BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg482300

Length=4253
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT2G33540.1 | Symbols: CPL3, ATCPL3 | C-terminal domain phospha...  6257    0.0  


> AT2G33540.1 | Symbols: CPL3, ATCPL3 | C-terminal domain phosphatase-like 
3 | chr2:14203505-14208797 REVERSE LENGTH=4302
Length=4302

 Score = 6257 bits (3388),  Expect = 0.0
 Identities = 3995/4277 (93%), Gaps = 85/4277 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGCTTGTGGCTCGATCTGGTTGTTCTAGAACCCTAATTCGAATGGGCAACGATGAAAAC  60
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGCTTGTAGCTCGATCTGGTTGTTCTAGAACCCTAATTCGAATGGGCAACGATGAAAAC  60

Query  61    TTGATGGTATTGGCGGATGTTGAGGAAGGTGAGATTCCTGATTCTGGGAACACTGAGATT  120
             ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
Sbjct  61    TTGATGGTAATGGTGGATGTTGAGGAAGGTGAGATTCCTGATTCTGTCAACACTGAGATT  120

Query  121   GAAGTTAAGCA-GA-AG-ACTACTACTACGGCCGATGTTGGCGGAGACGTCGATGTT---  174
             |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  121   GAAGTTAAGCACAAGAGTACTACTACTACGGCCGATGTTGGCGGAGACGTCGATGTTGGG  180

Query  175   g--gagg-aagaggaggaggaggaggaggTGGTGGTTCTAACGGCAACTCTAGGGTTTGG  231
             |  | ||   ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  181   GTTGTGGCTGGAGGAAGAGGAGGAGGTGGTGGTGGTTCTAATGGCAACTCTAGGGTTTGG  240

Query  232   ACAATGGAGGATTTGCTTACTAAGTATCCTGGTTACCGTCTATATGCGACTTCGGGTTTA  291
             ||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct  241   ACAATGGAGGAGTTGATTTCTCAGTATCCTGCTTACCGTCCATATGCGAATTCGGGTTTA  300

Query  292   TCTAATTTTGCTTGGTCTCAAGCTGTGCAGAACAAATCTCTTAATGAAGGTTTGGTAATG  351
             |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TCTAATTTAGCTTGGGCTCGAGCTGTGCAGAACAAACCTTTTAATGAAGGTTTGGTAATG  360

Query  352   GATTATGAACCAAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGATAGTGGTGATGAGAAAGAG  411
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| 
Sbjct  361   GATTATGAACCAAGAGAGAGTGATAAGATTGTGATTGAAGATAGTGATGATGAGAAAGAA  420

Query  412   GAAGGAGAGTTGGAGGAAGGTGAAATTGATTTGGTGGAGAATGCTTCTGATGACAATTTG  471
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct  421   GAAGGTGAGTTGGAGGAAGGTGAAATTGATTTGGTCGACAATGCTTCTGATGACAATTTG  480

Query  472   GTTGCTAGTGTTGACAAGGAAACTGAATCTGTTGTGTTGATAAGTGCTGATAAAGTGGAA  531
             ||||  |     |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  481   GTTG--A-----G--AAGGATACTGAATCTGTTGTGTTGATAAGTGCTGATAAAGTTGAA  531

Query  532   GATGATCGTATTC-AGAAGGAGATAGATTTGGAGAAGAATGTGAAACTGATTCGTGGGGT  590
             |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||
Sbjct  532   GATGATCGAATTCTA-AAGGAGAGAGATTTGGAGAAGAAAGTGAAACTAATTCGTGGTGT  590

Query  591   ATTGGAGAGTACTTCGTTGGTAGAAGCACAGACCGGATTTGAAGGGGTTTGTTCCAGAAT  650
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  591   TTTGGAGAGTACTTCGTTGGTAGAAGCACAGACCGGATTTGAAGGAGTTTGTTCCAGAAT  650

Query  651   TTTGGGGGCTTTAGAGTCTTTGCGAGAGCTGGTTTCAGATAATGAGGATTTTCCGAAGAG  710
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  651   ATTGGGGGCGTTAGAGTCTTTGCGAGAGCTGGTTTCAGATAATGATGATTTTCCGAAGAG  710

Query  711   GGATACTTTAGTTCAATTGTCATTTGCTTCTCTTCAAACCATAAACTCTGTGTTTTGCTC  770
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct  711   GGATACTTTAGTTCAATTGTCATTTGCTTCTCTTCAAACCATTAACTATGTGTTTTGCTC  770

Query  771   GTTGAATAATGTTTCCAAGGAGCGTAATAAGGAGACTATGTCAAGATTGCTAACTCTTGT  830
             | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  771   GATGAACAATATTTCCAAGGAGCGTAATAAGGAGACTATGTCAAGATTGCTGACTCTTGT  830

Query  831   AAATGACCATTTTTCCCGATTTCTCTCATCCAACCAGAAAAATGAGATAGAGGCCATGAA  890
             ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  831   AAATGACCATTTTTCCCAATTTCTCTCATTCAACCAGAAAAATGAGATAGAGACCATGAA  890

Query  891   TCAGGATTTTAGCCGTTCTGCTATTGCAGTTTATACTGGAACCAGCAGTGAAGAGAATGT  950
             ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891   TCAGGATTTAAGCCGTTCTGCTATTGCAGTTTTTGCTGGAACCAGCAGTGAAGAGAATGT  950

Query  951   TAATCGAATGACTCAGACAAGTAATGGTGATTCGTTTCTTGCCAAAAAGCTGTCTTCAGA  1010
             ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  951   TAATCAAATGACTCAGCCGAGTAATGGTGATTCTTTTCTTGCCAAAAAGCTGACTTCAGA  1010

Query  1011  AGGTACACATCGAGGAGCCTCCTACGTAAGGAGTAGGTTGCCTATGCTGCCTCTTCTAGA  1070
             | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1011  AAGTACACATCGAGGAGCCGCCTACTTAAGGAGTAGGTTGCCTATGCTGCCTCTTCTAGA  1070

Query  1071  CCTACATAAGGATCATGATGCAGACAGCCTTCCATCGCCCACTAGGGAAACAACACCAAG  1130
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1071  CCTTCATAAGGATCATGATGCAGACAGCCTTCCGTCGCCCACAAGGGAAACAACACCAAG  1130

Query  1131  TTTACCAGTAAATGGTCGCCATACAATGGTTAAACCAGGTTTTCCCGTCGGTAGAGAGAG  1190
             |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1131  TTTACCTGTAAATGGTCGCCATACAATGGTTAGACCAGGTTTTCCCGTTGGTAGAGAGAG  1190

Query  1191  CCAAACAACTGAAGGTGCCAAAGTCTATCCATATGAGAGTGATGCCCTTAAAGCAGTTTC  1250
             |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1191  CCAAACGACTGAGGGTGCCAAAGTCTATTCATATGAGAGTGATGCCCGTAAAGCAGTTTC  1250

Query  1251  TACCTACCATCAAAAATTTGGTCTTAATTCAGTGTTTAAGACAGATGACCTTCCAAGCCC  1310
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1251  TACCTACCAGCAAAAATTTGGTCTTAATTCAGTGTTTAAGACAGATGACCTTCCAAGCCC  1310

Query  1311  AACACCATCAGGAGAACCTAATGATGGCAATGGAGATATTGGTGGAGAGGTTTCTAGTTC  1370
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||
Sbjct  1311  AACCCCATCAGGAGAACCTAATGATGGCAATGGAGACGTTGGTGGAGAGGTTTCCAGTTC  1370

Query  1371  TGTTGTTAAGAGCTCGAATCCGGGGACTCTCCTAATTTATGGGCAAGACGTTCCTCTGCC  1430
             |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1371  TGTTGTTAAGAGCTCGAACCCGGGGAGTCACCTAATTTATGGGCAAGACGTTCCTCTGCC  1430

Query  1431  CTCCAATTTTAATTCTAGAAGCATGCCTGTTGCAAATGCTGTTTCTAGCACTGTTCCACC  1490
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1431  CTCCAATTTTAATTCTAGAAGCATGCCTGTTGCAAATTCTGTTTCTAGCACTGTTCCACC  1490

Query  1491  ACATCATCTGTCAATTCATACTATTTCTGCACCAACTGGTTCTACTCAAACAGTTTTTGC  1550
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  ||    |      || 
Sbjct  1491  ACATCATCTGTCAATTCATGCTATTTCTGCACCAACT-G--C--CT----C------TG-  1534

Query  1551  ATCTGACCAGACAGTGAAACCTTCTGCAAAGAGTCGAGATCCAAGACTAAGGCTTGCAAA  1610
             |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  1535  A--T---CAGACAGTGAAACCTTCTGCAAAGAGTCGAGATCCAAGACTAAGGCTTGCGAA  1589

Query  1611  ACCTGATACTGCCAATGTAACCATCAATTCCTACTCGTCTGGCGATGCTAGAAATCTTTT  1670
             ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| 
Sbjct  1590  ACCTGATGCTGCCAATGTAACCATTTATTCGTACTCGTCTGGCGACGCTAGAAATCTTTC  1649

Query  1671  TAAAGTAGAGCTTTCTGCAGACTTGGTGAACCCAAGAAAGCAAAAAGCCGCTGATGAACT  1730
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct  1650  AAAAGTAGAGCTTTCTGCAGACTTGGTGAACCCAAGAAAACAAAAAGCCGCTGATGAA-T  1708

Query  1731  TTTT-ATTGATGGGCCTGCATGGAAAAGACAAAAGAGTGATACGGATGCACCAAAAGCAG  1789
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1709  TTTTAATTGATGGGCCTGCATGGAAAAGACAAAAGAGTGATACGGATGCACCAAAAGCAG  1768

Query  1790  CTGGAATTGGTGGCTGGCTAGAGGATACAGAATCATCGGGACTTCCAAAACTGGAATCCA  1849
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1769  CTGGAACTGGTGGCTGGCTAGAGGATACAGAATCATCGGGACTTCTAAAACTGGAATCCA  1828

Query  1850  AGCCTAGGCTTATTGAGAACGGTGTAACTTCTATGACAACAAGTGTTATGCCCACGAGTG  1909
             |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1829  AGCCCAGGCTAATTGAGAACGGTGTAACATCTATGACATCAAGTGTTATGCCCACGAGTG  1888

Query  1910  CGGTTTCTGTGAGCCAAAAAGTACCAACAGCTTCAACTGACGCTGCATCATTGCAATCTC  1969
             | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |
Sbjct  1889  CTGTTTCTGTGAGCCAAAAAGTACGGACAGCTTCAACTGATACTGCATCATTGCAATCCC  1948

Query  1970  TTTTGAAGGATATTGCAGTAAATCCGACAATGCTACTGAATCTACTGAAAATGGGAGAAA  2029
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1949  TTTTGAAGGATATTGCAGTAAATCCTACAATGCTACTGAATCTCCTGAAAATGGGAGAAA  2008

Query  2030  GGCATAAGGTACCTGAAAAAGCTCTTCAGAAACCCATGGATCCAAGAAGAGCAGCACAAC  2089
             | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2009  GACAAAAGGTACCTGAAAAAGCTATTCAGAAACCCATGGATCCAAGAAGAGCAGCACAAC  2068

Query  2090  TTCCTGGCTCTTCCGTGCTACCAGGGGTATCAGCACCGCTTCA-TATACCTGCATCAAAT  2148
             | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct  2069  TCCCTGGCTCTTCCGTACAACCAGGGGTATCAACACCGCTT-AGTATACCTGCATCAAAT  2127

Query  2149  GCTTTAGCTACTAATTCTTCAAAGC-GAGGAGTACTTCAGGATTCTTCCCAAAACGCCCC  2207
             ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2128  GCTTTAGCTGCTAATTCTTTAAA-CTCAGGAGTACTTCAGGATTCTTCCCAAAACGCCCC  2186

Query  2208  CGCAGACGAATCTGGAAGCATTCGCATGAAACCTCGTGATCCTCGCCGAATCCTGCATGG  2267
              |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2187  TGCAGCCGAATCTGGAAGCATTCGCATGAAACCTCGTGATCCTCGCCGAATCCTGCATGG  2246

Query  2268  AGGTACTCTTCAAAGAACAGACTCTTCAATGGAAAAGCAGTCCAAAGTGAATGATTCC-T  2326
             | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
Sbjct  2247  AAGTACTCTTCAAAGAACGGACTCTTCAATGGAAAAGCAGACCAAAGTGAATGA-TCCTT  2305

Query  2327  CCACTCTAGGAACCTTGACTATGAAGGGTAAGACAGAAGATTTAGAATCACCTTCCCAGC  2386
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||
Sbjct  2306  CCACTCTAGGAACCTTGACTATGAAGGGTAAGGCAGAAGATTTGGAAACACCTCCCCAGC  2365

Query  2387  TTGTTCCACGGCAAAATATTAGCCAAAATGGTACCAGCAAAATGAAAATTTCGGGTGAAC  2446
             ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2366  TTGATCCACGGCAAAATATTAGCCAGAATGGTACCAGCAAAATGAAAATTTCGGGTGAAC  2425

Query  2447  TTCTCAGTGAAAAGACACCAGATTTTTCAACACAATTCACCAAAAGCGTGAAAAATATTG  2506
             |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||
Sbjct  2426  TTCTCAGTGGGAAGACACCAGACTTTTCAACACAATTCACCAAAAACCTGAAAAGTATTG  2485

Query  2507  CTGATATGGTTGTCGTGTCACAACAAGC-TGGCAATCCCCCAGCAAGTACGCATTCAATA  2565
             |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||
Sbjct  2486  CTGATATGGTTGTCGTATCACAACAA-CTTGGCAATCCCCCAGCAAGTATGCATTCGGTA  2544

Query  2566  CAGCTTAAGACGGAGAGAGATGTTAAACAGAATCCTTCAAATCCCAATGACCAGGAGGAG  2625
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct  2545  CAGCTTAAGACGGAGAGAGATGTTAAACATAATCCTTCAAATCCCAATGCCCAGGATGAG  2604

Query  2626  GATATGTCAGTTTCAGCAGCATCAGTAACAGCTGCAGCTGGTCCCACTCGTTCCATGAAC  2685
             ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2605  GATGTGTCAGTTTCAGCAGCATCAGTAACGGCTGCAGCTGGTCCCACTCGTTCCATGAAC  2664

Query  2686  AGTTGGGGAGATGTGGAACACCTATTTGAAGGATATGATGACACGCAGAGAGTAGCTATT  2745
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
Sbjct  2665  AGTTGGGGAGATGTGGAACACCTATTTGAAGGATATGATGACATTCAGAGAGTAGCTATT  2724

Query  2746  CAAAGAGAGAGAGTTCGGAGGTTAGAGGAACAGAAGAAAATGTTTGCATCTCAGAAGCTC  2805
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2725  CAAAGAGAGAGAGTTCGTAGGTTAGAGGAACAGAATAAAATGTTTGCATCTCAAAAGCTC  2784

Query  2806  TCTCTTGTCTTGGATATAGACCACACCCTTCTCAATTCAGCCAAGTTTAATGAGGTTGAA  2865
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2785  TCTCTTGTCTTGGATATAGACCACACCCTTCTCAATTCAGCTAAGTTTAATGAGGTTGAA  2844

Query  2866  TTCCGCCACGAGGAGATATTGAGAAAGAAGGAGGAACAAGATCGTGAGAAACCATATAGA  2925
             | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2845  TCCCGCCACGAGGAGATATTAAGAAAGAAGGAAGAACAAGATCGTGAGAAACCATATAGA  2904

Query  2926  CATCTCTTTCGCTTCCCCCACATGGGAATGTGGACTAAATTGAGACCAGGGATTTGGAAT  2985
             ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct  2905  CATCTCTTTCGTTTCCTGCACATGGGAATGTGGACTAAACTAAGACCAGGGATTTGGAAT  2964

Query  2986  TTTTTGGAGAAGGCTAGCAAGCTGTACGAGTTACATCTTTACACTATGGGCAACAAATTG  3045
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2965  TTTTTGGAGAAGGCTAGCAAGCTGTACGAGTTACATCTTTACACTATGGGAAACAAATTG  3024

Query  3046  TATGCTACAGAGATGGCCAAACTGCTTGATCCCAAAGGGGTTCTCTTTAATGGACGGGTC  3105
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3025  TATGCTACAGAGATGGCCAAGCTGCTTGATCCCAAAGGGGTTCTATTTAATGGACGGGTC  3084

Query  3106  ATATCGAAAGGAGATGATGGAGATCCTCTTGATGGAGATGAACGAGTACCTAAGAGCAAA  3165
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3085  ATATCGAAAGGAGATGATGGAGATCCTCTTGATGGAGACGAACGAGTACCTAAGAGCAAA  3144

Query  3166  GATTTAGAAGGAGTTATGGGTATGGAATCGTCTGTGGTGATCATAGATGACTCTGTCCGA  3225
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3145  GATTTAGAAGGAGTTATGGGTATGGAATCGTCTGTGGTGATCATAGATGACTCTGTCCGA  3204

Query  3226  GTGTGGCCTCATA-ACAAAATGAATTTAATAGCTGTTGAAAGATATCTTTATTTCCCTTG  3284
             ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3205  GTGTGGCCTCA-ACACAAAATGAATTTAATAGCTGTTGAAAGATATCTTTATTTCCCTTG  3263

Query  3285  TAGTAGACGGCAATTTGGGCTTCTTGGTCCTTCTCTTCTTGAGTTAGATCGCGACGAGGT  3344
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  3264  TAGTAGACGGCAATTTGGGCTTCTTGGTCCTTCTCTTCTTGAGTTAGATCGTGATGAGGT  3323

Query  3345  ACCTGAGGAGGGCACATTGGCATCTTCATTAGCGGTTATTGAGAAAATACAT-AAAAGTT  3403
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct  3324  ACCTGAGGAGGGCACATTGGCATCTTCATTAGCGGTTATTGAGAAAATACATCAAAA-TT  3382

Query  3404  TCTTCTCGCACACTTCACTAGACGAAGTAGATGTGAGAAATATTTTAGCTTCTGAGCAAC  3463
             ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3383  TCTTCTCGCACACTTCATTAGATGAAGTTGATGTGAGAAATATTTTAGCTTCTGAGCAAC  3442

Query  3464  GAAAGATATTGGCTGGTTGTCGGATTGTATTTAGTCGGATAATCCCAGTGGGTGAAGCCA  3523
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3443  GAAAGATATTGGCTGGTTGTAGGATTGTATTTAGTCGGATAATCCCAGTGGGTGAAGCCA  3502

Query  3524  AACCGCACTTGCATCCCTTGTGGCAAACTGCTGAGCAGTTTGGTGCTGTCTGCACAACCC  3583
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3503  AACCGCACTTGCATCCCCTGTGGCAAACTGCTGAGCAGTTTGGTGCTGTCTGCACAACCC  3562

Query  3584  AGGTGGATGAACATGTCACTCATGTTGTCACAAATTCTCTTGGAACCGACAAGGTAAATT  3643
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3563  AGGTGGATGAACATGTCACTCATGTTGTCACAAATTCTCTTGGAACCGACAAGGTAAATT  3622

Query  3644  GGGCACTAACCAGAGGTAGATTTGTTGTTCATCCTGGCTGGGTGGAAGCATCAGCTTTTC  3703
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3623  GGGCACTAACCAGAGGTAGATTTGTTGTTCATCCTGGCTGGGTGGAAGCATCAGCTTTTC  3682

Query  3704  TGTACCAGAGAGCAAATGAGAACTTATATGCCATCAACCCGTAAACCAAATCCATTTTCC  3763
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
Sbjct  3683  TGTACCAGAGAGCAAATGAGAACTTATATGCCATCAACCCGTAAACCAAATCCATGATCC  3742

Query  3764  GCCATCTTAATATCCCCACCATCTGGTGGCATTGAGACTTAAGAAGGCCAT-AAAACCCA  3822
             ||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct  3743  GCCCTCTTAA-ATCCCCACCATTTGGTGGAATTGAGACTTAAGAAGGCC-TGAAAACCCA  3800

Query  3823  ATAGGTCAGATTGGGTTGTTGATAAGGCTAGACCCCCGGGGGTACATACGCATTATTTTG  3882
             ||| |||| ||||||||| |  || |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||
Sbjct  3801  ATAAGTCATATTGGGTTGAT--TA-GGCTAGGCCCC-GGGG-TACATACACATTCTTTTG  3855

Query  3883  CCTCCAAAAGAGGC-AATTCATTAAAATGCCAAAGGTATTAGGGGCTATTAACAAAACGA  3941
             || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct  3856  CC-CCAAAAGAAGCGAATTCATTAAAATGCCAAAGGTATTGGGGGCTTTTAACAAAACGA  3914

Query  3942  ACTCCACATTGTATCAATGGTCTAGTA-TAGATCTACTAACTTGGGGGAGGGTGAAGGAA  4000
             ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | ||||||||||
Sbjct  3915  ACTCCACATTGTATCAATGGTCTAG-AGTAGATCTACTTACTTTGGG-ATGGTGAAGGAA  3972

Query  4001  AGTAGTCTGTCTCTGGATCTAAAAAAC-A-CA--AGAAAGACCCAGCAGTAGAAAGTGTG  4056
             | ||||||||||||| ||||||||||  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||
Sbjct  3973  ACTAGTCTGTCTCTGAATCTAAAAAAATAACACCAGAGAGACCCAGCATTAGAAAGTATG  4032

Query  4057  ATGTGCCAGGGTCACGTGCCAAAGGAGAGAGAGGATCATGTTCAATTTTGGTTCTCATCT  4116
             |||||||| ||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4033  ATGTGCCAAGGTCACGTGTCAAAGGAGAG-GA---TCATGTTCAATTTTGGTTCTCATCT  4088

Query  4117  GTTGATTCATGATCGGTAGGTTCTCTCCGATATATGTTTGTTGTGGTATTTATGTCTCTT  4176
             |||||||||||||||||     |     |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4089  GTTGATTCATGATCGGT-----CA----GATAAATGTTTGTTGTGGTATTTATGTCTCTT  4139

Query  4177  GTTGGAAGCAATTCTGATGGGGTACCAAGGCAACCGAGAAGAGAACAAAGCTTTAATTCA  4236
             || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
Sbjct  4140  GTCGGAAGCAATTCTGATGGGGTACCAAGGCAACAGAGAAGAGAAGAAAGCTTTAATTGA  4199

Query  4237  AATGTGCATATGCCTTA  4253
             ||||| |||||||||||
Sbjct  4200  AATGTTCATATGCCTTA  4216



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 212005501118


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5