BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg483634
Length=2479
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G45030.1 | Symbols: | Translation elongation factor EFG/EF2... 4111 0.0
AT1G45332.1 | Symbols: | Translation elongation factor EFG/EF2... 4060 0.0
> AT2G45030.1 | Symbols: | Translation elongation factor EFG/EF2
protein | chr2:18572411-18576970 FORWARD LENGTH=2479
Length=2479
Score = 4111 bits (2226), Expect = 0.0
Identities = 2403/2487 (97%), Gaps = 17/2487 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAGGTTTCCGAATTCTCCGGCGCCTAACCTCCTCTTGAGGCTCTTCTCGTCAAAC 60
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGCGAGGTTTCCGACTTCTCCGGCGCCTAACCTCCTCTTGAGACTCTTCTCGTCGAAC 60
Query 61 AAACGGTCTTCATCTCCTACTGCCGCGCTTTTAACCGGAGATTTTCAGCTGATTCGTCAT 120
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 61 AAACGGGCGTCATCTCCTACTGCCGCGCTTTTAACCGGAGATTTTCATCTGATTCGTCAT 120
Query 121 TTCTCCGCCGGAACCGCTGCTCGTGCGGCCAAGGATGACAAGGAACCCTGGTGGAAAGAA 180
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 121 TTCTCCGCCGGAACCGCTGCTCGTGCGGTCAAGGATGAGAAGGAGCCATGGTGGAAAGAA 180
Query 181 TCCATGGACAAGCTTCGCAACATCGGGATCTCAGCTCATATAGACTCTGGGAAGACTACG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 TCCATGGACAAGCTTCGCAACATCGGGATCTCAGCTCATATAGACTCTGGAAAGACTACG 240
Query 241 TTGACTGAGCGTGTTCTGTTCTATACCGGTCGGATCCATGAGATCCACGAAGTCAGAGGT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 TTGACTGAGCGTGTTCTGTTCTATACCGGTCGGATCCATGAGATCCATGAAGTCAGAGGT 300
Query 301 AGAGATGGCGTCGGCGCTAAAATGGACTCCATGGACTTGGAGCGAGAGAAAGGTATCACC 360
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 AGAGATGGCGTCGGCGCTAAAATGGACTCTATGGACTTGGAGCGAGAGAAAGGTATCACT 360
Query 361 ATCCAATCAGCCGCTACCTACTGTACTTGGAAGGATTACAAGGTTAATATAATTGATACT 420
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ATCCAGTCAGCCGCTACTTACTGTACTTGGAAGGATTACAAGGTTAATATAATTGATACT 420
Query 421 CCTGGTCACGTTGACTTCACCATTGAAGTTGAGAGGGCTTTACGTGTACTAGACGGTGCG 480
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CCTGGTCACGTTGACTTCACCATTGAAGTGGAGAGGGCTTTACGTGTACTAGACGGTGCG 480
Query 481 ATTCTAGTTCTGTGCAGTGTTGGTGGTGTACAGAGTCAGTCTATTACAGTAGATAGGCAA 540
|||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 481 ATTCTAGTCCTATGCAGTGTGGGTGGTGTACAGAGTCAGTCTATTACGGTAGATAGGCAA 540
Query 541 ATGAGGAGATATGAAGTCCCGAGAGTTGCGTTTATTAACAAGCTTGATAGGATGGGAGCA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 541 ATGAGGAGATATGAAGTCCCGAGAGTTGCGTTTATTAACAAGCTTGATAGAATGGGAGCA 600
Query 601 GATCCATGGAAAGTCTTGAACCAAGCAAGAGCTAAGCTTCGACATCATAGTGCAGCTGTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GATCCATGGAAAGTCTTGAACCAAGCAAGAGCTAAGCTTCGACATCATAGTGCAGCTGTG 660
Query 661 CAAGTGCCCATTGGTTTAGAAGAAAATTTCCAGGGTCTTATAGACCTTATTCATGTGAAA 720
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CAAGTGCCCATTGGTCTAGAAGAAAATTTCCAGGGTCTTATAGACCTTATTCATGTGAAA 720
Query 721 GCTTATTTCTTTCATGGATCCAGCGGTGAGAATGTTGTGGCTGGTGATATTCCTGCTGAT 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GCTTATTTCTTTCATGGATCAAGCGGTGAGAATGTTGTGGCTGGTGATATTCCTGCTGAT 780
Query 781 ATGGAAGGTTTGGTTGCGGAGAAGAGGCGAGAATTGATAGAGACAGTCTCTGAAGTTGAT 840
||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ATGGAGGGTTTGGTTGGGGATAAGAGGAGAGAATTGATAGAGACAGTCTCTGAAGTTGAT 840
Query 841 GATGTACTCGCCGAGAAATTTCTGAATGATGAGCCTGTATCTGCTGCTGAGCTTGAGGAA 900
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GATGTACTCGCCGAGAAATTTCTGAATGATGAACCTGTATCTGCTGCTGAGCTTGAGGAA 900
Query 901 GCTATTCGTAGAGCTACCATAGCACAAAAGTTTGTTCCTGTATTTATGGGTAGTGCATTC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCTATTCGTAGAGCTACCATAGCACAAAAGTTTGTTCCTGTATTTATGGGTAGTGCATTC 960
Query 961 AAAAACAAGGGAGTACAACCTCTACTAGATGGTGTTGTCAGTTATCTCCCTTCTCCAAAT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 961 AAAAACAAGGGAGTACAACCTCTACTAGATGGTGTTGTCAGTTTTCTCCCTTCTCCAAAT 1020
Query 1021 GAAGTCAATAACTATGCTCTTGACCAG-ATGAATAATGAAGAGAGGGTAACGTTGACTGG 1079
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1021 GAAGTCAATAACTATGCTCTTGACCAGAAT-AATAATGAAGAGAGGGTAACCTTGACTGG 1079
Query 1080 ATCTCCAGATGGGCCTCTTGTGGCGCTGGCTTTCAAATTAGAGGAGGGTCGTTTTGGTCA 1139
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 ATCTCCAGATGGACCTCTTGTGGCGCTGGCTTTCAAATTAGAGGAGGGTCGTTTTGGTCA 1139
Query 1140 GCTGACATATTTGAGAGTTTACGAAGGTGTGATTAAGAAGGGTGATTTTATCATAAATGT 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 ATTGACATATTTGAGAGTTTACGAAGGTGTGATTAAGAAAGGTGATTTTATCATAAATGT 1199
Query 1200 CAATACTGGGAAGAGAATTAAGGTTCCACGCTTGGTCCGTATGCATTCGAATGATATGGA 1259
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 CAACACTGGGAAGAGAATTAAGGTTCCACGCTTGGTCCGTATGCATTCGAATGATATGGA 1259
Query 1260 GGATATTCAAGAGGCACACGCTGGACAAATCGTAGCTGTGTTTGGTATTGAGTGTGCATC 1319
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GGATATTCAAGAGGCACACGCTGGACAAATTGTAGCTGTGTTTGGTATTGAGTGTGCATC 1319
Query 1320 AGGTGATACATTTACGGATGGATCAGTCAAGTACACAATGACATCGATGAACGTTCCTGA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 AGGTGATACATTTACGGATGGATCAGTCAAGTACACAATGACATCGATGAACGTTCCTGA 1379
Query 1380 ACCTGTTATGTCCTTAGCTGTTCAACCGGTTTCAAAAGATTCTGGAGGACAGTTCTCGAA 1439
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 ACCTGTTATGTCCTTAGCTGTTCAACCAGTTTCAAAAGATTCTGGAGGACAGTTCTCGAA 1439
Query 1440 AGCACTGAATCGATTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCCGGGTGGGATTGGATCCCGAGAG 1499
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1440 AGCATTGAATCGATTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCCGTGTGGGTTTGGATCCCGAGAG 1499
Query 1500 TGGCCAGACGATTATTTCTGGTATGGGGGAATTGCATTTGGACATCTATGTTGAACGCAT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TGGCCAGACGATTATTTCTGGTATGGGGGAATTGCATTTGGACATCTATGTTGAACGCAT 1559
Query 1560 GCGGAGAGAATATAAGGTTGATGCGACTGTGGGCAAACCCCGTGTTAATTTTAGGGAGAC 1619
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1560 GCGAAGAGAATATAAGGTTGATGCGACTGTGGGCAAACCCCGTGTCAATTTTAGGGAGAC 1619
Query 1620 TATTACTCAACGGGCGGAGTTTGATTATTTACATAAGAAGCAAAGTGGAGGAGCTGGTCA 1679
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1620 TATTACTCAGCGGGCAGAGTTTGATTATTTACATAAGAAGCAAAGTGGAGGAGCAGGTCA 1679
Query 1680 ATACGGTAGGGTTACAGGGTACGTGGAACCGCTACCACCAGGATCTAAAGAGAAGTTTGA 1739
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1680 ATACGGTAGAGTTACAGGGTACGTGGAACCGCTACCACCAGGCTCTAAAGAGAAGTTTGA 1739
Query 1740 ATTTGAAAACATGATTGTTGGACAAGCAATTCCGTCTGGTTTTATTCCAGCAATTGAGAA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATTTGAAAACATGATTGTTGGACAAGCAATTCCGTCTGGTTTTATTCCAGCAATTGAGAA 1799
Query 1800 AGGTTTCAAAGAAGCTGCAAACTCGGGCTCACTAATTGGTCACCCTGTAGAGAATCTCAG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1800 AGGTTTCAAAGAAGCTGCAAACTCGGGCTCACTAATTGGTCACCCTGTAGAGAATCTTAG 1859
Query 1860 AATAGTATTGACAGATGGAGCTTCACACGCGGTAGATTCGAGTGAACTTGCGTTTAAAAT 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 AATAGTATTGACAGATGGAGCTTCACACGCGGTAGATTCCAGTGAACTTGCGTTTAAAAT 1919
Query 1920 GGCTGCAATATACGCATTCAGACTGTGTTACACAGCAGCTAGACCGGTGATTCTAGAACC 1979
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GGCTGCAATATACGCATTCAGACTGTGTTATACAGCAGCTAGACCGGTGATTCTAGAACC 1979
Query 1980 TGTTATGCTTGTTGAGTTGAAAGTACCAACAGAGTTTCAGGGTACTGTTGCTGGTGACAT 2039
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1980 TGTTATGCTGGTCGAGTTGAAAGTACCAACAGAGTTTCAGGGCACTGTTGCTGGTGACAT 2039
Query 2040 CAACAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGGAAACGATCAAGAGGGTGACGATTCAGTAATCAC 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2040 CAACAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGGAAACGATCAAGAGGGTGATGATTCAGTAATCAC 2099
Query 2100 TGCTAATGTGCCTTTGAACAACATGTTTGGCTACTCCACTTCTCTCCGGTCCATGACACA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 TGCTAATGTGCCTTTGAACAACATGTTTGGCTACTCCACTTCTCTCCGGTCCATGACACA 2159
Query 2160 AGGAAAAGGAGAATTCACAATGGAATACAAAGAACATTCTGCTGTATCCAATGAAGTCCA 2219
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2160 AGGAAAAGGAGAATTCACGATGGAATACAAAGAACATTCTGCTGTGTCCAATGAAGTCCA 2219
Query 2220 AGCTCAGCTCGTCAATGCTTACAGCGCCAGCAAAGCAACTGAATAAGCAAGCCCTTGAAT 2279
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2220 GGCTCAGCTCGTCAATGCTTATAGCGCCAGCAAAGCTACTGAATAAGCAAACCCTTCAAT 2279
Query 2280 CGAATAT-T-ATGGTTTGTTTTCTCATAATGTTGA-ATTACAACATTATTTATACGGTTC 2336
| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||
Sbjct 2280 CCAATATATTATGGTTTGTTTTCTCATAATGTTGACAT-A-AT--TTATTTATACGGTTC 2335
Query 2337 ACA-A-CCAACAAAATCACTCAACATAAAATGCCTAATGGGCTATGTCAGAAAATCACTT 2394
||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 ACACAACCATCAAAATCACTCAACATAAACTGCCTAATGGGCTATGTCAGAAAATCACTT 2395
Query 2395 ATGTTTATTGGGCCATTAGGTAGGTCA--TTTTTTGGTATATTTCCACCAGTCCCAATCA 2452
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2396 ATGTTTATTGGGCCATTAGGTAGGTCACATTTTTTGGTAT----CCACCAGTCCCAATCA 2451
Query 2453 TTTTGATAATGGTAAACCAGCAAATAT 2479
|||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2452 TTTTGATAATGGTAAACCAGCATATAT 2478
> AT1G45332.1 | Symbols: | Translation elongation factor EFG/EF2
protein | chr1:17172322-17176821 REVERSE LENGTH=2588
Length=2588
Score = 4060 bits (2198), Expect = 0.0
Identities = 2347/2420 (97%), Gaps = 6/2420 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGAGGTTTCCGAATTCTCCGGCGCCTAACCTCCTCTTGAGGCTCTTCTCGTCAAAC 60
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||
Sbjct 139 ATGGCGAGGTTTCCGACTTCTCCGGCGCCTAACCGCCTCTTGAGGCTCTTCTCTTCCAAC 198
Query 61 AAACGGTCTTCATCTCCTACTGCCGCGCTTTTAACCGGAGATTTTCAGCTGATTCGTCAT 120
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 AAACGGTCGTCATCTCCTACTGCCGCGCTTTTAACCGGAGATTTTCAGCTGATTCGTCAT 258
Query 121 TTCTCCGCCGGAACCGCTGCTCGTGCGGCCAAGGATGACAAGGAACCCTGGTGGAAAGAA 180
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 259 TTCTCCGCCGGAACCGCTGCTCGTGTTGCCAAGGATGAGAAGGAACCATGGTGGAAAGAA 318
Query 181 TCCATGGACAAGCTTCGCAACATCGGGATCTCAGCTCATATAGACTCTGGGAAGACTACG 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 319 TCCATGGACAAGCTTCGCAACATCGGGATCTCAGCTCATATAGACTCTGGAAAGACTACG 378
Query 241 TTGACTGAGCGTGTTCTGTTCTATACCGGTCGGATCCATGAGATCCACGAAGTCAGAGGT 300
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 TTGACTGAACGTGTTCTCTTCTATACCGGTCGGATCCATGAGATCCACGAAGTCAGAGGT 438
Query 301 AGAGATGGCGTCGGCGCTAAAATGGACTCCATGGACTTGGAGCGAGAGAAAGGTATCACC 360
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 439 AGAGATGGCGTCGGCGCTAAAATGGATTCCATGGACTTAGAACGAGAGAAAGGTATCACC 498
Query 361 ATCCAATCAGCCGCTACCTACTGTACTTGGAAGGATTACAAGGTTAATATAATTGATACT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 ATCCAATCAGCCGCTACCTACTGTACTTGGAAGGATTACAAGGTTAATATAATTGATACT 558
Query 421 CCTGGTCACGTTGACTTCACCATTGAAGTTGAGAGGGCTTTACGTGTACTAGACGGTGCG 480
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 CCTGGTCATGTTGACTTCACCATTGAAGTGGAGAGGGCTTTACGTGTACTAGACGGTGCG 618
Query 481 ATTCTAGTTCTGTGCAGTGTTGGTGGTGTACAGAGTCAGTCTATTACAGTAGATAGGCAA 540
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 619 ATTCTAGTCCTGTGCAGTGTTGGTGGTGTACAGAGTCAGTCTATTACGGTTGATAGGCAA 678
Query 541 ATGAGGAGATATGAAGTCCCGAGAGTTGCGTTTATTAACAAGCTTGATAGGATGGGAGCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 679 ATGAGGAGATATGAAGTCCCGAGAGTTGCGTTTATTAACAAGCTTGATAGGATGGGAGCA 738
Query 601 GATCCATGGAAAGTCTTGAACCAAGCAAGAGCTAAGCTTCGACATCATAGTGCAGCTGTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GATCCATGGAAAGTCTTGAACCAAGCAAGAGCTAAGCTTCGACATCATAGTGCAGCTGTG 798
Query 661 CAAGTGCCCATTGGTTTAGAAGAAAATTTCCAGGGTCTTATAGACCTTATTCATGTGAAA 720
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 799 CAAGTGCCCATTGGTCTAGAAGAAAATTTTCAGGGTCTTATAGACCTTATTCATGTCAAA 858
Query 721 GCTTATTTCTTTCATGGATCCAGCGGTGAGAATGTTGTGGCTGGTGATATTCCTGCTGAT 780
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 GCTTATTTCTTTCATGGATCAAGCGGTGAGAATGTTGTGGCTGGTGATATTCCTGCTGAT 918
Query 781 ATGGAAGGTTTGGTTGCGGAGAAGAGGCGAGAATTGATAGAGACAGTCTCTGAAGTTGAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 ATGGAAGGTTTGGTTGCGGAGAAGAGGCGAGAATTGATAGAGACAGTCTCTGAAGTTGAT 978
Query 841 GATGTACTCGCCGAGAAATTTCTGAATGATGAGCCTGTATCTGCTGCTGAGCTTGAGGAA 900
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 979 GATGTACTCGCCGAGAAATTTCTGAATGATGAACCTGTATCTGCTTCTGAGCTTGAGGAA 1038
Query 901 GCTATTCGTAGAGCTACCATAGCACAAAAGTTTGTTCCTGTATTTATGGGTAGTGCATTC 960
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GCTATTCGTAGAGCTACCATAGCACAAACGTTTGTTCCTGTATTTATGGGTAGTGCATTC 1098
Query 961 AAAAACAAGGGAGTACAACCTCTACTAGATGGTGTTGTCAGTTATCTCCCTTCTCCAAAT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1099 AAAAACAAGGGAGTACAACCTCTACTAGATGGTGTTGTCAGTTTTCTCCCTTCTCCAAAT 1158
Query 1021 GAAGTCAATAACTATGCTCTTGACCAGA-TGAATAATGAAGAGAGGGTAACGTTGACTGG 1079
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 1159 GAAGTCAATAACTATGCTCTTGACCAGAAT-AATAATGAAGAGAGGGTCACCTTGACTGG 1217
Query 1080 ATCTCCAGATGGGCCTCTTGTGGCGCTGGCTTTCAAATTAGAGGAGGGTCGTTTTGGTCA 1139
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 ATCTCCAGATGGACCTCTTGTGGCGCTGGCTTTCAAATTAGAGGAGGGTCGTTTTGGTCA 1277
Query 1140 GCTGACATATTTGAGAGTTTACGAAGGTGTGATTAAGAAGGGTGATTTTATCATAAATGT 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 ACTGACATATTTGAGAGTTTACGAAGGTGTGATTAAGAAAGGTGATTTTATCATAAATGT 1337
Query 1200 CAATACTGGGAAGAGAATTAAGGTTCCACGCTTGGTCCGTATGCATTCGAATGATATGGA 1259
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1338 CAACACTGGGAAGAGAATTAAGGTTCCACGCTTGGTCCGTATGCATTCAAATGATATGGA 1397
Query 1260 GGATATTCAAGAGGCACACGCTGGACAAATCGTAGCTGTGTTTGGTATTGAGTGTGCATC 1319
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 GGATATTCAAGAGGCACATGCTGGACAAATCGTAGCTGTGTTTGGTATTGAGTGTGCATC 1457
Query 1320 AGGTGATACATTTACGGATGGATCAGTCAAGTACACAATGACATCGATGAACGTTCCTGA 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 AGGTGATACATTTACGGATGGATCAGTCAAGTACACGATGACATCGATGAACGTTCCTGA 1517
Query 1380 ACCTGTTATGTCCTTAGCTGTTCAACCGGTTTCAAAAGATTCTGGAGGACAGTTCTCGAA 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 ACCTGTTATGTCCTTAGCTGTTCAACCGGTTTCAAAAGATTCTGGAGGACAGTTCTCGAA 1577
Query 1440 AGCACTGAATCGATTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCCGGGTGGGATTGGATCCCGAGAG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1578 AGCACTGAATCGATTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCCGTGTGGGTTTGGATCCCGAGAG 1637
Query 1500 TGGCCAGACGATTATTTCTGGTATGGGGGAATTGCATTTGGACATCTATGTTGAACGCAT 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 TGGCCAGACGATTATTTCTGGTATGGGGGAATTGCATTTGGACATCTATGTTGAACGCAT 1697
Query 1560 GCGGAGAGAATATAAGGTTGATGCGACTGTGGGCAAACCCCGTGTTAATTTTAGGGAGAC 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1698 GCGGAGAGAATATAAGGTTGATGCGACTGTGGGCAAACCCCGTGTCAATTTTAGGGAGAC 1757
Query 1620 TATTACTCAACGGGCGGAGTTTGATTATTTACATAAGAAGCAAAGTGGAGGAGCTGGTCA 1679
|||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 TATTACCCAGCGCGCTGAGTTTGATTATTTACATAAGAAGCAAAGTGGAGGAGCTGGTCA 1817
Query 1680 ATACGGTAGGGTTACAGGGTACGTGGAACCGCTACCACCAGGATCTAAAGAGAAGTTTGA 1739
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1818 ATACGGTAGAGTTACAGGGTACGTGGAACCGCTACCACCAGGCTCTAAAGAGAAATTTGA 1877
Query 1740 ATTTGAAAACATGATTGTTGGACAAGCAATTCCGTCTGGTTTTATTCCAGCAATTGAGAA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 GTTTGAAAACATGATTGTTGGACAAGCAATTCCGTCGGGTTTTATTCCAGCAATTGAGAA 1937
Query 1800 AGGTTTCAAAGAAGCTGCAAACTCGGGCTCACTAATTGGTCACCCTGTAGAGAATCTCAG 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1938 AGGTTTCAAAGAAGCTGCAAACTCGGGCTCACTAATTGGTCACCCTGTAGAAAATCTCAG 1997
Query 1860 AATAGTATTGACAGATGGAGCTTCACACGCGGTAGATTCGAGTGAACTTGCGTTTAAAAT 1919
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 AATAGTATTGACAGATGGAGCTTCACACGCTGTAGATTCCAGTGAACTTGCGTTTAAAAT 2057
Query 1920 GGCTGCAATATACGCATTCAGACTGTGTTACACAGCAGCTAGACCGGTGATTCTAGAACC 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058 GGCTGCAATATACGCATTCAGACTGTGTTACACAGCAGCTAGACCGGTGATTCTAGAACC 2117
Query 1980 TGTTATGCTTGTTGAGTTGAAAGTACCAACAGAGTTTCAGGGTACTGTTGCTGGTGACAT 2039
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2118 TGTTATGCTGGTTGAGTTGAAAGTACCAACAGAGTTTCAGGGCACTGTTGCTGGTGACAT 2177
Query 2040 CAACAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGGAAACGATCAAGAGGGTGACGATTCAGTAATCAC 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178 CAACAAGAGGAAAGGTATAATCGTTGGAAACGATCAAGAGGGTGACGATTCAGTAATCAC 2237
Query 2100 TGCTAATGTGCCTTTGAACAACATGTTTGGCTACTCCACTTCTCTCCGGTCCATGACACA 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 TGCTAATGTGCCTTTGAACAACATGTTTGGCTACTCCACTTCTCTCCGGTCCATGACACA 2297
Query 2160 AGGAAAAGGAGAATTCACAATGGAATACAAAGAACATTCTGCTGTATCCAATGAAGTCCA 2219
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2298 AGGCAAAGGAGAATTCACGATGGAATACAAAGAACATTCTGCTGTGTCCAATGAAGTCCA 2357
Query 2220 AGCTCAGCTCGTCAATGCTTACAGCGCCAGCAAAGCAACTGAATAAGCAAGCCCTTGAAT 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 2358 GGCTCAGCTCGTCAATGCTTACAGCGCCAGCAAAGCTACTGAATAAACAAGCCATTGAAT 2417
Query 2280 CGAA-TATTATGGTTTGTTTTCTCATAATGTTGAATTACAACATT-ATTTATACGGTTCA 2337
| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2418 CAAAATATTATGGTTTGTTTTCTCATAATGTTCATTTACAACATTTATTTATACGGTTCA 2477
Query 2338 CAACCAACAAAATCACTCAACATAAAA-TGCCTAATGGGCTATGTCAGAAAATCACTTAT 2396
||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2478 CAACCAACAAAATCACTCAACATAAAAATGCGTGATGGGCTATGTCAGAAAATCACTTAT 2537
Query 2397 GTTTATTGGGCCATTA-GGT 2415
||||| |||||||||| |||
Sbjct 2538 GTTTACTGGGCCATTATGGT 2557
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 123009344236
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5