BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482889
Length=4789
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G38770.1 | Symbols: EMB2765 | P-loop containing nucleoside t... 7971 0.0
> AT2G38770.1 | Symbols: EMB2765 | P-loop containing nucleoside
triphosphate hydrolases superfamily protein | chr2:16202963-16210338
REVERSE LENGTH=4837
Length=4837
Score = 7971 bits (4316), Expect = 0.0
Identities = 4641/4796 (97%), Gaps = 30/4796 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACTTCTCTCTGAACAAGAAGCTTTCGCGTGAGAGAAATGACGAAGGTCTATGGAACCGGT 60
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 51 ACTTCTCTCTGAGCAAGAAGCTTTCGCGTGAGAG-AATGACGAAGGTCTATGGAACTGGC 109
Query 61 ACGTACGACTTCAAACGCCACAGAGTGGCGGAGTATCCATTGGAGTTACCTAGCCATCCT 120
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 110 ACGTACGACTTCAAGCGCCACAGAGTGGCGGAGTATCCATTGGAGTTACCTAGCCATCCT 169
Query 121 GCTGAGAAGCCACTAGAAG-CAAAGCCTGGATCCAATTTACCGAGCTCCATCACTTTATC 179
||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 170 GCTGAGAAGCCTCTAG-AGTCAAAGCCTGGATCTAATTTGCCGAGCTCCATCACTTTATC 228
Query 180 GGAGATTCAGCAAGATAGGTTAACGAAAATCGCTGAGGAGAGCTGGATTAAGACTGGAGG 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 229 GGAGATTCAGCAAGATAGGTTAACGAAAATCGCTGAGGAGAGCTGGATTAAGACTGGAGG 288
Query 240 CAAGCTACCGGAGAAACCTTTCGATCCGGAGGTTGTGAAGGAGATTTATGTGACGGAGCT 299
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 TAAGCTCCCTGAGAAACCGTTCGATCCGGAGGTTGTGAAGGAGATTTATGTGACGGAGCT 348
Query 300 TAAGGTAACTAGTGGTCGTAAACCGGTTCCACTTCAGCGAGTTATGATTTTGGAAGTGAG 359
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 349 TAAGGTAACTAGTGGTCGTAAACCTGTTCCACTTCAGCGAGTTATGATTCTGGAAGTGAG 408
Query 360 TCAGTATTTGGAGAACTATCTATGGCCGAATTTTGACCCTGAGACGGCTACGTTTGAGCA 419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 409 TCAGTATTTGGAGAACTATCTATGGCCGAATTTTGATCCTGAGACTGCTACGTTCGAGCA 468
Query 420 TGTCATGTCTATGATTCTTATGATTAACGAGAAGTTCCGGGAGAATGTGGCAGCTTGGAT 479
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 TGTTATGTCTATGATTCTTATGATTAACGAGAAGTTCCGGGAGAATGTGGCAGCTTGGAT 528
Query 480 TTGCTTTCATGATCGGGACGATCTATTCAAAAAGTTTCTTCAGAAGGTTCTTCGCCTTAA 539
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 529 TTGCTTTCATGATCGGGATGATCTATTCAAAAAGTTTCTACAGAAGGTTCTTCGCCTTAA 588
Query 540 AGAGGGAAGAGACTTGACTATTGCTGAGAAGACAAATTATTTGGTCTTCATGATTAATGC 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 AGAGGGAAGAGACTTGACTATTGCTGAGAAGACAAACTATTTGGTCTTCATGATTAATGC 648
Query 600 TTTCCAGAGTTTGGAAGACGCGGTGGTTAATGAGATTGTTCTAAGTCTAGCAGGATTACA 659
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 649 TTTCCAGAGTTTGGAAGACGCAGTGGTTAATGAGATTGTTCTAAGTCTAGCAGGATTACA 708
Query 660 ATCTTGGCACAGCTTGTCTTATGGACGTTTCCAGATGGAGCTCTGCCTTCAACCTGATCT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 709 ATCTTGGCACAGCTTGTCTTATGGACGTTTCCAGATGGAGCTCTGCCTTCAACCTGATCT 768
Query 720 AATaaaaaaaTGGAAGAGGTCATCAAAGAAATGGGCAGCTGAGGCGAAGTCAAAGGGAGA 779
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 769 AATTAAAAAGTGGAAGAGGTCATCAAAGAAATGGGCAGCTGAGGCAAAGTCAAAGGGAGA 828
Query 780 GAAATTTGATCTATCCTCATCACCTGAAGCAAATTTTGTTCGAGGCATAATAGAAGAATT 839
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 829 GAAATTTGATTTATCCTCATCCCCTGAAGCAAATTTTGTTCGAGGCCTAATAGAAGAATT 888
Query 840 CGTCGAGGTGCTTGATCATGGGGTTTTTGCGGATGAGGTTGATGATACTGCTGGGTCTCA 899
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 889 CGTTGAGGTGCTTGATCATGGGGTTTTTGCGGATGAGGTTGATGATACTGCTGGATCTCA 948
Query 900 ATTGGTCGATGATTCTTCTGTCTTATATTGTGAAAGATTCATGGAATTTCTCATTGACAT 959
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 949 ATTGGTCGATGATTCTTCTGTCTTATATTGTGAGAGATTCATGGAATTTCTTATTGACAT 1008
Query 960 GCTGAACCAACTTCCAACCAGAAGATACCTAAGACCTCTTGTGGCGGATATAGCTGTTGT 1019
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1009 GCTGAACCAACTTCCAACAAGAAGATACCTAAGACCTCTTGTGGCGGATATAGCAGTTGT 1068
Query 1020 TGCCAAATGTCGACTGAGTGCCCTATACAAACATGAAAAGGGGAAGCTTTTCGCCCAACT 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 TGCCAAATGTCGACTGAGTGCCCTATACAAACATGAAAAAGGGAAGCTTTTCGCCCAACT 1128
Query 1080 AGTTGACTTGTTACAGTTCTACGAAAAGTTTGAGATAAAGGATCATGATGGAACACAATT 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 AGTTGACTTGTTACAGTTCTACGAAAAGTTTGAGATAAAGGATCATGATGGAACACAATT 1188
Query 1140 AACTGATGATGAAGCACTTCAATTTCATTATGATCGTTTTATGGCGTTTCAGCTACTTGC 1199
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 AACTGATGATGAAGCACTTCAATTTCATTACGATCGTTTTATGGCGTTTCAGCTACTTGC 1248
Query 1200 CTTTAAGAAAATACCTAAGTTGCAAGATCTGTCTTTGGCTAACATTGGTTCGGTTCACAA 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1249 CTTTAAGAAAATACCTAAGTTGCAAGATCTGTCTTTGGCTAACATTGGTTCGATTCACAA 1308
Query 1260 GAGTTCTGATCTTCGGAGGAGATTGTCGGTGCTTTCTCTTGAAGATTTAAGGGATGTTGT 1319
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GAGTTCTGATCTTCGGAGGAGATTGTCTGTGCTTTCTCTTGAAGATTTAAGGGATGTTGT 1368
Query 1320 CTGCTCAAAGCTCAAACTGGTTTCAAGACATGATCCTTGGGCAGATAGTAAGGATTTTCT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1369 CTGCTCAAAGCTCAAACTGGTTTCAAGACATGATCCTTGGGCAGATAGTAAAGATTTTCT 1428
Query 1380 GACTGAAGTCGTTGTCTCCTCTTTTGAGAAGCAACAGTCTCAGAAAGAAGCAATAAACGC 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429 GACTGAAGTCGTTGTCTCCTCTTTTGAGAAGCAACAGTCTCAGAAAGAAGCAATAAACGC 1488
Query 1440 CCTGCCTTTGTACCCAAATGAGCAAATCATGTGGGACGAAAGTGTTATTCCAAGCATTAA 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489 TCTGCCTTTGTACCCAAATGAGCAAATCATGTGGGACGAAAGTGTTATTCCAAGCATTAA 1548
Query 1500 TTATTCTGGGGAAGGTTGCCTTGCTCTTCCAAAGCTTAATCTTCAGTTTCTAACACTCCA 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 TTATTCTGGGGAAGGTTGCCTTGCTCTTCCAAAGCTTAATCTTCAGTTTCTAACACTCCA 1608
Query 1560 TGATTATCTCCTTAGAAACTTCAACCTCTTCCGTCTAGAATCCACCTATGAGATTCGGGA 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1609 TGATTATCTCCTTAGAAACTTCAACCTCTTCCGTCTAGAATCCACCTATGAGATTCGTGA 1668
Query 1620 AGATATACAAGAAGCTGTACCACATCTTCTTGCACATATAAATAATGAGGGAGACACTGC 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1669 AGATATACAAGAAGCTGTACCACATCTTCTTGCACATATAAATAACGAGGGAGACACTGC 1728
Query 1680 TTTTCGTGGTTGGTCACGAATGGCGGTTCCTATTAATGATTTCAAAATCGCCCAGGTGAA 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1729 TTTTCGTGGTTGGTCACGAATGGCGGTTCCTATTAATGATTTCAAAATCGCTCAGGTGAA 1788
Query 1740 ACAGCCTAATATTGGAGAAGAGAAGCCTTCATCTGTGACTGCAGAAGTTACTTTCAGTAT 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1789 ACAGCCTAATATTGGAGAAGAGAAGCCTTCATCTGTGACAGCAGAAGTTACTTTCAGTAT 1848
Query 1800 TAAAAGTTACAGAACGCAGATAAGATCTGAATGGAATTCCCTTAAAGAGCATGACGTATT 1859
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1849 CAAGAGTTACAGAACGCAGATAAGATCTGAATGGAATTCCCTTAAAGAGCATGACGTGTT 1908
Query 1860 GTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCCATTAGGTCCTGATGAAGCTGATAAAGC 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1909 GTTTTTGCTTTGTATACGCCCTTCATTTGAGCCATTAGGTCCTGAGGAAGCTGATAAAGC 1968
Query 1920 TACAGTACCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATCCG 1979
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 TACAGTTCCACAGAGGCTCGGGCTTCAGTATGTTCGTGGTTGTGAAATCATCGATATCCG 2028
Query 1980 CGATGAGGAGGGTAATCTGATGAATGATTTTACTGGAAGAGTTAAACGGGATGAATGGAA 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 CGATGAGGAGGGTAATCTGATGAATGATTTTACTGGAAGAGTTAAACGGGATGAATGGAA 2088
Query 2040 GCCCCCAAAAGGTGAAATGAGGACTGTGACTGTTGCTTTAGATGCTGCACAGTATCATAT 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 GCCCCCAAAAGGTGAAATGAGGACTGTGACTGTCGCTTTAGATGCTGCACAGTATCATAT 2148
Query 2100 AGATGTTACAGACATGGCTGAAAAAGGTGCTGAGGATGTGTATGGCACATTTAATGTGCT 2159
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 AGATGTTACAGACATCGCTGAAAAAGGTGCTGAGGATGTGTATGGCACATTTAATGTGCT 2208
Query 2160 AATGAGGAGGAAACCAAAGGAGAACAACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCT 2219
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 AATGAGGAGGAAACCAAAAGAGAACAACTTCAAGGCTATTCTGGAATCTATCAGAGATCT 2268
Query 2220 TATGAATGAATATTGCATTGTGCCGGAGTGGCTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAA 2279
|||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 TATGAACGAATATTGTATTGTGCCGGAGTGGTTGCATAATGTTTTTCTTGGGTATGGCAA 2328
Query 2280 CCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAATATGCCAAACCTGTTGGAAACAGTGGACTTCAAAGA 2339
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2329 CCCTTCTGCTGCACAGTGGCCTAATATGCCAAACCTGTTGGAAATAGTGGACTTCAAAGA 2388
Query 2340 TACTTTCCTTGATGCAAATCATCTCAGTGAAAGTTTTCCAGATTATGAGGTATCTTTCAT 2399
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2389 CACTTTCCTTAATGCAAATCATCTCAGTGAAAGTTTTTCAGATTATGAGGTTTCTTTCAT 2448
Query 2400 CAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTGGATCCAAGTCCTCCGTTTCGAATCACTCTTCCAAA 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449 CAATGCTGAAGGTGCTGAAGCTCTGGATCCAAGTCCTCCGTTTCGAATCACTCTTCCAAA 2508
Query 2460 GACACTAAAAGGAAATGCTGCTATTTCTGGAAACAAGATATCTGAAGTCAATCCAGCAGA 2519
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2509 GACACTAAAAGGAAATGGTGCTATTTCTGGAAACAAGATATCTGAAGTGAATCCAGCAGA 2568
Query 2520 CAATGTTAATATGGTGGATGCTTCCCCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCCC 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 TAATGTTAATATGGTGGATGCTTCCCCGAAGGAGAAACTTATTGTTGAGGCATATACCCC 2628
Query 2580 ACCTGACCCAGGGCCTTATCCTCAGGACCAGCCGAAGCAGAACTCTGTCAAATTTACACC 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2629 ACCTGACCCAGGGCCTTATCCTCAGGACCAGCCGAAGCAGAACTCAGTTAAATTTACACC 2688
Query 2640 TACACAGGTTGGAGCAATTATCTCTGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCC 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2689 TACACAGGTTGGAGCAATTATCTCTGGTATTCAGCCTGGGCTAACTATGGTGGTTGGTCC 2748
Query 2700 ACCAGGTACCGGAAAGACTGATACAGCAGTGCAAATTTTGAATGTTCTATACCACAACTG 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2749 ACCAGGTACCGGAAAGACTGATACAGCAGTGCAAATTTTGAATGTTCTATACCACAACTG 2808
Query 2760 TCCTTCTCAGAGGACCTTGATAATCACTCATTCAAATCAGGCTTTGAATGATCTTTTTGA 2819
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 TCCTTCTCAGAGGACATTGATAATCACTCATTCAAATCAGGCTTTGAATGATCTTTTTGA 2868
Query 2820 GAAGATAATGGAGAGGGATGTACCAGCGCGGTATCTACTTCGTTTGGGTCAAGGTGAACA 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2869 GAAGATAATGGAGAGGGATGTACCAGCGCGGTATCTACTTCGTTTGGGTCAAGGTGAACA 2928
Query 2880 AGAGCTTGCCACTGATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCG 2939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 AGAGCTTGCCACTGATCTTGACTTTAGCAGACAAGGCCGTGTCAATGCCATGCTTGTTCG 2988
Query 2940 GCGTTTGGAACTGCTTAATGAGGTTGAGAGACTAGGAAGATCTCTTCAGCTTCCAGAGGA 2999
|||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2989 GCGTCTGGAACTCCTCAGTGAGGTTGAGAGACTAGCAAGATCTCTTCAGCTTCCAGAGGA 3048
Query 3000 TGTAGGATATACTTGTGAAACAGCTGGATATTTCTGGTTGCTTCATGTATACTCGCGCTG 3059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3049 TGTAGGATATACTTGTGAAACAGCTGGATATTTCTGGTTGCTTCATGTATACTCGCGTTG 3108
Query 3060 GGAGTTGTTTCTCGCTGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTTCGAGATCG 3119
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3109 GGAGCTGTTTCTCGCAGCTTGTGCAGGAAATGAAGACAATCAATCTTTTGTGCGAGATCG 3168
Query 3120 CTTCCCGTTCAAAGATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTATTTAGTGGGGAGTCATT 3179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 3169 CTTCCCGTTCAAAGATTTCTTCTCAGACACCCCTAAACCTGTTTTTAATGGGGAGTCATT 3228
Query 3180 TGAGAAAGACATGAGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATCTCAAGACTGTGTTCCAAGA 3239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 TGAGAAAGACATGAGGGCAGCTAAAGGTTGTTTCTCTCATCTCAAGACTGTGTTCCAAGA 3288
Query 3240 GCTAGAAGAGTGTAGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCT 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3289 GCTAGAAGAGTGTAGGGCCTTTGAACTACTCAAGTCAACTGCTGATAGAGCAAATTATCT 3348
Query 3300 GATGACCAAACAAGCAAAGATTGTAGCAATGACGTGTACTCATGCGGCATTAAAGAGGAG 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3349 GATGACCAAACAAGCAAAGATTGTAGCAATGACGTGTACTCATGCTGCATTAAAGAGGAG 3408
Query 3360 AGATTTTCTTCAGTTAGGGTTCAAATATGATAACTTATTGATGGAAGAAAGTGCTCAGAT 3419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3409 AGATTTTCTTCAGTTAGGGTTCAAATATGATAACTTATTGATGGAAGAAAGTGCTCAGAT 3468
Query 3420 TTTGGAAATTGAAACTTTCATACCAATGTTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGTCATGCACG 3479
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3469 TTTGGAAATTGAGACTTTCATACCAATGCTGCTTCAGAGGCAAGAAGATGGTCATGCACG 3528
Query 3480 ACTCAAGCGCTGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATAT 3539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3529 ACTCAAGCGCTGTATATTGATTGGTGATCACCACCAGCTGCCTCCCGTGGTGAAGAATAT 3588
Query 3540 GGCTTTCCAGAAATATAGTCACATGGATCAGAGTTTGTTTACGAGGTTTGTTCGTCTTGG 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 GGCTTTCCAGAAATATAGTCACATGGATCAGAGTTTGTTTACGAGGTTTGTTCGTCTTGG 3648
Query 3600 TATTCCTTATATTGAGCTCAATGCTCAAGGAAGAGCCAGGCCAACCTTAGCCAAACTTTA 3659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3649 TATTCCTTATATTGAGCTCAATGCTCAAGGAAGAGCCAGGCCAAGTTTAGCCAAACTCTA 3708
Query 3660 CAACTGGAGATACAGAGATTTAGGAGACCTTTCCATTGTTAAGGAAGCACCCATCTTCCA 3719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3709 CAACTGGAGATACAGAGATTTAGGAGACCTTTCCATTGTTAAGGAAGCACCCATCTTCCA 3768
Query 3720 AAGAGCAAATGCTGGATTCTCATATGAATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGATTATGAGGG 3779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3769 AAGAGCAAATGCTGGATTCTCATATGAATATCAGTTGGTGAATGTGCCTGATTATGAGGG 3828
Query 3780 GAAAGGAGAATCGACACCATCTCCATGGTTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATATAT 3839
|| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3829 GAGAGGAGAATCAACACCATCTCCTTGGTTTTATCAAAATCAGGGAGAAGCTGAATATAT 3888
Query 3840 CGTCAGTGTCTATATATACATGAGATTGTTAGGATATCCTGCGAATAAGATATCAATATT 3899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3889 CGTCAGTGTCTATATATACATGAGATTGTTAGGATATCCTGCGAATAAGATATCAATATT 3948
Query 3900 GACAACATATAATGGTCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTATCAACCGTCGATGTGTTCC 3959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3949 GACAACATATAATGGTCAGAAGCTCTTAATCCGTGATGTTATCAACCGACGATGTGTTCC 4008
Query 3960 ATATCCATTCATTGGCCCGCCGAGCAAGGTGACGACAGTGGACAAGTTCCAAGGACAACA 4019
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4009 GTATCCTTTCATTGGCCCGCCGAGCAAGGTGACTACAGTGGACAAGTTCCAAGGACAACA 4068
Query 4020 GAATGATTTTATATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTTGTAGGTCATCTACGTGATGT 4079
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4069 GAATGATTTCATATTGCTCTCTCTTGTACGGACACGCTTCGTAGGTCATCTACGTGATGT 4128
Query 4080 AAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTCGGTTTGTATGTGTTCTGCCGTCG 4139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4129 AAGAAGGTTGGTAGTTGCAATGTCACGTGCTCGGCTCGGTTTGTATGTGTTCTGCCGCCG 4188
Query 4140 TTCTCTCTTTGAACAATGCTATGAGCTGCAACCAACGTTTCAACTTCTTCTTCAAAGACC 4199
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4189 TTCGCTCTTTGAACAATGCTATGAGCTGCAACCAACGTTTCAACTTCTTCTTCAAAGACC 4248
Query 4200 CGATCGGCTCGGACTCAATCTCAATGAGAACACAACGTATACAGATCGTGCTG-TGGAGG 4258
||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4249 CGATCGGCTCGGACTCAATTTTAATGAGAACACAGCATATACAGATCGTG-TGGTGGAGG 4307
Query 4259 AAGTTGGAAATCCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAAATGGCACACATAGTTCACGATA 4318
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4308 AAGTTGAAAATTCTTATCTCGTTCATGATGTTGAAGAGATGGCACACATAGTTGACGACA 4367
Query 4319 GGATGAACCAGTTCTACCAGGCACAAGGAG-TGTATGAGCAATACCAGAACAACATGCCA 4377
|||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 4368 GGATGAACAAGTTCTACCAGGCACAAGGAGCT-TATGAGCAATACCAAAACAACATGGCA 4426
Query 4378 CAGATGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTCAGTAGTAGGAACTGTAGATGGT 4437
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||
Sbjct 4427 CAGATGGAAGATGGTAATCACGACATGGAGAGTGATTCAGTAGTAG-A--TG--G-TG-- 4478
Query 4438 GATGAATCTGAGAAAAATATGCAGCAGCTAAAACAAGCTCCAGACATAGACAGTGAATTC 4497
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 4479 -ATGAATCTGAAAAAAATATGCAGCAGCTAAACCAATCTCCAGACATAGACGGTGAATTA 4537
Query 4498 TCGAAGGAGGTGGTTGGAATGGAGGTGGACAATAATGGATTTAGCAGTGAGAATGGAAAG 4557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4538 TCGAAGGAGGTGGTTGGAATGGAGGTGGACAATAATGGATTTAGCAGTGAGAATGGAAAG 4597
Query 4558 GCTGATGAGAAGAATTAGGACAAATCAAACTGGGAATATCAAATTTATCCACTCGG-AGG 4616
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||
Sbjct 4598 GCTGATGAGAAGAATTAGGACAAAACAAACTGGGAATTTCAAAGTTATCCTTTCGGGAGG 4657
Query 4617 GTGATAAGTGAGTTGATGTTTGAAACATGAGGGAATTTGTT-GCTACTGTAAGA-AATAT 4674
||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||| ||| |
Sbjct 4658 GTGATAAGTGAGTTGATGTTTGAAACATG-G--ATTTTTTTTGCTACTGTAAGATAAT-T 4713
Query 4675 TTACTGAATTTGAGTAAATTCTGGTAAGTGTTATATGACACCGAGGAAAAAG-TAGCATT 4733
|||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 4714 TTACTGCATTTGAGTAAATTCTGGTAAGTGATACATGACAT-GAGGAAAAAAATAGCATT 4772
Query 4734 GTCTGACAATTCTTTCCTCACCAACTTTTTGTAACTTCTATTTGAGTTTTCAAGCT 4789
||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 4773 GTCTGAC----CTT-CCTCACCGACTTTTTGTAACTTCTAGTTGAGTATTCAAGCT 4823
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 238894982566
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5