BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484555
Length=5806
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G27670.1 | Symbols: RST1 | ARM repeat superfamily protein | ... 9116 0.0
> AT3G27670.1 | Symbols: RST1 | ARM repeat superfamily protein
| chr3:10245134-10253293 FORWARD LENGTH=5865
Length=5865
Score = 9116 bits (4936), Expect = 0.0
Identities = 5537/5825 (95%), Gaps = 49/5825 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTAGCTTAACTTATTGGGCCAAATCGAGACGGCCCATTATCTA 60
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 45 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTA--TTATCTTATTGGGCCAAATCG-GACGGCCCATTATCTA 101
Query 61 GCACCGGCTTATCGGACTTCCTC-TACCCGGCGCTGTAAATTCCAAATCCCTCCGTTCAC 119
|| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 102 GCTCCGGCTTATCGGACTTCCTCTTCCCCGGCGCTGTAAATTCCAAGTCCCTCCGTTCAC 161
Query 120 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCC-T-TCTCTCTCCGGTCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 177
||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCCTTCTCTCTCTCCAGCCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 221
Query 178 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTTGCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATTTCCGT 237
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 222 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTACCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATCTCCGT 281
Query 238 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTAGGATCAGAATCTGAAGCCGGAAGAGA 297
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 282 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTTGGATCAGAAGCCGAAGCCGGAAGAGA 341
Query 298 AGCTATCTCCTTCTGTCTCACTTCTGAATCTGTCACTGTAGTTGATCAATCCGTTCGTGA 357
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 342 AGCTATCTCCTTCTGCCTCACTTCTGAATCTATCACTGTCGTTGATCAATCCGTTCATGA 401
Query 358 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCTGTCTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGTTAGAACTTCA 417
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 402 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCAGTTTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGCTAGAACTTCA 461
Query 418 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTTGTGAAAGGGTTAGGGTT 477
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 462 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTCGTGAAAGGGTTAGGGTT 521
Query 478 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATTCTGGGAATTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 537
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATAATGGGAACTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 581
Query 538 TCATCCGTTTGTTAGGATTCTTTCTAGCCGAGCGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 597
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 TCATCCGTTTGTTAGGATTCAATCTAGCCGAGTGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 641
Query 598 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGGCGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 657
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGAAGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 701
Query 658 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACAATACTGCGGATTCCACTTGCAGATTCGTCGTCATCGTT 717
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 702 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACTATACTGCGGATTCCGCTTTCAGATTCGTCTTCATCGTT 761
Query 718 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCAAAGAAGC 777
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 762 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCCACGAAGC 821
Query 778 ACTTCCGATATTCAGGTTGC-TATTGCGTTGCCTAAAATATATCCCGGGAAAAAATCTGG 836
||| ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 822 ACTACCGATATTCAGATTGCTTA-TGCGATGTCTAAAATATATCCCGGGAAATAATCT-- 878
Query 837 AAGACAATAGAAATTTCAGCTACATTGTCAAGACT-CTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 895
| | | || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 --G------G--A----AG-TA-ATTGTCAAGA-TCCTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 921
Query 896 GTGAGAGACTTGGTTGGAACTGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATCTGCTCGGCGTGCAA 955
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 922 GTGAGAGACTTGGTTGGAACCGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATTTGCTCGGTGTGCAA 981
Query 956 CTGGTAGATGGTGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1015
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 CTGGTGGATGGCGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1041
Query 1016 TCTGTTATCGAATCTTCGAAGCATTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTACCATAT 1075
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1042 TCTGTTATCGAATCTTTGAAGCACTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTAGCATAT 1101
Query 1076 TCACGTGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCCAGTGTC 1135
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1102 TCACATGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCTACTGTC 1161
Query 1136 GAGCATGAACAACTCTCTATTCTAAAGTTCCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1195
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 GAGCATGAACAACTCTGTATTCTAAAGTTTCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1221
Query 1196 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAAGATGCGGCCGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1255
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAGGATGCGGCTGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1281
Query 1256 CCTATCATCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1315
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282 CCTATCACCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1341
Query 1316 CTTTCCATCATAGAAAATGTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGGGGTCCAC 1375
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1342 CTTTCCATCGTAGAAAATTTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGAGGTCCAC 1401
Query 1376 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGGTCATGCAG 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1402 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGTTCATGCAG 1461
Query 1436 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACGCACCTTCCACGCCCTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1495
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACACACCTTCCACGTCTTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1521
Query 1496 ATCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTATAC-AGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1554
| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 ACCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTAT-CTAGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1580
Query 1555 TAGGGAACATGCTGAACGGTTTTGGGATAGAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1614
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 TAGGGAACACGCTGAACGGTTTTGGGATAAAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1640
Query 1615 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCCCT 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1641 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCACT 1700
Query 1675 AGGAGCTGATGCTGTTAGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATCGATCCTAAGATGTGTGT 1734
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||
Sbjct 1701 AGGAGCTGATGCTATTGGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATTGATTCTAAGATGAGTGT 1760
Query 1735 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTACAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1794
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTTCAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1820
Query 1795 TCAGGGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCCCAACAGGTGAT 1854
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1821 TCAGAGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCACAACAGGTGAT 1880
Query 1855 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACACAAGGATGCGAAAGGTCTGTT 1914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1881 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACGCAAGGATGCCAAAGGTCTGTT 1940
Query 1915 GTATGCTACAGCAATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 1974
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 GTATGCTACAGCTATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 2000
Query 1975 AAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCAAAAGGATTTATAGACTATATTTCAGAGAGACATAT 2034
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2001 GAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCGCAAGGATTTATAGAATATATTTCAGAGAGACATAT 2060
Query 2035 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATTCACGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGGGGGGT 2094
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2061 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATCCATGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGAGGAGT 2120
Query 2095 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAACCAAGACTATCCAGTTCGAGCACT 2154
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||
Sbjct 2121 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAGCCAAAACTGTCCAGTTAGAGCCCT 2180
Query 2155 TGGTTTTCAGAGTCTTTCCCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2214
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2181 TGGTTTTCAGAGTCTTTCGCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2240
Query 2215 GGGTGTCGTTAAGAAACATGCTCAACACATCAAACTGAATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2274
|| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2241 GGATGTCATTAAGAAACATGCTCAACATATCAAACTGGATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2300
Query 2275 ATGCCTTCTTCTAAAGTGGGGTGCAATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2334
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 ATGCCATCTTCTAAAGTGGGGTGCCATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2360
Query 2335 CGTTCTGAACATTTTATGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGATGCCTCATGATTCCCAATG 2394
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2361 CGTTTTGAACATTTTGTGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGAAGCCTCATGATTCCCAATG 2420
Query 2395 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2480
Query 2455 GAAA-AAGTTTTCTGATTTCAACAAGAATTGTACATATTTGCTCTTCTCGGAGACAAATG 2513
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2481 -AAACAAGTTTTCTGACTTCAACAAGAATTGTACATATTTACTCTTCTCGGAGACAAATG 2539
Query 2514 CGGAAATTTTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAGATCATGATTCACGAGCACAGCA 2573
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2540 CGGAAATTCTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAAATCATGATTCACGAGCACAGCG 2599
Query 2574 TCCGGCGTAGATATGTTAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2633
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 TCCGGCGTAGATATGTAAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2659
Query 2634 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2719
Query 2694 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2779
Query 2754 GCTTTCGTGATGTTCATAGTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2813
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 GCTTTCATGATGTTCATTTTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2839
Query 2814 AGCTGTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCATTTATGC 2873
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2840 AGCTCTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCTTTTATGC 2899
Query 2874 GGCGTTGGATGAGAGCTAATATCTTGTCCATTGATGCAACGAGTAAAGAATTATCATCGG 2933
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2900 GGCGTTGGATGAGAGCGAATATATTGTCCATTGATGCAACGACTAAAGAATTATCATCGG 2959
Query 2934 ATAAAATTTCTAAAGCTGCAAACAACATCATGAAGAGTCTGGTACATATGGCTGAAGAAG 2993
|||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 ATAAGACCTCTAAAGCTACAAACAACATCATGAAGAGTTTGGTACATATGGCTGAAGAAG 3019
Query 2994 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCACTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3053
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3020 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCGCTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3079
Query 3054 CAGCTGCTGCTCATAATATTAAAGCGACTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3113
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 CAGCTGCTTCTCATAATATTAAAGCGTCTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3139
Query 3114 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACAGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3173
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3140 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACGGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3199
Query 3174 CCCTACATGTGACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3233
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3200 CCCTACACGTAACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3259
Query 3234 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3260 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3319
Query 3294 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3320 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3379
Query 3354 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTAGGAAGGATAGTGAGGTTACTATCTTCAATATTAC 3413
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3380 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTGGGAAGGATAGTGAGGTTGCTATCTTCTATATTAC 3439
Query 3414 ATCGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCATTGTTCCCAGCTG 3473
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 3440 ATGGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCACTGTTCCCCCCTG 3499
Query 3474 GAAAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGATAGTTCTGATGATTTTG 3533
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3500 GAGAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGAGAGTTCTGATGATTTTG 3559
Query 3534 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3560 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3619
Query 3594 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAACCTGATTGTATCGTGGA 3653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3620 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAATCTGATTGTATCATGGA 3679
Query 3654 TCCCATATGCAGATTCTCTTAAGCAAAC-TCCGGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3712
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3680 TCCCATATGCAGATTCTCTGAAGCAAACCTC-GGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3738
Query 3713 CTGTTTTCAGTTGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATCACTTTCTGCCAAAAAGTT 3772
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3739 CTGTTTTCAGTCGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATAACTTTCTGCCAAAAAGTA 3798
Query 3773 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTGGATCATCTAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3832
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3799 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTAGATGATATAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3858
Query 3833 GAGTTGCTGATTGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3892
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3859 GAGTTGCTAATCGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3918
Query 3893 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGT-TCTGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3951
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3919 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGTAT-TGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3977
Query 3952 TGAGTCTGTAAAAGGGTTACTAGAACTATTCAGGACATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4011
|||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3978 TGAGTCTGTAAAAGAGTTACTAGAACTGTTCAAGAAATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4037
Query 4012 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4038 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4097
Query 4072 TTTGGTGTATT-TCCATCCTTTACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAAAACGAAA 4130
||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4098 TTTGGTGTATTCTC-ATCCTCGACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAGAACGAAA 4156
Query 4131 TATCTTATGTGTCAGGTCCTTTGCTTTCAAACCCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4190
| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4157 TCTCTTATGTATCAGGTCCTTTGCTTTCAAACGCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4216
Query 4191 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4217 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4276
Query 4251 CTGCATGGGCAATATCAATTCTTAGAAATTACATGCGGTCCGGGGAAGCGTCAAGTCTCA 4310
||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 4277 CTGCATGGGCAATCTCAATTCTTAGAACTTACATGCGGTCAGGGGAATCGTCAAGTCTCA 4336
Query 4311 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTCACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4370
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4337 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTGACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4396
Query 4371 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4397 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4456
Query 4431 GCCCTCTGAATATTGGCACAATGGAAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4490
||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4457 GCCCTTTGAATATTGGCACAATGGCAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4516
Query 4491 TGCCAAACTTGGACTGGGGGGCAACAATAAGACGATTAATGAAACAAGAGACCCAGACCG 4550
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4517 TGCCAAACTTGGACTGGGGAGCAACAATAAGGCGTTTAATGAAACAAGAGACTCAGACTG 4576
Query 4551 ATGTATCGCAATCAGGCGATGTTCCCAAGGAAAGAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4610
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4577 ATGTAACGCAATCAGGCGATGTTCCTAAGGAAATAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4636
Query 4611 TTTCATTAGCCTACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAGTTGTCTG 4670
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 4637 TTTCATTAGCCCACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAACTGTCGG 4696
Query 4671 AACTAGCCAGATTCAAGGCGCTAGAGCAGAGTCTCCAGTCATGCCTGCTTTGTCATCTAG 4730
||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4697 AACTATCGAGATTCAAGGCACTAGAGGAGAGTCTTCAGTCGTGCCTGCTCTGTCATCTAG 4756
Query 4731 GGGATTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTATTTGACGATGTCTCTT 4790
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4757 GGGGTTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTGTTTGACGATGTCTCTT 4816
Query 4791 GCTTTGTAATCTCACTATCATCAAACCAAGTATATAGCTGTGAACAGAAGAGCTCATTGA 4850
|||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 4817 GCTTTGTAGTCTCGCTATCATCAGACCAAACATATAGCTGTGATCAGAAGAGCTCACTGA 4876
Query 4851 GGGTCTCTTTTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCGCTTGAATCTTCAG 4910
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4877 GGGTCTCTTGTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCACTTGAATCTTCAG 4936
Query 4911 AATACATCACAAAGATTGAAAAATGTATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4970
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4937 AATACGTCACAAAGATTGAAAAATGCATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4996
Query 4971 CACAATCTCCTGGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGCACGAGTGGTCAGAGGCAGTTAGAT 5030
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4997 CACAATCTCCTAGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGAAAGAGTGGTCAGAGGCAGTTACAT 5056
Query 5031 GTTTGCAGAAGTCGCCCCGGGATTGGTTATACAAATTTCTTCAGGTTTCAAATCTTGAAC 5090
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 5057 GTTTGCAGAAGTCGCATCGGGATTGGTTATACAAATTCCTACAGGTTTCAAATCTTGAAC 5116
Query 5091 CTCGAAACGGAGAGACGGACTTCAAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5150
|| |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5117 CTGGAAACGAAAAGACTAACTTCCAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5176
Query 5151 TAGCAAGACTTAGCTCAATTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATT-AAAGGCTATTATATTA 5209
|||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 5177 TAGCAAAACTTGGCTCAGTTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATTGAAAG-CTATTATATTA 5235
Query 5210 AATTGTGAACAGTCAGATATCTGGAACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTTTGCATCAC 5269
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5236 AATTGTGAAGAGTCAGATATCTGGGACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTCTGCATCAC 5295
Query 5270 GCCGAAGGAGGAATCAAAAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5329
|| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5296 GCTGAAGGAGGAATCAAGAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5355
Query 5330 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCAAGTATCTGCTGCGAATAC 5389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5356 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCTAGTATCTGCTGCGAATAC 5415
Query 5390 ATGCCGTTTCTCACTTTAGACCGATCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5449
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5416 ATGCCGTTTCTCAATTTAGACCGCTCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5475
Query 5450 TCTCTCCTGTCTGATCCCAGCTATGAAGTGGTCGCAGAGCCTGTCATCTCGTTTCTATGG 5509
|||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5476 TCTCTCCTTTCTGATCCAAGCTATGAAGTGGTCACAGAGCCTTTCATCTCGTTTCTATGG 5535
Query 5510 ACTTCATTGGAACGTATTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGATAAGC 5569
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 5536 ACTTCATTGGAACGTGTTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGCTAAGC 5595
Query 5570 TCACAGCAAATTGCGCAAAGTGAGAGAGATAAAGCATCAATGCTTATGAAAGTGATGCAT 5629
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5596 TCACAGCAAATTGCGCAAAGCGAGAGAGATAAAGCACCAATGCTTGTGAAAGTGATGCAT 5655
Query 5630 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5656 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5715
Query 5690 ATGGAGATCCCTTGATTCCttttaaac-tattgtataatttttatatttaggtgtatttt 5748
||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 5716 ATGGACATGTCTTAATTCCTTA-AAACCTATTGTATAGTTTTTATATTTAGGAGTATTTT 5774
Query 5749 gttgtatttttagt-----g-gg-attttcatttcccacattgttgtatttttgAAAGAT 5801
|||||||||||| | | || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5775 GTTGTATTTTTAATTTTTAGCGGGAATTTCATTGCCCACACTGTTGTATTTTTGAAAGAT 5834
Query 5802 ATATA 5806
|||||
Sbjct 5835 ATATA 5839
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 289670444298
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5