BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482091
Length=3817
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G31660.1 | Symbols: SAD2, URM9 | ARM repeat superfamily prot... 6069 0.0
> AT2G31660.1 | Symbols: SAD2, URM9 | ARM repeat superfamily protein
| chr2:13464298-13471821 FORWARD LENGTH=3812
Length=3812
Score = 6069 bits (3286), Expect = 0.0
Identities = 3672/3847 (95%), Gaps = 71/3847 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCCTCTCCTCCACTCTCGCCAACTATC-ATCAAATCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTCCGCC 59
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 1 CCCTCTCCTCCACTCTCGCCAACTATCAATCAAATCTTC-T-T-CTCCTTCTTCTCCGCC 57
Query 60 ATTCTTGTCGCTCGCTCTAAAACCCTATCATGCTCTTCTGAGAAAT-TCAGCTCCTTCT- 117
|||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||| |||
Sbjct 58 ATTCTTGT--C-C-CTCTTAAACCCTATCATGCTCTTCTGAG-ATTCTCCCCTCC-TCTA 111
Query 118 -TGAAG-------TCTTGGTCGGGAATTTCAAATCG-A-ATCCACTACTGCCTCTGATCG 167
| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||
Sbjct 112 ATTCAGCTCTCTCTCTTGGTTGGGAATTTCAAATCGAATATCAACCACTGCCTCTGATCG 171
Query 168 TCATCAAGCTTTACTCTGTCTAGTGTCCCGATTTTCAAACTCCACGGAGGATGGATCTGC 227
|||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 172 TCATCAAGGTTTACTCTGTTTAGTGTCCGGATTCTCAAACTCCACGGAGAATGGATCTGC 231
Query 228 CTAGCCTCGCTTTGATCCTCCGAACCGCCGCGCTCAGCTCTATTCCCGATGAGCGTAAAG 287
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 232 ATAGCCTCGCTTTGATCCTCCGAACCGCCGCTCTTAGCCCTATTCCCGATGAGCGTAAAG 291
Query 288 CTTCTGAGCAGCAACTCAATCAGTTGCAGCACATGCCTCAGCATTTGGTGAGGTTATTGC 347
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 TTTCTGAGCAGCAACTCAATCAGTTGGAGCACACGCCCCAGCATTTGGTGAGGTTATTGC 351
Query 348 AGATAGCCGTGGATGGAAACTGTGACATGGCAGTGCGTCAAATTGCTAGTATTCAGTTCA 407
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 352 AGATAGCCGTGGATGGAAATTGTGACATGGCAGTGCGTCAAATTGCTAGTATTCAGTTCA 411
Query 408 AACATTTAATTGCTAAGAACTGGTCACCTGAGGA------TCCTGGAG--A-GCAGCAGC 458
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||
Sbjct 412 AAAATTTAATTGCTAAGAACTGGTCACCTGAGGATTGTGGTCCTGCAGTAAGGCAGCAGC 471
Query 459 AGATA-TTGCAGAGTGACAAAGAATTGGTGAGGGACAATATTCTTGTCTATGTCACCCAA 517
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 472 AGATATTTG-AGAGTGACAAAGAATTGGTGAGGGACAATATTCTCGTCTATGTCACCCAA 530
Query 518 GTTCCAACCTTACTCAGATCACAACTTGGAGAGTGTCTCAAGACCATTATTTATGCTGAC 577
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 531 GTTCCAACCTTACTCAGATCACAACTTGGAGAGTCTCTCAAGACAATTATTTATGCTGAC 590
Query 578 TACCCAGAACAATGGCCACGTCTTCTGGATTGGGTGAAATACAACTTGCAAAATCAACAA 637
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TACCCAGAACAATGGCCACGTCTTCTGGATTGGGTGAAGTACAACTTGCAAAATCAACAA 650
Query 638 ATTTATGGGGCTTTGTTTGTGTTGCGGATACTCTCTAGGAAATATGAGTTCAAGTCAGAC 697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 651 ATTTATGGGGCTTTGTTTGTGTTGCGGATACTCTCTAGAAAATATGAGTTCAAGTCAGAT 710
Query 698 GAGGAGAGGACACCGGTTTCCCGCATTGTGGAGGAGACATTTCCTCAACTTTTGACTATT 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GAGGAGAGGACACCGGTTTCCCGCATTGTGGAGGAGACATTTCCTCAACTTTTGACTATT 770
Query 758 TTTAATGGGCTTATCCAGATACCTAATCCCTCTCTGGAGATAGCAGAACTTATGAAGTTG 817
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 TTTAATGGGCTTATCCAGATACCAAATCCGTCTCTGGAGATAGCAGAACTTATGAAGTTG 830
Query 818 ATATGCAAAATATTTTGGTCATCCATATATCTGGAGCTTCCAAGGCAATTATTTGATCTA 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 ATATGCAAAATATTTTGGTCATCCATATATCTGGAGCTTCCAAGGCAATTATTTGATCTA 890
Query 878 AATGTCTTTAATGCCTGGATGGTTCTGTTCTTGAGTGTTTCGGAGCGTCCTGTTCCAGTT 937
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 891 AACGTCTTTAATGCCTGGATGGTTCTGTTCTTGAGTGTTTCGGAACGTCCTGTTCCAGTT 950
Query 938 GAAGGTCAGCCTATGGATCCGGAACTTAGAAAATCTTGGGGCTGGTGGAAGGTCAAGAAG 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 GAAGGTCAGCCTATGGATCCGGAACTTAGAAAATCTTGGGGCTGGTGGAAGGTCAAGAAG 1010
Query 998 TGGACAGTGCACATATTAAACAGGCTCTATAGTCGGTTTGGAGATCCAAAACTTCAAAGT 1057
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TGGACAGTGCACATTTTAAACAGGCTCTATAGTCGGTTTGGAGATCCAAAACTTCAAAGT 1070
Query 1058 CCAGAAAACAAACCTTTTGCCCAAATGTTTCAGAAGAATTATGCAGGCAGAATTTTGGAA 1117
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 CCAGAAAACAAACCTTTCGCCCAAATGTTTCAAAAGAATTATGCAGGCAGAATTTTGGAA 1130
Query 1118 GGCCACCTAAATTTCTTGAATACAATTCGTGTTGGAGGCTATCTTCCTGACAGAGTTACC 1177
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1131 GGCCACCTAAATTTCTTGAACACAATTCGTGTTGGAGGCTATCTTCCTGACAGAGTTATC 1190
Query 1178 AATCTTCTCCTTCAGTACTTAAGCAACAGCATTTCGAAGAATAGCATGTACAAGTTGCTG 1237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 AATCTTCTCCTTCAGTACTTAAGCAACAGCATTTCGAAGAATAGCATGTACAAGTTGCTT 1250
Query 1238 CTGCCTCGGCTGGATGTTCTGCTTTTTGAGATTGTTTTCCCTCTAATGTGCTTTAATGAT 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 CTGCCTCGGCTGGATGTTCTGCTTTTTGAGATTGTTTTCCCTCTAATGTGCTTTAATGAT 1310
Query 1298 AATGATCAAAAGCTTTGGGTGGAAGACCCACATGAATATGTGAGGAAAGGTTACAATATC 1357
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 AATGATCAAAAGCTTTGGGAGGAAGACCCTCATGAATATGTGAGGAAAGGTTACAATATC 1370
Query 1358 ATTGAAGACTTGTACAGTCCGCGAACAGCGTCCATGGATTTTGTAAATGAGTTGGTTAGA 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1371 ATTGAAGACTTGTACAGTCCGCGAACAGCGTCCATGGATTTTGTAAATGAGTTGGTTCGA 1430
Query 1418 AAACGTGGGAAAGAGAACCTTCCGAAGTTTGTTCAGTTTATCGTTGGGATCTTCAGGAGT 1477
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||
Sbjct 1431 AAACGTGGGAAAGAAAACCTTCCGAAGTTTGTTAAGTTTGTCGTTGAGATCTTCTTGAGT 1490
Query 1478 TATGATGAAGCTCCTGCAGAGCATAAGCCTTATCGCCAAAAAGATGGTGCGATGCTTGCT 1537
||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1491 TATGAAAAAGCTACTGTAGAGGAGAAGCCTTATCGCCAAAAAGATGGTGCGATGCTGGCT 1550
Query 1538 GTTGGAGCTCTTTGTGACAAATTGAAGCAAACGGATCCCTATAAATCTGAACTAGAGCGT 1597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1551 GTTGGAGCTCTTTGTGACAAATTGAAGCAAACGGATCCCTATAAATCTCAACTAGAGC-T 1609
Query 1598 -ATGTTGGTGCAACATATTTTTCCTGATTTCAGTAGTCCAGTTGGACATCTTAGAGCAAA 1656
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 AATGTTGGTGCAACATATTTTTCCTGATTTCAATAGTCCAGTTGGACATCTTAGAGCAAA 1669
Query 1657 GGCCGCTTGGGTAGCTGGGCAATATGCACATATCAATTTCTCCGATCAGAACAACTTTCG 1716
||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1670 GGCTGCATGGGTAGCTGGGCAATATGCACACATCAATTTCTCAGATCAGAACAACTTTCG 1729
Query 1717 TAAAGCATTGCACAATGTTGTTTCGGGACTGCGCGATCCTGACCTCCCTGTTCGTGTTGA 1776
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1730 TAAAGCATTGCACAGTGTTGTTTCGGGACTGCGCGATCCTGATCTCCCTGTTCGTGTTGA 1789
Query 1777 TTCAGTTTTTGCATTGCGTTCATTTGTTGAGGCGTGCAAGGATTTAAATGAGATACGTCC 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1790 TTCAGTTTTTGCATTGCGTTCATTTGTTGAGGCGTGCAAGGATTTAAATGAGATACGTCC 1849
Query 1837 AATCCTCCCTCAGTTACTTGATGAATTTTTCAAACTCATGAATGAGGTAGAGAATGAGGA 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AATCCTCCCTCAGTTACTTGATGAATTTTTCAAACTCATGAATGAGGTAGAGAATGAGGA 1909
Query 1897 CCTTGTTTTTACTTTGGAGACCATCGTAGATAAGTTTGGCGAAGAGATGGCTCCTTTTGC 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910 CCTTGTTTTTACTTTGGAGACCATCGTAGATAAGTTTGGCGAAGAGATGGCTCCTTTTGC 1969
Query 1957 TTTTGGATTATGTCAAAATCTGGCGGCTGCATTTTGGAGATGTCTAAACACGTCAGAAGC 2016
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TTTTGGATTATGTCAAAATCTGGCGGCTGCGTTTTGGAGATGTCTAAACACGTCAGAAGC 2029
Query 2017 CAATGACGACTCTGATGACATGGGAGCTTTAGCTGCAGTTGGTTGTTTGCGTGCCATAAG 2076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 CAATGACGACTCTGATGACATGGGAGCTTTAGCTGCCGTTGGTTGTTTGCGTGCCATAAG 2089
Query 2077 TACAATCCTTGAATCTGTTAGCAGTCTCCCGCAGCTGTTCGTTGAGATAGAACCAACTAT 2136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 TACAATCCTTGAATCTGTTAGCAGTCTCCCGCAGCTGTTTGTTGAGATAGAACCAACTAT 2149
Query 2137 ACTTCCAATAATGCAGAAAATGTTGACCACTGATGGCCAAGAGGTATTTGAAGAAGTTTT 2196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 ACTTCCAATAATGCAGAAAATGTTGACCACTGATGGCCAAGAGGTATTTGAAGAAGTTTT 2209
Query 2197 GGAGATTGCATCATACATGACCTTTTATTCACCTAGCATTTCCTTGGATATATGGAGTCT 2256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 GGAGATTGCATCATACATGACCTTTTATTCACCTAGCATTTCCTTGGATATATGGAGTCT 2269
Query 2257 CTGGCCTTTAATGGTGGAAGCATTGGTTGATTGGGCAATCGATTTCTTTCCAAATATTTT 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 CTGGCCTTTAATGGTGGAAGCATTGGTTGATTGGGGAATCGATTTCTTTCCAAATATTTT 2329
Query 2317 GGTTCCAATGGACAACTTTATATCAAGGGGAACGGCTCATTTTCTCACTTGCAAGGAGCC 2376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2330 GGTTCCAATGGACAACTTTATATCAAGGGGAACGGCTCATTTTCTCACTTGCAAAGAGCC 2389
Query 2377 CGACTATCAGCAAAGTCTGTATAACGTTCTTTCAACTCTTATGACCGACAGAAACATAGA 2436
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 CGACTATCAGCAAAGTCTATATAACGTTCTTTCAACTCTTATGACCGACAGAAACATAGA 2449
Query 2437 AGACAGTGAAATTGAGTCTGCTCCAAAGCTTATTGAAGTTGTTTTCCAGAATTGCAAAGG 2496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2450 AGACAGTGAAATTGAGTCTGCTCCAAAGCTTATTGAAGTTGTTTTCCAGAATTGCAAAGG 2509
Query 2497 GCAGGTGGATCAGTGGGTTGAACCATATCTGCGTCTTACTGTTGACCGGTTACAACGGGC 2556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510 GCAGGTGGATCAGTGGGTTGAACCATATCTGCGTCTCACTGTTGACCGGTTACAACGGGC 2569
Query 2557 TGAGACTTCGTATGTAAAATCTCTTCTTATACAAGTGGTGGCAAATATGCTTTACTACAA 2616
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 TGAGACTTCGTATGTTAAATCTCTTCTTATACAAGTGGTGGCAAATATGCTTTACTACAA 2629
Query 2617 TCCAGGTTTGACGCTTGGTGTATTGCATAACACGGGACTTGCTTCCAAAGTCTTTGACCT 2676
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 TCCAGGTTTGACGCTTGGTGTATTGCATAACACAGGACTTGCTTCCAAAGTCTTTGACCT 2689
Query 2677 TTGGTTCCAGATGTTGCAGCAAAAGAGAAAAAGTGGCCTACCAGCAAACTTCAAAAGGGA 2736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 TTGGTTCCAGATGTTGCAGCAAAAGAGAAAAAGTGGCCTGCCAGCAAACTTCAAAAGGGA 2749
Query 2737 ACATGATAAAAAGGTTTGCTGCTTGGGTTTGACTTCATTACTTGCTCTACCGGGGGGTCA 2796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2750 ACATGATAAAAAGGTTTGCTGCTTGGGTTTGACTTCATTACTTGCTCTCCCTGGGGGTCA 2809
Query 2797 ATTACCCGATGAAGCGCTGCAGCGTGTTTTCAGGGCAACACTTGATCTTCTAGTTGCATA 2856
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 ATTCCCCGATGAAGCGCTGCAGCGTGTTTTCAGGGCAACACTTGATCTTCTAGTTGCATA 2869
Query 2857 TAAGAATCAGCTAGCTGAAGCAGCTAAGGAGGCAGAAGTAGATTATGAGGATGAAATGAA 2916
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2870 TAAGAATCAGCTAGCTGAAGCAGCTAAGGAGACAGAAGTAGATTATGAAGAAGAAATGAA 2929
Query 2917 TGGACTCCAGAGt-gatgatgacgatgatgatgatgatgggtctgatggagagatgggga 2975
||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || | |
Sbjct 2930 TGGACTCCAGAGTAG-TGATGATGATTATGATGATGATGGGTCTGATGG-G-GA-G---A 2982
Query 2976 tggatgatatagaggttggagatgaAGCACAAAGTGCTAAACTGCAGAAGTTAGCTGCAC 3035
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2983 TGGATGATACAGAGGAAGGAGATGAAGCACAAAGTGTTAAACTGCAGAAGTTAGCTGCAC 3042
Query 3036 AGGCAAAGGCCTTCCACTatgatgatgatgatgacgatgattctgatgatgactttagtg 3095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3043 AGGCAAAGGCCTTCCACTATGATGATGATGATGACGACGATTCTGATGATGACTTTAGTG 3102
Query 3096 atgaGGACGAGTTTCAGTCACCCATCGATGAGGTGGATGCCTTTGTATTCTTTGTCGATG 3155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3103 ATGAGGACGAGTTTCAGTCACCCATCGATGAGGTGGATGCCTTTGTATTCTTTGTCGATG 3162
Query 3156 CAATCAGAGTTATGCAGGCATCAGATGCGCAGAGGTTCCAGAACCTTAACCAGTCACTGG 3215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3163 CAATCAGAGTTATGCAGGCATCAGATGCGCAGAGGTTTCAGAACCTGAACCAGTCACTGG 3222
Query 3216 ACTTCACTTACCAGGCGATTGCAAACGGAATAGCACAGCATGCGGAGCTGAGAAGAGTGG 3275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3223 ACTTCACTTACCAGGCGATTGCAAACGGAATAGCACAGCATGCAGAGCTGAGAAGAGTGG 3282
Query 3276 AGATCGAGAAGGAGAAGCAAAAGAAGTTAGCAGAAGCTGCTTCTACTCCTGTTCCTACTC 3335
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||
Sbjct 3283 AGATCGAGAAGGAGAAGCAAAAGAAGTTAGCAG---CTGCTTCTACTCCTGTTACTGCTC 3339
Query 3336 T-TGTTCCTACTCTATGATCAGCTTTGGATCAAAGTCACAGTCTGATACACAGATGGTGT 3394
| || | | | | | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3340 TATGAT--T--T-T-T-A--AGCTTTGGATCAAAGTCAGAGTCTGATACACAGATGGTGT 3390
Query 3395 CATTTTTGTGAGAGATTCTCGTTCATGATTATTTGGCATAGTTGCTTGCTTCGAGGTTAT 3454
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3391 CATTTTTGTGAGAGATTCTCGTTCATAAATATTTGGCATAGTCGCTTGCTTCGAGGTTAT 3450
Query 3455 ACAAATGAAGAAGCAGATTTTGTGAATTTTTAGCAGAAGAGATCATCTCTAGAACCTTGT 3514
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3451 ACAAATGAAGAAGCAGATTTTGTGAATTTT-AGCAGAAGAGATCATCCCTAGAACCTTGT 3509
Query 3515 GAAACCGTGTGGTTAGGGTTGATGAAGATGGAGTCTCTTATTGGT-TGAAGAAAGGTGTG 3573
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||
Sbjct 3510 GAAACCGTGTGGTTACGGTTGATGAAGATGGAGTCTCTTAT-GGTATGAAGAAAG-TGTG 3567
Query 3574 TACTATACAATGTGTTGCGTCTCTTCTTTTGGATTGGTTGTATTGGTAAAGAAAGACAGT 3633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3568 TACTATACAATGTGTTGCGTCTCTTCTTTTGGATTGGTTGTATTCGTAAAGAAAGACAGT 3627
Query 3634 TTTTTGGGGAGGGTGGGGTGGGGGATTTTGTGTACTCTTTATCCTAT-T-ATGTGTTTGG 3691
|||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 3628 TTTT-GGGGAGGGTGGGG-G----ATTTTGTGTACTCTTTATCCTATATTATGTGTTTGG 3681
Query 3692 TCTTTTTGGGATGTGTTAGATATTTTTAGGGAAAGCTATATTGAATTTTT-GTGATCTCA 3750
|||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3682 TCTTTT-GGGATGTGATAGATTTTTTTAGGAAAAGCTATATTGAATTTTTTGTGATCTCA 3740
Query 3751 CAGAGAGATCAGCAAAGGTCACTCATCAGGTTGTACGACCATTCTTTCATAAAGTGATAA 3810
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3741 CAGAGAGATCAGCAA-GGTCACTCATCAGGTTGTACGACCATTCTTTCATAAAGTGATAA 3799
Query 3811 TTATTAT 3817
|||||||
Sbjct 3800 TTATTAT 3806
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 190132713970
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5