BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482523
Length=6294
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G35630.1 | Symbols: MOR1, GEM1 | ARM repeat superfamily prot... 1.054e+04 0.0
> AT2G35630.1 | Symbols: MOR1, GEM1 | ARM repeat superfamily protein
| chr2:14966678-14980606 FORWARD LENGTH=6332
Length=6332
Score = 1.054e+04 bits (5708), Expect = 0.0
Identities = 6032/6188 (97%), Gaps = 24/6188 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 tctctctctctctctTGCCGGCACTAACAACAACACGAAGAAAtttttttGAAAAGAGAG 60
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 TCTCTCTCTCTCTCTTGCCGGCACT---AACAACACGAAGAAATTTTTTTGAAAAGAGAG 60
Query 61 AGAAAGTTTCCAAGAGACCCGTACGAAGAAAAGaaaaaaaaaaCTTGGTATAGATCGATA 120
||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGAAAGTTTCCAAGAGA-CCGTAC---G--AAGAAAAAAAAAACTTGGTATAGATCGATA 114
Query 121 AGATCGATAACGTCGGAGAGATAATTTCGTGGCGTAATGTCGGCGGAGGACGAGAAGTTA 180
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 115 AGATCGATACCGTCGGAGAGATAATTTCGTGGAGTAATGTCGACGGAGGATGAGAAGTTA 174
Query 181 TTGAAGGAGGCGAAGAAACTTCCTTGGGAGGATCGGCTTGGGCATAAGAATTGGAAAGTT 240
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 TTGAAGGAGGCGAAAAAACTTCCTTGGGAGGATCGGCTTGGGCATAAGAATTGGAAAGTT 234
Query 241 AGGAACGAGGCTAACGTCGATTTAGCTTCTCTTTTTGATTCGATTACTGATCCTAAGGAC 300
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 235 AGGAACGAAGCTAACGTCGATTTAGCTTCTGTTTTTGATTCGATTACTGATCCTAAGGAC 294
Query 301 CCTCGTCTTCGCGATTTTGGTCACTTGTTTAGGAAGACGGTGGCGGATTCTAATGCGCCG 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 295 CCTCGTCTTCGCGATTTTGGTCACTTGTTTAGGAAGACGGTGGCAGATTCTAATGCGCCG 354
Query 361 GTGCAAGAGAAAGCGCTTGATGCATTGATTGCGTTTTTGCGAGCAGCTGACTCAGATGCT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 355 GTGCAAGAGAAAGCGCTTGATGCATTGATTGCGTTTTTGCGAGCAGCCGATTCAGATGCT 414
Query 421 GGAAGGTATGCAAAGGAAGTTTGCGATGCTATTTCTGCT-AAATGTCTCACGGGTCGGAA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 415 GGAAGGTATGCAAAGGAAGTTTGCGATGCTATTGC-GCTCAAATGCCTTACGGGTCGGAA 473
Query 480 GAATACTGTCGATAAGGCGCAAGCTGCTTTCTTACTTTGGGTAGAATTAGAGGCGGTCGA 539
||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 474 GAATACTGTGGACAAGGCGCAGGCTGCTTTCTTGCTTTGGGTAGAATTAGAGGCCGTCGA 533
Query 540 TGTTTTTCTGGATACGATGGAGAAAGCTATAAAGAATAAAGTTGCAAAGGCTGTGGTACC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 534 TGTTTTTCTGGATACGATGGAGAAAGCTATAAAGAATAAAGTTGCAAAGGCTGTGGTACC 593
Query 600 TGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTAAGTGAATTTGGATCAAAGGTTATTCCACCCAA 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 594 TGCAGTAGACGTTATGTTTCAAGCTCTAAGTGAATTTGGATCAAAAGTTATTCCACCTAA 653
Query 660 AAGGATTTTAAAGATGCTTCCTGAACTTTTCGACCATCAAGATCAGAATGTCCGTGCATC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 654 AAGGATTTTAAAGATGCTTCCTGAACTTTTCGACCATCAAGATCAGAATGTCCGTGCATC 713
Query 720 TGCTAAAGGGGTGACTCTTGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAGACCCTGTAAAGTCTAT 779
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 TGCCAAAGGAGTGACTCTTGAGCTATGCCGTTGGATTGGAAAAGACCCTGTAAAGTCTAT 773
Query 780 ATTGTTTGAGAAAATGAGGGATACGATGAAAAAAGAGCTGGAGGCTGAGCTTGCCAATGT 839
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 ATTGTTTGAAAAAATGAGGGATACGATGAAAAAAGAGCTGGAGGCTGAGCTTGCCAATGT 833
Query 840 TTCAGGGGGTGCCAAGCCTACTCGAAAGATAAGATCTGAGCAAGACAAGGAGCCAGAGGC 899
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 834 TACAGCGGGTGCCAAGCCTACTCGAAAGATAAGATCTGAGCAAGACAAGGAACCAGAGGC 893
Query 900 AGAAGCTAGTTCTGATGTTGTGGGTGATGGGCCCAGTGAAGAAGCTGTTGCTGATGCGCC 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 894 AGAAGCTAGTTCTGATGTTGTGGGTGATGGGCCCAGTGAAGAAGCTGTTGCTGACGCGCC 953
Query 960 TCAGGAAATAGATGAGTATGATCTTATGGATCCTGTGGACATTTTGACTCCTTTGGAGAA 1019
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 954 TCAAGAAATAGATGAGTATGATCTTATGGATCCTGTGGACATTTTGACACCTTTGGAGAA 1013
Query 1020 GTCTGGGTTCTGGGACGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCAGAGCGTAAAGAAGCTGTTGC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1014 GTCTGGGTTCTGGGACGGAGTGAAAGCTACAAAGTGGTCCGAACGTAAAGAAGCTGTTGC 1073
Query 1080 AGAGCTAACAAAGCTTGCTTCGACTAAAAAGATAGCTCCTGGTGATTTTTCAGAAATTTG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 AGAGCTAACAAAGCTTGCTTCGACTAAAAAGATAGCTCCTGGTGATTTTTCAGAAATTTG 1133
Query 1140 TCGGACTTTAAAGAAGCTTATCACGGATGTGAACTTGGCCGTTGCAGTTGAAGCTATTCA 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 TCGGACTTTAAAGAAGCTTATCACGGATGTGAACTTGGCCGTTGCAGTTGAAGCTATTCA 1193
Query 1200 AGCTATTGGAAATCTTGCATGTGGTTTAAGAACACATTTCTCTGCTAGTTCACGGTTTAT 1259
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 AGCCATTGGAAATCTTGCATGTGGTTTAAGAACACATTTCTCTGCTAGTTCACGGTTTAT 1253
Query 1260 GCTGCCTGTTTTACTTGAAAAATTGAAAGAGAAAAAGCCATCAGTCACAGAACCACTTAC 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1254 GCTGCCTGTTTTACTTGAAAAATTGAAAGAGAAAAAGCAATCAGTCACAGACCCACTTAC 1313
Query 1320 ACAAACGCTACAAACTATGTACAAAGCTGGGTGTTTGAATCTTGTTGACGTTATAGAAGA 1379
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314 ACAAACGCTACAAACAATGTACAAAGCCGGGTGTTTGAATCTTGTTGACGTTATAGAAGA 1373
Query 1380 TGTGAAGACAGCAGTGAAAAACAAAGTTCCACTTGTGCGTTCTTCAACTTTGACCTGGTT 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374 TGTGAAGACAGCAGTGAAAAACAAAGTTCCACTTGTGCGTTCTTCAACTTTGACCTGGTT 1433
Query 1440 GACATTCTGCCTTGAAACAAGTAACAAGGCTCTTATTCTAAAGGCGCACAAAGAATATGT 1499
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1434 GACATTCTGCCTTGAAACAAGTAACAAAGCTCTTATTCTAAAGGCTCACAAAGAATATGT 1493
Query 1500 CCCTTTATGTATGGAGTGTCTCAACGATGGAACTCCTGATGTGAGGGATGCAGCATTTTC 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494 CCCTTTATGTATGGAGTGTCTCAACGATGGAACTCCTGATGTGAGGGATGCAGCATTTTC 1553
Query 1560 GGCTTTGGCTGCAATAGCTAAGTCTGTAGGTATGAGACCTTTGGAAAGGTCGTTGGAAAA 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GGCTTTGGCTGCAATAGCTAAGTCTGTAGGTATGAGACCTTTGGAAAGGTCGTTGGAAAA 1613
Query 1620 ACTTGATGATGTTAGAAAAAAGAAACTTTCAGAAATGATTGCAGGCTCTGGTGGTGGTGA 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 ACTTGATGATGTTAGAAAAAAGAAACTTTCAGAAATGATTGCAGGCTCTGGTGGTGGTGA 1673
Query 1680 CCAAGCTGGTACAAGCTCAGTGACAGTTCAGTCTTCAGTTGGGAGCACGGCCACAGGGAA 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1674 CCAAGCTGGTACAAGCTCAGTGACAGTTCAGTCTTCAGTTGGGAGCACAGCCACAGGGAA 1733
Query 1740 CTCAGAAGCTTCCTTTGTAAGGAAATCAGCAGCAAGCATGTTGAGCGGCAAAAGACCCGC 1799
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734 CTCAGACGCTTCCTTTGTAAGGAAATCAGCTGCAAGCATGTTGAGCGGCAAAAGACCCGC 1793
Query 1800 TCCTTCTGCTCCTGCGAGCAAGAAGGTGGGGACTGGAAAACCGGGTGGAGGCAAAAAAGA 1859
|||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 TCCTTCGGCTCAGGCGAGCAAGAAGGTTGGGACTGGCAAACCGGGTGGAGGCAAAAAAGA 1853
Query 1860 TGGATCTGTAAGGAATGAAGGTCCAAAATCTGTTGAACCACCTGAAGATGTCGAGCCTGC 1919
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 TGGATCTGTAAGGAATGAAGGTTCAAAATCTGTTGAACCACCTGAAGATGTCGAGCCTGC 1913
Query 1920 CGAGATGGGTCTTGAAGAGATTGAAAACAGATTAGGTTCTCTTGTGAAACCAGAAACTAT 1979
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1914 CGAGATGGGTCTTGAAGAGATTGAAAACAGATTAGGTTCTCTTGTGAAACCAGAAACTGT 1973
Query 1980 ATCTCAGTTAAAGAGCTCTGTTTGGAAAGAAAGACTTGAAGCAACTTTGGCTTTGAAAGA 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974 ATCTCAGTTAAAGAGCTCTGTTTGGAAAGAAAGACTTGAAGCAACTTTGGCTTTGAAAGA 2033
Query 2040 AGAGATAGAAGGTCTACAAGAACTAGACAAGTCGGTGGAAATCTTGGTCCGGTTGTTGTG 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2034 AGAGATAGAAGGTCTACAAGAACTAGACAAGTCGGTGGAAATCTTGGTCCGGTTGCTGTG 2093
Query 2100 TGCAGTTCCTGGTTGGAATGAGAAAAATGTGCAGGTTCAGCAACAGGTCATTGAAATCAT 2159
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 TGCTGTTCCTGGTTGGAATGAGAAAAATGTGCAGGTTCAGCAACAGGTCATTGAAATCAT 2153
Query 2160 CACTTACATATCTTCGACTGCAGCGAAGTTTCCTAAGAAATGTGTCGTACTTTGTATTAC 2219
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 CACTTATATATCTTCGACTGCAGCGAAGTTTCCTAAGAAATGTGTCGTACTTTGTATTAC 2213
Query 2220 GGGCACTAGTGAACGAGTTGCAGATATAAAAACAAGAGCCTCTGCTATGAAGTGCCTTAC 2279
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 CGGCACTAGTGAACGAGTTGCAGATATAAAAACAAGAGCCTCTGCTATGAAGTGCCTTAC 2273
Query 2280 TGCTTTCTGTGAAGCAGTTGGTCCTGGATTTGTTTTCGAGAGGCTTTTCAAAATCATGAA 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TGCTTTCTGTGAAGCAGTTGGTCCTGGATTTGTTTTCGAGAGGCTTTTCAAAATCATGAA 2333
Query 2340 AGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTGAAGGCTTGTTATGGATGGTTTCGGCAGTTGA 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 AGAGCACAAGAATCCCAAGGTTCTTAGTGAAGGCTTGTTATGGATGGTTTCGGCAGTTGA 2393
Query 2400 TGACTTTGGTGTCTCACTTTTGAAACTTAAGGATTTGATAGATTTTTGTAAGGATGTTGG 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 TGACTTTGGTGTCTCACTTTTGAAACTTAAGGATTTGATAGATTTTTGTAAGGATGTTGG 2453
Query 2460 GCTGCAATCTAGTACAGCTGCCACCAGAAATGCTACAATTAAACTCTTGGGTGCTTTACA 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 GCTGCAATCTAGTACAGCTGCCACCAGAAATGCTACAATTAAACTCTTGGGTGCTTTACA 2513
Query 2520 CAAGTTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTTCTTAATGATGTCAAACCTGCGCTACTAAG 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2514 CAAGTTTGTTGGTCCAGACATTAAAGGGTTTCTTAATGATGTCAAACCTGCACTACTAAG 2573
Query 2580 TGCACTTGACACCGAATATGAGAAAAACCCTTTCGAGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGT 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574 TGCACTTGACACCGAATATGAGAAAAACCCTTTCGAGGGGACTGCGGCTCCAAAGAGAGT 2633
Query 2640 TGTTAAGACGTCAGTTTCAACATCAACATCTTCTGGAGGGTTGGATAGCTTACCTAGAGA 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2634 TGTTAAGACGTCAGTTTCAACATCAACATCTTCTGGAGGGTTGGATAGCTTACCTAGAGA 2693
Query 2700 AGATATCAGTAGCAAGATTACACCGAATCTCCTTAAGGGCTTTGAGAGTCCTGATTGGAA 2759
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2694 AGATATCAGTACCAAGATTACACCTAATCTCCTTAAGGGCTTTGAGAGTCCTGATTGGAA 2753
Query 2760 GATGCGTTTGGAGTCAATTGAAGCTGTCAATAAAATTCTGGAAGAAGCTAATAAACGTAT 2819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2754 GATGCGTTTGGAGTCAATTGAAGCTGTCAATAAAATTCTGGAAGAGGCTAATAAACGTAT 2813
Query 2820 CCAACCAACTGGAACTGGAGAATTATTTGGTGGTCTACGAGGACGTCTGTTGGATAGTAA 2879
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2814 CCAACCAACTGGAACTGGAGAATTATTTGGTGGTCTTCGAGGACGTCTGTTGGATAGTAA 2873
Query 2880 CAAAAATCTTGTTATGCAAACATTGACTACTATTGGAGGTGTTGCAGCAGCTATGGGACC 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874 CAAAAATCTTGTTATGCAAACATTGACTACTATTGGAGGTGTTGCAGCAGCTATGGGACC 2933
Query 2940 AGCTGTCGAGAAGGCGAGCAAGGGAATTCTATCTGATGTTCTGAAATGTCTCGGTGACAA 2999
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2934 AGCTGTCGAGAAGGCGAGCAAGGGAATTCTGTCTGATGTTCTGAAATGCCTCGGTGACAA 2993
Query 3000 CAAGAAGCACATGAGAGAATGCACCTTGGCTGCTCTTGATTTGTGGCTTGGTGCTGTGCA 3059
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 CAAGAAGCACATGAGAGAGTGTACCTTGGCTGCTCTTGACTTGTGGCTTGGTGCTGTGCA 3053
Query 3060 TCTTGACAAAATGATTCCTTACATTATAATAGCCCTAACAGATGGGAAAATGGGAGCAGA 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 TCTTGACAAAATGATTCCTTACATTATAATAGCCCTAACAGATGGGAAAATGGGAGCAGA 3113
Query 3120 AGGGCGTAAAGATCTTTTTGATTGGTTGACAAAACAGCTTACTGGATTAAGTGACTTTGT 3179
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 AGGTCGTAAAGATCTTTTTGATTGGTTGACAAAACAACTTACTGGATTAAGTGACTTTGT 3173
Query 3180 GGATGCCATACATTTACTAAAACCTGCAAGCACTGCAATGACGGACAAATCAGCAGATGT 3239
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 GGATGCCATACATTTACTAAAACCTGCGAGCACTGCAATGACGGACAAATCAGCAGATGT 3233
Query 3240 GCGAAAAGCAGCCGAAGGATGCATTTCTGAGATCTTGAGAGTCAGTGGACAAGAAACGAT 3299
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3234 GAGAAAAGCAGCCGAAGGATGCATTTCTGAGATCTTGAGAGTCAGTGGACAAGAAATGAT 3293
Query 3300 TGAAAAGAATCTTAAAGATATCCACGGCCCAGCATTAGCTCTTGTGCTTGAAAAAGTAAG 3359
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3294 TGAAAAGAATCTTAAAGATATCCAAGGCCCAGCATTAGCTCTTGTGCTTGAAAAAGTAAG 3353
Query 3360 ACCAGGATTTGTTCAAGAACCATTTGAATCATCAAAAGCTATGGCGGGGCCAGTGTCAAA 3419
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3354 ACCAGGATTCGTTCAAGAACCATTTGAATCATCAAAAGCTATGGCGGGGCCAGTGTCAAA 3413
Query 3420 AGGTGTTTCAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTACCTTAAAGCAAGGAAACAGATC 3479
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3414 AGGTGTTACAAAGATTTCAAAATCAACTTCTAATGGTACCTTAAAGCAAGGAAACAGATC 3473
Query 3480 AAGAGCCGTACCAACAAAGGGC--A-GTCAAATTACGTCTGTCCATGATATAGCTATCCA 3536
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474 AAGAGCCGTACCAACAAAGGGCTCAAGTCAAATTACGTCTGTCCATGATATAGCTATCCA 3533
Query 3537 GTCACAGGCTTTGCTAAATACTAAGGACTCCAATAAGGAGGACAGGGAGAGGGTGGTGGT 3596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3534 GTCACAGGCTTTGCTAAATACTAAGGACTCCAATAAGGAGGACAGGGAGAGGGTGGTGGT 3593
Query 3597 TCGTAGAATTAAATTTGAGGAGCTGCGACCAGAACAGATTCAGGATCTTGAGAATGATAT 3656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3594 TCGTAGAATTAAATTTGAGGAGCTGCGACCAGAACAGATTCAGGATCTTGAGAATGATAT 3653
Query 3657 GATGAAATTTTTTAGGGAAGACTTGCAAAAACGATTGTTGAGTCCCGACTTCAAGAAACA 3716
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3654 GATGAAATTTTTTAGGGAAGACTTGCAAAAACGGTTGTTGAGTCCCGACTTCAAGAAACA 3713
Query 3717 AGTAGATGGGCTGGAAATCCTACAGAAGGCACTTCCATCTGTTTCGAAGGATATTATAGA 3776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3714 AGTAGATGGGCTGGAAATCCTACAGAAGGCACTTCCATCTGTTTCGAAGGAAATTATAGA 3773
Query 3777 AGTATTAGATATACTTCTCAGGTGGTTTGTGTTACAATTCTGTAAATCCAACACAACCTG 3836
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3774 AGTATTAGATGTACTTCTCAGGTGGTTTGTGTTGCAATTCTGTAAATCCAACACAACCTG 3833
Query 3837 TCTGCTAAAGGTGCTTGAGTTTCTTCCAGAACTTTTCAACACATTGAGGGATGAGGAATA 3896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3834 TCTGCTAAAGGTGCTTGAGTTTCTTCCAGAACTTTTCAACACATTGAGGGATGAGGAATA 3893
Query 3897 CTGCATGACGGAAGCAGAAGCTGCAATATTTCTGCCTTGTTTAGCGGAGAAGTTGGGGCA 3956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3894 CTGCATGACGGAAGCAGAAGCTGCAATATTTCTGCCTTGTTTAGCGGAGAAGTTGGGGCA 3953
Query 3957 TAACATTGAAAAAGTAAGAGAAAAAATGCGGGAGCTGATGAAGCAGATTATCCAAGCTTA 4016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||
Sbjct 3954 TAACATTGAAAAAGTAAGAGAAAAAATGCGGGAGCTGATGAAGCAGATCATTCAGGCATA 4013
Query 4017 TTCTGTAGCAAAGACGTATCCCTATATTTTGGAAGGTTTACGTTCCAAAAACAACCGGAC 4076
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4014 TTCTGTAGGAAAGACGTATCCCTATATTTTGGAAGGTTTACGTTCCAAAAACAACCGGAC 4073
Query 4077 AAGGATAGAGTGTACTGATCTCATAGGATATCTACTCGAGACTTGTGGAACTGAGATAGG 4136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4074 GAGGATAGAGTGTACTGATCTCATAGGATATCTACTCGAGACTTGTGGAACTGAGATAGG 4133
Query 4137 TGGACTACTGAAATACTTGAATATGGTTGCAAGCTTGACGGCAGAAAGAGATGGTGAACT 4196
||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4134 TGGACTACTTAAATACTTAAATATCGTTGCAAGCTTGACAGCAGAAAGAGATGGTGAACT 4193
Query 4197 CAGGAAAGCTGCTTTGAACACCATGGCTACTGGTTATAAGATTCTTGGTGATGACATCTG 4256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 4194 CAGGAAAGCTGCTTTGAACACCATGGCTACTGGTTATCAGATTCTTGGTGCTGACATCTG 4253
Query 4257 GAAATATGTTGGGAAGCTTACAGATGCTCAAAAGAGTATGATTGATGATAGATTTAAGTG 4316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 GAAATATGTTGGGAAGCTTACAGATGCTCAAAAGAGTATGATTGATGATAGATTTAAGTG 4313
Query 4317 GAAAGTCAAGGAAATGGAGAAAAGAAGAGAAGGGAAACCTGGGGAGGCACGAGCAGCATT 4376
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4314 GAAAGCCAAGGATATGGAGAAAAGAAGAGAAGGGAAACCTGGGGAGGCACGAGCAGCATT 4373
Query 4377 AAGGCGTTCTGTTAGAGATAATGGACCTGAAGTGGCAGAGCAAAGTGGTGACCTTTCTCA 4436
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4374 AAGGCGTTCTGTTAGAGATAGCGGACCTGAGGTGGCAGAGCAAAGTGGTGACATTTCTCA 4433
Query 4437 AATAGTCCCTGGTCCTTTATTTCCAAGGCAAAGCTATGGTATTTCCGAACAAATTCTGGA 4496
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4434 AACAGTCCCTGGTCCTTTATTTCCAAGGCAAAGCTATGGTATTTCCGAACAAATGCTGGA 4493
Query 4497 GAGGAACCCGGTACCTCGGACAATTGCTGGAGTTAATGGCCCTACAGACTGGAATGAGGC 4556
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4494 GAGGACCCCGGTACCTCGGACAATTGCTGGAGTTAATGGCCCTACAGACTGGAATGAGGC 4553
Query 4557 TTTGGACATCATTATGTTTGGTTCTCCAGAGCAGTCGGTTGAAGGGATGAAAGTTGTGTG 4616
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4554 TTTAGACATCATTATGTTTGGTTCTCCAGAGCAGTCCGTTGAAGGGATGAAAGTTGTGTG 4613
Query 4617 TCATGAGTTGGCACAGGCTTCTAATGATCCTGAAGAGAGTGCAATTGATGAACTTGTGAA 4676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4614 TCATGAGTTGGCACAGGCTTCTAATGATCCTGAAGAGAGTGCAATTGATGAACTTGTGAA 4673
Query 4677 GGATGCAGATGGGCTTGTTTCATGCTTAGCAAATAAGGTTGCCAAAACATTTGATGTTAG 4736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4674 GGATGCAGATGGGCTTGTTTCATGCTTAGCAAATAAGGTTGCCAAAACATTTGATGTTAG 4733
Query 4737 CTTAATGGGAGCTTCATCGAGGTCGTGTAAATATGTTTTGAACACACTTATGCAGACATT 4796
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4734 CTTGATGGGAGCTTCATCGAGGTCGTGTAAATATGTTTTGAACACACTTATGCAGACATT 4793
Query 4797 CCAAAATAAAAAGCTTGCCCATGCAGTCAAAGAAGGGACTCTTGAAAGCCTTATAACTGA 4856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4794 CCAAAATAAAAAGCTTGCCCATGCAGTCAAAGAAGGGACTCTTGAAAGCCTTATAACAGA 4853
Query 4857 GCTCTTGCTTTGGCTTCTGGATGAAAGAGTTCCACGCATGGAAGATGGGAGCCAACTGCT 4916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 4854 GCTCTTGCTTTGGCTTCTGGATGAAAGAGTTCCACGCATGGAAGATGGGAGTCAACTTCT 4913
Query 4917 AAAAGCTCTGAATGTTTTGATGCTTAAGATCCTGGATAATGCAGATCGGACATCTTCGTT 4976
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4914 TAAAGCTCTGAATGTTTTGATGCTTAAGATCCTGGATAATGCAGATCGGACATCTTCGTT 4973
Query 4977 TGTGGTCCTTATTAGCTTGCTACGTCCTCTAGATCCATCTAGATGGCCTTCACCTGCTAC 5036
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4974 TGTGGTGCTTATTAGCTTGCTACGTCCTCTAGATCCATCTAGATGGCCTTCACCTGCTAC 5033
Query 5037 GGCTGAAGTTTATGCTGTCCGGAATCAGAAATTCTCTGATTTGGTAGTTAAATGCCTTAT 5096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5034 GGCTGAAGTTTATGCTGTCCGGAATCAGAAATTCTCTGATTTGGTAGTTAAATGCCTTAT 5093
Query 5097 TAAGCTTACAAAGCTCCTCCAAAGCACCATATATGAAGTTGATCTTGATAGACTTCTTCA 5156
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5094 TAAACTTACAAAGCTCCTCCAAAGCACCATATATGAAGTTGATCTTGATAGACTTCTTCA 5153
Query 5157 GAGTATCCATGTATATCTGCAAGAGCTGGGAATGGAAGAGATACGTAGGAGAGCTGGGGC 5216
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5154 GAGTATCCATGTATATCTGCAAGATCTGGGAATGGAAGAGATACGTAGGAGAGCTGGGGC 5213
Query 5217 AGATGATAAACCTCTGAGGATGGTGAAAACTGTTCTACATGAACTTGTTAAGCTCCGGGG 5276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5214 AGATGATAAACCTCTGAGGATGGTGAAAACTGTTCTACATGAACTTGTTAAGCTCCGCGG 5273
Query 5277 AGCCGCAATTAAGGGCCACTTGTCTCTTGTCCCTATTGACATGAGGCCACAACCCATCAT 5336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5274 AGCCGCAATTAAGGGCCACTTGTCTCTTGTCCCTATTGACATGAGGCCACAACCCATCAT 5333
Query 5337 TCTCGCTTACATCGATCTAAACCTTGAGACTTTAGCTGCAGCAAGAATGTTAACTGCAAC 5396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5334 TCTCGCTTACATCGATCTAAACCTTGAGACTTTAGCTGCAGCAAGAATGTTAACTGCAAC 5393
Query 5397 AGGTCCTGTGGGCCAAACCCATTGGACAGATTCAACAGCCAACAATCCTTCACCTCCCGC 5456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5394 AGGTCCTGTGGGCCAAACCCATTGGACAGATTCAACAGCCAACAATCCTTCACCTCCTGC 5453
Query 5457 AAATTCTGCTGATGTTCAGTTGAAGCAAGAGCTTGGGGCAATATTTAAGAAAATAGGTGA 5516
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 5454 AAATTCTGCCGATGTTCAGTTGAAGCAAGAGCTTGGGGCTATTTTTAAGAAAATAGGTGA 5513
Query 5517 CAAACAAACTTCCACAATAGGTCTTTACGACCTCTACCACATCACTAAGTCCTATCCAAA 5576
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 5514 CAAACAAACTTCCACAATTGGTCTTTACGACCTCTACCACATCACAAAGTCATATCCAAA 5573
Query 5577 GGTTGATATTTTTTCCCAACTTCAAAATGCTAGCGAAGCGTTTCGTACTTACATCAGAGA 5636
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5574 GGTTGATATATTTTCCCAACTTCAAAATGCTAGTGAAGCGTTTCGTACTTACATCAGAGA 5633
Query 5637 CGGTCTGGCCCAGGTTGAGAAGAATGCAGCTGCGGGAAGAACGCCTTCAAGCCTACCGTT 5696
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5634 TGGTCTGGCACAGGTTGAGAAGAATGCAGCTGCGGGAAGAACACCTTCAAGCCTACCGTT 5693
Query 5697 GTCAACTCCTCCCCCTTCTTCCTTAGCTCTTCCATCTCCTGATATTCCTTCCTTGTCCTA 5756
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5694 GTCAACTCCTCCCCCTTCGTCCTTAGCTCTTCCATCTCCTGATATTCCTTCCTTGTCCTC 5753
Query 5757 TTTAGATGTGAAGCCTCTGATGAACCCTAGATCTGATTTATATACCGATGACATCCGAGC 5816
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||
Sbjct 5754 TTTAGATGTGAAGCCTTTGATGAACCCTAGATCTGATTTATACACAGACGACATCCGAGC 5813
Query 5817 CAGTAACATGAATCCTGGAGTGATGACAGGGACGCTAGATGCAATCAGAGAAAGGATGAA 5876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5814 CAGTAACATGAATCCTGGAGTGATGACAGGGACGCTAGATGCAATCAGAGAAAGGATGAA 5873
Query 5877 GAACATGCAACTGGCTTCATCAGGAACCCTAGAACCAGTAAGCAAACAGCTGATGCCAAC 5936
||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5874 GAACATGCAACTGGCTTCATCAG-A------G--CCAGTAAGCAAACCGCTGATGCCAAC 5924
Query 5937 AAACGATAACTTATCAATGAACCAACAGAGCGTTCCCCAGAGCCAAATGGGACAAGAGAC 5996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5925 AAACGATAACTTATCAATGAACCAACAGAGCGTTCCCCCGAGCCAAATGGGACAAGAGAC 5984
Query 5997 ACCCCACACACACCCGGTGGTTCTCCCAATGGATGAGAAAGCATTGTCTGGTCTTCAAGC 6056
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5985 AGTCCACACACACCCAGTGGTTCTCCCAATGGATGAGAAAGCATTGTCCGGTCTTCAAGC 6044
Query 6057 CCGAATGGAGAGGCTCAAAGGTGGATCACTGGAACATATGTAGAACTAGAGACCCCAAGC 6116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6045 CCGAATGGAGAGGCTCAAAGGTGGATCACTGGAACATATGTAGAACTAGAGACCCCAAGC 6104
Query 6117 TTTGGAGTCTAAAGTTACATA-GCAAATTCGCCATTTTTGTTACTTCTCTCCAATTAATG 6175
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6105 TTTGGAGTCTGAAGTTACATAAGCAAATTCGCCATTTTTGTTACTTCTCTCCAATTAATG 6164
Query 6176 TAGTGGTA 6183
|||| |||
Sbjct 6165 TAGTAGTA 6172
Score = 75.0 bits (40), Expect = 8e-12
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6225 GCGGCTAGATTTCCATGGAGTTAGTGTGTATAGTGGTGGGAGA 6267
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6229 GCGGCTAGATTTCAATGGAGTTAGTGTGTATAGTGGTGGGAGA 6271
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 314135514706
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5