BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg482979
Length=4855
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G39580.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative ... 5566 0.0
> AT2G39580.1 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Putative
zinc-finger domain (InterPro:IPR019607); Has 249 Blast hits
to 219 proteins in 85 species: Archae - 0; Bacteria - 144;
Metazoa - 29; Fungi - 8; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes
- 18 (source: NCBI BLink). | chr2:16510425-16517073
FORWARD LENGTH=4974
Length=4974
Score = 5566 bits (3014), Expect = 0.0
Identities = 3470/3682 (94%), Gaps = 64/3682 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1181 AAAA-ATTCAATGGAAACCATCAGGTTTTTTCTAGATCCTCAAATAATGACTTGGAGGCA 1239
|||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||
Sbjct 1238 AAAATAGTCAATGGAAACCATCAGGTTTTTTCTAGATCCTCAAATAACAAC-TGGAAGCG 1296
Query 1240 GCTGTCTTGTTTGAATAATTCTGGCCTCTGGAACATCCCGGGAAATACAACAGCTCCTGG 1299
|||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1297 GCTGCCTTGTTCGAATAATTCTGGCCTCTACAACATCCCGGGAAGTACAACAGTTCCTGG 1356
Query 1300 ACATAGTCAACTGGATATGCTATCCTTGACGAACCTAGAGGAATCACTTGACAAAGAGTT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1357 ACATAGTCAACTGGATATGCTATCCTTGACGAACCTAGAGGAATCGCTTGACAAAGAGTT 1416
Query 1360 GGAGGAAGCACAAGAACGTAAACGCCTTTGTGAAATTGAAGAAAGAAATGCTCTTAAGGT 1419
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 GGAGGAAGCACAAGAACGAAAACGCCTTTTTGAAATTGAAGAAAGAAATGCTCTTAAGGT 1476
Query 1420 TTATAGAAAGGCACAGAGATCTTTGATAGAGGCAAATGCCAGATGTGCAGAACTTTACAG 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TTATAGAAAGGCACAGAGATCTTTGATAGAGGCAAATGCCAGATGTGCAGAACTTTACAG 1536
Query 1480 TAAGAGAGAAACTTTATCTGCTCATTATGGATCTCTCATCGTGCGCGACTCCAGATTGTT 1539
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1537 TAAGAGAGAAATTTTATCTGCTCATTATGGATCTCTCATCGTTCGTGACTCCAGATTGTT 1596
Query 1540 GTGGCCTTCTATACATGGTGAGAATCCTGAAACTGGGTTTCACTTCTTGAATAATAGTAC 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597 GTGGCCTTCTATACATGGTGAGAATCCTGAAACCGGGTTTCACTTCTTGAATAATAGTAC 1656
Query 1600 TGGAAATATTGATTTGGCAACCAAAACGGACATCGCTCAGCATACTCAGCTAGAAAGCAA 1659
||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1657 TGGAAGCATTGATCTGGCAACCAAAACGGACATTGCTCAGCATTCTCAGCTAGAAAGCAA 1716
Query 1660 CCACAGATATAACAGCGATTGTGGTGGCAGTCATCCTCCACCTCATTCCCGTAGTGGACA 1719
||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 CCACAAATATAACAGTGAATATGTTGGCAGTCATCCTCCACCTCATTCCCGTAGTGGACA 1776
Query 1720 GAATTTGGGTTCAGAACCGTACAATGATCTTGGTGCTAGTACCTCTGATGGGTTGCCTTG 1779
|||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1777 GAATTT-GG----G----GTACAGTGATCTTGGTGCTAGTACCTCTGATGGATTGCCTTG 1827
Query 1780 CAGTAACAAGCAAACTGCAAGTAGACTATGCTCCCCATCAAGTGATGCAAACATTTTGCC 1839
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1828 CGGTAACAAGCAAACTGCAAGTAGACTATGCTCCCCATCAAGTGATGCAAACATTTTGCC 1887
Query 1840 AGATGACGAGTCATTTCCAGTTGACCATGAATCTACGGAGGGGAACCTTGGACATCAAAC 1899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 1888 AGATGACGAGTCATTTCCAGTTGACCATGAATCTACCGAGGGGAACCCTGGACATCAAAA 1947
Query 1900 AGAAAATCTTGATCAAACACTAGGCAATCAGAATGCTTTGCTTCTTGAAGCATCATTAAG 1959
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1948 AGAAAATATTGATCAAACACTAGGCAATCAGAATGCTTTGCTTCTTGAAGCATCATTAAG 2007
Query 1960 ATCAAAATTGTTTGAGCATCTAGGCATGAGGGCAGAATCTAAG-GGTGTCACATGTTTCA 2018
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||
Sbjct 2008 ATCAAAATTGTTTGACCGTCTAGGCATGAGGGCAGAATCT-AGAGGTGGCACATGTTTCA 2066
Query 2019 ATGGAGAGACTGTGATAGATAGAGGGGATGAAAGAGATGTT-GCAAGTGAACGAACCCAG 2077
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||
Sbjct 2067 ATGAAGAGACTGTGATAGATAGAGGGGATGAAAGAGAT-TTCGGAAGTGAAGGAACCCAG 2125
Query 2078 ATAGATGATGGTAGTCCTTTCTCCGAAATATATCAGCATAATGATTCTCGAGAGCCAGGG 2137
| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2126 AGAGATAACGGTAGTCCTTTCTCCGAAATATATCTGCATAATGATTCTCTAGAGCCAGGG 2185
Query 2138 GCCAATAAACTGCAAGGAAGTCCCTCCGAAGCACCAGTTGAACGACGCTCAATCGA-G-- 2194
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2186 GCCAATAAACTGCAAGGAAGTCCATCCGAAGCACCAGTTGAACGACGCTCAATCGAGGAA 2245
Query 2195 -----G---AATT-TCAGTCATCTGTAGATATGGAGTCCCATAGGAGTTCACCAGAGAAT 2245
| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2246 AATTCGCTAAATTATCAGTTATCTATAGATATGGAGTCCCATAGGAGTTCACCAGAGAAT 2305
Query 2246 GACCTTTTATCGTCTGTAGCTTTGTCAGGTCCTTTATTTCGGAGCACAATCTATCATCTG 2305
| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2306 GCCCTTTTATCGTCTGTAGCGTTGTCCGGTCCTTTATTTCGGAGCACAATCTATCATTTG 2365
Query 2306 AAAGTCCCAGGGTCTTCAGTTACGTCTCTGGGACCAGAATATACACTTCAAAACAAGTCA 2365
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2366 AAAGTCCCAGGGTCTTCAATTACATCTCTGGGACCAGAATATATACTTCAAAACAAGACA 2425
Query 2366 TATAGCCTATATAGTGATAAAAGACAATGTAGGAGCTTGACTCAAACTACAGTATATGAG 2425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 2426 TATAGCCTATATAGTGATAAAAGACAATGTAGGAGCTTGACGGAAACTATAGTATATGAG 2485
Query 2426 ACAAAAATTGGCTGCTACACCTGTAATTTGAAGGTGGACCCTTCTTGGCCTCTCTGCATG 2485
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2486 AAAAAAATTGGCTTCTACACCTGTAATTTGAAGGTGGACCCTTCTTGGCCTCTCTGCATG 2545
Query 2486 TACGAGTTACGCGGAAGGTGCAATAATGATGAATGTCCTTGGCAACATTTCAAGGATTTC 2545
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2546 TACGAGTTACGTGGAAGGTGCAATAACGATGAATGTTCTTGGCAACATTTCAAGGATTTC 2605
Query 2546 TCTGATGACAGTTTGCATCAAAGTCTACATGATCCTCCTGATGGTAGAGTTGGGTCAAGT 2605
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 TCTGATGACAGTTTGCATCAAAGTCTACATGA---TCCTGATGGTAGAGTTGGGTCAAGT 2662
Query 2606 TCACATCAGAAGAAACATAATTCTTCCAAAGGACCCCAGATTTTGGACACGGTGGTTTCA 2665
||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 2663 TCACATCAGAAGACACATAATTCTTCCAAAGGATCCCAGATTTTGGACTCAGTGTTTTCA 2722
Query 2666 CCATCTTATCTTGTCTCCTTGGATACGATGAAGGTTGACTCGTGGTCTTATGAGTCCGTT 2725
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2723 CCAACTTATCTTGTCTCCTTGGATACGATGAAGGTTGACTCGTGGTCTTATGAGTCCGTT 2782
Query 2726 CTGGCTCAAAGACATGGACAAATATGGTGGAAGCACTTTAGTGCCTGCCTAGCCTCATCA 2785
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 CTGGCTCAAAGACATGGACAAATATGGTGCAAGCACTTTAGTGCCTGCCTAGCCTCATCA 2842
Query 2786 AACTCGCTTTACAGGAATGTACCTGCAAAGGAAAATGAAGGTCGAATTGAGGTCCTAGGA 2845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2843 AACTCGCTTTACAGGAATGTACCTGCAAAGGAAAATGAAGGTCGAATTGTGGTCCTAGGA 2902
Query 2846 AATTCAAAAACATACTCATCATACTTCAGGATTAAGCATAGC----T-T-G-----A--T 2892
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |
Sbjct 2903 AATTCGAAAACATACTCATCATACTTCAGGATTAAGCATAGCTTAATGTGGCACATATTT 2962
Query 2893 --GGCCCTTTCTTTGCTCTCACAATGTCTCGAAGGTGACCCAACTTCTGAGATTCTTTGG 2950
||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2963 CAGGCCCTTTCTTTGCTTTCACAAGGTCTTGAAGGTGACCCAACTTCTGAGATTCTTTGG 3022
Query 2951 ACTGTTTATCTCCTGATTTACCATGTATATGAAGGATCAGATGGGAAAGATATGTTTTCT 3010
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3023 GCTGTTTATCTCCTGATTTACCATGCATATGAAGGATCAGATGGGAAAGATATGTTTTCT 3082
Query 3011 TATGGGGTCAAACACAGTAGCAGATCATACGTAATTTGGCTTATGTACATCAACAGTCGA 3070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083 TATGGGGTCAAACACAGTAGCAGATCATACGTAATTTGGCTTATGTACATCAACAGTCGA 3142
Query 3071 GGACAACTTAGTGATCAATTTATTGCATATGATGCTGCCCTCTCAGCACTTTGCAACCAT 3130
|||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3143 GGACAACTTAATGATCAATTAATTGCATATGATACCGCCCTCTCAGCACTTTGCAACCAT 3202
Query 3131 GCGTCTGGGTCTATTGACAGGAATCATGCCAGCGCTTGCATATTAGATGTTTTGTTGCAG 3190
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3203 GCATCTGGGTCCATTGACAGGAATCATGCCAGCGCTTGCATATTAGATGTTTTGTTGCAG 3262
Query 3191 ATGTTCAATCTTTTGTGCATTTCTGGGAATGTTTCAAAGGCAATACAGAGAATATCCAAG 3250
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3263 ATGTTCAACCTTTTGTGCATTTCTGGGAATGTTTCGAAGGCAATACAGAGAATATCCAAG 3322
Query 3251 CTTCAGGCTCCAGCAGCAGTTTCTGATGATCCTGACTTTTCACTGATGTCTCACATTCTC 3310
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3323 CTTCAGGCTCCAGCAGCAGTTTCTGATGACCCTGACTTTTCACTGATGTCTCACATTCTC 3382
Query 3311 ACATGCTTAACATATTCTGACAAATGTGTGTTCTGGGTTTGTTGTGTGTACTTAGTTATT 3370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3383 ACATGCTTAACATATTCTGACAAATGTGTGTTCTGGGTTTGTTGTGTGTACTTAGTTATT 3442
Query 3371 TACAGGAAGCTACCTCAGTCTATTGTCCAACGACTTGAAATGGAGAAGGAACTACTTGAA 3430
||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3443 TACAGGAAGCTGCCTGACTCTATTATCCGACGACTTGAAATGGAGAAGGAACTACTTGAA 3502
Query 3431 ATAGAATGGCCAT-CTGTTAATTTGGATGGTGATGTGAAGCAAATGGCGCTCAGACTATT 3489
||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3503 ATAGAATGGCC-TACTGTTAATTTGGATGGTGATCTGAAGCAAATGGCGCTCAGACTATT 3561
Query 3490 TGATAAAGGGATGCGTTCCGTAGAACATTGTACCAATGGGTTGTCTGAAAATGGAATACA 3549
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||
Sbjct 3562 TGATAAAGGGATGCGTTCCGTAGAACATGGTACCAA--------C----AATGGAATACA 3609
Query 3550 AAAGCGACCTGCTGGGCTATTTGCTCTGAACCATGCCCTGTTTATGGTTGCAGTAGATGA 3609
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3610 AAAGCGACCTGCTGGGCTATTTGCTCTGAACTACGCCCTGTTTATGATTGCAGTAGATGA 3669
Query 3610 ATTGGAAAGCTGTAGGGACATTTTGAAGGCATCTGTTAAACTCTACCCAACTTGCTTGGA 3669
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3670 GTTAGAAAGCCGTAGGGACATTTTGAAGGCATCTGTTCAACTCTACCCAACATGCTTGGA 3729
Query 3670 GCTGAAATTGTTAGCAGTTAGGATGCAATCAAAGGAGTTAAAGGATATGTTTTCGTCTGG 3729
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3730 GCTAAAATTGTTAGCAGTTAGGATGCAATCAAATGAGTTAAAGGATATGTTTTCGTCTGG 3789
Query 3730 GTTTGAAGAGCTTCTCAAGCAGGAAGCAAAAGAGGCATCATGCATACAATGTATTTGGAA 3789
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3790 GTTTGAAGAGCTTCTCAAGCAGGAAGCAAAAGAGGCGTCATGCATACAGTGTATTTGGAA 3849
Query 3790 TCAGTATGCTGAATATGCTTTGCAAGGAGGGAGCTACGACTTGGCAAGAGAACTCATGTC 3849
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3850 TCAGTATGCTGAATATGCTTTGGAAGGAGGAAGCTACGATTTGGCAAGAGAACTCATGTC 3909
Query 3850 CCGTTGGTAC-GTGTCAGTATGGGATGTATTGTCCCATAAGAATAAGACAGTAC-TGGCT 3907
||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 3910 CCGGTGGTACGGT-TCAGTATGGGATGTTTTGTCCCATAAGTATAAGACAGTACGAGGC- 3967
Query 3908 AATGAAGAAGAAGGTGATGATAGTTTGCTGGAATCAGCGTTATCAGATCTTAATGTTGCA 3967
|||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3968 AATGAAGAAGAAGGGGATGATAATATGCTGGAATCAGCTTTATCAGATCTAAATGTTGCA 4027
Query 3968 TCGGATCAGGTGGATGTGATGTTTGGCTATCTTAATCTCTCGCTGCATAATCTACTGCAG 4027
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4028 TCGGATCAGGTGGATGTGATGTTTGGATATCTTAATCTCTCTCTGCATAATCTACTGCAG 4087
Query 4028 AGTAACTGGACCGGGGCTCGCTTGGCCATTGACCAAGCACTAAAAGCTACAGCTCCTGAG 4087
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4088 AGTAACTGGACTGAGGCTCGCTTGGCCATTGACCAAGCACTAAAAGCAACAGCTCCTGAG 4147
Query 4088 CATTTTATGCACTGTCTTAGAGAGCATGCTGTGTTTCAGCTAATCAACGAGTTGCAAGCA 4147
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4148 CATTTCATGCACTGTCTTAGAGAGCATGCTGTGTTTCAGCTAATCAACGAGTTGCAAGCA 4207
Query 4148 ACGGGTGAATTTTCAATCAACCTACAAATGAGATTACTCAACTCTTATTTGGATCGAGCA 4207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4208 ACGGGTGAATTTTCAATCAACCTACAAATGAGATTACTCAACTCTTATTTGGATCGAGCA 4267
Query 4208 AGTTCTTTACCTGTAAAAGAGCCACTATCTTGGAAGTTCATCAGCAACAGCGCTGAGAAA 4267
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4268 AGTTCTTTACCTGTAAAAGAGCCACTATCTTGGAAATTCATTAGCAACAGCGCTGAGAAA 4327
Query 4268 CCGAGAGTCAGGAAGCTAGTTACTAACCTTCTTGCTCCAGTTTCATCTGAACTCTTAGTG 4327
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4328 CCAAGAGTCAGGAAGCTAGTTACTAACCTTCTGGCTCCAGTTTCATCTGAACTCTTTGTG 4387
Query 4328 GTGAATGTTGTTCTCGAAGCATGGCACGGACCATCTCTTGTACCTGAGAAGCTAAGTAAA 4387
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4388 GTGAATGTTGTTCTTGAAGCATGGCACGGACCATCTCTTGTACCCGAGAAGCTAAGTAAG 4447
Query 4388 CAAAAGGAACTGGTGGATTTTGTGGAAACAATCTTAGGGTTGGTTCCATGCAATTATCCA 4447
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 4448 CAAAAGGAACTGGTGGATTTTGTGGAAACAATCTTAGGGTTGGTTCCAAGCAATTACCCG 4507
Query 4448 CTGGCTTTGTCTGTAAGTAAGCTGTTAAGGAAAGAAGAGAAACATTCAGATTCTGGTTCC 4507
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4508 CTGGCTTTGTCTGTAAGTAAGCTGTTAAGGAAAGAAGAGAAACAATCAGATTCTGGTTCC 4567
Query 4508 TCCTCGGGTATTCATTTCTGGGCAGGTCTGAATTTGGTGAGTACAATATCTTGTGCCATC 4567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4568 TCCTCGGGTATTCATTTCTGGGCAGGTCTGAATTTGGCGAGTACAATATCTTGTGCCATC 4627
Query 4568 CCAGTAGCTCCGGAGTATATTTGGGTGGAGGCTGGAGAAATAGTGAGCAATATCAATGGT 4627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4628 CCAGTAGCTCCGGAGTATATTTGGGTGGAGGCTGGAGAAATAGTGAGTGATATCAATGGT 4687
Query 4628 TTCAAGACAAGAGCTGAGAGATTCTTGAAGAAAGCTTTGTCTGTATATCCAATGTCTGTG 4687
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4688 TTCAAGACTAGAGCTGAGAGATTCTTGAAGAAAGCATTGTCTGTATATCCAATGTCTGTG 4747
Query 4688 AAGTTATGGAGATGTTATCGGAGTTTATGCAAAAGTATAGAAGAGAGAAGAGGTATTGAG 4747
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4748 AAGTTATGGAGATGTTATTGGAGTTTATGCAAAAGTATAGAAGAGAGAAGGGGTATTGAG 4807
Query 4748 ATCGAAGAAGCAGCCATAAAGAAAGGAATCACTCTTGATTGAAAAGTATTAAGTCTTTTG 4807
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 4808 ATCGAAGAAGCAGCCAGAAAGAAAGGAATCACTCTTGCTTGAAAC-TATTAAGTCTTTTG 4866
Query 4808 AATTTTGTCCCCCTATATATAG 4829
| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4867 ATTTTTGTCCCCCTATATATAG 4888
Score = 1602 bits (867), Expect = 0.0
Identities = 1089/1194 (91%), Gaps = 24/1194 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCCCATCTTAACGAAAGCTGTGATTGTCCTTCGTCTTTCGATATTATTCTTAGG-TTTTG 59
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||
Sbjct 27 TCCTATCTTAACGAAAGCTGTGATTCTCCTTCGTCTTTCAATATCATTCTTAGGTTTTTG 86
Query 60 AAATTCATGTGTTGTGAGAGCCTAGGAAGATGACGACACCAATCACCGCGAAACACGT-T 118
|||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || | |
Sbjct 87 AAATTCATGTGTCGTAAGAACCGAGGAAGATGACGACACCAATCACCGGGAAAAAC-TCT 145
Query 119 CCGGTTACCGGAAAAGAAGAAGGCGAGCTATCTGCTTCCGACGACGAAGTTCAACCAATG 178
|| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 146 CCTGTTACCGGAAAAGAAGAAGGCGAACTATCTACCTCCGACGACGAAGTACAACCAATG 205
Query 179 CAAACAAGCACAAGAGCTCCTCCTACTGAACATGTATCAGTTCCTTCAGCTAACACAAAT 238
||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||
Sbjct 206 CAAACAAGCACGAGATCTCCTCTTACTGAACA--TAT-A------TCAGCAAACACAAAT 256
Query 239 ATCCAAAGGCCTCAAGCGGGAAATGGTGGATCTTTAATTAAGCCTTCTGATGCTACACCG 298
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 ATCCAAAGGCGTCAAGCTGGAAATGGTGGATCTTTTATTAAGCCTTCTGATGCTACACCA 316
Query 299 AC-AAGGCTGACACACCCTGGAGGCCGGATATTTGAGAAGAAGCAAGCCATTGCTGCCAT 357
|| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 317 ACGAA-GCTGACAAACCCTGGAGGCCGGATTTTTGAGACGAAGCAAGCCATTGCTGCCAT 375
Query 358 TCATGGGAAGAAATTTCCTGCAAGGGGCAACAACAGCAACCTCGTGATAAACTTCTCAGA 417
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 TCATGGGAAGAAATTTCCTGTAAGGGGCAACAACAGCAACCTCGTGATAAACTTCTCAGA 435
Query 418 TGATGATAGTGGTAGTGAATCTGATGGTAACAG-ACGGACACAGACATCAAACATTCAAT 476
||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 436 TGATGATAGTGGTAGTGAATCTGATTGTAA-AGGACGTACACAGACATCAAAGATTCAAC 494
Query 477 CAAAGGGAACCATGTCTGGGAATAGAAACCCGTCTACATTTTCACAAACAAAATTGAAAG 536
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 CAAAGGGAACCATATCTGGGAATAGAAACCCGTCTACATTTTCACAAACAAAATTGAAAG 554
Query 537 GACCAAGACAAACTGATA-ACCGAGCCATAACTAAGAAGCCATTGCCCACTAGCACCTTT 595
|||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 555 GACCAAGACAGATTGATATAA-GAGCCATAACAAAGAAGGCATTGTCCACTAGCACCTTT 613
Query 596 AGTCATGCTGCGACTTCCAAAGTTTCCAACCTTTCATCTGCTAAGGAAATGAAATCCAAT 655
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 614 AGTCATGCTGCGACGTCCAAAGTCTCCAACCTTTCATTTGCCAAGGAAATGAAATCCAAT 673
Query 656 AAAAATATTCATACCTCTGAAATGACGGTTAGCAAAGATACACGGCTTCCTGAACAGATT 715
||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||
Sbjct 674 AAATATATTCATTCCTCTGAAAGGACGGTTAGCAAAGATGCACAGCGTCCTGAACAGATT 733
Query 716 GTGAA-TCCCAATAACATCAAACTTCAGGATTTGAAGCAGCAGATTGCGCTTCGGGAAAG 774
||| | ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GTGGAGTCC-AATAGCAACAAACTTCAGGATTTAAAGCAGCAGATTGCGCTTCGGGAAAG 792
Query 775 TGAGCTGAAGCTTAAGGCTGCACAGCCAAAGAAGGATGCTATTAACCCAAAAATCAGTCC 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 793 TGAGCTGAAGCTTAAGGCTGCACAGCCAAAGAAGGATGCCGTTAACCCAAAAATCACTCC 852
Query 835 AGCAAGGAGAGTCAGTATTATTTCTGATGATACTAGACAGCTAGAACCAAACGAACCTGC 894
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 853 AGCAAGGAGGGTCAGTATTATTTCTGATGATACTAGACATCTAGAACCAAACGAACCTCC 912
Query 895 CAAGAAGCGCTTAAAAGTTAGTGGAATTGACACAAGTCAGCCTGTTACTGATTACAGAGT 954
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 913 CAAGAAACGTTTAAAAGTTAGTGGAATTGACACAAGTCAGCCTGTTATTGATTACAGAGT 972
Query 955 GCCAGCATCTGCTGCCGCACCAATGGATGTGCCAGACATCCGTAAAAGTCTACTGCCAGG 1014
| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 973 GGCAGCATCTGCGGCTGCACCAATGAATGCGCCAGACATCCGCAAAAGTCTACTGCCAGG 1032
Query 1015 TGTCAATGCAAATCCTAGTTGCAAGCACCTTGGAAGTAACAGTGATGAGATTGTTCCACC 1074
||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 TGTCAATGCAAATTCTAGTTGCAAACACCTCGGAAGTAAGAGTGATGAGATTGTTCCACC 1092
Query 1075 TGTTGTTTCACAGCACACTGTGGAAGGAAATACTAGCTCAAGTGTCGTACAAAAAAG-AG 1133
|||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1093 TGTTATTCCTCAGCATACTGTGGAAGGAAATACAAGCTCAAGTGTCTTACAAAAAAGCAC 1152
Query 1134 CTGGCAAAGCT-AATTGTTACGAAGGTGGAAGAGAACTGGAAACAATGAAAAAT 1186
| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1153 C-GGCAAAG-TGAATCATTACGAAGGTGGAAGAGAACTCGAAACAATGAAAAAT 1204
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 242206000804
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5