BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg482735 Length=3380 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT2G37420.1 | Symbols: | ATP binding microtubule motor family ... 5177 0.0 > AT2G37420.1 | Symbols: | ATP binding microtubule motor family protein | chr2:15700331-15705346 FORWARD LENGTH=3432 Length=3432 Score = 5177 bits (2803), Expect = 0.0 Identities = 3171/3350 (95%), Gaps = 20/3350 (1%) Strand=Plus/Plus Query 43 TCTCTTTCGATCTCGAAGATCCATCATCT-TTTCGTAAATCGAAGATGTCGTTTACGCCG 101 |||||||||||||| | ||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 88 TCTCTTTCGATCTCCAGGATTCGGC-TCTGTTTCCTAAATCGAAGATGTCGTTTACGCCA 146 Query 102 GAGGTTGTTTCAAGGAAAAGCGGAGTCGGAGTGTTTCCATCACCGGCACCGTTTCTGACA 161 ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || Sbjct 147 GAGGTGGTATCAAGGAAAAGTGGAGTAGGAGTGATTCCATCACCTGCACCGTTTCTAACT 206 Query 162 CCTCGTCTTGAGAGAAGACGACCTGATTCTTTCTCTAACCGTCTCGATAGAGATAATAAA 221 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 207 CCTCGTCTCGAGAGAAGACGACCTGATTCTTTCTCTAACCGTCTCGATAGAGATAATAAA 266 Query 222 GAAGTCAATGTTCAAGTGATTCTACGATGCAGACCATTAACTGAAGAAGAGCAGAAATCT 281 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 267 GAAGTCAATGTTCAAGTGATTCTACGATGCAAACCATTAAGTGAAGAAGAGCAGAAATCT 326 Query 282 AATGTTCCTAGAGTCATCTCTTGTAATGAAATGAGAAGAGAAGTCAATGTTCTTCATAGT 341 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 327 AGTGTTCCTAGAGTCATCTCTTGTAATGAAATGAGAAGAGAAGTCAATGTTCTTCATACT 386 Query 342 GTTGCTCATAAGCAAGTAGACCGTGTTTTCAATTTCGACAAGGTTTTTGGTCCTAAGTCA 401 ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 387 ATTGCTAATAAGCAAGTAGACCGTCTTTTCAATTTCGACAAGGTTTTTGGTCCTAAGTCA 446 Query 402 CAACAACGGTCTATATATGATCAAGCTATTTCACCTATTGTTCATGAAGTCTTGGAAGGT 461 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 447 CAACAACGGTCTATATATGATCAAGCTATTGCACCTATTGTTCATGAAGTCTTGGAAGGT 506 Query 462 TTTAGCTGTACTGTGTTTGCTTATGGACAAACAGGAACTGGGAAGACTTACACTATGGAA 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 507 TTTAGCTGTACTGTGTTTGCTTATGGACAAACAGGAACTGGGAAGACTTACACTATGGAA 566 Query 522 GGTGGAATGAGGAAAAAGGGAGGGGATTTACCTGCGGAGGCAGGGGTGATTCCAAGAGCT 581 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| Sbjct 567 GGTGGAATGAGGAAAAAGGGAGGGGATTTACCTGCGGAGGCTGGGGTGATTCCCAGAGCT 626 Query 582 GTTAGGCATATTTTCGATACTCTTGAGGCCCAAAATGCTGATTACAGTATGAAAGTAACA 641 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 627 GTTAGACATATTTTCGATACTCTTGAGGCGCAAAATGCTGATTACAGTATGAAAGTAACA 686 Query 642 TTCTTGGAGCTTTACAATGAAGAAGTTACGGATTTGTTAGCTCAAGATGATTCATCAAGA 701 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 687 TTCTTGGAGCTTTACAATGAGGAAGTTACGGATTTGTTAGCTCAAGATGATTCCTCAAGA 746 Query 702 TCTTCTGAGGATAAGCAGAAGAAGCCCATTTCTTTGATGGAGGATGGCAAGGGTTCTGTG 761 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 747 TCTTCTGAGGATAAGCAGAGGAAGCCCATTTCTTTGATGGAGGATGGGAAGGGTTCTGTG 806 Query 762 GTTTTAAGGGGTCTTGAAGAAGAAGTTGTGTACAGCGCTAATGATATATATGCTCTTCTT 821 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 807 GTTTTAAGAGGTCTTGAAGAAGAAGTTGTGTACAGTGCTAATGATATATATGCTCTTCTT 866 Query 822 GAACGAGGCTCATCCAAAAGGCGCACCGCAGATACGTTGTTGAATAAGAGAAGTAGTAGA 881 |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 867 GAACGAGGTTCATCTAAAAGGCGTACAGCTGATACTTTGTTGAATAAGAGAAGTAGTCGA 926 Query 882 TCTCATTCAGTGTTTACTATCACAGTTCACATAAAGGAAGAGTCTATGGGCGATGAAGAG 941 ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 927 TCTCATTCAGTGTTTACTATCACTGTCCATATAAAGGAAGAGTCTATGGGAGATGAAGAG 986 Query 942 CTAATCAAATGCGGCAAGCTTAACCTTGTGGATCTAGCAGGATCTGAGAATATCTTACGG 1001 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 987 TTAATCAAATGTGGGAAGCTTAACCTTGTGGATCTAGCAGGATCTGAGAATATCTTACGG 1046 Query 1002 TCAGGAGCTCGAGATGGCCGTGCAAGAGAAGCAGGAGAGATTAACAAGAGCTTGCTCACA 1061 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1047 TCAGGAGCTCGAGATGGCCGTGCACGAGAAGCAGGAGAGATTAACAAGAGTTTGCTTACA 1106 Query 1062 CTAGGCCGTGTGATCAATGCCCTTGTGGAACATTCTTCTCATGTACCTTACAGGGATAGT 1121 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1107 CTAGGCCGTGTGATTAATGCCCTTGTGGAACATTCTTCTCATGTACCTTACAGGGATAGT 1166 Query 1122 AAGCTGACAAGGCTTTTACGGGACTCTCTAGGAGGAAAGACAAAAACTTGTATCATTGCT 1181 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1167 AAGCTGACAAGGCTTTTACGGGACTCTCTAGGAGGAAAGACAAAAACTTGTATCATTGCT 1226 Query 1182 ACAATCTCTCCATCTGCTCATTCCCTAGAGGAAACTTTAAGTACCTTGGATTATGCCTAT 1241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1227 ACAATCTCTCCATCTGCTCATTCCCTAGAGGAAACTTTAAGTACTTTGGATTATGCCTAT 1286 Query 1242 CGTGCCAAGAACATCAAGAACAAACCTGAGGCAAACCAGAAACTATCCAAGGCTGTGCTG 1301 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 1287 CGTGCCAAGAACATCAAGAACAAACCTGAGGCAAACCAGAAGTTATCCAAGGCTGTGTTG 1346 Query 1302 CTTAAAGACCTTTACTTGGAACTTGAGAGAATGAAAGAAGATGTAAGAGCGGCAAGGGAT 1361 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1347 CTTAAAGATCTTTACTTGGAGCTTGAGAGAATGAAAGAAGATGTAAGAGCAGCAAGGGAT 1406 Query 1362 AAAAATGGTGTTTACATTGCACATGAAAGATATACACAAGAAGAAGCTGAAAAGAAGGCG 1421 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1407 AAGAATGGTGTTTACATTGCACATGAAAGATATACACAAGAAGAAGTTGAAAAGAAGGCG 1466 Query 1422 AGAATCGAGAAGATAGAACAGTTGGAAAATGAATTAAATCTCAGTGAAAGTGAAGTTTCA 1481 ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1467 AGAATTGAGAGGATAGAACAGTTGGAGAATGAACTAAATCTCAGTGAAAGTGAGGTTTCC 1526 Query 1482 AAGTTCTGTGACCTTTACGAGACTGAGAAAGAGAAGTTACTGGACGTAGAAAGTGACCTT 1541 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1527 AAGTTCTGTGACCTTTATGAGACTGAGAAAGAGAAGTTACTGGACGTTGAAAGTGACCTT 1586 Query 1542 AAGGACTGCAAGAGAAACCTGGATAATAGTAACAAGGAGTTGCTTGATCTCAAAGTGAAT 1601 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| Sbjct 1587 AAGGACTGCAAGAGAAACCTGCACAATAGTAACAAGGACTTGCTAGATCTCAAAGAGAAT 1646 Query 1602 TATATCCAAGTTACCTCAAAGTTAAAAGAAAGAG-AATTCATCATCTCAAGAATGAAAGC 1660 |||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| Sbjct 1647 TATATCCAAGTTGTTTCAAAGTTAAAGGAAA-AGGAAGTCATCGTCTCCAGAATGAAAGC 1705 Query 1661 CTCAGAGACTACTTTGATCGACCGCGCAAAGGGGTTAAGTTCTGATTTGCAGCATGCGTC 1720 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| Sbjct 1706 TTCAGAGACTTCTTTGATCGACCGTGCAAAGGGGTTACGTTGTGATCTGCAGCATGCGTC 1765 Query 1721 AAACGATATAAATTCGTTGTTCACAAGATTAGACCAAAAGGACAAGCTGGAATCTGAAAA 1780 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || Sbjct 1766 AAACGATATAAATTCGTTGTTCACAAGATTGGACCAAAAAGACAAGCTGGAATCCGATAA 1825 Query 1781 CCAGAGCATGCTTCTGAAGTTTGGTTCACAACTTGATCAAAACCTTAAAGATTTGCACAG 1840 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1826 CCAGAGCATGCTTCTGAAATTTGGATCACAACTTGATCAAAACCTTAAAGATTTGCACAG 1885 Query 1841 AACAGTTCTTGGATCAGTCTCTCAGCAACAGCAACAATTAAGAACTATGGAAGAACATAC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1886 AACAGTTCTTGGATCAGTCTCTCAGCAACAGCAACAATTAAGAACTATGGAAGAACATAC 1945 Query 1901 ACATTCATTTCTTGCTCATAAATATGATGCAACACGTGATCTGGAATCAAGGATTGGGAA 1960 || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1946 CCACTCATTTCTTGCTCACAAATATGATGCAACACGCGATCTGGAATCAAGAATTGGGAA 2005 Query 1961 AACAGCAGACACTTATACTTCAGGAATAGCAGCCTTGAAGGAGTTATCTGAAATGCTACA 2020 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2006 AACATCAGACACTTATACTTCAGGAATAGCAGCCTTGAAGGAGTTATCTGAAATGCTACA 2065 Query 2021 AAAGAACGCCTCCTCTGATCTGGAGAAGATGAACACTTCTATAGTATCACAAATAAAGGC 2080 |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2066 AAAGAAAGCCTCCTCTGATCTGGAGAAGAAGAACACTTCTATAGTATCACAAATAGAGGC 2125 Query 2081 TGTTGAGAAATTTCTCACTACATCAGCAACAGAGGCTTCTGCAGTCGCTCAGGACATCCA 2140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2126 TGTTGAGAAATTTCTCACTACATCAGCAACAGAGGCTTCTGCAGTCGCTCAGGACATCCA 2185 Query 2141 CAATTCACTTAACGAACAGAAGAAGCTCTTAGCAGTTGCTGCAAGACAACAAGAGCAGGG 2200 ||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2186 CAATTTACTTAATGATCAGAAGAAGCTCTTAGCACTTGCTGCAAGACAACAAGAGCAGGG 2245 Query 2201 CTTGGTCAGAAGCATGCGATCTGCACAAGAAATATCGAACGCGACTTCAACCATGTTT-A 2259 |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||| | Sbjct 2246 CTTGGTCAGAAGCATGAGATCTGCACAAGAAATTTCCAATTCAACTTCAACCAT-TTTCA 2304 Query 2260 GTAACATCTACAACCAAGCTCACGGTGTGGTGGAAGCCATTAGAGGTAGCCAAGCAGAGA 2319 ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2305 GTAACATCTACAACCAAGCCCATGACGTGGTGGAAGCCATTAGAGCAAGCCAAGCAGAGA 2364 Query 2320 AATCAAGACAGCTTGATGCTTTTGAAATGAAGTTTAAGGAAGAGGCTGAAAGAGAGGAGA 2379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2365 AATCAAGACAGCTTGATGCTTTTGAAATGAAGTTTAAGGAAGAGGCTGAAAGAGAGGAGA 2424 Query 2380 AGCAAGCCTTAAATGATATCAGTCTGATATTATCAAAGTTAACTTCAAAGAAAACTGCAA 2439 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2425 AACAAGCCTTAAATGATATCAGTCTGATATTATCAAAGTTAACTTCAAAGAAAACTGCAA 2484 Query 2440 TGATCTCTGATGCATCAAGCAATATCCGTGAAAACGATAGACAGGAAGAGAAGAGATTGT 2499 |||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||| Sbjct 2485 TGATTTCTGATGCATCAAGCAATATCCGGGAACATGACATACAGGAAGAGAAGAGATTGT 2544 Query 2500 ATGAACAAATGTCTGGTATGCAGCAAGTCTCGATTGGCGCAAAGGAGGAATTGTGTGACT 2559 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 2545 ATGAACAAATGTCTGGTATGCAGCAAGTCTCGATTGGTGCAAAGGAAGAATTGTGTGACT 2604 Query 2560 ATCTAAAGAAAGCGAAAACGCACTTCACGGAAAACACTATAGCTTCAGCTGAGTCTATCA 2619 |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2605 ATCTAAAGAAAGAGAAAACTCACTTCACGGAAAACACAATAGCTTCAGCTGAGTCTATCA 2664 Query 2620 CAGTCATGGACAGTTACCTTGAAGATTGCTTGGGAAGGGCCAATGATTCTAAAA-AGTTG 2678 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 2665 CAGTCATGGATAGTTACCTTGAAGATTGCTTGGGAAGGGCCAATGATTCTAAAACA-TTG 2723 Query 2679 TGGGAGACCACTGAAACAGGCATAAAGAACCTTAACACGAAGTATCAACAAGAACTTAAT 2738 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2724 TGGGAGACCACTGAAACAGGCATAAAGAACCTTAACACGAAGTATCAACAAGAACTTAAT 2783 Query 2739 GTCACAATGGAGGACATGGCAAAAGAAAATGAGAAGGTGCAAGATGAATTTGCATCCACA 2798 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2784 GTCACAATGGAGGACATGGCAAAAGAAAATGAGAAGGTGCAAGATGAATTTACATCCACA 2843 Query 2799 TTTTCCTCAATGGATGCTAAATTTGTCTCTAGGACTAATGAACTTCACGCAGCTGTTAAT 2858 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2844 TTTTCCTCAATGGATGCTAACTTTGTCTCTAGGACAAATGAACTTCACGCAGCTGTTAAT 2903 Query 2859 GACTCGTTGATGCAAGACCGGGAGAACAAAGAAACAACGGAGGCTATAGTAGAGACTTGC 2918 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2904 GACTCATTGATGCAAGACCGTGAGAACAAAGAAACAACAGAGGCTATAGTAGAGACTTGC 2963 Query 2919 ATGAACCAGGTCACATTATTGCAAGAGAATCATGGACAAGCGGTATCAAACATTAGAAAC 2978 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 2964 ATGAACCAGGTCACATTATTGCAGGAGAATCATGGACAAGCTGTTTCAAACATTAGAAAC 3023 Query 2979 AAAGCAGAACAGTCTCTCATAAAAGACTATCAGGTTGATCAGCACAAGAACGAAACACCA 3038 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3024 AAAGCAGAACAGTCTCTCATAAAAGACTATCAGGTTGATCAGCACAAGAACGAAACACCA 3083 Query 3039 AAGAAACAATCCATAAATGTGCCAAGTCTGGCTTCGATTGAGGAAATGAGGACTTTGTTT 3098 |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3084 AAGAAACAATCCATAAATGTGCCAAGCCTGGATTCGATTGAGGAGATGAGGACTTTGTTT 3143 Query 3099 TCGCAGAATACACTCAGCGAAGATCACACAAGTAATTTGGAGAAAAGATCAATAAAAGAA 3158 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||| || Sbjct 3144 TCGCAGAATACTCTCAGCGAAGAACACACAAGT--TT-GGAGAAAATATCAACAAAACAA 3200 Query 3159 GGACTTGACGAAGCAAACAACAGAACTCCATTCTTGGAAGTAAACAAATGAGTaaaaaa- 3217 ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3201 GGACTTGGCGAAGCTAACAACAGAACTCCATTCTTGGAAGTAAACAAATGAGTAAAAAAG 3260 Query 3218 aa-GCTTATGTTCATCAACTGGATGAGTTTAGAAGATGAAGACTGTGTAAAGGTTGTTAT 3276 || |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3261 AAAGCTTATGTTCATCAGCTGGATGAGTGTAGAAGATTAAGACTGTGTAAAGGTTGTTAT 3320 Query 3277 GTAGTA---CGCAAGTTTATGTTGTCATGGATAA-TCTGGTTACGTTTTGACATTAAACC 3332 |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3321 GTAGTAGTACGCAAGCTTATGTTGTCATGGATAAATCTGGTTATATTTTGACATTAAACC 3380 Query 3333 GGTATGCAGATTGCTGAG-TTCTCAGATTT-AGGGATGACGTTTCCGGTT 3380 ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 3381 GGTATGCAGATTGCTGAAATTTT-AGATTTTATGGATGACGTTTCCGGTT 3429 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 168209759879 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5