BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484003
Length=3961
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G48110.1 | Symbols: REF4, MED33B | reduced epidermal fluores... 4082 0.0
> AT2G48110.1 | Symbols: REF4, MED33B | reduced epidermal fluorescence
4 | chr2:19673293-19679711 FORWARD LENGTH=4122
Length=4122
Score = 4082 bits (2210), Expect = 0.0
Identities = 2349/2418 (97%), Gaps = 4/2418 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1526 GTATC-GCT-GGTAATATTTCTTGTTGGTCTCTAGCGATGAAGGGTTCTCCTCTAACACC 1583
||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 GTATCTGCTCTGTAACATTTCTTGTTGGTCTCTAGTGATGAAGGGTTCTCCTCTAACACC 1594
Query 1584 GTCATTGACAAATTCACTAATCACAACTCCAGCTTCTAGCTTAGCAGAGATTGAAAAGAT 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 GTCATTGACAAATTCACTAATCACAACTCCAGCTTCTAGCTTAGCAGAGATTGAAAAGAT 1654
Query 1644 GTACGAGGTTGCAACTACTGGTTCAGAAGATGAGAAGATAGCCGCAGCTTCTATTCTCTG 1703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1655 GTACGAGGTTGCAACTACTGGTTCAGAAGATGAGAAGATAGCCGTGGCTTCTATTCTCTG 1714
Query 1704 TGGAGCATCTCTATTTCGTGGTTGGAGCATACAGGAGCATGTTATTATCTTCATTGTAAC 1763
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1715 TGGAGCATCTCTGTTTCGTGGTTGGAGCATACAGGAGCATGTTATTATCTTCATTGTAAC 1774
Query 1764 TTTACTCTCACCTCCGGCTCCAGCTGATCTTTCTGGGAGTTATAGCCATCTAATCAGTTC 1823
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1775 TTTACTTTCGCCTCCGGCTCCAGCTGATCTTTCTGGGAGTTATAGCCATCTAATCAATTC 1834
Query 1824 TGCGCCGTTTCTTAATGTTCTTCTTGTCGGGATATCACCCATAGATTGTGTTCAGATTTT 1883
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1835 TGCGCCGTTTCTTAATGTTCTTCTTGTCGGGATATCACCCATAGATTGTGTTCACATTTT 1894
Query 1884 CTCATTGCATGGGGTGGTCCCATTACTTGCTGGTGCTTTGATGCCAATATGTGAAGCGTT 1943
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 CTCATTGCACGGGGTGGTCCCATTACTTGCTGGTGCTTTGATGCCAATATGTGAAGCGTT 1954
Query 1944 TGGCTCCGGCATTCCGAACATTACGTGGACTCTCCCGACTGGCGAAGTAATCTCCTCTCA 2003
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1955 TGGCTCCGGCGTTCCAAACATTACGTGGACTCTCCCGACTGGCGAATTAATCTCCTCTCA 2014
Query 2004 TGCTGTTTTCTCCACTGCATTTACACTTCTTCTAAGGCTATGGAGATTTGATCACCCACC 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 TGCTGTTTTCTCCACTGCATTTACACTTCTTCTGAGGCTATGGAGATTTGATCACCCACC 2074
Query 2064 ACTAGATTACGTCTTGGGAGACGTTCCGCCGGTGGGCCCTCAACCAAGCCCCGAGTATCT 2123
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2075 ACTAGATTACGTCTTGGGAGATGTTCCCCCGGTGGGCCCTCAACCCAGCCCTGAGTATCT 2134
Query 2124 TTTGTTAGTAAGAAATTGCCGTCTGGAATGTTTTGGAAAGTCCCCAAAGGATCGCATGGC 2183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 GTTGTTAGTAAGAAATTGCCGTCTGGAATGTTTTGGAAAGTCCCCAAAGGATCGCATGGC 2194
Query 2184 ACGTCGAAGATTTTCGAAAGTGATAAATATCTCTGTGGATCCTATCTTCATGGATTCATT 2243
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2195 ACGTCGAAGATTTTCGAAAGTGATAGATATCTCTGTGGATCCCATCTTCATGGATTCATT 2254
Query 2244 CCCCAGACTGAAACAGTGGTACCGGCAGCATCAGGAATGTATGGCTTCAATTCTCTCTGA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2255 CCCCAGACTGAAACAGTGGTACCGGCAGCATCAGGAATGTATGGCTTCAATTCTCTCTGA 2314
Query 2304 ACTAAAGACAGGAAGCCCAGTACATCACATTGTTGATTCCCTCCTTAGCATGATGTTCAA 2363
||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 ACTAAAGACAGGAAGCCCAGTGCATCACATTGTCGATTCCCTCCTTAGCATGATGTTCAA 2374
Query 2364 GAAGGCAAATAAAGGTGGTAGTCAGTCACTGACTCCATCTTCAGGGAGCAGTAGTTTATC 2423
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 GAAGGCAAACAAAGGTGGTAGTCAGTCACTGACCCCATCTTCAGGGAGCAGTAGTTTATC 2434
Query 2424 TACTTCTGG-GGTGGACGACTCGTCTGATCAACTCAAGTTACCTGCATGGGATATCTTGG 2482
||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 TACTTCTGGAGGTG-ATGACTCGTCTGATCAACTCAAGTTACCTGCATGGGATATCTTGG 2493
Query 2483 AAGCGGCCCCGTTTGTGCTTGATGCTGCCCTTACTGCATGTGCTCATGGATCACTCTCTC 2542
||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2494 AAGCGGCMCCGTTTGTGCTTGATGCTGCTCTAACTGCTTGTGCTCATGGATCACTCTCTC 2553
Query 2543 CCCGGGAACTAGCAACAGGTCTTAAAATCTTGGCTGATTTTCTGCCGGCAACACTAGGAA 2602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2554 CCCGGGAACTAGCAACAGGTCTTAAAATCTTGGCTGATTTTCTGCCGGCAACACTTGGAA 2613
Query 2603 CCATGGTTAGCTACTTTTCTTCGGAAGTAACACGAGGTCTGTGGAAGCCCGTTTCCATGA 2662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2614 CCATGGTTAGCTACTTTTCTTCGGAAGTAACACGAGGTCTGTGGAAGCCCGTTTCCATGA 2673
Query 2663 ACGGAACTGACTGGCCTAGTCCTGCTGCAAATTTAGCAAGCGTTGAGCAACAGATAGAAA 2722
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2674 ACGGAACTGACTGGCCTAGTCCTGCTGCAAATTTAGCAAGCGTTGAGCAACAGATAGAGA 2733
Query 2723 AGATCTTAGCTGCTACTGGCGTTGACGTCCCAAGGCTTCCAGCAGATGGAATCTCTGCGG 2782
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 AGATCTTAGCAGCTACTGGCGTTGACGTACCAAGGCTTCCAGCAGATGGAATCTCTGCGG 2793
Query 2783 CCACACTTCCCTTGCCTCTCGCTGCACTAGTCAGCCTCACTATAACCTACAAGCTTGACA 2842
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794 CTACACTTCCCTTGCCTCTCGCTGCACTAGTGAGCCTTACTATAACCTACAAGCTTGACA 2853
Query 2843 AAGCAACAGAGCGCTTCCTTGTACTTGTCGGACCGGCCTTAGACTCCCTTGCTGCCGCTT 2902
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2854 AAGCAACAGAGCGCTTCCTTGTACTTGTAGGACCGGCCTTAGACTCCCTTGCTGCTGCTT 2913
Query 2903 GCCCCTGGCCCTGCATGCCGATTGTGACATCGCTGTGGACCCAGAAAGTGAAACGCTGGA 2962
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2914 GCCCCTGGCCCTGCATGCCTATTGTGACATCGCTGTGGACCCAGAAAGTGAAGCGCTGGA 2973
Query 2963 GCGACTTTCTTATCTTTTCAGCCTCCAGAACTGTGTTCCACCACAACAGAGATGCTGTTA 3022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2974 GCGACTTTCTTATCTTTTCAGCCTCCAGAACTGTGTTCCACCACAACAGAGATGCTGTTA 3033
Query 3023 TTCAGCTTCTCAGAAGCTGCTTCACTTGCACTCTTGGTCTAACACCTACCTCCCAACTCT 3082
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3034 TTCAGCTCCTCAGAAGCTGCTTCACTTGCACCCTTGGTCTAACACCTACTTCCCAACTCT 3093
Query 3083 GCAGCTATGGGGGAGTGGGTGCACTCCTTGGCCATGGCTTTGGCTCCCGTTACTCTGGAG 3142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3094 GCAGCTATGGGGGAGTGGGTGCACTCCTTGGCCATGGCTTTGGGTCCCGTTACTCTGGAG 3153
Query 3143 GAATTTCCACAGCTGCCCCAGGAATCTTGTACATAAAAGTGCACAGATCGATCAGAGATG 3202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 GAATTTCCACAGCTGCCCCAGGAATCTTGTACATAAAAGTGCACAGATCGATCAGAGATG 3213
Query 3203 TCATGTTCCTGACAGAAGAAATCCTCTCTCTTCTGATGTTCTCTGTGAAGAGCATTGCCA 3262
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3214 TCATGTTCCTGACAGAAGAAATCCTGTCTCTTCTGATGTTCTCTGTGAAGAGCATTGCCA 3273
Query 3263 CCAGGGAGCTACCAGCAGGGCAAGCAGAGAAATTGAAGAAAACGAAAGATGGGTCGAGGT 3322
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3274 CGAGGGAGCTACCAGCAGGGCAAGCAGAGAAATTGAAGAAAACGAAAGATGGGTCGAGGT 3333
Query 3323 ACGGGATTGGGCAGGTTTCACTTTCTTTGGCAATGAGACGTGTCAAGCTGGCAGCTTCCC 3382
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3334 ACGGGATTGGGCAGGTTTCACTTTCTTTAGCAATGAGACGTGTCAAGCTGGCAGCTTCCC 3393
Query 3383 TGGGAGCCTCTCTGGTGTGGATCTCCGGTGGCCTGAACCTGGTTCAGGCTCTGATCAAGG 3442
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3394 TGGGAGCCTCTCTGGTGTGGATCTCCGGTGGCCTAAACCTGGTTCAGGCACTGATCAAGG 3453
Query 3443 AGACATTACCGTCTTGGTTCATATCGGTTCACGGAGAAGAAGATGAGTTGGGAGGTATGA 3502
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3454 AGACATTACCGTCTTGGTTCATCTCGGTTCACGGAGAAGAAGATGAGTTGGGAGGTATGG 3513
Query 3503 TTCCGATGCTAAGAGGGTATGCTTTAGCCTACTTTGCAATCCTGAGCAGTGCATTTGCTT 3562
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3514 TTCCGATGCTAAGAGGCTATGCTTTAGCCTACTTTGCAATCCTGAGCAGTGCATTTGCCT 3573
Query 3563 GGGGAGTGGACTCCTCATCTCCTGCCTCAAAACGTCGGCCAAGGGTTCTGTGGCTGCATT 3622
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3574 GGGGAGTGGACTCCTCATATCCTGCATCAAAACGTCGGCCAAGGGTTCTGTGGCTGCATT 3633
Query 3623 TGGAGTTTATGGTGAGTGCCTTGGAAGGGAAGATATCACTGGGCTGTGATTGGGCGACAT 3682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3634 TGGAGTTTATGGTGAGTGCCTTGGAAGGGAAGATATCACTGGGCTGTGATTGGGCGACAT 3693
Query 3683 GGCAAGCATACGTGACAGGCTTTGTGAGCCTGATGGTGCAATGCACGCCGGCTTGGGTGC 3742
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3694 GGCAAGCTTACGTGACAGGCTTTGTGAGCCTGATGGTGCAATGCACGCCGGCTTGGGTGC 3753
Query 3743 TAGAGGTGGATGTAGAAGTAATAAAGAGACTAAGCAAAAGTCTGAGGCAGTGGAACGAGC 3802
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3754 TAGAGGTGGATGTTGAAGTAATAAAGAGACTAAGCAAAAGTCTGAGGCAGTGGAACGAGC 3813
Query 3803 AAGACTTGGCTCTCGCTCTGCTTTGTGCCGGTGGTCTGGGGACAATGGGTGCAGCTACTG 3862
||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |
Sbjct 3814 AAGACTTGGCTCTGGCTCTGCTTTGTGCCGGCGGCCTTGGGACAATGGGTGCAGCTACAG 3873
Query 3863 AACTCATTGTGGAGACTTGCCATCAACATTAGCTTTACGTCTTTCAACTTTCTTTTCTCG 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3874 AACTCATTGTGGAGACTTGCCATCAACATTAGCTTGACGTCTTTCAACTTTCTTTTCTCG 3933
Query 3923 ACTAATCTAAACTGTGAT 3940
||||||||||||||||||
Sbjct 3934 ACTAATCTAAACTGTGAT 3951
Score = 2305 bits (1248), Expect = 0.0
Identities = 1352/1404 (96%), Gaps = 0/1404 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 8 TGGCTCCGTCGGATTTCCAACCGACTCTCTGGGACTCGGTTACGTCGCTGATTAGGTCAA 67
||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 79 TGGCTCCGTCGGAGTTCCAACCGAGTCTCTGGGAATCGGTTACGTCGCTGATTAGGTCAG 138
Query 68 CCCAGGAGAAGAACGTCGATCCGCTTCAGTGGGCTCTTCAGCTTCGCCTGACCCTCGCGT 127
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 139 CCCAGGAGAAGAACGTGGATCCGCTTCATTGGGCTCTTCAGCTTCGCTTGACCCTCGCGT 198
Query 128 CTGCTGGAATCTCCCTTCCCTCTCCGGACCTCGCTCAATTCCTCGTCACCCACATCTTCT 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 CTGCTGGAATCTCCCTTCCCTCTCCGGACCTCGCTCAATTCCTCGTCACCCACATCTTCT 258
Query 188 GGGAAAATCACTCTCCTCTTTCATGGAAGCTTCTCGAAAAAGCTATATCCGTCAATATCG 247
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 259 GGGAAAATCACTCTCCTCTTTCATGGAAGCTTCTCGAAAAAGCTATATCCGTCAATATTG 318
Query 248 TCCCTCCCCTACTTGTCCTCGCCCTTCTCTCCCCAAGGGTAATCCCAAACAGAAAGCTTC 307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TCCCTCCCCTACTTGTCCTCGCCCTTCTCTCCCCAAGGGTAATCCCAAACAGAAAGCTTC 378
Query 308 ACCCCGCTGCCTATAGGCTCTATATGGAACTCCTCAAGAGACATGCATTCTCATTCATGC 367
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 ATCCCGCAGCCTATAGGCTCTATATGGAACTCCTCAAGAGACATGCATTCTCATTCATGC 438
Query 368 CTCAAATCAGAGCACCAGGATATCACAAAACAATTAATTCCATCGATGATATCCTCCATC 427
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CTCTAATCAGAGCACCAGGATATCACAAAACAATGAATTCCATCGATGATATCCTCCATC 498
Query 428 TTTCTGAAACCTTTGGTGTCCAAGATCAAGAACCGGGAAGTATTCTCCTTGCATTTGTCT 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 TTTCTGAAACCTTTGGTGTCCAAGATCAAGAACCGGGAAGTATTCTCCTTGCATTTGTCT 558
Query 488 TCTCCATTGTCTGGCAGCTAGTTGATGCATCCCTAGACGAGGAAGGGCTTTTAGAACTCA 547
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 559 TCTCCATTGTCTGGGAGCTACTTGATGCATCCCTAGACGAGGAAGGGCTTTTAGAACTGA 618
Query 548 CATCTAATAAGAGGTCTAAATGGCCAAGCAGGCCACATGACATGGAAATAGACGGGCTGG 607
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 619 CATCTAATAAGAGATCTAAATGGCCAAGCAGCCCACACGACATGGATTTAGACGGGCTGG 678
Query 608 AAAATTCTGTCAAGAGAAATGAAAACCACGATGCACTTGAGAAAGCAAACACTGAAATCG 667
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 679 AAAATTCTGTGAAGAGAAATGAAAACCATGATGCACTAGAGAAAGCAAACACTGAAATGG 738
Query 668 CTATCGAGCTAATCCAAGACTTTTTGCAGAATAAAGTCACATCGAGGATTCTTCACTTGG 727
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 739 CTATCGAGCTAATCCAAGAATTTTTGCAGAATAAAGTCACATCGAGGATTCTTCATTTGG 798
Query 728 CAAGTCAAAACATGGAGAGCAAGACCATCCCTCGAGGAGAATTTCATGCGATTGTCTCCT 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 CAAGTCAAAACATGGAGAGCAAGACCATCCCTCGAGGAGAATTTCATGCGATTGTCTCCT 858
Query 788 CTGGTTCTAAGCTAGCATTGACTAGTGACTCTGCACTTTGGTTGCCCATTGATCTTTTCT 847
||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 CTGGTTCTAAGTTAGCATTGACCAGTGATTCTGCACTTTGGTTGCCCATTGATCTTTTCT 918
Query 848 TCGAAGACATAATGGATGGGACACAAGCTGCAGCAGCCAGCGCTGTTGAAAATCTAACTG 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 919 TCGAAGACATAATGGATGGGACACAAGCTGCAGCAGCTAGCGCTGTTGAAAATCTAACCG 978
Query 908 GTCTTGTTAAAGCATTGCAGGCAGCTAACAGTACAACATGGCATGATGCCTTTCTAGCTC 967
||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 GTCTTGTAAAAGCATTGCAAGCAGCTAATAGTACATCATGGCATGATGCCTTTCTAGCTC 1038
Query 968 TATGGTTAGCAGCCTTACGCCTTGTGCAAAGGGAGAATCTATGTCTGCGTTATTGCTTTA 1027
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 TATGGTTAGCAGCCTTACGCCTTGTGCAAAGGGAGAATCTATGTCTGCGTTATTGCTTTT 1098
Query 1028 TCATTCATATGATGGAAATATTATCTGAAGAAAGAGATCCAATCGAGGGTCCTGTGCCCC 1087
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 TCATGCATATGTTGGAAATATTATCTGAAGAAAGAGATCCAATCGAGGGTCCTGTGCCCC 1158
Query 1088 GCACCGACACTTTTCTTTGTGTATTACTATCTGTCACTCCACTTGCAGTTGCCAATATTA 1147
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GCACCGACACTTTTCTTTGTGTATTACTTTCTGTCACTCCACTTGCAGTTGCCAATATTA 1218
Query 1148 TTGAAGAAGAAGAAAGTCAGTGGATTGATCAAACTTCATCTAGCCCAAGCAACCAGTGGA 1207
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1219 TCGAAGAAGAAGAAAGTCAGTGGATTGATCAAACTTCGTCTAGTCCAAGCAACCAGTGGA 1278
Query 1208 AAGAGAAAAAAGGAAAATGTCGACAAGGATTAGTCAATAGCTTACAACAACTTGGTGATT 1267
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1279 AAGAGAAAAAAGGAAAATGTCGACAAGGATTAATTAATAGCTTACAACAACTTGGTGATT 1338
Query 1268 ATGAAAGCTTGCTGACACCACTTCGTTCTGTACAGTCCGTTGCCAATCAAGCTGCTGCTA 1327
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339 ATGAAAGCTTGTTGACACCACCTCGTTCTGTACAGTCCGTTGCCAATCAAGCTGCTGCTA 1398
Query 1328 AAGCAGTTCTTTTCATCTCCGGCATTACAAATGGTAATGGTTCCTATGAAAATACAAGCA 1387
||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1399 AAGCAATTATGTTCATCTCCGGCATTACAAATAGTAATGGATCCTATGAAAATACAAGCA 1458
Query 1388 TGAGCGAATCTCCAAGTGGCTGCT 1411
||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1459 TGAGCGAATCTGCAAGTGGCTGCT 1482
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 197356753762
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5