BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484805
Length=3840
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G43610.1 | Symbols: | Spc97 / Spc98 family of spindle pole ... 5862 0.0
> AT3G43610.1 | Symbols: | Spc97 / Spc98 family of spindle pole
body (SBP) component | chr3:15517680-15524087 REVERSE LENGTH=3876
Length=3876
Score = 5862 bits (3174), Expect = 0.0
Identities = 3591/3788 (95%), Gaps = 46/3788 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CTCATCATCATCATACTCAGCTTTTTGGCTTGTGGGTATCGGAATGACGAAAGAGGTCTC 60
|||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||
Sbjct 33 CTCATCATCACCATTCTCAGCTTTTTGGCTTGT--G----GGAATGACGAAAGATCTCTC 86
Query 61 CTTTCTGGGATCCGAGAAGCAACTCGACGAAACCCTTTGCCGCTAAAACCATTCCAGTAA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 87 CTTTCTGGGATCCGAGAAGCAACTCGACGAAACCCTTTTCCGCTAAAACCATTCCAGTCA 146
Query 121 AGGCAGTAGTAATAATGCCGGTGGTGGCGACGAGTCTCGTTTCGCTTCAGGAGAAGCTTA 180
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 147 AGGCAGTAGTAATAATGCCGGTGCTGGCGACGAGTCTCG--T---TTC-------GCTTA 194
Query 181 AAGTGGAGGAGCCATACCTTCCTCCGCGCAATTGGGAATCTTTACCTTCTCAGAGCCGCC 240
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||
Sbjct 195 AAGTGGAGGAGCCATACCTTCCTCCGCGAAATTGGGAATCTTTACCGTCTCAAAGCGGCC 254
Query 241 GATTTCTTCCTCCAACTCCTTCTTCTG---CTTCTTC-T--TC--C-T-C--TGTCTCTG 288
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || | | | ||||||||
Sbjct 255 GATTTCTTCCTCCAACTCGTTCTTCTGCTTCTTCTTCTTCATCTTCTTCCTTTGTCTCTG 314
Query 289 AATCGAGCTTGGTCAGGTTGGCGCTGAATGCCCTGCAAGGTGTTGAGTCTTCTCTTATTA 348
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 315 AATCGAGCTTGGTCAGGTTGGCGCTGAATGCTCTGCAAGGAGTTGAGTCTTCTCTTATTA 374
Query 349 GCATAGAACAGCTCTCTTCTGCATTATGTTCTGAGCCAGCTGACAGGACCCTCCACAAAA 408
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 375 GTATAGAACAGCTCTCTTCTGCATTTTGTTCTGAGCCAGCTGACAGGACCTTCCACAAAA 434
Query 409 TTCCAAGCTTGTGGCATCGGTTGTCAAGCACTGATGCGTTGGGACAGATTCTTAGAAATA 468
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 435 TTCCGAGCTTGTGGCATCGGTTGTCAAGCACTGATGCGTTGGGACAGATTCTTAGAGATA 494
Query 469 TTGGCTGCTTTGGTTCTTTGGTCTTTCTTCTCCATAAGTTCGTAGACCATTTCACAAGCT 528
| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 495 TAGGCTGCTTCGGTTCTTTGGTATTTCTTCTCCATAAGTTCGTTGACCATTTCACAAGAT 554
Query 529 TGAATTTGGATGTGGAAACAGCTGTTGAGAGACAGGGGAGCTATAAAATTGGTGAAAATG 588
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 555 TGAATTTGGATGTGGAATCAGCTGTTGAGGGACAGGGGAGCTGTAAAATTGGTGAAAATG 614
Query 589 AAGAAGTCAATAACAGAAGCTGCTATACTCTTGTTAATCAGGCTTTTGCTATTGCTGTGA 648
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 AAGAAGTCAATAACAAAAGCTGCTATACTCTTGTTAATCAGGCTTTTGCTATTGCTGTGA 674
Query 649 GAAAGGTCCTTCAAGGCTATATATCTGGGCTGGATACATTATGTGCATCGATAGAACTGA 708
| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GGAGGGTCCTAGAAGGCTATATATCTGGGCTTGATACATTATGTGCATCGATAGAACTGA 734
Query 709 GGCGTTCGTCAAACATTGTTGATGGGTCTGACCATGGTTCCTCTTGGTCAGGCTGCCTTA 768
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||
Sbjct 735 GGCGTTCATCAAACATTGTTGATGGGTCTGACCATGGTTCTTCTCGGTTAGGCAGCCTTA 794
Query 769 CAAACGTCGTTCATCCAAAGATAACATTATTGGAAGTTTTTCTGCATACTAGAGAGTTAA 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 CAAACGTCGTTCATCCAAAGATAACATTATTGGAAGTTTTTCTGCATACTAGAGAGTTAA 854
Query 829 GAACACAGATTGAAGCTCTTGCAAACATATGCAATTTGTATGATATAGCCCTTTCTTACT 888
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 GAACACAGATTGAAGCTCTGGCAAACATATGTGATTTGTATGATATAGCCCTTTCTTACT 914
Query 889 GTGCCTCTCCTTGGGAATGTCTGATTACTGAAGCAACCACGCGATTTCATGGGTTCTACA 948
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 915 GTGCCTCTCCTTGGGAATGTCTCATTACTGAAGCAACCACGCGATTTCATGGGTTCTACA 974
Query 949 GTGGAAGCGACCTGCTTACTTACTTATATACACAACTACAGGTTGCTGATCCTGCTCACA 1008
| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 975 GAGGAAGTGACCTTCTTACTTACTTATATTCACAACTACAGGTTGCTGATCCTACTCACA 1034
Query 1009 GTGCTATGCTTAAGTTTTTGTTCCTCAAAACATGTGAGCCATATTGTGAGTTTATAAGAT 1068
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GTGCTATGCTGAAGTTTTTGTTCCTCAAAACATGTGAGCCATATTGTGAGTTTATAAGAT 1094
Query 1069 CTTGGATGTTTAAAGCCGAACTTAACGACCCTCACAAGGAGTTCATTGGGGAATGTCTCA 1128
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1095 CTTGGATGTTTAAAGCCGAACTTAACGATCCTCACAAGGAGTTCATTGTGGAATGTCGCA 1154
Query 1129 GCGAATCGACATCTTTTTCTTGGAATAAGCCTGGCACCTCCCCATTGAAGAGCGTAAGGG 1188
| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 GTGAGTCAACATCTTTTTCTTGGAATAAGCCTGGCATCTCCCCATTGAAGAGCGTAAGGG 1214
Query 1189 AGCAAGGAGGGCTTGTTCCGTGTTTCTTGAACGGCTTCTTGGAACCTATACTAAGGGCTG 1248
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1215 AGCGAGGAGGGCTTGTTCCGTGTTTCTTAAACGGCTTCTTGGAACCTATAGTAAGGGCTG 1274
Query 1249 GTCAACAGCTTCAAGTAATTACAAAACTTCTGGAACTGTGTAATCCTCCTGCATCTGGAC 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct 1275 GTCAACAGCTTCAAGTAATTACAAAACTTCTGGAACTGTGTAATCTTCCTGCGTCTGGAC 1334
Query 1309 ACAAAAATTACACAGATCTTCTTCCGTGTTGGACGTATTTTTCTACTTCTAGTCCAGGGC 1368
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1335 ACAAAAATTACACAGATCTTCTTCCGTGTTGGACCTATTTTTCTACCACTAGTCCAGGGT 1394
Query 1369 ACCCATCTCCAATAACTTTCAGCAAATTACAAATAGAAGTGATGGTAAAGAAAAGAGACG 1428
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1395 ACCCATCTCCAATAACTTTCAGCAAATTACATATAGAAGTGATGATAAAGAAAAGAGACG 1454
Query 1429 ATTACTACAGAATGATGCAAGAAAAACTTGGTGACTTTTCAGAAAAGTTTGA-GCTCTTC 1487
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||
Sbjct 1455 ATTACTACAGAATGATGCAAGAAAAACTTGGTGACTTTTCAGAAAAGTTTGAAG-TGTTC 1513
Query 1488 CCTGGGCAGGTTCCTGGAGCATTATCTTTACCAATATCCTATGGCGACGGAGACAAAAAT 1547
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 CCTGGGCAGGTTCCTGGAGCAATATCTTTACCAATCTCCTATGGCGACGGAGACAAAAAT 1573
Query 1548 TCTGTTTATTTCACACTGGATGAGAGTTTACTAATTCCTTCAACAGTGGCAATAGACTTG 1607
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1574 TCCATTTATTTCACACTGGATGAGAGTTTACTAATTCCTTCAACAATGGCAATAGACTTG 1633
Query 1608 ACCAGGGACCAGAGTGGCTCAGATTCTGATGACCAGAATACAGAAGACAGATGGTTTTCA 1667
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 ACCAGGGACCAGAGTGGCTCTGATTCTGATGATCAGAATACAGAAGACAGATGGTTTTCA 1693
Query 1668 GAGATAGATGCATCATGTTCATCTGAATGTTCATCGACTAGGGATTCTTTGGAAGCATCC 1727
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 GAGATAGATGCATCATGCTCATCTGAATGTTCATCGACTAGGGATTCTTTGGAAGCATCC 1753
Query 1728 GATGTTGGACTCCTTGATTCACAAAGTACATTAGTGGGACCTCCACCAAATTATTTATCA 1787
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 GAGGTTGGACTCCTTGATTCACAAAGTACATTAGTGGGACCTCCACCAAATTATTTATCA 1813
Query 1788 GCTCTACGTTTCTCTGTTGCCTCTGATGGGAATTGTAATCAGAATCTGGTTCAGCATAGT 1847
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 GCTCTACGTTTCTCTGTTGCCTCTAATGGGAATTGTAATCAGAATCTGGTTCAGCATAGT 1873
Query 1848 GATTCAGGTTATATAGACAATAATTTTGTGAAGCAAGGTGAGAAGGCAGATACTAATCAT 1907
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1874 GATTCAGGTTATATAGACAATAATCTTGTGAGGCAAGGTGAGAAGGCAGATATTAATCAT 1933
Query 1908 CAGTGGATGGATACTGAGCCAGAAGAGTCAACTGGAGTATGTGAAGATGATAAATTTAGG 1967
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1934 CAGTGGGTGGATACTAAGCCAGAAGAGTCAACTGGAGTATGTGAAGATGATAAATTTAGG 1993
Query 1968 GGGCCTATTTCT-ATTAAGTCATGGCCCCTTGGCGGATTACCTAGAAATCCGTTTTGTGT 2026
|| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1994 GGCCCTCTTT-TGATTAAGTCATGGCCCCTTGGCGGATTACCTAGAAATCCATTTTGTGT 2052
Query 2027 TGATAAGAAGTCTGCAGAAGATGACAGAGAAGATCCAAGAAATGATTCAGGAGCTATGAC 2086
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 2053 TGATAAGAAGTCTGCAGACGATGACAGCGAAGATCCAAGAAATTATTCAGGAGCTAGGAT 2112
Query 2087 GGAACAGAGGCACTTAATGAATACTGATGAAGGCAAACTATTTTTAAACAACATTTCCAC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 GGAACAGAGGCACTTAATGAATACTGATGAAAGAAAACTATTTTTAAACAACATTTCCAC 2172
Query 2147 CAGTGGCAGCTGTTCAAAGCACGAGAGGAGACATGATTTGCTGGAAAACTGTCTTTCATC 2206
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 CAGTGGCAGCTGTTCAAAGCACGAGAGAAGACATGATGTGCTGGAAAACTGTCTTTCATC 2232
Query 2207 GAAATTAGATTTGATGAAAGACACAAAGGTAAACTACCCTTACGAGGTGCTCAGTATGAA 2266
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||
Sbjct 2233 GAAATTAGATTTGATGAAAGACACAAAGGTAAACTACCCTAATGATGTCCTCAGTATGAA 2292
Query 2267 TCCTTTACTGAGATGTGATTTCTTGCGCAAGCATGGAAATACAAACAGGAGGAACCAGGG 2326
||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 2293 TCCCTTAGTGAGATGTGATTTCTTGCGCAAGCATGGTAACACAAACAAGAGGAACCAGGG 2352
Query 2327 GAAATCATTGCCTTGGTTTGATTTTTCTGCGGTGGATGACCCTTCAAAAACATGTATTAC 2386
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 GAAATCATTGCCTTGGTTTGATTTTTCCGCGGTGGATGACCCTTCAAAAACATGTATTAC 2412
Query 2387 CAGGATACCTGTACGAGTCCCTATTGATTTTCATAAGGAATCTCATAGTTTTCAGACTGA 2446
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||
Sbjct 2413 CAGGATACCTGTACGAGTCCCTATTGATTTTCAGAAAGAATCTCACAGTCCTCAGACTGA 2472
Query 2447 TAGAAACCGCCATCGCCATGTCAACCAAGAATGTGGGATAGATAGGTTTGATGTTGAAGA 2506
|||||| | |||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||
Sbjct 2473 TAGAAAGAGTCATCGCCATGCCAACCAAGAA------A--G---G-TTTGATGTTGAAGA 2520
Query 2507 ACCTAAAGTTTCATGCAGTCATTTATCTTCTGGTATAAAAGGTTGCGCTGAAGaaaaaaa 2566
||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2521 TCCTAAAGTTTCTTCCAGTCAGTTATCTTCTGGTATAAAAGGTTGCGCAGAAGAAAAAAA 2580
Query 2567 aTCAAATGCATTTGGTGGAGGTAGATGGGAGGGTATGCTTCGTAGATCAAATAACCCTGA 2626
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 ATCAAATGCATTTGGTGGAGGTAGATGGGAGAGTATGCTTCGTAGATCAAATAACCCTGA 2640
Query 2627 AACTAGTGCCTTTAGTGATCGCAGACAGGACTCCTCTGGCACATTTGAATTGCCACTTGA 2686
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 AACTAGTGCCTTTAGTGATCGCAGACAGGACTCCTCTGGCACATTTGAATTGCCACTTGA 2700
Query 2687 TTTTGTTATAGACAAGTGTCTACTGCAGGAAATACATCTTCAATATAACTTTGTCAGTAA 2746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 TTTTGTTATAGACAAGTGTCTACTGCAGGAAATACATCTTCAATATAACTTTGTCAGTAA 2760
Query 2747 GCTAGCTATCAAGTTGCTCGAAGAAGGATTTGGCTTGCAAGAACATCTGCTAGCTCTACG 2806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 GCTAGCTATCAAGTTGCTCGAAGAAGGATTTGGCTTGCAAGAACATCTGCTAGCTCTACG 2820
Query 2807 TAGATATCATTTCATGGAACTAGCAGATTGGGCAGATGTATTTGTAGTGTCCCTTTGGCA 2866
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2821 TAGATATCATTTCATGGAACTAGCAGACTGGGCAGATGTATTTGTAGTGTCACTTTGGCA 2880
Query 2867 TCATAACTGGCTTGTTACAGAGGCAGATAAGAGAATTGCAGAAATCCAAGGGTTTCTAGA 2926
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2881 TCATAAATGGCTTGTTACAGAGGCAGATAAGAGAATTGCAGAAATTCAAGGGTTTCTAGA 2940
Query 2927 ATCATCAATTCAGAGATCATCATGTGAACGAGACATTTGTAAGGACAGGTTATTTTTGTA 2986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2941 ATCATCAATTCAGAGATCATCATGTGAACGAGACATTTGTAAGGACAGGATATTTTTGTA 3000
Query 2987 CAAAAGACAAGGCACAATGCATATCCCACCATCAACCATTGGAGTGCGTTCCTTTGATTT 3046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 CAAAAGACAAGGCACAATGCATATCCCACCATCAACCATTGGAGTGCGTTCCTTTGATTT 3060
Query 3047 CCTAAGGTTGGGTTATCGAGTGGACTGGCCAATCAGTATAATTTTAACATGCGATGCCCT 3106
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3061 CCTAAGGTTGGGTTATCGAGTGGATTGGCCAATCAGTATAATTTTAACATGCGATGCCCT 3120
Query 3107 GAAAGCGTATGCAGATGTATTTAGTTTCCTGGTTCAAGTGAAACTAGCAGCCTATGTATT 3166
|| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3121 GACAGCGTATGCTGATGTATTTAGTTTCCTGGTTCAAGTGAAACTAGCAGCCTACGTATT 3180
Query 3167 AACTGATGTCTGGTGTTCACTGAAGGATGTAAGACATATGATGCATGAGAATAAAGAGAA 3226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3181 AACTGATGTCTGGTGTTCACTGAAGGATGTAAGACATATGATGCATGAGAAGAAAGAGAA 3240
Query 3227 GATATTGAAGCAAGAACTCCGGTGGTTGAACATATTGATGAAACTAAGGCATCAGGTCAA 3286
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3241 GATATTGAAGCAAGAACTCCGGTGGTTAAACATATTGATGAAACTAAGGCATCAGGTCAA 3300
Query 3287 CCATTTTGTAACAGCACTACAGCAATATATACATTCGGAATTGTCTCACGTATCATGGTC 3346
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3301 CCATTTTGTAACAGCACTACAGCAATATGTACATTCAGAATTGTCTCACGTATCATGGTC 3360
Query 3347 CAAGTTCCTTCATTCCCTGAAAAATAAGGTCAAGGATATGATGGATCTTGAATCTGTGCA 3406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3361 CAAGTTCCTTCATTCCCTGAAAAATAAGGTCAAGGATATGATGGATCTTGAATCTGTGCA 3420
Query 3407 TATGGCTTATCTAAGTGAGGCTTTGCGCATATGTTTCCTATGTGACGAAACTCGAGTCAT 3466
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||
Sbjct 3421 TATGGCTTATCTAAGTGAGGCTTTGCGCATATGCTTCCTATCTGACGAAACCCAAATCAT 3480
Query 3467 ATCTAACATCATAGAGAACATCTTGCAATGCGCACTGGATTTCCGGTCTTGTCTTCCCAG 3526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 ATCTAACATCATAGAGAACATCTTGCAATGCGCACTGGACTTCCGGTCTTGTCTTCCCAG 3540
Query 3527 AGGTATTCAGAGTACAGATCGAGTCCCAAACGATTCACAGACAAAAACACTAGGCATAAA 3586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct 3541 AGGTATTCAGAGTACAGATCGAGTCCCAAACGATTCATGGACAAAAACATTAGGCATAAA 3600
Query 3587 CACATCTCAGGTGATGATGGTAAAACAAAATTTTGACAAAGAGTTAAAAGAGCTGCATAA 3646
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3601 CACATCTCAGGTGATGATGGTGAAGCAGAATTTTGACAAAGAGTTAAAGGAGCTGCATAA 3660
Query 3647 GTGTCATATGAGATCACCAAAACATGGGAAATTTGGACTCTCTCGCTTCTGGGACTACCT 3706
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3661 GTGTCACCTGAGATCACCAAAACATGGGAAATATGGGCTCTCTCGCTTCTGGGACTACCT 3720
Query 3707 CAACTTCAACCTTTATTACTCAGATATCCTTCATGACTCTAACATCTTCTTTCTTATTCC 3766
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3721 CAACTTCAACCTTTATTATTCAGATATCCTTCATGACTCTAACATCTTCTCTCTTATTCC 3780
Query 3767 TTAGAAGT 3774
||||||||
Sbjct 3781 TTAGAAGT 3788
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 191286553659
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5