BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg483135
Length=5100
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G40770.1 | Symbols: | zinc ion binding;DNA binding;helicase... 3683 0.0
> AT2G40770.1 | Symbols: | zinc ion binding;DNA binding;helicases;ATP
binding;nucleic acid binding | chr2:17013269-17021315
REVERSE LENGTH=5261
Length=5261
Score = 3683 bits (1994), Expect = 0.0
Identities = 2280/2415 (94%), Gaps = 32/2415 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2714 ATT-CTCCAGACAGTGGTTTAAAGAAGGATGGAGAGTATCATGAAGAATGCAAAACTCTG 2772
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 ATTGCTCCAGACAATGGTTTAAAGAAGGATGGAGAGTGTCATGAAGAATGCAAAACTCTG 2853
Query 2773 AATATAGTTTGTGACACATTGAAAGTTAAGTATTTATCCGCATTCAACTCAAAGCTATCT 2832
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2854 GATATAGTTTGTGACACACTGAAGGTTAAGTATTTATCCGCATTCAACTCAAAGCTTTCT 2913
Query 2833 GCAGCACAGCAGGAATTCAAAAAATCATACAATCAGGTTTCTGAGTCGTTGAGCAATATG 2892
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2914 GCAGCACAGCACGAATTCAAAAAATCATACAATCAGGTTTCTGAGTCGTTGAGCAATATG 2973
Query 2893 GGGAAACAACGTTCAGTTTGGTGGTTGGATGCCCTGCAACTTGCTGAACAGAATAAAGAC 2952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2974 GGGAAACAACGTTCAGTTTGGTGGTTGGATGCCCTGCAACTTACTGAACAGAATAAAGAC 3033
Query 2953 TTCTCTAGCGAGTTGACCAGGAAGATTGAAGAGATCCTCCATGGAAGCTTAAACAATTCA 3012
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3034 TTCTCTAGCGAGTTGACAAGGAAGATTGAAGAGGCCCTCCATGGAAACTTAAACAATTCA 3093
Query 3013 AGCTCCTCCAGAGCGAGTTCTCGCTTTAGAACTATACATGGCATGAAACTTCATCTGCAA 3072
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3094 AGCTCCTCCAGAGAGAGTTCTCGATTTAGAACTATACATGGCATGAAACTTCATCTGCAG 3153
Query 3073 ACTTGTATGGATATGCTGGAGAGCTCTAGAAAGAAAGTGATAGATAGGATTCTAGAAATT 3132
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 ACGTGTATGGATATGCTGGAGAGATCTAGAAAGAAAGTGATAGATAGGATTCTAGAAATT 3213
Query 3133 GACCAGACTATGGAGAAACCAAAATTGGAGGATATTGAGCGTATTAGCAACTGCAAGTAT 3192
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 GATCAGACTATGGAGAAACCAAAGTTGGAGGATATTGAGCGTATTAGCAACTGCAAGTAT 3273
Query 3193 TGCAAGAAGAAGGA-TGATGGCCCCACGTGTATTCATTGCGAGCTAGATGAATTATTCCA 3251
||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3274 TGCAATAAGAA-TAGTGATGGCCCCCCGTGTATTCATTGCGAGCTAGATGAACTATTCCA 3332
Query 3252 GGAATATGAGGCTAGGCTTTTCCGTCTTAACAAATCTCGCAGGGGAGTAATGGAAATTGC 3311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3333 GGAATATGAGGCTAGGCTTTTCCGTCTTAACAAATCTCGCAGGGGAGTAATGGAAATTGC 3392
Query 3312 GGCTGCTGAAGAGACGGTACATTTGCAGAAGAAGAGAGATGCTCTTAATCTTTTCTTTA- 3370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 3393 GGCTGCTGAAGAGACGGTACATTTGCAGAAGAAGAGAGATGCTCGTAATCTTTT-TTTAT 3451
Query 3371 TTGGTTTGTCATCAAGAAGCAAGGATCTAAATGCACCACGTGGTGATGATGAGGAGCCAA 3430
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3452 TTGGTTTATCATCAAGAAGCAAGGATCTAAATGCATCACGTGGTGATGACGAGGAGCCAA 3511
Query 3431 CCAAAAGAAATGCTGGTGACACCGTGGTTGTTTCTAAATCTCCATCTGAGACGGAAATAG 3490
||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3512 CCAAAAGAAATGCTGGTGACATTGTGGTTCTTTCAAAATCTCCATCTGAGACGGAAATAG 3571
Query 3491 TTCTTGGAGTGATAAGAAACCATTGCAAAACTCATTTAGATAGGGAAAGCAAATTGGCAG 3550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3572 TTCTTGGAGTGATAAGAAACCATTGCAAAACTCATTTAGATAGGGAAAGCAAATTGGCAG 3631
Query 3551 CCACAAAACATTTGCATACCCTTGAGGTGATGCGAAAGGAATATGCACATGCAAGGGCCT 3610
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3632 CTACAAAACATTTGCATACCCTTGAGGTGATGCGAAAGGAATATGTACATGCAAGGGTCT 3691
Query 3611 TGGCTAGGGCTCAAGCTCAACTCCTACGTGCCTATGATGAGATTAACATGTCAACAATGA 3670
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3692 TAGCTAGGGATCAAGCTCAACTCCTACGTGCCTATGATGAGATTAACATGTCAACAATGA 3751
Query 3671 GACTACAGCTTAAG-GAATCTGAAGATGACACATCTATCTATGCTTTGAGCCGGGATGAG 3729
||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3752 GACTACAGCTT-AGAGAATCGGAAGATGACACATCGATCTATGCTTTGGGCCGGGACGAG 3810
Query 3730 TTAGATGTTGCTAGTGTGCTGAACACAAATGATAAATTTATGGCTCAATCCTCGGTGCTT 3789
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3811 TTAGATGTTGCTAGTGTGCTGAACACAAATGACAAATTTATGGCTCAATCCTCGTTGCTT 3870
Query 3790 AGTATCAAAGGGAAACTTCGTTATTTGAAGGGTTTGATCAAATCCAAACAGAAACAAGAA 3849
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3871 AGTATAAAAGGGAAACTTCGTTATTTGAAGGGTTTGATGAAATCCAAACAGAAACAAGAA 3930
Query 3850 TCTGAGAGTCCAGATCTTTCCTCACCAATTCACGAAACACTTGAGGCTTCAGATCCTGTT 3909
|| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||| ||||||| |
Sbjct 3931 TCCGAGAGTCCAGATCTTTCCTCACCAATACATGAAACAGTCGATGCTTCGGATCCTGCT 3990
Query 3910 GAACAGGAAGGAGAAAACCTGCTTAAGCGAGATGAAGCATGCCCGATTTGTCAAGAAATT 3969
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3991 GAACAGGAAAGCGAAAACCTGCTTAAGAGAGATGAAGCATGCCCGATTTGTCATGAAATT 4050
Query 3970 CTACGGAATCAGAAGATGGTTTTCCAGTGCGGGCATTCCACTTGCTGTAACTGCTTTTTT 4029
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4051 CTAAGGAATCAGAAGATGGTTTTCCAGTGCGGGCATTCCACTTGCTGTAACTGCTTTTTT 4110
Query 4030 GCTATGACTGAGCGCAAATCAGTTCAAGAAACGCTGCAAAAGTGGGTGATGTGTCCAATA 4089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4111 GCTATGACTGAGCGCAAATCAGTTCAAGAAACGCTGCAAAAGTGGGTGATGTGTCCAATA 4170
Query 4090 TGCAGGCAGCATACAGATGTTAGAAATATTGCATATGCTGATGACAGACGAAACAGTTCT 4149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 4171 TGCAGGCAGCATACAGATGTTAGAAATATTGCATATGCTGATGATAGAAGAAACAGTTCT 4230
Query 4150 TCGTCAGATCAAGATCACAAAGACAATGAAGCATCATTGGTGGTTCAAGGTTCATATGGA 4209
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4231 TCGTCAGATCAAGATCACAAAGACAGTGAAGCATCATTGGTGGTTCAAGGTTCATATGGA 4290
Query 4210 ACAAAGATCGAAGCTGTTACTAGAAGAATCTTATGGATCAAGTCAAGTGACCCGCAAGCA 4269
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 4291 ACAAAGATTGAAGCTGTTACTAGAAGAATCTTATGGATCAAGTCAAGTGACCCACAAACG 4350
Query 4270 AAGGTTCTTGTCTTCTCCAGTTGGAACGACGTTCTTGATGTGTTGCAACATGCCTTCGCT 4329
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4351 AAGGTTCTTGTTTTCTCCAGCTGGAACGATGTTCTTGATGTGTTGGAACATGCCTTCGCT 4410
Query 4330 GCCAATAGCATCACCTGCATCCGGATGAAAGGAGGCAGGTAATCACAGACAGCCATTAGC 4389
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4411 GCAAATAGCATCACCTGCATCCGGATGAAAGGGGGCAGGAAATCACAGACAGCCATTAGC 4470
Query 4390 AAATTCAAGGGATCTGAGAAAGAAACCCAAAAGACAAA-TC--A--AAAA-GAGGAAAA- 4442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||
Sbjct 4471 AAATTCAAGGGATCTGAGAAAGAAACCCAAAAGACAAACTCCCATCAAAAAGAGGAAAAA 4530
Query 4443 TCCGATTCAAGTGTTATTGCTTTTGGTGCAGCATGGTGCCAACGGTCTTAATCTTCTAGA 4502
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4531 TC-GATTCAAGTGTTATTGCTTTTGGTGCAGCATGGTGCCAACGGTCTTAATCTTCTAGA 4589
Query 4503 AGCACAGCATGTTATTCTGGTGGAGCCGCTTCTAAATCCAGCTGCGGAAGCGCAAGCTGT 4562
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4590 AGCACAGCATGTTATTCTGGTGGAGCCACTTCTAAATCCAGCTGCGGAAGCGCAAGCTGT 4649
Query 4563 TGGGCGTGTTCACCGGATTGGACAAGAAAAACCTACTCTAGTTCATCGTTTTCTGGTAAC 4622
||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4650 TGGGCGTGTTCACCGAATTGGACAAGAGAAGCCTACTCTAGTTCATCGGTTTCTGGTATC 4709
Query 4623 GGGGACGGTGGAAGAGAGCATCTACAAACTGAACAGGAATAAGAATACAAACTTAAGTTC 4682
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4710 GGGCACAGTGGAAGAGAGCATCTACAAACTGAACAGGAATAAGAATACAAACTTAAGTTC 4769
Query 4683 ATTTAGCAGCAGGAATACAAAGAATCAAGATCAACAGTTCTTGACACTAAAAGATCTCGA 4742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4770 ATTTAGCAGCAGGAATACAAAGAATCAAGATCAACAGTTCTTGACACTAAAAGATCTTGA 4829
Query 4743 ATCTCTATTTGCTTCACCAGCAGCAGAAACAGCAGAGATAAAAGAAAACCCGGGAGAGAG 4802
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||
Sbjct 4830 ATCTCTATTTGCTTCACCAACAGCAGAAACAGCAGAGATGGAACAAAACCCAGGAGAGAG 4889
Query 4803 ACGGGAGAATCTGAGAGACCTACCACCCTCGGTCGCTGCAGCATTAGCAGCCGAGAGGAG 4862
|| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4890 ACAGGAGAATCTGAGAGATCTACCACCCTCAGTCGCTGCAGCATTAGCAGCCGAGAGGAG 4949
Query 4863 AATGAAGGAAAGCAGTGCATCCTCATCAGCTACAAACGCATCATGACTATGAAAAAGGTT 4922
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4950 AATGAAGGAAAGTAATGCATCCTCATCAACTACAAACGCATCATGACTATGGAAAAGGTT 5009
Query 4923 GCAGAGAGATTGGTTCCAGCCAAATGTTTGTTGTAGGGTCTTGTTGTATGTACATAAGAT 4982
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5010 GCAGAGAGATTGGTTCCAGCCAAATGTTTGTTGGAGCGTCTTGTTGTATGCACATAAGAT 5069
Query 4983 GGTGAAGAGAGAAGCT-CTC----T--T--T--C------GTGTCGTTTACATTCATTTT 5025
|||||||||||||||| ||| | | | | ||||||| || |||||| |
Sbjct 5070 GGTGAAGAGAGAAGCTGCTCGAAATAATACTTTCTCTTTTGTGTCGTCCACGTTCATTAT 5129
Query 5026 GTAGGTTAGGCAAAGAATAAGATCTTTTATTTATTCATTGTATTGCAACAGACATTACTT 5085
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5130 GTAGGTTAGGCAAAGGATAAGCTCTTTTATTTATTCATTGTATTGCAACAGACATTACTG 5189
Query 5086 TGTTAGGTCTTCTAT 5100
||||||||||||||
Sbjct 5190 CGTTAGGTCTTCTAT 5204
Score = 2867 bits (1552), Expect = 0.0
Identities = 1657/1709 (97%), Gaps = 2/1709 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1017 ATTCAGTACGG-ATGC-TGCAGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTTGAACTACTTGCT 1074
|||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1063 ATTCAGGGCGGTATCCTTGCTGATGAAATGGGATTGGGAAAAACGGTGGAACTACTTGCT 1122
Query 1075 TGCATCTTTTCTCATCGAAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCA 1134
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 TGTATCTTTTCTCATCGAAAACCAGCGGAGGATGAAATTTCTGTGTCTAATGGTTCATCA 1182
Query 1135 TTTACTGATGATTTGAACGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATA 1194
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GTTACTGATGTTTTGAACGCTGGCTTGAGAAGATTGAAAAGAGAACGTGTTGAGTGCATA 1242
Query 1195 TGTGGAGCTGTCAGTGAAAGTCGCAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGT 1254
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TGTGGAGCTGTCAGTGAAAGTCACAAATACAAAGGAGTTTGGGTACAGTGTGACCTTTGT 1302
Query 1255 GATGCTTGGCAGCATGCCGATTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAGGTAAGAAAGCT 1314
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1303 GATGCTTGGCAGCATGCCGACTGTGTAGGTTATTCACCTAAAGGGAAAGGTAAGAAGGAT 1362
Query 1315 AGTCAACATGTTGATGAAAAAGTATCTCAAAAGAAGAGCAAAAAGGATGCAACGGAAATT 1374
||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 AGTCAACATATTGATGAAAAAGCATCTCAAAAGAAGAGCAAAAAGGATGCAACGGAAATT 1422
Query 1375 ATTGACAGAGAAGGTGAATATATTTGCCAAATGTGCTCTGAACTTCTACAAGTCACTGCC 1434
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 ATTGTCAGAGAAGGTGAATATATTTGCCAAATGTGCTCTGAACTTCTACAAGTCACTGCC 1482
Query 1435 TCTCCCATCTCTACGGGTGCCACTCTTATTGTCTGTCCAGCTCCTATATTACCACAATGG 1494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1483 TCTCCCATCTCTACGGGTGCCACTCTTATTGTCTGTCCAGCTCCTATATTACCGCAATGG 1542
Query 1495 CATTCCGAGATTACACGCCATACACGCTTGGGATCTCTCGTAACATGTATCTATGAAGGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 CATTCCGAGATTACACGCCATACACGCTTGGGATCTCTCATAACATGTATCTATGAAGGT 1602
Query 1555 GTGAGGAACGCCTCACTTTCTGAAGAACCTATGATTGACATCACTGAACTCCTCAATGCT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1603 GTGAGGAACGCCTCACTTTCTGAAGAACCTATGATTGACATTACTGAACTTCTCAATGCG 1662
Query 1615 GACATTGTTTTAACTACATATGATGTCCTTAAAGAGGACTTGACACATGACTTCGACAGG 1674
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 GACATTGTTTTAACTACGTATGATGTCCTTAAAGAGGACTTGACACATGACTTCGACAGG 1722
Query 1675 CATGATGGTGACCGGCATTGTCTTAGATTCCAGAAAAGGTACCCTGTTATTCCGACTCCA 1734
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723 CATGATGGTGACCGGCACTGTCTTAGATTCCAGAAAAGGTACCCTGTTATTCCGACTCCA 1782
Query 1735 CTCACCAGAATATTTTGGTGGAGGATTTGTTTGGATGAGGCCCAGATGGTGGAGAGCAAT 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 CTCACCAGAATATTTTGGTGGAGGATTTGTTTGGATGAGGCCCAGATGGTGGAGAGCAAT 1842
Query 1795 GCAGCTGCTGCAACAGAGATGGCATTGAGATTATACACCAAACACCGTTGGTGTATCACT 1854
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 GCAGCTGCTGCAACAGAGATGGCGTTGAGATTATACACCAAACACCGTTGGTGTATCACC 1902
Query 1855 GGAACTCCTATACAACGCAAACTTGATGACTTATTTGGACTATTGAAGTTTCTTAAAGCA 1914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 GGAACTCCTATACAACGCAAACTTGATGACTTATTTGGACTATTGAAGTTTCTTAAAGCA 1962
Query 1915 AATCCTTTCGATGTTTCAAGATGGTGGATTGAAGTTATAAGAGACCCATATGAGAGGCGA 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 AATCCTTTCGATGTTTCAAGATGGTGGATTGAAGTTATAAGAGACCCATATGAGAGGCGA 2022
Query 1975 GACACAAAGGCCATGGAATTCACGCATAAGTTTTTCAAACAAGTTATGTGGCGTTCTTCA 2034
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 GACACAAAGGCCATGGAATTTACGCATAAGTTTTTCAAACAAGTTATGTGGCGTTCTTCA 2082
Query 2035 AAAGTCCATGTGGCTGATGAGTTGCAACTTCCACCTCAAGAGGAATGCGTCTCATGGCTC 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2083 AAAGTCCATGTGGCTGATGAGTTGCAACTTCCACCTCAAGAGGAATGCGTCTCGTGGCTT 2142
Query 2095 AAATTTTCTGCAATTGAAGAACACTTCTACAGTAGACAGCATGAAACTTGTGTGAGTTAT 2154
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2143 AAATTTTCCGCAATTGAAGAACACTTTTACAGTAGACAGCATGACACTTGTGTGAGTTAT 2202
Query 2155 GCTCGTGAAGTTATAGAAACTTTGAAACGTGATATTCTCAAAAGAGGTCATACTTCTTCT 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2203 GCTCGTGAAGTTATAGAAACTTTGAAACGTGATATTCTCAAAAGAGGTCATACTTCTTCT 2262
Query 2215 GATAATCCTTTAATCACTCATGCCGAAGCTGCAAAACTGTTGAACTCGCTCTTGAAATTG 2274
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 GATAATCCTTTAGTCACTCATGCTGAAGCTGCAAAACTGTTGAACTCGCTCTTGAAATTG 2322
Query 2275 CGCCAAGCTTGCTGCCACCCTCAAGTAGGAAGTTCAGGTTTACGTTCATTGCAACAAACT 2334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
Sbjct 2323 CGCCAAGCTTGCTGCCACCCTCAAGTAGGAAGTTCAGGTTTACGCTCTTTGCAACAAAGT 2382
Query 2335 CCAATGACCATGGAAGAAATTCTAATGGTCCTTGTGAAAAAGACCCAGAAAGAGGGAGAA 2394
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2383 CCAATGACCATGGAAGAAATTTTAATGGTCCTTGTGAAAAAGACCCAGAGCGAGGGAGAA 2442
Query 2395 GAAGCTCTTAGAGTGTTAATTGTTGCATTAAATGGGATTGCTGCTATTGCCATGCTTAAG 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAAGCTCTTAGAGTGTTAATTGTTGCATTAAATGGGATTGCTGCTATTGCCATGCTTAAG 2502
Query 2455 CAAGAATTTTCTGAAGCTGTGTCCTTATACAAGGAAGCATTAAGTATAACTGAAGAACAC 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2503 CAAGAATTTTCTGAAGCTGTGTCCTTATACAAGGAAGCATTAAGTATAACTGAAGAACAC 2562
Query 2515 GCTGAGGATTTTCGTCTTGATCCATTGTTAAATATTCACATTCTTCACAATTTAGCTGAG 2574
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563 GCCGAGGATTTTCGTCTTGATCCATTGTTAAATATTCACATTCTTCACAATTTAGCTGAG 2622
Query 2575 ATACTACCAATGGCCAAAAGCTACGGCGTAAAACTTTCTGCATCAGGAAGGCCTGAAATT 2634
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 ATACTACCAATGGCCAAAAGCTACGGTGGAAAACTTTCTGCATCAGGAAGGCCTGAAACA 2682
Query 2635 AAAATAGATGTACAGGATGACGATCATCACCGTGCATCAAAAAGGCAAAGGATCAATGAG 2694
|||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 2683 AAAATAGATGTAAAAGATGATGATCATCATCGTGCATCGAAGAGGCAAAGGATCAATGAG 2742
Query 2695 CTCGAGAGTTTAACTCATGATTCTCCAGA 2723
|||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2743 CTCGAGAGTTTAACTCATGATTCTTCAGA 2771
Score = 1640 bits (888), Expect = 0.0
Identities = 979/1024 (96%), Gaps = 2/1024 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTAGGAGAAAACAATCCAAGCCACAGCGTTCAGTGGGTTTGATCACTCAAACTGGT 60
|||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1 ATGGGTAGGAGAAAGCAATCCAAGCCCCAGCGTGCAGTGGGTTTGATCACTCCAACTGGT 60
Query 61 TCTGAATCCGATAGAAAGGATTTACCTGGCGACGAAGCTGAGGGTTCGGGGGAAAAGAAT 120
||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 61 TCTGAATCCGATAGAAATCAATTACCCGGCGACGAAGCTGAGGGTTCAGGGGACAAGAAT 120
Query 121 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTATTATGTGAACATATGTTTAAGTAGTCGTA-TTTCTGA 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||
Sbjct 121 GTTGAAGATATCGATAAGCCGTATTATGTGAACATATGTTTAAGTAGTCG-AGTTTCGGA 179
Query 180 GCAGCAGCAGCACTTTGATATAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTTTAAGAGAACG 239
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 180 GCAGCAGCAGAACTTTGATTTAGCTGAAGTTGTTCTAACGAATTTTAGTGTAAGAGAACG 239
Query 240 TGTAGGAAGTAGTAGTACAGTCACAACACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 299
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TGTAGGAAGTAGTAGTACATTCACAAAACCTATTGAGGTTGATCATGATCTGGATTGCTC 299
Query 300 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACCAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 359
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GTTACGGTTTCGGCTTTGCAATGTGACTAATTTTGTTGATCGGATTAAGCTTGGTCACTG 359
Query 360 GCCGGTATTGTCTTCCAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAAGTGTCTGATGA 419
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 360 GCCGGTTTTGTCTTCGAGTGATATAACTTTGGAATTGGTTGATAATAAGGTGTCTGATGA 419
Query 420 TGAGGCTGGATCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGACGGTCCAGGGGAAGGGGTTTCGGG 479
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 420 TGAGGTTGGGTCAGTGATTTGGTCTGCAAGTTTTGATGGTCCAGGTGAAGGGGTTTCGGG 479
Query 480 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTCTTGACTTTAAGGCTCATGCCGGGTAATCAGGG 539
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 480 TCTTGCTCATTTGGCAAGTATAAAGTTTTTGACTTTAAGGCTCATGCCTGGTAATGAGGG 539
Query 540 CTTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATTCTTGTGATTC 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 540 ATTGTTGTCTCCTAGAGTTAGAGTTGAGATGCTTCAGCAGGCTTTTGATGCATGTGATTC 599
Query 600 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCCTGGTT 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 600 TCTTCTTGAGAATACAAGGCAGATTTGGAAAAAGAGTATGATTCATGTCATGTCTTGGTT 659
Query 660 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTGAAGGATAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 660 GAGGCCAGAGGTAATGACATCAGAGGCTAGGTATGGGACAAGATTCAACGTCAAGGATAT 719
Query 720 TGAGTCATCAGTTGCGTCGGAAGCTGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTGGGTTTGA 779
|||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 720 TGAGTCATCAGTTGTGACGGAAGATGAAACTTTGGACTCTAGTAAGCAGTCTAGTTTTGA 779
Query 780 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGAATACGATGCTTGGAGATGA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||
Sbjct 780 TGCTGCTGCTTTTTATGAAGCCATAAAGCCATCAAAGACGGATGCAATGCTTGGAGATGA 839
Query 840 TATAACTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 899
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CATAGCTGATTTGCTCCCAGAACTTAGGCCGTACCAACGACGGGCAGCTTATTGGATGGT 899
Query 900 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGTTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCATTTC 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TCAGCGAGAGAGAGGCGATCCAATAACGTTGGGAGACAAGGAAGACAACCAATTCATTTC 959
Query 960 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTTGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTTAACCCATT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 960 ACCTTTGTCTATCTCCGTGGGATTCCTTGACTCTGCTACAAAAATGTTCTTGAACCCATT 1019
Query 1020 CAGT 1023
||||
Sbjct 1020 CAGT 1023
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 254496901839
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5