BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482666
Length=5404
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G36850.1 | Symbols: ATGSL08, GSL8, GSL08, ATGSL8, CHOR | glu... 2410 0.0
> AT2G36850.1 | Symbols: ATGSL08, GSL8, GSL08, ATGSL8, CHOR | glucan
synthase-like 8 | chr2:15454697-15469889 REVERSE LENGTH=6176
Length=6176
Score = 2410 bits (1305), Expect = 0.0
Identities = 1351/1373 (98%), Gaps = 3/1373 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2257 AGCAACAGTATAGAACAGGGTTCCCTTGCGATAACTCTAAATCTTAAGAAGCTTCAGTTA 2316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 AGCAACAGTATAGAACAGGGTTCCCTTGCGATAACTCTAAATCTTAAGAAGCTTCAGTTA 3022
Query 2317 GTGGTTTCCAGATTTACTGCACTAACCGGGCTTTTGAAGATTCGAAATGAAACTCCAGAT 2376
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3023 GTGGTTTCCAGATTTACTGCATTAACCGGGCTTTT---GATTCGAAATGAAACCCCAGAT 3079
Query 2377 CTTGCAAAAGGTGCTGCAAAAGCTATGTTTGATTTTTACGAGGTGGTCACGCATGACCTT 2436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 CTTGCAAAAGGTGCTGCAAAAGCTATGTTTGATTTTTACGAGGTGGTCACGCATGACCTT 3139
Query 2437 CTTTCACATGATTTGAGGGAGCAGCTTGATACATGGAATATTTTAGCACGGGCTCGAAAT 2496
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3140 CTTTCACATGATTTAAGGGAGCAGCTTGATACATGGAATATTTTAGCACGGGCTCGAAAT 3199
Query 2497 GAAGGGCGTCTCTTTTCCAGGATAGCTTGGCCTAGGGACCCAGAAATTATAGAGCAGGTC 2556
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3200 GAAGGGCGTCTCTTTTCCAGAATAGCTTGGCCTAGGGACCCAGAAATTATAGAGCAGGTC 3259
Query 2557 AAGCGGCTACATCTTCTTCTCACTGTGAAGGATGCCGCTGCTAACGTCCCAAAAAATCTA 2616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 AAGCGGCTACATCTTCTTCTCACTGTGAAGGATGCCGCTGCTAACGTCCCAAAAAATCTA 3319
Query 2617 GAAGCAAGAAGAAGATTGGAGTTTTTCACAAATTCTTTATTTATGGATATGCCCCAAGCA 2676
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3320 GAAGCAAGAAGAAGATTGGAGTTTTTCACAAATTCGTTATTTATGGATATGCCCCAAGCA 3379
Query 2677 AGGCCTGTTGCTGAAATGGTTCCATTCAGTGTCTTCACCCCATACTATAGTGAGACAGTC 2736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3380 AGGCCTGTTGCTGAAATGGTTCCATTCAGTGTCTTCACCCCATACTATAGTGAGACAGTG 3439
Query 2737 CTCTATAGCTCCTCAGAACTGCGAAGTGAGAATGAGGATGGGATATCTATTCTTTTCTAT 2796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3440 CTCTATAGCTCCTCAGAACTGCGAAGTGAGAATGAGGATGGAATATCTATTCTTTTCTAT 3499
Query 2797 CTTCAAAAGATATTTCCTGATGAATGGGAGAACTTCTTGGAGAGGATTGGCAGGTCTGAA 2856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3500 CTTCAAAAGATATTTCCTGATGAATGGGAGAACTTCTTGGAGAGGATTGGCAGGTCTGAA 3559
Query 2857 TCAACAGGGGATGCAGATCTTCAAGCAAGTTCAACTGATGCTTTGGAGCTTCGGTTTTGG 2916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3560 TCAACAGGGGATGCAGATCTTCAAGCAAGTTCAACTGATGCTTTGGAGCTTCGGTTTTGG 3619
Query 2917 GTATCTTATCGAGGACAGACTTTAGCGAGGACTGTGCGAGGTATGATGTATTACCGAAGG 2976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3620 GTATCTTATCGAGGACAGACTTTAGCGAGGACTGTGCGAGGTATGATGTATTACCGAAGG 3679
Query 2977 GCTTTGATGCTCCAGAGTTTCTTAGAAAGACGAGGCTTGGGAGTGGATGATGCCTCTCTG 3036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3680 GCTTTGATGCTCCAGAGTTTCTTAGAAAGACGAGGCTTGGGAGTGGATGATGCATCTCTG 3739
Query 3037 ACCAACATGCCACGAGGATTTGAATCGTCAATTGAAGCTCGAGCTCAAGCGGACCTTAAA 3096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3740 ACCAACATGCCACGAGGATTTGAATCGTCAATTGAAGCTCGAGCTCAAGCGGACCTTAAG 3799
Query 3097 TTTACGTATGTTGTGTCGTGCCAAATTTATGGGCAACAGAAACAGCAAAAGAAACCAGAG 3156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3800 TTTACGTATGTTGTGTCGTGCCAAATTTATGGGCAACAGAAACAGCAAAAGAAACCAGAG 3859
Query 3157 GCTACTGATATCGGACTTTTATTGCAAAGATATGAGGCGCTACGAGTTGCTTTCATACAT 3216
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3860 GCTACTGATATCGGACTTTTATTGCAAAGATACGAGGCGCTACGAGTTGCTTTCATACAT 3919
Query 3217 TCCGAGGATGTTGGAAGTGGAGATGGTGGAAGTGGAGGGAAAAAGGAATTCTATTCTAAA 3276
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3920 TCGGAGGATGTTGGAAATGGAGATGGTGGAAGTGGAGGGAAAAAGGAATTCTATTCTAAA 3979
Query 3277 CTAGTAAAAGCTGACATTCACGGAAAAGATGAGGAAATTTATTCAATTAAACTTCCCGGA 3336
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3980 TTAGTAAAAGCTGACATTCACGGAAAAGATGAGGAAATTTATTCAATTAAACTTCCCGGA 4039
Query 3337 GATCCTAAACTTGGTGAAGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCGATCGTTTTTACGCGT 3396
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 4040 GATCCTAAACTTGGTGAAGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTATCGTGTTTACGCGG 4099
Query 3397 GGAGAAGCTATCCAGACCATAGATATGAATCAGGACAATTATCTAGAGGAAGCAATTAAA 3456
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 4100 GGAGAAGCTATCCAGACCATAGATATGAATCAGGACAATTATCTGGAGGAAGCAATCAAA 4159
Query 3457 ATGAGAAATCTACTTGAGGAGTTTCATGGAAAACATGGAATTCGACGTCCTACTATTTTG 3516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4160 ATGAGAAATCTACTTGAGGAGTTTCATGGAAAACATGGAATTCGACGTCCTACTATTTTG 4219
Query 3517 GGAGTTAGAGAGCATGTTTTCACGGGAAGTGTTTCATCACTGGCGTGGTTCATGTCGAAT 3576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4220 GGAGTTAGAGAGCATGTTTTCACGGGAAGTGTTTCATCACTGGCGTGGTTCATGTCGAAT 4279
Query 3577 CAAGAGACCAGTTTTGTGACGTTGGGTCAACGGGTTCTAGCATATCCACTTAA 3629
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4280 CAAGAGACCAGTTTTGTAACGTTGGGTCAACGGGTTCTAGCATATCCACTTAA 4332
Score = 1779 bits (963), Expect = 0.0
Identities = 995/1011 (98%), Gaps = 0/1011 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3802 GGAAGAGATGTAGGACTCAACCAGATTGCCCTATTTGAAGGGAAGGTAGCAGGTGGAAAT 3861
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4508 GGAAGAGATGTAGGACTTAACCAGATTGCCCTATTTGAAGGGAAGGTAGCAGGTGGAAAT 4567
Query 3862 GGAGAACAAGTTCTTAGCAGGGATGTCTACAGAATTGGGCAGCTGTTTGACTTTTTTAGA 3921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 GGAGAACAAGTTCTTAGCAGGGATGTCTACAGAATTGGGCAGCTGTTTGACTTTTTTAGA 4627
Query 3922 ATGATGTCGTTCTACTTCACAACAGTTGGATTCTATGTCTGCACAATGATGACCGTCCTT 3981
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4628 ATGATGTCATTCTACTTCACAACAGTTGGATTCTATGTCTGCACAATGATGACCGTCCTT 4687
Query 3982 ACTGTGTACGTCTTTTTGTATGGAAGAGTTTATCTGGCCTTTTCTGGTGCTGATCGTGCA 4041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4688 ACTGTGTACGTCTTTTTGTATGGAAGAGTTTATCTGGCCTTTTCTGGTGCTGATCGTGCA 4747
Query 4042 ATATCAAGAGTAGCCAAACTGTCAGGTAACACTGCATTGGATGCTGCACTAAACGCACAG 4101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4748 ATATCAAGAGTAGCCAAACTGTCAGGTAACACTGCATTGGATGCTGCACTAAACGCACAG 4807
Query 4102 TTTTTAGTCCAGATTGGAGTCTTTACTGCCGTCCCTATGGTGATGGGTTTCATACTTGAG 4161
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4808 TTTTTAGTCCAGATTGGAATCTTTACTGCCGTCCCTATGGTGATGGGTTTCATACTTGAA 4867
Query 4162 CTTGGATTGCTAAAGGCTATTTTCAGCTTTATTACGATGCAATTCCAGTTGTGTTCTGTC 4221
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4868 CTTGGGTTGCTAAAGGCTATTTTCAGCTTCATTACAATGCAATTCCAGTTGTGTTCTGTC 4927
Query 4222 TTTTTCACATTTTCTCTCGGGACAAGAACTCATTACTTTGGACGTACTATTCTTCACGGT 4281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4928 TTTTTCACATTTTCTCTCGGGACAAGAACTCATTACTTTGGACGTACTATTCTTCACGGT 4987
Query 4282 GGTGCAAAGTATCGAGCAACTGGCAGAGGTTTTGTGGTTCAGCACATCAAGTTTGCCGAT 4341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4988 GGTGCAAAGTATCGAGCAACTGGCAGAGGTTTTGTGGTTCAGCACATAAAGTTTGCCGAT 5047
Query 4342 AATTACAGACTTTATTCTAGAAGTCATTTTGTTAAAGCTTTTGAAGTAGCTCTACTGTTG 4401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5048 AATTACAGACTTTATTCTAGAAGTCATTTTGTTAAAGCTTTTGAAGTAGCTCTACTGTTG 5107
Query 4402 ATCATTTACATTGCCTATGGGTATACGGACGGGGGTGCCTCTTCGTTCGTTTTGCTAACT 4461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5108 ATCATTTACATTGCCTATGGGTATACGGACGGGGGTGCCTCTTCGTTCGTTTTGCTAACT 5167
Query 4462 ATCAGCAGTTGGTTCCTTGTAATCTCCTGGTTGTTTGCACCCTACATCTTCAATCCCTCT 4521
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 5168 ATCAGCAGTTGGTTCCTTGTAATATCCTGGTTGTTTGCACCCTATATCTTCAATCCCTCT 5227
Query 4522 GGATTTGAATGGCAAAAGACTGTCGAGGATTTTGAAGACTGGGTCAGTTGGCTGATGTAC 4581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5228 GGATTTGAATGGCAAAAGACTGTCGAGGATTTTGAAGACTGGGTCAGTTGGCTTATGTAC 5287
Query 4582 AAAGGTGGAGTGGGAGTAAAGGGAGAGCTCAGTTGGGAGTCGTGGTGGGAGGAAGAACAG 4641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5288 AAAGGTGGAGTGGGAGTAAAGGGAGAGCTCAGTTGGGAGTCGTGGTGGGAGGAAGAACAG 5347
Query 4642 GCGCATATCCAAACATTAAGAGGAAGGATATTGGAGACCATTTTGAGCTTGAGATTTTTC 4701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 5348 GCGCATATCCAAACATTAAGAGGAAGGATATTGGAGACTATTTTGAGCCTGAGATTTTTC 5407
Query 4702 ATGTTTCAATATGGCATTGTGTACAAGCTTGATCTCACTGGGAAAAACACTTCACTTGCG 4761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5408 ATGTTTCAATATGGCATTGTGTACAAGCTTGATCTCACTCGGAAAAACACTTCACTTGCG 5467
Query 4762 CTCTATGGCTACTCGTGGGTTGTATTGCTTGTTATTGTGTTCTTGTTTAAG 4812
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5468 CTCTATGGCTACTCGTGGGTTGTTTTGGTTGTTATTGTGTTCTTGTTTAAG 5518
Score = 1474 bits (798), Expect = 0.0
Identities = 838/858 (98%), Gaps = 0/858 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCACAGAACTTGGATCCTAATAGTGATGGTAGAGGTGTTCTTCAATTCAAAACTGGT 60
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452 ATGGCACAGAACTTGGACCCTAACAGTGATGGTAGAGGTGTTCTTCAATTCAAAACTGGT 511
Query 61 TTGATGTCCGTGATTAAGCAAAAACTTGCCAAGAGAGATGGTGCTTCAATAGACCGCGAT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 TTGATGTCCGTGATTAAGCAAAAACTTGCCAAGAGAGATGGTGCTTCAATAGACCGCGAT 571
Query 121 CGTGATGTTGAACGACTATGGGAGTTTTACAAACTTTATAAAAGACGGCATAGAGTGGAT 180
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 CGTGATATTGAACGACTATGGGAATTTTACAAACTTTATAAAAGACGGCATAGAGTGGAT 631
Query 181 GATATTCAGAAGGAAGAGCAAAAGTGGAGGGAATCAGGAACAACTTTTTCTTCAAACGTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 632 GATATTCAGAAGGAAGAGCAAAAGTGGAGGGAATCAGGAACAACTTTTTCTTCTAACGTG 691
Query 241 GGGGAGATCTTGAAGATGAGGAAGGTGTTTGCCACATTGAGGGCCCTAATTGAAGTGTTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 GGGGAGATCTTGAAGATGAGGAAGGTGTTTGCCACATTGAGGGCCCTAATTGAAGTGTTA 751
Query 301 GAGGTGCTAAGCAGAGATGCTGATCCAAATGGTGTTGGGAGGTCTATCAGGGACGAGCTT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 GAGGTGCTAAGCAGAGATGCTGATCCAAATGGTGTTGGGAGGTCTATCAGGGACGAGCTT 811
Query 361 GGGCGGATTAAAAAAGCTGATGCAACTTTGTCTGCGGAACTAACTCCTTACAATATCGTC 420
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 812 GGGCGGATTAAAAAAGCTGATGCAACTTTGTCTGCGGAACTAACTCCTTACAATATTGTC 871
Query 421 CCTCTAGAAGCGCAGTCCATGACCAATGCAATTGGGGTTTTTCCTGAAGTACGTGGTGCA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 872 CCTCTAGAAGCGCAGTCCATGACCAATGCAATTGGGGTTTTCCCTGAAGTACGTGGTGCA 931
Query 481 GTCCAGGCTATCAGATATACCGAACATTTCCCTAGGCTTCCCGATGATTTTGAGATTTCC 540
||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 932 GTCCAAGCTATCAGATACACTGAACATTTCCCTAGGCTTCCCGTTGATTTTGAGATTTCC 991
Query 541 GGACAACGTGATGCAGATATGTTTGATTTATTGGAGTATATCTTTGGGTTTCAGAGAGAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 GGACAACGTGATGCAGATATGTTTGATTTATTGGAGTATATCTTTGGGTTTCAGAGAGAC 1051
Query 601 AACGTAAGGAACCAACGGGAGCATCTGGTTCTCACACTTTCAAATGCACAATCTCAGCTT 660
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1052 AATGTAAGGAACCAACGGGAGCATTTGGTTCTCACACTTTCAAATGCACAGTCCCAGCTT 1111
Query 661 AGTATACCTGGCCAGAATGACCCAAAAATTGATGAGAATGCAGTCAATGAGGTTTTCTTG 720
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 AGTATACCTGGGCAGAATGACCCAAAAATTGATGAGAATGCAGTCAATGAGGTTTTCTTA 1171
Query 721 AAGGTTTTGGACAACTACATCAAGTGGTGCAAATACTTGAGGATACGCTTTGTGTACAAC 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1172 AAGGTTTTGGACAACTACATCAAGTGGTGCAAATACTTGAGGATACGCGTTGTGTACAAC 1231
Query 781 AAGTTAGAAGCCATTGACCGGGACAGGAAATTGTTTCTTGTTTCTTTGTACTTCCTAATC 840
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 AAGTTAGAAGCCATTGACCGGGACAGGAAGCTGTTTCTTGTTTCTTTGTACTTCCTAATC 1291
Query 841 TGGGGTGAAGCTGCTAAT 858
||||||||||||||||||
Sbjct 1292 TGGGGTGAAGCTGCTAAT 1309
Score = 894 bits (484), Expect = 0.0
Identities = 560/596 (94%), Gaps = 8/596 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4811 AGGGAGTGGCTTCGCTCACATTCATCGCCCTCATCGCTGTAGCCATTGCACTAACACCGC 4870
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |
Sbjct 5577 AGGGAGTGGCTTCGATCACATTCATCGCCCTCATCGTTGTAGCCATTGCAATGACAGATC 5636
Query 4871 TATCGATTCCAGACATGTTTGCATGTGTTCTTGCTTTTATCCCGACCGGTTGGGGTCTAC 4930
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 5637 TATCGATTCCAGACATGTTTGCATGTGTCCTTGGTTTTATCCCGACCGGCTGGGCTCTAC 5696
Query 4931 TGTCTTTAGCAATCACATGGAAACAGGTGCTTCGGGTCCTGGGCTTGTGGGAAACAGTCC 4990
| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5697 TCTCTTTAGCCATCACATGGAAACAGGTGCTTAGGGTCCTGGGCTTGTGGGAAACAGTCC 5756
Query 4991 GTGAGTTTGGACGTATATATGATGCTGCAATGGGTATGCTCATATTTTCTCCGATCGCCC 5050
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5757 GTGAGTTTGGGCGTATATATGATGCTGCAATGGGTATGCTCATATTTTCTCCGATCGCCC 5816
Query 5051 TTCTTTCCTGGTTCCCTTTCATCTCCACGTTCCAGTCTCGTCTCCTCTTCAACCAAGCTT 5110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5817 TTCTTTCCTGGTTCCCTTTCATCTCCACGTTCCAGTCTCGGCTCCTCTTCAACCAAGCTT 5876
Query 5111 TCAGTCGCGGACTTGAAATCTCCATTATCCTCGCCGGTAACAGAGCTAATGTTGAGACCT 5170
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5877 TCAGTCGCGGACTTGAAATCTCCATTATCCTTGCCGGAAACAGAGCTAATGTTGAGACCT 5936
Query 5171 GATGAACgagagagagagagagaAATTAGTGTGGAAGTAGAAGAAGTATTAGACATTTTG 5230
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5937 GATGAACGAGAGAGAGAGAGA-AG-TTAGTGTGGAAGTAGAAGAAGTATTAGACATTTTG 5994
Query 5231 TTTGTAGAGTTTGTAGAACGTCACTGAAAGCTCATCGACTCGGATTTTATATG-TTGGTA 5289
||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||
Sbjct 5995 TTTGTAGAGTTTGTAGAACATCATTGGAAGCTCATAGACTCGAATTTTATATGGTTG-TA 6053
Query 5290 ATCTTAGTTTTGTTTACTCTAAAAGCTTACTGTTTATTGTCATAGGTTGACTATATTTTG 5349
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6054 ATCTTAGTTTTGTTTACTCTAA--GCTTACTGTTTATTGTCATAGGTTGACTATATTTTG 6111
Query 5350 GTAACTTGATTTTTGTTAAATTGAGATTTGTTGATCGTCTGAGA-ATCTTTGATCT 5404
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||
Sbjct 6112 GTAACTTGATTTTTTTTAAAATGAGATTTGTTGATTGTCTGAGATA-CTTTAATCT 6166
Score = 556 bits (301), Expect = 6e-157
Identities = 329/343 (96%), Gaps = 0/343 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1857 GGATGGTCAGGATATGAACAAGGCATATGCTGCAATGTTTTCGCCGTTTTGGAATGAGAT 1916
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 2596 GGATGGTCAGGATATGAACAAGGCATATGCTGCGATGTTTTCACCTTTTTGGAATGAGAT 2655
Query 1917 AATAAAGAGCTTGAGAGAGGAAGATTATCTCAGTAACAGGGAGATGGATTTGCTTTCTAT 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2656 AATAAAGAGCTTGAGAGAGGAAGATTATCTCAGTAACAGGGAGATGGATTTGCTTTCTAT 2715
Query 1977 CCCCAGTAACACGGGGAGTCTTAGACTAGTCCAGTGGCCATTGTTTCTTCTCTGCAGTAA 2036
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2716 TCCCAGTAACACGGGGAGCCTTAGACTAGTCCAGTGGCCCTTGTTTCTTCTCTGCAGTAA 2775
Query 2037 GATTTTGGTGGCCATTGATTTAGCCATGGAGTGCACAGAAACACAGGAAGTACTATGGAA 2096
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2776 GATTCTGGTAGCCATTGATTTAGCCATGGAGTGCAAAGAAACACAAGAAGTACTATGGAG 2835
Query 2097 ACGAATATGCGATGATGAATACATGGCATATGCAGTTCAGGAGTGCTATTACAGCGTTGA 2156
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2836 ACAAATATGCGATGATGAATACATGGCGTATGCAGTTCAGGAGTGCTATTACAGTGTTGA 2895
Query 2157 AAAAATATTGAATTCCATGGTTAATGATGAAGGGCGACGTTGG 2199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2896 AAAAATATTGAATTCCATGGTTAATGATGAAGGGCGACGTTGG 2938
Score = 475 bits (257), Expect = 2e-132
Identities = 279/290 (96%), Gaps = 0/290 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 859 ATGGCCAAGGAATTGGATGCAAAATTGGATCATGGTGAAGCTGTTCGTGCTGACAGTTGC 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 ATGGCCAAGGAATTGGATGCAAAATTGGATCATGGAGAAGCTGTTCGTGCTGACAGTTGC 1411
Query 919 TTAACGGGAACTGATACTGGTTCTGTATCATTTCTTGAGCGAATTATCTGCCCTATATAT 978
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 TTAACTGGAACGGATACCGGTTCTGTATCATTTCTTGAGCGAATTATCTGCCCTATATAT 1471
Query 979 GAAACAATCTCAGCGGAAGCTGCTCGAAACAATGGTGGGAAAGCTGCGCATTCAGAATGG 1038
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1472 GAAACAATCTCAGCGGAAACTGTTCGAAACAATGGTGGGAAAGCTGCACATTCTGAATGG 1531
Query 1039 CGGAATTATGATGACTTCAATGAATACTTTTGGACACCTGCTTGCTTTGAGTTAGGCTGG 1098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1532 CGGAATTATGATGACTTCAATGAATACTTTTGGACACCTGCTTGCTTTGAGTTAAGCTGG 1591
Query 1099 CCTATGAAAACAGAGTCACGCTTTTTAAGCAAGCCTAAAGGGAGGAAAAG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1592 CCTATGAAAACAGAGTCACGCTTTTTAAGCAAGCCGAAAGGGCGGAAAAG 1641
Score = 418 bits (226), Expect = 3e-115
Identities = 244/253 (96%), Gaps = 0/253 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1408 TCTAACAATCATGCATTGACCATTGTTAGCTTGTGGGCTCCAGTTTTGGCGATATATCTT 1467
|||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2345 TCTAACGATCATGCGTTGACCATTGTTAGCTTGTGGGCTCCAGTTTTGGCGATTTATCTT 2404
Query 1468 ATGGATATTCATATATGGTACACACTCTTGTCTGCAATTATTGGTGGTGTGATGGGTGCA 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2405 ATGGATATTCATATATGGTACACACTCTTGTCTGCAATTATTGGTGGTGTGATGGGTGCA 2464
Query 1528 AAAGCTCGTCTAGGCGAGATACGCTCCATCGAGATGGTTCATAAGCGTTTTGAGAGTTTT 1587
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2465 AAAGCTCGCCTAGGCGAGATACGCACCATCGAGATGGTTCATAAGCGTTTTGAGAGTTTT 2524
Query 1588 CCAGAAGCTTTTGCCCAGAACCTTGTCTCTCCTGTTGTGAAAAGAGTACCACTGGGCCAA 1647
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2525 CCAGAGGCTTTTGCTCAGAACCTTGTCTCTCCTGTTGTGAAAAGAGTACCACTTGGCCAA 2584
Query 1648 CATACTTCTCAGG 1660
||| |||||||||
Sbjct 2585 CATGCTTCTCAGG 2597
Score = 296 bits (160), Expect = 1e-78
Identities = 174/181 (96%), Gaps = 0/181 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1150 TCTTTGACGATTATAGCCTTCAGGAAAGAACATCTCGATATAGATACTTTTAAGATCTTA 1209
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||
Sbjct 1736 TCTTTGACGATTATAGCCTTCAGGAATGAACATCTCAATATCGAAACTTTCAAGATCTTA 1795
Query 1210 CTCAGTGCTGGGCCTACATATGCTATTATGAACTTCATTGAATGTCTTCTTGACGTTGTG 1269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1796 CTCAGTGCTGGGCCTACATATGCTATTATGAACTTCATTGAATGTCTTCTTGATGTTGTA 1855
Query 1270 CTTATGTATGGCGCCTACAGCATGGCAAGAGGAATGGCTATATCCAGGCTGGTTATCAGG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 CTTATGTATGGCGCCTACAGCATGGCAAGAGGAATGGCTATATCCAGGCTGGTTATCAGG 1915
Query 1330 T 1330
|
Sbjct 1916 T 1916
Score = 213 bits (115), Expect = 1e-53
Identities = 115/115 (100%), Gaps = 0/115 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3690 AGTTCGAATGCACTATGGGCATCCAGATGTGTTCGATAGAATATTTCATATAACTCGCGG 3749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4333 AGTTCGAATGCACTATGGGCATCCAGATGTGTTCGATAGAATATTTCATATAACTCGCGG 4392
Query 3750 AGGAATCAGCAAAGCATCCCGTGTTATTAACATCAGTGAAGATATATATGCTGGA 3804
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4393 AGGAATCAGCAAAGCATCCCGTGTTATTAACATCAGTGAAGATATATATGCTGGA 4447
Score = 119 bits (64), Expect = 3e-25
Identities = 64/64 (100%), Gaps = 0/64 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1326 CAGGTATGTGGCGTTTTGGTTGGTTGTCCTGGCCTCCAAATTCACATTTGCATACTTCCT 1385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200 CAGGTATGTGGCGTTTTGGTTGGTTGTCCTGGCCTCCAAATTCACATTTGCATACTTCCT 2259
Query 1386 CCAG 1389
||||
Sbjct 2260 CCAG 2263
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 269747652511
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5