BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484168
Length=3982
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G02560.1 | Symbols: CAND1, ATCAND1, ETA2, TIP120, HVE | cull... 6311 0.0
> AT2G02560.1 | Symbols: CAND1, ATCAND1, ETA2, TIP120, HVE | cullin-associated
and neddylation dissociated | chr2:689788-697596
FORWARD LENGTH=4095
Length=4095
Score = 6311 bits (3417), Expect = 0.0
Identities = 3758/3923 (96%), Gaps = 22/3923 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGTACGGAAAATTACAGTATCTCCTCCTCCATCTTTTTTAACTTTCCTCAGAGCTCTCTC 60
|||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4 AGTACGGAAATTTACAGTA--T-CTCCTCCATCTTTTTTTACTTTCCTCAGAGCTCTCTC 60
Query 61 CTCTCCGCAACTTCCACCACCACCAAATCGGAACTCTCGGCGTTCTTACTCCGTCTCCGG 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 61 CTCTCCGCAACTTCCACCACCACCAAATCGGAACTCTCGGCGTTC-TACTCCGTCTCCGG 119
Query 121 CGTTGCCTCCGTCGATTTCATCATCTCAGTTGGAAGGAGTGAATTGATAAGGACAGGCCA 180
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||
Sbjct 120 CGTTACCTCCGTCGATTTCATCTTCTCAGTTGGAAGGAGTGAATTGAGAAGGTCGGGCCA 179
Query 181 AGATGGCGAACTTACAAGTGTCTGGGATAATCGAAAAGGTTCAGATGACGGGTAAAGATA 240
| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ATATGGCGAACTTACAAGTTTCTGGGATACTCGAAAAGTTTCAGATGACGGGTAAAGATA 239
Query 241 AAGATTATAGATACATGGCAACCTCTGATTTGCTTAATGAGTTGAATAAGGATTCCTTTA 300
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 AAGATTACAGATACATGGCAACCTCTGATTTGCTTAATGAGTTGAATAAGGATTCCTTTA 299
Query 301 AACTCGACAC-GGACTTGGAGATGAGATTGTCGAGTATCATATTGCAACAGCTCGATGAT 359
|| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 AAATCGAC-CTGGACTTGGAGGTGAGATTGTCGAGTATCATATTGCAACAGCTCGATGAT 358
Query 360 GTGGCTGGTGATGTTTCTGGATTGGCTGTTAAATGTCTTGCTCCATTGGTGAAGAAGGTT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GTGGCTGGTGATGTTTCTGGATTGGCTGTTAAATGTCTTGCTCCATTGGTGAAGAAGGTT 418
Query 420 GGAGAAGAGCGAATTGTCGAAATGACCAACAAATTATGTGATAAACTGTTGCATGGGAAA 479
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 419 GGAGAAGAACGAATTGTTGAAATGACCAACAAGTTATGTGATAAACTGCTGCATGGGAAA 478
Query 480 GACCAGCACCGTGATACCGCAAGCATAGCTCTCAGGACTGTTGTCGCCCAAGTTACTCCG 539
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 479 GACCAGCATCGTGATACCGCAAGCATAGCTCTCAGGACTGTTGTCGCTCAAATTGCTCC- 537
Query 540 T-CGCTTGCTCCATCTATTCTTGTTACTCTAACCCCACAAATGATAGGAGGGATAAGTGG 598
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 538 TACGCTTGCTCCATCTATTCTTGTTACTCTAACACCACAAATGATAGGAGGAATAAGTGG 597
Query 599 CCAGGGAATGAGCTCAGGGATTAAGTGTGAATGTCTTGAGATCATGTGTGATGTTGTTCA 658
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 CCAGGGAATGAGCTCAGGGATCAAGTGTGAATGTCTTGAGATCATGTGTGATGTTGTTCA 657
Query 659 AAAATATGGAAGTTTAATGACGGATGATCACGAGAAGCTATTGAACACATTGCTATTGCA 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 658 AAAATATGGAAGTTTAATGACGGATGATCACGAGAAGCTATTGAATACATTGTTATTGCA 717
Query 719 ATTGGGCTGTAACCAAGCCACAGTCAGGAAGAAGACTGTTACATGCATTGCATCTCTTGC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 718 ATTGGGCTGTAACCAAGCCACAGTCAGGAAGAAGACTGTTACATGCATTGCTTCTCTTGC 777
Query 779 CTCCAGTCTGTCTGATGATTTGCTCGCAAAGGCGACAGTTGAAGTTGTGAAAAATCTAAG 838
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TTCCAGTCTGTCTGATGATTTGCTCGCGAAGGCGACTGTTGAAGTTGTGAAAAATCTAAG 837
Query 839 TAACAGGAATGCAAAATCTGAGATTACACGTACCAATATTCAAATGATTGGAGCTTTATG 898
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TAACAGGAATGCAAAATCGGAGATTACACGTACCAATATTCAAATGATTGGAGCTTTATG 897
Query 899 CCGTGCTGTTGGGTATCGATTTGGGACTCATCTAGGTAACACAGTGCCAGTATTAATCAA 958
|||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 898 CCGTGCTGTTGGTTACCGGTTTGGCACTCATCTAGGTAACACTGTGCCAGTATTAATCAA 957
Query 959 TTACTGCACCAGCGCTTCAGAAAATGACGAGGAGCTTCGCGAGTATAGCTTACAGGCACT 1018
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TTACTGCACTAGCGCTTCAGAAAATGACGAGGAGCTTCGCGAGTATAGCTTACAGGCACT 1017
Query 1019 TGAAAGTTTCTTGCTACGATGTCCCAGGGATATCTCACCATATTGTGATGAAATTTTAAA 1078
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TGAAAGTTTCTTGCTACGATGTCCCAGGGACATCTCACCATATTGTGATGAAATTTTAAA 1077
Query 1079 TCTCACTTTGGAATATATTAGTTATGACCCGAATTTTACGGACAACATGGAGGAAGATAC 1138
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1078 TCTTACTTTAGAATATATTAGTTATGACCCGAATTTTACGGACAATATGGAGGAAGATAC 1137
Query 1139 TGATAATGAGACTCTTGAAGATGAAGAAGATGACGAGAGTGCAAATGAGTACACAGATGA 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 TGATAATGAGACTCTTGAAGATGAAGAAGATGACGAGAGTGCAAATGAGTACACAGATGA 1197
Query 1199 TGAGGATGCCAGCTGGAAAGTTAGGAGAGCAGCGGCGAAATGCCTAGCAGGATTAATCGT 1258
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TGAAGATGCCAGCTGGAAAGTTAGGAGAGCAGCGGCCAAATGCCTAGCAGGATTAATCGT 1257
Query 1259 TTCTCGTTCTGAGATGCTCGCTAAAGTATATCAAGAGGCCTGCCCGAAACTAATTGATAG 1318
||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TTCGCGTTCTGAGATGCTCACTAAAGTATATCAAGAGGCCTGCCCGAAACTAATTGATAG 1317
Query 1319 ATTTAAGGAAAGGGAGGAAAATGTGAAGATGGATGTATTCAACACATTCATTGATTTGTT 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1318 ATTTAAGGAAAGGGAGGAAAATGTGAAGATGGATGTATTCAACACATTCATTGATCTGTT 1377
Query 1379 ACGGCAAACAGGAAATGTTACAAAAGGTCAAACTGACACTGATGAATCAAGTCCAAAATG 1438
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 GCGGCAAACGGGAAATGTTACAAAAGGTCAAACTGACACCGATGAATCAAGTCCAAAATG 1437
Query 1439 GCTACTGAAGCAAGAAGTCTCAAAGATTGTAAAATCCATAAATAGGCAACTGCGTGAAAA 1498
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1438 GCTACTGAAGCAAGAAGTCTCAAAGATTGTGAAATCCATAAATAGGCAACTGCGCGAAAA 1497
Query 1499 GTCTGTAAAGACAAAGGTTGGTGCATTCTCCGTTTTGAGAGAACTTGTTGTTGTCTTGCC 1558
|||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||
Sbjct 1498 GTCTGTTAAGACAAAGGTTGGAGCATTCTCTGTTTTGAGAGAACTTGTGGTTGTCCTGCC 1557
Query 1559 TGACTGCCTTGCTGATCATATTGGTTCACTTGTTCCTGGAATTGAAAGGGCGCTAAATGA 1618
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 TGACTGTCTTGCTGATCATATTGGTTCACTTGTTCCTGGAATTGAAAGGGCGCTAAATGA 1617
Query 1619 TAAATCTTCTACTTCAAACTTGAAAATTGAAGCTCTTGTCTTCACCAAATTAGTCTTGGC 1678
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TAAATCTTCTACATCAAACTTGAAAATTGAAGCTCTTGTCTTCACCAAATTAGTCTTGGC 1677
Query 1679 ATCACATGCGCCTCCTGTTTTTCATCCGTACATTAAGGCTCTTTCAAGTCCTGTTTTAGC 1738
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 ATCACATGCGCCTCCTGTTTTTCACCCTTACATTAAGGCTCTTTCAAGTCCTGTTTTAGC 1737
Query 1739 TGCTGTTGGTGAACGCTATTACAAGGTGACCGCTGAGGCATTAAGGGTTTGTGGGGAACT 1798
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 TGCTGTTGGTGAACGCTATTATAAGGTGACTGCTGAGGCATTAAGGGTTTGTGGGGAACT 1797
Query 1799 TGTCAGAGTAGTACGCCCAAGTACTGCGGGAATGGGCTTTGATTTTAAACCGTTTGTTCA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 TGTCAGAGTAGTACGCCCAAGTACTGCGGGAATGGGCTTTGATTTTAAACCGTTTGTTCA 1857
Query 1859 TCCAATCTACAATGCGATAATGTCGCGGTTGACAAATCAAGATCAGGACCAGGAAGTCAA 1918
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1858 TCCAATCTACAATGCGATAATGTCCCGCTTGACAAATCAAGATCAGGACCAGGAGGTCAA 1917
Query 1919 GGAGTGTGCTATCACCTGTATGGGTCTTGTGATTTCAACATTTGGTGATCAGTTGAGAGC 1978
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1918 GGAGTGTGCTATCACCTGCATGGGTCTTGTGATTTCAACATTTGGTGATCAACTGAGGGC 1977
Query 1979 AGAGTTACCTTCATGCCTTCCTGTGCTTGTTGATCGAATGGGAAACGAAATCACTCGCCT 2038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 AGAGTTACCTTCATGCCTTCCTGTGCTTGTTGATCGAATGGGAAACGAAATCACTCGCCT 2037
Query 2039 CACTGCAGTAAAGGCATTTGCAGTCATTGCCACTTCTCCCCTTCACATTGATCTATCATG 2098
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2038 CACTGCAGTAAAGGCATTTTCTGTCATTGCCACTTCTCCGCTTCACATTAATCTATCATG 2097
Query 2099 TGTCTTGGACCATTTGATTACTGAACTAACGGGATTCTTACGGAAGGCTAATCGGGTTCT 2158
||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 TGTCTTGGACCATTTGATTGCAGAACTAACAGGATTCTTACGGAAGGCTAATCGGGTTCT 2157
Query 2159 AAGGCAAGCAACACTGATTACTATGAATACCTTGGTAACAGCCTACGGTGATAAAATTGG 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2158 AAGGCAAGCAACACTGATTACTATGAATACCTTGGTAACAGCCTATGGTGATAAAATTGG 2217
Query 2219 CTCAGATGCTTATGAAGTTATTCTTGTGGAGCTTTCATCTCTGATAAGTGTTTCGGACCT 2278
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2218 TTCAGAAGCTTATGAAGTTATTCTTGTGGAGCTTTCATCTCTGATAAGTGTTTCAGACCT 2277
Query 2279 GCACATGACAGCTCTTGCACTCGAACTCTGCTGCACTCTGATGACTGGAAAGAGTTGTAG 2338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GCACATGACAGCTCTTGCACTCGAACTCTGCTGCACTCTGATGACTGGAAAGAGTTGTAG 2337
Query 2339 TGAAAATATCAGTTTGGCAGTTCGCAACAAAGTTCTTCCGCAGGCACTAACTTTAGTTAA 2398
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 TGAAAATATCAGTTTGGCGGTCCGCAACAAAGTTCTTCCGCAGGCACTAACTTTAGTTAA 2397
Query 2399 AAGCCCATTGCTCCAGGGTCAAGCACTTTTGGATCTGCAAAAATTCTTTGAAGCTCTGGT 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 AAGCCCATTGCTCCAGGGTCAAGCACTTTTGGATCTGCAAAAATTCTTTGAAGCTCTGGT 2457
Query 2459 GTATCATGCAAATACGAGTTTCTACACCTTGCTGGAATCATTGCTATCTTGTGCTAAGCC 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 GTATCATGCAAATACGAGTTTCTACACCTTGCTGGAATCATTGCTATCTTGTGCTAAGCC 2517
Query 2519 TTCTCCTCAGTCTGGAGGTGTCCCAAAGCAAGCATTATATTCAATTGCACAGTGTGTGGC 2578
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 TTCTCCTCAGTCTGGAGGTGTCCCAAAGCAAGCACTATATTCAATTGCACAGTGTGTGGC 2577
Query 2579 GGTTCTTTGTCTCGCAGCGGGTGATAAGAATTGTTCGTCTACTGTTAAAATGCTTATGGA 2638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2578 GGTTCTTTGTCTCGCAGCGGGTGATAAGAATTGTTCGTCTACAGTTAAAATGCTCATGGA 2637
Query 2639 AATCCTTAAAGATGACAGTGGCACAAATTCAGCAAAACAACATCTTGCCCTGTTATCTCT 2698
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 AATCCTTAAAGATGACAGCGGCACAAATTCAGCAAAACAACATCTTGCCCTGTTATCTCT 2697
Query 2699 TGGTGAGATTGGGAGAAGGAAAGATCTCAGCGCACATGCTGGCATTGAAACAATCGTCAT 2758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 TGGTGAGATTGGGAGAAGGAAAGATCTCAGCGCACATGCTGGCATTGAAACAATCGTCAT 2757
Query 2759 TGAGTCTTTCCAATCTCCGTTTGAAGAAATAAAGTCTGCAGCTTCTTATGCTCTTGGAAA 2818
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2758 TGAGTCTTTCCAATCTCCTTTTGAAGAAATAAAGTCCGCAGCTTCATATGCTCTTGGAAA 2817
Query 2819 CATTGCTGTTGGCAATCTATCCAATTATTTACCTTTTATCTTGAACCAGATTGATAATCA 2878
|||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2818 CATTGCCGTTGGCAATCTATCCAATTATCTACCGTTTATATTGGACCAGATCGATAATCA 2877
Query 2879 ACAGAAAAAACAGTATATTCTCCTTCATTCACTCAAGGAGGTTATTGTGAGGCAGTCTGT 2938
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2878 ACAGAAAAAACAATATATTCTCCTTCATTCACTCAAGGAGGTTATTGTGAGACAGTCTGT 2937
Query 2939 TGATAAAGCGGATTTTCAGAATTCCAGTGTTGAGAAAATACTTGCTTTACTGTTTAACCA 2998
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2938 TGATAAAGCGGATTTCCAGAATTCCAGCGTTGAGAAAATACTTGCTTTACTGTTCAACCA 2997
Query 2999 TTGTGAAAGCGAGGAAGAAGGTGTAAGGAATGTTGTTGCTGAATGCTTGGGAAAAATGGC 3058
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2998 CTGTGAAAGCGAGGAAGAAGGTGTAAGGAATGTTGTTGCTGAATGCTTGGGAAAAATGGC 3057
Query 3059 TTTGATAGAGCCTGAGAAACTGGTTCCTGCTCTTCAGGTAAGGACGACGAGTCCAGCTGC 3118
||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3058 TTTGATAGAGCCTGAGAAACTTGTTCCAGCACTTCAGGTCAGGACAACGAGCCCAGCTGC 3117
Query 3119 TTTTACTCGTGCAACTGTTGTTACCGCTGTGAAATATTCAGTAGTGGAACGACCTGAGAA 3178
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3118 TTTTACCCGTGCAACTGTTGTTACTGCTGTGAAATATTCAGTAGTGGAACGACCTGAGAA 3177
Query 3179 ATTAGATGAAATCATCTTCCCTCAAATTTCTTCTTTCCTCATGCTGATTAAAGATGGTGA 3238
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3178 ATTAGATGAAATCATCTTCCCTCAGATTTCTTCTTTCCTCATGCTAATCAAAGATGGTGA 3237
Query 3239 CCGGCATGTTAGGCGTGCAGCTGTCTCAGCTCTGAGTACTTTTGCTCATTATAAACCAAA 3298
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 CCGTCATGTTAGGCGTGCAGCTGTCTCAGCTCTGAGTACTTTTGCTCATTATAAACCAAA 3297
Query 3299 CCTTATTAAAGGACTTCTCCCTGAACTGTTACCGCTTCTTTATGATCAGACCGTTATTAA 3358
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 CCTTATTAAAGGACTTCTCCCTGAGTTGTTACCACTTCTTTATGATCAGACCGTTATTAA 3357
Query 3359 GAAAGAATTAATTAGGACGGTTGATCTTGGCCCATTCAAGCATGTCGTTGATGACGGGCT 3418
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 3358 GAAAGAATTAATCAGGACGGTTGATCTTGGTCCATTCAAGCATGTTGTGGATGACGGGCT 3417
Query 3419 TGAGCTGAGGAAAGCAGCTTTTGAGTGTGTGTTTACTCTGCTAGATAGCTGTCTTGATCA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||
Sbjct 3418 CGAGCTGAGGAAAGCAGCTTTTGAGTGTGTGTTTACTCTGGTGGACAGCTGCCTTGATCA 3477
Query 3479 AGTGAATCCGTCTTCTTTCATTGTTCCTTTCCTCAAATCCGGACTAGAAGATCATTATGA 3538
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3478 AGTTAATCCGTCTTCTTTCATTGTTCCTTTCCTCAAATCCGGATTAGAAGATCATTATGA 3537
Query 3539 CTTGAAGATGCTTTGTCATCTTATACTCTCTTTGCTAGCAGATAAATCCCCCTCAGCCGT 3598
| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 3538 CCTGAAGATGCTTTGTCATCTTATACTCTCCTTACTAGCAGATAAATGCCCATCAGCCGT 3597
Query 3599 ACTTGCTGTACTGGATTCTCTTGTGGAACCACTGCATAAAACAATAAGCTTCAAGCCAAA 3658
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 ACTTGCAGTACTGGATTCTCTTGTGGAACCACTGCATAAAACAATAAGCTTCAAGCCAAA 3657
Query 3659 GCAAGATGCAGTGAAGCAAGAGCATGATCGTAATGAAGATATGATCAGAAGTGCTCTTCG 3718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3658 GCAAGATGCAGTGAAGCAAGAGCATGATCGTAATGAAGATATGATCAGAAGCGCTCTTCG 3717
Query 3719 TGCTATATCATCACTTGATCGAATCAATGGGGTGGATTATAGCCACAAGTTCAAGGGCTT 3778
||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 TGCTATATCGTCACTGGATCGTATCAATGGGGTGGACTATAGCCACAAGTTCAAGGGCTT 3777
Query 3779 AATGGGTGACATGAAGAGGTCTGTACCGTTGTGGGAAAAGTTTCAGACAATCCGGAACGA 3838
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3778 AATGGGTGATATGAAGAGGTCTGTACCATTGTGGGAGAAGTTTCAGACAATCCGGAATGA 3837
Query 3839 GTAAGTTTTTGTGTATGTTGTCT--AT----C-G--AT-GATGAT--TTTTCTATTCCAA 3886
||||||||||||||||||||||| || | | || |||||| |||||||||||||
Sbjct 3838 GTAAGTTTTTGTGTATGTTGTCTTCATTAAACAGTGATCGATGATGATTTTCTATTCCAA 3897
Query 3887 GAAAAGGGTACAGCGaaa-aaaa 3908
||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3898 -AAAAGGGTACAGCGAAAGAAAA 3919
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 198410259565
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5