BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481780
Length=1512
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G28671.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 2019 0.0
AT2G28670.1 | Symbols: | Disease resistance-responsive (dirige... 1989 0.0
> AT2G28671.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: cellular_component unknown; Has 30201 Blast
hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria
- 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses
- 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | chr2:12300203-12302036
FORWARD LENGTH=1834
Length=1834
Score = 2019 bits (1093), Expect = 0.0
Identities = 1391/1527 (91%), Gaps = 52/1527 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 ATGGCAGGTCAAAAGATACTTTCTTTACTGGTTATAGCTCTTGTTGTTACTTTTGCAGCT 60
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 ATGGCTGGTCAAAAGATACTTTCTTTACTGGTTATAGCTCTTGTTGTTACTTTTGCAGCT 1462
Query 61 GCGGCTCGGCTTCTTGATGAAGAAGATGCATTCTCAGCTACCACAACAACCTCTGGCTCT 120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |
Sbjct 1461 GCGGCTCGGCTTCTTGATGAAGAAAATGCATTCTCAGCTACCACAACCA-C-C---CT-T 1408
Query 121 GGCTCAACTGCTGGGTCAGGTTCCACTGGAATTGGTTTTGGTGCAGGAACAGGGTCAAGT 180
||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCTC-A-----GGTTCAGGTTCCACCGGAATTGGTTTTGGTGCAGGAACAGGGTCAAGT 1354
Query 181 GGTTCAGGTTCCACGGGAATCGGTTTTGGTGCAGGATCAGGGTCATCTGGTTCAGGTTCT 240
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 GGTTCAGGTTCCACGGGATTCGGTTTTGGTGCAGGATCAGGGTCATCTGGTTCAGGTTCT 1294
Query 241 ACTGGAACCGGTCTCGGTGCAGGTACAGGGTCGATACCATTAAGTGGTTCAAGTCCTTTG 300
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |
Sbjct 1293 ACTGGAAGCGGTCTCGGTGCAGGTACAGGGTCAATACCATCAAGTGGTTC-AG------G 1241
Query 301 ACTACAACTGGTTCTGGTCCTCTACCAACAGCCGGTTCTGTTCCTGGTTCTTTAGTGGGT 360
| | |||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1240 --T-C--CTGG-TC---T--TCTACCAACTGCCAGTTCTGTTCCTGGTTCTTTAGCGGGT 1192
Query 361 GGTGGTTCTGGTTCTTTACC-AGTCGGTGGTTCAGCAACTGGTCCAggtggtgcgggtgc 419
|||||||| ||||| || || | | ||||||||| |||||| || ||||| ||| |
Sbjct 1191 GGTGGTTCAGGTTCCTTGCCTA-CCACTGGTTCAGCCACTGGTGCA---GGTGCAGGTAC 1136
Query 420 cggtccagctcttggtggtggtgcgggtgctggttcagctcttggtggtggtgcgggtgc 479
|||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 CGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGGCTCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGC 1076
Query 480 cggtctagctcttggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGC 539
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1075 CGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCAGGTGC 1016
Query 540 CGGTCCAGCTC-T--TGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGT-G-GG-GC 593
||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 1015 TGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGC 956
Query 594 Gggtgccggtccagctcttggtggt-g-g-tgcaggtgccggtccagctcttggtggtgg 650
||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||||||
Sbjct 955 AGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGTTGCAGGTTCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGG 896
Query 651 tg---gtg-TAGGTCCTGATAACACATTGGTATTTTTTATGCACGATATACTCGGTGGTT 706
|| ||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 895 TGCAAGTGCT-GGTCCTGACAATACGTTGGTATTTTTTATGCATGATATACTCGGTGGTT 837
Query 707 CAAATCCCACTGCCAGAGCCGTAACTGGAGTCGTCGCGAACCCGGCTTTAAGCGGCCAAC 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 836 CAAATCCCACTGCCAGAGCCGTAACTGGAGTCGTCGCAAATCCGGCTTTAAGCGGGCAAC 777
Query 767 TCCCATTTGCTAAACCCAACGGTGCAAACCTTCCTGTAAGCAACGGAGTTCCATCGaaca 826
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 776 TTCCATTTGCTAAACCCAACGGCGCAAACCTTCCTGTAAGCAACGGAGTTCCGTCAAACA 717
Query 827 acaacaacaacgggattgtcaacaacaacaacGTCCCTTTCCTGGTTGGACTCGGCGGAA 886
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 716 ACAACAACAATGGGATTGTCAACAACAACAATGTCCCTTTCCTCGTTGGACTCGGCGGAA 657
Query 887 CCACGGCTAACATTCTCCAGAACAACAATAACGGAAACAACATTTTAAATGGTTTCCCTG 946
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 CCACAGCTAACATTCTCCAGAACAACAATAACGGAAACAACATTTTAAATGGTTTCCCTG 597
Query 947 TTGCTAGTGGCGGTCAGCTCCCAAGCGGTTCTGCTCTTCAGATGCTAATGTTCGGGACAA 1006
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 TTGCTAGTGGCGGTCAGCTCCCGAGCGGTTCTGCTCTTCAGATGCTAATGTTCGGGACAA 537
Query 1007 TGACAGTAATCGATGATGAACTAACCGAAGGCCATGAGCTCGGATCTGGTTTGCTCGGGA 1066
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 536 TGACAGTAATCGATGATGAACTAACTGAAGGCCATGAGCTCGGATCTGGCTTACTCGGGA 477
Query 1067 AAGCGCAGGGATATTATGTTGCGAGTGCCATTGACGGAACTAGCCAGACATTGGCTTTCA 1126
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 476 AAGCGCAGGGATATTATGTGGCGAGTGCAATTGACGGAACTAGCCAGACAATGGCTTTCA 417
Query 1127 CTGCGATGTTTGAGAGCGGCGGTTATGAAGATAGTATAAGCTTCTTTGGGGTTCTCAGAA 1186
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 CCGCGATGTTTGAAAGCGGCGGTTATGAAGATAGTATAAGCTTCTTTGGGGTTCTCAGAA 357
Query 1187 CAGCGGTTTCGGAATCGCATATAGGAGTTATGGGAGGAACCGGAAAGTATGTGAATGCGA 1246
||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 CAGCGGTATCAGAATCGCATATAGGAGTAATGGGAGGTACCGGAAAGTATGTGAATGCGA 297
Query 1247 GGGGATTTGCTATTCTAAAGACGTTTACAGGATCTAGCGGGACGCAGCAGAATCAGCCGC 1306
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GGGGATTCGCGATTCTGAAGACGTTTACAGGATCTAGCGGGACGCAGCAGAATCAGCCGC 237
Query 1307 ATCAGTTCACTGATGGGCTTGAGACTGTTCTCGAGTGTACCGTTTATCTTTCGTACTAGT 1366
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Sbjct 236 ATCAGTTCACTGATGGGCTTGAGACTGTTGTTGAGTGTACCGTTTATCTTTCTTACTAGT 177
Query 1367 TTTATTTTTCTTCTTCTGTTGGAGTTTGGGAATGTTTGGTGTGTATGTGATGTGTGTCCT 1426
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 176 TTTATTTTTCTTCTTTTGTTGGGGTTTGGGAATGTTTGGTGTGTATGTTATGTGTGTCAT 117
Query 1427 TTGTAATCTACATATGAAACTTGTGTAAGAAAATTGTATTTACTTTCTTTT-TTAATTCC 1485
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Sbjct 116 TTGTAATCTAAATATGAAATTTGTGTAAGAAAATTGTATGTACTTTTTTTTCTT--TTCT 59
Query 1486 TGATATTACTGATTTCTTTGGAGCAAA 1512
||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 58 TGAAATTACTGATTTGTTTGGAGCAAA 32
Score = 287 bits (155), Expect = 2e-76
Identities = 213/240 (89%), Gaps = 8/240 (3%)
Strand=Plus/Minus
Query 432 tggtggtggtgcgggtgctggttcagctcttggtggtggtgcgggtgccggtct-agctc 490
||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||
Sbjct 1153 TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGG-CTCAGCTC 1095
Query 491 ttggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1094 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 1035
Query 551 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGG-GGCG--ggtgccggtccag 607
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||||
Sbjct 1034 TTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAG 975
Query 608 ctcttggtggtggtg---caggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||
Sbjct 974 CTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGTTGCAGGTTCTG 915
Score = 257 bits (139), Expect = 2e-67
Identities = 196/222 (88%), Gaps = 9/222 (4%)
Strand=Plus/Minus
Query 449 ctggttcag-ctcttggtggtggtgcgggtgccgg-tctagctcttggtggtggtgcggg 506
||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| | ||
Sbjct 1166 CTGGTTCAGCCAC-TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTC-AGCTCTTGGAGGTGGTCCAGG 1109
Query 507 tgccggtc-cagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGG 565
||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 TGCTGG-CTCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGG 1050
Query 566 GTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGGGCGggtgccggtccagctcttggtggtggtg--- 622
||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1049 GTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTG 990
Query 623 caggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 989 CAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTG 948
Score = 226 bits (122), Expect = 5e-58
Identities = 157/174 (90%), Gaps = 2/174 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 492 tggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTC-CAGCTC 550
||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||
Sbjct 1153 TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGG-CTCAGCTC 1095
Query 551 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGGGCGggtgccggtccagctc 610
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1094 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 1035
Query 611 ttggtggtggtgcaggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1034 TTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTG 981
> AT2G28670.1 | Symbols: | Disease resistance-responsive (dirigent-like
protein) family protein | chr2:12300259-12301790 REVERSE
LENGTH=1532
Length=1532
Score = 1989 bits (1077), Expect = 0.0
Identities = 1362/1492 (91%), Gaps = 50/1492 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCAGGTCAAAAGATACTTTCTTTACTGGTTATAGCTCTTGTTGTTACTTTTGCAGCT 60
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 ATGGCTGGTCAAAAGATACTTTCTTTACTGGTTATAGCTCTTGTTGTTACTTTTGCAGCT 127
Query 61 GCGGCTCGGCTTCTTGATGAAGAAGATGCATTCTCAGCTACCACAACAACCTCTGGCTCT 120
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |
Sbjct 128 GCGGCTCGGCTTCTTGATGAAGAAAATGCATTCTCAGCTACCACAACCA-C-C---CT-T 181
Query 121 GGCTCAACTGCTGGGTCAGGTTCCACTGGAATTGGTTTTGGTGCAGGAACAGGGTCAAGT 180
||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 GGCTC-A-----GGTTCAGGTTCCACCGGAATTGGTTTTGGTGCAGGAACAGGGTCAAGT 235
Query 181 GGTTCAGGTTCCACGGGAATCGGTTTTGGTGCAGGATCAGGGTCATCTGGTTCAGGTTCT 240
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 GGTTCAGGTTCCACGGGATTCGGTTTTGGTGCAGGATCAGGGTCATCTGGTTCAGGTTCT 295
Query 241 ACTGGAACCGGTCTCGGTGCAGGTACAGGGTCGATACCATTAAGTGGTTCAAGTCCTTTG 300
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |
Sbjct 296 ACTGGAAGCGGTCTCGGTGCAGGTACAGGGTCAATACCATCAAGTGGTTC-AG------G 348
Query 301 ACTACAACTGGTTCTGGTCCTCTACCAACAGCCGGTTCTGTTCCTGGTTCTTTAGTGGGT 360
| | |||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 349 --T-C--CTGG-TC---T--TCTACCAACTGCCAGTTCTGTTCCTGGTTCTTTAGCGGGT 397
Query 361 GGTGGTTCTGGTTCTTTACC-AGTCGGTGGTTCAGCAACTGGTCCAggtggtgcgggtgc 419
|||||||| ||||| || || | | ||||||||| |||||| || ||||| ||| |
Sbjct 398 GGTGGTTCAGGTTCCTTGCCTA-CCACTGGTTCAGCCACTGGTGCA---GGTGCAGGTAC 453
Query 420 cggtccagctcttggtggtggtgcgggtgctggttcagctcttggtggtggtgcgggtgc 479
|||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 CGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGGCTCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGC 513
Query 480 cggtctagctcttggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGC 539
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 514 CGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCAGGTGC 573
Query 540 CGGTCCAGCTC-T--TGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGT-G-GG-GC 593
||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 574 TGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGC 633
Query 594 Gggtgccggtccagctcttggtggt-g-g-tgcaggtgccggtccagctcttggtggtgg 650
||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| ||||||||||||||||
Sbjct 634 AGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGTTGCAGGTTCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGG 693
Query 651 tg---gtg-TAGGTCCTGATAACACATTGGTATTTTTTATGCACGATATACTCGGTGGTT 706
|| ||| | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 694 TGCAAGTGCT-GGTCCTGACAATACGTTGGTATTTTTTATGCATGATATACTCGGTGGTT 752
Query 707 CAAATCCCACTGCCAGAGCCGTAACTGGAGTCGTCGCGAACCCGGCTTTAAGCGGCCAAC 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct 753 CAAATCCCACTGCCAGAGCCGTAACTGGAGTCGTCGCAAATCCGGCTTTAAGCGGGCAAC 812
Query 767 TCCCATTTGCTAAACCCAACGGTGCAAACCTTCCTGTAAGCAACGGAGTTCCATCGaaca 826
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 813 TTCCATTTGCTAAACCCAACGGCGCAAACCTTCCTGTAAGCAACGGAGTTCCGTCAAACA 872
Query 827 acaacaacaacgggattgtcaacaacaacaacGTCCCTTTCCTGGTTGGACTCGGCGGAA 886
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 873 ACAACAACAATGGGATTGTCAACAACAACAATGTCCCTTTCCTCGTTGGACTCGGCGGAA 932
Query 887 CCACGGCTAACATTCTCCAGAACAACAATAACGGAAACAACATTTTAAATGGTTTCCCTG 946
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 CCACAGCTAACATTCTCCAGAACAACAATAACGGAAACAACATTTTAAATGGTTTCCCTG 992
Query 947 TTGCTAGTGGCGGTCAGCTCCCAAGCGGTTCTGCTCTTCAGATGCTAATGTTCGGGACAA 1006
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 TTGCTAGTGGCGGTCAGCTCCCGAGCGGTTCTGCTCTTCAGATGCTAATGTTCGGGACAA 1052
Query 1007 TGACAGTAATCGATGATGAACTAACCGAAGGCCATGAGCTCGGATCTGGTTTGCTCGGGA 1066
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1053 TGACAGTAATCGATGATGAACTAACTGAAGGCCATGAGCTCGGATCTGGCTTACTCGGGA 1112
Query 1067 AAGCGCAGGGATATTATGTTGCGAGTGCCATTGACGGAACTAGCCAGACATTGGCTTTCA 1126
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1113 AAGCGCAGGGATATTATGTGGCGAGTGCAATTGACGGAACTAGCCAGACAATGGCTTTCA 1172
Query 1127 CTGCGATGTTTGAGAGCGGCGGTTATGAAGATAGTATAAGCTTCTTTGGGGTTCTCAGAA 1186
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 CCGCGATGTTTGAAAGCGGCGGTTATGAAGATAGTATAAGCTTCTTTGGGGTTCTCAGAA 1232
Query 1187 CAGCGGTTTCGGAATCGCATATAGGAGTTATGGGAGGAACCGGAAAGTATGTGAATGCGA 1246
||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 CAGCGGTATCAGAATCGCATATAGGAGTAATGGGAGGTACCGGAAAGTATGTGAATGCGA 1292
Query 1247 GGGGATTTGCTATTCTAAAGACGTTTACAGGATCTAGCGGGACGCAGCAGAATCAGCCGC 1306
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293 GGGGATTCGCGATTCTGAAGACGTTTACAGGATCTAGCGGGACGCAGCAGAATCAGCCGC 1352
Query 1307 ATCAGTTCACTGATGGGCTTGAGACTGTTCTCGAGTGTACCGTTTATCTTTCGTACTAGT 1366
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1353 ATCAGTTCACTGATGGGCTTGAGACTGTTGTTGAGTGTACCGTTTATCTTTCTTACTAGT 1412
Query 1367 TTTATTTTTCTTCTTCTGTTGGAGTTTGGGAATGTTTGGTGTGTATGTGATGTGTGTCCT 1426
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1413 TTTATTTTTCTTCTTTTGTTGGGGTTTGGGAATGTTTGGTGTGTATGTTATGTGTGTCAT 1472
Query 1427 TTGTAATCTACATATGAAACTTGTGTAAGAAAATTGTATTTACTTTCTTTTT 1478
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 1473 TTGTAATCTAAATATGAAATTTGTGTAAGAAAATTGTATGTACTTT-TTTTT 1523
Score = 287 bits (155), Expect = 2e-76
Identities = 213/240 (89%), Gaps = 8/240 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 432 tggtggtggtgcgggtgctggttcagctcttggtggtggtgcgggtgccggtct-agctc 490
||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||| | ||||| || || |||||
Sbjct 436 TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGG-CTCAGCTC 494
Query 491 ttggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 495 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 554
Query 551 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGG-GGCG--ggtgccggtccag 607
||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||||
Sbjct 555 TTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAG 614
Query 608 ctcttggtggtggtg---caggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||
Sbjct 615 CTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGTTGCAGGTTCTG 674
Score = 257 bits (139), Expect = 2e-67
Identities = 196/222 (88%), Gaps = 9/222 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 449 ctggttcag-ctcttggtggtggtgcgggtgccgg-tctagctcttggtggtggtgcggg 506
||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||| | ||
Sbjct 423 CTGGTTCAGCCAC-TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTC-AGCTCTTGGAGGTGGTCCAGG 480
Query 507 tgccggtc-cagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGG 565
||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGCTGG-CTCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGG 539
Query 566 GTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGGGCGggtgccggtccagctcttggtggtggtg--- 622
||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 540 GTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTG 599
Query 623 caggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 600 CAGGTGCTGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTG 641
Score = 226 bits (122), Expect = 5e-58
Identities = 157/174 (90%), Gaps = 2/174 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 492 tggtggtggtgcgggtgccggtccagctcttggtggtggGGCGGGTGCCGGTC-CAGCTC 550
||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||| || | ||||||
Sbjct 436 TGGTGCAGGTGCAGGTACCGGTTCAGCTCTTGGAGGTGGTCCAGGTGCTGG-CTCAGCTC 494
Query 551 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGGGCGggtgccggtccagctc 610
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 495 TTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTCTTGGTGGTGGTGCGGGTGCCGGTCCAGCTC 554
Query 611 ttggtggtggtgcaggtgccggtccagctcttggtggtggtggtgTAGGTCCTG 664
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 555 TTGGTGGTGGTGCAGGTGCTGGTTCAGCTCTTGGTGGTGGTGGTGCAGGTGCTG 608
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 74598009870
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5