BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481833
Length=3260
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-... 4948 0.0
AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-... 4348 0.0
AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-... 4169 0.0
AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3... 326 1e-87
> AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-12535399
FORWARD LENGTH=3324
Length=3324
Score = 4948 bits (2679), Expect = 0.0
Identities = 3078/3267 (94%), Gaps = 41/3267 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGATACCGGAACTAGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTT 60
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 91 ATGATGATACCGGAACTAGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTT 150
Query 61 GGGGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTA 120
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 151 GGGGATGATTACGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTA 210
Query 121 GAAGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACT 180
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 GAGGCGGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACT 270
Query 181 GTTGATGGTTCTGTCAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTT 240
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 271 GTTGATGGTTCTCTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTTCTTTT 330
Query 241 TTGGAGTTTGGTGGAGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGG 300
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 331 CTGGAATTTGGTGGAGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGG 390
Query 301 AAAGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCA 360
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 391 AAAGATCCAGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCA 450
Query 361 CCGCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAAT 420
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 451 CCTCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAAT 510
Query 421 GTTTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGCGAAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTGTTCTCTATG 480
|| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 511 GTGTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTGAATGACAGTCGGTCTTTGTTCTCTATG 570
Query 481 CCACCTGGTTTTGAGGCTGAGAAAA-CTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGG 539
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 CCACCTGGTTTTGAGGCTG-GAAAACCTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGG 629
Query 540 ATTGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTT 599
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630 ATTGA-----TT----GGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTT 680
Query 600 TCAGGCGGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCG 659
|||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 681 TCAGGCGGATAT--GG---GG-CATCCTGTTGTACAGCAGCCCTCACGTCCTGCTAGTCG 734
Query 660 TAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGG 719
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 735 TAATACCTTTGATGAGAATGTTGACTCTAATAATAACCTGTCTCCATCTGCATCACAAGG 794
Query 720 TATTGGAGCGCCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAA 779
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 795 CATTGGAGCGCCATCTCCATACTGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCATCTTTGTCTAGAAA 854
Query 780 TGGAACTCCAGATCCACAGGCCGTTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACCCCCATTGG 839
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 855 TGGAACTCCAGATCCACAGGGCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCTTGCCTTACTCCCATTGG 914
Query 840 GAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTTAACGG 899
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 915 CAGTGGAAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTCAACGG 974
Query 900 TGTTACATCTGGTCTGGTTGAGTCTTCTGATCTCGCCGCTGCTTTATCTGGCTTGAACCT 959
||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||
Sbjct 975 TGTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCCGGCTTGAACCT 1034
Query 960 GTC-TGCAACTGGCGGGTTAGATGAACAG-AGTCAAGCTGAGCATGATGTCGAAAAGGTC 1017
||| || ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1035 GTCAGGC-ACTGGCGGGCTAGATGAAC-GTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTC 1092
Query 1018 AGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATGGGTTCCCA 1077
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1093 AGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGATGGGCATAATGAAGTCAATCCACATGGGTTCCCA 1152
Query 1078 AACAAACCTGATCAAGCCCCTAAGGGAACTGCTTCTTGGAGGAATTCACAGCTGAGAGGG 1137
|||| | ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||
Sbjct 1153 AACAGATCTGATCAAG---CTAGGGGAACTGCTTCGTGCAGGAATTCACAAATGAGAGGG 1209
Query 1138 TCACAAGGATCTGCCTACAATGGTGGAAGTGGACTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGAT 1197
|||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1210 TCACAAGGATCTGCATATAATAGTGGAAGTGGAGTAGCTAATCCTTACCAGCATCATGAT 1269
Query 1198 AGCCCAAACTATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCCAGTCAACTTGGA 1257
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 1270 AGCCCAAACTATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTTGGA 1329
Query 1258 ACTAATAACTATCCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGCGGCATCTGCTATGGGATTTTCT 1317
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||
Sbjct 1330 ACTAATAACTATTCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGC--CA-CT--T-TGGGATATTCT 1383
Query 1318 GGAATGGACTCAAGACTTCATGGTGGAGGTTTTGTTTCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAA 1377
| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 GCAATGGACTCCAGACTTCATGGTGGAAGTTTTGTTTCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAA 1443
Query 1378 TCACGAAATATTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCA 1437
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||
Sbjct 1444 TCACGAAATATTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTACGGGTCACCCGTCA 1503
Query 1438 CATATGGCAGACCCAATGTATCATCAGTATGCGAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTT 1497
||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1504 CATCTTGCAGACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTT 1563
Query 1498 GATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATG 1557
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1564 GATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATTCATACATGAATATG 1620
Query 1558 CTTGAACTTCAGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAA 1617
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 CTTGAAATTCAGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAA 1680
Query 1618 TCAGGGAGTCCTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCA 1677
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TCAGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCA 1740
Query 1678 TATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGC 1737
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1741 TATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTACAGC 1800
Query 1738 CCTATGAGACGAGGTGAAGTTAATATGCGATAT-CCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGG 1796
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1801 CCTATGAGACGAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCG-CTGCAACAAGAAACTATACTGG 1859
Query 1797 AGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAAT 1856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1860 AGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGATTTGGATCTTCAAT 1919
Query 1857 GCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCA 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCA 1979
Query 1917 TGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGAC 1976
|||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 TGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGAC 2039
Query 1977 AGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCT 2036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 2040 AGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAAAAGCTCTTGCCCT 2099
Query 2037 GATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACC 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACC 2159
Query 2097 ACAGAGGAGAGAATTGGGCGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGAT 2156
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 ACAGAGAAGAGAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGAT 2219
Query 2157 GTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAA 2216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2220 GTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATCCA 2279
Query 2217 AATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCA 2276
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 AATGGTCAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCA 2339
Query 2277 TGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAGGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGAC 2336
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2340 TGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGTTTATTATTTCAAC 2399
Query 2337 TTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAG 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400 TTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAG 2459
Query 2397 AGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGATGAAATCTTGAT 2456
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
Sbjct 2460 AGTATTGGAACACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTG-T 2518
Query 2457 T-ACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTGCTGG 2515
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 2519 CCACTGTTAGTATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTACTGG 2578
Query 2516 AGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTC 2575
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2579 AGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGGGGAAGATTGTTC 2638
Query 2576 AGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTC 2635
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2639 AGATGAGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGACTTTTGGAGGTC 2698
Query 2636 CTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTC 2695
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 CTGAGGAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTC 2758
Query 2696 TTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTGAGACAT 2755
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2759 TTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTGGAGACAT 2818
Query 2756 GCGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGA 2815
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |
Sbjct 2819 GTGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATCTGAATGCTCTAA 2878
Query 2816 AGAAGTACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAG 2875
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2879 AGAAATACACTTACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAG 2938
Query 2876 AGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGGGGCGTAAGGCCACAAGTCTT 2935
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2939 AGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAGGCCGCAAGTGTT 2998
Query 2936 GTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTA 2995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 GTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTA 3058
Query 2996 AACCAAAAATCTGCGGAGAAATTATAAAAGAGAGCTTTGTTTTGTTCTCCGCAAAATCTG 3055
|||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 AACCAAAAATCTGCGGAGAAATAATGAGAGAGAGCTTTGTTTTGTTCTCCGCAAAATCTG 3118
Query 3056 TACATTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACCAAAGATCCCCCTTAGGCT 3115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 TACATTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACCAAAGATCCCCCTTAGGCT 3178
Query 3116 GATGA-TGAGTAAG-TGAAAAAGGCAGAGAATGGTGTAAAGAAAAATGGTGAGGATTTTA 3173
||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GATGAGTGAGTGAGAT-AAAA-GGCAGAGAATGGTGTAAAGAAAAATGGTGAGGATTTTA 3236
Query 3174 GAGTTTTTCCTTTCACATGTACAAAAAGAATGGCTCTTGTGCCAATGTGTAGAATGCTTT 3233
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 GAGTTTTTCCTTTCACATGTACAAAAAGAATGGCTCTTACGCCAATGTGTAGAATGCTTT 3296
Query 3234 TTAGAACAATCCCAGTTTATTTCACGA 3260
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3297 TTAGAACAATCCCAGTTTATTTCACGA 3323
> AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-12553433
REVERSE LENGTH=3622
Length=3622
Score = 4348 bits (2354), Expect = 0.0
Identities = 2921/3185 (92%), Gaps = 77/3185 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGATACCGGAACTAGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 63
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 ATGATACCGGAACTAGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 223
Query 64 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 123
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 283
Query 124 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTTTAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 343
Query 184 GATGGTTCTGTCAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 243
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 344 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 403
Query 244 GAGTTTGGTGGAGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAAA 303
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 404 GAGTTTGGTGGTGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAAA 463
Query 304 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACCG 363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 464 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACCG 523
Query 364 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 423
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 524 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGTG 583
Query 424 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGCGAAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTGTTCTCTATGCCA 483
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 584 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAATCGATCTTTGTTCTCTATGCCA 643
Query 484 CCTGGTTTTG-AGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGATT 542
|| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 644 CCGGGTTTTGAAGG-TGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAATGGGATGCTAATGGATT 702
Query 543 GATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCA 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 GATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCA 762
Query 603 GGCGGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAA 662
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 GGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAACAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAA 822
Query 663 TACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGTAT 722
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 823 TACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAATAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGCAT 882
Query 723 TGGAGCGCCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGG 782
||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 883 TGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTAGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATGG 942
Query 783 AACTCCAGATCCACAGGCCGTTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACCCCCATTGGGAG 842
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 943 AACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAG 1002
Query 843 TGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTTAACGGTGT 902
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||
Sbjct 1003 TGGAAGAATGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAGAGCCCATTCAATGGTGT 1062
Query 903 TACATCTGGTCTGGTTGAGTCTTCTGATCTCGCCGCTGCTTTATCTGGCTTGAACCTGTC 962
||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 TACCTCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCTTGAACCTGTC 1122
Query 963 -TGCAACTGGCGGGTTAGATGAACAGAGTCAAGCTGAGCATGATGTCGAAAAGGTCAGGA 1021
||| | || ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1123 ATGC-AGTGTTGGGTTAGATGATCGGAGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGGA 1181
Query 1022 ACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATGGGTTCCCAAACA 1081
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1182 ACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAAGTCAATCAACATGAGTTCCCAAACA 1241
Query 1082 AACCTGATCAAGCCCCTAAGGGAACT-GCTTC-TTGGAGGAATTCACAGCTGAGAGGGTC 1139
|| |||||||||||| ||||| |||| || || || |||||||||||| |||||||| |
Sbjct 1242 AATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGC-TCGTT-GAGGAATTCACAATTGAGAGGGCC 1299
Query 1140 ACAAGGATCTGCCTACAATGGTGGAAG-TGGACTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGATA 1198
||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1300 ACACGGATCTGCCTATAATGGTGG-AGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCAACTTGATA 1358
Query 1199 GCCC-AA--A----CT-----ATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCCA 1246
|||| || | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1359 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCCTCTATGATGGCTA 1418
Query 1247 GTCAACTT-GGAACTAATAACTATCCTCCAATGTATGAAAATGCTTCTGCGGCATCTGCT 1305
|||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| | ||| |||
Sbjct 1419 ACCAACTTGGGAAC-AATAACTTTGCTCCAATGTATGATAATG----T-----ATCCGCT 1468
Query 1306 ATGGGATTTTCTGGAATGGACTCAAGACTTCATGGTGGAGGTTTTGTTTCTTCTGGTCAA 1365
|||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1469 TTGGGATTTTCTGGAATGGACTCTAGACATCATGGACGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAA 1528
Query 1366 AACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGTAGGGTCGGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACT 1425
||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1529 AACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCT 1588
Query 1426 GGTCTCCAGTCACATATGGCAGACCCAATGTATCATCAGTATGCGAGGTTCTCTGAAAAT 1485
||||||||||||||||||| |||||||||| | || | || | | | | ||
Sbjct 1589 GGTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATG--T-AT-A--AT-C-A-G-----T----AT 1630
Query 1486 GCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAGCTATATGGGT-AAT-- 1542
|||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| || ||||||| |
Sbjct 1631 GCTGATTCACTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCATGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCA 1690
Query 1543 TCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTTATCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTAT 1602
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 TCATACATGGATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTAT 1750
Query 1603 GGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCCATAGCTATTATGGTAGTCCAACATTT 1662
||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1751 GGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTT 1810
Query 1663 GGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCCTGGTATGCCAAATTCTCTT 1722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1811 GGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTT 1870
Query 1723 ATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGG-TGAAGTTAATATGCGATATCCGTCTGCAAC 1781
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 1871 ATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACG-GGATGAAGTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAAC 1929
Query 1782 AAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGG 1841
|||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1930 AAGAAATTATTCGGGAGGGTTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGG 1989
Query 1842 CTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACTTTC 1901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1990 CTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTC 2049
Query 1902 TGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATACGGGAGCCGGTTTATTCA 1961
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 2050 TGAAATAGCTGGCCATGTTGTGGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCA 2109
Query 1962 GCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCC 2021
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2110 GCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTCTATGAGGAGATCATGCC 2169
Query 2022 ACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGA 2081
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2170 ACAAGCTCTTGTCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGA 2229
Query 2082 GCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC-GAGAAACTCATTGACAATGTTTTGC 2140
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2230 GCATGGACTCCCGCCACAGAGGAGAGAATT-GGCAGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGC 2288
Query 2141 CTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATC 2200
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 CTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATC 2348
Query 2201 TAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTG 2260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2349 TAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTAATGCGATGTGTACGTG 2408
Query 2261 ATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAGGAAAACATCG 2320
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2409 ATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCG 2468
Query 2321 AGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGT 2380
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2469 AGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATATGGGT 2528
Query 2381 GCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTA 2440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2529 GCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTA 2588
Query 2441 TGGATGAAATCTTGATT-ACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTT 2499
|||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 TGGAAGAAATCCTG-TCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTT 2647
Query 2500 ATTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAAAGAGTTA 2559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2648 GTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAATTG 2707
Query 2560 GCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGT 2619
|| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708 GCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGT 2767
Query 2620 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACT 2679
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2768 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGCTGGGAACAACT 2827
Query 2680 GATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAA 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2828 GATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAG 2887
Query 2740 AAAGTCCTTG-AGACATGCGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGT 2798
||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||
Sbjct 2888 AAAGTT-TTGGAGACCTGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGT 2946
Query 2799 GCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAA 2858
|||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||
Sbjct 2947 GCATCTTACTGCTTTAAAAAAGTACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAA 3006
Query 2859 ACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTAACCCAGCCTCTGGGGGC 2918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||
Sbjct 3007 ACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGC 3066
Query 2919 GTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGA 2978
|||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||
Sbjct 3067 TTAAGACCTTAAGTAATGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGA 3126
Query 2979 GAATTAGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAAATTATAAAAGAGAGCTTTGT 3035
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | || |||||||||||
Sbjct 3127 GAATTAGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGGAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGT 3186
Query 3036 TTTGTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTT-CTTACCGTTTTGACTATACATAG 3093
||| | || || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3187 TTTCT-CT--GCTAAATCTGTAAAATTGTGTAGTTTGCTTACGGTTTTT-CTATACATAG 3242
Query 3094 AACCAAAGATCCCCCTT-AGGCTGATGA-TGAGTA-AGTGAAAAAGGCAGAGAATGGTGT 3150
||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3243 AACGAAACATCCCTCTTTAGGCTGATGAGTGAG-AGA-T-AAAAAGGCAGAGAATGGTGT 3299
Query 3151 AAAGA 3155
|||||
Sbjct 3300 AAAGA 3304
> AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-12548494
REVERSE LENGTH=3703
Length=3703
Score = 4169 bits (2257), Expect = 0.0
Identities = 2906/3204 (91%), Gaps = 106/3204 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 ATGATACCGGAACTAGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 63
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 337 ATGATACCGGAACTGGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGGAACGAAGATTCATCTTTTGGG 396
Query 64 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 456
Query 124 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 183
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAATTTGTATAGGAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 516
Query 184 GATGGTTCTGTCAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 243
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCTGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 576
Query 244 GAGTTTGGTGGAGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAAA 303
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 577 GAGTTTGGTGGAGGCAACAAGGGTAATGGGTTTGGTGGCGATGATGAGGAGTTTAGGAAA 636
Query 304 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACCG 363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 637 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACCG 696
Query 364 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 756
Query 424 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGCGAAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTGTTCTCTATGCCA 483
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 757 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGGAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTATTCTCTATGCCA 816
Query 484 CCTGGTTTTGA---G-G----C----TGAG----A-----A-AA--CTGGTGCTTCTGCT 519
||||||||||| | | | |||| | | || || |||||||| ||
Sbjct 817 CCTGGTTTTGATCAGAGGAAGCAGCATGAGTTTGAGGTTGAGAAAACTAGTGCTTCTTCT 876
Query 520 TCTGAGTGGGATGCTAATGGATTGATTGGTTTACCGGGTTTGGG-ACTTGGAGGCAAGCA 578
||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 877 TCTGAATGGGATGCTAATGGATTGATCGGTTTGCCGGGTTTGGGGA-TTGGAGGCAAGCA 935
Query 579 GAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCGGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGC-ACAGC 637
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct 936 GAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCACTA-AGC 994
Query 638 AGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATC 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 AGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAATC 1054
Query 698 TGTCTCCGTCTGCATCACAAGGTATTGGAGCGCCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTC 757
||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 TGTCTCCATCTGCATCGCAAGGCATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTC 1114
Query 758 TGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCGTTGCTAGGGTGCCTA 817
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1115 TGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTA 1174
Query 818 GTCCCTGTCTTACCCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAA 877
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 GTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAA 1234
Query 878 GTAATCAAAGCCCGTTTAACGGTGTTACATCTGGTCTGGTTGAGTCTTCTGATCTCGCCG 937
|||||||||||||||| ||||||| | || | | ||||||||||||| | |
Sbjct 1235 GTAATCAAAGCCCGTTCAACGGTGGG-C-TCAA--C-G----AGTCTTCTGATCTTGTCA 1285
Query 938 CTGCTTTATCTGGCTTGAACCTGTCTG-CAACTGGCGGGTTAGATGAACAGAG-TCAAGC 995
||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | | ||| ||
Sbjct 1286 ATGCTTTATCTGGCATGAACCTGTCTGGCAG-TGGCGGGTTAGATGAAC-GTGGTCAGGC 1343
Query 996 TGAGCATGATGTCGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGA 1055
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1344 TGAGCAAGATGTGGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGA 1403
Query 1056 AGTCAATCAACATGGGTTCCCAAACAAACCTGATCAAGCCCCTAAGGGAACTG-CTTCTT 1114
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||
Sbjct 1404 AGTCAATCAACATGGGTTCCCAAACAAATCTGATCAAGCCCAGAAGGCAACTGGCTTGTT 1463
Query 1115 GGAGGAATTCACAGCTGAGAGGGTCACAAGGATCTGCCTACAATGGTGGAAGTGGACTAG 1174
| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||
Sbjct 1464 G-AGGAATTCACAATTGAGAGGGGCACAAGGATCTACCTATAATGATGGAGGTGGAGTAG 1522
Query 1175 CTAATCCTTACCAGCATCTTGATAGCCCAAACTATT-----A----T---GCATTAAATC 1222
||| || |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||
Sbjct 1523 CTACTCAGTACCAGCATCTTGATAGCCCAAACTATTGTCTCAACAATTATGGATTAAATC 1582
Query 1223 CAGCTGTAGCTTCTATGATGGCCAGTCAACTTGGAACTAATAACTATCCTCCAATGTATG 1282
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1583 CAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTTGGAACTAATAACTATTCTCCAGTGTATG 1642
Query 1283 AAAATGCTTCTGCGGCATCTGCTATGGGATTTTCTGGAATGGACTCAAGACTTCATGGTG 1342
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1643 AAAATGCTTCTGCAGCATCTGCTATGGGATTTTCTGGAATGGATTCCAGACTTCATGGTG 1702
Query 1343 GAGGTTTTGTTTCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGTAGGGTCGGTA 1402
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || |||
Sbjct 1703 GAGGTTATGTATCATCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTA 1762
Query 1403 ATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATATGGCAGACCCAATGTATCATC 1462
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1763 ATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTTCAGTCACATATGGCAGATCCAATGTATCATC 1822
Query 1463 AGTATGCGAGGTTCTCTGAAAATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGG 1522
||||||| | || | | | | || |||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1823 AGTATGC----T-----GAT--T-C-G---C-TT-GATCTTCTCAATGATCCTTCCATGG 1864
Query 1523 ACAG-GAGCTATATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTTCAGAGGGCTTATCTC 1581
|| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1865 AC-GTGAACTTTATGGGTAATTCATACATGAATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTATCTT 1923
Query 1582 GGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCAGGGAGTCCTAACAGCCATAGC 1641
||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |
Sbjct 1924 GGAGCACAGAAATCACAGTACGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCACACC 1983
Query 1642 TATTATGGTAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCAT 1701
||||||| ||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||
Sbjct 1984 GATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTC-A-TAT--C----C-TGGCAGCCCATTGGCTCAT 2034
Query 1702 CCTGGTATGCCAAATTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAAT 1761
| | | |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 CATCTTCTGCCTAATTCTCTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAAT 2094
Query 1762 ATGCGATATCCGTCTGCAACAAGAAACTATTCCGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATG 1821
||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2095 ATGCGATATCCCTCTGCAACAAGAAACTACGCAGGAGGGGTAATGGGTTCCTGGCACATG 2154
Query 1822 GATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAA 1881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 GATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAA 2214
Query 1882 ACAAGAGGATTCGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAA 1941
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 ACAAGAGGATTCGAACTTGCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAG 2274
Query 1942 TACGGGAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATG 2001
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2275 TATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAAGTGATGAGAAAAACATG 2334
Query 2002 GTTTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTAT 2061
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 GTTTATGAGGAGATCATGCCACACGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTAT 2394
Query 2062 GTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGGAGAGAATTGGGC-GAGAA 2120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||
Sbjct 2395 GTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGG-CAGATAA 2453
Query 2121 ACTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAA 2180
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2454 ACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCCTACAGATGTATGGTTGTCGTGTTATTCAGAA 2513
Query 2181 GGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACA 2240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2514 GGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTCGATGGACA 2573
Query 2241 TGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATG 2300
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2574 TGTGATGCGATGCGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATG 2633
Query 2301 TGTGCCTGAGGAAAACATCGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCT 2360
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 2634 TGTGCCTGAAGAAAACATCGAATTTATTATTTCCACCTTCTTTGGCAATGTTGTGACCCT 2693
Query 2361 CTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCC 2420
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2694 CTCCACTCACCCATATGGGTGCCGAGTTATTCAGAGGGTATTGGAGCACTGCCATGACCC 2753
Query 2421 TGATACACAGAGTAAGGTTATGGATGAAATCTTGATTA-CTGTTAGTATGCTGGCCCAAG 2479
|||||| |||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||||||
Sbjct 2754 TGATACTCAGAGTAAGGTTATGGATGAAATCATG-TCAACTATTAGTATGCTGGCCCAAG 2812
Query 2480 ATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCA 2539
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
Sbjct 2813 ATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTATTGGAACACGGAAAGCCTGATGAGCGTA 2872
Query 2540 CCGTGATAATCAAAGAGTTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCAT 2599
| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 2873 CTGTGATTATCAAGGAATTAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCTT 2932
Query 2600 CAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGA 2659
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2933 CAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTTCTGGTAA 2992
Query 2660 ATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGT 2719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2993 ATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGT 3052
Query 2720 TTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTT-GAGACATGCGATGACCAACAGCGTGAACTG 2778
|||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3053 TTGCCAACTATGTAGTGCAAAAAGTT-TTAGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAGCTG 3111
Query 2779 ATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTTAATGCTTTGAAGAAGTACACTTATGGAAAGCAT 2838
|| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3112 ATCCTTGGTCGTATTAAAGTGCATCTCAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCAT 3171
Query 2839 ATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCA 2898
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3172 ATCGTTGCTCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATGGCTTTGCAGTCC 3231
Query 2899 TTAACCCAGCCTCTGGGGGCGTAAGGCCACAAGTCTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATG 2958
|||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 CTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATG 3291
Query 2959 GCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAA 3015
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||
Sbjct 3292 GCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAAATCTAAACCGGAAATAATCTGCGG-GAA 3350
Query 3016 A-TTATAAAAGAGAGCTTTGTTTTGTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTTCTT 3073
| || | || |||||||||||||| | || ||||| |||||| | |||||||||| |||
Sbjct 3351 AATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCT-CT--GCAAA-TCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTT 3406
Query 3074 ACCGTTTTGACTATACATAGAACCAAAGATCCCCCTT-AGGCTGATGA-TGAGTA-AGTG 3130
|| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | || | || |
Sbjct 3407 ACGGTTTTT-CTATACATAGAACCAAACATCCCACTTTAGGCTGATGAGTAAG-AGAG-G 3463
Query 3131 AAAAAGGCAGAGAATGGTGTAAAG 3154
||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3464 AAATATGCAGAGAATGGTGTAAAG 3487
> AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3215556
REVERSE LENGTH=3692
Length=3692
Score = 326 bits (176), Expect = 1e-87
Identities = 758/1029 (74%), Gaps = 80/1029 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 1897 CTTTCTGAAATAGCTGGCCATGTTG-TAGAGTTCAG-TTCGGATCAATACGGGAGCCGGT 1954
||||| ||||||| ||| |||| || | |||||||| | |||||| ||||| || | ||
Sbjct 2272 CTTTCAGAAATAGTTGGTCATG-TGATTGAGTTCAGCAT-GGATCAGTACGGAAGTC-GT 2328
Query 1955 TT-ATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGA-GAAAA-ACATGGTTTA-T-GA 2009
|| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||| | ||| || |
Sbjct 2329 TTCATTCAACAGAAACTTGAGACTG---CAACGGATGAGGAAAAGA-ATGCAATATTCCC 2384
Query 2010 GGAGATCA-TGCC--ACAAGCTC-TAGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGA 2065
||||| | | || || || | || | | ||||| || || |||||||| ||||| |
Sbjct 2385 TGAGAT-ACTTCCTTAC-GGC-CGTA-CTTTAATGACAGATGTCTTTGGAAATTATGTCA 2440
Query 2066 TTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCACC-A-CAGAGGAGAGAATTGGGC-GAGA-AA 2121
|||| ||||| ||||| ||||| | | ||| | ||||| | |||| | || || | ||
Sbjct 2441 TTCAAAAGTTTTTTGAACATGG--TACAACCAAGCAGAGAAAAGAACT-CGCTGA-ACAA 2496
Query 2122 CTCATTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCT-TACAGATGTATGGTTGTC-GTGTCATCCAGA 2179
| | | | | |||||| ||||| || |||| ||||| || || | | || ||||| |
Sbjct 2497 GTAACAGGCCACGTTTTGGCTCTT-TCTCTACAAATGTACGGCTG-CAGGGTTATCCAAA 2554
Query 2180 AGGCAATT-GAGGTGGTTG-ATCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGAT-G 2236
|||| || |||||||||| || | || ||| || | |||||||||||| |||||| |
Sbjct 2555 AGGC-GTTAGAGGTGGTTGAAT-TGGAGCAGCAAGCTCGAATGGTGAAAGAGCTTGATGG 2612
Query 2237 GACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATCG 2296
| | ||| ||| ||| || | ||| ||||| || || |||||| | || |||||||| |
Sbjct 2613 GTC-TGTCATGAAATGCGTTCATGACCAGAACGGTAATCATGTGATCCAGAAGTGTATAG 2671
Query 2297 AATGTGTGCCTGAGGAAAACAT-CGAGTTTATTATTTCGACTTTCTTTGGCCATGTGGTG 2355
| || | ||| |||| || | |||| || ||||| | |||| || | || |
Sbjct 2672 AGCGTCTTCCTCAGGATTGGATAC-AGTTCATCATTTCCTCATTCTACGGAAAAGT-TTT 2729
Query 2356 A-CCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAGTATTGGA--ACACTGC 2412
| | || || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| | | ||
Sbjct 2730 AGCTCTTTCAACACACCCTTATGGATGCCGTGTAATCCAGAGGGTACTGGAGCATATTG- 2788
Query 2413 CATGACCCT-GATACACAGA-GTAAGGTTATGGATGAAATC-TTGATTACTGT-TAGTA- 2467
|||| | || || || | | | ||||||| |||||| | |||| | || | |||
Sbjct 2789 -ATGA-TATAGAAACCCA-ACGGATCATTATGGAGGAAATCATGGATT-CAGTCT-GTAC 2843
Query 2468 TGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTATTCAGCATGTGC-TGGAGCATGG-AAA 2525
| || || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | | | | ||||| |||
Sbjct 2844 T-CTAGCACAAGATCAATACGGAAATTATGTTATCCAGCATAT-CATACAACATGGTAAA 2901
Query 2526 GCCTGATGAGCGCACCGTGATAATCAA-AGAG-TTAGCTGGAAAGATTGTTCAGATGAGC 2583
||| |||| || | | || ||||| | || || |||||| ||||||| |||||||
Sbjct 2902 -CCTCATGAACGGTCAGAAATTATCAATA-AGCTT-GCTGGACAGATTGTGAAGATGAGT 2958
Query 2584 CAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAA-TGTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGA 2642
||||| |||||||| || || |||||||| ||| || | || ||||| ||||| |||||
Sbjct 2959 CAGCAAAAGTTTGCTTCTAATGTTGTTGA-AAAGTGCCTAACATTTGGCGGTCCAGAGGA 3017
Query 2643 ACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGC-TGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGG 2701
||| | |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3018 ACGTCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGTTA-TACTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGG 3076
Query 2702 CGATGATGAAGGATC-AGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAGTCCTTGAGACATGCGAT 2760
||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||
Sbjct 3077 CGATGATGAAGGACCCA-TTTGGGAACTATGTAGTGCAGAAGGTTCTTGAAACATGTGAT 3135
Query 2761 GACCAACAG-CGTGAACTGATACTTACTCGTATTAAGGTGCATCTT-AATGCTTTGAAGA 2818
|| ||| || | || ||| || ||| |||| || || || || ||| ||||| |||||||
Sbjct 3136 GATCAA-AGTCTTGCACTCATTCTTTCTCGCATCAAAGTACA-CTTGAATGCCTTGAAGA 3193
Query 2819 -AGTACACTTATGG-AAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGA 2876
| ||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || | || |||||||
Sbjct 3194 GA-TACACATATGGGAAA-CACATCGTTGCCCGGGTTGAGAAGCTTATCACTACTGGAGA 3251
Query 2877 GAGGAGAAT 2885
||| |||||
Sbjct 3252 GAGAAGAAT 3260
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162189726719
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5