BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg481838
Length=3108
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-... 4913 0.0
AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-... 4590 0.0
AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-... 4287 0.0
AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3... 298 2e-79
> AT2G29200.1 | Symbols: APUM1, PUM1 | pumilio 1 | chr2:12548931-12553433
REVERSE LENGTH=3622
Length=3622
Score = 4913 bits (2660), Expect = 0.0
Identities = 2976/3125 (95%), Gaps = 36/3125 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 164 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 222
Query 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 282
Query 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTTTAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 342
Query 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 402
Query 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296
||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 403 GGAGTTTGGTGGTGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 462
Query 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 463 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 522
Query 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 523 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 582
Query 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 583 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAATCGATCTTTGTTCTCTATGCC 642
Query 477 ACCTGGTTTTG-AGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535
||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 643 ACCGGGTTTTGAAGG-TGAGAAAACTGGTGCTTCTGCTTCTGAATGGGATGCTAATGGAT 701
Query 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 761
Query 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCTCAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 655
|||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 AGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCGCACAACAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTA 821
Query 656 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGCA 715
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 822 ATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAATAATAATCTGTCTCCGTCTGCATCACAAGGCA 881
Query 716 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTAGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATG 941
Query 776 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 GAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGA 1001
Query 836 GTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGTG 895
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1002 GTGGAAGAATGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAGAGCCCATTCAATGGTG 1061
Query 896 TTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTGT 955
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1062 TTACCTCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCTTGAACCTGT 1121
Query 956 C-TGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTG-GTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1013
| | |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122 CAT-GCAGTGTTGGGTTAGATGATCG-GAGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAG 1179
Query 1014 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATAG-GTTCCCAA 1072
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1180 GAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAAGTCAATCAACAT-GAGTTCCCAA 1238
Query 1073 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1239 ACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTGAGGAATTCACAATTGAGAGGGC 1298
Query 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGATA 1192
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1299 CACACGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCAACTTGATA 1358
Query 1193 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCTA 1252
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1359 GCCCAAATTATTGTCTCAACAATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCCTCTATGATGGCTA 1418
Query 1253 ACCAACTTGGGAACAATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATGTATCCGCAGCATCCGCTT 1312
||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||
Sbjct 1419 ACCAACTTGGGAACAATAACTTTGCTCCAATGTATGATAATG--T-------ATCCGCTT 1469
Query 1313 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1372
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 TGGGATTTTCTGGAATGGACTCTAGACATCATGGACGAGGCTTTGTATCTTCTGGTCAAA 1529
Query 1373 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTACTG 1432
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1530 ACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTGCTG 1589
Query 1433 GTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATGTATCATCAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTC 1492
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1590 GTCTCCAGTCACATATGGTAGACCCAATGTATAATCAGTATGCTGATTCACTTGATCTTC 1649
Query 1493 TCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGT-AAT--TCATACAT-GAGTATGCTT 1548
||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||| || |||||||
Sbjct 1650 TCAATGATCCTTCCATGGATAGGAACTTTATGGGTGGTTCATCATACATGGA-TATGCTT 1708
Query 1549 GAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTCTTCCTTACAAATCC 1608
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1709 GAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCTCAGAAATCACAGTATGGTGTCCCTTACAAATCC 1768
Query 1609 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAACATATCATAT 1668
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1769 GGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGGAGTCCAACATTTGGGTCTAATATGTCATAT 1828
Query 1669 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTGTGTCACCCTGTAGCCCT 1728
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| | |||||||
Sbjct 1829 CCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTATGTCACCTTATAGCCCT 1888
Query 1729 ATGAGACGAGG-TGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAAGAAATTATTCGGGAGG 1787
|||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1889 ATGAGACG-GGATGAAGTTAATATGCGATTTCCTTCTGCAACAAGAAATTATTCGGGAGG 1947
Query 1788 AG-TAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 1846
| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 -GTTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTTGATGAAGGCTTTGGATCTTCAATGC 2006
Query 1847 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTGAAATAGCTGGCCATG 1906
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2007 TTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTTTCTGAAATAGCTGGCCATG 2066
Query 1907 TTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 1966
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 TTGTGGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGCTTTATTCAGCAGAAACTCGAGACAG 2126
Query 1967 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCACATGCTCATGCCCTGA 2026
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||
Sbjct 2127 CAACAACTGATGAGAAAAACATGGTCTATGAGGAGATCATGCCACAAGCTCTTGTCCTGA 2186
Query 2027 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187 TGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCCAC 2246
Query 2087 AGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2146
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247 AGAGGAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACCATGTTTTGCCTCTTAGCTTACAGATGT 2306
Query 2147 ATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2206
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2307 ATGGTTGCCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAGACCAGAAAATTAAAA 2366
Query 2207 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAATCATG 2266
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2367 TGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTAATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAACCATG 2426
Query 2267 TGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2326
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2427 TGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGTTTATTATTTCAACTT 2486
Query 2327 TCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTAATTCAGAGAG 2386
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2487 TCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATATGGGTGCCGTGTTATTCAGAGAG 2546
Query 2387 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTTTCCA 2446
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2547 TATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGGAAGAAATCCTGTCCA 2606
Query 2447 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2506
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2607 CTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTCAGCATGTGCTGGAGC 2666
Query 2507 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2667 ATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAATTGGCGGGGAAGATTGTTCAGA 2726
Query 2567 TGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2626
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 TGAGCCAGCAGAAGTTCGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGACTTTTGGAGGTCCTG 2786
Query 2627 AGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2686
||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787 AGGAACGAGAATTGCTTGTGAATGAGATGCTGGGAACAACTGATGAAAACGAGCCTCTTC 2846
Query 2687 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACATGTG 2746
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2847 AGGCGATGATGAAGGATCAGTTCGCAAACTATGTAGTGCAGAAAGTTTTGGAGACCTGTG 2906
Query 2747 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTAATGCTTTAAAGA 2806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2907 ATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATCTTACTGCTTTAAA-A 2965
Query 2807 AA-TACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 2865
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2966 AAGTACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAG 3025
Query 2866 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAGGCCGCAAGTGTTGT 2925
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||
Sbjct 3026 AGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCCCAGATGGCTTAAGACCTTAAGTAATGT 3085
Query 2926 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 2985
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 ACAGCTTAACTAGGGTGGATGGGGCTGCCGTAGCGTTTTGAGAATTAGGTAAGATCTAAA 3145
Query 2986 CCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGC-AAGATCTGT 3044
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3146 CCGGAAATAATCTGCGGGGAAATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTTCTCTGCTAA-ATCTGT 3204
Query 3045 AAAATTGTGTAGTT-GCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACCAAACATCCCACTTTAGGC 3103
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3205 AAAATTGTGTAGTTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACGAAACATCCCTCTTTAGGC 3264
Query 3104 TGATG 3108
|||||
Sbjct 3265 TGATG 3269
> AT2G29190.1 | Symbols: APUM2, PUM2 | pumilio 2 | chr2:12543812-12548494
REVERSE LENGTH=3703
Length=3703
Score = 4590 bits (2485), Expect = 0.0
Identities = 2934/3143 (93%), Gaps = 62/3143 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATACCGGAACTGGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGGG 60
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 337 ATGATACCGGAACTGGGGAGAAGACCGATGCATAGAGGGAACGAAGATTCATCTTTTGGG 396
Query 61 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397 GATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGAA 456
Query 121 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 180
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 457 GCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAATTTGTATAGGAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGTT 516
Query 181 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 240
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GATGGTTCTGTTAGTGCTGCTGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTTG 576
Query 241 GAG-TT--TGGCGGCAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAAA 297
||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 577 GAGTTTGGTGGAGGCAACAAGGGTAATGGGTTTGGTGGCGATGATGAGGAGTTTAGGAAA 636
Query 298 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACCG 357
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 637 GATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACCG 696
Query 358 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 CCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGTT 756
Query 418 TTAGGTGGTGTTGGGGAT---AGG--AG--AA--A-AGTTAA---TGATAGTC---G--A 459
|||||||||||||||||| ||| || || | ||| || | || || | |
Sbjct 757 TTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGGAAAGTTAATGATAGTCAATCTTTATTCTCTATGCCA 816
Query 460 TCT--TTGTT-CTC-TATG--CCA-CCTG-GTTTTGAGGCTGAGAAAACTGGTGCTTCTG 511
|| || || || | | || | || | ||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 817 CCTGGTT-TTGATCAGAGGAAGCAGCATGAG-TTTGAGGTTGAGAAAACTAGTGCTTCTT 874
Query 512 CTTCTGAGTGGGATGCTAATGGATTGATTGGTTTACCGGGTTT-GGGACTTGGAGGCAAG 570
||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 875 CTTCTGAATGGGATGCTAATGGATTGATCGGTTTGCCGGGTTTGGGGA-TTGGAGGCAAG 933
Query 571 CAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCTCAG 630
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 934 CAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTCAGGCTGATATGGGGCATGGACATCCTGTCACTAAG 993
Query 631 CAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAAT 690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 994 CAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGTAATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAGAATAAT 1053
Query 691 CTGTCTCCATCTGCATCACAAGGCATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTT 750
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 CTGTCTCCATCTGCATCGCAAGGCATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTT 1113
Query 751 CTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCT 810
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 CTGGGTTCGTCTTTGTCTAGAAATGGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCT 1173
Query 811 AGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACA 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 AGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGGAGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACA 1233
Query 871 AGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGTGTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTC 930
||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234 AGTAATCAAAGCCCGTTCAACGGTG--------GG-CTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTC 1284
Query 931 AATGCTTTATCTGGCATGAACCTGTCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 AATGCTTTATCTGGCATGAACCTGTCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCT 1344
Query 991 GAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAA 1050
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1345 GAGCAAGATGTGGAAAAGGTCAGGAACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGCATAACGAA 1404
Query 1051 GTCAATCAACATAGGTTCCCAAACAAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGCTCGTTG 1110
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 1405 GTCAATCAACATGGGTTCCCAAACAAATCTGATCAAGCCCAGAAGGCAACTGGCTTGTTG 1464
Query 1111 AGGGATTCACAATTGAGAGGGCCACAAGGATCTGCCTATAATGGTGGAGTTGGATTAGCT 1170
||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||
Sbjct 1465 AGGAATTCACAATTGAGAGGGGCACAAGGATCTACCTATAATGATGGAGGTGGAGTAGCT 1524
Query 1171 AATCCTTACCAGCATCTTGATAGCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCA 1230
| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1525 ACTCAGTACCAGCATCTTGATAGCCCAAACTATTGTCTCAACAATTATGGATTAAATCCA 1584
Query 1231 GCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTTGGGAAC-AATAATTTTTCTCCAATGTACGA 1289
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| ||
Sbjct 1585 GCTGTAGCTTCTATGATGGCTAACCAACTT-GGAACTAATAACTATTCTCCAGTGTATGA 1643
Query 1290 TAATG-TATCCGCAGCATCCGCTTTGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAG 1348
|||| | || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1644 AAATGCT-TCTGCAGCATCTGCTATGGGATTTTCTGGAATGGATTCCAGACTTCATGGTG 1702
Query 1349 GAGGCTT-TGTATCTTCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGT 1407
|||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1703 GAGG-TTATGTATCATCTGGTCAAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGATTCAGT 1761
Query 1408 AATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATGTATCAT 1467
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1762 AATCGAATGATGGGAGGAGGTACTGGTCTTCAGTCACATATGGCAGATCCAATGTATCAT 1821
Query 1468 CAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGT 1527
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1822 CAGTATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCCATGGACGTGAACTTTATGGGT 1881
Query 1528 AATTCATACATGAGTATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAG 1587
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1882 AATTCATACATGAATATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTATCTTGGAGCACAGAAATCACAG 1941
Query 1588 TATGGTCTTCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACA 1647
|| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 1942 TACGGTGTCCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCACACCGATTATGGGAGTCCAACA 2001
Query 1648 TTTGGGTCTAACATATCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCT 1707
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2002 TTTGGG---------TCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCTAATTCT 2052
Query 1708 CTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCA 1767
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2053 CTTGTGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAATATGCGATATCCCTCTGCA 2112
Query 1768 GCAAGAAATTATTCGGGAGGAGTAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAA 1827
||||||| || | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 ACAAGAAACTACGCAGGAGGGGTAATGGGTTCCTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAA 2172
Query 1828 GGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTC 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2173 GGCTTTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTCGAACT- 2231
Query 1888 T-CTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTAT 1946
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2232 TGCTGAAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTAT 2291
Query 1947 TCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCAT 2006
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 TCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAAGTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCAT 2351
Query 2007 GCCACATGCTCATGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTT 2066
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 GCCACACGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTT 2411
Query 2067 TGAGCATGGACTCCCGCCACAGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTT 2126
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2412 TGAGCATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGGCAGATAAACTCTTTGACAATGTTTT 2471
Query 2127 GCCTCTTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGA 2186
|||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2472 GCCTCTTAGCCTACAGATGTATGGTTGTCGTGTTATTCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGA 2531
Query 2187 TCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACG 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2532 TCTAGACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTCGATGGACATGTGATGCGATGCGTACG 2591
Query 2247 TGATCAGAATGGGAATCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT 2306
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2592 TGATCAGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT 2651
Query 2307 CGAGTTTATTATTTCAACTTTCTTTGGTC-ATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACG 2365
||| ||||||||||| || |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2652 CGAATTTATTATTTCCACCTTCTTTGG-CAATGTTGTGACCCTCTCCACTCACCCATATG 2710
Query 2366 GGTGCCGTGTAATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGG 2425
||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711 GGTGCCGAGTTATTCAGAGGGTATTGGAGCACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGG 2770
Query 2426 TTATGGAAGAAATCCTTTCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATG 2485
||||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2771 TTATGGATGAAATCATGTCAACTATTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTATGGAAACTATG 2830
Query 2486 TTGTTCAGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGT 2545
|| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |
Sbjct 2831 TTATTCAGCATGTATTGGAACACGGAAAGCCTGATGAGCGTACTGTGATTATCAAGGAAT 2890
Query 2546 TGGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAAT 2605
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2891 TAGCGGGGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCTTCAAACGTTGTTGAGAAAT 2950
Query 2606 GTTTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAA 2665
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2951 GTTTGACTTTTGGAGGGCCAGAGGAACGGGAATTTCTGGTAAATGAGATGCTGGGCACAA 3010
Query 2666 CTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGC 2725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3011 CTGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCCAACTATGTAGTGC 3070
Query 2726 AGAAAGTTTTGGAGACATGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAG 2785
| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||
Sbjct 3071 AAAAAGTTTTAGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAGCTGATCCTTGGTCGTATTAAAG 3130
Query 2786 TGCATCTTAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAA 2845
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 3131 TGCATCTCAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATATCGTTGCTCGTGTTGAAA 3190
Query 2846 AACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGG 2905
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3191 AACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGGATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGG 3250
Query 2906 CGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTG 2965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3251 CGTAAGGCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTG 3310
Query 2966 AGAATTAGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTG 3025
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3311 AGAATTAGGTAAAATCTAAACCGGAAATAATCTGCGGGAAAATTGTGAAGGAGAGCTTTG 3370
Query 3026 TTTTCTCTGCAAGATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACC 3085
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3371 TTTTCTCTGCAA-ATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTTCTATACATAGAACC 3429
Query 3086 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3108
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3430 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3452
> AT2G29140.1 | Symbols: APUM3, PUM3 | pumilio 3 | chr2:12530838-12535399
FORWARD LENGTH=3324
Length=3324
Score = 4287 bits (2321), Expect = 0.0
Identities = 2884/3143 (92%), Gaps = 89/3143 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATACCGGAACT-GGGAAGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 59
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 ATGATACCGGAACTAGGG-AGAAGACCGATGCATAGAGGTAACGAAGATTCATCTTTTGG 152
Query 60 GGATGATTATGAGAAAGAGATTGGAGTATTACTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 119
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GGATGATTACGAGAAAGAGATTGGAGTATTGCTTGGTGAGCAGCAGAGAAGGCAAGTAGA 212
Query 120 AGCTGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 179
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 GGCGGATGAGCTTGAGAGAGAGCTTAACTTGTATAGAAGTGGCTCTGCTCCACCGACTGT 272
Query 180 TGATGGTTCTGTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTCCTTTTTT 239
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 273 TGATGGTTCTCTTAGTGCTGCCGGAGGGCTTTTTAGCGGCGGAGGTGGGGCTTCTTTTCT 332
Query 240 GGAGTTTGG-CG-G-CAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGGTGATGAGGAGTTTAGGAA 296
||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 333 GGAATTTGGTGGAGTTAATAAGGGTAATGGGTTTGGTGGTGATGATGAGGAGTTTAGGAA 392
Query 297 AGATCCGGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAACCCGAGGTTGCCACC 356
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 393 AGATCCAGCTTACTTGTCTTATTACTATGCTAATATGAAGTTGAATCCGAGGTTGCCACC 452
Query 357 GCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAGTAATGT 416
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 453 TCCTTTGATGTCTAGGGAGGATTTGAGGGTTGCTCAGAGGCTTAAAGGGAGTAATAATGT 512
Query 417 TTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTTAATGATAGTCGATCTTTGTTCTCTATGCC 476
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 513 GTTAGGTGGTGTTGGGGATAGGAGAAAAGTGAATGACAGTCGGTCTTTGTTCTCTATGCC 572
Query 477 ACCTGGTTTTGAGGCTGAGAAAA-CTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 535
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 ACCTGGTTTTGAGGCTG-GAAAACCTGGTGCTTCTGCTTCTGAGTGGGATGCTAATGGAT 631
Query 536 TGATTGGTTTACCGGGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 595
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 TGA-----TT----GGTTTGGGACTTGGAGGCAAGCAGAAGAGTTTTGCTGATATCTTTC 682
Query 596 AGGCGGATATGGGGCATGGACATCCCGTTGCT-CAGCAGCCCTCACGTCCTGCAAGTCGT 654
|||||||||| || || ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 683 AGGCGGATAT--GG---GG-CATCCTGTTG-TACAGCAGCCCTCACGTCCTGCTAGTCGT 735
Query 655 AATACCTTTGATGAAAATGTTGACTCTAAAAATAATCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 714
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 AATACCTTTGATGAGAATGTTGACTCTAATAATAACCTGTCTCCATCTGCATCACAAGGC 795
Query 715 ATTGGTGCACCATCTCCATACAGCTATGCAGCTGTTCTGGGCTCTTCTTTGTCTAGAAAT 774
||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 796 ATTGGAGCGCCATCTCCATACTGCTATGCAGCTGTTCTGGGTTCATCTTTGTCTAGAAAT 855
Query 775 GGAACTCCAGATCCACAGGCCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCCTGTCTTACTCCCATTGGG 834
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 856 GGAACTCCAGATCCACAGGGCATTGCTAGGGTGCCTAGTCCTTGCCTTACTCCCATTGGC 915
Query 835 AGTGGGAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAACCAAAGCCCGTTCAACGGT 894
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 916 AGTGGAAGAGTGAGTTCAAATGATAAGAGGAACACAAGTAATCAAAGCCCGTTCAACGGT 975
Query 895 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCTGGCATGAACCTG 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 976 GTTACATCTGGTCTCAACGAGTCTTCTGATCTTGTCAATGCTTTATCCGGCTTGAACCTG 1035
Query 955 TCTGGCAGTGGCGGGTTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1014
|| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TCAGGCACTGGCGGGCTAGATGAACGTGGTCAGGCTGAGCAAGATGTCGAAAAGGTCAGG 1095
Query 1015 AACTATATGTTTGGACTGCAAGGTGGGTATAACGAAGTCAATCAACATAGGTTCCCAAAC 1074
|||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1096 AACTATATGTTTGGACTGCAAGATGGGCATAATGAAGTCAATCCACATGGGTTCCCAAAC 1155
Query 1075 AAATCTGATCAAGCCCATAAGGCAACTGGC-TCGTTG-AGGGATTCACAATTGAGAGGGC 1132
| ||||||||||| | || || |||| || ||| || ||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1156 AGATCTGATCAAG--C-TAGGGGAACT-GCTTCG-TGCAGGAATTCACAAATGAGAGGGT 1210
Query 1133 CACAAGGATCTGCCTATAATGGTGG-AGTTGGATTAGCTAATCCTTACCAGCATCTTGAT 1191
||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1211 CACAAGGATCTGCATATAATAGTGGAAG-TGGAGTAGCTAATCCTTACCAGCATCATGAT 1269
Query 1192 AGCCCAAATTATTGTCTCAACAATTATGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1251
||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1270 AGCCC-AA--A----CT-----ATTACGCATTAAATCCAGCTGTAGCTTCTATGATGGCT 1317
Query 1252 AACCAACTTGGGAAC-AATAATTTTTCTCCAATGTACGATAATG-TATCCGCAGCATCCG 1309
||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||| | || || ||
Sbjct 1318 AACCAACTT-GGAACTAATAACTATTCTCCAATGTATGAAAATGCT-TCTGC--CA---- 1369
Query 1310 CTTTGGGATTTTCTGGAATGGACTCCAGACTTCATGGAGGAGGCTTTGTATCTTCTGGTC 1369
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 1370 CTTTGGGATATTCTGCAATGGACTCCAGACTTCATGGTGGAAGTTTTGTTTCTTCTGGTC 1429
Query 1370 AAAACCTCTCTGAATCACGTAATCTTGGCAGGTTCAGTAATCGAATGATGGGAGGAGGTA 1429
||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1430 AAAACCTCTCTGAATCACGAAATATTGGCAGGGTCGGTAATCGAATGATGGAAGGAGGTA 1489
Query 1430 CTGGTCTCCAGTCACATATGGCGGACCCAATG--T-ATC---AT-C-A-G-----T---- 1471
| |||| || ||||||| | || ||||| ||| | ||| || | | | |
Sbjct 1490 CGGGTCACCCGTCACATCTTGCAGACCCGATGTATCATCAGTATGCAAGGTTCTCTGAAA 1549
Query 1472 ATGCTGATTCGCTTGATCTTCTCAATGATCCTTCGATGGACATGAACTTTATGGGTAATT 1531
||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||
Sbjct 1550 ATGCTGATTCGTTTGATCTTCTTAATGACCCTTCAATGGACAGGAAC--TAT-GGTAATT 1606
Query 1532 CATACATGAGTATGCTTGAACTCCAGAGGGCTTTTCTCGGAGCTCAGAAATCACAGTATG 1591
||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1607 CATACATGAATATGCTTGAAATTCAGAGGGCTTATCTCGGATCTCAGAAATCACAGTATG 1666
Query 1592 GTCTTCCTTACAAATCCGGGAGCCCTAACAGCCATAGCGATTATGGGAGTCCAACATTTG 1651
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 1667 GTCTTCCTTACAAATCAGGGAGCCCTAACAGCCATAGCTATTATGGCAGTCCAACATTTG 1726
Query 1652 GGTCTAACATATCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATCTTCTGCCAAATTCTCTTG 1711
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct 1727 GGTCTAATATGTCATATCCTGGCAGCCCATTGGCTCATCATGGTATGCCAAACTCTCTTA 1786
Query 1712 TGTCACCCTGTAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTTAGTATGCGATATCCCTCTGCAGCAA 1771
||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1787 TGTCACCTTACAGCCCTATGAGACGAGGTGAAGTAAATATGCGATATCCCGCTGCAACAA 1846
Query 1772 GAAATTATTCGGGAGGAGTAATGGGGTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGCT 1831
|||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1847 GAAACTATACTGGAGGGGTAATGGGTTCTTGGCACATGGATGCTAGTTTGGATGAAGGAT 1906
Query 1832 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGATTTGAACTCTCTG 1891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||
Sbjct 1907 TTGGATCTTCAATGCTTGAAGAGTTCAAAAGTAACAAAACAAGAGGGTTCGAACTTTCTG 1966
Query 1892 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAATATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 1951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967 AAATAGCTGGCCATGTTGTAGAGTTCAGTTCGGATCAGTATGGAAGCCGGTTTATTCAGC 2026
Query 1952 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAC 2011
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2027 AGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGAGAAAAACATGGTTTATGAGGAGATCATGCCAA 2086
Query 2012 ATGCTCATGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2071
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087 AAGCTCTTGCCCTGATGACTGACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGC 2146
Query 2072 ATGGACTCCCGCCACAGAGAAGAGAATTGGCAGAGAAACTCTTTGACAATGTTTTGCCTC 2131
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGGACTCCCACCACAGAGAAGAGAATTGGGAGAGAAACTCATTGACAATGTTTTGCCTC 2206
Query 2132 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2207 TTAGCTTACAGATGTATGGTTGTCGTGTCATCCAGAAGGCAATTGAGGTGGTTGATCTAG 2266
Query 2192 ACCAGAAAATTAAAATGGTGAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2251
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 ACCAGAAAATCCAAATGGTCAAAGAACTTGATGGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATC 2326
Query 2252 AGAATGGGAATCATGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATCGAGT 2311
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2327 AGAATGGGAACCATGTGGTTCAAAAGTGTATTGAATGTGTGCCTGAAGAAAACATTGAGT 2386
Query 2312 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGTCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2371
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2387 TTATTATTTCAACTTTCTTTGGCCATGTGGTGACCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCC 2446
Query 2372 GTGTAATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATGACCCTGATACTCAGAGTAAGGTTATGG 2431
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2447 GTGTTATTCAGAGAGTATTGGAACACTGCCATAACCCTGATACACAGAGTAAGGTTATGG 2506
Query 2432 AAGAAATCCTTTCCACTGTTAGTATGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTC 2491
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2507 AAGAAATCCTGTCCACTGTTAGTATGCTGACCCAAGATCAGTATGGAAACTATGTTGTTC 2566
Query 2492 AGCATGTGCTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTGGCGG 2551
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2567 AGCATGTACTGGAGCATGGAAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAAAGAGTTAGCGG 2626
Query 2552 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAATGTTTGA 2611
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2627 GGAAGATTGTTCAGATGAGCCAACAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAGTGTTTGA 2686
Query 2612 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2671
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2687 CTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTGCTGGTGAATGAGATGCTGGGCACAACTGATG 2746
Query 2672 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAGAAAG 2731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2747 AAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATCAGTTTGCAAACTATGTAGTGCAAAAAG 2806
Query 2732 TTTTGGAGACATGTGATGACCAACAACGTGAGCTGATACTTACTCGCATCAAAGTGCATC 2791
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 2807 TCCTGGAGACATGTGATGACCAACAGCGTGAACTGATACTGACTCGTATTAAAGTGCATC 2866
Query 2792 TTAATGCTTTAAAGAAATACACTTATGGAAAGCATGTCGTTGCGCGTATTGAAAAACTCG 2851
| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2867 TGAATGCTCTAAAGAAATACACTTACGGAAAGCATATCGTTGCCCGTGTTGAAAAACTCG 2926
Query 2852 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCCCTAACCCAGCCTCAGATGGCGTAAG 2911
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||
Sbjct 2927 TTGCTGCTGGAGAGAGGAGAATGGCTTTGCAGTCATTACCCCAGCCTCTGGTGGCGTAAG 2986
Query 2912 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAGCGTTTTGAGAATT 2971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2987 GCCGCAAGTGTTGTACAGCTTAACTAGGGTGGATGGCTCTGCCATAACGTTTTGAGAATT 3046
Query 2972 AGGTAAGATCTAAACCGGAAATAATCTGCGG-GAAA-ATTGTGAAGGAGAGCTTTGTTTT 3029
|||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | || || | |||||||||||||
Sbjct 3047 AGGTAAGATCTAAACC--AAA-AATCTGCGGAGAAATAATGAGA-G-AGAGCTTTGTTTT 3101
Query 3030 CT-CT--GCAAGATCTGTAAAATTGTGTAGTTGCTTACGGTTTTT-CTATACATAGAACC 3085
| || |||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 3102 GTTCTCCGCAAAATCTGTACA-TTGTGTAGTTTCTTACCGTTTTGACTATACATAGAACC 3160
Query 3086 AAACATCCCACTTTAGGCTGATG 3108
||| ||||| ||| |||||||||
Sbjct 3161 AAAGATCCCCCTT-AGGCTGATG 3182
> AT3G10360.1 | Symbols: APUM4, PUM4 | pumilio 4 | chr3:3210884-3215556
REVERSE LENGTH=3692
Length=3692
Score = 298 bits (161), Expect = 2e-79
Identities = 770/1053 (73%), Gaps = 86/1053 (8%)
Strand=Plus/Plus
Query 1864 AACAAAACAAGAGGATTT-GAACTCTCTGAAATAGCTGGCCATGTTG-TAGAGTTCAG-T 1920
||||| ||||| | ||| || || || ||||||| ||| |||| || | ||||||||
Sbjct 2251 AACAAGACAAG-GTCTTTGGAGCTTTCAGAAATAGTTGGTCATG-TGATTGAGTTCAGCA 2308
Query 1921 TCGGATCAATATGGAAGCCGGTTT-ATTCAGCAGAAACTCGAGACAGCAACAACTGATGA 1979
| |||||| || ||||| | |||| ||||| |||||||| ||||| | |||| |||||
Sbjct 2309 T-GGATCAGTACGGAAGTC-GTTTCATTCAACAGAAACTTGAGACTG---CAACGGATGA 2363
Query 1980 -GAAAA-ACATGGTTTA-T-GAGGAGATCA-TGCC--ACATGCTCATGCCCTGATGACTG 2032
||||| | ||| || | ||||| | | || || || | | | | ||||| |
Sbjct 2364 GGAAAAGA-ATGCAATATTCCCTGAGAT-ACTTCCTTAC-GGC-CGTACTTTAATGACAG 2419
Query 2033 ACGTTTTTGGAAACTATGTGATTCAGAAGTTCTTTGAGCATGGACTCCCGCC-A-CAGAG 2090
| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | | || | |||||
Sbjct 2420 ATGTCTTTGGAAATTATGTCATTCAAAAGTTTTTTGAACATGG--TACAACCAAGCAGAG 2477
Query 2091 AAGAGAATTGGCAGAGA-AACTCTTTGACAATGTTTTGCCTCTTAGCT-TACAGATGTAT 2148
|| |||| | || || | || | | | | |||||| ||||| || |||| |||||
Sbjct 2478 AAAAGAACTCGCTGA-ACAAGTAACAGGCCACGTTTTGGCTCTT-TCTCTACAAATGTAC 2535
Query 2149 GGTTGTC-GTGTCATCCAGAAGGCAATT-GAGGTGGTTG-ATCTAGACCAGAAAATTAAA 2205
|| || | | || ||||| ||||| || |||||||||| || | || ||| || | |
Sbjct 2536 GGCTG-CAGGGTTATCCAAAAGGC-GTTAGAGGTGGTTGAAT-TGGAGCAGCAAGCTCGA 2592
Query 2206 ATGGTGAAAGAACTTGAT-GGACATGTGATGCGATGTGTACGTGATCAGAATGGGAATCA 2264
||||||||||| |||||| || | ||| ||| ||| || | ||| ||||| || |||||
Sbjct 2593 ATGGTGAAAGAGCTTGATGGGTC-TGTCATGAAATGCGTTCATGACCAGAACGGTAATCA 2651
Query 2265 TGTGGTTCAAAAGTGTATCGAATGTGTGCCTGAAGAAAACAT-CGAGTTTATTATTTCAA 2323
|||| | || |||||||| || || | ||| | || || | |||| || |||||
Sbjct 2652 TGTGATCCAGAAGTGTATAGAGCGTCTTCCTCAGGATTGGATAC-AGTTCATCATTTCCT 2710
Query 2324 CTTTCTTTGGTCATGTGGTGA-CCCTCTCCACTCACCCATACGGGTGCCGTGTAATTCAG 2382
| |||| || | || | | | || || || ||||| || || ||||||||||| |||
Sbjct 2711 CATTCTACGGAAAAGT-TTTAGCTCTTTCAACACACCCTTATGGATGCCGTGTAATCCAG 2769
Query 2383 AGAGTATTGGA--ACACTGCCATGACCCT-GATACTCAGA-GTAAGGTTATGGAAGAAAT 2438
|| ||| |||| | | || |||| | || || || | | | ||||||| |||||
Sbjct 2770 AGGGTACTGGAGCATATTG--ATGA-TATAGAAACCCA-ACGGATCATTATGGAGGAAAT 2825
Query 2439 CCT---TTCCACTGT-TAGTA-TGCTGGCCCAAGATCAGTACGGAAACTATGTTGTTCAG 2493
| | || || || | ||| | || || |||||||| |||||||| |||||| | |||
Sbjct 2826 CATGGATT-CA--GTCT-GTACT-CTAGCACAAGATCAATACGGAAATTATGTTATCCAG 2880
Query 2494 CATGTGC-TGGAGCATGG-AAAGCCTGATGAGCGCACTGTGATAATCAA-AGAG-TTGGC 2549
||| | | | | ||||| ||| ||| |||| || | | || ||||| | || || ||
Sbjct 2881 CATAT-CATACAACATGGTAAA-CCTCATGAACGGTCAGAAATTATCAATA-AGCTT-GC 2936
Query 2550 GGGGA-AGATTGTTCAGATGAGCCAGCAGAAGTTTGCATCAAACGTTGTTGAGAAA-TGT 2607
||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||
Sbjct 2937 -TGGACAGATTGTGAAGATGAGTCAGCAAAAGTTTGCTTCTAATGTTGTTGA-AAAGTGC 2994
Query 2608 TTGACTTTTGGAGGTCCTGAGGAACGGGAATTTCTGGTGAATGAGATGC-TGGGCACAAC 2666
| || ||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 2995 CTAACATTTGGCGGTCCAGAGGAACGTCAGGTTCTAGTGAATGAGATGCTTGGTTA-TAC 3053
Query 2667 TGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGATC-AGTTTGCAAACTATGTAGTGC 2725
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||
Sbjct 3054 TGATGAAAACGAGCCTCTTCAGGCGATGATGAAGGACCCA-TTTGGGAACTATGTAGTGC 3112
Query 2726 AGAAAGTT-TTGGAGACATGTGATGACCAACAA-CGTG-AGCTGATACTTACTCGCATCA 2782
|||| ||| ||| | ||||||||||| ||| | | || | || || ||| |||||||||
Sbjct 3113 AGAAGGTTCTTGAA-ACATGTGATGATCAA-AGTCTTGCA-CTCATTCTTTCTCGCATCA 3169
Query 2783 AAGTGCATCTT-AATGCTTTAAAGAAATACACTTATGG-AAAGCATGTCGTTGCGCGTAT 2840
|||| || ||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||| || ||||||| || |
Sbjct 3170 AAGTACA-CTTGAATGCCTTGAAGAGATACACATATGGGAAA-CACATCGTTGCCCGGGT 3227
Query 2841 TGAAAAACTCGTTGCTGCTGGAGAGAGGAGAAT 2873
||| || || | || |||||||||| |||||
Sbjct 3228 TGAGAAGCTTATCACTACTGGAGAGAGAAGAAT 3260
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 154564351383
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5