BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482735
Length=3380
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G37420.1 | Symbols: | ATP binding microtubule motor family ... 5177 0.0
> AT2G37420.1 | Symbols: | ATP binding microtubule motor family
protein | chr2:15700331-15705346 FORWARD LENGTH=3432
Length=3432
Score = 5177 bits (2803), Expect = 0.0
Identities = 3171/3350 (95%), Gaps = 20/3350 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 43 TCTCTTTCGATCTCGAAGATCCATCATCT-TTTCGTAAATCGAAGATGTCGTTTACGCCG 101
|||||||||||||| | ||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 TCTCTTTCGATCTCCAGGATTCGGC-TCTGTTTCCTAAATCGAAGATGTCGTTTACGCCA 146
Query 102 GAGGTTGTTTCAAGGAAAAGCGGAGTCGGAGTGTTTCCATCACCGGCACCGTTTCTGACA 161
||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 147 GAGGTGGTATCAAGGAAAAGTGGAGTAGGAGTGATTCCATCACCTGCACCGTTTCTAACT 206
Query 162 CCTCGTCTTGAGAGAAGACGACCTGATTCTTTCTCTAACCGTCTCGATAGAGATAATAAA 221
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 CCTCGTCTCGAGAGAAGACGACCTGATTCTTTCTCTAACCGTCTCGATAGAGATAATAAA 266
Query 222 GAAGTCAATGTTCAAGTGATTCTACGATGCAGACCATTAACTGAAGAAGAGCAGAAATCT 281
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 267 GAAGTCAATGTTCAAGTGATTCTACGATGCAAACCATTAAGTGAAGAAGAGCAGAAATCT 326
Query 282 AATGTTCCTAGAGTCATCTCTTGTAATGAAATGAGAAGAGAAGTCAATGTTCTTCATAGT 341
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 327 AGTGTTCCTAGAGTCATCTCTTGTAATGAAATGAGAAGAGAAGTCAATGTTCTTCATACT 386
Query 342 GTTGCTCATAAGCAAGTAGACCGTGTTTTCAATTTCGACAAGGTTTTTGGTCCTAAGTCA 401
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387 ATTGCTAATAAGCAAGTAGACCGTCTTTTCAATTTCGACAAGGTTTTTGGTCCTAAGTCA 446
Query 402 CAACAACGGTCTATATATGATCAAGCTATTTCACCTATTGTTCATGAAGTCTTGGAAGGT 461
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 CAACAACGGTCTATATATGATCAAGCTATTGCACCTATTGTTCATGAAGTCTTGGAAGGT 506
Query 462 TTTAGCTGTACTGTGTTTGCTTATGGACAAACAGGAACTGGGAAGACTTACACTATGGAA 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 TTTAGCTGTACTGTGTTTGCTTATGGACAAACAGGAACTGGGAAGACTTACACTATGGAA 566
Query 522 GGTGGAATGAGGAAAAAGGGAGGGGATTTACCTGCGGAGGCAGGGGTGATTCCAAGAGCT 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 567 GGTGGAATGAGGAAAAAGGGAGGGGATTTACCTGCGGAGGCTGGGGTGATTCCCAGAGCT 626
Query 582 GTTAGGCATATTTTCGATACTCTTGAGGCCCAAAATGCTGATTACAGTATGAAAGTAACA 641
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GTTAGACATATTTTCGATACTCTTGAGGCGCAAAATGCTGATTACAGTATGAAAGTAACA 686
Query 642 TTCTTGGAGCTTTACAATGAAGAAGTTACGGATTTGTTAGCTCAAGATGATTCATCAAGA 701
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 687 TTCTTGGAGCTTTACAATGAGGAAGTTACGGATTTGTTAGCTCAAGATGATTCCTCAAGA 746
Query 702 TCTTCTGAGGATAAGCAGAAGAAGCCCATTTCTTTGATGGAGGATGGCAAGGGTTCTGTG 761
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 747 TCTTCTGAGGATAAGCAGAGGAAGCCCATTTCTTTGATGGAGGATGGGAAGGGTTCTGTG 806
Query 762 GTTTTAAGGGGTCTTGAAGAAGAAGTTGTGTACAGCGCTAATGATATATATGCTCTTCTT 821
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 GTTTTAAGAGGTCTTGAAGAAGAAGTTGTGTACAGTGCTAATGATATATATGCTCTTCTT 866
Query 822 GAACGAGGCTCATCCAAAAGGCGCACCGCAGATACGTTGTTGAATAAGAGAAGTAGTAGA 881
|||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 867 GAACGAGGTTCATCTAAAAGGCGTACAGCTGATACTTTGTTGAATAAGAGAAGTAGTCGA 926
Query 882 TCTCATTCAGTGTTTACTATCACAGTTCACATAAAGGAAGAGTCTATGGGCGATGAAGAG 941
||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 927 TCTCATTCAGTGTTTACTATCACTGTCCATATAAAGGAAGAGTCTATGGGAGATGAAGAG 986
Query 942 CTAATCAAATGCGGCAAGCTTAACCTTGTGGATCTAGCAGGATCTGAGAATATCTTACGG 1001
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 987 TTAATCAAATGTGGGAAGCTTAACCTTGTGGATCTAGCAGGATCTGAGAATATCTTACGG 1046
Query 1002 TCAGGAGCTCGAGATGGCCGTGCAAGAGAAGCAGGAGAGATTAACAAGAGCTTGCTCACA 1061
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1047 TCAGGAGCTCGAGATGGCCGTGCACGAGAAGCAGGAGAGATTAACAAGAGTTTGCTTACA 1106
Query 1062 CTAGGCCGTGTGATCAATGCCCTTGTGGAACATTCTTCTCATGTACCTTACAGGGATAGT 1121
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 CTAGGCCGTGTGATTAATGCCCTTGTGGAACATTCTTCTCATGTACCTTACAGGGATAGT 1166
Query 1122 AAGCTGACAAGGCTTTTACGGGACTCTCTAGGAGGAAAGACAAAAACTTGTATCATTGCT 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167 AAGCTGACAAGGCTTTTACGGGACTCTCTAGGAGGAAAGACAAAAACTTGTATCATTGCT 1226
Query 1182 ACAATCTCTCCATCTGCTCATTCCCTAGAGGAAACTTTAAGTACCTTGGATTATGCCTAT 1241
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1227 ACAATCTCTCCATCTGCTCATTCCCTAGAGGAAACTTTAAGTACTTTGGATTATGCCTAT 1286
Query 1242 CGTGCCAAGAACATCAAGAACAAACCTGAGGCAAACCAGAAACTATCCAAGGCTGTGCTG 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1287 CGTGCCAAGAACATCAAGAACAAACCTGAGGCAAACCAGAAGTTATCCAAGGCTGTGTTG 1346
Query 1302 CTTAAAGACCTTTACTTGGAACTTGAGAGAATGAAAGAAGATGTAAGAGCGGCAAGGGAT 1361
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1347 CTTAAAGATCTTTACTTGGAGCTTGAGAGAATGAAAGAAGATGTAAGAGCAGCAAGGGAT 1406
Query 1362 AAAAATGGTGTTTACATTGCACATGAAAGATATACACAAGAAGAAGCTGAAAAGAAGGCG 1421
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1407 AAGAATGGTGTTTACATTGCACATGAAAGATATACACAAGAAGAAGTTGAAAAGAAGGCG 1466
Query 1422 AGAATCGAGAAGATAGAACAGTTGGAAAATGAATTAAATCTCAGTGAAAGTGAAGTTTCA 1481
||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1467 AGAATTGAGAGGATAGAACAGTTGGAGAATGAACTAAATCTCAGTGAAAGTGAGGTTTCC 1526
Query 1482 AAGTTCTGTGACCTTTACGAGACTGAGAAAGAGAAGTTACTGGACGTAGAAAGTGACCTT 1541
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1527 AAGTTCTGTGACCTTTATGAGACTGAGAAAGAGAAGTTACTGGACGTTGAAAGTGACCTT 1586
Query 1542 AAGGACTGCAAGAGAAACCTGGATAATAGTAACAAGGAGTTGCTTGATCTCAAAGTGAAT 1601
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1587 AAGGACTGCAAGAGAAACCTGCACAATAGTAACAAGGACTTGCTAGATCTCAAAGAGAAT 1646
Query 1602 TATATCCAAGTTACCTCAAAGTTAAAAGAAAGAG-AATTCATCATCTCAAGAATGAAAGC 1660
|||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1647 TATATCCAAGTTGTTTCAAAGTTAAAGGAAA-AGGAAGTCATCGTCTCCAGAATGAAAGC 1705
Query 1661 CTCAGAGACTACTTTGATCGACCGCGCAAAGGGGTTAAGTTCTGATTTGCAGCATGCGTC 1720
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||
Sbjct 1706 TTCAGAGACTTCTTTGATCGACCGTGCAAAGGGGTTACGTTGTGATCTGCAGCATGCGTC 1765
Query 1721 AAACGATATAAATTCGTTGTTCACAAGATTAGACCAAAAGGACAAGCTGGAATCTGAAAA 1780
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 1766 AAACGATATAAATTCGTTGTTCACAAGATTGGACCAAAAAGACAAGCTGGAATCCGATAA 1825
Query 1781 CCAGAGCATGCTTCTGAAGTTTGGTTCACAACTTGATCAAAACCTTAAAGATTTGCACAG 1840
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826 CCAGAGCATGCTTCTGAAATTTGGATCACAACTTGATCAAAACCTTAAAGATTTGCACAG 1885
Query 1841 AACAGTTCTTGGATCAGTCTCTCAGCAACAGCAACAATTAAGAACTATGGAAGAACATAC 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 AACAGTTCTTGGATCAGTCTCTCAGCAACAGCAACAATTAAGAACTATGGAAGAACATAC 1945
Query 1901 ACATTCATTTCTTGCTCATAAATATGATGCAACACGTGATCTGGAATCAAGGATTGGGAA 1960
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1946 CCACTCATTTCTTGCTCACAAATATGATGCAACACGCGATCTGGAATCAAGAATTGGGAA 2005
Query 1961 AACAGCAGACACTTATACTTCAGGAATAGCAGCCTTGAAGGAGTTATCTGAAATGCTACA 2020
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 AACATCAGACACTTATACTTCAGGAATAGCAGCCTTGAAGGAGTTATCTGAAATGCTACA 2065
Query 2021 AAAGAACGCCTCCTCTGATCTGGAGAAGATGAACACTTCTATAGTATCACAAATAAAGGC 2080
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2066 AAAGAAAGCCTCCTCTGATCTGGAGAAGAAGAACACTTCTATAGTATCACAAATAGAGGC 2125
Query 2081 TGTTGAGAAATTTCTCACTACATCAGCAACAGAGGCTTCTGCAGTCGCTCAGGACATCCA 2140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126 TGTTGAGAAATTTCTCACTACATCAGCAACAGAGGCTTCTGCAGTCGCTCAGGACATCCA 2185
Query 2141 CAATTCACTTAACGAACAGAAGAAGCTCTTAGCAGTTGCTGCAAGACAACAAGAGCAGGG 2200
||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 CAATTTACTTAATGATCAGAAGAAGCTCTTAGCACTTGCTGCAAGACAACAAGAGCAGGG 2245
Query 2201 CTTGGTCAGAAGCATGCGATCTGCACAAGAAATATCGAACGCGACTTCAACCATGTTT-A 2259
|||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||| |
Sbjct 2246 CTTGGTCAGAAGCATGAGATCTGCACAAGAAATTTCCAATTCAACTTCAACCAT-TTTCA 2304
Query 2260 GTAACATCTACAACCAAGCTCACGGTGTGGTGGAAGCCATTAGAGGTAGCCAAGCAGAGA 2319
||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2305 GTAACATCTACAACCAAGCCCATGACGTGGTGGAAGCCATTAGAGCAAGCCAAGCAGAGA 2364
Query 2320 AATCAAGACAGCTTGATGCTTTTGAAATGAAGTTTAAGGAAGAGGCTGAAAGAGAGGAGA 2379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 AATCAAGACAGCTTGATGCTTTTGAAATGAAGTTTAAGGAAGAGGCTGAAAGAGAGGAGA 2424
Query 2380 AGCAAGCCTTAAATGATATCAGTCTGATATTATCAAAGTTAACTTCAAAGAAAACTGCAA 2439
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2425 AACAAGCCTTAAATGATATCAGTCTGATATTATCAAAGTTAACTTCAAAGAAAACTGCAA 2484
Query 2440 TGATCTCTGATGCATCAAGCAATATCCGTGAAAACGATAGACAGGAAGAGAAGAGATTGT 2499
|||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2485 TGATTTCTGATGCATCAAGCAATATCCGGGAACATGACATACAGGAAGAGAAGAGATTGT 2544
Query 2500 ATGAACAAATGTCTGGTATGCAGCAAGTCTCGATTGGCGCAAAGGAGGAATTGTGTGACT 2559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2545 ATGAACAAATGTCTGGTATGCAGCAAGTCTCGATTGGTGCAAAGGAAGAATTGTGTGACT 2604
Query 2560 ATCTAAAGAAAGCGAAAACGCACTTCACGGAAAACACTATAGCTTCAGCTGAGTCTATCA 2619
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2605 ATCTAAAGAAAGAGAAAACTCACTTCACGGAAAACACAATAGCTTCAGCTGAGTCTATCA 2664
Query 2620 CAGTCATGGACAGTTACCTTGAAGATTGCTTGGGAAGGGCCAATGATTCTAAAA-AGTTG 2678
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 2665 CAGTCATGGATAGTTACCTTGAAGATTGCTTGGGAAGGGCCAATGATTCTAAAACA-TTG 2723
Query 2679 TGGGAGACCACTGAAACAGGCATAAAGAACCTTAACACGAAGTATCAACAAGAACTTAAT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 TGGGAGACCACTGAAACAGGCATAAAGAACCTTAACACGAAGTATCAACAAGAACTTAAT 2783
Query 2739 GTCACAATGGAGGACATGGCAAAAGAAAATGAGAAGGTGCAAGATGAATTTGCATCCACA 2798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2784 GTCACAATGGAGGACATGGCAAAAGAAAATGAGAAGGTGCAAGATGAATTTACATCCACA 2843
Query 2799 TTTTCCTCAATGGATGCTAAATTTGTCTCTAGGACTAATGAACTTCACGCAGCTGTTAAT 2858
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2844 TTTTCCTCAATGGATGCTAACTTTGTCTCTAGGACAAATGAACTTCACGCAGCTGTTAAT 2903
Query 2859 GACTCGTTGATGCAAGACCGGGAGAACAAAGAAACAACGGAGGCTATAGTAGAGACTTGC 2918
||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2904 GACTCATTGATGCAAGACCGTGAGAACAAAGAAACAACAGAGGCTATAGTAGAGACTTGC 2963
Query 2919 ATGAACCAGGTCACATTATTGCAAGAGAATCATGGACAAGCGGTATCAAACATTAGAAAC 2978
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2964 ATGAACCAGGTCACATTATTGCAGGAGAATCATGGACAAGCTGTTTCAAACATTAGAAAC 3023
Query 2979 AAAGCAGAACAGTCTCTCATAAAAGACTATCAGGTTGATCAGCACAAGAACGAAACACCA 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024 AAAGCAGAACAGTCTCTCATAAAAGACTATCAGGTTGATCAGCACAAGAACGAAACACCA 3083
Query 3039 AAGAAACAATCCATAAATGTGCCAAGTCTGGCTTCGATTGAGGAAATGAGGACTTTGTTT 3098
|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3084 AAGAAACAATCCATAAATGTGCCAAGCCTGGATTCGATTGAGGAGATGAGGACTTTGTTT 3143
Query 3099 TCGCAGAATACACTCAGCGAAGATCACACAAGTAATTTGGAGAAAAGATCAATAAAAGAA 3158
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||
Sbjct 3144 TCGCAGAATACTCTCAGCGAAGAACACACAAGT--TT-GGAGAAAATATCAACAAAACAA 3200
Query 3159 GGACTTGACGAAGCAAACAACAGAACTCCATTCTTGGAAGTAAACAAATGAGTaaaaaa- 3217
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3201 GGACTTGGCGAAGCTAACAACAGAACTCCATTCTTGGAAGTAAACAAATGAGTAAAAAAG 3260
Query 3218 aa-GCTTATGTTCATCAACTGGATGAGTTTAGAAGATGAAGACTGTGTAAAGGTTGTTAT 3276
|| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3261 AAAGCTTATGTTCATCAGCTGGATGAGTGTAGAAGATTAAGACTGTGTAAAGGTTGTTAT 3320
Query 3277 GTAGTA---CGCAAGTTTATGTTGTCATGGATAA-TCTGGTTACGTTTTGACATTAAACC 3332
|||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3321 GTAGTAGTACGCAAGCTTATGTTGTCATGGATAAATCTGGTTATATTTTGACATTAAACC 3380
Query 3333 GGTATGCAGATTGCTGAG-TTCTCAGATTT-AGGGATGACGTTTCCGGTT 3380
||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 3381 GGTATGCAGATTGCTGAAATTTT-AGATTTTATGGATGACGTTTCCGGTT 3429
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 168209759879
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5