BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482300
Length=4253
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G33540.1 | Symbols: CPL3, ATCPL3 | C-terminal domain phospha... 6257 0.0
> AT2G33540.1 | Symbols: CPL3, ATCPL3 | C-terminal domain phosphatase-like
3 | chr2:14203505-14208797 REVERSE LENGTH=4302
Length=4302
Score = 6257 bits (3388), Expect = 0.0
Identities = 3995/4277 (93%), Gaps = 85/4277 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGCTTGTGGCTCGATCTGGTTGTTCTAGAACCCTAATTCGAATGGGCAACGATGAAAAC 60
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTGTAGCTCGATCTGGTTGTTCTAGAACCCTAATTCGAATGGGCAACGATGAAAAC 60
Query 61 TTGATGGTATTGGCGGATGTTGAGGAAGGTGAGATTCCTGATTCTGGGAACACTGAGATT 120
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 TTGATGGTAATGGTGGATGTTGAGGAAGGTGAGATTCCTGATTCTGTCAACACTGAGATT 120
Query 121 GAAGTTAAGCA-GA-AG-ACTACTACTACGGCCGATGTTGGCGGAGACGTCGATGTT--- 174
||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GAAGTTAAGCACAAGAGTACTACTACTACGGCCGATGTTGGCGGAGACGTCGATGTTGGG 180
Query 175 g--gagg-aagaggaggaggaggaggaggTGGTGGTTCTAACGGCAACTCTAGGGTTTGG 231
| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTTGTGGCTGGAGGAAGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTTCTAATGGCAACTCTAGGGTTTGG 240
Query 232 ACAATGGAGGATTTGCTTACTAAGTATCCTGGTTACCGTCTATATGCGACTTCGGGTTTA 291
||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 241 ACAATGGAGGAGTTGATTTCTCAGTATCCTGCTTACCGTCCATATGCGAATTCGGGTTTA 300
Query 292 TCTAATTTTGCTTGGTCTCAAGCTGTGCAGAACAAATCTCTTAATGAAGGTTTGGTAATG 351
|||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCTAATTTAGCTTGGGCTCGAGCTGTGCAGAACAAACCTTTTAATGAAGGTTTGGTAATG 360
Query 352 GATTATGAACCAAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGATAGTGGTGATGAGAAAGAG 411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 GATTATGAACCAAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGATAGTGATGATGAGAAAGAA 420
Query 412 GAAGGAGAGTTGGAGGAAGGTGAAATTGATTTGGTGGAGAATGCTTCTGATGACAATTTG 471
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAAGGTGAGTTGGAGGAAGGTGAAATTGATTTGGTCGACAATGCTTCTGATGACAATTTG 480
Query 472 GTTGCTAGTGTTGACAAGGAAACTGAATCTGTTGTGTTGATAAGTGCTGATAAAGTGGAA 531
|||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 481 GTTG--A-----G--AAGGATACTGAATCTGTTGTGTTGATAAGTGCTGATAAAGTTGAA 531
Query 532 GATGATCGTATTC-AGAAGGAGATAGATTTGGAGAAGAATGTGAAACTGATTCGTGGGGT 590
|||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct 532 GATGATCGAATTCTA-AAGGAGAGAGATTTGGAGAAGAAAGTGAAACTAATTCGTGGTGT 590
Query 591 ATTGGAGAGTACTTCGTTGGTAGAAGCACAGACCGGATTTGAAGGGGTTTGTTCCAGAAT 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 591 TTTGGAGAGTACTTCGTTGGTAGAAGCACAGACCGGATTTGAAGGAGTTTGTTCCAGAAT 650
Query 651 TTTGGGGGCTTTAGAGTCTTTGCGAGAGCTGGTTTCAGATAATGAGGATTTTCCGAAGAG 710
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 651 ATTGGGGGCGTTAGAGTCTTTGCGAGAGCTGGTTTCAGATAATGATGATTTTCCGAAGAG 710
Query 711 GGATACTTTAGTTCAATTGTCATTTGCTTCTCTTCAAACCATAAACTCTGTGTTTTGCTC 770
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 711 GGATACTTTAGTTCAATTGTCATTTGCTTCTCTTCAAACCATTAACTATGTGTTTTGCTC 770
Query 771 GTTGAATAATGTTTCCAAGGAGCGTAATAAGGAGACTATGTCAAGATTGCTAACTCTTGT 830
| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 771 GATGAACAATATTTCCAAGGAGCGTAATAAGGAGACTATGTCAAGATTGCTGACTCTTGT 830
Query 831 AAATGACCATTTTTCCCGATTTCTCTCATCCAACCAGAAAAATGAGATAGAGGCCATGAA 890
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 831 AAATGACCATTTTTCCCAATTTCTCTCATTCAACCAGAAAAATGAGATAGAGACCATGAA 890
Query 891 TCAGGATTTTAGCCGTTCTGCTATTGCAGTTTATACTGGAACCAGCAGTGAAGAGAATGT 950
||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TCAGGATTTAAGCCGTTCTGCTATTGCAGTTTTTGCTGGAACCAGCAGTGAAGAGAATGT 950
Query 951 TAATCGAATGACTCAGACAAGTAATGGTGATTCGTTTCTTGCCAAAAAGCTGTCTTCAGA 1010
||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 951 TAATCAAATGACTCAGCCGAGTAATGGTGATTCTTTTCTTGCCAAAAAGCTGACTTCAGA 1010
Query 1011 AGGTACACATCGAGGAGCCTCCTACGTAAGGAGTAGGTTGCCTATGCTGCCTCTTCTAGA 1070
| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 AAGTACACATCGAGGAGCCGCCTACTTAAGGAGTAGGTTGCCTATGCTGCCTCTTCTAGA 1070
Query 1071 CCTACATAAGGATCATGATGCAGACAGCCTTCCATCGCCCACTAGGGAAACAACACCAAG 1130
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1071 CCTTCATAAGGATCATGATGCAGACAGCCTTCCGTCGCCCACAAGGGAAACAACACCAAG 1130
Query 1131 TTTACCAGTAAATGGTCGCCATACAATGGTTAAACCAGGTTTTCCCGTCGGTAGAGAGAG 1190
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1131 TTTACCTGTAAATGGTCGCCATACAATGGTTAGACCAGGTTTTCCCGTTGGTAGAGAGAG 1190
Query 1191 CCAAACAACTGAAGGTGCCAAAGTCTATCCATATGAGAGTGATGCCCTTAAAGCAGTTTC 1250
|||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1191 CCAAACGACTGAGGGTGCCAAAGTCTATTCATATGAGAGTGATGCCCGTAAAGCAGTTTC 1250
Query 1251 TACCTACCATCAAAAATTTGGTCTTAATTCAGTGTTTAAGACAGATGACCTTCCAAGCCC 1310
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 TACCTACCAGCAAAAATTTGGTCTTAATTCAGTGTTTAAGACAGATGACCTTCCAAGCCC 1310
Query 1311 AACACCATCAGGAGAACCTAATGATGGCAATGGAGATATTGGTGGAGAGGTTTCTAGTTC 1370
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1311 AACCCCATCAGGAGAACCTAATGATGGCAATGGAGACGTTGGTGGAGAGGTTTCCAGTTC 1370
Query 1371 TGTTGTTAAGAGCTCGAATCCGGGGACTCTCCTAATTTATGGGCAAGACGTTCCTCTGCC 1430
|||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 TGTTGTTAAGAGCTCGAACCCGGGGAGTCACCTAATTTATGGGCAAGACGTTCCTCTGCC 1430
Query 1431 CTCCAATTTTAATTCTAGAAGCATGCCTGTTGCAAATGCTGTTTCTAGCACTGTTCCACC 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1431 CTCCAATTTTAATTCTAGAAGCATGCCTGTTGCAAATTCTGTTTCTAGCACTGTTCCACC 1490
Query 1491 ACATCATCTGTCAATTCATACTATTTCTGCACCAACTGGTTCTACTCAAACAGTTTTTGC 1550
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | || | ||
Sbjct 1491 ACATCATCTGTCAATTCATGCTATTTCTGCACCAACT-G--C--CT----C------TG- 1534
Query 1551 ATCTGACCAGACAGTGAAACCTTCTGCAAAGAGTCGAGATCCAAGACTAAGGCTTGCAAA 1610
| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1535 A--T---CAGACAGTGAAACCTTCTGCAAAGAGTCGAGATCCAAGACTAAGGCTTGCGAA 1589
Query 1611 ACCTGATACTGCCAATGTAACCATCAATTCCTACTCGTCTGGCGATGCTAGAAATCTTTT 1670
||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1590 ACCTGATGCTGCCAATGTAACCATTTATTCGTACTCGTCTGGCGACGCTAGAAATCTTTC 1649
Query 1671 TAAAGTAGAGCTTTCTGCAGACTTGGTGAACCCAAGAAAGCAAAAAGCCGCTGATGAACT 1730
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1650 AAAAGTAGAGCTTTCTGCAGACTTGGTGAACCCAAGAAAACAAAAAGCCGCTGATGAA-T 1708
Query 1731 TTTT-ATTGATGGGCCTGCATGGAAAAGACAAAAGAGTGATACGGATGCACCAAAAGCAG 1789
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 TTTTAATTGATGGGCCTGCATGGAAAAGACAAAAGAGTGATACGGATGCACCAAAAGCAG 1768
Query 1790 CTGGAATTGGTGGCTGGCTAGAGGATACAGAATCATCGGGACTTCCAAAACTGGAATCCA 1849
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1769 CTGGAACTGGTGGCTGGCTAGAGGATACAGAATCATCGGGACTTCTAAAACTGGAATCCA 1828
Query 1850 AGCCTAGGCTTATTGAGAACGGTGTAACTTCTATGACAACAAGTGTTATGCCCACGAGTG 1909
|||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 AGCCCAGGCTAATTGAGAACGGTGTAACATCTATGACATCAAGTGTTATGCCCACGAGTG 1888
Query 1910 CGGTTTCTGTGAGCCAAAAAGTACCAACAGCTTCAACTGACGCTGCATCATTGCAATCTC 1969
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 1889 CTGTTTCTGTGAGCCAAAAAGTACGGACAGCTTCAACTGATACTGCATCATTGCAATCCC 1948
Query 1970 TTTTGAAGGATATTGCAGTAAATCCGACAATGCTACTGAATCTACTGAAAATGGGAGAAA 2029
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1949 TTTTGAAGGATATTGCAGTAAATCCTACAATGCTACTGAATCTCCTGAAAATGGGAGAAA 2008
Query 2030 GGCATAAGGTACCTGAAAAAGCTCTTCAGAAACCCATGGATCCAAGAAGAGCAGCACAAC 2089
| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2009 GACAAAAGGTACCTGAAAAAGCTATTCAGAAACCCATGGATCCAAGAAGAGCAGCACAAC 2068
Query 2090 TTCCTGGCTCTTCCGTGCTACCAGGGGTATCAGCACCGCTTCA-TATACCTGCATCAAAT 2148
| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 2069 TCCCTGGCTCTTCCGTACAACCAGGGGTATCAACACCGCTT-AGTATACCTGCATCAAAT 2127
Query 2149 GCTTTAGCTACTAATTCTTCAAAGC-GAGGAGTACTTCAGGATTCTTCCCAAAACGCCCC 2207
||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128 GCTTTAGCTGCTAATTCTTTAAA-CTCAGGAGTACTTCAGGATTCTTCCCAAAACGCCCC 2186
Query 2208 CGCAGACGAATCTGGAAGCATTCGCATGAAACCTCGTGATCCTCGCCGAATCCTGCATGG 2267
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187 TGCAGCCGAATCTGGAAGCATTCGCATGAAACCTCGTGATCCTCGCCGAATCCTGCATGG 2246
Query 2268 AGGTACTCTTCAAAGAACAGACTCTTCAATGGAAAAGCAGTCCAAAGTGAATGATTCC-T 2326
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct 2247 AAGTACTCTTCAAAGAACGGACTCTTCAATGGAAAAGCAGACCAAAGTGAATGA-TCCTT 2305
Query 2327 CCACTCTAGGAACCTTGACTATGAAGGGTAAGACAGAAGATTTAGAATCACCTTCCCAGC 2386
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct 2306 CCACTCTAGGAACCTTGACTATGAAGGGTAAGGCAGAAGATTTGGAAACACCTCCCCAGC 2365
Query 2387 TTGTTCCACGGCAAAATATTAGCCAAAATGGTACCAGCAAAATGAAAATTTCGGGTGAAC 2446
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 TTGATCCACGGCAAAATATTAGCCAGAATGGTACCAGCAAAATGAAAATTTCGGGTGAAC 2425
Query 2447 TTCTCAGTGAAAAGACACCAGATTTTTCAACACAATTCACCAAAAGCGTGAAAAATATTG 2506
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||
Sbjct 2426 TTCTCAGTGGGAAGACACCAGACTTTTCAACACAATTCACCAAAAACCTGAAAAGTATTG 2485
Query 2507 CTGATATGGTTGTCGTGTCACAACAAGC-TGGCAATCCCCCAGCAAGTACGCATTCAATA 2565
|||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 2486 CTGATATGGTTGTCGTATCACAACAA-CTTGGCAATCCCCCAGCAAGTATGCATTCGGTA 2544
Query 2566 CAGCTTAAGACGGAGAGAGATGTTAAACAGAATCCTTCAAATCCCAATGACCAGGAGGAG 2625
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2545 CAGCTTAAGACGGAGAGAGATGTTAAACATAATCCTTCAAATCCCAATGCCCAGGATGAG 2604
Query 2626 GATATGTCAGTTTCAGCAGCATCAGTAACAGCTGCAGCTGGTCCCACTCGTTCCATGAAC 2685
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2605 GATGTGTCAGTTTCAGCAGCATCAGTAACGGCTGCAGCTGGTCCCACTCGTTCCATGAAC 2664
Query 2686 AGTTGGGGAGATGTGGAACACCTATTTGAAGGATATGATGACACGCAGAGAGTAGCTATT 2745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2665 AGTTGGGGAGATGTGGAACACCTATTTGAAGGATATGATGACATTCAGAGAGTAGCTATT 2724
Query 2746 CAAAGAGAGAGAGTTCGGAGGTTAGAGGAACAGAAGAAAATGTTTGCATCTCAGAAGCTC 2805
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2725 CAAAGAGAGAGAGTTCGTAGGTTAGAGGAACAGAATAAAATGTTTGCATCTCAAAAGCTC 2784
Query 2806 TCTCTTGTCTTGGATATAGACCACACCCTTCTCAATTCAGCCAAGTTTAATGAGGTTGAA 2865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2785 TCTCTTGTCTTGGATATAGACCACACCCTTCTCAATTCAGCTAAGTTTAATGAGGTTGAA 2844
Query 2866 TTCCGCCACGAGGAGATATTGAGAAAGAAGGAGGAACAAGATCGTGAGAAACCATATAGA 2925
| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2845 TCCCGCCACGAGGAGATATTAAGAAAGAAGGAAGAACAAGATCGTGAGAAACCATATAGA 2904
Query 2926 CATCTCTTTCGCTTCCCCCACATGGGAATGTGGACTAAATTGAGACCAGGGATTTGGAAT 2985
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2905 CATCTCTTTCGTTTCCTGCACATGGGAATGTGGACTAAACTAAGACCAGGGATTTGGAAT 2964
Query 2986 TTTTTGGAGAAGGCTAGCAAGCTGTACGAGTTACATCTTTACACTATGGGCAACAAATTG 3045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2965 TTTTTGGAGAAGGCTAGCAAGCTGTACGAGTTACATCTTTACACTATGGGAAACAAATTG 3024
Query 3046 TATGCTACAGAGATGGCCAAACTGCTTGATCCCAAAGGGGTTCTCTTTAATGGACGGGTC 3105
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3025 TATGCTACAGAGATGGCCAAGCTGCTTGATCCCAAAGGGGTTCTATTTAATGGACGGGTC 3084
Query 3106 ATATCGAAAGGAGATGATGGAGATCCTCTTGATGGAGATGAACGAGTACCTAAGAGCAAA 3165
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3085 ATATCGAAAGGAGATGATGGAGATCCTCTTGATGGAGACGAACGAGTACCTAAGAGCAAA 3144
Query 3166 GATTTAGAAGGAGTTATGGGTATGGAATCGTCTGTGGTGATCATAGATGACTCTGTCCGA 3225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3145 GATTTAGAAGGAGTTATGGGTATGGAATCGTCTGTGGTGATCATAGATGACTCTGTCCGA 3204
Query 3226 GTGTGGCCTCATA-ACAAAATGAATTTAATAGCTGTTGAAAGATATCTTTATTTCCCTTG 3284
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3205 GTGTGGCCTCA-ACACAAAATGAATTTAATAGCTGTTGAAAGATATCTTTATTTCCCTTG 3263
Query 3285 TAGTAGACGGCAATTTGGGCTTCTTGGTCCTTCTCTTCTTGAGTTAGATCGCGACGAGGT 3344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3264 TAGTAGACGGCAATTTGGGCTTCTTGGTCCTTCTCTTCTTGAGTTAGATCGTGATGAGGT 3323
Query 3345 ACCTGAGGAGGGCACATTGGCATCTTCATTAGCGGTTATTGAGAAAATACAT-AAAAGTT 3403
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 3324 ACCTGAGGAGGGCACATTGGCATCTTCATTAGCGGTTATTGAGAAAATACATCAAAA-TT 3382
Query 3404 TCTTCTCGCACACTTCACTAGACGAAGTAGATGTGAGAAATATTTTAGCTTCTGAGCAAC 3463
||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3383 TCTTCTCGCACACTTCATTAGATGAAGTTGATGTGAGAAATATTTTAGCTTCTGAGCAAC 3442
Query 3464 GAAAGATATTGGCTGGTTGTCGGATTGTATTTAGTCGGATAATCCCAGTGGGTGAAGCCA 3523
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3443 GAAAGATATTGGCTGGTTGTAGGATTGTATTTAGTCGGATAATCCCAGTGGGTGAAGCCA 3502
Query 3524 AACCGCACTTGCATCCCTTGTGGCAAACTGCTGAGCAGTTTGGTGCTGTCTGCACAACCC 3583
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3503 AACCGCACTTGCATCCCCTGTGGCAAACTGCTGAGCAGTTTGGTGCTGTCTGCACAACCC 3562
Query 3584 AGGTGGATGAACATGTCACTCATGTTGTCACAAATTCTCTTGGAACCGACAAGGTAAATT 3643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3563 AGGTGGATGAACATGTCACTCATGTTGTCACAAATTCTCTTGGAACCGACAAGGTAAATT 3622
Query 3644 GGGCACTAACCAGAGGTAGATTTGTTGTTCATCCTGGCTGGGTGGAAGCATCAGCTTTTC 3703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3623 GGGCACTAACCAGAGGTAGATTTGTTGTTCATCCTGGCTGGGTGGAAGCATCAGCTTTTC 3682
Query 3704 TGTACCAGAGAGCAAATGAGAACTTATATGCCATCAACCCGTAAACCAAATCCATTTTCC 3763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3683 TGTACCAGAGAGCAAATGAGAACTTATATGCCATCAACCCGTAAACCAAATCCATGATCC 3742
Query 3764 GCCATCTTAATATCCCCACCATCTGGTGGCATTGAGACTTAAGAAGGCCAT-AAAACCCA 3822
||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 3743 GCCCTCTTAA-ATCCCCACCATTTGGTGGAATTGAGACTTAAGAAGGCC-TGAAAACCCA 3800
Query 3823 ATAGGTCAGATTGGGTTGTTGATAAGGCTAGACCCCCGGGGGTACATACGCATTATTTTG 3882
||| |||| ||||||||| | || |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||
Sbjct 3801 ATAAGTCATATTGGGTTGAT--TA-GGCTAGGCCCC-GGGG-TACATACACATTCTTTTG 3855
Query 3883 CCTCCAAAAGAGGC-AATTCATTAAAATGCCAAAGGTATTAGGGGCTATTAACAAAACGA 3941
|| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 3856 CC-CCAAAAGAAGCGAATTCATTAAAATGCCAAAGGTATTGGGGGCTTTTAACAAAACGA 3914
Query 3942 ACTCCACATTGTATCAATGGTCTAGTA-TAGATCTACTAACTTGGGGGAGGGTGAAGGAA 4000
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | ||||||||||
Sbjct 3915 ACTCCACATTGTATCAATGGTCTAG-AGTAGATCTACTTACTTTGGG-ATGGTGAAGGAA 3972
Query 4001 AGTAGTCTGTCTCTGGATCTAAAAAAC-A-CA--AGAAAGACCCAGCAGTAGAAAGTGTG 4056
| ||||||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3973 ACTAGTCTGTCTCTGAATCTAAAAAAATAACACCAGAGAGACCCAGCATTAGAAAGTATG 4032
Query 4057 ATGTGCCAGGGTCACGTGCCAAAGGAGAGAGAGGATCATGTTCAATTTTGGTTCTCATCT 4116
|||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4033 ATGTGCCAAGGTCACGTGTCAAAGGAGAG-GA---TCATGTTCAATTTTGGTTCTCATCT 4088
Query 4117 GTTGATTCATGATCGGTAGGTTCTCTCCGATATATGTTTGTTGTGGTATTTATGTCTCTT 4176
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4089 GTTGATTCATGATCGGT-----CA----GATAAATGTTTGTTGTGGTATTTATGTCTCTT 4139
Query 4177 GTTGGAAGCAATTCTGATGGGGTACCAAGGCAACCGAGAAGAGAACAAAGCTTTAATTCA 4236
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4140 GTCGGAAGCAATTCTGATGGGGTACCAAGGCAACAGAGAAGAGAAGAAAGCTTTAATTGA 4199
Query 4237 AATGTGCATATGCCTTA 4253
||||| |||||||||||
Sbjct 4200 AATGTTCATATGCCTTA 4216
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 212005501118
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5