BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg484555 Length=5806 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G27670.1 | Symbols: RST1 | ARM repeat superfamily protein | ... 9116 0.0 > AT3G27670.1 | Symbols: RST1 | ARM repeat superfamily protein | chr3:10245134-10253293 FORWARD LENGTH=5865 Length=5865 Score = 9116 bits (4936), Expect = 0.0 Identities = 5537/5825 (95%), Gaps = 49/5825 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTAGCTTAACTTATTGGGCCAAATCGAGACGGCCCATTATCTA 60 |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 45 GGGTCGGTTCGGTTTCTCTA--TTATCTTATTGGGCCAAATCG-GACGGCCCATTATCTA 101 Query 61 GCACCGGCTTATCGGACTTCCTC-TACCCGGCGCTGTAAATTCCAAATCCCTCCGTTCAC 119 || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 102 GCTCCGGCTTATCGGACTTCCTCTTCCCCGGCGCTGTAAATTCCAAGTCCCTCCGTTCAC 161 Query 120 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCC-T-TCTCTCTCCGGTCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 177 ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 162 GTCTCCAAACTAGCCGTTGCCTTCTCTCTCTCCAGCCAAAGCGATGGCCTCATACGCTAC 221 Query 178 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTTGCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATTTCCGT 237 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 222 GTTACTGGAGAAAACTCGCGTACCTCAACCTTCTATACAAAGATTCGCAGTAATCTCCGT 281 Query 238 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTAGGATCAGAATCTGAAGCCGGAAGAGA 297 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 282 CTTCTCCAAGTTACGATCTGCTCCAGAACAATTTGGATCAGAAGCCGAAGCCGGAAGAGA 341 Query 298 AGCTATCTCCTTCTGTCTCACTTCTGAATCTGTCACTGTAGTTGATCAATCCGTTCGTGA 357 ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| Sbjct 342 AGCTATCTCCTTCTGCCTCACTTCTGAATCTATCACTGTCGTTGATCAATCCGTTCATGA 401 Query 358 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCTGTCTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGTTAGAACTTCA 417 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 402 GCTATGTCGATTAGTATCAGACTCAGTTTTAGACCTCTCTCGTGGTTTGCTAGAACTTCA 461 Query 418 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTTGTGAAAGGGTTAGGGTT 477 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 462 ATCAGCTCTCGAAGGATGCGATTCGAAATTGGTTTCGCTGTTCGTGAAAGGGTTAGGGTT 521 Query 478 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATTCTGGGAATTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 537 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 522 TTTGATTCGTATTGGTTATGAACGGAATAATGGGAACTGGAAGTTTAATTCGACGGAGAA 581 Query 538 TCATCCGTTTGTTAGGATTCTTTCTAGCCGAGCGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 597 |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 582 TCATCCGTTTGTTAGGATTCAATCTAGCCGAGTGGAGACACAGACGGAGCTTCTTCATCA 641 Query 598 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGGCGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 657 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 642 AGTATCACTCTTTGTGATGCATAATCGAAGATTAGGAATGGTGGGAGTATGTGAATTCTT 701 Query 658 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACAATACTGCGGATTCCACTTGCAGATTCGTCGTCATCGTT 717 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| Sbjct 702 GGAGCCGTTCTTGAATTTCACTATACTGCGGATTCCGCTTTCAGATTCGTCTTCATCGTT 761 Query 718 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCAAAGAAGC 777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 762 GTTTGCGAGGGAGTTGATTTCATCAATGGCTTCCCTTTGTTGCTCATCCCGCCACGAAGC 821 Query 778 ACTTCCGATATTCAGGTTGC-TATTGCGTTGCCTAAAATATATCCCGGGAAAAAATCTGG 836 ||| ||||||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 822 ACTACCGATATTCAGATTGCTTA-TGCGATGTCTAAAATATATCCCGGGAAATAATCT-- 878 Query 837 AAGACAATAGAAATTTCAGCTACATTGTCAAGACT-CTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 895 | | | || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 879 --G------G--A----AG-TA-ATTGTCAAGA-TCCTAGTGGATGCCTACACTGTGGTT 921 Query 896 GTGAGAGACTTGGTTGGAACTGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATCTGCTCGGCGTGCAA 955 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| Sbjct 922 GTGAGAGACTTGGTTGGAACCGGATTGGAAGTAACAGAAGTTCATTTGCTCGGTGTGCAA 981 Query 956 CTGGTAGATGGTGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1015 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 982 CTGGTGGATGGCGTACTTTTTCTTTGCGCTTCTCCTCATGTACAAACAACCGAACAAGAG 1041 Query 1016 TCTGTTATCGAATCTTCGAAGCATTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTACCATAT 1075 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1042 TCTGTTATCGAATCTTTGAAGCACTTGTTGGCTGTTCAGAAAGACCTTGGATTAGCATAT 1101 Query 1076 TCACGTGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCCAGTGTC 1135 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1102 TCACATGATTTATCCTTGGTGGTTCTCTCGCTAGTTTTCATGCTTGCCAAATCTACTGTC 1161 Query 1136 GAGCATGAACAACTCTCTATTCTAAAGTTCCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1195 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1162 GAGCATGAACAACTCTGTATTCTAAAGTTTCTGCTTTTTCTGCTCAAATGGAAAACTGAA 1221 Query 1196 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAAGATGCGGCCGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1255 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1222 AGTGAAAACTTGTCGGTTAAGGATGCGGCTGGTTCAAGTGTGGAGTCTCTATTATTGTTC 1281 Query 1256 CCTATCATCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1315 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1282 CCTATCACCGCACTGATGTCTTCTCCTTCTAAATCAATCAAAGTAGCAGCAAGTAAGGTT 1341 Query 1316 CTTTCCATCATAGAAAATGTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGGGGTCCAC 1375 ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1342 CTTTCCATCGTAGAAAATTTCTTGGTAACAGTGTCAAATGCACCAAAGATTGAGGTCCAC 1401 Query 1376 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGGTCATGCAG 1435 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1402 ACAAGTAAGGGAGATTCACCACTCAGCAGGGTGGGCTCTGTCGTATTTAGGTTCATGCAG 1461 Query 1436 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACGCACCTTCCACGCCCTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1495 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1462 CAACTCTGGCATCAGAATGATTACACACCTTCCACGTCTTCCTTCCTCAGAGTGGCTTAC 1521 Query 1496 ATCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTATAC-AGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1554 | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1522 ACCAATGGAAGTGAAAAACAGGAAACTTAT-CTAGGACCAGTGACTTGGAATTCACTACT 1580 Query 1555 TAGGGAACATGCTGAACGGTTTTGGGATAGAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1614 ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1581 TAGGGAACACGCTGAACGGTTTTGGGATAAAAAAAAGTTGTCTGCGTCGTTTTGTCTTTC 1640 Query 1615 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCCCT 1674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1641 ACAAGAGATACCTATTTTACTTGGTGCTGTTGCTGGTGTCATGGTGATGCACCCGTCACT 1700 Query 1675 AGGAGCTGATGCTGTTAGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATCGATCCTAAGATGTGTGT 1734 ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| Sbjct 1701 AGGAGCTGATGCTATTGGTTCTTTGACTATTATTGGTGGCATTGATTCTAAGATGAGTGT 1760 Query 1735 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTACAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1794 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1761 CCCGCTGTTGCTAGCTGTTCTATATTTCAGCAACTTGTTATCTCGAACTAACGTCCCTTG 1820 Query 1795 TCAGGGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCCCAACAGGTGAT 1854 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1821 TCAGAGTCTATTGTCAAAACTTCTGGGGTTGCTCCCATCACTAGCTGCACAACAGGTGAT 1880 Query 1855 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACACAAGGATGCGAAAGGTCTGTT 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 1881 GATTCCACTTGTAGTTCAGACTATTACTCCAATGCTACGCAAGGATGCCAAAGGTCTGTT 1940 Query 1915 GTATGCTACAGCAATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 1974 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1941 GTATGCTACAGCTATTAGATTACTTTGCCAGACCTGGGTAGTCAATGACCGTGCCTTTTC 2000 Query 1975 AAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCAAAAGGATTTATAGACTATATTTCAGAGAGACATAT 2034 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2001 GAGTTTGCAAGAGGTGTTACGCCCGCAAGGATTTATAGAATATATTTCAGAGAGACATAT 2060 Query 2035 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATTCACGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGGGGGGT 2094 |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 2061 CTGCATTAGTATGGCTGCTTCCATCCATGATGTATGCAAGAGACACCCTGATAGAGGAGT 2120 Query 2095 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAACCAAGACTATCCAGTTCGAGCACT 2154 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| || Sbjct 2121 AGACCTAATCTTGTCCGTTCAGGCCTGTATAGAAAGCCAAAACTGTCCAGTTAGAGCCCT 2180 Query 2155 TGGTTTTCAGAGTCTTTCCCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2214 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2181 TGGTTTTCAGAGTCTTTCGCATCTGTGTGAAGCCGATGTCATTGATTTCTATACTGCATG 2240 Query 2215 GGGTGTCGTTAAGAAACATGCTCAACACATCAAACTGAATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2274 || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2241 GGATGTCATTAAGAAACATGCTCAACATATCAAACTGGATCCTCTCCTTGCTTATAGTGT 2300 Query 2275 ATGCCTTCTTCTAAAGTGGGGTGCAATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2334 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2301 ATGCCATCTTCTAAAGTGGGGTGCCATGGATGCCGAAGCATATCCTGAAGATGCAGAAAA 2360 Query 2335 CGTTCTGAACATTTTATGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGATGCCTCATGATTCCCAATG 2394 |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2361 CGTTTTGAACATTTTGTGGGAAATTGGGAGCTCTATGCAGAAGCCTCATGATTCCCAATG 2420 Query 2395 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2421 GACAAAGGCAAGAGTCTCTGCCATAGTGGCCCTGGGTCAATATGAGGTATCATTTATGGA 2480 Query 2455 GAAA-AAGTTTTCTGATTTCAACAAGAATTGTACATATTTGCTCTTCTCGGAGACAAATG 2513 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2481 -AAACAAGTTTTCTGACTTCAACAAGAATTGTACATATTTACTCTTCTCGGAGACAAATG 2539 Query 2514 CGGAAATTTTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAGATCATGATTCACGAGCACAGCA 2573 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2540 CGGAAATTCTGAATGCTTTAGAAGACCTTTCAATCAAAATCATGATTCACGAGCACAGCG 2599 Query 2574 TCCGGCGTAGATATGTTAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2633 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2600 TCCGGCGTAGATATGTAAGAGAGAAGAAAGTTCCTGGTAGTAAGATTGAAAAGCTGCTTG 2659 Query 2634 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2693 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2660 ATGTGATACCTCAGGTCATCTTCCCTGCAGGGAAAGAAATAAAGACTGGAGAACTACCTG 2719 Query 2694 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2753 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2720 GTGCGGCATTACTATGTCTATCTTATAACCCCAGAGATGTGAAGTTTGGGTCATCAAGAA 2779 Query 2754 GCTTTCGTGATGTTCATAGTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2813 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2780 GCTTTCATGATGTTCATTTTCAATACGAGGAGGCATTTAGAGTAGTAGTCAAATCTCTCC 2839 Query 2814 AGCTGTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCATTTATGC 2873 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2840 AGCTCTCAAGAAATATTTCCCTTGCTCTTATTTCCTTGCAATCACTGAAAGCTTTTATGC 2899 Query 2874 GGCGTTGGATGAGAGCTAATATCTTGTCCATTGATGCAACGAGTAAAGAATTATCATCGG 2933 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2900 GGCGTTGGATGAGAGCGAATATATTGTCCATTGATGCAACGACTAAAGAATTATCATCGG 2959 Query 2934 ATAAAATTTCTAAAGCTGCAAACAACATCATGAAGAGTCTGGTACATATGGCTGAAGAAG 2993 |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2960 ATAAGACCTCTAAAGCTACAAACAACATCATGAAGAGTTTGGTACATATGGCTGAAGAAG 3019 Query 2994 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCACTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3053 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3020 CTCTTCCCAGGTGTGCAGAAAACATAGCACTGGCGCTGGGTGCACTATGTGCAGCTTTGC 3079 Query 3054 CAGCTGCTGCTCATAATATTAAAGCGACTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3113 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3080 CAGCTGCTTCTCATAATATTAAAGCGTCTGCATCAAAATTTCTGTTGAGTTGGTTGTTGG 3139 Query 3114 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACAGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3173 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3140 AGCATGAGCATGAACACCGTCAGTGGACGGCTGGTATTTCTCTTGGATTGATTTCGTCGT 3199 Query 3174 CCCTACATGTGACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3233 ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3200 CCCTACACGTAACTGACCACAAGCAGAAATTTCAGAATATATCTGGGCTTCTTGAGGTTT 3259 Query 3234 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3260 TGTGTAGCAGTAAAAGCACTCTTGTAAAAGGAGCCTGTGGGGTTGGATTGGGTTTTTCAT 3319 Query 3294 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3320 GCCAAGATCTGCTCACTCGGACTGAAGCCTCTGCGAGCTCTGATATAGACAGTGACTCCT 3379 Query 3354 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTAGGAAGGATAGTGAGGTTACTATCTTCAATATTAC 3413 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 3380 ACAGGAACCAAGAAGAACGGCTCTTGGGAAGGATAGTGAGGTTGCTATCTTCTATATTAC 3439 Query 3414 ATCGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCATTGTTCCCAGCTG 3473 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 3440 ATGGTTTCCTGCACACTCCGTGTGATATCCTAGAAAGCTTGTCTGCACTGTTCCCCCCTG 3499 Query 3474 GAAAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGATAGTTCTGATGATTTTG 3533 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3500 GAGAGGAAGACAACGTTATAGGTTTACCTCAGCTGTTGGATGAGAGTTCTGATGATTTTG 3559 Query 3534 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3560 ATGATGATACATGGGGTATTGCTGGACTCATTATAGGTTTGGGGATGTCAGTTGGTGCAA 3619 Query 3594 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAACCTGATTGTATCGTGGA 3653 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 3620 TATACAGAGCTGGGAAGAAAGACGCTGTTGTAAAGATTAAAAATCTGATTGTATCATGGA 3679 Query 3654 TCCCATATGCAGATTCTCTTAAGCAAAC-TCCGGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3712 ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3680 TCCCATATGCAGATTCTCTGAAGCAAACCTC-GGGTTCTAATAGTAAGGTATCAGTGAGA 3738 Query 3713 CTGTTTTCAGTTGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATCACTTTCTGCCAAAAAGTT 3772 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3739 CTGTTTTCAGTCGGTTCCTGCCTTGCACTCCCAATTGTGATAACTTTCTGCCAAAAAGTA 3798 Query 3773 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTGGATCATCTAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3832 ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3799 GAACTGTTTGATGCACATGAGGTAGATGATATAATCGGTTGTTTCAAGGACCTTATTTCC 3858 Query 3833 GAGTTGCTGATTGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3892 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3859 GAGTTGCTAATCGTTAGAAAGTCTGGTGCTTTACGTAAGAGGTTGTTGATGGCTTCCTGT 3918 Query 3893 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGT-TCTGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3951 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3919 ATTGGGGCGGGAGACCTCCTTGGTTCTGTAT-TGAATGAAGGTATCCACCCTGTTAAGAT 3977 Query 3952 TGAGTCTGTAAAAGGGTTACTAGAACTATTCAGGACATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4011 |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3978 TGAGTCTGTAAAAGAGTTACTAGAACTGTTCAAGAAATGTTACTCTGGACTTTACCCACC 4037 Query 4012 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4071 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4038 GGTTGCTCACTTTGGAGGCATGCTCGGAGTTGTTAATGTTTTAGGAGCAGGTGCTGGGAA 4097 Query 4072 TTTGGTGTATT-TCCATCCTTTACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAAAACGAAA 4130 ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4098 TTTGGTGTATTCTC-ATCCTCGACCCCGTGCTCCTCCAGCCAGTTCTGAGGAGAACGAAA 4156 Query 4131 TATCTTATGTGTCAGGTCCTTTGCTTTCAAACCCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4190 | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4157 TCTCTTATGTATCAGGTCCTTTGCTTTCAAACGCATATTTTACTCAGCAGTTGACGCCAG 4216 Query 4191 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4217 TTGTGCAAGAAATATTTCTTATCGCACAAAATACCAAGGATCGCCAGCTCCAACATTATG 4276 Query 4251 CTGCATGGGCAATATCAATTCTTAGAAATTACATGCGGTCCGGGGAAGCGTCAAGTCTCA 4310 ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| Sbjct 4277 CTGCATGGGCAATCTCAATTCTTAGAACTTACATGCGGTCAGGGGAATCGTCAAGTCTCA 4336 Query 4311 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTCACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4370 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4337 GCAATGAAAACCAATCTGATGACTCTGACCGTAATTCCATCTCTCACAATGTTCCTGAAC 4396 Query 4371 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4430 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4397 ATACCATGGTCATGAAACTTGCTCAAGGCCTGACAAATCCAAGTTTTCCTTTGGCGGGTA 4456 Query 4431 GCCCTCTGAATATTGGCACAATGGAAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4490 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4457 GCCCTTTGAATATTGGCACAATGGCAAGTGCTTTGCGGTGTTTGTCTCATGCTCCGAGAT 4516 Query 4491 TGCCAAACTTGGACTGGGGGGCAACAATAAGACGATTAATGAAACAAGAGACCCAGACCG 4550 ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 4517 TGCCAAACTTGGACTGGGGAGCAACAATAAGGCGTTTAATGAAACAAGAGACTCAGACTG 4576 Query 4551 ATGTATCGCAATCAGGCGATGTTCCCAAGGAAAGAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4610 ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4577 ATGTAACGCAATCAGGCGATGTTCCTAAGGAAATAACTCTTAGGGAAGAGTGCTTCAAAT 4636 Query 4611 TTTCATTAGCCTACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAGTTGTCTG 4670 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 4637 TTTCATTAGCCCACGCAAGCGAATTTGATGAACTTCTAGCTTTTCTGGACGAACTGTCGG 4696 Query 4671 AACTAGCCAGATTCAAGGCGCTAGAGCAGAGTCTCCAGTCATGCCTGCTTTGTCATCTAG 4730 ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 4697 AACTATCGAGATTCAAGGCACTAGAGGAGAGTCTTCAGTCGTGCCTGCTCTGTCATCTAG 4756 Query 4731 GGGATTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTATTTGACGATGTCTCTT 4790 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4757 GGGGTTTAATGAGAATATTCTCAGGTTCAAGAATGAATAAATTGTTTGACGATGTCTCTT 4816 Query 4791 GCTTTGTAATCTCACTATCATCAAACCAAGTATATAGCTGTGAACAGAAGAGCTCATTGA 4850 |||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 4817 GCTTTGTAGTCTCGCTATCATCAGACCAAACATATAGCTGTGATCAGAAGAGCTCACTGA 4876 Query 4851 GGGTCTCTTTTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCGCTTGAATCTTCAG 4910 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4877 GGGTCTCTTGTTGGAAGGGTCTGAGTCAGTGTCTTGAAGAAACTTCACTTGAATCTTCAG 4936 Query 4911 AATACATCACAAAGATTGAAAAATGTATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4970 ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4937 AATACGTCACAAAGATTGAAAAATGCATAGAGTTGCTTTTTGCTGTCTTACCAGTAGCAT 4996 Query 4971 CACAATCTCCTGGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGCACGAGTGGTCAGAGGCAGTTAGAT 5030 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || Sbjct 4997 CACAATCTCCTAGAGCAGATCAGATGGGTTCGGTGAAAGAGTGGTCAGAGGCAGTTACAT 5056 Query 5031 GTTTGCAGAAGTCGCCCCGGGATTGGTTATACAAATTTCTTCAGGTTTCAAATCTTGAAC 5090 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 5057 GTTTGCAGAAGTCGCATCGGGATTGGTTATACAAATTCCTACAGGTTTCAAATCTTGAAC 5116 Query 5091 CTCGAAACGGAGAGACGGACTTCAAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5150 || |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5117 CTGGAAACGAAAAGACTAACTTCCAAGGTGATCTAAAGAAGATCCAGGCAAAAGCCAAGC 5176 Query 5151 TAGCAAGACTTAGCTCAATTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATT-AAAGGCTATTATATTA 5209 |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 5177 TAGCAAAACTTGGCTCAGTTCCATTTTCCGAGTTAGGAAAATTGAAAG-CTATTATATTA 5235 Query 5210 AATTGTGAACAGTCAGATATCTGGAACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTTTGCATCAC 5269 ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5236 AATTGTGAAGAGTCAGATATCTGGGACGTGTTGATTGAGATAGTAGCGGCTCTGCATCAC 5295 Query 5270 GCCGAAGGAGGAATCAAAAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5329 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5296 GCTGAAGGAGGAATCAAGAGACAGTGGCTCATTGATGCAGTTGAAATCAGCTGCGTTTCT 5355 Query 5330 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCAAGTATCTGCTGCGAATAC 5389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5356 AGCCATCCTTCCACTGCTATTATCTTCGTCGGCCTTCTTTCTAGTATCTGCTGCGAATAC 5415 Query 5390 ATGCCGTTTCTCACTTTAGACCGATCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5449 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5416 ATGCCGTTTCTCAATTTAGACCGCTCCACGGTGTTGAGCGATATGTCTGTTACCGTAACT 5475 Query 5450 TCTCTCCTGTCTGATCCCAGCTATGAAGTGGTCGCAGAGCCTGTCATCTCGTTTCTATGG 5509 |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5476 TCTCTCCTTTCTGATCCAAGCTATGAAGTGGTCACAGAGCCTTTCATCTCGTTTCTATGG 5535 Query 5510 ACTTCATTGGAACGTATTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGATAAGC 5569 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5536 ACTTCATTGGAACGTGTTTACAGTTTTGCAACTGAATCTGACGCTAATGCAAGGCTAAGC 5595 Query 5570 TCACAGCAAATTGCGCAAAGTGAGAGAGATAAAGCATCAATGCTTATGAAAGTGATGCAT 5629 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 5596 TCACAGCAAATTGCGCAAAGCGAGAGAGATAAAGCACCAATGCTTGTGAAAGTGATGCAT 5655 Query 5630 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5656 TACATTTGTGTAGCCTTCAGAGATCATTTGCCTCTTGAGAAACAGCTTAGACTTGCTTCT 5715 Query 5690 ATGGAGATCCCTTGATTCCttttaaac-tattgtataatttttatatttaggtgtatttt 5748 ||||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 5716 ATGGACATGTCTTAATTCCTTA-AAACCTATTGTATAGTTTTTATATTTAGGAGTATTTT 5774 Query 5749 gttgtatttttagt-----g-gg-attttcatttcccacattgttgtatttttgAAAGAT 5801 |||||||||||| | | || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5775 GTTGTATTTTTAATTTTTAGCGGGAATTTCATTGCCCACACTGTTGTATTTTTGAAAGAT 5834 Query 5802 ATATA 5806 ||||| Sbjct 5835 ATATA 5839 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 289670444298 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5