BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482684
Length=3192
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G37010.1 | Symbols: ATNAP12, NAP12 | non-intrinsic ABC prote... 4006 0.0
> AT2G37010.1 | Symbols: ATNAP12, NAP12 | non-intrinsic ABC protein
12 | chr2:15541720-15546159 FORWARD LENGTH=3249
Length=3249
Score = 4006 bits (2169), Expect = 0.0
Identities = 2361/2454 (96%), Gaps = 11/2454 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 750 CATTACTGCAGACAAGGTTCTACTTCAC---AA--A------AACCTCGCAACATGTAAT 798
||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||| |||
Sbjct 796 CATTACTGCAGACAAGGTTCTACGTCACAGAAACCATGTTTTAAGCTCGCAACATGCAAT 855
Query 799 CCGAATACCGCAAACCAAAATATTCATGCCTACGGAGCCATCTTAATTGCGTCACTAAGT 858
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 856 CCGAATACCGCAAACCAAAATATTCATGCCTATGGAGCGATCTTAATTGCATCACTAAGT 915
Query 859 CTTCTCATGATCATGGTTTATAACTGTTCCGATCAAGTTCTTGCCACTCGAGAAAAAAGA 918
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 916 CTTCTCATGATCATGGTTTATAACTGTTCTGATCAAGTTCTCGCCACTCGAGAAAAAAGA 975
Query 919 CAAGCAAAGTCGAGAGAAGCTGCAGCGAGACACGCAAAGGAAACAACACAAGCTCGAGAA 978
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 976 CAAGCAAAGTCGAGAGAAGCTGCAGCGAGACATGCAAAAGAAACAACACAAGCTCGAGAA 1035
Query 979 AGGTGGAAAACTGCAAAAGGTGTTGCCAAGAACCAAAAGATGGGATTATCTGCACAACTA 1038
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1036 AGGTGGAAAACCGCAAAAGGTGTTGCCAAGAACCAAAAGATGGGATTGTCTGCACAACTA 1095
Query 1039 TCTCAAACATTTTCTCGCATGAAATCTGCTAGAAAGGATGCCACACCTGCTAAAGCGTCA 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||
Sbjct 1096 TCTCAAACATTTTCTCGCATGAAATCTGCTAGAAAGGATGCCACACCAGTTAAAGCATCG 1155
Query 1099 GGAAAGTCAAAAGACAAGAAAAAAGAGCCAAGTAATTTAACCAAGATGATGAAATCAATG 1158
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 GGAAAGTCAAAAGACAAGAAAAAAGAACCGAGTAATTTAACCAAGATGATGAAATCAATG 1215
Query 1159 GAGGAGAACCCGAGTAACAACGAAGGATTCAATGTAGGAACCGGTAGTAAACCTGGGAAG 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 GAGGAGAACCCGAGTAACAACGAAGGATTCAATGTAGGAACCGGTAGTAAACCTGGGAAG 1275
Query 1219 AAGCCGCAAGCTCCAAAGGGTAAACAACTACATACTCAAAGCCAAATCTTTAAGTATGCT 1278
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct 1276 AAGCCACAAGCTCCAAAGGGTAAACAACTACATACCCAAAGCCAGATTTTTAAGTATGCA 1335
Query 1279 TATGGTCAGATTGAGAAGGAGAAAGCTATGGAGCAAAACAACAAGAACTTGACATTCTCG 1338
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 TATGGTCAGATTGAGAAGGAGAAAGCTATGGAACAAAACAACAAGAACTTGACATTCTCG 1395
Query 1339 GGAGTTATTTCGATGGCTACCGACACTGAGATGAGGACTAGACCTGTTATAGAAGTTGCG 1398
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1396 GGAGTTATTTCAATGGCTACTGACACTGAGATGAGGACTAGACCTGTTATAGAAGTCGCG 1455
Query 1399 TTTAAGGATCTAACCCTTACATTGAAGGGTAAACATAAACATATATTGAGATCTGTCACC 1458
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1456 TTTAAGGATCTAACTCTTACATTGAAGGGTAAACATAAGCATATATTGAGATCTGTCACC 1515
Query 1459 GGAAAGATCATGCCAGGTCGTGTTTCTGCCGTCATGGGTCCATCAGGAGCTGGAAAAACT 1518
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 GGAAAGATCATGCCAGGTCGTGTTTCTGCGGTCATGGGTCCATCAGGAGCTGGAAAAACT 1575
Query 1519 ACATTTCTTTCTGCCTTGGCTGGAAAAGCAACTGGATGTACGAGGACTGGTCTAATCCTC 1578
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1576 ACATTTCTTTCTGCCTTGGCAGGAAAAGCAACTGGATGTACGAGGACGGGTCTAATCCTT 1635
Query 1579 ATAAATGGTAGAAATGACTCCATAAACTCATATAAGAAGATCACTGGATTTGTGCCACAA 1638
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1636 ATAAATGGTAGAAATGACTCTATAAACTCGTATAAGAAGATCACTGGATTTGTGCCACAA 1695
Query 1639 GATGATGTTGTGCATGGCAATCTTACCGTCGAGGAGAACCTTCGATTTAGCGCAAGATGC 1698
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 GATGATGTTGTGCATGGCAATCTTACCGTCGAAGAGAACCTTCGATTTAGCGCAAGATGC 1755
Query 1699 AGATTAAGTGCTTATATGTCAAAAGCAGATAAAGTGTTGATCATTGAAAGAGTGATTGAA 1758
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756 AGATTAAGTGCTTATATGTCAAAAGCAGACAAAGTTTTGATCATTGAAAGAGTGATTGAA 1815
Query 1759 AGCTTAGGACTACAACATGTAAGAGACTCGTTGGTTGGTACGATAGAAAAAAGAGGAATC 1818
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1816 AGCTTAGGATTACAACATGTAAGAGACTCGTTGGTTGGTACGATAGAAAAAAGAGGAATC 1875
Query 1819 TCTGGAGGACAAAGAAAACGTGTGAACGTTGGTGTTGAAATGGTCATGGAACCTTCTCTA 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1876 TCTGGAGGACAAAGAAAACGTGTGAACGTTGGTGTTGAAATGGTCATGGAACCTTCTCTA 1935
Query 1879 TTGATATTAGATGAACCCACTACAGGTTTAGATAGTGCATCTTCACAATTACTTCTTAGA 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1936 TTGATATTAGATGAACCCACTACAGGTTTAGATAGTGCATCTTCACAATTACTTCTTAGA 1995
Query 1939 GCACTTCGACGTGAAGCACTTGAAGGTGTTAACATTTGTATGGTCGTGCATCAACCCAGT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1996 GCACTTCGACGTGAAGCACTTGAAGGTGTTAACATTTGTATGGTCGTCCATCAACCCAGT 2055
Query 1999 TATACAATGTACAAAATGTTCGATGACATGATCATACTAGCAAAAGGTGGCCTTACCGTG 2058
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2056 TATACAATGTACAAAATGTTCGATGACATGATAATACTAGCAAAAGGTGGTCTTACCGTG 2115
Query 2059 TACCATGGATCAGTCaaaaaaaTCGAAGAATATTTTGCTGATATCGGGATCACGGTTCCC 2118
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2116 TACCATGGATCAGTCAAAAAAATAGAAGAATATTTTGCTGATATCGGAATCACGGTTCCC 2175
Query 2119 GATCGTGTCAATCCTCCTGATCATTATATAGACATTCTTGAAGGCATTGTGAAACCAGAT 2178
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2176 GATCGTGTCAATCCTCCTGATCATTATATAGATATTCTTGAAGGCATTGTGAAACCAGAT 2235
Query 2179 GGTGATATAACTATAGAACAACTTCCGGTGAGATGGATGTTGCACAATGGTTACCCTGTG 2238
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2236 GGTGATATAACTATAGAACAACTTCCTGTGAGATGGATGCTGCACAATGGTTACCCTGTG 2295
Query 2239 CCTCACGATATGTTGAAGTTTTGTGATGGACTTCCATCATCATCAACTGGATCAGCTCAA 2298
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||
Sbjct 2296 CCTCACGATATGTTGAAATTTTGTGATGGACTTCCTTCCTCGTCAACTGGATCAGCTCAA 2355
Query 2299 GAGGATTCCACTCATAATTCTTTTAGTAATGATCTATGGCAAGATGTGAAAACTAATGTG 2358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356 GAGGATTCCACTCATAATTCTTTTAGTAATGATCTATGGCAAGATGTGAAAACTAATGTG 2415
Query 2359 GAAATCACGAAAGATCAGTTACAACACAATTACTCAAATTCGCATGACAATTCTAATCGA 2418
|| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2416 GAGATTACAAAAGATCAGTTACAACACAATTACTCGAATTCTCATGACAATTCTAATCGA 2475
Query 2419 GTAACTCCTACCGTAGGTCGACAATATAGATATTTTGTTGGAAGGGTTGGAAAACAACGA 2478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2476 GTAACTCCTACCGTAGGTCGACAATATAGATATTTTGTTGGAAGGGTTGGAAAACAACGG 2535
Query 2479 CTTAGAGAAGCAAGACTACAAGCGTTAGATTTCCTAATATTATTAGTTGCAGGAGCTTGT 2538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2536 CTTAGAGAAGCAAGACTACAAGCGTTAGATTTCCTAATATTATTAGTTGCGGGAGCTTGT 2595
Query 2539 TTAGGAACTCTTGCCAAGGTGAACGACGAGACGATTGATACACTTGGCTACACATACACC 2598
|||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2596 TTAGGAACTCTTGCGAAGGTGAACGACGAGACAATCGATACACTTGGCTACACATACACC 2655
Query 2599 ATTATAGCCGTCTCTCTTTTGTGTAAGATCTCGGCGTTGAGATCGTTCTCTGTAGATAAA 2658
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2656 ATAATAGCTGTCTCTCTTTTGTGTAAGATCTCGGCATTGAGATCATTCTCTGTAGATAAA 2715
Query 2659 CTACAATATTGGAGAGAAAGTGCCGCTGGAATTAGCAGTTTGGCGCATTTTATGGCTAAA 2718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2716 TTACAATATTGGAGAGAAAGTGCCGCTGGAATTAGCAGTTTGGCACATTTTATGGCTAAA 2775
Query 2719 GATACAATGGACCATTTAAACACAATTATGAAACCTTTAGTGTACTTGTCCATGTTCTAC 2778
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2776 GACACAATGGACCATTTAAACACAATTATGAAACCTTTAGTGTACTTGTCCATGTTCTAC 2835
Query 2779 TTCTTCAACAACCCGAGATCTAGTTTCGAAGACAACTACATTGTACTAGTATGCTTGGTC 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2836 TTCTTCAACAACCCGAGATCTAGTTTCGAAGACAACTACATTGTACTAGTATGCTTGGTC 2895
Query 2839 TACTGCGTAACAGGCATGGCTTACATTTTTGCCATATTGTACAGTCCTAGCGCTGCCCAA 2898
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2896 TACTGTGTAACAGGCATGGCTTACATTTTTGCCATATTGTACAGTCCTAGCGCCGCACAA 2955
Query 2899 TTGTTATCGGTGTTAGTCCCCGTTGTTATGACTCTTATTGCGAATCAAGATAAAGAAAGC 2958
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2956 TTGTTGTCGGTGTTAGTCCCCGTTGTTATGACTCTTATCGCTAATCAAGATAAAGAAAGC 3015
Query 2959 ATGGTTCTTAAGTATCTCGGAAGCTTCTGCTACCCCAAATGGACTCTCGAAGCTTTTGTC 3018
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3016 ATGGTCCTTAAGTATCTCGGAAGCTTTTGCTACCCCAAATGGACTCTCGAAGCCTTTGTC 3075
Query 3019 CTTTCCAATGCTCAAAGGTACTCTGGAGTGTGGGTGGTGACTATATGCAGTTCATTGTCT 3078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3076 CTTTCCAATGCTCAAAGGTACTCTGGAGTGTGGGTGGTGACTAGATGCAGTTCATTGTCT 3135
Query 3079 CAAAACGGATATGATCTTAGTGATTGGATATTATGTCTCATTGTTCTCATTCTTATGGGA 3138
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 3136 CAAAACGGATATGATCTTAGTGATTGGATATTGTGTCTCATTGTTCTCGTTCTCATGGGA 3195
Query 3139 CTAATATGCCGATTCATAGCTTATTTCTGCATGGTTACATTCCAAAAGAAATAA 3192
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3196 CTAATATGCCGATTCATAGCTTATTTCTGCATGGTTACATTCCAGAAGAAATAA 3249
Score = 1229 bits (665), Expect = 0.0
Identities = 721/749 (96%), Gaps = 0/749 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGATTTAGGGTTGATGTTTGTTGGACACAACACATCTTGTTGTTCTTTGTATTTGCC 60
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
Sbjct 1 ATGAGAGTTAGGGTTGATGTTTGTTGGACACAACACATCTTCTTGTTCTTTGTTTTTGGC 60
Query 61 TTGAGTCTTATGGCATTGGCATTATGTCTGGATGGAGATGATTACAGTAAAACAGGGAAC 120
|||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 TTGAGTTTTATGTCATTTGCACTATCTCTGGATGGAGATGATTACAGCAAAACAGGGAAC 120
Query 121 CCAAAAGTTCTTATTTCGGTTACAAATCTTATATATACCCGACTTCAGAATCTAAAGAAT 180
||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 121 CCAAAAGCTCTTGTTTCGGTTACAAACCTTATCTATACTCGACTTCAGAATCTAAAGACT 180
Query 181 GTCTTAAAGGCTGACGTCGATCGAGATTTAGGATATTGCATCAAAAATTTGAAAGGTGAT 240
|| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 181 GTTTTAAAGGCTGACGTTGATCGAGATTTAGGTTATTGCATCAAGAATTTGAAGGGCGAT 240
Query 241 TGGAATGAAGCATTTAATTTTGATAAAAATCTGGACTTCTTAAGCAATTGTGTCAAGAAA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 TGGAATGAAGCATTTAATTTTGATAAAAATCTGGACTTCTTAAGCAATTGTGTCAAGAAA 300
Query 301 AATGATGGTGACCTCACAGTTAGACTATGTACAGCTGCGGAGATAAAGTTCTACTTTAGT 360
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AATGATGGTGACCTCACACTTAGACTATGTTCAGCTGCGGAGATAAAGTTCTACTTTAGT 360
Query 361 AGTTTTGTTAGAAGAGATGAAGCAACAACGGTTCATGTAAAGCCTAACATCAACTGCAAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGTTTTGTTAGAAGAGATGAAGCAACAACGGTTCATGTAAAGCCTAACATCAACTGCAAT 420
Query 421 TTAGCTAAATGGGTTTCCGGATGCGAGCCAGGATGGAGTTGCAATGCAGATGATGAAAAA 480
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTAGCTAAATGGGTTTCCGGATGTGAGCCTGGATGGAGTTGCAATGCAGATGATGAAAAA 480
Query 481 AGATTTGATCTCAACAATGGAAAAATTCTTCCATCTAGAACTCGTAAATGTCAACCTTGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGATTTGATCTCAACAATGGAAAAATTCTTCCATCTAGAACTCGTAAATGTCAACCTTGT 540
Query 541 TGTGAGGGTTTCTTTTGTCCACAAGGTCTTGCTTGCATGATACCGTGTCCATTAGGCGCA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 541 TGTGAGGGTTTCTTTTGTCCACAAGGTCTTGCTTGCATGATACCGTGTCCGTTAGGCGCA 600
Query 601 TATTGCCCGCTTGCCAAGCTTAATAAAACAACAGGATTTTGTGAGCCATATAATTACCAA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 601 TATTGCCCGCTTGCCAAGCTTAATAAAACAACAGGATTTTGTGAGCCATATAACTACCAA 660
Query 661 ATTCCTCCGGGAAAGTTGAATCATACATGTGGTTCTGCAGATAGTTGGGTTGATGCTGAG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATTCCTCCGGGAAAGTTGAATCATACATGTGGTTCTGCAGATAGTTGGGTTGATGCTGAG 720
Query 721 AGTAGTGGTGATATGTTTTGTTCACCAGG 749
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 AGTAGTGGTGATATGTTTTGTTCACCAGG 749
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 158778374595
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5