BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482971
Length=4861
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G39480.1 | Symbols: PGP6 | P-glycoprotein 6 | chr2:16477792-... 8058 0.0
AT3G55320.1 | Symbols: PGP20 | P-glycoprotein 20 | chr3:205069... 4610 0.0
> AT2G39480.1 | Symbols: PGP6 | P-glycoprotein 6 | chr2:16477792-16485039
REVERSE LENGTH=4893
Length=4893
Score = 8058 bits (4363), Expect = 0.0
Identities = 4703/4867 (97%), Gaps = 24/4867 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 aaaaaaaGAAAGTATCTCACCGGAAACGATTTCTTCGCCGATTCCAAGACTTTTCTTCCT 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 45 AAAAAAAAAAAGTATCTCACCGGAAACGATTTCTTCGCCGATTCCAAGACTTTTCTT-C- 102
Query 61 CTAAAGCTTTTTAGCAGATCCGGTGAAGATTTCAAAAT-CAAAGAATCCTCTAAACCTAG 119
|| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||
Sbjct 103 CT-AAGCTTTTTAACAGATCCGGTGAAAATTTCAAAATCCGAAGAATTCTCTAAAGCTAG 161
Query 120 GGTTCCTTCTACGC-CGGAGACGGAGGTGATATTATTCCCCCGTCGTATCGTAGCTAAAA 178
|||| ||| | | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||
Sbjct 162 GGTTTCTT-AATTCAC-GAGACGGAGGTGATATAATTCCCCC-CCG--TCGTAGCT---- 212
Query 179 GATGATGATTTCCAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCC 238
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 -ATGATGATTTCGAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCC 271
Query 239 GGTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCACCTTCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGA 298
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 TGTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCATCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGA 331
Query 299 GAACGGTGGTTCGGGAACGGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAAGATATGGAGGAGCCGGA 358
| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 332 GCACGGTGGTACAGGAACAGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAGGAAATGGAGGAGCCGGA 391
Query 359 GGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGCTGATCG 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 GGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGCTGATCG 451
Query 419 GTTTGATTGGGTGCTTATGGTTTTTGGATCCGTAGCTGCTGCTGCTCATGGCACTGCGCT 478
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 452 CTTTGATTGGGTTCTTATGGTTTTTGGATCCGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTACTGCGCT 511
Query 479 TATTATCTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTCCTAGTGAATC 538
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||
Sbjct 512 TATTGTTTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTCCCACTGATTC 571
Query 539 GGATCACCTGATTAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCGTCGAGCTTTCGTTGACCATTGT 598
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 572 GGATCATCTGATAAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCCTCGAGCTTTCGCTGACCATTGT 631
Query 599 ATACATTGCTGGAGGTGTTTTTGTATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGATACTGAC 658
||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 ATATATCGCTGGAGGTGTTTTCATATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGATACTGAC 691
Query 659 TGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTACTACTAAATCAGGA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 692 TGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTGCTACTAAATCAGGA 751
Query 719 TATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTGCTGAGTGA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 752 TATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTACTGAGTGA 811
Query 779 TGTCCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGCGAAAAAGTTGGGAATTACATTCATAACATGGC 838
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TGTTCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGTGAAAAAGTTGGGAATTACATTCATAACATGGC 871
Query 839 AACATTTATCAGTGGTCTTGTTATCGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCGCTCATTAC 898
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 872 GACATTTATCAGTGGTCTTATTATTGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCCCTCATTAC 931
Query 899 GTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCAGGAGGCATATCAAATATATTTCTCCACAG 958
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 GTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTTCTCCACAG 991
Query 959 ACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGAACAGGCAGT 1018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 992 ACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCAGCATTGCTGAACAGGCAGT 1051
Query 1019 CTCTTACGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAATACTCTTATGC 1078
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 CTCTTATGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAATACTCTTATGC 1111
Query 1079 AACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGCAAGGACTTGG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 AACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGCAAGGACTTGG 1171
Query 1139 ACTTGGATTTACTTACGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTCTGCAACTTTGGATTGGTCG 1198
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1172 ACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTATGCAACTTTGGATTGGTCG 1231
Query 1199 GTTCTTTGTTATTCATCATAGAGCAAATGGTGGAGAAATCATCACAGCCCTTTTTGCTGT 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1232 GTTCTTTGTTATTCATCATAGAGCAAATGGTGGAGAGATCATAACAGCCCTTTTTGCTGT 1291
Query 1259 TATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATTCATTTGATCAAGG 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 TATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATTCATTTGATCAAGG 1351
Query 1319 AAGAATTGCAGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGCCGTTCATCCTCTGGGACTAATCA 1378
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 AAGAATTGCGGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGTCGTTCATCCTCTGGGACTAATCA 1411
Query 1379 AGAGGGAACTATTTTGTCTGCTGTTCTAGGAAATATTGAGTTTCGGAATGTATATTTCAG 1438
|||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 AGAGGGAATTATTTTGTCTGCTGTCCAAGGAAATATTGAGTTTCGGAATGTATATTTCAG 1471
Query 1439 CTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTCACTGTGCCGGCTAA 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1472 CTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTTACTGTGCCGGCTAA 1531
Query 1499 AAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTCCTCTAAT 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1532 AAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGTATCATTCCTCTAAT 1591
Query 1559 GGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGGGAAAATATTAAAAA 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1592 GGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGAGAAAATATTAAAAA 1651
Query 1619 TCTAAAGTTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAGGAGCCTGCTTTGCT 1678
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652 TCTAAAATTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAGGAGCCTGCTTTGCT 1711
Query 1679 TAGTCTTAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGCCGAGATGCTACTCTGGATCAGATAGA 1738
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 TAGTCTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATACGGCCGAGATGCTACTCTGGATCAGATAGA 1771
Query 1739 GGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAGGATATGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 GGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAGGATATGA 1831
Query 1799 AACTCAGGTTGGGAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGAAAATAAAACTATCGAT 1858
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1832 AACTCAGGTTGGAAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGAAAATAAAGCTATCGAT 1891
Query 1859 TGCTAGAGCCGTACTCTTAGATCCAACAATTCTTTTGCTTGACGAGGTCACTGGAGGACT 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892 TGCTAGAGCCGTACTCTTAGATCCAACAATTCTTTTGCTTGACGAGGTCACTGGAGGACT 1951
Query 1919 AGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCTCTTGATCTTCTAATGTTAGGAAGGTC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 AGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCCCTTGATCTTCTAATGTTAGGAAGGTC 2011
Query 1979 GACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGCTGACTATATTGCTGTAAT 2038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2012 TACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGCTGACTATATTGCTGTAAT 2071
Query 2039 GGAGGAGGGTCAGCTACTTGAAATGGGTACGCATGATGAATTAATCAACCTTGGTAATTT 2098
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GGAGGAGGGCCAGCTACTTGAAATGGGTACGCATGATGAACTAATCAACCTTGGTAATTT 2131
Query 2099 GTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAG 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2132 GTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTACCCAGACGGATGCCAGTTAG 2191
Query 2159 GAACTACAATGATTCTGCTGCGTTTCAGGTTGAGAGGGATTCTTCAGCTGGCCGTGGCTT 2218
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2192 GAACTACAACGATTCTGCTGCGTTTCAGGCTGAGAGGGATTCTTCAGCTGGTCGTGGCTT 2251
Query 2219 CCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCCAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCATAATGT 2278
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252 CCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCTAAGTCTCCATCTCTTCAGAGAGGTCATAATGT 2311
Query 2279 TTTTCGCTCCCAGGAAGTGTGCTTTAATAGTGAAGAATCGCCCAATGATCATAGCCCTGC 2338
||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 TTTCCGCTCCCAGGAATTGTGCTTTAATAGTGAAGAATCGCCCAATGATCATAGCCCTGC 2371
Query 2339 ACCAGAGAAAATGGGAGAAAATGGCTCGTCGTTGGATGTTGGTGATAAGGAACCAAGCAT 2398
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||
Sbjct 2372 ACCAGAGAAACTGGGAGAAAATGGCTCGTCGTTGGATGTTGGTGAGAAGGAACCCACCAT 2431
Query 2399 CAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGAGCTACCAAAAATTGACATTCAGTG 2458
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432 CAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGAATTACCAAAAATTGACATTCAGTG 2491
Query 2459 TCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGGAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGAT 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 TCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGGAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGAT 2551
Query 2519 ATCCGATCCCCAAAATGAGCGCTCCCATTCACAGACTTTTAGCCGCCCTCTTGGTCACTC 2578
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2552 ATCAGATCCCCAAAATGAGCGCTCTCATTCACAGACTTTTAGCCGCCCTCTTGGTCACTC 2611
Query 2579 AGATGACACTTCAGCAAATGTTAAGGTGGCCAAGGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTC 2638
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2612 AGATGACACTTCAGCAAGTGTTAAGGTGGCCAAGGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTC 2671
Query 2639 ATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAGTGGCTATATGCTGTATTAGGGAGTAT 2698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2672 ATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAGTGGCTATACGCTGTATTAGGGAGTAT 2731
Query 2699 TGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGT 2758
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732 TGGTGCTGCAATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGT 2791
Query 2759 GACAACATACTATAAGAGCACGGGAAGCCACCTGCGTGAGGAGGTTGACAAGTGGTGCTT 2818
||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2792 GACGACATACTATACGAGCAAGGGAAGCCACCTGCGTGAAGAGGTTGACAAGTGGTGTTT 2851
Query 2819 GATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTACTT 2878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2852 GATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTACAGCACTTCTACTT 2911
Query 2879 TGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGTGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCT 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2912 TGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGTGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCT 2971
Query 2939 GCGTAATGAAGTTGGATGGTATGACGAAGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCG 2998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2972 GCGTAATGAAGTTGGATGGTATGACGAAGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCG 3031
Query 2999 CCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCCGCCTTCAGCAACAGGCTTTCGATATTTAT 3058
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3032 CCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCTGCCTTCAGCAACAGGCTTTCCATATTTAT 3091
Query 3059 TCAGGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCCATTCTTATTGGGTTGCTGCTCGGTTGGCGTTT 3118
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3092 TCAGGATAGTTTTGCTGTTATCGTTGCCATTCTTATTGGGCTGCTGCTCGGTTGGCGTTT 3151
Query 3119 GGCCCTTGTTGCATTGGCGACTTTGCCAGTACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACT 3178
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3152 GGCCCTTGTTGCATTAGCGACTTTGCCAGTACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACT 3211
Query 3179 TTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCAGGAGATGCATCGAAAGGCGT-CTCTAGTAC 3237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3212 TTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCAGGAGATGCATCGAAAGGCGTCCT-TAGTAC 3270
Query 3238 TCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGTTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGATGA 3297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3271 TCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGTTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGGTGA 3330
Query 3298 TGGAACTCTACAGACTGCAACTCCAACGGATACTCAGACAGAGCTTTTTCCACGGGATGG 3357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 3331 TGGAACTCTACAGACTGCAACTCCAACGGATACTCAGGCAGAGCTTTTTCCATGGGATGG 3390
Query 3358 CTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCC 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3391 CTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCC 3450
Query 3418 TGTGGTACACCGCGTTATCAGTAGACCGCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTGACCG 3477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3451 TGTGGTACACCGCGTTATCAGTAGACCGCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTAACCG 3510
Query 3478 AGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTT 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3511 AGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTT 3570
Query 3538 ACATTCTCAAGCGCCGTAGATCTCTCGCTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTA 3597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3571 ACATTCTCAAGCGCCGTAGATCTCTCGCTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTA 3630
Query 3598 CAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTCTTAGTCCGCCTAATGTGTATGGAAGCATTGAAC 3657
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3631 CAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTCTTAGTCCGCCTAACGTGTATGGAAGCATTGAAC 3690
Query 3658 TGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAACCCGCCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCA 3717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3691 TGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAACCCGCCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCA 3750
Query 3718 GTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGA 3777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3751 GTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGA 3810
Query 3778 GCACAATAATATCGTTGATCGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAG 3837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3811 GCACAATAATATCGTTGATCGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAG 3870
Query 3838 ATGGGCGAGACTTGACGTCGTATAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTC 3897
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3871 ATGGGCGAGACTTGAAGTCATATAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTC 3930
Query 3898 AACAGGAACCCATAATCTTTTCCACGACGATCAGAGAAAACATTATATATGCAAGGCACA 3957
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3931 AACAGGAACCCATAATCTTTTCCACAACGATCAGAGAAAACATTATATACGCAAGGCACA 3990
Query 3958 ATGCAAGTGAGGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCCCACCATTTCATCA 4017
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3991 ATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGGATTGCAAATGCCCACCATTTCATCA 4050
Query 4018 GCAGCTTACCTCACGGATACGACACGCATATCGGGATGAGAGGCGTTGAACTTACCCAAG 4077
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 4051 GCAGCTTACCTCACGGATACGACACACATATCGGGATGAGAGGTGTTGAGCTTACCCAAG 4110
Query 4078 GACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAATACTGTTGA 4137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4111 GACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAATACTGTTGA 4170
Query 4138 TTGACGAAGCGAGTTCATCAATCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTG 4197
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4171 TTGACGAAGCGAGTTCATCTATCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTG 4230
Query 4198 ATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGA 4257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 ATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGA 4290
Query 4258 GACATGTGGATAACATCGTGGTTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACACATG 4317
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4291 GACATGTGGATAACATTGTGGTTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACGCATG 4350
Query 4318 ATTCTTTAGCGGGTAAAAACGGATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGA 4377
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4351 ATTGTTTAGCGGGTAAAAACGGATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGA 4410
Query 4378 ATCTACGGCGACATCAACTGATCTAAA-GAGATTGGACTCCTGTGCCTAATTGAGATTAG 4436
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4411 ATCTACGGCGACATCAACTGATCTAAAAGAGATTGGACTCATGTGCCTAATTGAGATTAG 4470
Query 4437 TTCAGTCACATACCAACCATCACGTGATATGCCACGGGATAATGTTATTGGATGCAATTA 4496
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||
Sbjct 4471 TTCAGTCACATACCAACCATCATGTGATATGCCACGAGATAACGTTATTGGATGTAGTTA 4530
Query 4497 CGGGACATGCATCTGATCAGAGGCTTATCGAGTCCGAGATGACACCAAATGAGCAGAAGT 4556
| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4531 CAGGACATGCATCTGATCAAAGGCTTATCGGGTCCGGGATGACAGCAGATGAGCAGAAGT 4590
Query 4557 TGTACAACCACGGTTAGTTTCTGTAAGCAACTTAGGAGCTTGTAGACGTTAGATTCCCTT 4616
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4591 TGTACAACCACGGTTAGTTTCTGTAAGCAACTTAGGAGTTTGTAGACGTTAGATTCCCTT 4650
Query 4617 ATTCTTTCAGGAGGCTAAGCAATGAAGTAGGACTGTGTAATTTATTCATT-ATTTGGTCT 4675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||
Sbjct 4651 ATTCTTTCAGGAGGCTAAGCAATGAAGTAGGACTGTGTTATTTATTCATTGATT-GGTCT 4709
Query 4676 CTTAAGGTATATCGATTTGTTTATTGAAACTGAAGATTAGGGGCAATTT-ATTTGCTGAG 4734
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4710 CTTAAGGTATATCGATTTGTTTATTGAAACTGAAGATTAGAGGCAATTTTATTTGCTGAG 4769
Query 4735 GTTTGttttttttttATTGTTGTGAGTGATTTAGGTGGAGAAGTGTGTAATGGTTAGGAA 4794
||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4770 GTTTGCTTTTTTGTT---GTTGTGAGTGATTTAGGTGGAGAAGTGTGTAATGGCTAGGAA 4826
Query 4795 GAAAGATGTCTGTTTTGTAAATACATTATATGCACTTTATTTGCAAGTTTGATTCAATTA 4854
|||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4827 GAAATATGTCTGTTTTGTAAATACATTATTTCCACTTTATTTGCAAGTTTGATTGAATTA 4886
Query 4855 CTGAACC 4861
|||||||
Sbjct 4887 CTGAACC 4893
> AT3G55320.1 | Symbols: PGP20 | P-glycoprotein 20 | chr3:20506992-20513393
REVERSE LENGTH=4626
Length=4626
Score = 4610 bits (2496), Expect = 0.0
Identities = 3687/4262 (87%), Gaps = 81/4262 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 180 ATGATGATTTCCAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCCG 239
|||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCATTAACTCCA 60
Query 240 GTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCACCTTCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGAG 299
|| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCACCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
Query 300 AAC-GGTGGT---TCGGG-A--ACGGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAAGATATGGAGGA 352
| |||||| |||| | ||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||
Sbjct 121 -TCTGGTGGTGGCACGGGCACGGCGGCGGCGCTAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATGA 179
Query 353 GCCGGAGGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGC 412
| || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 180 TCAAGATGAGCTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCGC 239
Query 413 TGATCGGTTTGATTGGGTGCTTATGGTTTTTGGATCCGTAGCTGCTGCTGCTCATGGCAC 472
||| || |||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 240 TGACCGCTTTGATTGGGTGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTAC 299
Query 473 TGCGCTTATTATCTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTC-CTA 531
|||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||
Sbjct 300 TGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAAGATTGTTGATGTTCTTGC-TTTCTCTA 358
Query 532 GTGAATCGGA-TCACCTGATTA-GTGATGATCAGTTCAATCGTCTCGTCGAGCTTTCGTT 589
||| || | ||| | || | ||| | ||||| | || |||||| ||||||||||
Sbjct 359 ATGATTC-TAGTCAGCAGA-GATCTGAACACCAGTTTGACCGACTCGTCCAGCTTTCGTT 416
Query 590 GACCATTGTATACATTGCTGGAGGTGTTTTTGTATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTG 649
||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GACGATCGTGTACATTGCTGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTG 476
Query 650 GATACTGACTGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTACTACT 709
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |
Sbjct 477 GATACTGACTGGAGAAAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATT 536
Query 710 AAATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGT 769
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||
Sbjct 537 GAATCAAGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGT 596
Query 770 GCTGAGTGATGTCCTACTTATTCAGTCGGCTCTAAGCGAAAAAGTTGGGAATTACATTCA 829
|||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 597 GCTGAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCA 656
Query 830 TAACATGGCAACATTTATCAGTGGTCTTGTTATCGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 889
||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TAACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGC 716
Query 890 GCTCATTACGTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCAGGAGGCATATCAAATATATT 949
| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 717 ATTGATTACACTAGCCACTGGTCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATTTT 776
Query 950 TCTCCACAGACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGA 1009
||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TCTACACAGACTTGCTGAGAACATACAGGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGA 836
Query 1010 ACAGGCAG-TCTCTTACGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAAT 1068
|||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 837 ACAGGC-GATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAAT 895
Query 1069 ACTCTTATGCAACTTCTCTCCAAGCAACTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGC 1128
| || |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 896 ATTCATATGCAACCTCCCTTCAAGCAACCCTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGC 955
Query 1129 AAGGACTTGGACTTGGATTTACTTACGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTCTGCAACTTT 1188
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||
Sbjct 956 AAGGCCTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTT 1015
Query 1189 GGATTGGTCGGTTCTTTGTTATTC-AT-CATAGAGCAAATGGTGGAGAAATCATCA-CAG 1245
||||||| || ||||||||| | || | || |||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1016 GGATTGGACGATTCTTTGTT-CACAATGGA-AGGGCAAATGGTGGAGAAATCAT-AGCAG 1072
Query 1246 CCCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATT 1305
| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |
Sbjct 1073 CTCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTGGGGTTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTACT 1132
Query 1306 CATTTGATCAAGGAAGAATTGCAGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGC-CGTTCATCC 1364
| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1133 CTTTTGATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAA-CTCGTTCATCT 1191
Query 1365 TCTG-GGACTAATCAAGAGGGAACTATTTTGTCTGCTGTTCTAGGAAATATTGAGTTTCG 1423
|||| || |||| ||||| ||| || | || || |||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 1192 TCTGTGG-CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAAGGAAATATTGAGTTCCG 1250
Query 1424 GAATGTATATTTCAGCTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCT 1483
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1251 GAATGTATATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCT 1310
Query 1484 CACTGTGCCGGCTAAAAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAG 1543
||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CACGGTTCCTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAG 1370
Query 1544 CATCATTCCTCTAATGGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGG 1603
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1371 CATCATTCCTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCGACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGG 1430
Query 1604 GGAAAATATTAAAAATCTAAAGTTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACA 1663
|||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || ||
Sbjct 1431 AGAAAATATTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGTTGGTTACCCA 1490
Query 1664 GGAGCCTGCTTTGCTTAGTCTT-AGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGCCGAGATGCTA 1722
|||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1491 GGAGCCTGCTCTGCTTAG-CTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGTCGTGATGCTA 1549
Query 1723 CTCTGGATCAGATAGAGGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCAC 1782
|||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CTCTTGATCAGATAGAGGAGGCAGCTAAAAATGCGCATGCGCACACATTTATCAGCTCAC 1609
Query 1783 TTGAAAAAGGATATGAAACTCAGGTTGGGA-AGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAG 1841
||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1610 TTGAAAAAGGATATGAAACACAGGTCGGGAGAGCC-GGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAG 1668
Query 1842 AAAATAAAACTATCGATTGCTAGAGCCGTACTCTTAGA-TCCAACAATTCTTTTGCTTGA 1900
||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1669 AAAATTAAACTTTCGATTGCTAGAGCTGTGCTTTT-GAATCCAACAATTCTTCTGCTTGA 1727
Query 1901 CGAGGTCACTGGAGGACTAGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCTCTTGATCT 1960
|| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||
Sbjct 1728 TGAAGTAACTGGAGGACTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCT 1787
Query 1961 TCTAATGTTAGGAAGGTCGACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGC 2020
||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 1788 TCTGATGTTGGGACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGC 1847
Query 2021 TGACTATATTGCTGTAATGGAGGAGGGTCAGCTAC-TTGAAATGGGTACGCATGATGAAT 2079
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1848 TGACTATATTGCTGTGATGGAGGAGGGTCAGCT-CGTTGAAATGGGTACACACGATGAAT 1906
Query 2080 TAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTAC 2139
| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1907 TGATAAATCTTGGTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTC 1966
Query 2140 CCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAATGATTCTGCTGCGTTTCAGGTTGAGAGGGATT 2199
| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || |
Sbjct 1967 CAAGAAGGATGCCAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTGAGGTCGAGAGAGACT 2026
Query 2200 CTTCAGCTGGCCGTGGCTTCCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCCAAGTCTCCATCTC 2259
||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2027 CTTCAGCTGGCTGTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATTAAGTCTCCATCTC 2086
Query 2260 TTCAGAGAGGTCA-TAATGTTTTTCGCTCCC-AGGAAGTGTGCTTTAATAGTGAAGAATC 2317
|||| |||||| | | ||| || || |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||
Sbjct 2087 TTCAAAGAGGT-AGTGGTGTGTTCCG-TCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAATC 2144
Query 2318 GCCCAATGATCATAGCCCTGCACCAGAGAAAAT-GGGAGAAAATGGC-TCGTCGT-TGGA 2374
|| || | ||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| | ||| | ||||
Sbjct 2145 ACCTAAAGCTCATAGCCCTGCATCTGAGAAAACAGGG-GAAGATGGCAT-GTC-TCTGGA 2201
Query 2375 T-GTTGGTGATAAGGAACCAAGC-ATCAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCA 2432
| || | |||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 2202 TTGT-GCTGATAAAGAGCCAA-CTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTGCCA 2259
Query 2433 GAGCTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCG 2492
| || || ||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||| || ||||| ||
Sbjct 2260 CACCTTCCTAAAGTTGACGTTCAGTGTCCCCAACA--A-AAATCAAACGGCTCAGAGCCA 2316
Query 2493 GAGTCCCCTATATCACCCCTTTTGATATCCGATCCCCAAAATGAGCGCTCCCATTCACAG 2552
||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||
Sbjct 2317 GAGTCCCCTGTTTCACCCCTTTTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAG 2376
Query 2553 ACTTTTAGCCGCCCTCTTGGTCACTCA-GATGACACTTCAGCAAATGTTAAGGTGGCCAA 2611
|| ||||| || |||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| | | ||
Sbjct 2377 ACGTTTAGTCGTCCTCTTAGTT-CTCCTGATGACACTAAAGCAAATGGTAAGGCGTCTAA 2435
Query 2612 GGACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGA 2671
||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2436 GGATGCTCAACACAAGGAGTCACCTTCGTTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGA 2495
Query 2672 GTGGCTATATGCTGTATTAGGGAGTATTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCT 2731
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496 GTGGCTTTATGCTGTATTAGGGAGTCTTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCT 2555
Query 2732 TCTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGTGACA-ACATACTATAAGAGCACGGGAAGCCACC 2790
||| |||||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| |||| ||| ||||||
Sbjct 2556 TCTGGCTTATGTCATTGCGTTGGTAGTTACGGA-ATATTATAAAAGCAAAGGAGGCCACC 2614
Query 2791 TGCGTGAGGAGGTTGACAAGTGGTGCTTGATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTG 2850
|||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2615 TGCGCGAGGAGGTTGACAAATGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTG 2674
Query 2851 TTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTACTTTGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAG 2910
||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 2675 TTGCCAATTTCTTGCAGCATTTCTATTTTGGCATAATGGGAGAGAAAATGACGGAGAGAG 2734
Query 2911 TGCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTAT-GACGAAGAA 2969
| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||
Sbjct 2735 TTAGGAGGATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAACGAAGTTGGATGGT-TCGATGATGAA 2793
Query 2970 GAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGCCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCC 3029
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2794 GAGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCT 2853
Query 3030 GCCTTCAGCAACAGGCTTTCGATATTTATTCAGGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGC-CAT 3088
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 2854 GCCTTCAGCAACAGGCTTTCAATATTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCTC-T 2912
Query 3089 TCTTATTGGGTTGCTGCTCGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCGACTTTGCCAGT 3148
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
Sbjct 2913 TCTGATTGGGTTGCTGCTTGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAAT 2972
Query 3149 ACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACTTTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCA 3208
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2973 TCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCAGAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACA 3032
Query 3209 GGAGATGCATC-GAAAGGCGTCTCTAGTACTCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTG 3267
||||||||| | |||| || ||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||
Sbjct 3033 GGAGATGCA-CAGAAAAGCATCTTTAGTTCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTG 3091
Query 3268 TTGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAA-GATGATGGAACTCTACAG-ACTGCAACTCCAACG 3325
|||| || |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||| ||
Sbjct 3092 TTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAAAG-TGATGGAACTGTACAGGA-TGCAACTCCAGCG 3149
Query 3326 GATACTCAGACAGAGCTTTTTCCACGGGATGGCTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACA 3385
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 3150 GATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGGGATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACA 3209
Query 3386 GTTTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCCTGTGGTACACCGCGTTATCAGT-AGACC 3444
||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||| || | |||
Sbjct 3210 GTTTCTTCTTTTCGCCTGCAACGCGCTCCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTTA-ACC 3268
Query 3445 GCAGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTGACCGAGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACAT 3504
| ||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3269 GTGGATATATGAAATTATCGACAGCTATAACGGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACAT 3328
Query 3505 TTGCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTTACATTCTCAAGCGCCGTA-GATCTCTC 3563
| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||| | |||||
Sbjct 3329 TCGCCCTTGTGGAGCCATTTGGATTAGCACCGTATATCCTCAAGCGACGTAAG-TCTCT- 3386
Query 3564 GCT-TCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTACAATCGAACCTGATGATACCTCGGC 3622
| | ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||
Sbjct 3387 GATATCAGTGTTTGAAATAGTCGATCGAGTCCCTACGATTGAACCAGATGATAACTCTGC 3446
Query 3623 TCTTAGTCCGCCTAATGTGTATGGAAGCATTGAACTGAAAAACATCGACTTCTGCTACCC 3682
||| | || |||||||| || ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3447 TCTCAAACCTCCTAATGTCTACGGAAGTATTGAATTGAAAAACGTAGACTTCTGCTACCC 3506
Query 3683 AACCCG-CCCG-GAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAATGGCGGACAA 3740
||| || |||| || | |||| || |||||||| ||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 3507 AACTCGACCCGAGA--TACTAGTGCTGAGCAACTTTAGTCTCAAAATCAGTGGCGGACAG 3564
Query 3741 ACAGTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGAGCACAATAATATCGTT-GATCGA 3799
|| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | | | ||
Sbjct 3565 ACTGTAGCTGTTGTTGGCGTTTCAGGTTCTGGAAAGAGCACGATAATCTCACTAG-TAGA 3623
Query 3800 GAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAGATGGGCGAGACTTGACGTCGTA 3859
|||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||| | || ||
Sbjct 3624 GAGATACTACGACCCAGTTGCTGGCCAAGTCCTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATA 3683
Query 3860 TAATTTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTCAACAGGAACCCATAATCTTTTC 3919
||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3684 TAACTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGTTTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTC 3743
Query 3920 CACGACGATCAGAGAAAACATTATATATGCAAGGCACAATGCAAGTGAGGCTGAGATGAA 3979
||| || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3744 CACAACAATCAGAGAGAATATCATATATGCAAGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAA 3803
Query 3980 GGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCCCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGATACGA 4039
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3804 GGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCTCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTACGA 3863
Query 4040 CACGCATATCGGGATGAGAGGCGTTGAACTTACCCAAGGACAAAAACAGAGAATCGCTAT 4099
||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||
Sbjct 3864 CACACATATTGGGATGAGAGGCGTAGAACTTACCCCTGGACAGAAACAGAGAATAGCAAT 3923
Query 4100 AGCTCGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCAAT-ACTGTTGATTGACGAAGCGAGTTCATCAA 4158
||| || ||||| |||||||||||||| || | | || || || ||||| || || || |
Sbjct 3924 AGCACGCGTAGTACTGAAGAATGCTCCCATCA-TCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGTCTA 3982
Query 4159 TCGAATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACA 4218
||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3983 TCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAGGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACA 4042
Query 4219 AAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGAGACATGTGGATAACATCGTGG 4278
||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4043 AAACAACAATTCTGATAGCACATAGAGCGGCTATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGG 4102
Query 4279 TTCTCAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCGGGTAAAAACG 4338
| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
Sbjct 4103 TACTTAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCAGCAAAAAATG 4162
Query 4339 GATTGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAA-GAATCTACGGCGACATCAACTG 4397
| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| | ||||| ||||
Sbjct 4163 GGTTGTATGTACGTTTGATGCAACCACACTTTGGTAAAGG-TCTACGCCAACATCGACTG 4221
Query 4398 AT 4399
||
Sbjct 4222 AT 4223
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 242507002462
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5