BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg482593 Length=3182 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G36200.2 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosp... 2904 0.0 AT1G12430.2 | Symbols: ARK3 | armadillo repeat kinesin 3 | chr1... 62.1 3e-08 > AT2G36200.2 | Symbols: | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | chr2:15179869-15185314 REVERSE LENGTH=3457 Length=3457 Score = 2904 bits (1572), Expect = 0.0 Identities = 1676/1728 (97%), Gaps = 0/1728 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1319 CAACTTGAGGAGTTGCAAGATAAGTATGTCGGTCAAGTGCGGGAGTGCTCTGATCTGACT 1378 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1512 CAACTTGAGGAGTTGCAAGATAAGTATGTCGGTCAAGTGCGGGAGTGCTCTGATCTGACT 1571 Query 1379 AGCAAGCTTGATATCACCGAGAAAAACTTGAGCCAAACATGCAAAGTGCTTGCTTCCACA 1438 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1572 ACCAAGCTTGATATCACCGAGAAAAACTTGAGCCAAACATGCAAAGTGCTTGCTTCCACA 1631 Query 1439 AACGAGGAATTGAAGAAATCTCAATATGCCATGAAGGAGAAAGATTTCATCATTTCAGAG 1498 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1632 AACGAGGAATTGAAGAAATCTCAATATGCCATGAAAGAGAAAGATTTCATCATTTCAGAG 1691 Query 1499 CAGAAAAAATCTGAAAACGTACTGGTTCAACAAGCTTGCATTTTGCAATCCAACCTAGAG 1558 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1692 CAGAAAAAATCTGAAAATGTACTGGTTCAACAAGCTTGCATTTTGCAATCCAACCTAGAG 1751 Query 1559 AAAGCTACTAAAGACAATTCTTCATTACACCAAAAAATTGGAAGAGAGGACAAGCTCAGT 1618 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1752 AAAGCTACTAAAGACAATTCTTCATTACACCAAAAGATTGGAAGAGAGGACAAGCTTAGT 1811 Query 1619 GCGGATAACAGAAAAGTGGTCGACAATTATCAAGTAGAACTTTCTGAACAAATTTCCAAT 1678 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1812 GCGGATAACAGAAAAGTGGTGGACAATTATCAAGTAGAACTTTCTGAACAAATTTCAAAT 1871 Query 1679 CTGTTCAATAGGGTTGCTTCTTGTCTGTCCCAGCAAAATGTACACCTTCAGGGAGTTAAC 1738 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1872 CTGTTCAATAGGGTTGCTTCTTGTCTCTCCCAGCAAAATGTACACCTTCAGGGTGTTAAC 1931 Query 1739 AAACTGTCCCAATCTCGTTTAGAGGCACACAACAAGGCGATCCTAGAAATGAAAAAGAAG 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1932 AAACTGTCCCAATCTCGTTTAGAGGCACACAACAAGGCGATCCTAGAAATGAAAAAGAAG 1991 Query 1799 GTTAGAGCTTCAAGGGATTTATATAGTTCTCACTTGGAGGAAGTGCAGAATGTAGTTCGG 1858 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1992 GTTAAAGCTTCAAGGGATTTATATAGTTCTCACTTGGAGGCAGTGCAGAATGTAGTTCGG 2051 Query 1859 TTGCACAAGGCTAACTCGAATGCTTGTCTTGAGGAAGTTTCAGCATTGACGACTTCAAGT 1918 || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2052 TTACACAAGGCAAACGCGAATGCTTGTCTTGAGGAAGTTTCAGCATTGACGACTTCAAGT 2111 Query 1919 GCAAGTTCCATTGATGAGTTTCTTGCTTCAGGAGATGAGACAACATCGTCTTTATTTGAT 1978 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 2112 GCATGTTCCATTGATGAATTTCTTGCTTCAGGAGATGAAACAACATCGTCGTTATTTGAT 2171 Query 1979 GAACTTCAGAGTGCTCTCTCGTCTCATCAGGGAGAAATGGCTCTCTTTGCGAGGGAACTG 2038 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2172 GAACTTCAGAGTGCTCTCTCGTCCCATCAGGGAGAAATGGCTCTCTTTGCGAGGGAACTG 2231 Query 2039 AGACAGAGGTTCCACACAACGATGGAGCAAACTCAGCAAATGTCTGAATACACAAGTACG 2098 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 2232 AGACAAAGGTTCCACACAACGATGGAGCAAACTCAGGAGATGTCTGAATACACAAGTACG 2291 Query 2099 TTCTTTCAGAAGCTTATGGAAGAGTCTAAAAATGCTGAGAGTCGTGCTGCAGAGGCAAAT 2158 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2292 TTCTTTCAGAAGCTTATGGAAGAGTCTAAAAATGCTGAGACTCGTGCTGCAGAGGCAAAT 2351 Query 2159 AATGGTCAAATAAACAGCATTATTGATTTTCAGAAGACTTACGAGGCTCAGTCAAAATCT 2218 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2352 GATAGTCAAATAAACAGCATTATTGATTTTCAGAAGACTTACGAGGCTCAGTCAAAATCT 2411 Query 2219 GATGCAGATAAACTTATAGCAGATTTAACTACCCTCGTCTCAAGTCACATTCGTCGCCAA 2278 ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2412 GATACAGATAAACTTATTGCAGATTTAACTAACCTAGTCTCAAGTCACATTCGTCGCCAA 2471 Query 2279 CACGAACTGGTTGATACAAGACTCCATAATTTTAAAGATGCCGTCTCTTCCAACAAAATT 2338 |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2472 CACGAATTGGTTGATTCAAGACTCCATAACTTTAAAGATGCCGTCTCTTCCAACAAAACT 2531 Query 2339 TTCTTGGACGAACACGTCTCTGCTGTTAATAATCTGACTAAAGACGCAAAAAGAAAGTGG 2398 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2532 TTCTTGGACGAACATGTCTCTGCTGTTAATAATCTGACGAAAGACGCAAAAAGAAAGTGG 2591 Query 2399 GAGACCTTTTCCATGCAAGCTGAGAATGAAGCCAGAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCC 2458 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2592 GAGACATTTTCCATGCAAGCTGAGAATGAAGCCAGAGAAGGTGCTGATTTCTCGGCTGCA 2651 Query 2459 AAACATTGTCGAATGGAATTACTGCTTCAGCAATCTGTGGGTCATGCGGAATCAGCTTTC 2518 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2652 AAACATTGTCGAATGGAGTTACTGCTTCAGCAATCTGTGGGTCATGCGGAATCAGCTTTC 2711 Query 2519 AAACACTGCAAGATAACTCATGAATCTCTAAAGGAGATGAACAGTAAGCAAGTCACAGAT 2578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2712 AAACACTGCAAGATAACTCATGAATCTCTAAAGGAGATGACCAGTAAGCAAGTCACAGAT 2771 Query 2579 GTCTCTTCACTTGTTAGGTCTGCTTGTGATAGTAACGAGCGGCACGATGCGGAAGTAGAT 2638 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 2772 GTCTCTTCACTTGTTAGGTCTGCTTGTGATAGTAACGAGCAGCACGATGCCGAAGTAGAT 2831 Query 2639 TCTGCAAGGACTGCGGCTGAAAAAGATGTAACAAAGAACAGCGATGATATAATCCAGCAA 2698 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2832 TCTGCAAGGACTGCTGCTGAAAAAGATGTAACAAAGAACAGCGATGATATAATCCAGCAA 2891 Query 2699 ATTGACCGCATGTCAGAGGATGAAAAAGCGTCTGTATCACAAATCTTGGAAAATGTCAGG 2758 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 2892 ATTGAACGCATGTCAGAGGATGAAAAAGCGTCTGTATCAAAAATCCTGGAAAATGTCAGG 2951 Query 2759 TCGCATGAAAAAACTCTTGAAAGTTTCCAACAGGATCAGTGTTGCCAAGCCAGATGCATT 2818 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2952 TCGCATGAAAAAACTCTTGAAAGTTTCCAACAGGATCAGTGTTGCCAAGCCAGATGCATC 3011 Query 2819 GAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAAAAATACATGGAGTATGAGCCCACAGGGGCA 2878 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3012 GAGGATAAAGCTCAAGAAACTTTTCAACAACAATACATGGAGTATGAGCCCACAGGTGCA 3071 Query 2879 ACTCCAACAAAGAATGAACCAGAGATCCCAACTAAAGCCACCATTGAATCACTAAGAGCC 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3072 ACTCCAACAAAGAATGAACCAGAGATCCCAACCAAAGCCACCATTGAATCACTACGAGCC 3131 Query 2939 ATGCCAATTGAGACATTGGTTGAAGAGTTCCGTGAAAACAATTCTTATGAATCCTTTGCG 2998 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3132 ATGCCAATTGAGACATTAGTTGAAGAGTTCCGTGAAAACAACTCTTATGAATCCTTTGCG 3191 Query 2999 ACCAAGGAAACAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCCTCTCTCACAA 3046 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3192 ACCAAGGAAACAAAACCGCAACAGCTAACACGGTCGCCTCTCTCACAA 3239 Score = 2230 bits (1207), Expect = 0.0 Identities = 1284/1321 (97%), Gaps = 6/1321 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 TTCGCCGTCCGTTCGCCGCTTT-AAGATGTCTAGCCGCCACGACAAAGAGAAAGGCGTCA 59 |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 101 TTCGCCGTCCGTTCGCCG-TTTAAAAATGTCTAGCCGCCATGACAAAGAGAAAGGCGTCA 159 Query 60 ATGTTCAAGTCCTCCTTCGATGCAGGCCATTTAGCGATGATGAATTGAGAAGCAATGCTC 119 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 160 ATGTTCAAGTCCTCCTCCGATGCAGGCCATTTAGCGATGATGAATTGAGAAGCAATGCGC 219 Query 120 CTCAGGTTCTCACTTGTAATGATTTGCAAAGAGAAGTTGCTGTTTCCCAAAACATCGCTG 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 220 CTCAGGTTCTCACTTGTAATGATTTGCAAAGAGAAGTTGCTGTTTCCCAAAACATCGCTG 279 Query 180 GGAAGCATATTGATAGGGTTTTCACTTTTGATAAGGTGTTTGGACCATCCGCACAACAAA 239 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 280 GGAAGCATATTGATAGGGTTTTCACTTTTGATAAGGTGTTTGGACCATCAGCACAACAGA 339 Query 240 AGGATTTGTATGATCAGGCCGTTGTTCCTATTGTGAATGAAGTACTTGAAGGTTTTAACT 299 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 340 AGGATTTGTATGATCAAGCCGTTGTTCCAATTGTGAATGAAGTACTTGAAGGTTTTAATT 399 Query 300 GTACGATATTTGCGTATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACAATGGAAGGAGAAT 359 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 400 GTACTATATTTGCGTATGGTCAGACTGGTACTGGTAAAACATATACAATGGAAGGAGAAT 459 Query 360 GTAGAAGGTCAAAGACG-GCTCCTTGTGGAGGTCTTCCGGCAGAAGCAGGTGTTATACCT 418 ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 460 GTAGAAGATCAAAGA-GCGCACCTTGTGGAGGTCTTCCGGCAGAAGCAGGTGTTATACCT 518 Query 419 AGAGCTGTGAAACAAATCTTTGATACGCTTGAGGGTCAGCAAGCTGAGTACAGTGTTAAG 478 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 519 AGAGCTGTGAAACAAATATTTGATACGCTTGAGGGTCAGCAAGCTGAGTACAGTGTTAAA 578 Query 479 GTCACGTTTTTGGAACTCTACAATGAAGAGATTACTGATTTGCTTGCTCCTGAAGATATA 538 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 579 GTCACGTTTTTGGAACTCTACAATGAAGAGATTACCGATTTGCTTGCTCCTGAAGATCTA 638 Query 539 TCCAGAGTTGCTGCTGAAGATAAACAAAAGAAGCCGTTACCTCTCATGGAGGATGGCAAA 598 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 639 TCCAGAGTTGCTGCTGAAGAAAAACAAAAGAAGCCGTTGCCTCTCATGGAGGACGGCAAA 698 Query 599 GGTGGTGTTCTTGTTAGAGGATTGGAAGAGGAAATCGTCACAAGTGCCAATGAAATCTTC 658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 699 GGTGGTGTTCTTGTTAGAGGATTGGAAGAGGAAATCGTGACAAGTGCCAATGAAATCTTT 758 Query 659 ACTTTGCTTGAGAGAGGTTCCTCTAAAC-GACGGACTGCAGAAACATTCTTGAATAAACA 717 |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 759 ACTTTGCTTGAGAGAGGTTCCTCTAAACGGA-GAACTGCAGAAACATTCTTGAATAAACA 817 Query 718 ATCAAGTCGGTCACATTCTCTCTTCTCAATAACCATACATATTAAAGAAGCTACTCCAGA 777 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 818 ATCAAGTCGGTCACATTCTCTCTTCTCAATAACAATACATATCAAAGAAGCTACTCCAGA 877 Query 778 AGGTGAAGAACTAATCAAGTGTGGCAAGCTGAACTTGGTTGACTTGGCAGGATCAGAAAA 837 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 878 AGGTGAAGAACTAATCAAGTGTGGCAAGCTCAACTTGGTTGACTTGGCAGGGTCAGAAAA 937 Query 838 TATATCACGTTCTGGTGCTAGGGATGGCCGGGCTCGAGAAGCTGGTGAAATAAACAAAAG 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 938 TATATCACGTTCTGGTGCTAGGGATGGCCGGGCTCGAGAAGCTGGTGAAATAAACAAAAG 997 Query 898 TCTTCTTACATTAGGACGAGTGATCAGCGCTTTGGTTGAACATCTTGGACACGTTCCTTA 957 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 998 TCTTCTTACATTAGGACGAGTGATCAGCGCTTTGGTTGAACATCTTGGACACGTTCCTTA 1057 Query 958 CAGGGATAGTAAGCTCACCCGTTTACTACGTGATTCACTTGGTGGGAGAACAAAGACATG 1017 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1058 CAGGGATAGTAAGCTCACCCGTTTACTACGTGATTCACTTGGTGGGAGAACAAAGACATG 1117 Query 1018 TATCATAGCCACAGTTTCACCTGCCGTTCATTGTCTGGAGGAAACTTTAAGTACTCTTGA 1077 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1118 TATCATAGCCACAGTTTCACCTGCCGTTCATTGTCTGGAGGAAACATTAAGTACTCTTGA 1177 Query 1078 TTATGCACACAGGGCTAAGAATATTAGAAACAAACCAGAGGTTAACCAGAAAATGATGAA 1137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 TTATGCACACAGGGCTAAGAATATTAGAAACAAACCAGAGGTTAACCAGAAAATGATGAA 1237 Query 1138 ATCTACTTTGATAAAGGACCTTTATGGTGAAATAGAACGACTTAAGGCGGAGGTATATGC 1197 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1238 ATCTACTTTGATAAAGGACCTTTATGGTGAAATAGAACGACTTAAGGCGGAGGTATACGC 1297 Query 1198 TTCCCGTGAGAAAAATGGTGTTTATATGCCAAAAGAGAGATACTATCAAGAGGAGAGTGA 1257 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1298 TTCCCGTGAGAAAAATGGTGTTTATATGCCAAAAGAGAGATACTACCAAGAGGAGAGTGA 1357 Query 1258 GAGAAAGGCAATGGCTGAGCAGATTGAACAGATGGGTGGTCAGATAGAGAATTACCAAAA 1317 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1358 GAGAAAGGTAATGGCTGAGCAGATTGAACAGATGGGTGGTCAGATAGAGAATTACCAAAA 1417 Query 1318 A 1318 | Sbjct 1418 A 1418 > AT1G12430.2 | Symbols: ARK3 | armadillo repeat kinesin 3 | chr1:4233873-4238764 REVERSE LENGTH=3224 Length=3224 Score = 62.1 bits (33), Expect = 3e-08 Identities = 33/33 (100%), Gaps = 0/33 (0%) Strand=Plus/Plus Query 314 TATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACA 346 ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 672 TATGGTCAGACTGGTACTGGTAAGACATATACA 704 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 158276705165 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5