BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484766
Length=3873
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G42670.1 | Symbols: CHR38, CLSY | chromatin remodeling 38 | ... 6095 0.0
> AT3G42670.1 | Symbols: CHR38, CLSY | chromatin remodeling 38
| chr3:14755798-14760085 REVERSE LENGTH=3879
Length=3879
Score = 6095 bits (3300), Expect = 0.0
Identities = 3692/3884 (95%), Gaps = 16/3884 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAAGAGAAAGCATTACTTTGAGTTTAATCATCCATTTAATCCATGTCCTTTCGAGGTG 60
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGAGAAAGCATTACTTTGAGTTTAACCATCCATTTAATCCATGTCCTTTCGAGGTG 60
Query 61 TTCTGCTGGGGGACATGGAAGGCCGTGGAGTACTTAAGAATCGAGAATGGAACGATGACG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TTCTGCTGGGGGACATGGAAGGCCGTGGAGTACTTAAGGATCGAGAATGGAACGATGACA 120
Query 121 ATGCGTCTCTTGGAAAATGGACAAGTATTGGATGATATAAGACCATTTCAGAGGCTTCGT 180
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 121 ATGCGTCTCTTAGAAAATGGACAAGTTTTGGATGATATAAAACCATTTCAGAGGCTTCGA 180
Query 181 CTTAGATCAAGAAAGGCGACTTTGATCGACTGTACTTCTTTTTTAAGACCCGGTATCGAT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 ATTAGATCAAGAAAGGCGACTTTGATCGACTGTACTTCTTTTTTAAGACCCGGTATCGAT 240
Query 241 GTTTGCGTTCTCTATCAGAAAGATGAAGAGACTCCAGAACCGGTTTGGGTGGATGCAAGG 300
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 241 GTTTGCGTTCTTTATCAGAGAGATGAAGAGACTCCAGAACCAGTTTGGGTGGATGCAAGG 300
Query 301 ATATTATCTATAGAGAGGAAGCCTCATGAATCTGAATGCTTGTGTACGTTCCATGTCATT 360
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 301 GTTTTATCTATAGAGAGGAAGCCTCATGAATCTGAATGCTTGTGTACGTTCCATGTCAGT 360
Query 361 GTTTATATAGACCAAGGCTGCATCGGTTTGGAGAAGCATAGAATGAATAAAGTTCCGGTA 420
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTTTATATAGACCAAGGCTGCATTGGTTTGGAGAAGCATAGAATGAATAAAGTTCCGGTA 420
Query 421 CTCGTGGGACTCAACCAAATCGCCATTCTCCAAAAGTTTTGCAAGGAACAAAGCTTGGAC 480
||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CTCGTGGGACTCAACGAAATCGCCATCCTTCAAAAGTTTTGCAAGGAACAAAGCTTGGAC 480
Query 481 CGCTACTACAGATGGAGATACTCTGAGGACTGCTCTTCGCTGGTGAAAACAAGACTAAAC 540
|| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CGTTACTATAGATGGAGATACTCTGAGGACTGTTCTTCGTTGGTGAAAACAAGACTAAAC 540
Query 541 CTGGGGAAGTTCTTGCCTGATCTTACATGGTTGCTTGTTACATCAGTTTTGAAAAACATT 600
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 TTAGGGAAGTTCTTGCCTGATCTTACATGGTTGCTTGTTACATCAGTTTTGAAAAACATT 600
Query 601 GTGTTTCAGATCAGAACAGTTCACGAGAAGATGGTTTATCAGATTGTGACTGATGAAGAT 660
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 601 GTGTTTCAGATTAGAACCGTTCACGAGAAGATGGTTTATCAGATTGTGACGGATGAAGAT 660
Query 661 TGCGAAGGCTCTAGTAGCTCTTTGAGTGCAATGAACATCACGGTCGAAGACGGTGTTTTC 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||
Sbjct 661 TGCGAAGGCTCTAGTAGCTCTTTGAGTGCAATGAACATTACGGTTGAAGACGGTGTTGTC 720
Query 721 ATGTCTAAGGTGGTTTTGTTCAATCCAGCTGAGGATACTTATGAAGATAGTGATGTAAAG 780
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 721 ATGTCTAAGGTTGTTTTGTTCAATCCAGCTGAGGATACTTGTCAAGATAGTGATGTAAAG 780
Query 781 GAGGAGATTGAAGAGGAGGTAATGGAGCTGCGTCGGTCCAAGAGAAGAAGCGGGCGACCT 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 GAGGAGATTGAAGAGGAGGTAATGGAGCTGCGTCGGTCCAAGAGAAGAAGCGGGCGGCCT 840
Query 841 GAGAGATACGGGGACTCTGAGATTCAGCCAGATTCAAAGGATGGATGGGTAAGGATGATG 900
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GAGAGATACGGAGACTCTGAGATTCAGCCGGATTCGAAGGATGGATGGGTAAGGATGATG 900
Query 901 CCATATAGGTACAGTACATGGACTGTTTCAAGTGATGACGATGACGAAG-A-AA-ATTGT 957
||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||
Sbjct 901 CCATATAGGTACAACATATGGAATGTTTCAAGTGATGATGATGATGAAGAAGAAGATTGC 960
Query 958 GATGATGATAGAGATACCGATGACGATTTATACTTACCGTTATCGCATTTACTT-GGAAG 1016
|| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 961 GAGGATGATAAAGATACTGATGATGATTTATACTTACCGTTATCGCATTTACTTAGAAAG 1020
Query 1017 AAAAGGAAGCACAAAGGGATTAAGTAAGGATAAGCAAAGAGAGATTGTTTTGGTAGACAA 1076
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1021 -AAAGGAAGCAAAAAGGGATTTAGTAAGGATAAGCAGAGAGAGATAGTTTTGGTAGACAA 1079
Query 1077 AACTGAAAGGAAGAAGAGAAAGAAAACAGAGGGATTTGGTCGAAATTGTGAGCTTTCGGT 1136
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 1080 AACTGAGAGGAAGAAGAGAAAGAAAACAGAGGGATTTAGTCGAAGTTGTGAGCTTTCGGT 1139
Query 1137 TATTCCTTTCACTCCTGTCTTTGAACCTATACCGTTGGAACAGTTTGGTCTCAATGCAAA 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TATTCCTTTCACTCCTGTCTTTGAACCTATACCGTTGGAACAGTTTGGTCTCAATGCAAA 1199
Query 1197 TAGTTTGTGTGGTGGTTTCTCTGGAAGTCATTTGATGGATGAGATCGATAAGTATCGTAG 1256
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TAGTTTGTGTGGTGGTGTCTCTGGAA---ATTTGATGGATGAGATCGATAAGTATCGTAG 1256
Query 1257 TAAAGCAGCGAAATAC--G--G--GAAGAAGAAGAAG-TTAGAAATGGAAGAGATGGAAT 1309
|||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TAAAGCAGCGAAATACGGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATT-GAAATGGAAGAGATGGAAT 1315
Query 1310 CTGATCTAGGTTGGAATGGACCCATTGGCAATGTGGTTCATAAAAGAAATGGACCGCATT 1369
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 CTGATCTAGGTTGGAATGGACCTATTGGGAATGTGGTTCATAAAAGAAATGGACCGCATT 1375
Query 1370 CCCGAATAAGGTCCGTTTCTAGGGAAACCGGAGTTTCTGAGGAACCGCAGATTTATAAGA 1429
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CTCGAATAAGGTCCGTTTCTAGGGAAACCGGAGTTTCTGAGGAACCGCAGATTTATAAGA 1435
Query 1430 AGAGAACGTTGAGCGCAGGCGCGTATAACAAGCTGATCGACTCGTACATGAGTAGAATTG 1489
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 AGAGAACGTTGAGCGCAGGTGCGTATAACAAGTTGATAGACTCGTACATGAGTAGAATTG 1495
Query 1490 ATTCTACAATTGCAGCCAAAGATGAAGCAACCAATGTTGTTGAGCAGTGGGAGGGGATAA 1549
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||
Sbjct 1496 ATTCTACAATTGCAGCCAAGGACAAAGCAACCAATGTTGTTGAGCAGTGGCAAGGGTTAA 1555
Query 1550 AGAACACTGCAACCTTTTCTATAGAAGCCGAAGAAAGGTTGAGTGACGAGGATGACGATG 1609
||||| | |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||
Sbjct 1556 AGAACCCCGCAAGCTTTTCGATCGAAGCCGAAGAAAGGTTGAGTGAGGAGGAGGAGGATG 1615
Query 1610 ACGGAGAGACGTCAGAGAACGAGATGCTATGGAGGGAAATGGAACTATGTTTGGCTTCTT 1669
| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1616 ATGGCGAGACTTCAGAGAATGAGATTCTATGGAGGGAAATGGAACTATGCTTGGCTTCTT 1675
Query 1670 CTTACATTCTTGATGACAATGAGGTGAGAGTGGATAACGAGGCGTTCCATAAAGCAACCG 1729
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 CTTACATTCTTGATGACCATGAGGTGAGAGTGGATAACGAGGCGTTCCATAAAGCAACCT 1735
Query 1730 GTGATTGTGAACATGATTATGAATTGAATGAAGAAATCGGAATGTGTTGCAGATTGTGTA 1789
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 GTGATTGTGAACATGACTATGAATTGAATGAAGAAATCGGAATGTGTTGCAGATTGTGTG 1795
Query 1790 GTCATGTAGGATCTGAGATAAAACATGTCTCTGCACCTTTTGCGCAGCACAAGAAATGGA 1849
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1796 GTCATGTAGGAACTGAGATAAAACATGTTTCTGCACCTTTTGCGCGGCACAAGAAATGGA 1855
Query 1850 CCACGGAGACTAAGCAAATCAACGAAGATGACATTAATACTACTAAAGTGAACCAAGATG 1909
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 1856 CGACGGAGACTAAGCAAATCAACGAAGATGACATTAATACTACTATAGTTAACCAAGATG 1915
Query 1910 GAGTTGAGAACCATACTTTCACTATACCAGTTGCTTCCTCCGATATGCCCTCTGCTGAAG 1969
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 1916 GAGTTGAGAGCCATACTTTCACTATACCAGTTGCTTCCTCAGATATGCCATCGGCTGAAG 1975
Query 1970 AAAGTGACAATGTTTGGTCTCTAATACCTCAGCTTAAGAGAAAACTGCATTTGCACCAGA 2029
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 AAAGTGACAATGTCTGGTCTTTAATACCTCAGCTTAAGAGAAAACTGCATTTGCACCAGA 2035
Query 2030 AAAAAGCTTTTGAGTTTCTCTGGAAGAACTTAGCCGGGTCAGTGATTCCCGCGATGATGG 2089
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2036 AAAAAGCTTTTGAGTTTCTCTGGAAGAACCTAGCCGGGTCAGTGGTTCCCGCGATGATGG 2095
Query 2090 ATCCGAGTTCAGAGAAGATAGGTGGGTGCGTGGTTTCTCATACTCCCGGAGCAGGCAAAA 2149
||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2096 ATCCGAGTTCAGATAAGATAGGTGGGTGTGTAGTTTCTCATACTCCCGGAGCAGGAAAAA 2155
Query 2150 CATTTCTGATCATAGCTTTTCTCGCGAGCTACTTGAAGATATTTCCGGGTAAAAGGCCAT 2209
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2156 CATTTCTAATCATAGCTTTTCTCGCGAGCTACTTGAAGATATTTCCGGGTAAAAGACCTT 2215
Query 2210 TGGTTCTTGCTCCAAAAACAACGTTGTACACATGGTATAAGGAGTTCATCAAATGGGAGA 2269
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TGGTTCTTGCTCCAAAAACAACTTTGTACACTTGGTACAAGGAGTTCATCAAATGGGAGA 2275
Query 2270 TTCCGGTCCCTGTTCACTTGCTCCATGGTCGTAGAACCTACTGTGTGTCCAAAGAGAACA 2329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 2276 TTCCGGTCCCTGTTCACTTGCTCCATGGTCGTAGAACCTACTGTATGTCCAAAGAGAAGA 2335
Query 2330 CCATTCAGTTCAAGGGAATTCCAAAACCGAGCCAAGATGTTATGCATGTTCTTGACTGTT 2389
||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 CCATTCAGTTCGAGGGAATTCCAAAACCAAGCCAAGATGTTATGCATGTTCTTGACTGTT 2395
Query 2390 TAGACAAAATCCAGAAATGGCATGCACAGCCGAGTGTTCTTGTGATGGGTTACACATCGT 2449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2396 TAGACAAAATCCAGAAATGGCATGCACAGCCGAGTGTTCTTGTAATGGGTTACACATCGT 2455
Query 2450 TCCTAACATTGATGAGGGAAGATTCAAAGTTTGCTCATAGAAAATACATGGCCAAAGTAC 2509
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2456 TTCTAACTTTGATGAGGGAAGATTCAAAGTTTGCTCATAGAAAGTACATGGCTAAAGTAC 2515
Query 2510 TGAGAGAGTCTCCTGGATTACTAGTTTTAGACGAGGGACATAACCCGAGGAGTACCAAAT 2569
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2516 TGAGAGAGTCTCCTGGATTACTGGTTCTAGACGAGGGACATAACCCGAGGAGTACCAAGT 2575
Query 2570 CGAGATTACGAAAGGCCTTGATGAAAGTTGATACTGATTTGAGGATTCTGCTTTCGGGTA 2629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2576 CGAGATTACGAAAGGCCTTGATGAAAGTTGATACTGACTTGAGGATTCTGCTTTCTGGTA 2635
Query 2630 CATTGTTTCAGAACAACTTCTGTGAGTACTTCAACACTTTGTGCTTGGCTAGACCCAAGT 2689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 CATTGTTTCAGAACAACTTCTGTGAGTACTTCAACACTTTGTGCTTGGCTAGACCCAAGT 2695
Query 2690 TTGTTCATGAGGTTCTTGTGGAGTTGGACCAGAAGTTCCAGACCAACCAAGCTGTGGAAA 2749
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct 2696 TTGTTCATGAGGTTCTAGTGGAGTTGGACAAGAAGTTCCAGACCAACCAAGCCGAGCAAA 2755
Query 2750 AGGCGCCTCACTTGCTTGAAAATAGAGCTCGGAAATTCTTCCTCGACATTATTGCCAAGA 2809
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2756 AGGCGCCTCACTTGCTTGAAAATAGAGCTCGGAAGTTCTTCCTTGACATTATAGCCAAGA 2815
Query 2810 AGATTGACACAAAAGTGGGCGATGAGCGCTTGCAGGGTCTCAACATGTTGAGGAATATGA 2869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2816 AGATTGACACAAAAGTGGGCGATGAGCGCTTGCAGGGTCTCAACATGTTGAGGAATATGA 2875
Query 2870 CCAGTGGTTTCATCGATAACTATGAAGGGAGCGGAAGCGGAAGTGGTGATGTTCTCCCAG 2929
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 CGAGTGGTTTCATCGATAACTATGAAGGGAGTGGAAGCGGAAGTGGTGATGTTCTCCCAG 2935
Query 2930 GTTTGCAGATTTACACATTGTTGATGAATTCAACTGATGTACAGCACAAGAGTCTTACCA 2989
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 GTTTGCAGATTTACACATTGTTGATGAATTCCACTGATGTACAGCACAAGAGTCTTACCA 2995
Query 2990 AACTTCAGAATATAATGTCGACTTACCATGGATATCCACTCGAGCTTGAGTTACTCATAA 3049
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2996 AACTTCAGAACATAATGTCAACTTACCATGGATATCCACTCGAGCTCGAGTTACTCATAA 3055
Query 3050 CGTTAGCAGCTATCCATCCTTGGTTGGTCAAAACCACTACATGTTGCACCAAATTCTTCA 3109
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||
Sbjct 3056 CGTTAGCTGCTATCCATCCTTGGTTGGTCAAAACCACAACCTGTTGCGCCAAATTCTTCA 3115
Query 3110 ATCCTGAGGAGCTTTTCGAGATTGAGAAGCTCAAGCATGATGCAAAGAAAGGATCAAAAG 3169
| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 ACCCTCAGGAGCTTTTAGAGATTGAGAAGCTCAAGCACGATGCAAAGAAAGGATCAAAAG 3175
Query 3170 TCATGTTTGTGCTTAACCTAGTGTTCCGGGTGGTCAAGAGGGAGAAAATCCTCATCTTTT 3229
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3176 TCATGTTTGTGCTTAATCTTGTGTTCCGGGTGGTCAAGAGGGAGAAAATCCTCATATTTT 3235
Query 3230 GCCACAACATTGCGCCGATCCGCCTGTTTCTTGAGCTGTTTGAGAATGTTTTCAGGTGGC 3289
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3236 GTCACAACATTGCGCCGATCCGCCTGTTTCTTGAGCTGTTCGAGAATGTATTCAGGTGGA 3295
Query 3290 AGAGAGGCCGAGAGCTCCTGACCTTGACAGGGGATCTCGAGCTGTTTGAGAGAGGCAGAG 3349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3296 AGAGAGGCCGAGAGCTCCTGACCTTGACAGGGGATCTCGAGCTGTTTGAAAGAGGCAGAG 3355
Query 3350 TGATAGACAAATTTGAAGAACCAGGAGGCCAGTCCCGTGTTCTGCTGGCTTCGATCACAG 3409
| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3356 TAATAGACAAATTTGAAGAGCCAGGAGGCCAGTCCCGTGTTCTGCTGGCTTCGATTACAG 3415
Query 3410 CCTGTGCAGAAGGCATCAGTCTAACCGCTGCTTCCCGGGTGATCATGCTTGATTCGGAGT 3469
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3416 CCTGTGCAGAAGGCATCAGTCTAACCGCTGCTTCACGGGTGATCATGCTTGATTCAGAGT 3475
Query 3470 GGAATCCTTCTAAGACTAAGCAAGCAATCGCACGTGCGTTCAGACCAGGACAGCAGAAAG 3529
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 3476 GGAATCCTTCTAAGACAAAGCAAGCAATCGCACGTGCATTCAGACCGGGACAGCAGAAAG 3535
Query 3530 TGGTGTACGTTTACCAGCTCTTGTCCAGAGGAACACTTGAGGAAGACAAATACAGGAGGA 3589
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3536 TGGTGTACGTTTACCAGCTCTTGTCGAGAGGAACACTTGAAGAAGACAAATACAGGAGGA 3595
Query 3590 CGACCTGGAAAGAGTGGGTGTCAAGTATGATTTTCAGCGAAGAATTTGTGGAGGACCCAT 3649
||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 CGACCTGGAAAGAATGGGTCTCCAGTATGATTTTCAGTGAAGAATTTGTGGAGGACCCAT 3655
Query 3650 CACAGTGGCAAGCTGAGAAGATCGAGGACGATGTTCTTAGAGAAATCGTGGAGGAAGACA 3709
| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 CTCAATGGCAAGCTGAGAAGATTGAGGACGATGTTCTTAGAGAAATCGTGGAGGAAGACA 3715
Query 3710 AAGTCAAATCCTTCCATATGATCATGAAGAACGAGAAAGCTTCAACAGGTGGCTGATTGC 3769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 AAGTCAAATCCTTCCATATGATCATGAAGAACGAGAAAGCTTCAACAGGTGGCTGATTGC 3775
Query 3770 TGAAGTTTTACAGTTCAAGTTTCTGTTTCACCATGCCTTTGATGATGATTCTTTAACAGC 3829
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3776 TGAATTTTTCCAGTTCAAGTTTCTGTTTCACCATGCCTTTGATGATGATTCTTTAACAGC 3835
Query 3830 TTGTTGTATTGTAATATAAACTAATCCGGTATCACAAGTTTGTG 3873
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 3836 TTGTTGTATTGTAATATAAACTAATCCTGTATCATAAGTTTGTG 3879
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 192942062778
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5