BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg483146
Length=3204
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G40840.1 | Symbols: DPE2 | disproportionating enzyme 2 | chr... 5201 0.0
> AT2G40840.1 | Symbols: DPE2 | disproportionating enzyme 2 | chr2:17044963-17050947
FORWARD LENGTH=3263
Length=3263
Score = 5201 bits (2816), Expect = 0.0
Identities = 3091/3223 (96%), Gaps = 22/3223 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAATTAACGGTGCAGAGCGATTGAACCAAAACGAAAATATCTTCCAGAAAAAGACATTTT 60
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 44 AAATTAACGGTGCAGAGCGATTGAACAAAAACAAAAATATCTTCCAGAAAAAGCCATTTT 103
Query 61 TGATTGCGTATAATGAATATACGAAATTGAAATCATTAGC-TGCCATATAGAGTACACTA 119
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||
Sbjct 104 TGATTGCGTATAATGAATACACGAAATTAAAATCATTA-CTTGCCATATATAGTACACTA 162
Query 120 TTTAGCCGCTTCACTCACTGTCGAGACTCGTGCATGTTGATTTACGGTTTGTTTAAGCAA 179
||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 163 TTTCTCAGCTTCACTCACTCTCGAGACTCGTGTATGTTGATTTACGGTTTGTTCAAGCAA 222
Query 180 AGAGAATGATGAATCTAGGATCGCTTTCGTTGAGTACGAGCAAGTCGAGTAAGCCAATGG 239
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGAATGATGAATCTAGGATCTCTTTCGTTGAGTACGAGCAAGTCGAGTAAGCCAATGG 282
Query 240 TTAGCCTCAGCTTTTGGATACCATATTTCACTCACTGGGGAGAGAGCCTGCTGGTCTGTG 299
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283 TTAGCATCAGCTTTTGGATACCGTATTTCACTCACTGGGGAGAGAGCCTGCTGGTCTGTG 342
Query 300 GCTCGGCTCCTGGACTTGGTTCCGGGAATGTGAAAAAAGGTTTGCTGCTTAAGCCATCCC 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 343 GCTCGGCTCCTGGACTTGGTTCCGGGAATGTGAAAAAAGGTTTGCTGCTAAAGCCATCCC 402
Query 360 AGCAGGATGATCAGCTCATCTGGAGTGGCTCTGTCTCGGTTCCACCTGGCTTTAGCTGTG 419
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 403 AGCAAGATGATCAGCTCATCTGGAGTGGCTCTGTCTCGGTTCCACCTGGGTTTAGCTCTG 462
Query 420 ACTATTGTTACTATGTGGTGGATGACTCGAAGAATGTGCTAAGGTCGGAGTTTGGGATGA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 463 ACTATTGTTACTATGTGGTGGATGACTCGAAGAGTGTGTTAAGGTCGGAGTTTGGGATGA 522
Query 480 AGCGAAAACTCGTGGTGCCTGAGACATTGACTGGTGGAGAGTCTGTTCATCTTCGTGATC 539
| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523 AACGAAAACTTGTGGTGCCTGAGACATTGACCGGTGGAGAGTCTGTTCATCTTCGTGATC 582
Query 540 TCTGGCAGAGTGGGGATCAAGCTCTTCCATTTAGAAGTGCATTTAAAGATGTCATCTTCC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 TCTGGCAGAGTGGGGATCAAGCTCTTCCATTTAGAAGTGCATTTAAAGATGTCATCTTCC 642
Query 600 ACCACAGTTTCGATGTAAAAGTAGAAAAACCGCTAGGGGTCTTTATGAATAAGTCGGATC 659
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 643 ACCACAGTTTCGATGTGAAAGTAGAAAAACCTCTAGGGGTCTTTATGAATAAGTCAGATC 702
Query 660 AAGATGATTCAGTTGTTGTCCAATTCAAAATCTGTTGTCCAGACATTGGAGAGGGAACAT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 AAGATGATTCAGTTGTTGTCCAATTCAAAATCTGTTGTCCAGACATTGGAGAGGGAACAT 762
Query 720 CGGTGTATGTTCTAGGCACCCCAGAAAAGTTGGGGAAATGGAAAGTTGTAAATGGACTTA 779
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 763 CTGTGTATGTTCTAGGCACCCCAGAAAAGTTGGGGAATTGGAAAGTTGAAAATGGACTTA 822
Query 780 GACTCAACTATGTCGATGATTCCATATGGGAAGCAGATTGCTTGATCCCTAAAGCAGACT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GACTCAACTATGTCGATGATTCCATATGGGAAGCAGATTGCTTGATCCCTAAAGCAGACT 882
Query 840 TTCCTATCAAATATAGATACTGTAAAGTTCAGAAGGAAGGTAGCATAGGGTTTGAATCTG 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 883 TTCCTATCAAATATAGATACTGTAAAGTTCAGAAGGAAGATAGCATAGGGTTTGAATCTG 942
Query 900 GTGGAAATCGGGAGCTGTCTCTTCACTCCATCGGTAGTAAACAGGAATACATTGTCATGT 959
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 GTGGTAATCGGGAGCTGTCTCTTCACTCCATCGGTAGTAAACAGGAATACATTGTCATGT 1002
Query 960 CAGATGGCTTGTTTCGAGCAATGCCATGGAGGGGTGCTGGTGTCGCAGTTCCCATGTTCT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1003 CAGATGGCTTGTTTCGAGCAATGCCATGGAGGGGTGCTGGTGTAGCAGTTCCCATGTTCT 1062
Query 1020 CTGTTAGATCAGAAGATGATGTTGGTGTGGGGGAGTTTCTCGATCTGAAGTTGCTTGTTG 1079
|||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063 CTGTAAGGTCAGAAGATGATGTTGGTGTGGGAGAGTTTCTCGATCTGAAGTTGCTTGTTG 1122
Query 1080 ACTGGGCTGTAGATTCCGGGTTGCATCTAGTACAACTTTTACCAGTAAATGACACATCCG 1139
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123 ATTGGGCTGTAGATTCCGGGTTGCATCTAGTACAACTTTTACCAGTAAATGACACATCCG 1182
Query 1140 TGCATAAGATGTGGTGGGACTCGTATCCCTACAGCTCGTTATCTGTGTTTGCATTGCATC 1199
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TTCATAAGATGTGGTGGGACTCGTATCCCTACAGCTCGTTATCTGTGTTTGCATTGCATC 1242
Query 1200 CATTATATCTTAGAGTGCAGGCTCTCTCTGAACGTTTGCCCGAAGATATCAAGGAAGAAA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1243 CATTATATCTTAGAGTGCAGGCTCTCTCTGAACGTCTGCCAGAAGATATCAAGGAAGAAA 1302
Query 1260 TTCAGAAGGCGAAGAAGCAACTGGACAAGAAGGATGTCGATTATGAGGCTACCATGGAAA 1319
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 TTCAGAAGGCGAAGAATCAACTGGACAAGAATGATGTTGATTATGAGGCTACCATGGAAA 1362
Query 1320 CTAAACTTTCAATTGCCAAGAAGATCTTTGACCTAGAGAAAGACCAGACGTTGAACTCAA 1379
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1363 CTAAGCTTTCAATTGCCAAGAAAATCTTTGACATAGAGAAAGACCAGACTTTGAACTCAA 1422
Query 1380 GCTCCTTCCAAAAATTCTTCTCTGAAAACGAGGGCTGGTTGAAACCATACGCAGCTTTCT 1439
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1423 GCACCTTCCAGAAATTCTTCTCTGAAAACGAGGGCTGGTTGAAACCATATGCAGCTTTCT 1482
Query 1440 GCTTTCTCCGTGACTTTTTTGAGACTTCAGATCATAGTCAGTGGGGGACCTTTTCTGACT 1499
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 GCTTCCTTCGTGACTTTTTTGAGACTTCAGATCATAGTCAGTGGGGGACCTTTTCTGACT 1542
Query 1500 ACACAGACGACAAGCTTGAAAAATTGATATCCAAGGACAGCTTGCACTATAACACTATAT 1559
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 ATACAGACGACAAGCTTGAAAAATTGATATCCAAGGACAACTTGCACTATAACACTATAT 1602
Query 1560 GCTTCCACTACTACATTCAGTACCATTTACATGTACAATTGTCAGCAGCAGCAGAATATT 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 GCTTCCACTACTACATTCAGTACCATTTACATGTACAATTGTCAGCAGCAGCAGAATATG 1662
Query 1620 CAAGGAAGAAAGGAGTTGTGCTGAAAGGAGACCTACCTATCGGAGTTGACAGAAACAGTG 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1663 CAAGGAAGAAAGGAGTTGTGCTGAAAGGAGACCTACCTATTGGCGTTGACAGAAACAGTG 1722
Query 1680 TTGATACGTGGGTTTACAGGAATCTGTTTCGCATGAATACGTCAACTGGAGCACCTCCAG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1723 TTGATACGTGGGTTTACAGGAATCTGTTTCGCATGAATACGTCAACTGGAGCACCTCCAG 1782
Query 1740 ACTATTTTGACAAAAATGGTCAGAACTGGGGATTTCCTACTTATAACTGGGAGGAAATGT 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783 ACTATTTTGACAAAAATGGTCAGAACTGGGGATTTCCTACTTATAACTGGGAGGAAATGT 1842
Query 1800 CAAAAGACAACTATGCCTGGTGGCGTGCTCGGCTAACACAGATGGGAAAATATTTCACAG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1843 CAAAAGACAACTATGCCTGGTGGCGTGCTCGCCTAACACAGATGGGGAAATATTTCACAG 1902
Query 1860 CGTACAGGATTGATCATATATTGGGATTCTTCAGAATCTGGGAGCTTCCAGCTCATGCTA 1919
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 CATACAGGATTGATCATATATTGGGATTCTTCAGAATCTGGGAGCTTCCAGCTCATGCTA 1962
Query 1920 TGACTGGTTTAGTGGGGAAGTTCCGTCCATCTATTCCGTTAAGTCAGGAAGAGTTGGAAA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1963 TGACTGGTTTAGTGGGGAAGTTCCGTCCATCTATTCCTTTAAGTCAGGAAGAGTTGGAAA 2022
Query 1980 AGGAGGGAATATGGGATTTTGACCGCTTAAGCAAGCCCTATATCCAGAAGAAGTTTCTTG 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2023 AGGAGGGAATATGGGATTTTGACCGCTTAAGCAAGCCCTATATCCAGAAGAAGTTTCTTG 2082
Query 2040 AGGAGAAATTTGGAGACTTTTGGCCTTTCATTGCATCAAACTTTCTTAATGAAACTCAGA 2099
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2083 AGGAGAAATTTGGAGATTTTTGGCCTTTTATTGCATCAAACTTTCTTAATGAAACTCAGA 2142
Query 2100 AGGACATGTATGAGTTCAAGGAGGACTGCAACACAGAGAAGAAGATTGCAGCAAAGCTGA 2159
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2143 AGGACATGTATGAGTTCAAGGAGGACTGCAACACAGAGAAGAAGATTGTAGCAAAGCTGA 2202
Query 2160 AGTCATTGGCTGAGAAGTCTCTGTTGCTAGAAAATGAGGACAAAGTTCGTCGTGATGTCT 2219
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2203 AGTCATTGGCTGAGAAGTCTTTGTTGCTAGAAAATGAGGACAAAGTTCGACGTGATGTCT 2262
Query 2220 TTGACATTTTACGGAATGTTGTTCTGATCAAAGATCCAGAGGATGCAAGAAAATTCTATC 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 TTGACATTTTACGGAATGTTGTTCTGATCAAAGATCCAGAGGATGCAAGAAAATTCTATC 2322
Query 2280 CTCGCTTTAATATTGAGGATACGTCAAGCTTCCAGGATCTGGATGATCACAGCAAAAATG 2339
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 CTCGCTTTAATATTGAGGATACTTCAAGCTTCCAGGATTTGGATGATCACAGCAAAAATG 2382
Query 2340 TTCTGAAGAGACTATACTATGACTACTATTTCCAACGCCAAGAAGATCTATGGAGAAAAA 2399
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2383 TTCTGAAGAGGCTATACTATGACTACTATTTCCAACGCCAAGAGGATCTATGGAGAAAAA 2442
Query 2400 ATGCTTTGAAAACCTTGCCTGCTCTGTTAAATTCATCTAATATGCTGGCCTGTGGGGAGG 2459
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2443 ATGCTTTGAAAACCTTGCCTGCTCTGTTGAATTCATCTAATATGCTGGCATGTGGGGAGG 2502
Query 2460 ATCTGGGTCTCATTCCTTCTTGTGTACATCCTGTTATGCAAGAACTGGGGTTGGTTGGCC 2519
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2503 ATCTGGGTCTCATTCCATCTTGTGTACATCCTGTTATGCAAGAACTGGGATTGGTTGGCC 2562
Query 2520 TTCGCATCCAGCGCATGCCCAGTGAGTCCGATGTGAAGTTTGGGATTCCGGCTAATTATG 2579
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2563 TTCGCATCCAGCGCATGCCAAGTGAGTCCGATGTGAAGTTTGGGATTCCGTCTAATTATG 2622
Query 2580 AATATATGACGGTGTGTGCTCCTTCATGCCACGACTGCTCTACACTACGGGCTTGGTGGG 2639
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 2623 ACTATATGACGGTGTGTGCTCCTTCATGCCACGACTGCTCTACCCTGCGAGCTTGGTGGG 2682
Query 2640 AAGAGGACGAAGAGAGAAGACAACAGTACTTCAAGGAAGTGATTGGTGTAGATGAAATCC 2699
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2683 AAGAGGACGAAGAGAGAAGACAGCAGTACTTCAAGGAAGTGATTGGTGTAGATGGAATCC 2742
Query 2700 CTCCAAGTCAGTGTGTTCCAGAGATAACTCATTTCATTCTGAGGCAACATGTCGAAGCTC 2759
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2743 CTCCAAGTCAGTGTATTCCAGAGATAACTCATTTCATTCTGAGGCAACATGTTGAAGCTC 2802
Query 2760 CATCAATGTGGGCTATTTTCCCTCTGCAGGATATGATGGCTCTGAAAGAAGAGTATACTA 2819
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2803 CATCAATGTGGGCTATTTTCCCGCTTCAGGATATGATGGCTCTGAAAGAAGAGTACACTA 2862
Query 2820 CTCGTCCTGCAACAGAGGAGACGATCAATGATCCAACAAACCCTAAACATTACTGGAGAT 2879
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2863 CTCGTCCTGCAACAGAGGAGACAATCAATGATCCAACAAACCCCAAACACTACTGGAGAT 2922
Query 2880 ACCGTGTACATGTGACGTTGGACTCGCTTCTAAAGGACACAGACCTGAAGTCAACCATCA 2939
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2923 ACCGCGTACACGTGACTTTGGACTCGCTTCTAAAGGACACTGACCTGAAGTCAACCATCA 2982
Query 2940 AGAACCTCGTTTCGAGCAGTGGAAGATCTGTTCCTTCTA--GT----G---AAGACATTC 2990
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |
Sbjct 2983 AGAACCTCGTTTCCAGCAGTGGAAGATCTGTTCCTGCTAATGTTTCTGGTGAAGACAT-C 3041
Query 2991 AACAAAAGCCAAGGAGAAGTTATAGCCAATGGCTCGACTAAGCCAAACCCATGAAG-AGA 3049
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 3042 AACAAAAGCCGAGGAGAAGTTATAGCCAATGGCTCGACTAAGCCAAACCCATAAAGCA-A 3100
Query 3050 CAAGTCTTCTGATTTCCTGTCTGGTTCCACAAATGTTGCTTATTAGTTATT--CACT--C 3105
||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |
Sbjct 3101 TAAGCCTTCTGATTTCCTGTTTGGTTCCACATATGTTGCTTATTAGTTATTATCATTATC 3160
Query 3106 A---AAAATAGTACAGGAGCTCAACATTATTGTCCATAAGGCATAAA-CTCTGTATTTGT 3161
| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 3161 ACTCAAAATAGTACAAGCTCTCAACATCATTGTCCATAAGACATAAAACTCTGTATTTGT 3220
Query 3162 TGTTCCTGTCCAAAATAAAATCCTTAATTTTCGGTATTAACTT 3204
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 3221 TGTTCCTGTCCAAAATAAAATCCTCAATTTTCGGTGTTAACTT 3263
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 159380377911
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5