BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482209
Length=3302
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G32730.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex, no... 5505 0.0
AT1G04810.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex, no... 3288 0.0
> AT2G32730.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex,
non-ATPase subcomplex, Rpn2/Psmd1 subunit | chr2:13880046-13885736
FORWARD LENGTH=3430
Length=3430
Score = 5505 bits (2981), Expect = 0.0
Identities = 3205/3313 (97%), Gaps = 15/3313 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAAACCACTC-TCTTTCAAACCCAGTAGAGAGATTCAAGACGGGTCTCATCGAAAGTTCG 59
|||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 19 AAAA-CACTCTTC-TTCAAATCCAGTAGAGAGATTCAAGACGAGTCTCATCGAAAGTTCG 76
Query 60 AATCTTTCGTCATCTGATTTGCTTTCTCTTAGGGTTT-TTTCAATTTCGATTTAGTGTTC 118
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 77 AATCTTTCGTCATCTGATTAGCTTTCTCTTAGGGTTTATTTCGATTTCGATTTAGTGTTC 136
Query 119 TTCATCAATGGCGACACCCATGGTTAGTTCGGCTGGAGGGTTACTAGCAATGCTCAACGA 178
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TCCATCAATGGCGACACCCATGGTTAGTTCCGCTGGAGGATTACTAGCAATGCTCAACGA 196
Query 179 GCCTCATCCTGCTTTAAAGCTTCATGCGCTCTCTTATCTCAACAATTTGGTTGACCAATT 238
||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 GCCTCATCCTGTTTTGAAGCTTCATGCGCTCTCTAACCTCAACAATTTGGTTGACCAATT 256
Query 239 CTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATT 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 CTGGCCTGAGATCTCCACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATT 316
Query 299 CGATCTGCATCAAAGACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGG 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CGATCTGCATCAAAGACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGG 376
Query 359 CGAGCTTAATGATTCATTGTCTTATGCCCTTGGAGCTGGGCCCTTATTTGATGTTTCAGA 418
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 377 CGAGCTTAATGATTCGCTGTCTTATGCCCTAGGAGCCGGTCCCTTATTTGATGTTTCAGA 436
Query 419 GGATTCTGATTATGTTCATACGCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAATATGCCAGTCTCAG 478
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 437 GGATTCTGATTATGTTCATACGCTTCTGGCCAAAGCAATAGACGAATATGCCAGTCTCAG 496
Query 479 ATCAAAAGCAGTTGAGTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCCAGGCTGGAGGCGATTGT 538
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 497 ATCAAAGGCAGTTGAGTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCCAGGCTAGAGGCGATTGT 556
Query 539 TGAAAGAATGCTTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TGAAAGAATGCTTGGAAAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGC 616
Query 599 GATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAGGCTATCACTAAGAGCGATAATGTTCA 658
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 617 GATAGAATGCCGGAGATTGGATAAGTTGGAAGAAGCTATCATTAAGAGCGATAATGTTCA 676
Query 659 GGGAACTTTATCATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTTAACCGCAGAGAGTATAG 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 677 GGGAACTTTATCATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTCAACCGCAGAGAGTACAG 736
Query 719 ACATGAGGTGCTTAGTTTACTTGTTAAAGTCTACCAGAAGCTGCCTTCTCCTGATTATTT 778
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 737 ACATGAGGTGCTTAGTTTACTTGTAAAAGTCTACCAGAAGCTGCCCTCTCCTGATTATTT 796
Query 779 GAGCATTTGTCAATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATTTTGGA 838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 797 GAGCATTTGTCAATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATATTGGA 856
Query 839 GAAGCTTCTTCGCTCGGAGAGCAAGGATGATGCTTTATTGGCGTTGCAAATTGCATTTGA 898
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 857 GAAGCTTCTTCGCTCAGAGAACAAGGATGATGCTTTATTGGCATTGCAAATTGCATTTGA 916
Query 899 TCTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 TCTTGTAGAGAACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCC 976
Query 959 CAAAACACGTCCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACTACTACTGCTCCGAATGAGAA 1018
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||
Sbjct 977 CAAAACACGTGCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAACAACTATTGCTCCTAATGAGAA 1036
Query 1019 CCCTTCGGGGGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCACGAGAC 1078
||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1037 CCCTTCGGGAGATGTTCAGATGGCAGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCATGAGAC 1096
Query 1079 AGATCCAGTTGATGCTACATATGCTGAGAGGTTGACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGG 1138
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 GGATCCAGTTGATGCTACATATGCTGAGAGGTTAACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGG 1156
Query 1139 AGAGACATCTATTCAGCTGACACTTCAATTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCT 1198
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 AGAGACATCTATTCAGCTGACACTGCAGTTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCT 1216
Query 1199 GATACTGAAGACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 GATACTGAAGACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTAC 1276
Query 1259 AATATATGCTAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAA 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 AATATATGCTAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAA 1336
Query 1319 TTTGGATTGGTTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCGGGATTAGG 1378
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1337 TTTGGATTGGCTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTCAGTGCTACCGCGGGATTAGG 1396
Query 1379 TGTTATTCACAGAGGTCATCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCA 1438
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 TGTTATTCACAGAGGTCACCTGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCA 1456
Query 1439 GGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCCCTTGG 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1457 GGGAGGAGCAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCTCTTGG 1516
Query 1499 CCTTATTCATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAG 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 CCTTATTCATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAG 1576
Query 1559 CACTAATGTTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGCTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGG 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 CACTAATGTTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGG 1636
Query 1619 GACAGCTGATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGATAGTGCAGT 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1637 GACAGCTGATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGACAGTGCAGT 1696
Query 1679 TGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAA 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 TGCTGGTGAAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAA 1756
Query 1739 GGCAAGTGAGATGCTTGCTTATGCTCATGAGACACAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATT 1798
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 GGCAAGTGAGATGCTCGCTTATGCTCATGAGACACAACATGAGAAGATAATAAGGGGATT 1816
Query 1799 GGCTCTAGGAATAGCTCTTACAGTATACGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGA 1858
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817 GGCTCTAGGAATAGCTCTTACAGTATATGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGA 1876
Query 1859 GCAGATGACTAGAGATCAGGATCCTATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATT 1918
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 GCAGATGACGAGAGATCAGGATCCAATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATT 1936
Query 1919 GGCTTACAGTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAATTGCTGCACTTTGCTGTATC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1937 GGCTTACAGTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAATTGCTGCACTTTGCTGTATC 1996
Query 1979 TGATGTCAGTGATGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTC 2038
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 TGATGTCAGTGATGATGTTAGGAGGACTGCCGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTC 2056
Query 2039 TGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCTCTGCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGT 2098
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2057 TGATCCAGAGCAGACTCCCCGTATTGTATCACTGCTTTCTGAGTCATACAATCCACATGT 2116
Query 2099 TCGCTATGGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGC 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117 TCGCTATGGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGC 2176
Query 2159 GATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTT 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177 GATATCCTTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTT 2236
Query 2219 GATTGCAATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGC 2278
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 GATTGCAATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGT 2296
Query 2279 ATTTAGGCGCCAACTTGAGAAGATTATACTCGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGAT 2338
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2297 ATTTAGGCGCCAACTTGAGAAGATTATACTTGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGAT 2356
Query 2339 GGGAGCAATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATCAGACT 2398
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2357 GGGAGCGATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATAAGACT 2416
Query 2399 ACTCTCTAAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCA 2458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 GCTCTCTAAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCA 2476
Query 2459 ATTTTGGTATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTT 2518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2477 GTTTTGGTATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTT 2536
Query 2519 CATCGGTTTGAATTACGACCTTAAGGTCCCCAAGTTTGAGTTCATGTCACACGCAAAACC 2578
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2537 CATCGGTTTGAACTATGACCTTAAGGTCCCAAAGTTTGAGTTCATGTCACATGCAAAACC 2596
Query 2579 GTCTTTGTTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCTGTGAAACT 2638
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 2597 GTCTTTATTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCCGTTAAACT 2656
Query 2639 TCCAACCGCTGTTCTCTCAACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGA 2698
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 TCCAACCGCTGTTCTCTCAACTTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGA 2716
Query 2699 GCAAAAAGCTATTGCTGAAAAAACATCTGGTCCTGAAAAACCTGTCAATGAAAGTGGATC 2758
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2717 GCAAAAAGCTATTGCTGAGAAAACATCTGGCCCTGAAAAGCCTGTCAATGAAAGTGGATC 2776
Query 2759 TGGAAAAGGAAAAGCATCAACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC 2818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2777 TGGAAAAGGAAAAGCATCAACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC 2836
Query 2819 AGCGGTCGAGAAGAAAGCTGCTGAGCCAGAGCCAGCATTTGAGATTCTAGTGAACCCAGC 2878
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2837 AGCGGTCGAGAAGAAAGCACCTGAGCCTGAGCCAGCGTTTGAGATTTTAGTGAACCCAGC 2896
Query 2879 TCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACATAAAGTTACTTGAAGACAGCAGATATGTACC 2938
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2897 TCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACATAAAGTTACTTGATGACAGCAGATATGTACC 2956
Query 2939 AGTGAAGCTAGCTCCGTCAGGTTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTCAACACGAGCCAGA 2998
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2957 AGTGAAGCTAGCACCGTCAGGTTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTGAACACGAGCCAGA 3016
Query 2999 GGTTCTCTCTCTGACCGATGCCCCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGT---GCAGC 3055
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3017 GGTTCTCTCTCTGACCGACGCACCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGGTACAGCAGC 3076
Query 3056 GGC---ACAAGGAACCACAGCCTCGGCTATGGCCGTAGATGATGAGCCACAACCTCCACA 3112
||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3077 GGCTGCACAAGGAACCCCGGCCTCAGCTATGGCCGTAGATGATGAGCCACAACCTCCACA 3136
Query 3113 AGCCTTTGAATACGCTTCATGATTTTATTTTCTTTTAAAATTAGTGGGAATTTGTTGTTG 3172
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3137 AGCCTTTGAATACGCTTCATGATTTTATTT-CATTTAAAATTAGTGGGAATTTGTTGTTG 3195
Query 3173 GTTTTATTGGTTTCTGTTGAAAGACAAAAAGCA-A-AGAAAAACAGATCTTTGAACTTTG 3230
||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3196 GTTTTATTGGTTTCTGTTGAAAGACAAAAGGCAGAGAGAAAAACAGATCTTTGAACTTTG 3255
Query 3231 AGATA-CTGCTTCTTGTCATTTGCAACTGGTTTCAAGTTCAATTACGATCTTTGTGTTAG 3289
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||
Sbjct 3256 AGATAACTGCTTCTTGTCATTTGCAACTGGTTTCATGTTCAACTACGATCTT-GTATTAG 3314
Query 3290 GTACTTTTCTTTT 3302
|||||| ||||||
Sbjct 3315 GTACTTCTCTTTT 3327
> AT1G04810.1 | Symbols: | 26S proteasome regulatory complex,
non-ATPase subcomplex, Rpn2/Psmd1 subunit | chr1:1350180-1355442
FORWARD LENGTH=3311
Length=3311
Score = 3288 bits (1780), Expect = 0.0
Identities = 2638/3045 (87%), Gaps = 87/3045 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 136 CCATGGTTAGTTCGGCTGGAGGGTTACTAGCAATGCTCAACGAGCCTCATCC-TGCTTTA 194
||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||| |
Sbjct 135 CCATGGTTAGTTCCGCCGGTGGGTTACTGGCAATGCTCAACGAACCCCATCCTTCCTTGA 194
Query 195 AAGCTTCATGCGCTCTCTTATCTCAACA-ATTTGGTTGACCAATTCTGGCCTGAGATCTC 253
|| ||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 195 AA-CTTCACGCTCTCTCATATCTCATCAGA-TTGGTTGACCAATTTTGGCCCGAGATCTC 252
Query 254 CACTAGTGTCCCCATCATTGAGAGTTTATATGAAGATGAAGAATTCGATCTGCATCAAAG 313
|||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 253 CACTAGTGTCCCAATCATAGAGAGCTTATACGAAGATGAAGAGTTTGATCAGCATCAAAG 312
Query 314 ACAGCTTGCTGCTTTGCTGGTCTCTAAGGTTTTCTATTACTTGGGCGAGCTTAATGATTC 373
|||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 313 ACAGCTTGCTGCCTTGTTGGCCTCCAAGGTTTTCTATTACTTGGGTGAGCTTAACGATTC 372
Query 374 ATTGTCTTATGCCCTTGGAGCTGGGCCCTTATTTGATGTTTCAGAGGATTCTGATTATGT 433
||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 373 CTTGTCCTATGCCCTTGGAGCTGGATCCTTGTTTGATGTGTCAGAGGATTCTGATTATAT 432
Query 434 TCATACGCTTCTAGCCAAAGCAATAGATGAATATGCCAGTCTCAGATCAAAAGCAGTTGA 493
|||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||
Sbjct 433 TCATACTCTTCTATCCAAAGCAATAGATGAGTATGCTATTCTCAGATCAAAGGCAGTCGA 492
Query 494 GTCAAATGAGATGGTGGACATTGATCCC-AGGCTGGAGGCGATTGTTGAAAGAATGCTTG 552
||||| |||| ||||||| ||||| ||| || ||| ||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 493 GTCAAGTGAGGTGGTGGAAATTGA-CCCGAGATTGGTGGCCATTGTTGAACGAATGC-TA 550
Query 553 GA-AAATGCATCAGTGATGGGAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCGATAGAATGCCGG 611
|| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 551 GACAAATGTATCACTGACGGAAAGTATCAACAAGCCATGGGCATTGCTATAGAATGCCGG 610
Query 612 AGATTGGATAAGTTGGAAGAGGCTATCACT-AAGAGCGATAATGTTCAGGGAACTTTATC 670
||||||||||||||||| || || |||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||
Sbjct 611 AGATTGGATAAGTTGGAGGAAGCGATCA-TAAAGAGTGAGAATGTGCAGGGAACATTATC 669
Query 671 ATATTGCATCAATGTTTCTCATTCCTTTGTTAACCGCAGAGAGTATAGACATGAGGTGCT 730
|| |||||||||||||| || || |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 670 TTACTGCATCAATGTTTCCCACTCTTTTGTTAATCAAAGAGAATATAGACATGAGGTTCT 729
Query 731 TAGTTTACTTGTTAAAGTCTACCAGAAGCTGCCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGTCA 790
| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 730 TCGGTTACTTGTTAATGTTTACCAGAAGCTGGCTTCTCCTGATTATTTGAGCATTTGCCA 789
Query 791 ATGCCTCATGTTTTTGGATGAACCGCAAGGTGTTGCAAGCATTTTGGAGAAGCTTCTTCG 850
|||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 790 ATGCCTTATGTTCTTGGATGAACCACAAGGCGTTGCAAGCATATTGGAGAAGCTTCTTCG 849
Query 851 CTCGGAGAGCAAGGATGATGCTTTATTGGCGTTGCAAAT-TGCATTT-GATCTTGTAGAG 908
|| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| | | ||| ||||||||| ||
Sbjct 850 TTCAGAGAACAAAGATGATGCTTTATTGGCTTTCCAAATCT-C-TTTCGATCTTGTACAG 907
Query 909 AACGAGCACCAGGCCTTTCTCTTGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCTCCCAAAACACGT 968
|| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 908 AATGAGCACCAGGCATTCCTCATGAGTGTTAGAGATCGCCTTCCAGCGCCCAAGACCCGT 967
Query 969 CCTGTAGAAGCAACTCAGGCTGTTGAAA-CTACTACTGCTCCGAATGAGAACCCTTCGGG 1027
||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| || | ||
Sbjct 968 CCTGTAGAAGCAATTCAAGCTGTTGAAACCT-CTACTGCTCAGAATGAGAACACTGCAGG 1026
Query 1028 GGATGTCCAGATGGCGGATGAAACTCCAGCTCAGACAATTGTGCACGAGACAGATCCAGT 1087
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct 1027 GGATGTTCAGATGGCGGATGAAACTCCATCTCAGACAATTGTGCATGAAACAGATCCTGT 1086
Query 1088 TGATGCTACATATGCTGAGAGGTTGACAAAGATTAAGGGAATTTTATCTGGAGAGACATC 1147
||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 TGACGCTGTGTACGCTGAGAGGTTAACAAAGGCTAAGGGGATTTTATCTGGAGAGACATC 1146
Query 1148 TATTCAGCTGACACTTCAATTTCTTTACAGCCACAACAAATCGGACCTGCTGATACTGAA 1207
|| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1147 AATACAACTGACACTCCAGTTTCTTTACAGCCATAACAAATCGGACCTGCTGATCCTGAA 1206
Query 1208 GACAATCAAACAGTCTGTAGAGATGCGGAACAGTGTATGCCACAGTGCTACAATATATGC 1267
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1207 GACAATCAAACAATCTGTTGAGATGCGGAACAGTGTATGTCACAGTGCTACAATTTATGC 1266
Query 1268 TAATGCCATTATGCATGCTGGAACTACAGTGGACACTTTCCTTAGAGAGAATTTGGATTG 1327
|||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 1267 TAATGCTATAATGCATGCTGGAACGACAGTTGACACTTTTCTCAGGGAGAATTTGGATTG 1326
Query 1328 GTTAAGCAGGGCAACCAATTGGGCTAAGTTTAGTGCTACAGCGGGATTAGGTGTTATTCA 1387
| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1327 GCTAAGCAGGGCCACCAATTGGGCCAAGTTTAGTGCTACAGCAGGATTAGGTGTTATTCA 1386
Query 1388 CAGAGGTCATC-TGCAACAGGGTAGGTCATTGATGGCTCCATACTTGCCTCAGGGAGGAG 1446
|| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1387 TAGGGGTCA-CTTGCAACAGGGCAGGTCACTGATGGCCCCATACTTGCCTCAGGGCGGAG 1445
Query 1447 CAGGTGGTGGTGGGAGTCCTTATTCCGAAGGAGGTGCTTTATATGCCCTTGGCCTTATTC 1506
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1446 CAGGTGGTGGCGGGAGTCCTTATTCCGAAGGGGGTGCTTTATATGCTCTCGGCCTTATTC 1505
Query 1507 ATGCTAACCATGGCGAGGGAATCAAGCAATTTCTACGTGATAGCCTACGCAGCACTAATG 1566
|||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 1506 ATGCAAACCATGGTGAGGGAATCAAGCAATTTCTTCGTGATAGTCTACGCAGCACTAGTG 1565
Query 1567 TTGAGGTCATTCAACATGGAGCTTGCTTAGGTCTTGGCTTGTCAGCTCTCGGGACAGCTG 1626
||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||
Sbjct 1566 TTGAGGTTATTCAACACGGAGCTTGTTTAGGTCTTGGTTTGGCTGCTCTTGGGACAGCTG 1625
Query 1627 ATGAAGAGATATATGATGATGTCAAAAGCGTGCTTTATACTGATAGTGCAGTTGCTGGTG 1686
||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1626 ATGAAGACATATATGATGATATCAAAAGTGTGCTTTACACTGACAGTGCTGTTGCTGGTG 1685
Query 1687 AAGCTGCTGGCATCAGCATGGGTTTATTATTGGTTGGAACTGCTACTGAAAAGGCAAGTG 1746
||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 1686 AAGCTGCCGGCATAAGCATGGGTCTATTGTTGGTTGGAACAGCAACTGATAAGGCAAGTG 1745
Query 1747 AGATGCTTGCTTATGCTCATGAGACACAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAG 1806
||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 AGATGCTCGCTTATGCTCACGAGACTCAGCATGAGAAGATAATAAGGGGATTGGCTCTAG 1805
Query 1807 GAATAGCTCTTACAGTATACGGTAGAGAAGAAGGAGCAGATACCTTGATTGAGCAGATGA 1866
|||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1806 GAATAGCTCTCACAGTATATGGAAGAGAAGAGGGAGCAGATACTTTGATTGAGCAGATGA 1865
Query 1867 CTAGAGATCAGGATCCTATCATTCGTTATGGTGGCATGTACGCATTGGCATTGGCTTACA 1926
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||
Sbjct 1866 CTAGAGATCAGGATCCTATCATCCGTTATGGTGGAATGTATGCACTCGCATTGGCTTACA 1925
Query 1927 GTGGAACCGCAAACAACAAGGCAATTCGACAA-TTGCTGCACTTTGCTGTATCTGATGTC 1985
||||||| ||||||||||| || || || ||| || || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1926 GTGGAACTGCAAACAACAAAGCCATCCGCCAACTT-CTTCACTTTGCTGTGTCTGATGTC 1984
Query 1986 AGTGATGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTGGCACTTGGATTTGTCTTGTACTCTGATCCA 2045
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1985 AGTGACGATGTTAGGAGGACTGCTGTTCTTGCACTTGGATTTGTCTTATACTCTGATCCA 2044
Query 2046 GAGCAGACTCCCCGTATTGTATCTCTGCTTTCTGAGTCGTACAATCCACATGTTCGCTAT 2105
||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2045 GAGCAGACTCCCCGTATTGTATCCCTTCTTTCCGAGTCGTACAATCCACATGTCCGCTAT 2104
Query 2106 GGTGCGGCTCTTGCAGTGGGTATTTCTTGTGCAGGCACTGGCCTCAGCGAAGCGATATCC 2165
|| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||
Sbjct 2105 GGCGCAGCTCTTGCAGTTGGCATCTCTTGTGCAGGCACTGGTCTGAGTGAGGCGATATCT 2164
Query 2166 TTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTTGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTTTGATTGCA 2225
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2165 TTGTTGGAGCCACTTACATCAGATGTTGTAGACTTTGTTCGTCAAGGTGCTCTGATTGCC 2224
Query 2226 ATGGCCATGGTGATGGTTCAAATTAGCGAAGCTAGCGATTCTCGTGTTGGAGCATTTAGG 2285
||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2225 ATGGCCATGGTGATGGTCCAAATTAGTGAAGCAAGCGATTCTCGCGTTGGAGCATTTAGG 2284
Query 2286 CGCCAACTTGAGAAGATTATACTCGACAAGCACGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCA 2345
|| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 CGTCAACTTGAGAAGATAATACTTGACAAGCATGAAGATACAATGAGCAAGATGGGAGCA 2344
Query 2346 ATTCTGGCCTCTGGTATCCTTGATGCTGGTGGTAGGAACGTTACTATCAGACTACTCTCT 2405
||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||
Sbjct 2345 ATTTTGGCTTCAGGTATTCTTGATGCTGGTGGAAGGAATGTGACGATAAGACTGCTGTCT 2404
Query 2406 AAGACCAAACATGACAAAGTCACTGCTGTTATCGGCCTTGCAGTCTTCAGCCAATTTTGG 2465
||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 2405 AAGACAAAACATGACAAAGTCACTGCAGTCATTGGCCTTACTGTCTTCAGCCAGTTTTGG 2464
Query 2466 TATTGGTACCCACTGATCTATTTCATTAGTTTGGCCTTCTCACCAACCGCTTTCATCGGT 2525
|||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2465 TATTGGTACCCATTGATTTACTTCATAAGCTTGGCGTTTTCACCCACCGCCTTCATCGGT 2524
Query 2526 TTGAATTACGACCTTAAGGTCCCCAAGTTTGAGTTCATGTCACACGCAAAACCGTCTTTG 2585
||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2525 TTGAACTACGATCTCAAAGTCCCAAAGTTTGAATTCATGTCACACGCAAAACCATCGTTG 2584
Query 2586 TTTGAGTACCCAAAACCCACCACGGTTCCTACAGCCAATACCGCTGTGAAACTT-CCAAC 2644
|||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||
Sbjct 2585 TTTGAGTATCCAAAACCAACTACGGTTGCTACTGCCAACACCGCTGCCAAA-TTACCAAC 2643
Query 2645 CGCTGTTCTCTCAACCTCAGTTAAAGCCAAAGCTAGGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAAAA 2704
||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2644 TGCTGTGCTCTCAACCTCAGCCAAAGCCAAAGCTAAGGCTAAGAAAGAAGCAGAGCAGAA 2703
Query 2705 AGCTATTGCTGAAAAAACATCTGGTCCTGAAAAACCTGTCAATGAAAGTGGATCTGGAAA 2764
||||| |||||||| | ||||| | || || || | |||||||
Sbjct 2704 AGCTAAAGCTGAAAA--C-TCTGG-C---AA-----TG--AA-G---------CTGGAAA 2739
Query 2765 AGGAAAAGCA---TCA-ACTGAGAAGGAAGGAGACTCTATGCAGGTCGATAGCCCAGC-A 2819
|| || ||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |
Sbjct 2740 AGCCAATGCAGCGTCAGA-TGAGAAGGAAGCAGAGTCTATGCAGGTTGATAGCACAGCTA 2798
Query 2820 G--CGGTCGAGAAGAAAGCTGCTGAGCCAGA-GCCAGCATTTGAGATTCTAGTGAACCCA 2876
|||| |||||||| | | ||||||||| || | | |||||||||||||| || ||
Sbjct 2799 CAACGGTGGAGAAGAAGG-T--TGAGCCAGAAGCAA-CGTTTGAGATTCTAGTCAATCCT 2854
Query 2877 GCTCGAGTAGTCCCAGCTCAAGAGAAATACAT-AAAGTT-ACTTGAAGACAGCAGATATG 2934
|| || |||||||| | || ||||||||||| ||| || | | || || ||| ||||||
Sbjct 2855 GCGCGTGTAGTCCCTTCACAGGAGAAATACATCAAA-TTGA-TGGAGGATAGCCGATATG 2912
Query 2935 TACC-AGTGAAGCTAGCTCCGTCAGG-TTTCGTTCTTCTCAAAGACTTGCGTCAACACGA 2992
|||| | ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 2913 TACCGA-TGAAGCTAGCTCCATCAGGGTTT-GTCCTTCTCAGAGACTTGCGTCCGCATGA 2970
Query 2993 GCCAGAGGTTCTCTCTCTGACCGATGCCCCAACTTCAACAGCTTCTCCTGCAACTGG-TG 3051
||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||| ||
Sbjct 2971 GCCTGAAGTTCTGTCTCTGACCGATGCACCGACTTCAACAGCATCCCCTGCAG-TGGGTG 3029
Query 3052 CAGC-G--GCA---CAAGG--AACCA-CAGCC------TCGGCTATGGCCGTAGATGATG 3096
||| | ||| |||| ||| | ||||| || ||||||||| ||||||| |
Sbjct 3030 CAGAAGCTGCAGGACAAGCCCAACAAGCAGCCACCACCTCTGCTATGGCCATAGATGACG 3089
Query 3097 AGCCACAACCTCCACAAGCCTTTGAATACGCTTC---ATGATTTT 3138
||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3090 AGCCACAACCTCCGCAGGCCTTTGAATACGCTTCTCCATGATTTT 3134
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164296738325
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5