BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg484963
Length=4165
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G45830.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 6564 0.0
> AT3G45830.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24
plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G02290.1);
Has 499 Blast hits to 438 proteins in 100 species:
Archae - 0; Bacteria - 7; Metazoa - 236; Fungi - 15;
Plants - 108; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 131 (source: NCBI
BLink). | chr3:16841277-16845541 FORWARD LENGTH=4174
Length=4174
Score = 6564 bits (3554), Expect = 0.0
Identities = 3973/4173 (95%), Gaps = 38/4173 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGATCGAGAAGAGTAACGTCAAGGTTACGAGGTTTGATCTAGAGTACTCACATGGT 60
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGCGATCGAGAAGAGTAACGTCAAGGTTTCGAGGTTTGATCTAGAGTACTCTCATGGT 60
Query 61 AGTGGTGAATCTATGTCAAGTTATGAAGAAAGACGTAAAAACTCAGTGGCT-AATAATGT 119
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 61 AGTGGTGATTCTATGTCAAGTTACGAAGAAAGACGTAAAAACTCAGTGG-TGAATAATGT 119
Query 120 tgattctgaggatgaagatgatgattttgatgaagatgattctggagcaggttctgatga 179
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TGATTCGGAGGATGAAGATGATGATTTTGATGAAGATGATTCTGGAGCAGGTTCTGATGA 179
Query 180 ttttgatttgcttgaATTAGCGGAAACTGGTGCTGAGTTTTGTCAAGTTGGGAATGTTAC 239
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTTGATTTGCTTGAATTGGCGGAAACTGGTGCTGAGTTTTGTCAAGTTGGGAATGTTAC 239
Query 240 TTGTAGTATTCCTTTTGAGTTGTATGATCTCTCTAGT-TTGGAAGATATACTCTCTGTTG 298
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 240 TTGTAGTATTCCTTTTGAGTTGTATGATCTCCCTAGTCTT-GAAGATATACTCTCTGTTG 298
Query 299 ATGTTTGGAATGAGTGTCTCACTGAGGAAGAGAGGTTTAGTCTCTCGAGTTATCTACCTG 358
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 ATGTTTGGAATGAGTGTCTCACTGAGAAAGAGAGGTTTAGTCTCTCGAGTTATCTACCTG 358
Query 359 ATGTCGATCAGCTTACTTTTATGCGTACTTTGAAAGAGCTTTTCGAGGGTCGGAATTTCC 418
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 359 ATGTTGATCAGCTTACGTTTATGCGTACTTTGAAAGAGCTTTTCGAGGGTTGCAATTTCC 418
Query 419 ACTTTGGTAGTCCTGTTAAGAAACTGTTTGATATGTTAAAGGGTGGGCAGTGTGAACCGA 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 419 ACTTTGGTAGTCCTGTTAAGAAACTGTTTGATATGTTGAAGGGTGGGCAGTGTGAACCCA 478
Query 479 GGAATACGCTTTATCTCGAAGGACGTAGTTTGTTTCTAAGAATTAAACATTATCATAGTT 538
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 479 GGAATACGCTTTATCTTGAAGGACGTAGTTTGTTTCTACGAACCAAACATTATCATAGTT 538
Query 539 TGAGGAAGTATCATAATGATATGGTGGTGAATCTTTGTCAGACGAGGGATGCTTGGGCAA 598
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 539 TGAGGAAGTATCATAATGACATGGTGGTGAATCTTTGTCAGACGAGGGATGCTTGGACAA 598
Query 599 GTTGTAAAGGGTATAGTATTGACGAGAAGCTTCGTGTACTGAATATTGTGAAAAGCCAAA 658
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GTTGTAAAGGGTATAGTATCGATGAGAAGCTCCGTGTCCTGAATATTGTGAAAAGCCAAA 658
Query 659 AGACTTTGATGCGTGAGAAAAAGGATGATTTTGAGGAGGATTCATCAGAGACGGAAGAAC 718
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 659 AGACTCTGATGCGTGAGAAAAAGGATGATTTTGAGGATGATTCATCAGAGAAGGACGAAC 718
Query 719 CTTTTGATAAGCCTTGGAGTAGAAAGGAAAAAGATAGGAAGTCTACACAACACAAATTGG 778
||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||
Sbjct 719 CTTTTGATAAGCCTTGGGGAAGAAAGGGAAAGGATAGGAAGTCTACGCAAAAGAAATTGG 778
Query 779 CCCGTCATTCTGGTTATGGTGTTGATTCAGGTTTGGAATTTCCTAGCCGGCGGCAGCTGG 838
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 779 CCCGTCATGCTGGTTATGGTGTTGATTCAGGTTTGGAATTTCCTA---GGCGGCAGCTGG 835
Query 839 CGGCTGTTGAACAGGATAGATATGG-AACACCAAAGTCGAAACCGAAGTTTCCTTTTACC 897
||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 836 CGGCTGTAGAACAGGATTTATATGGTAA-ACCGAAGTCAAAACCGAAGTTTCCTTTTGCT 894
Query 898 AAAACGTCTGTTGGGCCGTATGCTTCAGGTTATAATGGGTATGGTATGAATTCTGGATAC 957
||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 895 AAAACGTCTGTTGGGCCATATGCTACAGGTTATAATGGGTATGGTATGAATTCTGCATAC 954
Query 958 AACCCCTCTTCTCTTGTTAGGCAGAGGTATGGTTCAGAAGATAATATTGACGATGATGAT 1017
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 AACCCCTCTTCTCTCGTTAGGCAGAGGTATGGTTCAGAAGATAATATTGACGATGATGAT 1014
Query 1018 CAGGATCCACTCTTTGGAATGGGTTCTCGACGAGACCGGGATAAATCTGGATACTCAAGG 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||
Sbjct 1015 CAGGATCCACTCTTTGGAATGGGTTCTCGACGAGACCGTGAGAAACCTGGATATTCAAGG 1074
Query 1078 CCTGGAAAGAAACACAAATCTTCAAGAGATGGAGAACCAATTTCTGAACATTTTATGGGT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CCTGGAAAGAAACACAAATCTTCAAGAGATGGAGAACCAATTTCTGAACATTTTATGGGT 1134
Query 1138 CCACCATATTCATCAAGGCAGTCCCACAGCAATTACGCAAAATCGAGTAGATATGCAAAT 1197
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1135 CCACCATATTCATCAAGGCAGTACCACAGCAATTACTCAAAATCGAGTAGATATGCTAAT 1194
Query 1198 AATATTCATCCTCATGCATTTGCCGACCAGATGAAGCCTGTAAAAGGTAGTCTAGCAGAC 1257
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 AATATTCAGCCTCACGCATTTGCCGACCAGATGAAGCCTGTAAAAGGTAGTCTAGCAGAC 1254
Query 1258 CTTCGTGGTGACTTATATCGGCATGGGAAGAATCATGGAGATGCCTTTTCTGTTGATCCC 1317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1255 CTTCGTGGTGACTTATATCGGCATGGGAAGAATCATGGAGATGGCTTTTCTGTTGATCCC 1314
Query 1318 AGATATATATCTGATGACTTGTCTGGTAAAAGCAAAAAGTTGAAGTCTGAGAGGGACTCA 1377
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AGATATATATCTGATGACTTGAATAGTAAAAGCAAAAAGTTGAAGTCTGAGAGGGACTCA 1374
Query 1378 CCTGATACTAGTTTGAGATCTTATAGAGCTTCTATGCAACAAATGAACGAGAGGTTCTTA 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 CCTGATACTAGTTTGAGATCTTATAGAGCTTCTATGCAACAAATGAACGAGAGGTTCTTA 1434
Query 1438 AATTCTGATTTTGGCGAGAACCATGTGCAGGAAAAGATTAGGGTGAATGTGGTACCAAAT 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1435 AATTCTGATTTTGGCGAGAACCATGTGCAGGAAAAGATTAGGGTGAATGTGGTACCCAAT 1494
Query 1498 GCGAGGTCTGGTGTTGCGGCATTCAGAGATAGCAGGATGTTCATGGGAAATGATGATACA 1557
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GCAAGGTCTGGTGTTGCGGCTTTCAGAGATAGCAGGATGTTCATGGGAAATGATGATACA 1554
Query 1558 GAGTCGGATTCATCCCATGGCTATGATGATGAGGAAGAGAGAAACCGCGTAATACGGAAC 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||
Sbjct 1555 GAGTCGGATTCATCCCATGGCTATGATGATGAGGAGGAGAGAAATCGCTTAATGCGGAAC 1614
Query 1618 AAATCTTCTGTCTCAGTTGGTGGGATGAATAATTCTCATTTTCCAATACTCAAATCCAGG 1677
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 AAATCTTCTGTCTCAGTTGGTGGGATGAATAATTCTCATTTTCCAATACTCAAATCCAGA 1674
Query 1678 CAAGATAGTAAAAAGAGCAAATCCAGAAAGAAAGATATGCAGGAGACTGAATTGCTTGAT 1737
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1675 CAAGATATTAAAAAGAGCAAATCCAGAAAGAAAGATATGCAGGAGAATGAATTGCTTGAT 1734
Query 1738 GGACGGAGTACTTACTTGAAATATTTAGGCGTACCTGGGGAACACATCTATGCGCCAGGG 1797
||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GGACGGAGTGCGTACTTGAAATATTTAGGCGTATCTGGAGAACACATCTATGCGCCAGGG 1794
Query 1798 ACAGAGAAGCACTCCTTTAAGGCAAAACAGAAGGGTAAGATGCGTGACAGGAGTCCCTTA 1857
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 ACAGAGAAGCACTCCTTCAAGTCAAAACAGAAGGGTAAGATGCGTGACAGGAGTCCCTTA 1854
Query 1858 AATAACTTTTCCTCTCGAGATTTTGAAGATGGCCCGATCACAAGCTTGAGTGAGTTGCAG 1917
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1855 GAGAACTTTTCCTCTCGAGATTTTGAAGATGGCCCGATCACAAGCTTGAGTGAGTTTCAG 1914
Query 1918 GACAGAAACAACAGGAATGAGTTTTTCAGGTCAAACAAGAATAGCCAGACAAGAGAGCAA 1977
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 GACAGAAACAACAGGAAGGAGTTTTTCAGGTCAAACAGGAATAGCCAGACAAGAGAGCAA 1974
Query 1978 ATGATTGATAGACCACTGTTTCAGAGACCATCTGCAAAACCATATTTGTCTGGGAGAAAA 2037
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1975 ATGATTGATAGAACACTATTTCAGAGACCATCTGCAAAACCAAATTTGTCTGGGAGAAAA 2034
Query 2038 AGGGGCTTTGATGAAGATGACGAATCACATGAGATGAGAACATTGGTTAATGATAGTGCC 2097
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2035 AGAGTCTTTGATGAAGATGACGAATCACATGAGATGAGAACATTGGTTAATG------CC 2088
Query 2098 CGTGGCCGACTTAGTAGGAAATATCAGGTTTCTGAGGATGATGGTAATAGTGGTGATGAA 2157
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 CGTGATAGACTTAGTAGGAAATATCAGGTTTCTGAGGATGATGGTAATAGTGGTGATGAA 2148
Query 2158 AATTTAGAGGCCAGGTTGTTGGTTACATGCAGTACTGTGTCGAAAAAGAGGAAGACTAGA 2217
|||||||||||||||||||| ||| | |||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 AATTTAGAGGCCAGGTTGTTTGTTTCTTGCAATGCTCTGTCGAAAAAGAGGAAGACTAGA 2208
Query 2218 GTCTCTTTGATGGACATGGAGAGGAGGGAGGATAATGGTGATCTGCAGCTTTATTCCGAC 2277
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 2209 GAGTCTTTGATGGACATGGAGAGGAGGGAGGATAATGGTGATCTGCAGCTATATCCCGAC 2268
Query 2278 ATTCAAC-AGCCGGTTGATGATGTAATTGTGTCAAAGAGAAAGGGAAAGAAGAAAATGGA 2336
||||||| | ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 ATTCAACTA-CCGGTTGGTGATGTAACTGTCTCGAAGAGAAAGGGAAAGAAGAAAATGGA 2327
Query 2337 GGTTGATGTTGGTTTTATTGATCTGGAAACCTCTGACATACCGAAAGCAAGTGAAGTAGA 2396
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2328 GGTTGATGTTGGTTTTCTTGATCTGGAAACCTCTGACATACCGAAAGCAAGTGAAGCAGA 2387
Query 2397 GGTGGAAACCAAGCCGCAGAAGAAGCCATTTGTGTTGATCACACCAACAGTTCACACTGG 2456
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 GGTGGAAACCAAACCGCAGAAGAAGCCATTTGTGTTGATCACACCAACAGTTCACACTGG 2447
Query 2457 CTTCTCTTTCTCTATTGTACATCTTCTATCAGCCGTACGTATGGCAATGACAAGTTTGCG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 CTTCTCTTTCTCTATTGTACATCTTCTATCAGCAGTGCGTATGGCAATGACAAGTTTGCG 2507
Query 2517 TCCTGAAGATTCATTAGATGTTAGCAAATCTGTGGCAGTGGAGAACGCAGAACATGAAAC 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2508 TCCTGAAGATTCATTAGATGTTAGCAAATCTGTGGCAGTAGAGAATGCAGAACATGAAAC 2567
Query 2577 TGGAGAAAATGGTGCCTCCGTGCCCAAGGAGGCAGAGGATAACAAGTCGCCACAGCAGGG 2636
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 TGGAGAAAATGGTGCCTCCGTGCCCGAGGAGGCAGAGGATAACAAGTCGCCACAGCAGGG 2627
Query 2637 AATTGGGAACTTGCCATCCCTCACTATCCAGGAGATTGTTAGCTGTGTGAAGTCAAACCC 2696
|| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2628 AAATGGGAACTTGCCATCCCTTACTATCCAGGAAATTGTTAGCTGCGTGAAGTCAAACCC 2687
Query 2697 GGGAGATCCTTGTATCCTTGAGACACAAGAGCCACTTCAGGATTTGATTAGAGGGGTTCT 2756
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 GGGAGATCCCTGTATCCTTGAGACACAAGAGCCGCTCCAGGATTTGATTAGAGGGGTTCT 2747
Query 2757 GAAAATCTTCTCTTCGAAAACCTCGCCTTTAGGGGCAAAGGGTTGGAAGCCACTTGTAAC 2816
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 GAAAATCTTCTCTTCAAAAACCTCGCCTTTAGGGGCAAAGGGTTGGAAGCCACTTGTAAC 2807
Query 2817 ATTTGAGAAGTCCACGAAATGCTGGTCTTGGATTGGCCCTGTTCTCAGTCCTTCTGATCA 2876
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2808 ATTTGAGAGGTCCACGAAATGCTGGTCTTGGATTGGCCCTGTTCTCGGTCCTTCTGATCA 2867
Query 2877 AGAGACTGTTGAAGAGGTAACATCGCCTGAAGCCTGGGGTCTCCCGCACAAGATGCTTGT 2936
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868 GGAGACTGTCGAAGAGGTAACATCGCCTGAAGCCTGGAGTCTCCCGCACAAGATGCTTGT 2927
Query 2937 CAAGTTGGTTGATTCGTTTGCAAATTGGCTGAAAAATGGCCAGGAAACTCTTCAGCAAAT 2996
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 CAAGTTGGTTGATTCATTTGCAAATTGGCTGAAAACTGGCCAGGAAACTCTTCAGCAAAT 2987
Query 2997 AGGAAGTCTTCCTGAACCACCGTTGTCACTCATGCAGTGTAACCTTGATGAGAAAGAAAG 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2988 AGGAAGTCTTCCTGAACCACCGTTGTCACTCATGCAGTGTAACCTTGATGAGAAAGAAAG 3047
Query 3057 GTTCAAAGATCTGAGAGCACAAAAGAGCCTTAGTACGATTACCAAGAGTTCTGAAGAAGC 3116
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3048 GTTTAAAGATCTGAGAGCACAAAAGAGCCTTAGTACGATTACCCAGAGTTCTGAAGAAGC 3107
Query 3117 AAGAGCCTATTTCCGCAAAGAGGAATTTCTGAGGTACTCAATTCCGGACAGAGCCTTTGT 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 AAGAGCCTATTTCCGCAAAGAGGAATTTCTGAGGTACTCAATTCCGGACAGAGCCTTTGT 3167
Query 3177 GTACACAGCTGCTGATGGTAAGAAGTCAATTGTTGCTCCTCTGAGAAGAGGGGGAGGGAA 3236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3168 TTACACAGCTGCTGATGGTAAGAAGTCAATTGTTGCTCCTCTGAGAAGAGGCGGAGGAAA 3227
Query 3237 GCCAACCTCGAAAGCTCGGGATCATTTCATGTTGAAACGCGAGAGACCACCACATGTCAC 3296
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 GCCAACCTCGAAAGCTCGTGACCATTTCATGTTGAAACGCGAGAGACCACCACATGTCAC 3287
Query 3297 AATTCTGTGTCTTGTGAGAGATGCTGCGGCCAGATTACCTGGTAGTATTGGGACAAGAGC 3356
||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3288 AATCCTGTGTCTAGTGAGAGATGCTGCCGCCAGATTGCCTGGTAGTATTGGGACAAGAGC 3347
Query 3357 TGATGTTTGTACCTTAATAAGAGACTCGCAGTATATCGTGGAGGATGTGTCTGATTCACA 3416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3348 TGATGTTTGTACCTTAATAAGAGACTCGCAGTATATCGTGGAGGATGTGTCTGATTCACA 3407
Query 3417 AGTGAATCAAGTCGTGAGTGGGGCCTTGGATCGTTTGCACTATGAACGGGACCCTTGTGT 3476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3408 AGTGAATCAAGTCGTGAGTGGGGCCTTGGATCGTTTGCACTATGAGCGGGACCCTTGTGT 3467
Query 3477 CCAATTCGATTCAGAGAGGAAACTGTGGGTGTATCTACACAGAGACAGAGAAGAAGAAGA 3536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3468 CCAATTCGATTCAGAGAGGAAACTGTGGGTGTATCTACACAGAGACAGAGAACAAGAAGA 3527
Query 3537 TTTCGAGGATGATGGTACTTCATCCACAAAGAAATGGAAGAGACCAAAGAAAGAAGCTGC 3596
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3528 TTTCGAGGATGATGGTACTTCATCCACAAAGAAGTGGAAGAGACCAAAGAAGGAAGCTGC 3587
Query 3597 AGAGCAAACAGAAGAACAAGAAGCTGTCACTGTAGCTTTCATTGGGAATGAAGAACAACC 3656
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3588 GGAGCAAACAGAGGAACAAGAAGCTGTCACTGTAGCTTTCCTTGGGAATGAAGAACAAAC 3647
Query 3657 CGAAACTGAGATGGGTACAGATCCAAAGAC-GGATGAGCCCACTGGTTTGGACGGAGATC 3715
|||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 CGAAACTGAGATGGGTTCAGAACCAAAGACTGG-TGAGCCCACTGGTTTGGACGGAGATC 3706
Query 3716 AAGGTGCAGCAGACCAACTGTGTAACGAGACTGAACAAGCTGCAGAGGAGCAAGATAATG 3775
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3707 AAGGTGCAACAGACCAACTGTGTAATGAGACTGAACAAGCTGCAGAGGAGCAAGATGGTG 3766
Query 3776 AGAACACCGCTCAGGGTAATGAGCCAACGATATGGGAGCCTGATCCTGCTGTTGTTTCTA 3835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3767 AGAACACCGCTCAGGGTAATGAGCCAACGATATGGGAGCCTGATCCTGCTGTTGTTTCCA 3826
Query 3836 ATCCGGTTGACGAGAACACATTTATCTGCCAAGAGAACTCAGTGAATGATGATTTCGATG 3895
|||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3827 ATCCGGTTGAGGATAACACGTTTATCTGCCAAGAGAACTCAGTGAATGATGATTTCGATG 3886
Query 3896 ATGAAACATGATCGGTGATACCAGGTGAAAAGGCCAAGAGGGTATTTGATTAATAGAAAG 3955
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3887 ATGAAACATGATTGGTGATACCAGGTGAAAATGCCAAGAGGGTATTTGATTAACAGAAAG 3946
Query 3956 AGAAGCTTATG-TGGATTTGTTGTATAATTAATTGTTTGGTC-C-CAATAGATGTCAAAA 4012
||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 3947 AGAAGCTTATGGTG-ATTTGTTGTATAATT----GTTTGGTCTCTCAATAGATGTCAAAA 4001
Query 4013 AAGAGTGAGATCACAGTCTCTCTCACAAACAGCGTTGAAAGGGTTATTCCTATTGTTCTC 4072
| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |||||||||
Sbjct 4002 A-GAGTGAGATCACAGTCTCTCTCCCAAACAG-----A--GG-TTATTCCAATTGTTCTC 4052
Query 4073 ATGCCATCCATGtttttttATTCTTAAAGaaaaaaaGAATAGAAGTTAGTTTAGTGATCA 4132
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4053 ATGCCATGCATGTTTTTT-ATTCTTAAAGAAAAAAAGAATAGAAGTTAGTT-AGTGATCA 4110
Query 4133 GTGTTATTTTGATTAAACATCAATATTTGATAT 4165
|| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4111 GTCTTATTTTGATTAAACATCAATATTTGATAT 4143
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 207590810134
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5