BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484854
Length=3669
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-... 5845 0.0
AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family ... 1746 0.0
> AT3G44340.1 | Symbols: CEF | clone eighty-four | chr3:16011621-16020254
REVERSE LENGTH=3723
Length=3723
Score = 5845 bits (3165), Expect = 0.0
Identities = 3518/3685 (95%), Gaps = 38/3685 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTCCTTCTACTCTCCAGATCCGAGGATTCTCTT-GTTTACAGATTTGTAAAACGTACGT 59
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 37 TCTCCTTCTACTCTCCAGATCCGAGGATTCTCTTCGTTTACAGATTTGT-AAACGTTCGT 95
Query 60 GATATTGGATTTGTTGATCTCTTTTGGTATATA-AAGCATGGCTGCTCCAGTGCCTCCAG 118
|| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 GAAATTGGATTTGTTGATCTC-TTTGGTA-A-ACAAGCATGGCTGCTCCAGTGCCTCCAG 152
Query 119 GAGCATATAGACCTAATAACAATCCGCAAAACTCCGGTGGTCCTCCGAATTTTGTTCCTG 178
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GAGCATATAGACCTAATAACAATCAGCAAAACTCTGGTGGTCCTCCGAATTTTGTTCCTG 212
Query 179 GTTCACAAGGAAACCCCAATTCTTTAGCTGCTAATATGCAGAATTTGAACATTAATCGGC 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 GTTCACAAGGAAACCCCAATTCTTTAGCTGCTAATATGCAGAATTTGAACATTAATCGGC 272
Query 239 CACCTCCTCCTATGCCTGGTTCTGGTCCTAGACCATCTCCACCTTTTGGTCAGTCACCAC 298
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 CACCTCCTCCTATGCCTGGTTCAGGTCCTAGACCATCTCCACCTTTTGGTCAGTCACCAC 332
Query 299 AATCTTTTCCT------CAACAACAACAACCAAGGCCTTCTCCAATGGCTAGACCTGGAC 352
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 AATCTTTTCCTCAACAACAACAACAACAACCAAGGCCTTCTCCAATGGCTAGACCTGGAC 392
Query 353 CTCCTCCACCTGCTGCAATGGCGAGACCAGGTGGACCTCCTCAGGTATCGCAACCTGGCG 412
||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 393 CTCCTCCTCCTGCTGCTATGGCTAGACCAGGTGGACCTCCTCAGGTATCGCAACCTGGTG 452
Query 413 GGTTTCCACCAGTTGGAAGACCGGTTGGTCCGCCTTCTAGTCAGCCGCCGTTTGGTTCCA 472
| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |
Sbjct 453 GTTTTCCGCCAGTTGGAAGACCCGTTGCTCCACCTTCTAATCAGCCACCGTTTGGTGGAA 512
Query 473 GACCATCGACTGGTCCATTGGTTGGTGGTGGTTCGTCATTTCCTCAGCCTGGTGGTTTTC 532
||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 GACCATCTACAGGTCCGTTGGTTGGTGGTGGTTCGTCATTTCCTCAGCCTGGTGGTTTTC 572
Query 533 CGGCTTCAGGTCCACCAGGAGGTGTACCTTCTGGTCCTCCTTCAGGAGCACGTCCGATTG 592
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CAGCTTCAGGTCCACCAGGAGGTGTACCTTCTGGTCCTCCTTCAGGAGCACGTCCGATTG 632
Query 593 GTTTTGGTTCGCCTCCACCTATGGGACCTGGCATGTCCATGCCTCCTCCCTCTGGCATGC 652
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GTTTTGGTTCTCCTCCACCTATGGGACCTGGTATGTCCATGCCTCCTCCCTCTGGCATGC 692
Query 653 CTGGTGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGTGGTCCGTTGAGTA 712
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
Sbjct 693 CTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCATGCATGGCGGTCATTTGAGCA 752
Query 713 ATGGGCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCTCCGA 772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 753 ATGGGCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGACCTCCTCCTCCGA 812
Query 773 TGATGGGTCCGGGGGCATTTCCCAGAGGATCACAGTTCACAAGTGGTCCTATGATGGCTC 832
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 TGATGGGTCCGGGGGCATTTCCCAGAGGATCACAATTCACAAGTGGTCCTATGATGGCTC 872
Query 833 CACCGCCTCCCTATGGACAGCCTCCTAACGCAGGTCCTTTTCCAGGAAATTCACCATTAT 892
||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 873 CACCGCCACCATATGGACAGCCTCCTAATGCAGGCCCTTTTACGGGAAATTCACCATTAT 932
Query 893 CTTCGCCTCCTGCTCATTCGCTGCCTCCGCCAACAACTTTTCCTGGTG-CACCTTACGGC 951
|||| |||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||
Sbjct 933 CTTCACCTCCTGCTCATTCAATACCCCCGCCGACAAATTTTCCTGGTGTC-CCTTATGGC 991
Query 952 AGACCACCCATGCCAGGAGGCTTTCCTTATGGAGCACCACCTCAGCAGCTACCTTCTACT 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||
Sbjct 992 AGACCACCCATGCCAGGAGGCTTTCCTTATGGAGCACCACCACAACAGCTACCTTCTGCT 1051
Query 1012 CCTGGCACTCCTGGTTCAATGTATAGCATGGGTCCAGTGCCAAATCAGTCAATGACCTCT 1071
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1052 CCTGGCACTCCTGGTTCAATCTATGGCATGGGTCCAATGCAAAATCAGTCAATGACCTCT 1111
Query 1072 GTTTCTAATTCTAGCCCCTCAAAGATTGATCTGAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGC 1131
| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 G----T--TTCTAGCCCCTCAAAGATTGATCTTAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGC 1165
Query 1132 TCCAGTCCAATCATGTATGAAACTCGTGTGCAGAATCAGGCTAATCCTCCACCACCTACT 1191
||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 TCCAGTCCAATTGTGTATGAAACTCGTGTGGAAAATAAGGCTAATCCTCCACCACCTACT 1225
Query 1192 ACTGTTGATTATATTACTAGGGACACTGGAAATTCCAGCCCGCGTTACATGCGATGCACA 1251
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226 ACTGTTGATTATATAACTAGAGACACTGGAAATTCCAGCCCGCGTTACATGCGATGCACA 1285
Query 1252 ATCAATCAGATCCCTTGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCGTTA 1311
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1286 ATCAATCAGATCCCATGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCACTA 1345
Query 1312 ATAGTCCAACCAATGGCACTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGACTTT 1371
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346 ATAGTCCAACCAATGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGACTTT 1405
Query 1372 GGTGAGAGTGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACATGAATCCTTTTATGAAG 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1406 GGTGAGAGTGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACGTGAATCCTTTCATGAAG 1465
Query 1432 TTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACTCCT 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 TTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACTCCT 1525
Query 1492 CGTGACTACCAATGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGGCCT 1551
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 CGTGACTACCAGTGTAATCTCGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGGCCT 1585
Query 1552 GAGCTGTGTAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGATCCA 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 GAGCTGTGTAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGATCCA 1645
Query 1612 ATGCCAGCAGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATTCAAACAGGTGCA 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1646 ATGCCAGCAGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAACGCGATTCAAACAGGTGCA 1705
Query 1672 ACTGCAGCTACTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGG 1731
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706 ACTGCAGCTGCTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGG 1765
Query 1732 ACATTTGTTGGAATTGCCACATTTGATTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGTGCA 1791
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 ACATTTGTTGGAATTGCCACGTTTGACTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGTGCA 1825
Query 1792 CTGCAGCAGCCGTTGATGCTCATTGTTCCTGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTAGAA 1851
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826 CTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTTCCGGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTAGAA 1885
Query 1852 ACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAAAGT 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 ACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAAAGT 1945
Query 1912 ATCCCAACAATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 ATCCCAACAATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAG 2005
Query 1972 GCCGCATTCTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTTCAATCAGTTTTG 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2006 GCCGCATTCTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTCCAATCAGTTTTG 2065
Query 2032 CCTTCTGTTGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGATGGGAGAGCTAATGCCTCT 2091
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066 CCTTCTGTTGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAAGCCGATGGGAGAGCTAATGCCTCT 2125
Query 2092 GCGAGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTACTTCAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACCATG 2151
||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126 GCGGGTGAAAAAGAGGCCCATAAATTACTACAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACCATG 2185
Query 2152 GCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCCTAT 2211
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2186 GCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCGTAT 2245
Query 2212 GTTGACATGGCTTCAATTTCCGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGCTAT 2271
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2246 GTTGACATGGCTTCAATTTCTGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGTTAT 2305
Query 2272 TACCCTTTCTCAGCTCTTTCAGACCCCCCAAAGCTATACAACGATCTTAGATGGAATATC 2331
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306 TACCCTTTCTCAGCTCTTTCAGACCCCCCAAAGTTATACAACGATCTTAGATGGAATATC 2365
Query 2332 ACGAGGCCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTCAAGTG 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 ACGAGGCCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTCAAGTG 2425
Query 2392 CATGAATACTCAGGGAATTTCTGTAAACGCATACCAACTGACATCGATCTACCAGCGATT 2451
|| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2426 CAAGAATACTCAGGGAACTTCTGTAAGCGCATACCAACTGACATCGATCTACCTGCGATT 2485
Query 2452 GACTGTGACAAAGCTGTAATGGTGACATTAAAGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCT 2511
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2486 GACTGTGACAAAGCTATAATGGTGACATTAAAGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCT 2545
Query 2512 GAATGTGGTTTCCAGTGTGCCCTTCTGTATACCACCATATCTGGAGAAAGAAGAATTAGG 2571
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2546 GAATGCGGTTTTCAGTGTGCCCTTCTGTATACCACCATATCTGGAGAAAGGAGAATTAGG 2605
Query 2572 GTTCTTAACTTATCGCTCCCTTGTACAAACATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGAC 2631
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606 GTTCTTAACTTATCAATCCCTTGTACAAACATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGAC 2665
Query 2632 CTGGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCCAAGGCA 2691
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2666 CTAGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCGAAGGCA 2725
Query 2692 CTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAATTGCATCACCATACTACATTCCTATCGT 2751
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726 CTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATGATTGCATCACCATACTACATTCCTATCGT 2785
Query 2752 AAATTCTGCGCTACAGTTACATCAACCGGACAACTTATTCTTCCTGAAGCACTCAAGCTT 2811
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2786 AAATTCTGCGCTACAGTTACATCAACTGGACAACTTATTCTACCTGAAGCACTCAAGCTT 2845
Query 2812 TTGCCTTTATATACTCTCGCCTTAACCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATT 2871
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2846 TTGCCATTATATACTCTCGCCTTAACCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATT 2905
Query 2872 GATGACCGATCATTTTGGATAAACCATGTGTCTTCATTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCG 2931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2906 GATGACCGATCATTTTGGATAAACCATGTGTCTTCATTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCG 2965
Query 2932 CTAGTTTATCCAAGGATGATTGCTGTCCATGACCTTGATGTAAACGATAATGAAGAAAAT 2991
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 2966 CTAGTTTATCCAAGGATGATTGCTGTCCATGACCTTGATGCAAATGATAATGAAGAAAAT 3025
Query 2992 GTGGTTCCTTGTCCAATCCCATTACAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTATATTTT 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3026 GTGGTTCCTTGTCCAATCCCATTACAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTCTATTTT 3085
Query 3052 CTTGAGAACGGTGAAGATGGTTTGATATATATTGGGGAATCAGTAAATTCAGATATCCTA 3111
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 CTTGAGAACGGTGAAGATGGTTTGATATATATTGGAGAATCAGTAAATTCAGATATCCTA 3145
Query 3112 CAGAAGCTCTTTAATGTTCACTCAGCTGCTGAACTTCAAAATCAGTATGTGCTGCAAAAG 3171
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3146 CAGAAGCTCTTTAATGTTCGCTCAGCTGCTGAACTTCCAAGTCAGTATGTGCTGCAAAAG 3205
Query 3172 TATGATAATCAGCTATCAAAGAAGTTCAATGACGTGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGA 3231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3206 TATGATAATCAGCTATCAAAGAAGTTCAATGACGTGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGA 3265
Query 3232 AGTTCTTACCTACGCCTTAAATTGTGCAAGAAAGGAGATCCAGCAGGAAATATGTTGTTC 3291
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3266 AGTTCTTACCTACGCATTAAATTGTGCAAGAAAGGAGATCCAGCTGGAAATATGTTGTTC 3325
Query 3292 CAATCGTATATGGTGGAGGACAGGGGATCGAGTGGGCCTTCGTACGTGGAGTTTCTCGTT 3351
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3326 CAATCGTATATGGTAGAGGACAGGGGATCGGGTGGGGCTTCGTACGTGGATTTTCTCGTT 3385
Query 3352 TCAGTTCACCGTCAAATCCAACACAAACTGAACTGACAGGTCTCTCTAGTCTCCTCTGTT 3411
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3386 TCAGTTCACCGTCAAATCCAACACAAACTGAACTGATAGGTCTCTCTAGTCTCCTCTGGA 3445
Query 3412 TCCA-GAAAAAGAAAAAGGAAAGACAATCTTCTTCCTTTGTACATACTTTCGGCTGGAAA 3470
| | | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3446 GCAAAGCAGAAGAAAA-GGAAAGACAATCTTCTTCCTTTGTACATACTTTCGGTTGGAAA 3504
Query 3471 CTTTATAATTATTCTTCAAGTTCTTATGTCCTTGA--GAA-GTTCTATATTCAATGGAag 3527
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3505 CTTTATAATTATTCTTCAAGTTCTTATGTGCTTGATAGAAAGTTCTATATTCAATGGAAG 3564
Query 3528 atagagagagagaacagagacagacagggagagagagacacagagagCTAGATATTCTTC 3587
|||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3565 ATAGAGAGAG----CAGAGACAGACAG--ATTGAGAGA----GAGAGCTAGATATTCTTC 3614
Query 3588 TGCtttttttGTGGATTTTTATTTATACAACAGTCTTTTTGTAGTG-CGTA--CTTCAGA 3644
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 3615 TGCCTTTTTTGTGGATTTTTATTTATACAACAGTTTTTTTGTAGTGGCGTATACTTCAGA 3674
Query 3645 AAAAAGGTTTTCCAATATTTTACGA 3669
||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3675 AAAAAGGTTTTACAATATTTAACGA 3699
Score = 145 bits (78), Expect = 4e-33
Identities = 88/93 (95%), Gaps = 0/93 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 675 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGTGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCAT 734
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCAT 732
Query 735 GCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCC 767
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 733 GCATGGCGGTCATTTGAGCAATGGGCCTCCTCC 765
Score = 134 bits (72), Expect = 8e-30
Identities = 86/93 (92%), Gaps = 0/93 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 633 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGTGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCAT 692
|||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCATGGCGGTCATTTGAGCAATGGGCCTCCTCCCTCTGGCAT 774
Query 693 GCCTGGTGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCC 725
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 775 GCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGACCTCCTCC 807
Score = 95.3 bits (51), Expect = 4e-18
Identities = 51/51 (100%), Gaps = 0/51 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 717 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCC 767
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GCCTCCTCCCTCTGGCATGCCTGGCGGTCCGTTGAGTAATGGGCCTCCTCC 723
> AT4G32640.1 | Symbols: | Sec23/Sec24 protein transport family
protein | chr4:15742032-15750862 FORWARD LENGTH=3942
Length=3942
Score = 1746 bits (945), Expect = 0.0
Identities = 1232/1371 (90%), Gaps = 18/1371 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1087 CCCTCAAAG-ATTGAT-CTGAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGTCCAATCA 1144
||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1243 CCCTC-AAGAATTGATCCT-AATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAA-C- 1298
Query 1145 TGTA--TGAAACTCGTGTGCAG-AATCAGGCTAATCCTCCACCACCTACTACT-GTTGAT 1200
|||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||
Sbjct 1299 TGTATTTGAAACTCGCCAG-AGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAG-TGAT 1356
Query 1201 TATATTACTAGGGACACTGGAAATTCCAG-CCCGCGTTACATGCGATGCACAATCAATCA 1259
||| || | | ||||| ||||||| || ||| ||||||||| | || || ||||||||
Sbjct 1357 TATGTTGTTCGAGACACCGGAAATTGTAGTCCC-CGTTACATGAGGTGTACCATCAATCA 1415
Query 1260 GATCCCTTGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCGTTAATAGTCCA 1319
|||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||
Sbjct 1416 GATCCCATGTACAGTTGATCTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCA 1475
Query 1320 ACCAATGGCACTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGACTTTGGTGAGAG 1379
||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1476 ACCGCTGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGG 1535
Query 1380 TGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACATGAATCCTTTTATGAAGTTCATTGA 1439
||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1536 TGGGCCTGTTCGATGTTCACGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGA 1595
Query 1440 CCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACTCCTCGTGACTA 1499
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1596 CCAAGGAAGGAAGTTCATCTGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTA 1655
Query 1500 CCAATGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGGCCTGAGCTGTG 1559
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 1656 TCACTGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTG 1715
Query 1560 TAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGATCCAATGCCAGC 1619
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1716 TAGGGGAACCGTTGAGTTTGTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGC 1775
Query 1620 AGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATTCAAACAGGTGCAACTGCAGC 1679
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1776 AGTATATTTTTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGC 1835
Query 1680 TACTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1739
| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TGCTTGCAATGCAATCCAGCAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1895
Query 1740 TGGAATTGCCACATTTGATTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGTGCACTGCAGCA 1799
||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1896 TGGGATTGCTACATTTGACTCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCA 1955
Query 1800 GCCGTTGATGCTCATTGTTCCTGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTAGAAACAGATGT 1859
||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956 GCCATTGATGCTCATTGTCCCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGT 2015
Query 1860 CATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAAAGTATCCCAAC 1919
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 2016 TGTAGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAAC 2075
Query 1920 AATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCCGCATT 1979
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2076 GATGTTTCAGGAAAGTAAAATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTT 2135
Query 1980 CTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTTCAATCAGTTTTGCCTTCTGT 2039
||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2136 CTTGGCGATGAAGAGCAAAGGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGT 2195
Query 2040 TGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGATGGGAGAGCTAATGCCTCTGC-GAGTG 2098
||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 2196 TGGTGTTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTG-GTG 2254
Query 2099 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTTCAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACCATGGCTATTG 2158
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2255 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTG 2314
Query 2159 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCCTATGTTGACA 2218
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2315 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACA 2374
Query 2219 TGGCTTCAATTTCCGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGCTATTACCCTT 2278
||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 2375 TGGCTTCAATTTCCGTTATTCCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTT 2434
Query 2279 TCTCAGCTCTTTCAGACCC-CCCAAAGCTATACAACGATCTTAGATGGAATATCACGAGG 2337
|||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||
Sbjct 2435 TCTCAGCTCTCTCAGATCCTCCCAA-GCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGG 2493
Query 2338 CCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTCAAGTGCATGAA 2397
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2494 CCACAGGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAA 2553
Query 2398 TACTCAGGGAATTTCTGTAAACGCATACCAACTGACATCGATCTACCAGCG 2448
||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2554 TACTCTGGGAATTTCTGCAAACGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCG 2604
Score = 791 bits (428), Expect = 0.0
Identities = 758/916 (83%), Gaps = 27/916 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2484 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGTGGTTTCCAGTGTGCCCTTCTGTATAC 2543
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2604 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAATGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATAC 2663
Query 2544 CACCATATCTGGAGAAAGAAGAATTAGGGTTCTTAAC-TTATCGCTC-CCTTGTACAAAC 2601
|| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||
Sbjct 2664 TACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT-ACCACATTATCACTCTCC-TGTACAAAC 2721
Query 2602 ATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGACCTGGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAAA 2661
||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2722 ATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTAGATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAA 2781
Query 2662 CAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCCAAGGCACTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAAT 2721
|||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2782 CAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTTCCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAAT 2841
Query 2722 AATTGCATCACCAT--ACTAC-ATTCCTATCGTAAATTCTGCGCTACAGTTACATCAACC 2778
| |||||| | || ||| | || |||| |||||||| || |||||||| |||||| |
Sbjct 2842 AGTTGCATAA--ATGCACT-CTATGCCTACCGTAAATTTTGTGCTACAGTGACATCATCT 2898
Query 2779 GGACAACTTATTCTTCCTGAAGCACTCAAGCT-TTTGCCTTTATATACTCTCGCCTTAAC 2837
||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||||| |||||||| || ||
Sbjct 2899 GGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT-CCATTATACACTCTCGCATTGAC 2957
Query 2838 CAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATTGATGACCGATCATTTTGGATAAACCA 2897
|||| ||||||| ||| | | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |
Sbjct 2958 CAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGATGATCGATCATTCTGGATCAACTA 3017
Query 2898 TGTGTCTTCA-TTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCGCTAGTTTATCCAAGGATGATTGCTG 2956
||||||||| || || ||||||||||| || || | |||||||| || |||||| |||
Sbjct 3018 TGTGTCTTCCCTT-TCTACTCCTTTGGCAATCCCATTGGTTTATCCGAGAATGATTTCTG 3076
Query 2957 TCCATGACCTTGATGTAAACGATAATGAAGAAAATGTGGTTCCTTGTCCAATCCCATTA- 3015
| || ||||||||||| || || | ||| | | || ||||| ||||||||||||
Sbjct 3077 TTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTCCTTCCTCCTCCAATCCCATTGT 3136
Query 3016 CAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTATATTTTCTTGAGAACGGTGAAGATGGTTTG 3075
|| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
Sbjct 3137 CAG-GTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTTGAGAATGGTGAAGACGGTCT- 3194
Query 3076 A-TATATATTGGGGAATCAGTAAATTCAGATATCCTACAGAAGCTCTTTAATGTTCACT- 3133
| ||| | |||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| |||| ||
Sbjct 3195 ACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAGAAACTTTTTGCTGTTT-CTT 3253
Query 3134 CAGCTGCTGAACTTCAAAATCAGTATGTGCTGCAAAAGTATGATAATCAGCTATCAAAGA 3193
||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3254 CAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTATGATAATCAGTTATCAAAGA 3313
Query 3194 AGTTCAATGACGTGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGAAGTTCTTACCTACGCCTTAAAT 3253
| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||
Sbjct 3314 AATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGTTCTTACCTAAGAATAAAAT 3373
Query 3254 TGTGCAAGAAAGGAGATCCAGCAGGAAATATGTTGTTCCAATCGTATATGGTGGAGGACA 3313
|||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct 3374 TGTGCAAGAAGGGAGAACCATCAGGAA-T--GTTGTTTCTCTCGTATATGGTAGAGGACA 3430
Query 3314 GGGGATCGAGTGGGCCTTCGTACGTGGAGTTTCTCGTTTCA-GTTCACCGTCAAATCCAA 3372
|| | | || || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||
Sbjct 3431 GGACAGCAAGCGGCCCGTCGTATGTGGAGTTTCTCGTG-CAAGTCCATCGCCAAATCCAG 3489
Query 3373 C-ACAAACTGAACTGA 3387
| | ||| ||||||||
Sbjct 3490 CTAAAAA-TGAACTGA 3504
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182708006406
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5