BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg483012
Length=2802
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carbo... 4510 0.0
AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate ... 2322 0.0
> AT2G39800.1 | Symbols: P5CS1, ATP5CS | delta1-pyrroline-5-carboxylate
synthase 1 | chr2:16598164-16603319 REVERSE LENGTH=2886
Length=2886
Score = 4510 bits (2442), Expect = 0.0
Identities = 2701/2823 (96%), Gaps = 29/2823 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTTCCACGGCGCTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCCCT 60
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1 CTTCCACGGCGTTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCTAT 60
Query 61 AGCGCCACAATCCCCTACAACACACCCTACTCTCCTTACCATACACCACCCAACGACCAC 120
||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 61 AGCGCCACAATCCTCTACATCACACCCTAATCTCATTACCATACACCACCCAACGAACAC 120
Query 121 GCGCCACTTCATCTGTCAGTGTCTAAAATACCAAATCTACCCTTA-TTCCAACACGTGGC 179
|||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 121 GCGCCACTTCATTTGTTAGTATCTAAAATACCAAACCTACCCTTAGTTCC-ACACGTGGC 179
Query 180 GCTTCATGGTTTGGTAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTTGTTGGTGTTTATAAACCCCTT 239
| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 180 GTTTCCTGGTTTGATAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTCGCTGGTGTTTATAAACCCCTT 239
Query 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTA-TTT-TTA-C----- 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
Sbjct 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTATTTTCTTACCTTAAA 299
Query 292 -ACG-C--TGCTTCACTGATTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTCTGTGTGGTGTGG 347
||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 300 TACGACGGTGCTTCACTGAGTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTC--TGT-GTGTGG 356
Query 348 TTTTGGT--A-GACGACGACGATAATGGAGGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGA 404
||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 357 TTTTGGTAGACGACGACGACGATAATGGAGGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGA 416
Query 405 GACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGA 464
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 417 GACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGA 476
Query 465 TTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 524
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 TTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 536
Query 525 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATAT 584
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 537 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCAGGCAAAGGCTTCGTTAT 596
Query 585 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 656
Query 645 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGAC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 657 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGAC 716
Query 705 CAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGAT 764
||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 717 CAGCTTGATGTGACGGCAGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGAT 776
Query 765 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCCATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 824
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCTATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 836
Query 825 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCTTATCAGGATTCTTCTGGTATT 884
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTATT 896
Query 885 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 944
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 956
Query 945 ATTCTCCTGAGTGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1004
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 ATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1016
Query 1005 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1076
Query 1065 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCT 1124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1077 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCT 1136
Query 1125 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGACAAAGTCCTCAGA 1184
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1137 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACATAGATAAAGTCCTCAGA 1196
Query 1185 GGACTGCGTGTTGGAACCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1244
||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 GGACTACGTGTTGGAACCTTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1256
Query 1245 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1316
Query 1305 TCTTCAGAAGATAGGaaaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGAA 1364
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 TCTTCGGAAGACAGGAAAAAAATTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTT 1376
Query 1365 ACAAGAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1424
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 ACTACAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1436
Query 1425 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1496
Query 1485 GTTCGTAAGCTAGCTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1544
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 GTTCGTAAGCTAGCTGATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1556
Query 1545 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTT 1604
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1557 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTT 1616
Query 1605 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1676
Query 1665 CTTCTGTTGAAGGGTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATT 1724
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1677 CTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATC 1736
Query 1725 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1796
Query 1785 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAG 1843
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1797 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGCTTGAT-GACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAG 1855
Query 1844 CAACAAGCTTGTTACTCAGATTGAAAATACTACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTG 1902
||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || ||||||||
Sbjct 1856 CAACAAGCTTGTTACTCAGATAAAAAATACTACAAAAATCCCTGTGCTAGG-TCATGCTG 1914
Query 1903 ATGGAATCTGTCATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1962
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 ATGGAATCTGTCATGTATATGTCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1974
Query 1963 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGC 2022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1975 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGC 2034
Query 2023 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATG 2082
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2035 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATG 2094
Query 2083 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCA-ATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2141
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGT-AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2153
Query 2142 TCATTTAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2201
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 TCATTCAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2213
Query 2202 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2273
Query 2262 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAAC 2321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 2274 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAAC 2333
Query 2322 GCAAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGC 2381
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2334 GCCAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGC 2393
Query 2382 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2441
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2394 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2453
Query 2442 ATAATGAGAGGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2501
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 ATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2513
Query 2502 GACATTCCCATCCAAGCTTAAAACCAGACTTC-GAGTGTGTCTTTTTGTGTTTGGTTGAG 2560
|||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||
Sbjct 2514 GACATTCCCATCCAAGCTTAAA-CAAGACTTCCGAGTGTGTGTTTGTGTATTTGGTTGAG 2572
Query 2561 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTT-GTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTTTGTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2632
Query 2620 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2692
Query 2680 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTGGTCTTGCTCA 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2693 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTAGTCTTGCTCA 2752
Query 2740 TAAGTAAGATGAAGAACATTTTATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACC 2799
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 TAAGTACGATGAAGAACATTTAATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACA 2812
Query 2800 TTT 2802
|||
Sbjct 2813 TTT 2815
> AT3G55610.1 | Symbols: P5CS2 | delta 1-pyrroline-5-carboxylate
synthase 2 | chr3:20624020-20629093 REVERSE LENGTH=2543
Length=2543
Score = 2322 bits (1257), Expect = 0.0
Identities = 1862/2153 (86%), Gaps = 46/2153 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 374 GGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGAGACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGG 433
|||| | ||||||||||| || || || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 110 GGAGATCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGG 169
Query 434 GACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGC-ACTGT 492
||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |
Sbjct 170 GACTGCAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCTA-TCT 228
Query 493 GTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTG 552
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 229 GTGAACAGCTTGCGGAGTTAAACTCAGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTG 288
Query 553 CGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATATC-GACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCG 611
| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 289 CCGTTGGTCTTGGTCGACAAAGGCTTCGATA-CAGACAATTAGTCAACAGCAGTTTTGCA 347
Query 612 GATCTT-CAGAAGCCTCAGACT-GAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAA 669
||| || |||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 348 GAT-TTACAGAAGCCACA-AATGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGGCAGA 405
Query 670 GCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGACCAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAAC 729
||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||
Sbjct 406 GCAGTCTCATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGTTGGATGTGACGGTTGCTCAAA 465
Query 730 TTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTG 789
| || |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 466 TGCTTGTGACCGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACTG 525
Query 790 TC-AAGTCCATGCTTGA-TTTGAGGGTTATTCCAATTTTCAATGAGAATGATGCTATTAG 847
|| ||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 526 TCAAAG-CGATGC-TGAGGATGAGGGTTATTCCAGTTTTCAATGAGAATGATGCTATAAG 583
Query 848 CACCCGAAGAGCCCCTTATC-AGGATTCTTCTGGTAT-TTTCTGGGATAACGATAGCTTA 905
||| || |||||||| || | |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||
Sbjct 584 CACTCGCAGAGCCCCCTA-CAAGGATTCTACTGGTATATTT-TGGGATAATGACAGCTTA 641
Query 906 GCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTGATTCTCCTGAGTGATGTTGAA 965
|| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||
Sbjct 642 GCCGCTCTTCTGTCGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAG 701
Query 966 GGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAGTTGATCCACACTTTTGTTAAA 1025
|| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||| || |||||
Sbjct 702 GGCCTTTACACTGGCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAATTAATACACACATTCATTAAA 761
Query 1026 GAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAA-T-CAAGATTAGGGA-GAGGGGGT 1082
|||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||| ||||||||
Sbjct 762 GAAAAACACCAGGACGAGATTACTTTTGGCGA-AAAGTCCAA-ATTA-GGACGAGGGGGT 818
Query 1083 ATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCTGG-GATTCCTGTCATCAT 1141
|||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||
Sbjct 819 ATGACTGCAAAAGTTAAAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCG-TTCCTGTTATCAT 877
Query 1142 AACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGA-CAAAGTCCTCAGAGGACTGCGTGTTGGAA 1200
||||||||| ||| |||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 878 AACCAGTGGATATGCAGCTGAGAATA-TAAGTAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTA 936
Query 1201 CCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGATTCTAATGCTCGTGACA 1260
|| | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||
Sbjct 937 CCCTGTTCCATCAAGATGCTCATTTATGGGCTCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACA 996
Query 1261 TGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGa 1320
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TGGCAGTTGCTGCAAGGGAAAGCTCAAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGA 1056
Query 1321 aaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGA-AACAAGAATCAAAGCT 1379
|| ||||||| | || |||||| |||||||||||| |||||| || || ||| ||||||
Sbjct 1057 AACAAATTCTACACGACATTGCCAATGCCCTTGAAGTAAATGAGAA-AACAATTAAAGCT 1115
Query 1380 GAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGT-TGGAAGAGTCAATGGTGGC 1438
|||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| |||| ||
Sbjct 1116 GAGAATGATTTAGATGTTGCTGCAGCACAAGAAGCTGGATAT-GAAGAGTCTTTGGTAGC 1174
Query 1439 TCGCTTAGTTATGACA-CCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCAGTTCGTAAGCTAG 1497
|||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1175 TCGCTTAGTTATGA-AGCCTGGGAAGATCTCAAGCCTTGCAGCTTCCGTTCGCCAGCTAG 1233
Query 1498 CTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTGGCAGATGGTCTTG 1557
| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||
Sbjct 1234 CCGAAATGGAAGATCCAATAGGCCGTGTATTAAAGAAAACTCAGGTTGCAGATGATCTTA 1293
Query 1558 TCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTTGAATCCCGACCTG 1617
| ||||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1294 TTTTAGAGAAGACCTCATCACCAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTG 1353
Query 1618 ATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGTCTTCTGTTGAAGG 1677
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1354 ATGCACTTGTTCAGATAGCTTCGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGG 1413
Query 1678 GTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATTACTGATGCAATTC 1737
||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1414 GTGGAAAGGAGGCTCGTCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTC 1473
Query 1738 CAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATT 1797
| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 1474 CGGAGACTGTTGGAGGTAAACTCATAGGACTTGTGACCTCAAGAGAGGAGATTCCTGATT 1533
Query 1798 TGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT 1856
|||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 TGCTCAAGCTTGAT-GACGTTATTGATCTTGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTT 1592
Query 1857 ACTCAGATTGAAAATACT--ACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTGATGGAATCTGT 1913
|||| | | |||| ||| ||| |||| | || || || ||||||||||||||||||
Sbjct 1593 TCTCA-AAT-AAAAAACTCGACGAAAATCCCAGTGCTAGG-CCATGCTGATGGAATCTGT 1649
Query 1914 CATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATAC-GGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGC 1972
||||| ||||| || |||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1650 CATGTATATGTTGATAAGTCTGGT-AAACTGGACATGGCAAAGCGCATTGTTTCCGATGC 1708
Query 1973 AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGCATAAGGATCT 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |
Sbjct 1709 AAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTT 1768
Query 2033 AGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATGGAGTCACTTT 2092
|||||||||| | | ||| |||| ||||||| || ||| || | ||| || ||||||||
Sbjct 1769 GGAGCAGAATGGTTTTCTCGATGATCTTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTT 1828
Query 2093 GTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCAATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATTTAACCA 2152
||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| || |||||| ||||
Sbjct 1829 GTATGGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAAAACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCACCA 1888
Query 2153 TGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGA 2212
|||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1889 CGAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCGTTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGA 1948
Query 2213 TCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCAC-GAAG 2271
||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | ||||
Sbjct 1949 TCATATTCACCAACATGGAAGTGCACACACTGATTGCATAGTGACGGAAGAT-AGTGAAG 2007
Query 2272 TTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAACGCAAGCACAA 2331
| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2008 TAGCAGAAATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAA 2067
Query 2332 GATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGCACGGGCAGGA 2391
||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 2068 GATTCTCTGATGGTTTTAGGTTCGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGA 2127
Query 2392 TCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTT-ACAACGAGATGGATAATGAGA 2450
| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct 2128 TTCATGCCCGTGGTCCAGTTGGAGTTGAAGGATTA-TTGACAACAAGATGGATAATGAGA 2186
Query 2451 GGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGA 2503
||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2187 GGAAAGGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGAATCGTTTACACCCATAAGGA 2239
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 139213266825
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5