BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485153
Length=4920
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 7563 0.0
AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 6359 0.0
> AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related
protein | chr3:17666927-17673530 REVERSE LENGTH=4952
Length=4952
Score = 7563 bits (4095), Expect = 0.0
Identities = 4642/4905 (95%), Gaps = 41/4905 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTCAGAAGAAGAAAGCCCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTGTGATCAAGCTCGAATGC 60
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGTCAGAAGAAAAAAGCTCCCGCGCCGTTGGATTCGGCTCTGATCAAGCTCGAATGC 60
Query 61 GAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGCGGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAG 120
||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||
Sbjct 61 GAGAAGGCACTGAAGTCATTCGGTCGTGGGAGCTACAACAAAGCGATTCGTCTCATTAAG 120
Query 121 GATTCATGCTCTCGTCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGC 180
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 121 GATTCATGCTCTCGCCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGC 180
Query 181 GTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGGATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCA 240
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 181 GTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAAGATCTAGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGGAATGCA 240
Query 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCC-GAATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGTTGTCTCCTG-ATTCGATTGAGTTTGGGCATTT 299
Query 300 TTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGT 359
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 300 TTATGCCAACTTGCTTTACGAGGCTGCTAATGATGGAAAGAGAGAGTACGACGAAGTTGT 359
Query 360 GCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCAAGAGTGTCATCGTGCTCTCTCTATCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGTTT 419
Query 420 GCATGATGAGACTCAG-TTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478
||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 GCAGGATGAAACTCAGCTT-AAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGG 478
Query 479 ATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAATCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATA 538
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 479 ATGAGCTCAGGTCACTAATACAGAAATCCAACATTAGTTCATTGTCCACTTGGATGAATA 538
Query 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAAAAGTTTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 ATCTGGGAAAAGGTGAAGAGAAGTTTCGGTTGATACCTATTAGGAGAATGGCTGAGGATC 598
Query 599 CTATTGAGAGTAACTTGATTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAA 658
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 599 CTATTGAGAGTAACTTGGTTCAGACCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAGGCTAACAAGA 658
Query 659 CTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 GTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGGTTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGCTAGGTTGTTGCAGC 718
Query 719 AGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTGGAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATC 778
||||||||| | | | | || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 719 AGAAGTCAG-A--GT----G-T-GAGAATGTAGGCGCTGTTGACAACAAGGGATCAGATG 769
Query 779 CAACTTTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAA 837
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |
Sbjct 770 CAACATTAGGTTCGGGGAAGAGAAGCGGTGAGAGGAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAGA 828
Query 838 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 897
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 829 AACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAAGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAA 888
Query 898 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCT 957
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 889 GAAATGAAGAAACAATTGCTTAGAGTTAAGCTTAGCGATCTTAAGAGTCATTTTAGTGCT 948
Query 958 TCAAAGGATGGGAATGCAAATGAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1017
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 949 TCAAAGGATGGGAATGAAAATGAGATTATTAGTGAAGCTCTTTCCTTTTGTGAGGCCAAT 1008
Query 1018 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1077
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 AAGACTTGGAGGTTCTGGGTTTGCTGCCAGTGTAGCGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCT 1068
Query 1078 CATATGCATCATATTGTGCAGGAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1137
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 TATATGCATCATATTGTGCAGGTGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTT 1128
Query 1138 CTGCCTCAAAGTGTCGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCA 1197
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CTGCCTCAAAGTTTTGACACTGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCG 1188
Query 1198 TTGGATCTCTCTGCTGCGATGAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAG 1257
|||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1189 TTGGATCTCTCTGCTGCGGTAAAATGGCTTCGCAGTCGGCAGAAAATCCAAAACTCTGAG 1248
Query 1258 TTTGA-TAAATTTCACTCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGC 1316
||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1249 TTT-AGTGAGTTTCACGCTGGAGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGC 1307
Query 1317 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGA 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||
Sbjct 1308 ACGGAATGATACTTCACCAGAGAAAGAAAGCCTTGGAGACTCTTGCAAGGGTTGTGATGA 1367
Query 1377 GAATGAACAAGAAG-AGGTTAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTA 1435
|||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1368 GAATGACCCAGAAGAAGG-TAAGCTGTCAATCACATTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTA 1426
Query 1436 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGC 1495
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1427 TATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTAC 1486
Query 1496 TTATTAGACACAAATACTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGG 1555
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1487 TGATCAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAGTTTACGCTGG 1546
Query 1556 ATGAACTTCAGAATCTAGCTTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1615
|||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 ATGAACTTCAGAATCTTGCCTCGGTGTCACAATTCTTAAATCGTAGCTTGAACCAGTCAC 1606
Query 1616 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1607 CCATATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCAGCTCAGAAAAATTCTCAAATTCCTGCAGG 1666
Query 1676 ACTTGACTCAGGCCTGTGGATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAA 1735
||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1667 ACTTGTCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCAACGATGAAT 1726
Query 1736 TTAATTCTGGCGACCTGAGTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1795
|||||| ||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1727 TTAATTTTGGGGCCCTGTGTAGAGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATT 1786
Query 1796 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGG 1855
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1787 CATGTCTTCTTTTGGATGAAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGATATATATGG 1846
Query 1856 TCTCAGCATTTG-ATAATGTAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAAT 1914
||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||
Sbjct 1847 GCTCAGCA-TTGCATAATGTAGCTGTAGCAAGTTCTGGGGATATTGCTAATGGAAATGAT 1905
Query 1915 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAA 1974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||
Sbjct 1906 GTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAA 1965
Query 1975 CAAGTTGTGTCATGGATGTGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2034
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966 CAAGTTGTGTCATGGATGCGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATG 2025
Query 2035 CAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2094
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2026 CAACATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCAC 2085
Query 2095 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAG-AAGCCCGGAA 2153
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2086 TTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAAG-CCGGAA 2144
Query 2154 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAG 2213
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2145 GAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGCTGAGGAAACGAAG 2204
Query 2214 ACAAGAGCTAAATGAGAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2273
| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 AGAAGAGCTAAATGAAAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGA 2264
Query 2274 TGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGA 2333
|||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 TGCTTTAACAAATGTGTTGAAAGATGCTGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGA 2324
Query 2334 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 AGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGA 2384
Query 2394 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAA 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2385 ATGGGGGATGAAAGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAGAA 2444
Query 2454 ACAAAAAGAGCAGCTGTCTGCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGT 2513
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||
Sbjct 2445 ACAAAAAGAGCAATTGTCTGCAGAGCTTAGCAGAATTGACGCGCAAATGATGCGAAATGT 2504
Query 2514 CACTGGGATGCAGCAATTAGAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGAT 2573
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2505 CACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCGGTTTCCTCCAACGATTATCAGAT 2564
Query 2574 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAA 2633
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2565 AGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGTGCACATTTGGAGGCGTTGGCAGAGAA 2624
Query 2634 AGATGCCACTGAGAAGTCGGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGA 2693
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 2625 AGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTTTTGAGCTAGCTCTTGA 2684
Query 2694 TTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAA 2753
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 2685 TTCTAAGAAGGAGGGTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAACACACGCTGGAAAAGTCGAA 2744
Query 2754 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 GGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGAATTTGAAGGCTACTATTGGAAA 2804
Query 2814 CGACCATCGCTTCAATGTTGACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTCGGTTGCATCTTTTGT 2873
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2805 CGACCATCGCTTCAATGGTGACTCAATTGAGCACAGCCTCCTTTCGGTTGCATCTTTTGG 2864
Query 2874 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGA 2933
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2865 TGATCATTCAGAGGCTGACGTTGTTTCTGAAGCCATTGAAGCGTTAAGTGATGAGGAAGA 2924
Query 2934 GGAATACAGACGCCGTATCGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGA 2993
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2925 GGAATACAGACGTTGTAACGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGCAAAAACTCTAGA 2984
Query 2994 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAA 3053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 GTATCAAAGAAGAATTGAGAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACAAAAAAAGAA 3044
Query 3054 ATACAGCTGTTTACATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3113
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3045 ATACAGCTGTTCAGATCCGATGAATGTGACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAA 3104
Query 3114 ATTCTTTGATGATG-TAGATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGA 3172
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 3105 TTTCTTTGATGATGCT-GATTTACAAGAACAAGAAAAACCCATAAATCAGGAGAAATGGA 3163
Query 3173 ATGGACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAA 3232
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3164 ATAAACAACTTGATGACTTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATGGAGTTTTCCCGTCAA 3223
Query 3233 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAG 3292
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3224 CAAATCATTGTGTGATATCTGATACTGCAAAGGTGCTGGATGTAATATCCCAAGAAGTAG 3283
Query 3293 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3352
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 TGCCTAACGGTATAGCTATTCAAGCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGA 3343
Query 3353 GGGGTAGACGCCAAAAAGGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTT 3412
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 3344 GGGGTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCACACTTT 3403
Query 3413 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTA-AGTGAGAGACAATCTGAA 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 3404 CTGAGAGCGAGGATAGTAAATCTCAGAGGTCAGGCACCG-ACAGTGAGAGACAATCTGAA 3462
Query 3472 ATTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3531
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463 ACTCTACGTAGCAATGGTGATGCGGGACCAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGAC 3522
Query 3532 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTG 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3523 GATGAAGAAGAAAGATTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAAAACTTCAAAGCCTTGATGTG 3582
Query 3592 TACCGAGGAGGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3651
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3583 TACCGAGGTCGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAGACAACAATGAT 3642
Query 3652 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3643 TGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCAGAGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGC 3702
Query 3712 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3703 ACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCT 3762
Query 3772 CTATGGAATCTGGGGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCAT 3831
|| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3763 CTGTGGAATCTGGGGATGTTTCGGGCTGAGTTCTTGCGGAGCTCAACACTAGAGCACCAT 3822
Query 3832 CACGTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCT 3891
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3823 CACTTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGCGATTTTTACAGCTTTAAGTACT 3882
Query 3892 GCTACGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGT 3951
||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3883 GCTTCGAGTGAAACACGAAAAGAACCTGTTGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGT 3942
Query 3952 AACTTGTATCCAGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTA 4011
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3943 AACTTGTATCCTGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTA 4002
Query 4012 TTGGCCGTAATCTTCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4071
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4003 TTGGCCGTAATCTTCGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGAC 4062
Query 4072 ACAGAATCTACTGAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4131
||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4063 ACAGAATCTGCTGAGAGCAACAGTACGGGCTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATT 4122
Query 4132 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4191
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4123 GCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATGTTTCTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTG 4182
Query 4192 GAGTCCAGGCATTTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGC 4251
||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4183 GAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGC 4242
Query 4252 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4311
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4243 ACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATG 4302
Query 4312 AACCATCAACTAGCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCA 4370
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 4303 AACCATCAACTAGCTTGTGATCGCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAACGCAA-CCATATCCA 4361
Query 4371 CCACATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4430
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4362 CCATATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATG 4421
Query 4431 TGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAG 4490
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||
Sbjct 4422 TGAGACTGTAGAAGACATAGCCGCTACTCTTGCAGCTTTGAATACAGAGATAGACATCAG 4481
Query 4491 CATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4550
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4482 CATCATGTACCGTGGTGTGGACCCTAAGAACACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTA 4541
Query 4551 TTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTA 4610
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4542 TTATGGACAGCATTATCACTGTTTTGCATATAGTCATGAGCACGATCAGTGGATCATGTA 4601
Query 4611 CAATGACCAAA-CAGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTACTTTCTATGTGTGAGA 4669
| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 4602 CGATGACCAAAAC-GTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATGTGTAAGA 4660
Query 4670 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACaaaaagaaactttaaatcagaaaacaaa 4729
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4661 GAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAAAAGAAACTTTAAATTAGAAAACAAA 4720
Query 4730 agaaaaaaCAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAA-GTACAA 4788
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||
Sbjct 4721 AGTAAAAACAGAGCAAGTAGAGTTACGTTGCGACAG------A--TCTCCCAAAGTACAA 4772
Query 4789 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTCAGAGAGGAAGGAATGTG 4848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 4773 ACTGCAAAGAAAGTAAGTACTATTTTTTGATAATCGAAAACTC-GAGAGGAAGAAATGTG 4831
Query 4849 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTCAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4893
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4832 ATTTTTACTCATCTCAGTAGTTTAAAGAGGATGGGGAAGAAGATT 4876
> AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related
protein | chr3:17674417-17681722 REVERSE LENGTH=5422
Length=5422
Score = 6359 bits (3443), Expect = 0.0
Identities = 4435/4910 (90%), Gaps = 84/4910 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 27 GCCGTTGGATTCGGCTGT-GATCAAGCTCGAATGCGAGAAGGCACTCAAGTCATTCGGGC 85
|||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |
Sbjct 425 GCCGTTGGATTCATCTGTCG-TCAAGCTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGAC 483
Query 86 GGGGGAGCTACAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCATGCTCTCGTCATCAAGACT 145
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||
Sbjct 484 GGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCACCAAGACT 543
Query 146 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAAGGAACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 205
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CTGCCCTAATTCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGG 603
Query 206 ATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTCCGGAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 265
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 ATCTCGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGAAATGCAATCGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 663
Query 266 AGTTGTCTCCGAATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 325
|| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AGCTGTCTCCTAACTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 723
Query 326 CTAATGATGGGAAGAGAGAGTATGACGAAGTTGTGCAAGAGTGTCAACGTGCTCTCTCTA 385
|||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 724 CTAACGAAGGGAAGAGAGAGTACGAGGAGGTTGTGCAAGAGTGCCACCGTGCTCTCTCCA 783
Query 386 TCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGT-TTGCATGATGAGACTCAGTTGAAGATA 444
||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||||
Sbjct 784 TCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGAGAGAGTCTT-CAGGATGAGACTCAGCTGAAGATA 842
Query 445 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAA 504
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGCTCATTTCCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAG 902
Query 505 TCTAACATTGGTTCATTGTCTACTTGGATGAATAATC-TGGGAAAAGGTGAAGA-AAAGT 562
||||||||| ||||||||| ||||||||| | | | ||||||| |||||||| ||| |
Sbjct 903 TCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGGATGCA-GACCTTGGGAAATGGTGAAGAGAAA-T 960
Query 563 TTCGGTTGATACCGATTAGGAGAATGGCTGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGA 622
|| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 TTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCCGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGT 1020
Query 623 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAAGCTAACAAAACTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGG 682
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1021 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAATCTACCAAGACTAATGAAGAGAGGAGGAAGGAGA 1080
Query 683 TTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGC-TAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAATCTTCCCCGTTG 741
||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1081 TTGAAGTGAGGGTAGCTGC-GCATAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAGTCTTCCCCGTCG 1139
Query 742 GAAAATGTAGGAGCTGTTGGCAACAAGGGATCAGATCCAACTTTAGGTTCGGGG-AAGAG 800
|| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||
Sbjct 1140 GAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGATCAGATTCAGCATTAGCCGCGGGGCCA-AG 1198
Query 801 AAGCGGAGAGAGGAGAAAGCAT-GGAAGTGCAAGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAA 859
|||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAGCGGGGAGAGAAGAAAGCATGGGAA-TGCAAGGAAAAATGGCTCCACAGCGGATAGAA 1257
Query 860 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAAGAAATGAAGAAACAATTGCTTA 919
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |
Sbjct 1258 GGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTGAGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAA 1317
Query 920 GAGTTAAGGTTAGTGATCTTACGAGTCACTTTAGTGCTTCAAAGGATGGG-AATGCAAAT 978
|||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||
Sbjct 1318 GAGTTAAGTTTAGTGATCTTAAGAGTCACTTTAGTGGTTCAAAGGATGGGCAA-GCATAT 1376
Query 979 GAGATTATAAGTGAAGCTCTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGTT 1038
|||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1377 GAGATTGTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCT 1436
Query 1039 TGCTGCCGGTGTAGTGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1098
||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437 TGCTGCCGGTGTAGTCAAAACTTCATAGAGTCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1496
Query 1099 GAGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTCTGCCTCAAAGTGTCGACACT 1158
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||
Sbjct 1497 GCGCACATGGGTAACGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTTTGCCACAAATTGTCGACACT 1556
Query 1159 GAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGA-T 1217
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 1557 GAGAGGATTGATATGCTTTTTAAGTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTAC-ACT 1615
Query 1218 GAAATTGCTTCGCGGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAGTTTGATAAATTTCACTCTGG 1277
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1616 GAAATTGCTTCGAAGTCAGCAGAAAATACAAAATTCTGAGTTTGATGAATTTCACTCTGG 1675
Query 1278 AGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCACGGATGCACGGAATGATACTTCACCAGA 1337
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1676 AGATAATATGGATGGTGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCATGGAATGATACTACACC--- 1732
Query 1338 GAAAGAAAGCCTTGGATACACTTGCAACGGTTGTAATGAGAATGAA-C--AAGAAGAGGT 1394
|| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||
Sbjct 1733 ---AG--A----TGGAGATACTTGCAACGGTTGGAATGAGAATGAATCTGAAGAGGAGGT 1783
Query 1395 TAAGCTGTCGATCGCATTTCCTCCTCCTGATGGCTGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1454
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 TAAGCTATCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACG 1843
Query 1455 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGCTTATTAGACACAAATACTT 1514
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||
Sbjct 1844 TGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCAACTGATCAGACACAAATATTT 1903
Query 1515 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTTCAGAATCTAGC 1574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1904 AGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTTACGCTGGATGAACTCCAGAATCTACC 1963
Query 1575 TTCGGTTTCACAATTCTTAAGTCGTAGCTTGAACCAGTCACCCATATGCATCTGCTTTTT 1634
|||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1964 CTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAACAAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTT 2023
Query 1635 GGGAGCTTCCCAGCTCAGGAAAATTCTCATATTCCTGCAAGACTTGA-CTCAGGCCTGTG 1693
|||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||
Sbjct 2024 GGGAGCTTCCCATCTCAGCAAAATCCTCAAATTCCTGCAGGACTT-ATCTCAGGCCTGTG 2082
Query 1694 GATTGAATCAATATTCTGAACAAAGTAACTCCAATGATGAAATTAATTCTGGCGACCTGA 1753
|||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| ||| ||||||
Sbjct 2083 GATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCCACGATGAGATTAATTTTGGTGACCTGG 2142
Query 1754 GTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATG 1813
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2143 GTCGTGAAGTCACAGAGGAGATTCTTCTTGATAGTGAAGATTCATGTCTTCTTATGGATG 2202
Query 1814 AAAAAGTACTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGAAATATATGGTCTCAGCATTTGATAATG 1873
||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 2203 AAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAAAAATATATGGGCTCAGCATTTAATAATG 2262
Query 1874 TAGCTATAGTAAGTTCTGGAGATATTGCTAACGGCAATAATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 1933
|| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2263 TAACTATAGCAAGTTCTGGAGATATTGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATG 2322
Query 1934 GATTTCTTTCATGGATCTTTGCAGGACCCTCTACCGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGT 1993
||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2323 GATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGC 2382
Query 1994 GCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2053
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 GCACAAAGGAAGATAAAACTAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGT 2442
Query 2054 TCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCAC 2113
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2443 TCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTATGAGGGAGCAC 2502
Query 2114 TGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGCCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGT 2173
|||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2503 TGCAGACTGTCGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAGGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAAT 2562
Query 2174 TTACCCATGAAAGTTATGAATCTTTGCTGAGGAAACGAAGACAAGAGCTAAATGAGAATG 2233
||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 2563 TTACCCATGAAAGCTATGAAACTGTGCTGAGGAAACGAAGAGAAGAGCTAAATGAGAGTG 2622
Query 2234 ACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2293
||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2623 ACCATGAGTTGTTGTTTATCAGTAGCAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGA 2682
Query 2294 AAGATGCTGAAACCCTCAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGA 2353
||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2683 AAGATGCCGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACTA 2742
Query 2354 GTTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAAA-GATTCC 2412
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2743 GTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGAT-AAAGGATTCC 2801
Query 2413 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAAAAACAAAAAGAGCAGCTGTCT 2472
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||
Sbjct 2802 TTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGATTCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCT 2861
Query 2473 GCAGAGCTTAGCAAAATCGATGCTCAAATGATGCGGAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2532
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 GCAGAGCTTAGCAGAATCGATGCACAAATGATGCGAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTA 2921
Query 2533 GAACTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTTCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2592
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2922 GAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTG 2981
Query 2593 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCG 2652
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 AAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCT 3041
Query 2653 GATGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 2712
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 GATGCTGCAAGAGAAGCCTTACTTGTTGAGCTAGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGA 3101
Query 2713 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 GGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAA 3161
Query 2773 GACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCTACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGTT 2832
|||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 3162 GACACTAGGAAAGTGAAGGATATGAAGGCAACTATTGGAAGCGACCATCGCTCCAATGCT 3221
Query 2833 GACTCAATTGAACACAGCCTCCCTTC-GGTTGCATCTTTTGTTGATCATTCAGAGGCTGA 2891
|| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || | | |||||||||||||||||
Sbjct 3222 GATTCAGTTGAACACAGCC-CCCTTCCGGTTGCACCTGTCGGCGATCATTCAGAGGCTGA 3280
Query 2892 CGTTGTTTCTGAAGCCGTTGAAGCGTTAAAAGATGAGGAAGAGGAATACAGACGCCGTAT 2951
| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||
Sbjct 3281 CATTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTTTAAAAGAAGAGGAAGAGGAATATAAACGCCAAAT 3340
Query 2952 CGAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGAAAAAACTCTAGAGTATCAAAGAAGAATTGA 3011
||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3341 AGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAACCCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGA 3400
Query 3012 GAATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACaaaaaaaGAAATACAGCTGTTTACATCC 3071
| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || | |||
Sbjct 3401 GGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAACAAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCC 3460
Query 3072 GATGAATGT-GACAGAGGCAGTGTATGATGATTGCATAGAAAAATTCT-TTGATGATGTA 3129
|||||||| | || || |||||||| ||| |||| ||| || | ||||| || ||
Sbjct 3461 CATGAATGTTG-CAAAGACAGTGTATAATGGGTGCACAGATAA-TGAAGTTGATTATTTA 3518
Query 3130 GATTTACAAGAACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACAACTTGATGAC 3189
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3519 GTTTTACAAGGACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACGACTTGATGAC 3578
Query 3190 TTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATTGTGTTTTCCCGTCAACAAATCATTGTGTGATA 3249
|||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3579 CTGGAAGGAGCCAGTGTGAATACAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATCATTCTGCGATA 3638
Query 3250 TCTGATACTGGAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAGAAGTAGTGCCTAACGGTATAGCT 3309
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3639 TCTGATACTGCAAAGGTGCAGAATGTAAAATCCCAAAAAGTAGTGCCTAACGGCACAGCT 3698
Query 3310 ATTCAATCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGAGGGGTAGACGCCAAAAA 3369
|| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3699 ATGCAAGCTGGTATTTTCCAATCTGATCAACGAACTGGGAGGAGAACTAGACGCCAAAAA 3758
Query 3370 GGTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCATACCTTCTGAGAGCGAGGATAGT 3429
| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||
Sbjct 3759 GCTTCAAACAAGTTAGCTGATGGAAAATATCCGGTCACACCTCCTGAGACCGAAAATAGT 3818
Query 3430 AAATCTCAGAGGTCAGGCACCGTAA-GT-GAGAGACAATCTGAAATTCTACGTAGCAATG 3487
||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||
Sbjct 3819 AAATCTCAGTTGTCAGGCACC--AACGGCGAGAGACATTCTGAAACTCTACGTAACAATG 3876
Query 3488 GTGATGCGGGAATAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGAT 3547
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3877 GTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGACGAAGAAAGGT 3936
Query 3548 TTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGATGTGTACCGAGGAGGTAGAA 3607
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 3937 TTCAAGCTGACATGCAAAGGGCAGTGCTTCAAAGCCTTGACGTGTACCAAGGAGGTAGAA 3996
Query 3608 ATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAG-ACAACAATGATTGGGTTTTATCTGAT 3666
||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3997 ATATGGCGTCATGTTTGAGGACACCGCTGGAAGTA-AACAATGATGGGGGTTTATCTGAT 4055
Query 3667 GTCACAAAGGAATCTCAG-AGTTCGCCCGGAGTTGCCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 3725
| ||||| ||| ||| || || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4056 GACACAATGGAGTCT-AGGAGCTCAACAGGAGTTACCATATTTGGCACAGGTCTTCAGAA 4114
Query 3726 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATCTGGG 3785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4115 TGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATACAGTCTCTATGGAATTTGGA 4174
Query 3786 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTGCGGAGTTCAACACTAGAGCACCATCACGTTGGAGATCC 3845
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4175 GCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACGGAGTTCAACACGAGAGCACCATCACGTGGGAGATCC 4234
Query 3846 TTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGAGATTTTTACTGCTTTAAGTGCTGCTACGAGTGAAAC 3905
||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||
Sbjct 4235 TTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATCTTTACCGCTTTGAGCGCTGCTTCAAGTGAAAA 4294
Query 3906 ACGAAAA-GAACCTGTGGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTGAGTAACTTGTATCCAG 3964
|| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 4295 AC-AAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCTTTAAGTAATTTGTATCCAG 4353
Query 3965 ATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAATGATGCTTCAGAAGTATTGGCCGTAATCT 4024
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 4354 ATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCAGAAGTACTGGCTGTGATCT 4413
Query 4025 TCGAATGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGACACAGAATC-TACT 4083
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |
Sbjct 4414 TTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTGTCTGATGTGGATTCCT-CA 4472
Query 4084 GAGAGCAACAGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAATCGCTCATGTATTGCCCATTCTCTG 4143
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4473 GACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACATGTATTGCCCATTCTTTG 4532
Query 4144 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4203
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4533 TTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGTGGGCTGGAGTCCAGGCAT 4592
Query 4204 TTGAAATACACATCCTTTTTCCATAACATCAATGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4263
||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4593 TTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCCCTACGCACCATGAAGGTT 4652
Query 4264 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTAAATCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4323
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4653 ACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTTAACCTTGTCGAGATGAACCATCAACTA 4712
Query 4324 GCTTGTGATCCCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAAC-CAAACCATATCCACCACATTCTCAC 4382
|| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 4713 GCCTGTGATCCCGAAACCGGTGGGTGTGGGAAACTCAA-CCATATCCACCATATTCTCAC 4771
Query 4383 CACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4442
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4772 TACTCCACCACATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAACACATGTGAGACTGTAGA 4831
Query 4443 AGACATAGCAGCTACCCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGATATCAGCATCATGTACCG 4502
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4832 AGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGACATCAGCATCATGTACCG 4891
Query 4503 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4562
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4892 TGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCTGTGGTTTGTTATTATGGACAGCA 4951
Query 4563 TTATCATTGTTTTGCACATAGTAATGAGCACGATCGGTGGATCATGTACAATGACCAAAC 4622
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 4952 TTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATCATGTACGATGACAAAAC 5011
Query 4623 AGTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGT-GATGTACTTTCTATGTGTGAGAGAGGACATTTGC 4681
|||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 5012 CGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGA-TCGATGTTCTTTCAATGTGTGAAAGAGGACACTTGC 5070
Query 4682 AACCACAGGTTCTTCTCTACaaaaagaaactttaaa-tcagaaa-a--caaaagaaaaaa 4737
| |||||||||||||||||| | | || | ||||| | | ||| | ||||| |||
Sbjct 5071 AGCCACAGGTTCTTCTCTACGAGA-GA--CGTTAAAATAAAAAAGAAGCAAAACAAATG- 5126
Query 4738 CAGAGCAAGTAGAGTTAC-GTTGCAACAGTTTTGGAGATCTCCCAAGTACAAACTGCAAA 4796
|||| ||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 5127 CAGACCAAGTAGAGTT-CTGTTGCTACAATTTAGGAGATCTCGTAAGTACATACTACAAA 5185
Query 4797 GAAAGTAAGTAC-TATTTTTTGATAATC-GAA--AA-CTCAGAGAGGAAGGAATGTGATT 4851
| |||||||||| | |||||||| || | ||| || ||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 5186 GGAAGTAAGTACGT-TTTTTTGACAAGCAGAAGTAAACTC-GAGAGGAAAGAATGTGATT 5243
Query 4852 TTT-ACTCATCTCAGTAGTTC-AA-----A-GAGGATGGGGAAGAAGATT 4893
|| |||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||
Sbjct 5244 TTACACTCATCTCAGTGGTTCTAACTTCTAAGAGGATGGGGAAGACGATT 5293
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 245466852099
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5