BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482593
Length=3182
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G36200.2 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 2904 0.0
AT1G12430.2 | Symbols: ARK3 | armadillo repeat kinesin 3 | chr1... 62.1 3e-08
> AT2G36200.2 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate
hydrolases superfamily protein | chr2:15179869-15185314
REVERSE LENGTH=3457
Length=3457
Score = 2904 bits (1572), Expect = 0.0
Identities = 1676/1728 (97%), Gaps = 0/1728 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1319 CAACTTGAGGAGTTGCAAGATAAGTATGTCGGTCAAGTGCGGGAGTGCTCTGATCTGACT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 CAACTTGAGGAGTTGCAAGATAAGTATGTCGGTCAAGTGCGGGAGTGCTCTGATCTGACT 1571
Query 1379 AGCAAGCTTGATATCACCGAGAAAAACTTGAGCCAAACATGCAAAGTGCTTGCTTCCACA 1438
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572 ACCAAGCTTGATATCACCGAGAAAAACTTGAGCCAAACATGCAAAGTGCTTGCTTCCACA 1631
Query 1439 AACGAGGAATTGAAGAAATCTCAATATGCCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATTTCAGAG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632 AACGAGGAATTGAAGAAATCTCAATATGCCATGAAAGAGAAAGATTTCATCATTTCAGAG 1691
Query 1499 CAGAAAAAATCTGAAAACGTACTGGTTCAACAAGCTTGCATTTTGCAATCCAACCTAGAG 1558
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692 CAGAAAAAATCTGAAAATGTACTGGTTCAACAAGCTTGCATTTTGCAATCCAACCTAGAG 1751
Query 1559 AAAGCTACTAAAGACAATTCTTCATTACACCAAAAAATTGGAAGAGAGGACAAGCTCAGT 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1752 AAAGCTACTAAAGACAATTCTTCATTACACCAAAAGATTGGAAGAGAGGACAAGCTTAGT 1811
Query 1619 GCGGATAACAGAAAAGTGGTCGACAATTATCAAGTAGAACTTTCTGAACAAATTTCCAAT 1678
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1812 GCGGATAACAGAAAAGTGGTGGACAATTATCAAGTAGAACTTTCTGAACAAATTTCAAAT 1871
Query 1679 CTGTTCAATAGGGTTGCTTCTTGTCTGTCCCAGCAAAATGTACACCTTCAGGGAGTTAAC 1738
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1872 CTGTTCAATAGGGTTGCTTCTTGTCTCTCCCAGCAAAATGTACACCTTCAGGGTGTTAAC 1931
Query 1739 AAACTGTCCCAATCTCGTTTAGAGGCACACAACAAGGCGATCCTAGAAATGAAAAAGAAG 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1932 AAACTGTCCCAATCTCGTTTAGAGGCACACAACAAGGCGATCCTAGAAATGAAAAAGAAG 1991
Query 1799 GTTAGAGCTTCAAGGGATTTATATAGTTCTCACTTGGAGGAAGTGCAGAATGTAGTTCGG 1858
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1992 GTTAAAGCTTCAAGGGATTTATATAGTTCTCACTTGGAGGCAGTGCAGAATGTAGTTCGG 2051
Query 1859 TTGCACAAGGCTAACTCGAATGCTTGTCTTGAGGAAGTTTCAGCATTGACGACTTCAAGT 1918
|| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052 TTACACAAGGCAAACGCGAATGCTTGTCTTGAGGAAGTTTCAGCATTGACGACTTCAAGT 2111
Query 1919 GCAAGTTCCATTGATGAGTTTCTTGCTTCAGGAGATGAGACAACATCGTCTTTATTTGAT 1978
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2112 GCATGTTCCATTGATGAATTTCTTGCTTCAGGAGATGAAACAACATCGTCGTTATTTGAT 2171
Query 1979 GAACTTCAGAGTGCTCTCTCGTCTCATCAGGGAGAAATGGCTCTCTTTGCGAGGGAACTG 2038
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2172 GAACTTCAGAGTGCTCTCTCGTCCCATCAGGGAGAAATGGCTCTCTTTGCGAGGGAACTG 2231
Query 2039 AGACAGAGGTTCCACACAACGATGGAGCAAACTCAGCAAATGTCTGAATACACAAGTACG 2098
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 2232 AGACAAAGGTTCCACACAACGATGGAGCAAACTCAGGAGATGTCTGAATACACAAGTACG 2291
Query 2099 TTCTTTCAGAAGCTTATGGAAGAGTCTAAAAATGCTGAGAGTCGTGCTGCAGAGGCAAAT 2158
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2292 TTCTTTCAGAAGCTTATGGAAGAGTCTAAAAATGCTGAGACTCGTGCTGCAGAGGCAAAT 2351
Query 2159 AATGGTCAAATAAACAGCATTATTGATTTTCAGAAGACTTACGAGGCTCAGTCAAAATCT 2218
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 GATAGTCAAATAAACAGCATTATTGATTTTCAGAAGACTTACGAGGCTCAGTCAAAATCT 2411
Query 2219 GATGCAGATAAACTTATAGCAGATTTAACTACCCTCGTCTCAAGTCACATTCGTCGCCAA 2278
||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412 GATACAGATAAACTTATTGCAGATTTAACTAACCTAGTCTCAAGTCACATTCGTCGCCAA 2471
Query 2279 CACGAACTGGTTGATACAAGACTCCATAATTTTAAAGATGCCGTCTCTTCCAACAAAATT 2338
|||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2472 CACGAATTGGTTGATTCAAGACTCCATAACTTTAAAGATGCCGTCTCTTCCAACAAAACT 2531
Query 2339 TTCTTGGACGAACACGTCTCTGCTGTTAATAATCTGACTAAAGACGCAAAAAGAAAGTGG 2398
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2532 TTCTTGGACGAACATGTCTCTGCTGTTAATAATCTGACGAAAGACGCAAAAAGAAAGTGG 2591
Query 2399 GAGACCTTTTCCATGCAAGCTGAGAATGAAGCCAGAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCC 2458
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2592 GAGACATTTTCCATGCAAGCTGAGAATGAAGCCAGAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCA 2651
Query 2459 AAACATTGTCGAATGGAATTACTGCTTCAGCAATCTGTGGGTCATGCGGAATCAGCTTTC 2518
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652 AAACATTGTCGAATGGAGTTACTGCTTCAGCAATCTGTGGGTCATGCGGAATCAGCTTTC 2711
Query 2519 AAACACTGCAAGATAACTCATGAATCTCTAAAGGAGATGAACAGTAAGCAAGTCACAGAT 2578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2712 AAACACTGCAAGATAACTCATGAATCTCTAAAGGAGATGACCAGTAAGCAAGTCACAGAT 2771
Query 2579 GTCTCTTCACTTGTTAGGTCTGCTTGTGATAGTAACGAGCGGCACGATGCGGAAGTAGAT 2638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2772 GTCTCTTCACTTGTTAGGTCTGCTTGTGATAGTAACGAGCAGCACGATGCCGAAGTAGAT 2831
Query 2639 TCTGCAAGGACTGCGGCTGAAAAAGATGTAACAAAGAACAGCGATGATATAATCCAGCAA 2698
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2832 TCTGCAAGGACTGCTGCTGAAAAAGATGTAACAAAGAACAGCGATGATATAATCCAGCAA 2891
Query 2699 ATTGACCGCATGTCAGAGGATGAAAAAGCGTCTGTATCACAAATCTTGGAAAATGTCAGG 2758
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2892 ATTGAACGCATGTCAGAGGATGAAAAAGCGTCTGTATCAAAAATCCTGGAAAATGTCAGG 2951
Query 2759 TCGCATGAAAAAACTCTTGAAAGTTTCCAACAGGATCAGTGTTGCCAAGCCAGATGCATT 2818
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2952 TCGCATGAAAAAACTCTTGAAAGTTTCCAACAGGATCAGTGTTGCCAAGCCAGATGCATC 3011
Query 2819 GAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAAAAATACATGGAGTATGAGCCCACAGGGGCA 2878
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3012 GAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAACAATACATGGAGTATGAGCCCACAGGTGCA 3071
Query 2879 ACTCCAACAAAGAATGAACCAGAGATCCCAACTAAAGCCACCATTGAATCACTAAGAGCC 2938
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3072 ACTCCAACAAAGAATGAACCAGAGATCCCAACCAAAGCCACCATTGAATCACTACGAGCC 3131
Query 2939 ATGCCAATTGAGACATTGGTTGAAGAGTTCCGTGAAAACAATTCTTATGAATCCTTTGCG 2998
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3132 ATGCCAATTGAGACATTAGTTGAAGAGTTCCGTGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCG 3191
Query 2999 ACCAAGGAAACAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCCTCTCTCACAA 3046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3192 ACCAAGGAAACAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCCTCTCTCACAA 3239
Score = 2230 bits (1207), Expect = 0.0
Identities = 1284/1321 (97%), Gaps = 6/1321 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCGCCGTCCGTTCGCCGCTTT-AAGATGTCTAGCCGCCACGACAAAGAGAAAGGCGTCA 59
|||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 101 TTCGCCGTCCGTTCGCCG-TTTAAAAATGTCTAGCCGCCATGACAAAGAGAAAGGCGTCA 159
Query 60 ATGTTCAAGTCCTCCTTCGATGCAGGCCATTTAGCGATGATGAATTGAGAAGCAATGCTC 119
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 160 ATGTTCAAGTCCTCCTCCGATGCAGGCCATTTAGCGATGATGAATTGAGAAGCAATGCGC 219
Query 120 CTCAGGTTCTCACTTGTAATGATTTGCAAAGAGAAGTTGCTGTTTCCCAAAACATCGCTG 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 CTCAGGTTCTCACTTGTAATGATTTGCAAAGAGAAGTTGCTGTTTCCCAAAACATCGCTG 279
Query 180 GGAAGCATATTGATAGGGTTTTCACTTTTGATAAGGTGTTTGGACCATCCGCACAACAAA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 280 GGAAGCATATTGATAGGGTTTTCACTTTTGATAAGGTGTTTGGACCATCAGCACAACAGA 339
Query 240 AGGATTTGTATGATCAGGCCGTTGTTCCTATTGTGAATGAAGTACTTGAAGGTTTTAACT 299
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 340 AGGATTTGTATGATCAAGCCGTTGTTCCAATTGTGAATGAAGTACTTGAAGGTTTTAATT 399
Query 300 GTACGATATTTGCGTATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACAATGGAAGGAGAAT 359
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 GTACTATATTTGCGTATGGTCAGACTGGTACTGGTAAAACATATACAATGGAAGGAGAAT 459
Query 360 GTAGAAGGTCAAAGACG-GCTCCTTGTGGAGGTCTTCCGGCAGAAGCAGGTGTTATACCT 418
||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 460 GTAGAAGATCAAAGA-GCGCACCTTGTGGAGGTCTTCCGGCAGAAGCAGGTGTTATACCT 518
Query 419 AGAGCTGTGAAACAAATCTTTGATACGCTTGAGGGTCAGCAAGCTGAGTACAGTGTTAAG 478
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAGCTGTGAAACAAATATTTGATACGCTTGAGGGTCAGCAAGCTGAGTACAGTGTTAAA 578
Query 479 GTCACGTTTTTGGAACTCTACAATGAAGAGATTACTGATTTGCTTGCTCCTGAAGATATA 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 579 GTCACGTTTTTGGAACTCTACAATGAAGAGATTACCGATTTGCTTGCTCCTGAAGATCTA 638
Query 539 TCCAGAGTTGCTGCTGAAGATAAACAAAAGAAGCCGTTACCTCTCATGGAGGATGGCAAA 598
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 639 TCCAGAGTTGCTGCTGAAGAAAAACAAAAGAAGCCGTTGCCTCTCATGGAGGACGGCAAA 698
Query 599 GGTGGTGTTCTTGTTAGAGGATTGGAAGAGGAAATCGTCACAAGTGCCAATGAAATCTTC 658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 699 GGTGGTGTTCTTGTTAGAGGATTGGAAGAGGAAATCGTGACAAGTGCCAATGAAATCTTT 758
Query 659 ACTTTGCTTGAGAGAGGTTCCTCTAAAC-GACGGACTGCAGAAACATTCTTGAATAAACA 717
|||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 759 ACTTTGCTTGAGAGAGGTTCCTCTAAACGGA-GAACTGCAGAAACATTCTTGAATAAACA 817
Query 718 ATCAAGTCGGTCACATTCTCTCTTCTCAATAACCATACATATTAAAGAAGCTACTCCAGA 777
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 818 ATCAAGTCGGTCACATTCTCTCTTCTCAATAACAATACATATCAAAGAAGCTACTCCAGA 877
Query 778 AGGTGAAGAACTAATCAAGTGTGGCAAGCTGAACTTGGTTGACTTGGCAGGATCAGAAAA 837
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 878 AGGTGAAGAACTAATCAAGTGTGGCAAGCTCAACTTGGTTGACTTGGCAGGGTCAGAAAA 937
Query 838 TATATCACGTTCTGGTGCTAGGGATGGCCGGGCTCGAGAAGCTGGTGAAATAAACAAAAG 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 TATATCACGTTCTGGTGCTAGGGATGGCCGGGCTCGAGAAGCTGGTGAAATAAACAAAAG 997
Query 898 TCTTCTTACATTAGGACGAGTGATCAGCGCTTTGGTTGAACATCTTGGACACGTTCCTTA 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 TCTTCTTACATTAGGACGAGTGATCAGCGCTTTGGTTGAACATCTTGGACACGTTCCTTA 1057
Query 958 CAGGGATAGTAAGCTCACCCGTTTACTACGTGATTCACTTGGTGGGAGAACAAAGACATG 1017
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 CAGGGATAGTAAGCTCACCCGTTTACTACGTGATTCACTTGGTGGGAGAACAAAGACATG 1117
Query 1018 TATCATAGCCACAGTTTCACCTGCCGTTCATTGTCTGGAGGAAACTTTAAGTACTCTTGA 1077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1118 TATCATAGCCACAGTTTCACCTGCCGTTCATTGTCTGGAGGAAACATTAAGTACTCTTGA 1177
Query 1078 TTATGCACACAGGGCTAAGAATATTAGAAACAAACCAGAGGTTAACCAGAAAATGATGAA 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 TTATGCACACAGGGCTAAGAATATTAGAAACAAACCAGAGGTTAACCAGAAAATGATGAA 1237
Query 1138 ATCTACTTTGATAAAGGACCTTTATGGTGAAATAGAACGACTTAAGGCGGAGGTATATGC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1238 ATCTACTTTGATAAAGGACCTTTATGGTGAAATAGAACGACTTAAGGCGGAGGTATACGC 1297
Query 1198 TTCCCGTGAGAAAAATGGTGTTTATATGCCAAAAGAGAGATACTATCAAGAGGAGAGTGA 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1298 TTCCCGTGAGAAAAATGGTGTTTATATGCCAAAAGAGAGATACTACCAAGAGGAGAGTGA 1357
Query 1258 GAGAAAGGCAATGGCTGAGCAGATTGAACAGATGGGTGGTCAGATAGAGAATTACCAAAA 1317
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 GAGAAAGGTAATGGCTGAGCAGATTGAACAGATGGGTGGTCAGATAGAGAATTACCAAAA 1417
Query 1318 A 1318
|
Sbjct 1418 A 1418
> AT1G12430.2 | Symbols: ARK3 | armadillo repeat kinesin 3 | chr1:4233873-4238764
REVERSE LENGTH=3224
Length=3224
Score = 62.1 bits (33), Expect = 3e-08
Identities = 33/33 (100%), Gaps = 0/33 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 314 TATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACA 346
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672 TATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACA 704
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 158276705165
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5