGAGCATCATCTATGAACTTG 3202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 ACCAGAATGAACTTACACAGGAGCTGGCATCCCAGGGCATGAGCATCATCTATGAACTTG 3008
Query 3203 GTGATGCATCAATGAAGAAAAGCCTGGTAGATGCTCTGGTAAATACTCTAACTGGCACAA 3262
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3009 GTGATGCATCAATGAAGAAAAGCCTGGTAGATGCTCTGGTAAATACTCTAACAGGCACAA 3068
Query 3263 GCAAAAGAAAACGAGCTATAAAGCTTGTTGAGGAGTCTGAAGTGTTTCAAGAGGGAACTA 3322
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3069 GCAAAAGAAAACGAGCTATTAAGCTTGTTGAGGAGTCTGAAGTGTTTCAAGAGGGAACTA 3128
Query 3323 TCGGTGAGAGTCCCAGTGGAGGGAAGATTAGCACTTACAAGGAGCTTTGTAATCTTGCAA 3382
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3129 TCGGTGAGAGTCCTAGTGGAGGGAAGATTAGCACTTACAAGGAGCTTTGTAATCTTGCAA 3188
Query 3383 ATGAAATGGGGCAACCTGATTTAATTTACAAATTTATGGACTTAGCCAATCACCAAGCTT 3442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3189 ATGAAATGGGGCAACCTGATTTAATTTACAAATTTATGGACTTAGCCAATCACCAAGCTT 3248
Query 3443 CTCTTAACTCAAAGAGAGGAGCTGCTTTTGGGTTCTCCAAGATAGCCAAGCAAGCAGGAG 3502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3249 CTCTTAACTCAAAGAGAGGAGCTGCTTTTGGGTTCTCCAAGATAGCCAAGCAAGCTGGAG 3308
Query 3503 ATGCTCTTCGACCACATTTGCGACTGTTGATTCCGAGGTTGATTCGTTACCAATATGATC 3562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3309 ATGCTCTTCGACCACATTTGCGACTGTTGATTCCGAGGTTGATTCGTTACCAATATGATC 3368
Query 3563 CTGACAAAAATGTGCAGGATGCGATGGCACACATTTGGAAAGCACTGATACAAGACCCTA 3622
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3369 CTGACAAAAATGTCCAGGATGCGATGGCACACATTTGGAAAGCACTGATACAAGACCCTA 3428
Query 3623 AGAAAGCTGTCGATGAACATTTGAATCACATCTTCGATGATCTGCTAGTACAATGTGGTT 3682
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3429 AGAAAGCTGTTGATGAACATTTGAATCACATCTTCGATGATCTGCTAGTACAATGTGGTT 3488
Query 3683 CACGGCTTTGGCGCTCCCGTGAGGCATCCTGTTTGGCTCTTGCTGATATTATTCAAGGGC 3742
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3489 CACGGCTTTGGCGCTCCCGTGAGGCATCCTGTTTGGCTCTTGCTGATATTATTCAAGGTC 3548
Query 3743 GGAAATTTGACCAGGTCAAGGAGCATTTGAAAAAACTATGGATAGCTGCCTTCCGTGCTA 3802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3549 GGAAATTTGACCAGGTCAAGGAGCATTTGAAAAAACTATGGATAGCTGCCTTCCGTGCAA 3608
Query 3803 TGGATGACATTAAAGAGACTGTGAGAAATGCTGGTGATAAGTTATGTCGTGCTGTGACAT 3862
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3609 TGGATGACATTAAAGAAACTGTGAGAAATGCTGGTGATAAGTTATGTCGTGCCGTGACAT 3668
Query 3863 CCTTAACGATAAGGATCTGTGATGTCACGCTTACCGAACTAGCAGATGCAAAACAAGCAA 3922
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3669 CCTTAACAATAAGGATCTGTGATGTCACGCTTACCGAACTAGCAGATGCAAAACAAGCGA 3728
Query 3923 TGGATATTGTTCTTCCTTTTTTGCTTTCAGAAGGAATAATGAGTAAAGTCAACAGTGTAC 3982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3729 TGGATATTGTTCTTCCTTTTTTGCTTTCAGAAGGAATAATGAGTAAAGTCAACAGTGTAC 3788
Query 3983 GTAAGGCTTCAATTGGAGTTGTTATGAAGCTTGCAAAGGGTGCAGGAGTTGCCCTCCGTC 4042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3789 GTAAGGCTTCAATTGGAGTTGTTATGAAGCTTGCAAAGGGTGCAGGAGTTGCCCTCCGTC 3848
Query 4043 CACATTTGTCCGACCTAGTTTGCTGTATGTTGGAAAGTTTGTCTAGTCTTGAAGACCAAG 4102
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 CACATTTGTCCGACTTAGTTTGTTGTATGTTGGAAAGTTTGTCTAGTCTTGAAGACCAAG 3908
Query 4103 GACTTAACTATGTTGAGTTGCATGCTGCCAATATTGGCATAGAAACAGAGAAACTTGAAA 4162
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3909 GACTTAACTATGTTGAGTTGCATGCTGCCAATATTGGCATAGAAACCGAGAAACTTGAAA 3968
Query 4163 ATTTACGAATTTCAATCTCGAAAGGCTCTCCAATGTGGGAAACTCTTGATCTGTGTATTA 4222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3969 ATTTACGAATTTCAATCTCGAAAGGCTCTCCAATGTGGGAAACACTTGATCTGTGTATTA 4028
Query 4223 ATATAGTGGATATTGAATCACTTGATCAATTGATCCCTCGTCTCACGCAACTTGTTCGGG 4282
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4029 ATATAGTGGATATTGAATCACTTGAACAATTGATCCCTCGTCTCACTCAACTTGTTCGGG 4088
Query 4283 GTGGTGTTGGCCTCAATACGAGGGTTGGTGTTGCCAGCTTTATCTCATTGCTAGTTCAAA 4342
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4089 GTGGTGTTGGCCTCAATACGAGAGTTGGTGTTGCCAGCTTTATCTCATTGCTAGTTCAAA 4148
Query 4343 AAGTCGGTACCGAGATAAAGCCGTTAACTGGAATGCTGCTAAAACTTTTGTTTCCTGTTG 4402
|||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 4149 AAGTTGGTTCCGAGATAAAGCCGTTCACTGGAATGCTGCTGAGACTTTTGTTTCCTGTTG 4208
Query 4403 CCAAGGAGGAGAAAAGTTCTTCCGCAAAACGTGCCTTTTCGAGTGCTTGTGGCATTGTAT 4462
|||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4209 CCAAAGAGGAGAAAAGTTCTGCTGCAAAACGTGCCTTTTCGAGTGCTTGCGGCATTGTAT 4268
Query 4463 TGAAGTATTCTAGCCCCTCTCAAGCTCAAAGCTTAATCGAAGAAACTGCAGCTCTGCACT 4522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4269 TGAAGTATTCTAGCCCCTCTCAAGCTCAAAGCTTAATCGAAGAAACTGCAGCTCTGCACT 4328
Query 4523 CTGGTGATAGAAGCTCCCAGATCGCATGTGCGAGTCTTTTCAAAAGCTTCTCATCTACAG 4582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4329 CTGGTGATAGAAGCTCCCAGATCGCATGTGCGAGTCTGTTCAAAAGCTTCTCATCTACAG 4388
Query 4583 CTTCTGATATTATGAGCAGTCACCAGTCGGCTATTGTTCCAGCTATATTTATTTCCAGAT 4642
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4389 CTGCTGATATTATGAGCAGTCATCAGTCGGCTATTGTTCCAGCTATATTTATTTCCAGAT 4448
Query 4643 TTGAGGATGAAAAACAAATTTCGAGTCTCTTTGAGGAGGTGTGGGAAGATATCACAAGTG 4702
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4449 TTGAGGATGAAAAACAGATTTCGAGTCTCTTTGAGGAGGTGTGGGAAGACATCACAAGTG 4508
Query 4703 GTGAAAGGGTCACACTACAGTTGTTTCTGCAAGAAATTGTGAATCATATTTGCGAGAGCA 4762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4509 GTGAAAGGGTCACACTACAGTTGTTTCTGCAAGAAATTGTGAATCATATCTGCGAGAGCA 4568
Query 4763 TCACATCATCATCGTGGGCAAGCAAGAAAAAGGCAACtttttttATCTTTCTCTCTGGTA 4822
|||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||
Sbjct 4569 TCACATCATCCTCGTGGGCAAGCAAGAAGAAG-----T--------CT--------GGTA 4607
Query 4823 AGGCGATATGCAAACTAGCTGAAGTCTTGGGTGAATCATTATCGCCACACCACAAGAGAT 4882
|||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4608 AGGCAATTTGCAAACTAACTGAAGTCTTGGGTGAATCATTATCGCCACACCACAAGAGAT 4667
Query 4883 TGCTGCAATGTCTTGTCAATGAAATTCCTGGACGATTATGGGAGGGAAAGGATGCTCTTT 4942
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4668 TGCTACAATGTCTTGTCAATGAAATTCCTGGACGTTTATGGGAGGGAAAGGATGCTCTTT 4727
Query 4943 TGGATGCCCTAGGTGCTCTTTCAGTCGCTTGCCACGAGGCAATAACTAAGGAGGACCCAA 5002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4728 TGGATGCCCTAGGTGCTCTTTCAGTCGCTTGCCACGAGGCAATAACTAAGGAGGACCCAA 4787
Query 5003 CAACTCCCACTACCATCTTGAGTCTTATCTGTTCTGCATGCAAAAAGAAACTCAAGAAAT 5062
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4788 CAACTCCGACTACCATCTTGAGTCTTATCTGTTCTGCATGCAAAAAGAAACTCAAGAAAT 4847
Query 5063 ATCGCGAGTCAGCCTTTTCTTGTCTGGAGAAGGTCATAATAGCTTTTGGCGATCCAAAGT 5122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4848 ATCGCGAGTCAGCCTTTTCTTGTCTGGAGAAGGTCATAATAGCTTTTGGCGATCCAAAGT 4907
Query 5123 TTTTCCATGCCGTTTTCCCGATGTTGTATGAGATGTGTAGTACTGCCTCTGTCAAAACGA 5182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4908 TTTTCCATGCCGTTTTCCCGATGTTGTATGAGATGTGTAATACTGCCTCCATCAAAACGA 4967
Query 5183 GCACCCAAGTTCAGGCAACAAGTGATACTGTCAAAACAGAATCAGAAAACGGAGAAGACG 5242
||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4968 ACACTCAAGTTCAGGCAGCAAGTGATGCTGTCAAAACAGAATCAGAAAATGGAGAAGATG 5027
Query 5243 GACAAGTCCCACTTGAAAAAATTATGGAATGCGTCAAGTCTTGCATCCAAGTGGCAACTA 5302
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5028 GACATGTCCCTCTTGAAAAAATTATGGAATGCGTCAAGTCTTGCATCCAAGTGGCAACTA 5087
Query 5303 TAGATGATATTCTTAGCGCGAAAGCAAATTTGATTCATGTTCTTTTAATTTCCTTATCAC 5362
||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5088 TAGATGACATTCTTAGCGCAAAAGCAGATTTGATTCATGTTCTTATAATTTCCTTATCAC 5147
Query 5363 CTGGTTTTCTGTGGACTGTAAAAATGTCTGGAATTTCATGTGTGGGAAAGCTTTGTTCAA 5422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5148 CTGGTTTTCTGTGGACTGTAAAAATGTCTGGAATTTCATGTGTGGGAAAGCTTTGTTCAA 5207
Query 5423 GGTTTCAGAGTCTATGGACTGACTCCATGGATGACCTTTCACCTAGTGATGCGACAAAAT 5482
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5208 GGTTTCCGAGTCTATGGACTGACTCCATGGATGACCTTTCACCTAGTGATGCGACAAAAT 5267
Query 5483 TCGTTCATGAGTTATTTCACTCACTAGTTCCTAAACTACTGGAATGCATTCACACTGTGA 5542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 5268 TCGTTCATGAGTTATTTCACTCACTAGTTCCTAAACTCCTGGAGTGCATACACACTGTGA 5327
Query 5543 AGATAGCACAGTTTCATGTGGCTGCTTCCCAATGCCTGCTCGAGCTCATCGAACTGTATA 5602
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5328 AGATAGCACAGTTTCATGTGGCTGCTTCCCAATGCCTGCTTGAGCTCATCGAACTGTATA 5387
Query 5603 GCACAGTCTCGTCTTTGCATCCCGTGGAAGTAGATTTCAAGGCTGAAGTTGTCTCTTTAC 5662
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 5388 GCACAATCTCGTCTTTGCATCCCGTGGAAGTAGATTTTAAGGCTGAGGTTGTTTCTTTAC 5447
Query 5663 TTGAACTCGAGAAGAGTGAAGAAGCCAAGTCGTTGTTGAGAAAATCCAGGGATGCTCTTG 5722
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5448 TTGAACTCGAAAAGAGTGAAGAAGCCAAGTCGTTGTTGAGAAAATCCAGGGATGCTCTTG 5507
Query 5723 CAAATCTCCCCTCGTTAAACTGAGCAAACACAG-GAAAGATTTTAGTTTTATGCCTTAAA 5781
|||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 5508 CAAATCTCCCTTCGTTAAACTAAGCAAGCACAGAGAA-GATTTTAGTTTTATGCCTGAAG 5566
Query 5782 TTGATATAAATGTCT-TTG--T-T--TACTT-GTA--------C--A-A--CAAGTTCAC 5821
|||||||||||| ||| | | ||||| ||| | | | |||||||||
Sbjct 5567 TTGATATAAATGGGAATTGAATCTCCTACTTTGTATTTGTTTACTTATATACAAGTTCAC 5626
Query 5822 ATGGAGATA-AT--CTTCTAAGTTTTTACTTTTCTTCCCCGATGGTAACAATTTCTTCAC 5878
|| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 5627 ATTGATATATATATCTTCTAAGTTTTTACTTTTCTTCCCTGATGGTAAAAATTTATTCAC 5686
Query 5879 GGCTTTTTT 5887
|||||||||
Sbjct 5687 GGCTTTTTT 5695
Score = 963 bits (521), Expect = 0.0
Identities = 553/569 (97%), Gaps = 0/569 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 310 GTTCTTGAGATACTGAGTCATGTTAACAAGAGAGTGAAGCATCAGCATGAAATTGGTTTG 369
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GTTCTTGAGATATTGAGTCATGTTAACAAGAGAGTGAAGCATCAGCATGAAATTGGTTTG 295
Query 370 CCTTTGTTGGCTTTATGGAAATTGTACACCGATCCTGCTGCTGCTCCTATGGTTAGGAAC 429
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 CCTTTATTGGCTTTATGGAAATTGTACACAGATCCTGCTGCTGCTCCTATGGTTAGGAAC 355
Query 430 TTTGCTATTGTCTATGTTGAGATGGCTTTTGAACGAGCTCCTGCCAAGGAAAGGGAGGAA 489
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 356 TTTGCTATTGTCTATGTTGAGATGGCTTTTGAACGAGCTCCTGCAAAGGAAAGGGAGGAA 415
Query 490 ATTGCACCTAGTACACTGGAGAATGTTTCGAAGCTTCCTAAGCAGCATCAAGAGATTATT 549
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 ATTGCACCTAATACACTGGAGAATGTTTCAAAGCTTCCTAAGCAGCATCAAGAGATTATT 475
Query 550 TTGAGAATTGCTATTAAGGTCATTGGAGAGTGTCATGCAAGCAAGATCAGTGATGATGTC 609
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 TTGAGAATTGCTATTAAGGTCATTGGAGAATGTCATGCAAGCAAGATCAGTGATGATGTG 535
Query 610 TCTGCGAAGTATAGATCTCTGATTACTTCTCAGGATAAAGACTTGTTTCTGGATTTTTGC 669
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TCTGCGAAGTATAGATCTTTGATTACTTCTCAGGATAAAGACTTGTTTCTGGATTTTTGC 595
Query 670 CTTCATATGCTTTTGTATCAACCATCTTCTCAAGGAGGTGGATCTTCTCCTGGGCTTTCA 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 CTTCATATGCTTTTGTATCAACCATCTTCTCAAGGAGGTGGATCTTCTCCTGGGCTTTCA 655
Query 730 GTTTTTCAAGTTAATCGTATAATCGGAAAACAAGCATTAAAAGGAGACATACTTACAAAA 789
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
Sbjct 656 GTTTTTCAAGTTAATCGTATAATCGGAAAGCAAGCATTAAAAGGGGACACGCTTACAAGA 715
Query 790 CGAAAGTTGGGGATCTTGAATGTCATTGGAACCATGGACCTGCCTGGTGAATCTGTATAT 849
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 716 CGAAAGTTGGGGATCTTGAATGTCATTGGAAACATGGACCTACCTGGTGAATCTGTATAT 775
Query 850 CCATTGTACATTGCTGCATCAGTGGATAG 878
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 CCATTGTACATTGCTGCATCAGTGGATAG 804
Score = 374 bits (202), Expect = 7e-102
Identities = 225/236 (95%), Gaps = 1/236 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGAAGCACTGATAAATCTCTGCAACTCCAGAAA-TTCGGAGATTAGCTATGGCAGGTTC 59
|||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 AAGAAGCACTGATAAATCTCTGCAACTCAACAAATTTCTGAGATTAGCTATGGAAGGTTC 60
Query 60 TTCATCTTCGTCTTCGTTAATCTCCAAATCGGACGGTGAATTGGAGGAAATGCTCGATCG 119
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTCATCTTCGTCTTCGTTAATTTCCAAATCGGACGCTGAGTTGGAGGAAATGCTCGATCG 120
Query 120 GATGCTGACGAGACTCGCTCTTTGCGACGATTCCAAGCTCGAATCCCTAGTCTCTAACCT 179
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GATGCTGACGAGACTCGCTCTTTGCGACGACTCCAAGCTCGAATCCCTAGTCTCTAACCT 180
Query 180 CCTTCCTCTTACCATATCTTCTCTGTCTTCTCAATCTCCAGTTGTTCGCAACAAGG 235
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 181 CCTTCCTCTTACCATATCTTCTCTTTCTTCTCAATCTCCCGTTGTTCGCAACAAGG 236
Score = 202 bits (109), Expect = 3e-50
Identities = 109/109 (100%), Gaps = 0/109 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 913 AGTCAAGAACCTGTAGCTAAGAGAGGGGAAGAGCTTCTAAAAAAGATAGCTTCTGGAACA 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 AGTCAAGAACCTGTAGCTAAGAGAGGGGAAGAGCTTCTAAAAAAGATAGCTTCTGGAACA 862
Query 973 AATTTGGATGATCCCAAGTTGATAAACAGACTGTTCTTACTATTCAATG 1021
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 AATTTGGATGATCCCAAGTTGATAAACAGACTGTTCTTACTATTCAATG 911
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 293731244919
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5