BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg481838 Length=3108 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-... 4913 0.0 AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-... 4590 0.0 AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-... 4287 0.0 AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3... 298 2e-79 > AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-12553433 REVERSE LENGTH=3622 Length=3622 Score = 4913 bits (2660), Expect = 0.0 Identities = 2976/3125 (95%), Gaps = 36/3125 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 164 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 222 Query 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 223 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 282 Query 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 283 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTTTAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 342 Query 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 343 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 402 Query 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296 ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 403 GGAGTTTGGTGGTGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 462 Query 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 463 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 522 Query 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 523 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 582 Query 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 583 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAATCGATCTTTGTTCTCTATGCC 642 Query 477 ACCTGGTTTTG-AGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535 ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 643 ACCGGGTTTTGAAGG-TGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAATGGGATGCTAATGGAT 701 Query 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 702 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 761 Query 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCTCAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 655 |||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 762 AGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAACAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 821 Query 656 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGCA 715 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 822 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAATAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGCA 881 Query 716 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 775 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 882 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTAGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 941 Query 776 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 942 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 1001 Query 836 GTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGTG 895 |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| Sbjct 1002 GTGGAAGAATGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAGAGCCCATTCAATGGTG 1061 Query 896 TTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTGT 955 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1062 TTACCTCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCTTGAACCTGT 1121 Query 956 C-TGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTG-GTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1013 | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1122 CAT-GCAGTGTTGGGTTAGATGATCG-GAGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1179 Query 1014 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATAG-GTTCCCAA 1072 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| Sbjct 1180 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAAGTCAATCAACAT-GAGTTCCCAA 1238 Query 1073 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1239 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGAATTCACAATTGAGAGGGC 1298 Query 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGATA 1192 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1299 CACACGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCAACTTGATA 1358 Query 1193 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTA 1252 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1359 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCCTCTATGATGGCTA 1418 Query 1253 ACCAACTTGGGAACAATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATGTATCCGCAGCATCCGCTT 1312 ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||||||| Sbjct 1419 ACCAACTTGGGAACAATAACTTTGCTCCAATGTATGATAATG--T-------ATCCGCTT 1469 Query 1313 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1372 |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1470 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCTAGACATCATGGACGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1529 Query 1373 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTG 1432 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1530 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCTG 1589 Query 1433 GTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATGTATCATCAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTC 1492 |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1590 GTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATGTATAATCAGTATGCTGATTCACTTGATCTTC 1649 Query 1493 TCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGT-AAT--TCATACAT-GAGTATGCTT 1548 ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| || ||||||| Sbjct 1650 TCAATGATCCTTCCATGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCATCATACATGGA-TATGCTT 1708 Query 1549 GAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCC 1608 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 1709 GAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTGTCCCTTACAAATCC 1768 Query 1609 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAACATATCATAT 1668 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 1769 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATAT 1828 Query 1669 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTGTGTCACCCTGTAGCCCT 1728 |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| Sbjct 1829 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCT 1888 Query 1729 ATGAGACGAGG-TGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAAGAAATTATTCGGGAGG 1787 |||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1889 ATGAGACG-GGATGAAGTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAACAAGAAATTATTCGGGAGG 1947 Query 1788 AG-TAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 1846 | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1948 -GTTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 2006 Query 1847 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTGAAATAGCTGGCCATG 1906 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2007 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATG 2066 Query 1907 TTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 1966 |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2067 TTGTGGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 2126 Query 1967 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACATGCTCATGCCCTGA 2026 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| Sbjct 2127 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTCTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTTGTCCTGA 2186 Query 2027 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2086 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2187 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2246 Query 2087 AGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2146 |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2247 AGAGGAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2306 Query 2147 ATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2206 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2307 ATGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2366 Query 2207 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAATCATG 2266 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2367 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATG 2426 Query 2267 TGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2326 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2427 TGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2486 Query 2327 TCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTAATTCAGAGAG 2386 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 2487 TCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAG 2546 Query 2387 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTTTCCA 2446 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2547 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCA 2606 Query 2447 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2506 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2607 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2666 Query 2507 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2667 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAATTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2726 Query 2567 TGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2626 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2727 TGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2786 Query 2627 AGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2686 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2787 AGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGCTGGGAACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2846 Query 2687 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACATGTG 2746 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2847 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACCTGTG 2906 Query 2747 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTAATGCTTTAAAGA 2806 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct 2907 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTACTGCTTTAAA-A 2965 Query 2807 AA-TACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 2865 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2966 AAGTACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 3025 Query 2866 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGT 2925 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||| Sbjct 3026 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGCTTAAGACCTTAAGTAATGT 3085 Query 2926 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 2985 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3086 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 3145 Query 2986 CCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGC-AAGATCTGT 3044 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 3146 CCGGAAATAATCTGCGGGGAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGCTAA-ATCTGT 3204 Query 3045 AAAATTGTGTAGTT-GCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACCAAACATCCCACTTTAGGC 3103 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 3205 AAAATTGTGTAGTTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACGAAACATCCCTCTTTAGGC 3264 Query 3104 TGATG 3108 ||||| Sbjct 3265 TGATG 3269 > AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-12548494 REVERSE LENGTH=3703 Length=3703 Score = 4590 bits (2485), Expect = 0.0 Identities = 2934/3143 (93%), Gaps = 62/3143 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATACCGGAACTGGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 60 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 337 ATGATACCGGAACTGGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGGAACGAAGATTCATCTTTTGGG 396 Query 61 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 397 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 456 Query 121 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 180 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 457 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAATTTGTATAGGAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 516 Query 181 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 240 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 517 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCTGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 576 Query 241 GAG-TT--TGGCGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAAA 297 ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 577 GAGTTTGGTGGAGGCAACAAGGGTAATGGGTTTGGTGGCGATGATGAGGAGTTTAGGAAA 636 Query 298 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACCG 357 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 637 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACCG 696 Query 358 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 417 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 697 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 756 Query 418 TTAGGTGGTGTTGGGGAT---AGG--AG--AA--A-AGTTAA---TGATAGTC---G--A 459 |||||||||||||||||| ||| || || | ||| || | || || | | Sbjct 757 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGGAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTATTCTCTATGCCA 816 Query 460 TCT--TTGTT-CTC-TATG--CCA-CCTG-GTTTTGAGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTG 511 || || || || | | || | || | ||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 817 CCTGGTT-TTGATCAGAGGAAGCAGCATGAG-TTTGAGGTTGAGAAAACTAGTGCTTCTT 874 Query 512 CTTCTGAGTGGGATGCTAATGGATTGATTGGTTTACCGGGTTT-GGGACTTGGAGGCAAG 570 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 875 CTTCTGAATGGGATGCTAATGGATTGATCGGTTTGCCGGGTTTGGGGA-TTGGAGGCAAG 933 Query 571 CAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCTCAG 630 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || Sbjct 934 CAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCACTAAG 993 Query 631 CAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAAT 690 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 994 CAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAAT 1053 Query 691 CTGTCTCCATCTGCATCACAAGGCATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTT 750 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1054 CTGTCTCCATCTGCATCGCAAGGCATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTT 1113 Query 751 CTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCT 810 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1114 CTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCT 1173 Query 811 AGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACA 870 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1174 AGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACA 1233 Query 871 AGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGTGTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTC 930 ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1234 AGTAATCAAAGCCCGTTCAACGGTG--------GG-CTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTC 1284 Query 931 AATGCTTTATCTGGCATGAACCTGTCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCT 990 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1285 AATGCTTTATCTGGCATGAACCTGTCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCT 1344 Query 991 GAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAA 1050 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1345 GAGCAAGATGTGGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAA 1404 Query 1051 GTCAATCAACATAGGTTCCCAAACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTG 1110 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| Sbjct 1405 GTCAATCAACATGGGTTCCCAAACAAATCTGATCAAGCCCAGAAGGCAACTGGCTTGTTG 1464 Query 1111 AGGGATTCACAATTGAGAGGGCCACAAGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCT 1170 ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| Sbjct 1465 AGGAATTCACAATTGAGAGGGGCACAAGGATCTACCTATAATGATGGAGGTGGAGTAGCT 1524 Query 1171 AATCCTTACCAGCATCTTGATAGCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCA 1230 | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1525 ACTCAGTACCAGCATCTTGATAGCCCAAACTATTGTCTCAACAATTATGGATTAAATCCA 1584 Query 1231 GCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTTGGGAAC-AATAATTTTTCTCCAATGTACGA 1289 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| || Sbjct 1585 GCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTT-GGAACTAATAACTATTCTCCAGTGTATGA 1643 Query 1290 TAATG-TATCCGCAGCATCCGCTTTGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAG 1348 |||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 1644 AAATGCT-TCTGCAGCATCTGCTATGGGATTTTCTGGAATGGATTCCAGACTTCATGGTG 1702 Query 1349 GAGGCTT-TGTATCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGT 1407 |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1703 GAGG-TTATGTATCATCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGT 1761 Query 1408 AATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATGTATCAT 1467 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1762 AATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTTCAGTCACATATGGCAGATCCAATGTATCAT 1821 Query 1468 CAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGT 1527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| Sbjct 1822 CAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCATGGACGTGAACTTTATGGGT 1881 Query 1528 AATTCATACATGAGTATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAG 1587 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1882 AATTCATACATGAATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCACAGAAATCACAG 1941 Query 1588 TATGGTCTTCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACA 1647 || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 1942 TACGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCACACCGATTATGGGAGTCCAACA 2001 Query 1648 TTTGGGTCTAACATATCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCT 1707 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2002 TTTGGG---------TCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCTAATTCT 2052 Query 1708 CTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCA 1767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2053 CTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAATATGCGATATCCCTCTGCA 2112 Query 1768 GCAAGAAATTATTCGGGAGGAGTAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAA 1827 ||||||| || | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2113 ACAAGAAACTACGCAGGAGGGGTAATGGGTTCCTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAA 2172 Query 1828 GGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTC 1887 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2173 GGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACT- 2231 Query 1888 T-CTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTAT 1946 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2232 TGCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTAT 2291 Query 1947 TCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCAT 2006 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2292 TCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAAGTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCAT 2351 Query 2007 GCCACATGCTCATGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTT 2066 |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2352 GCCACACGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTT 2411 Query 2067 TGAGCATGGACTCCCGCCACAGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTT 2126 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2412 TGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGGCAGATAAACTCTTTGACAATGTTTT 2471 Query 2127 GCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGA 2186 |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2472 GCCTCTTAGCCTACAGATGTATGGTTGTCGTGTTATTCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGA 2531 Query 2187 TCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACG 2246 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2532 TCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTCGATGGACATGTGATGCGATGCGTACG 2591 Query 2247 TGATCAGAATGGGAATCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT 2306 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2592 TGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT 2651 Query 2307 CGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGTC-ATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACG 2365 ||| ||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2652 CGAATTTATTATTTCCACCTTCTTTGG-CAATGTTGTGACCCTCTCCACTCACCCATATG 2710 Query 2366 GGTGCCGTGTAATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGG 2425 ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2711 GGTGCCGAGTTATTCAGAGGGTATTGGAGCACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGG 2770 Query 2426 TTATGGAAGAAATCCTTTCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATG 2485 ||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2771 TTATGGATGAAATCATGTCAACTATTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATG 2830 Query 2486 TTGTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGT 2545 || |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | Sbjct 2831 TTATTCAGCATGTATTGGAACACGGAAAGCCTGATGAGCGTACTGTGATTATCAAGGAAT 2890 Query 2546 TGGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAAT 2605 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2891 TAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCTTCAAACGTTGTTGAGAAAT 2950 Query 2606 GTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAA 2665 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2951 GTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTTCTGGTAAATGAGATGCTGGGCACAA 3010 Query 2666 CTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGC 2725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3011 CTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCCAACTATGTAGTGC 3070 Query 2726 AGAAAGTTTTGGAGACATGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAG 2785 | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||| Sbjct 3071 AAAAAGTTTTAGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAGCTGATCCTTGGTCGTATTAAAG 3130 Query 2786 TGCATCTTAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAA 2845 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| Sbjct 3131 TGCATCTCAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCTCGTGTTGAAA 3190 Query 2846 AACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGG 2905 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3191 AACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGG 3250 Query 2906 CGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTG 2965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3251 CGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTG 3310 Query 2966 AGAATTAGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTG 3025 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3311 AGAATTAGGTAAAATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTG 3370 Query 3026 TTTTCTCTGCAAGATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACC 3085 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3371 TTTTCTCTGCAA-ATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACC 3429 Query 3086 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3108 ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3430 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3452 > AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-12535399 FORWARD LENGTH=3324 Length=3324 Score = 4287 bits (2321), Expect = 0.0 Identities = 2884/3143 (92%), Gaps = 89/3143 (3%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59 |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 94 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 152 Query 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 153 GGATGATTACGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 212 Query 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 213 GGCGGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 272 Query 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 273 TGATGGTTCTCTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTTCTTTTCT 332 Query 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296 ||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 333 GGAATTTGGTGGAGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 392 Query 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 393 AGATCCAGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 452 Query 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 453 TCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 512 Query 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 513 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTGAATGACAGTCGGTCTTTGTTCTCTATGCC 572 Query 477 ACCTGGTTTTGAGGCTGAGAAAA-CTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 573 ACCTGGTTTTGAGGCTG-GAAAACCTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 631 Query 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595 ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 632 TGA-----TT----GGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 682 Query 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCT-CAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGT 654 |||||||||| || || ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 683 AGGCGGATAT--GG---GG-CATCCTGTTG-TACAGCAGCCCTCACGTCCTGCTAGTCGT 735 Query 655 AATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 714 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 736 AATACCTTTGATGAGAATGTTGACTCTAATAATAACCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 795 Query 715 ATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAAT 774 ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 796 ATTGGAGCGCCATCTCCATACTGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCATCTTTGTCTAGAAAT 855 Query 775 GGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGG 834 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| Sbjct 856 GGAACTCCAGATCCACAGGGCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCTTGCCTTACTCCCATTGGC 915 Query 835 AGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGT 894 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 916 AGTGGAAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTCAACGGT 975 Query 895 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTG 954 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 976 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCCGGCTTGAACCTG 1035 Query 955 TCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1014 || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1036 TCAGGCACTGGCGGGCTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1095 Query 1015 AACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATAGGTTCCCAAAC 1074 |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 1096 AACTATATGTTTGGACTGCAAGATGGGCATAATGAAGTCAATCCACATGGGTTCCCAAAC 1155 Query 1075 AAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGC-TCGTTG-AGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132 | ||||||||||| | || || |||| || ||| || ||| |||||||| |||||||| Sbjct 1156 AGATCTGATCAAG--C-TAGGGGAACT-GCTTCG-TGCAGGAATTCACAAATGAGAGGGT 1210 Query 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGG-AGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGAT 1191 ||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1211 CACAAGGATCTGCATATAATAGTGGAAG-TGGAGTAGCTAATCCTTACCAGCATCATGAT 1269 Query 1192 AGCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1251 ||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1270 AGCCC-AA--A----CT-----ATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1317 Query 1252 AACCAACTTGGGAAC-AATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATG-TATCCGCAGCATCCG 1309 ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||| | || || || Sbjct 1318 AACCAACTT-GGAACTAATAACTATTCTCCAATGTATGAAAATGCT-TCTGC--CA---- 1369 Query 1310 CTTTGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTC 1369 ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| Sbjct 1370 CTTTGGGATATTCTGCAATGGACTCCAGACTTCATGGTGGAAGTTTTGTTTCTTCTGGTC 1429 Query 1370 AAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTA 1429 ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1430 AAAACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTA 1489 Query 1430 CTGGTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATG--T-ATC---AT-C-A-G-----T---- 1471 | |||| || ||||||| | || ||||| ||| | ||| || | | | | Sbjct 1490 CGGGTCACCCGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAA 1549 Query 1472 ATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGTAATT 1531 ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||| Sbjct 1550 ATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATT 1606 Query 1532 CATACATGAGTATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATG 1591 ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1607 CATACATGAATATGCTTGAAATTCAGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATG 1666 Query 1592 GTCTTCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTG 1651 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 1667 GTCTTCCTTACAAATCAGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTG 1726 Query 1652 GGTCTAACATATCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTG 1711 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| Sbjct 1727 GGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTA 1786 Query 1712 TGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAA 1771 ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1787 TGTCACCTTACAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCGCTGCAACAA 1846 Query 1772 GAAATTATTCGGGAGGAGTAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCT 1831 |||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1847 GAAACTATACTGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGAT 1906 Query 1832 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTG 1891 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| Sbjct 1907 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTG 1966 Query 1892 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 1951 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1967 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 2026 Query 1952 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAC 2011 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2027 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAA 2086 Query 2012 ATGCTCATGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2071 | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2087 AAGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2146 Query 2072 ATGGACTCCCGCCACAGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTC 2131 |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2147 ATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTC 2206 Query 2132 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2191 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2207 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2266 Query 2192 ACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2251 |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2267 ACCAGAAAATCCAAATGGTCAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2326 Query 2252 AGAATGGGAATCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGT 2311 |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2327 AGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGT 2386 Query 2312 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2371 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2387 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2446 Query 2372 GTGTAATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGG 2431 |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2447 GTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGG 2506 Query 2432 AAGAAATCCTTTCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTC 2491 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2507 AAGAAATCCTGTCCACTGTTAGTATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTC 2566 Query 2492 AGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGG 2551 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2567 AGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGG 2626 Query 2552 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGA 2611 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2627 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGA 2686 Query 2612 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2671 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2687 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2746 Query 2672 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAG 2731 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2747 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAG 2806 Query 2732 TTTTGGAGACATGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATC 2791 | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| Sbjct 2807 TCCTGGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATC 2866 Query 2792 TTAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCG 2851 | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 2867 TGAATGCTCTAAAGAAATACACTTACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCG 2926 Query 2852 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAG 2911 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| Sbjct 2927 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAG 2986 Query 2912 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATT 2971 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2987 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 3046 Query 2972 AGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGG-GAAA-ATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTT 3029 |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | || || | ||||||||||||| Sbjct 3047 AGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAAATAATGAGA-G-AGAGCTTTGTTTT 3101 Query 3030 CT-CT--GCAAGATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTT-CTATACATAGAACC 3085 | || |||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 3102 GTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACC 3160 Query 3086 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3108 ||| ||||| ||| ||||||||| Sbjct 3161 AAAGATCCCCCTT-AGGCTGATG 3182 > AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3215556 REVERSE LENGTH=3692 Length=3692 Score = 298 bits (161), Expect = 2e-79 Identities = 770/1053 (73%), Gaps = 86/1053 (8%) Strand=Plus/Plus Query 1864 AACAAAACAAGAGGATTT-GAACTCTCTGAAATAGCTGGCCATGTTG-TAGAGTTCAG-T 1920 ||||| ||||| | ||| || || || ||||||| ||| |||| || | |||||||| Sbjct 2251 AACAAGACAAG-GTCTTTGGAGCTTTCAGAAATAGTTGGTCATG-TGATTGAGTTCAGCA 2308 Query 1921 TCGGATCAATATGGAAGCCGGTTT-ATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGA 1979 | |||||| || ||||| | |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| ||||| Sbjct 2309 T-GGATCAGTACGGAAGTC-GTTTCATTCAACAGAAACTTGAGACTG---CAACGGATGA 2363 Query 1980 -GAAAA-ACATGGTTTA-T-GAGGAGATCA-TGCC--ACATGCTCATGCCCTGATGACTG 2032 ||||| | ||| || | ||||| | | || || || | | | | ||||| | Sbjct 2364 GGAAAAGA-ATGCAATATTCCCTGAGAT-ACTTCCTTAC-GGC-CGTACTTTAATGACAG 2419 Query 2033 ACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCC-A-CAGAG 2090 | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | | || | ||||| Sbjct 2420 ATGTCTTTGGAAATTATGTCATTCAAAAGTTTTTTGAACATGG--TACAACCAAGCAGAG 2477 Query 2091 AAGAGAATTGGCAGAGA-AACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCT-TACAGATGTAT 2148 || |||| | || || | || | | | | |||||| ||||| || |||| ||||| Sbjct 2478 AAAAGAACTCGCTGA-ACAAGTAACAGGCCACGTTTTGGCTCTT-TCTCTACAAATGTAC 2535 Query 2149 GGTTGTC-GTGTCATCCAGAAGGCAATT-GAGGTGGTTG-ATCTAGACCAGAAAATTAAA 2205 || || | | || ||||| ||||| || |||||||||| || | || ||| || | | Sbjct 2536 GGCTG-CAGGGTTATCCAAAAGGC-GTTAGAGGTGGTTGAAT-TGGAGCAGCAAGCTCGA 2592 Query 2206 ATGGTGAAAGAACTTGAT-GGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAATCA 2264 ||||||||||| |||||| || | ||| ||| ||| || | ||| ||||| || ||||| Sbjct 2593 ATGGTGAAAGAGCTTGATGGGTC-TGTCATGAAATGCGTTCATGACCAGAACGGTAATCA 2651 Query 2265 TGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT-CGAGTTTATTATTTCAA 2323 |||| | || |||||||| || || | ||| | || || | |||| || ||||| Sbjct 2652 TGTGATCCAGAAGTGTATAGAGCGTCTTCCTCAGGATTGGATAC-AGTTCATCATTTCCT 2710 Query 2324 CTTTCTTTGGTCATGTGGTGA-CCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTAATTCAG 2382 | |||| || | || | | | || || || ||||| || || ||||||||||| ||| Sbjct 2711 CATTCTACGGAAAAGT-TTTAGCTCTTTCAACACACCCTTATGGATGCCGTGTAATCCAG 2769 Query 2383 AGAGTATTGGA--ACACTGCCATGACCCT-GATACTCAGA-GTAAGGTTATGGAAGAAAT 2438 || ||| |||| | | || |||| | || || || | | | ||||||| ||||| Sbjct 2770 AGGGTACTGGAGCATATTG--ATGA-TATAGAAACCCA-ACGGATCATTATGGAGGAAAT 2825 Query 2439 CCT---TTCCACTGT-TAGTA-TGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAG 2493 | | || || || | ||| | || || |||||||| |||||||| |||||| | ||| Sbjct 2826 CATGGATT-CA--GTCT-GTACT-CTAGCACAAGATCAATACGGAAATTATGTTATCCAG 2880 Query 2494 CATGTGC-TGGAGCATGG-AAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAA-AGAG-TTGGC 2549 ||| | | | | ||||| ||| ||| |||| || | | || ||||| | || || || Sbjct 2881 CATAT-CATACAACATGGTAAA-CCTCATGAACGGTCAGAAATTATCAATA-AGCTT-GC 2936 Query 2550 GGGGA-AGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAA-TGT 2607 ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| || Sbjct 2937 -TGGACAGATTGTGAAGATGAGTCAGCAAAAGTTTGCTTCTAATGTTGTTGA-AAAGTGC 2994 Query 2608 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGC-TGGGCACAAC 2666 | || ||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||| | || Sbjct 2995 CTAACATTTGGCGGTCCAGAGGAACGTCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGTTA-TAC 3053 Query 2667 TGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATC-AGTTTGCAAACTATGTAGTGC 2725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| Sbjct 3054 TGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGACCCA-TTTGGGAACTATGTAGTGC 3112 Query 2726 AGAAAGTT-TTGGAGACATGTGATGACCAACAA-CGTG-AGCTGATACTTACTCGCATCA 2782 |||| ||| ||| | ||||||||||| ||| | | || | || || ||| ||||||||| Sbjct 3113 AGAAGGTTCTTGAA-ACATGTGATGATCAA-AGTCTTGCA-CTCATTCTTTCTCGCATCA 3169 Query 2783 AAGTGCATCTT-AATGCTTTAAAGAAATACACTTATGG-AAAGCATGTCGTTGCGCGTAT 2840 |||| || ||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||| || ||||||| || | Sbjct 3170 AAGTACA-CTTGAATGCCTTGAAGAGATACACATATGGGAAA-CACATCGTTGCCCGGGT 3227 Query 2841 TGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAAT 2873 ||| || || | || |||||||||| ||||| Sbjct 3228 TGAGAAGCTTATCACTACTGGAGAGAGAAGAAT 3260 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 154564351383 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5