BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg485153 Length=4920 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 7563 0.0 AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 6359 0.0 > AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related protein | chr3:17666927-17673530 REVERSE LENGTH=4952 Length=4952 Score = 7563 bits (4095), Expect = 0.0 Identities = 4642/4905 (95%), Gaps = 41/4905 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGGTCAGAAGAAGAAAGCCCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTGTGATCAAGCTCGAATGC 60 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGGTCAGAAGAAAAAAGCTCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTCTGATCAAGCTCGAATGC 60 Query 61 GAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGCGGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAG 120 ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||| Sbjct 61 GAGAAGGCACTGAAGTCATTCGGTCGTGGGAGCTACAACAAAGCGATTCGTCTCATTAAG 120 Query 121 GATTCATGCTCTCGTCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGC 180 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 121 GATTCATGCTCTCGCCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGC 180 Query 181 GTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGGATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCA 240 || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 181 GTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAAGATCTAGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGGAATGCA 240 Query 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCC-GAATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCCTG-ATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299 Query 300 TTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGT 359 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 300 TTATGCCAACTTGCTTTACGAGGCTGCTAATGATGGAAAGAGAGAGTACGACGAAGTTGT 359 Query 360 GCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 GCAAGAGTGTCATCGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419 Query 420 GCATGATGAGACTCAG-TTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478 ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 GCAGGATGAAACTCAGCTT-AAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478 Query 479 ATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAATCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATA 538 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 479 ATGAGCTCAGGTCACTAATACAGAAATCCAACATTAGTTCATTGTCCACTTGGATGAATA 538 Query 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAAAAGTTTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAGAAGTTTCGGTTGATACCTATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598 Query 599 CTATTGAGAGTAACTTGATTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAA 658 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 599 CTATTGAGAGTAACTTGGTTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAGGCTAACAAGA 658 Query 659 CTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 659 GTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718 Query 719 AGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTGGAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATC 778 ||||||||| | | | | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct 719 AGAAGTCAG-A--GT----G-T-GAGAATGTAGGCGCTGTTGACAACAAGGGATCAGATG 769 Query 779 CAACTTTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAA 837 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | Sbjct 770 CAACATTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGTGAGAGGAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAGA 828 Query 838 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 897 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 829 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAAGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 888 Query 898 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCT 957 |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| Sbjct 889 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGCTTAGCGATCTTAAGAGTCATTTTAGTGCT 948 Query 958 TCAAAGGATGGGAATGCAAATGAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1017 |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 949 TCAAAGGATGGGAATGAAAATGAGATTATTAGTGAAGCTCTTTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1008 Query 1018 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1077 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1009 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCAGTGTAGCGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1068 Query 1078 CATATGCATCATATTGTGCAGGAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1137 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1069 TATATGCATCATATTGTGCAGGTGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1128 Query 1138 CTGCCTCAAAGTGTCGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCA 1197 |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1129 CTGCCTCAAAGTTTTGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCG 1188 Query 1198 TTGGATCTCTCTGCTGCGATGAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAG 1257 |||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 1189 TTGGATCTCTCTGCTGCGGTAAAATGGCTTCGCAGTCGGCAGAAAATCCAAAACTCTGAG 1248 Query 1258 TTTGA-TAAATTTCACTCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGC 1316 ||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1249 TTT-AGTGAGTTTCACGCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGC 1307 Query 1317 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGA 1376 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| Sbjct 1308 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGAGACTCTTGCAAGGGTTGTGATGA 1367 Query 1377 GAATGAACAAGAAG-AGGTTAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTA 1435 |||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1368 GAATGACCCAGAAGAAGG-TAAGCTGTCAATCACATTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTA 1426 Query 1436 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGC 1495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1427 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTAC 1486 Query 1496 TTATTAGACACAAATACTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGG 1555 | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1487 TGATCAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAGTTTACGCTGG 1546 Query 1556 ATGAACTTCAGAATCTAGCTTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1615 |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1547 ATGAACTTCAGAATCTTGCCTCGGTGTCACAATTCTTAAATCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1606 Query 1616 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAG 1675 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | Sbjct 1607 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGAAAAATTCTCAAATTCCTGCAGG 1666 Query 1676 ACTTGACTCAGGCCTGTGGATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAA 1735 ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 1667 ACTTGTCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCAACGATGAAT 1726 Query 1736 TTAATTCTGGCGACCTGAGTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1795 |||||| ||| | |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1727 TTAATTTTGGGGCCCTGTGTAGAGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1786 Query 1796 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGG 1855 ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1787 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGATATATATGG 1846 Query 1856 TCTCAGCATTTG-ATAATGTAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAAT 1914 ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| || Sbjct 1847 GCTCAGCA-TTGCATAATGTAGCTGTAGCAAGTTCTGGGGATATTGCTAATGGAAATGAT 1905 Query 1915 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAA 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| Sbjct 1906 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAA 1965 Query 1975 CAAGTTGTGTCATGGATGTGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2034 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1966 CAAGTTGTGTCATGGATGCGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2025 Query 2035 CAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2094 || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2026 CAACATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2085 Query 2095 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAG-AAGCCCGGAA 2153 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 2086 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAAG-CCGGAA 2144 Query 2154 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAG 2213 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2145 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGCTGAGGAAACGAAG 2204 Query 2214 ACAAGAGCTAAATGAGAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2273 | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 AGAAGAGCTAAATGAAAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2264 Query 2274 TGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGA 2333 |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2265 TGCTTTAACAAATGTGTTGAAAGATGCTGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGA 2324 Query 2334 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2384 Query 2394 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAA 2453 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2385 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAGAA 2444 Query 2454 ACAAAAAGAGCAGCTGTCTGCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGT 2513 |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| Sbjct 2445 ACAAAAAGAGCAATTGTCTGCAGAGCTTAGCAGAATTGACGCGCAAATGATGCGAAATGT 2504 Query 2514 CACTGGGATGCAGCAATTAGAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGAT 2573 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2505 CACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCGGTTTCCTCCAACGATTATCAGAT 2564 Query 2574 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAA 2633 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2565 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGTGCACATTTGGAGGCGTTGGCAGAGAA 2624 Query 2634 AGATGCCACTGAGAAGTCGGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGA 2693 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 2625 AGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTTTTGAGCTAGCTCTTGA 2684 Query 2694 TTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAA 2753 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct 2685 TTCTAAGAAGGAGGGTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAACACACGCTGGAAAAGTCGAA 2744 Query 2754 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2813 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2745 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGAATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2804 Query 2814 CGACCATCGCTTCAATGTTGACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTCGGTTGCATCTTTTGT 2873 ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2805 CGACCATCGCTTCAATGGTGACTCAATTGAGCACAGCCTCCTTTCGGTTGCATCTTTTGG 2864 Query 2874 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGA 2933 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2865 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCATTGAAGCGTTAAGTGATGAGGAAGA 2924 Query 2934 GGAATACAGACGCCGTATCGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGA 2993 |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2925 GGAATACAGACGTTGTAACGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGCAAAAACTCTAGA 2984 Query 2994 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAA 3053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2985 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACAAAAAAAGAA 3044 Query 3054 ATACAGCTGTTTACATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3113 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3045 ATACAGCTGTTCAGATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3104 Query 3114 ATTCTTTGATGATG-TAGATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGA 3172 ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 3105 TTTCTTTGATGATGCT-GATTTACAAGAACAAGAAAAACCCATAAATCAGGAGAAATGGA 3163 Query 3173 ATGGACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAA 3232 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 3164 ATAAACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATGGAGTTTTCCCGTCAA 3223 Query 3233 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAG 3292 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 3224 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGCAAAGGTGCTGGATGTAATATCCCAAGAAGTAG 3283 Query 3293 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3352 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3284 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAAGCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3343 Query 3353 GGGGTAGACGCCAAAAAGGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTT 3412 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 3344 GGGGTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCACACTTT 3403 Query 3413 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTA-AGTGAGAGACAATCTGAA 3471 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 3404 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCG-ACAGTGAGAGACAATCTGAA 3462 Query 3472 ATTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3531 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3463 ACTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGACCAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3522 Query 3532 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTG 3591 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3523 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAAAACTTCAAAGCCTTGATGTG 3582 Query 3592 TACCGAGGAGGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3651 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3583 TACCGAGGTCGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3642 Query 3652 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3711 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3643 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3702 Query 3712 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3771 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3703 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3762 Query 3772 CTATGGAATCTGGGGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCAT 3831 || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3763 CTGTGGAATCTGGGGATGTTTCGGGCTGAGTTCTTGCGGAGCTCAACACTAGAGCACCAT 3822 Query 3832 CACGTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCT 3891 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || Sbjct 3823 CACTTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGCGATTTTTACAGCTTTAAGTACT 3882 Query 3892 GCTACGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGT 3951 ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3883 GCTTCGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTTGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGT 3942 Query 3952 AACTTGTATCCAGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTA 4011 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3943 AACTTGTATCCTGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTA 4002 Query 4012 TTGGCCGTAATCTTCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4071 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4003 TTGGCCGTAATCTTCGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4062 Query 4072 ACAGAATCTACTGAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4131 ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4063 ACAGAATCTGCTGAGAGCAACAGTACGGGCTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4122 Query 4132 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4191 |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4123 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATGTTTCTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4182 Query 4192 GAGTCCAGGCATTTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGC 4251 ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4183 GAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGC 4242 Query 4252 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4311 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 4243 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4302 Query 4312 AACCATCAACTAGCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCA 4370 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 4303 AACCATCAACTAGCTTGTGATCGCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAACGCAA-CCATATCCA 4361 Query 4371 CCACATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4430 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4362 CCATATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4421 Query 4431 TGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAG 4490 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 4422 TGAGACTGTAGAAGACATAGCCGCTACTCTTGCAGCTTTGAATACAGAGATAGACATCAG 4481 Query 4491 CATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4550 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4482 CATCATGTACCGTGGTGTGGACCCTAAGAACACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4541 Query 4551 TTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTA 4610 |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4542 TTATGGACAGCATTATCACTGTTTTGCATATAGTCATGAGCACGATCAGTGGATCATGTA 4601 Query 4611 CAATGACCAAA-CAGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTACTTTCTATGTGTGAGA 4669 | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| Sbjct 4602 CGATGACCAAAAC-GTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATGTGTAAGA 4660 Query 4670 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACaaaaagaaactttaaatcagaaaacaaa 4729 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4661 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAAAAGAAACTTTAAATTAGAAAACAAA 4720 Query 4730 agaaaaaaCAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAA-GTACAA 4788 || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| Sbjct 4721 AGTAAAAACAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCGACAG------A--TCTCCCAAAGTACAA 4772 Query 4789 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTCAGAGAGGAAGGAATGTG 4848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 4773 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTC-GAGAGGAAGAAATGTG 4831 Query 4849 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTCAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4893 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4832 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTTAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4876 > AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related protein | chr3:17674417-17681722 REVERSE LENGTH=5422 Length=5422 Score = 6359 bits (3443), Expect = 0.0 Identities = 4435/4910 (90%), Gaps = 84/4910 (2%) Strand=Plus/Plus Query 27 GCCGTTGGATTCGGCTGT-GATCAAGCTCGAATGCGAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGC 85 |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | Sbjct 425 GCCGTTGGATTCATCTGTCG-TCAAGCTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGAC 483 Query 86 GGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCATGCTCTCGTCATCAAGACT 145 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| Sbjct 484 GGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCACCAAGACT 543 Query 146 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 205 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 544 CTGCCCTAATTCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 603 Query 206 ATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 265 |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 604 ATCTCGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGAAATGCAATCGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 663 Query 266 AGTTGTCTCCGAATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 325 || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 664 AGCTGTCTCCTAACTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 723 Query 326 CTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGTGCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTA 385 |||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| | Sbjct 724 CTAACGAAGGGAAGAGAGAGTACGAGGAGGTTGTGCAAGAGTGCCACCGTGCTCTCTCCA 783 Query 386 TCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGT-TTGCATGATGAGACTCAGTTGAAGATA 444 ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| |||||||| Sbjct 784 TCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGAGAGAGTCTT-CAGGATGAGACTCAGCTGAAGATA 842 Query 445 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAA 504 |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGCTCATTTCCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAG 902 Query 505 TCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATAATC-TGGGAAAAGGTGAAGA-AAAGT 562 ||||||||| ||||||||| ||||||||| | | | ||||||| |||||||| ||| | Sbjct 903 TCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGGATGCA-GACCTTGGGAAATGGTGAAGAGAAA-T 960 Query 563 TTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGA 622 || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCCGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGT 1020 Query 623 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAACTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGG 682 |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| Sbjct 1021 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAATCTACCAAGACTAATGAAGAGAGGAGGAAGGAGA 1080 Query 683 TTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGC-TAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTG 741 ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 1081 TTGAAGTGAGGGTAGCTGC-GCATAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAGTCTTCCCCGTCG 1139 Query 742 GAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATCCAACTTTAGGTTCGGGG-AAGAG 800 || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||| | || Sbjct 1140 GAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGATCAGATTCAGCATTAGCCGCGGGGCCA-AG 1198 Query 801 AAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAA 859 |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1199 AAGCGGGGAGAGAAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAAAAATGGCTCCACAGCGGATAGAA 1257 Query 860 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAAGAAATGAAGAAACAATTGCTTA 919 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | Sbjct 1258 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTGAGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAA 1317 Query 920 GAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCTTCAAAGGATGGG-AATGCAAAT 978 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || Sbjct 1318 GAGTTAAGTTTAGTGATCTTAAGAGTCACTTTAGTGGTTCAAAGGATGGGCAA-GCATAT 1376 Query 979 GAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGTT 1038 |||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1377 GAGATTGTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCT 1436 Query 1039 TGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1098 ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 TGCTGCCGGTGTAGTCAAAACTTCATAGAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1496 Query 1099 GAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTCTGCCTCAAAGTGTCGACACT 1158 | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| Sbjct 1497 GCGCACATGGGTAACGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTTTGCCACAAATTGTCGACACT 1556 Query 1159 GAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGA-T 1217 |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | | Sbjct 1557 GAGAGGATTGATATGCTTTTTAAGTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTAC-ACT 1615 Query 1218 GAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAGTTTGATAAATTTCACTCTGG 1277 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1616 GAAATTGCTTCGAAGTCAGCAGAAAATACAAAATTCTGAGTTTGATGAATTTCACTCTGG 1675 Query 1278 AGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGCACGGAATGATACTTCACCAGA 1337 |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 1676 AGATAATATGGATGGTGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCATGGAATGATACTACACC--- 1732 Query 1338 GAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGAGAATGAA-C--AAGAAGAGGT 1394 || | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| Sbjct 1733 ---AG--A----TGGAGATACTTGCAACGGTTGGAATGAGAATGAATCTGAAGAGGAGGT 1783 Query 1395 TAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1454 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1784 TAAGCTATCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1843 Query 1455 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGCTTATTAGACACAAATACTT 1514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || Sbjct 1844 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCAACTGATCAGACACAAATATTT 1903 Query 1515 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTTCAGAATCTAGC 1574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | Sbjct 1904 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTCCAGAATCTACC 1963 Query 1575 TTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCACCCATATGCATCTGCTTTTT 1634 |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1964 CTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAACAAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTT 2023 Query 1635 GGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAGACTTGA-CTCAGGCCTGTG 1693 |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| Sbjct 2024 GGGAGCTTCCCATCTCAGCAAAATCCTCAAATTCCTGCAGGACTT-ATCTCAGGCCTGTG 2082 Query 1694 GATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAATTAATTCTGGCGACCTGA 1753 |||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| |||||| Sbjct 2083 GATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCCACGATGAGATTAATTTTGGTGACCTGG 2142 Query 1754 GTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATG 1813 |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2143 GTCGTGAAGTCACAGAGGAGATTCTTCTTGATAGTGAAGATTCATGTCTTCTTATGGATG 2202 Query 1814 AAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGGTCTCAGCATTTGATAATG 1873 ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| Sbjct 2203 AAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAAAAATATATGGGCTCAGCATTTAATAATG 2262 Query 1874 TAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 1933 || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2263 TAACTATAGCAAGTTCTGGAGATATTGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 2322 Query 1934 GATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGT 1993 ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2323 GATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGC 2382 Query 1994 GCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2053 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2383 GCACAAAGGAAGATAAAACTAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2442 Query 2054 TCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCAC 2113 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2443 TCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTATGAGGGAGCAC 2502 Query 2114 TGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGCCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGT 2173 |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2503 TGCAGACTGTCGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAGGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAAT 2562 Query 2174 TTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAGACAAGAGCTAAATGAGAATG 2233 ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 2563 TTACCCATGAAAGCTATGAAACTGTGCTGAGGAAACGAAGAGAAGAGCTAAATGAGAGTG 2622 Query 2234 ACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2293 ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2623 ACCATGAGTTGTTGTTTATCAGTAGCAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2682 Query 2294 AAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGA 2353 ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2683 AAGATGCCGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACTA 2742 Query 2354 GTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAAA-GATTCC 2412 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 2743 GTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGAT-AAAGGATTCC 2801 Query 2413 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAAACAAAAAGAGCAGCTGTCT 2472 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| Sbjct 2802 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGATTCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCT 2861 Query 2473 GCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2532 ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2862 GCAGAGCTTAGCAGAATCGATGCACAAATGATGCGAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2921 Query 2533 GAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2592 || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2922 GAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2981 Query 2593 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCG 2652 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2982 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCT 3041 Query 2653 GATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 2712 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3042 GATGCTGCAAGAGAAGCCTTACTTGTTGAGCTAGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 3101 Query 2713 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 2772 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3102 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 3161 Query 2773 GACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGTT 2832 |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | Sbjct 3162 GACACTAGGAAAGTGAAGGATATGAAGGCAACTATTGGAAGCGACCATCGCTCCAATGCT 3221 Query 2833 GACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTC-GGTTGCATCTTTTGTTGATCATTCAGAGGCTGA 2891 || ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||| Sbjct 3222 GATTCAGTTGAACACAGCC-CCCTTCCGGTTGCACCTGTCGGCGATCATTCAGAGGCTGA 3280 Query 2892 CGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGAGGAATACAGACGCCGTAT 2951 | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| || Sbjct 3281 CATTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTTTAAAAGAAGAGGAAGAGGAATATAAACGCCAAAT 3340 Query 2952 CGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGAGTATCAAAGAAGAATTGA 3011 ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3341 AGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAACCCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGA 3400 Query 3012 GAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAAATACAGCTGTTTACATCC 3071 | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || | ||| Sbjct 3401 GGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAACAAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCC 3460 Query 3072 GATGAATGT-GACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAAATTCT-TTGATGATGTA 3129 |||||||| | || || |||||||| ||| |||| ||| || | ||||| || || Sbjct 3461 CATGAATGTTG-CAAAGACAGTGTATAATGGGTGCACAGATAA-TGAAGTTGATTATTTA 3518 Query 3130 GATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACAACTTGATGAC 3189 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3519 GTTTTACAAGGACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACGACTTGATGAC 3578 Query 3190 TTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAACAAATCATTGTGTGATA 3249 |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 3579 CTGGAAGGAGCCAGTGTGAATACAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATCATTCTGCGATA 3638 Query 3250 TCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAGTGCCTAACGGTATAGCT 3309 |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| Sbjct 3639 TCTGATACTGCAAAGGTGCAGAATGTAAAATCCCAAAAAGTAGTGCCTAACGGCACAGCT 3698 Query 3310 ATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGAGGGGTAGACGCCAAAAA 3369 || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3699 ATGCAAGCTGGTATTTTCCAATCTGATCAACGAACTGGGAGGAGAACTAGACGCCAAAAA 3758 Query 3370 GGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTTCTGAGAGCGAGGATAGT 3429 | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||| Sbjct 3759 GCTTCAAACAAGTTAGCTGATGGAAAATATCCGGTCACACCTCCTGAGACCGAAAATAGT 3818 Query 3430 AAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTAA-GT-GAGAGACAATCTGAAATTCTACGTAGCAATG 3487 ||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| ||||| Sbjct 3819 AAATCTCAGTTGTCAGGCACC--AACGGCGAGAGACATTCTGAAACTCTACGTAACAATG 3876 Query 3488 GTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGAT 3547 |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 3877 GTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGACGAAGAAAGGT 3936 Query 3548 TTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTGTACCGAGGAGGTAGAA 3607 ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| Sbjct 3937 TTCAAGCTGACATGCAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGACGTGTACCAAGGAGGTAGAA 3996 Query 3608 ATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAG-ACAACAATGATTGGGTTTTATCTGAT 3666 ||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| Sbjct 3997 ATATGGCGTCATGTTTGAGGACACCGCTGGAAGTA-AACAATGATGGGGGTTTATCTGAT 4055 Query 3667 GTCACAAAGGAATCTCAG-AGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 3725 | ||||| ||| ||| || || || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4056 GACACAATGGAGTCT-AGGAGCTCAACAGGAGTTACCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 4114 Query 3726 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATCTGGG 3785 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4115 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATTTGGA 4174 Query 3786 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCATCACGTTGGAGATCC 3845 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4175 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACGGAGTTCAACACGAGAGCACCATCACGTGGGAGATCC 4234 Query 3846 TTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCTGCTACGAGTGAAAC 3905 ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||| | ||||||| Sbjct 4235 TTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATCTTTACCGCTTTGAGCGCTGCTTCAAGTGAAAA 4294 Query 3906 ACGAAAA-GAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGTAACTTGTATCCAG 3964 || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 4295 AC-AAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGTAATTTGTATCCAG 4353 Query 3965 ATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTATTGGCCGTAATCT 4024 |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| Sbjct 4354 ATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTACTGGCTGTGATCT 4413 Query 4025 TCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGACACAGAATC-TACT 4083 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | Sbjct 4414 TTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGATGTGGATTCCT-CA 4472 Query 4084 GAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATTGCCCATTCTCTG 4143 || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || Sbjct 4473 GACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACATGTATTGCCCATTCTTTG 4532 Query 4144 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4203 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4533 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4592 Query 4204 TTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4263 ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4593 TTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4652 Query 4264 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4323 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 4653 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTTAACCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4712 Query 4324 GCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCACCACATTCTCAC 4382 || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| Sbjct 4713 GCCTGTGATCCCGAAACCGGTGGGTGTGGGAAACTCAA-CCATATCCACCATATTCTCAC 4771 Query 4383 CACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4442 |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4772 TACTCCACCACATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4831 Query 4443 AGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAGCATCATGTACCG 4502 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4832 AGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGACATCAGCATCATGTACCG 4891 Query 4503 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4562 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4892 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCTGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4951 Query 4563 TTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTACAATGACCAAAC 4622 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 4952 TTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATCATGTACGATGACAAAAC 5011 Query 4623 AGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGT-GATGTACTTTCTATGTGTGAGAGAGGACATTTGC 4681 |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| Sbjct 5012 CGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGA-TCGATGTTCTTTCAATGTGTGAAAGAGGACACTTGC 5070 Query 4682 AACCACAGGTTCTTCTCTACaaaaagaaactttaaa-tcagaaa-a--caaaagaaaaaa 4737 | |||||||||||||||||| | | || | ||||| | | ||| | ||||| ||| Sbjct 5071 AGCCACAGGTTCTTCTCTACGAGA-GA--CGTTAAAATAAAAAAGAAGCAAAACAAATG- 5126 Query 4738 CAGAGCAAGTAGAGTTAC-GTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAAGTACAAACTGCAAA 4796 |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||| Sbjct 5127 CAGACCAAGTAGAGTT-CTGTTGCTACAATTTAGGAGATCTCGTAAGTACATACTACAAA 5185 Query 4797 GAAAGTAAGTAC-TATTTTTTGATAATC-GAA--AA-CTCAGAGAGGAAGGAATGTGATT 4851 | |||||||||| | |||||||| || | ||| || ||| |||||||| |||||||||| Sbjct 5186 GGAAGTAAGTACGT-TTTTTTGACAAGCAGAAGTAAACTC-GAGAGGAAAGAATGTGATT 5243 Query 4852 TTT-ACTCATCTCAGTAGTTC-AA-----A-GAGGATGGGGAAGAAGATT 4893 || |||||||||||| |||| || | |||||||||||||| |||| Sbjct 5244 TTACACTCATCTCAGTGGTTCTAACTTCTAAGAGGATGGGGAAGACGATT 5293 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 245466852099 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5