BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485166
Length=5057
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G48060.1 | Symbols: | BAH domain ;TFIIS helical bundle-like... 7949 0.0
AT3G48050.1 | Symbols: | BAH domain ;TFIIS helical bundle-like... 7821 0.0
> AT3G48060.1 | Symbols: | BAH domain ;TFIIS helical bundle-like
domain | chr3:17743114-17748736 REVERSE LENGTH=5250
Length=5250
Score = 7949 bits (4304), Expect = 0.0
Identities = 4823/5073 (95%), Gaps = 37/5073 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AAGGTATTGAATATTGTCTGGGGAAAAAAGGAATTTTTGAGGATTTGTTGGATTTTCGCT 60
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 194 AAGGTATCGAATATTGTCTGGGGAAAAAAGGAA-TTTTGAGGATTTGTTTGATTTTCGCT 252
Query 61 GAGGAGTTGTGTATTGATGTTGTTCGAAGGAGAAGATGATAGAAGGCTATGCATGGGAGG 120
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 GAGGA------AATTGATGTTGTTCGAAGGAGAAGATGATAGAAGGCTATGCATGGGAGG 306
Query 121 GTTTGTGAGCGGAGGCACAAAAGTCGTCGCCGGCACATGTTGATATCTTCCTCGCGTGTA 180
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 307 GTTTGTGAGCGGAGGCACAAAAGTCGTCGTCGGCACATGTTGATATCTTCCTCTCGTGTA 366
Query 181 ATTGCGACTGTGGAAGGTGGTGGTTCTTCTTGTTTGTCATTATCTTCATCTACCTCGTTT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 367 ATTGCGACTGTGGAAGGTGGTGGTTCTTCTTGTTTGTCCTTATCTTCATCTACCTCGTTT 426
Query 241 TCTAAGGACGGGCGCAAAATTAGTGTTGGTGACTGTGCTCTTTTTAAGCCACCACAGGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 427 TCTAAGGACGGGCGCAAAATTAGTGTTGGTGACTGTGCTCTGTTTAAGCCACCACAGGAT 486
Query 301 TGTCCACCGTTCATTGGGATAATTCGCTTGATCATTGCTGAGAAAGAAGATAAGTTGAAG 360
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 487 TGTCCACCGTTCATTGGGATAATTCGCTTGATCATTGCTGAGGAAGAAGATAAGTTGAAG 546
Query 361 TTGGGTGTTAATTGGCTGTATCGACCCACAGAATTAAAACTTGGCAAAGGCATCCTTCTA 420
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 547 TTGGGTGTTAATTGGCTTTATCGACCCACTGAATTAAAACTTGGCAAAGGTATCCTTCTA 606
Query 421 GAGGCTGAGCCGAACGAACTCTTTTATTCCTTTCACGAGGATAATATACCTGCTGCATCT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 607 GAGGCTGAGCCGAACGAACTCTTTTATTCCTTTCACGAGGATAATATACCTGCAGCATCT 666
Query 481 CTATTGCATCCGTGTAAAGTTGCCTTCCTTCCAAGAGGTGTTGAACTGCCATCTGGTATC 540
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTACTGCATCCGTGTAAAGTTGCCTTCCTTCCAAGAGGTGTTGAACTGCCATCTGGTATC 726
Query 541 TGCTCGTTTGTGTGTCGGCGAGTTTACGACGTTACAAACGAGCGCATATGGTGGCTGACA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 727 AGCTCGTTTGTGTGTCGGCGAGTTTACGACGTTACAAACGAGCGCTTATGGTGGCTGACT 786
Query 601 GATCAAGACTATATTGATGATCGACAACTAGAAGTAGACAAGTTATTGTGTAAGACTCGT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 GATCAAGACTATATTGATGATCGACAACTAGAAGTAGACAAGTTATTGTGTAAGACTCGT 846
Query 661 TCAGAAATGCATACAACATTACAGCAGGGTGGTCGTTCTCCCAAGTCCATGAATAGTCCA 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 847 TCAGAAATGCATACAACATTACAGCAGGGTGGTCGTTCTCCAAAGTCCATGAATAGTCCA 906
Query 721 ACAACATCACAAGCGAAAGATGGCATACAGAACAATAACTCT-TTTCTTTCTCAGGGTAA 779
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||| ||||
Sbjct 907 ACAACATCACAACCGAAAGATGGCATCCAGAACAACAACTCTCTTT-TCTCTCAGAGTAA 965
Query 780 GGGAAGGAAAAGAGAGCGTATGGATCATGGTTCCGAGTCTGTTAAACGGGAACGTTCTTC 839
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 GGGAAGGAAAAGAGAGCGTATGGATCATGGTTCTGAGTCTGTTAAACGGGAACGTTCTAG 1025
Query 840 TCGAGTAGATGACAGTGGTTCTGGCCCCCTCAGAACAGAAAGCGGTTTAAAGTCTGAGAT 899
||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1026 TCGAGTAGATGACAGTGGTTCCGGTCCCCTCAGAACCGAAAGCGGTTTAACGTCTGAGAT 1085
Query 900 TTCAAAATTTACAGAGAAAGGTGGTCTGGTGGATTCGGAAGGAGTTGAAAAATTGGTGCA 959
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1086 TTTAAAATTTACAGAGAAAGGTGGTCTGGTGGATTCTGAAGGAGTTGAAAAATTGGTTCA 1145
Query 960 GCTCATGCTACCTGAGAGGAATGAGAAGAAAATAGACTTAATTGGCCGTGCGATTCTTGC 1019
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1146 GCTCATGCTGCCTGAGAGGAATGAAAAGAAAATAGACTTAGTTGGCCGTGCGATTCTTGC 1205
Query 1020 AGGGGTTGTAGCGGCAACAGACAAGTTTGATTGCCTTAGTCGTTTTGTCCAGCTCAGGGG 1079
|||| ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AGGGTTTGTAGCAGCGACAAACAGGTTTGATTGCCTTAGTCGTTTTGTCCAGCTCAGGGG 1265
Query 1080 ATTACCCGTGTTTGATGAGTGGCTGCAGGAAGTTCATAAAGGGAAAGTTGGAGATGGGGG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1266 ATTACCCGTGTTTGATGAGTGGCTGCAGGAAGTTCATAAAGGGAAAGTTGGGGATGGGGG 1325
Query 1140 CAGTCCCAAGGACAGTGATAGGTTAGTAGACGATTTCCTCTTAGTCTTACTTCGTGCTCT 1199
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1326 CAGTCCCAAAGACAGTGATAGGCTAGTAGACGATTTCCTCTTAGTCTTACTTCGGGCTCT 1385
Query 1200 TGACAAGCTACCTGTGAATCTCAACGCTCTTCAGACTTGTAACATTGGAAAGTCTGTTAA 1259
||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 TGATAAGCTACCGGTGAATCTCAACGCGCTTCAGACTTGTAACATTGGAAAGTCTGTTAA 1445
Query 1260 TCATCTACGGTCACATAAAAATTCAGAGATTGGGAAAAAAGCAAGGAGCTTGGTTGACAC 1319
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 TCATCTACGCTCACATAAAAATTCAGAGATTGGGAAAAAAGCAAGGAGCTTGGTTGACAC 1505
Query 1320 ATGGAAGAAACGAGTTGAGGCAGAAATGGATGCGAAGTCTGGATCCAACCAGGGTGTTTC 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 TTGGAAGAAACGAGTTGAGGCAGAAATGGATGCGAAGTCTGGATCCAACCAGGGTGTTTC 1565
Query 1380 CTGGCCTGGAAGACTGAGTCATGGGGGAAGGCATTCAGGTGGTTCCGCGGAGGCAAACAA 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1566 CTGGCCTGGAAGACTGAGTCATGGGGGAAGGCATTCAGGTGGTTCCGCGGAGGCAAACAA 1625
Query 1440 GACATCATCATCACATTTACATGCTTCTAAGTCAGTCTCGGTCAAACAACAGGTGGAAAA 1499
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 GACATCATCATCACACCTACATGCTTCTAAGTCTGTCTCGGTCAAACAACAGGTGGAAAA 1685
Query 1500 TAACCTGAAATGTGTAGCCACGTCGCCAGGCTCTACAAGATCAGCCCCATCTCCGGGATC 1559
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1686 CAACCTGAAGTGTGTAGCCACGTCGCCAGGCTCCACAAGATCAGCTCCTTCTCCGGGATC 1745
Query 1560 TGGTGGTACTGTTTCTAAAGATGGACAGCAACGAAATGCTGGGGCTGGTGGTGTATCTGA 1619
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 AGGTGGTAATGTTTCTAAAGATGGACAGCAGCGAAATGCTGGGGCTGGTGGTGTATCTGA 1805
Query 1620 AGTCCTAGCTGCAGTAAAGGATGAGAAAAGTAGCAGCTCCAGTCAGTCCCACAATAATAG 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1806 AGTCCTAGCTGCAGTAAAGGATGAGAAAAGTAGCAGCTCCAGTCAGTCGCACAATAATAG 1865
Query 1680 TCAGTCTTGCTCGAGCGAGCATGCTAAAACAGGCAATTTATGTGGGAAAGAGGATGCAAG 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 1866 TCAGTCTTGCTCGAGCGAGCATGCTAAAACAGGCAATTTATGTGGAAAAGAAGATGCAAG 1925
Query 1740 AAGCTCAACTGCTGGTTCAACTTTGAAGAAGTGCTCTGGTGGCTCTTCAAGGCATCGGAA 1799
|||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926 AAGCTCTACTGCTGGTTCAACTTTGAAGAAGTGTTCCGGTGGCTCTTCAAGGCATCGGAA 1985
Query 1800 ATCAAACAATGTGTTTCAAGGTTCATCTTCGTCAGCATCCCCTAGGGAAGCTGGTTTTAG 1859
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1986 GTCAAACAATGTGTTTCAAGGTTCGTCTTCGTCAGCATCCCCTAGGGGAGCTGGTTTGAG 2045
Query 1860 TAGAAGCTTCTCATCGCAAAGGAATGTCCCTTCTGAGAAAATTTCTCAATCAAGTTTGAC 1919
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 TAGAAGCTTCTCATCACACAGGAATGTCCCTTCTGAGAAAATTTCTCAATCAAGTTTGAC 2105
Query 1920 ATCTGAAAAAACTCTTGAGGTTCCTCTGACTGAGAGTTCCGGTAATAAATTGATTGTGAA 1979
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 ATCTGAAAAGACTCTTGAGGTTCCTCTGACTGAGGGTTCCGGTAATAAATTGATTGTGAA 2165
Query 1980 GCTGCCTAATCGGGGTCGCAGTCCTGCTCAAAGTGTGAGTGGAGGCTCTTTGGAGGACCC 2039
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 GCTGCCG---CGGGGTCGAAGTCCTGCTCAAAGTGTGAGTGGAGGCTCTTTGGAGGACCC 2222
Query 2040 TGCGCCGGTGAATAGCAGAGTTTCTTCACCTGTGCATGCGGTGAAGCAGGAACTGTGTGA 2099
||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2223 TGCACCAGTGAATAGCAGAGTTTCTTCACCTGTGCATACGGTGAAGCAGGAACTGTGTGA 2282
Query 2100 CAATAA-TGTGAGAGaaaaaaaTCATTCTTATCGAGCTAACGTGAGCTCTGTCTTGAATG 2158
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2283 CAATAACTG-GAGAGAAAAAAATCATTCTTATCGAGCTGATGTGAGCTCTGTCTTGAATG 2341
Query 2159 CCGATTCTTGGCAAAGCAATGAATTAAAAGATATTTTGACAGGCTCGCAAGAGGCAGCTG 2218
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2342 CCGAGTCTTGGCAAAGCAATGAATTAAAAGATATATTGACAGGCTCGCAAGAGGCAACTG 2401
Query 2219 GTTCACCACTTGTTGTTGCTGGTGATGAGCGCGGAGGGGCTCTTAAAGATTCTGATAAAG 2278
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2402 GTTCACCACTTGTTGTTGCTGGTGATGAGCGCGAAGGGGCTCTTAAGGATTCTGATAAAG 2461
Query 2279 CAGCTGGGAATGTTAAAGGCACATCTTCCTTAGGAAATGAGATCAAATCTGGAGAAAGGC 2338
|| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 2462 CATCTGGGAATGTTAAAGCCACATCTTCATTAGGAAATGAGTTCAAATCTGGAGAAAGAC 2521
Query 2339 ATGGCGGAACACTCAGTTCGATGAATGCTTTGATTGAAAGTTGTGTCAGATACTCCGAGA 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2522 ATGGCGGAACACTCAGTTCGATGAATGCTTTGATTGAAAGTTGTGTCAGATACTCTGAGA 2581
Query 2399 CAAATGCGTCTTTGGCTGGTTCGGATGATGTTGGAATGAATCTTCTTGCTAGCGTTGCTG 2458
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2582 CAAATGCCTCTTTGGCTGGTTCGGATGATGTTGGAATGAATCTTCTTGCTAGTGTTGCTG 2641
Query 2459 CTGATGAGATGTCTAAATCGCCTGTTGCATCACCCTCAGTATCTCAGCCTCCAAATTCCT 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 CTGATGAGATGTCTAAATCGCCTGTTGCATCACCCTCAGTATCTCAGCCTCCAAATTCCT 2701
Query 2519 TGATGAATGAAAATTCTACTGTAGGGAACAATACAAAGCTAATCGCTTCGGATGGCTTGC 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2702 TGATGAATGAAAATTCTACTGTAGGGAACAATACAAAGCTAATGGCTTCGGATGGCTTGC 2761
Query 2579 CTCACGAGCAACATCAAGCTGCTCGCACCACTGTCAGTAATGAGCAAGGTGAGCAACATG 2638
|||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 CTCATAAGCAACATCAAGCTGTTCGCCCCACTCTCAGTAATGAGCAAGGTGAGCAACATG 2821
Query 2639 TTAGCAGTAGTGGCACACAGTTGGAGTCAGAGATAAAAAATGAGTCTAAGACCGGAGATC 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2822 TTAGCAGTAGTGGCACACAGTTGGAGTCAGAGATAAAAAATGAATCTAAGACCGGAGATC 2881
Query 2699 GTGATAAGATCTCGAATTCAGACACCGAAGATCTGCAAAGGTTGGTGGATCAGCACCTAG 2758
||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2882 GTGTTAAGAGCTCGAATTCAGACACTGAAGATCTGCAAAGGTTTGTGGATCAGCGCCTAG 2941
Query 2759 AGAACAATGACAATTCAGATGGTGCCGTTGCTTCGCCTGCTTTGCCCACTAAAGCCATCA 2818
||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |
Sbjct 2942 AGAGCAATGAAAATTCAGATGGTGTCGTTGCTTCGCCTCCTTTACCCACAAAAGTCATTA 3001
Query 2819 AGGAAAAGATTTTGGATGATAGTGACTCTGGGGAAGTAAAGGATATAAAGGCTGATGTTA 2878
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 3002 AGGAAAATATTTTGGATGATAGTGACTCTGGAGAAGTGAAGGATATAAAGACTGATGTTA 3061
Query 2879 AATCAGAGGCTGATTGCACATCTGACTCAACAAAAAGACTAGCAAGCTCAATGCTAACTG 2938
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 3062 AATCAGAGGCTGATTGCACATCTGACTTAACAAAAAGAGTAGCAAGCTCAATGCTAACCG 3121
Query 2939 AATGTAGAGATGTAAGTCAAAA-GGTAGATTCTGTTGCTGTTGAACACACTCCTTTGGAC 2997
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3122 AATGTAGAGATGTAAGT-AAAATGGTAGATTCTGTGGCTGTTGAACATACTCCCTTGGAA 3180
Query 2998 CGTGTTGATGAT-A-A-GAAAGAAGAGAAACCCCCAACGGCGTTGAGTTCTGAGCTAGTT 3054
||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3181 GGTGTTGATGATGATAAGAAAGAAGAGAAACCCCCAACGGCGTTGAGTTCTGAGCTAGTT 3240
Query 3055 AAAAAAGTGGAAGAAGATGTACCAGTTTCTTCTGGGATTTCAAGCGGTATGGATGCAGTA 3114
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3241 AAAAAAGTGGAAGAAGATGTACCCGTTTCTTCTGGGATTTCAAGGGGTATGGATGCTGTA 3300
Query 3115 AGCATTGATAGACCTATAACTGAAATGGTCAATAATATAGCGGTTAATCATACAGACCAA 3174
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||
Sbjct 3301 AGCATTGATAGACCTATAACTGAAATGGTCAATAATATTGCGTTTAATCATATGGACCAA 3360
Query 3175 AAAGATATAAAGAAGATTAAGCAGGATTGTGATGCCTT-TGTGGGTGCTATAAAGGATGC 3233
|||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3361 AAAGATATAAAGAAGATTAAGCAGGATTTTGATAC-TTCTGTGGGAGCTGTAAAGGATGC 3419
Query 3234 CTCAGCCAGTTTGGACTCATCTGTAACTAAAGGTAAAGTTGAGCCTGTGGAGGGGAATCT 3293
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 CTCAGCCGGTTTGGACTCATCTGTAACTAAAGGTAAAGTTGAGCCTGTGGAGGGGAATCT 3479
Query 3294 AGAAAATATTGAAGTCAAGGAACGGTACTCAGGATTAAAAGCTACTCCAGGAGTATCACC 3353
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 3480 AGAAAATATTGAAATCATGGAACGGTACTCAGGATTAAGAGCTACTCCAGGATTATCACC 3539
Query 3354 TAAAGATGCAGAGGATCTTAAGAGACCGAATGGGCCTAAAACTAGTGATGCTGATGGAGA 3413
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3540 TAAAGAAGCAGAGGATCTTAAGAGACCGAATGCGCCTAAAACCAGTGATGCTGATGGAGA 3599
Query 3414 TGAAGCGGAGGAATGTACGTCTGCTGCCAGAGATGCTTCTTCCGTTTCAGCTGCAGCTTC 3473
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3600 TGAAGCGGGGGAATGTACGTCTGCTGCCAGAGATGCTTCTTCCGTTTCAGCTGCAGCTTC 3659
Query 3474 AGCT---G--G-CTCTGAGATGGATGCCAGAGTTGAATTTGATCTAAATGAAGGTTTTGA 3527
|||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 AGCTTCAGCTGGCTCTGAGATGGATGCCAGAGTTGAATTTGATCTAAATGAAGGTTTTGA 3719
Query 3528 TGGAGACGATGCAAAACATGGGGACTCAAATAACTTCTCTGGATCTGTATTTTTGACGCC 3587
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3720 TGGAGACGATGCACAACATGGGGACTCAAATAACTTCTCTGGATCTGTAGTTTTGACGCC 3779
Query 3588 TACTCCTCTACAACCAGTTAATACCTTGCCTTTTCCTGTGGCTCCTGTATCTAGTGGAAT 3647
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3780 TACTCCTCTACAACCAGTTAATACCTTACCTTTTCCGGTGGCTCCTGTATCTAGTGGAAT 3839
Query 3648 TCCTGCATCCATTACTGTTGCTGCTGCTGCCAAAGGTCCGTTTGTTCCACCCGAAGATCT 3707
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3840 TCCTGCATCCATTACTGTTGCTGCTGCCGTCAAAGGTCCGTTTGTTCCACCTGAAGATCT 3899
Query 3708 GTTGAGAAATAAAGGGGCTGTTGGTTGGAGAGGATCTGCTGCCACTAGTGCCTTCCGCCC 3767
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3900 GTTGAGATATAAAGGGGCTGTTGGTTGGAGAGGATCTGCTGCCACTAGTGCCTTCCGCCC 3959
Query 3768 AGCTGAGCCAAGAAAAGCTCAGGATGTGTTACTGAGCATTAACAATACCTCTACATCTGA 3827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 AGCTGAGCCAAGAAAAGCTCAGGATGTGTTACTGAGCATTAACAATACCTCTACATCTGA 4019
Query 3828 TGCATCTACATCTGCTGGCAAACAGACAAGGACGTTTCTGGATTTTGACTTGAATGTACC 3887
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 TGCATCTACTTCTGCTGGCAAACAGACAAGGACGTTTCTGGATTTTGACTTGAATGTACC 4079
Query 3888 TGACGAGAGAGTCCTTGAAGATTTGGCTTCCCAAAGAACTGGAAATGCCACAAATTGTAC 3947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 4080 TGACGAGAGAGTCCTTGAAGATTTGGCTTCCCAAAGATCTGGAAATCCCACAAATTGTAC 4139
Query 3948 ATCTGGTATCACCAATAGTTTTGACCAAGCACGTTCTGGGGTCATGGGTTCCGCGCTTGA 4007
|||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4140 ATCTGGTATCACAAATAATTTTGACCAAGTACGTTCTGGGGTCATGGGTTCCGCCCTTGA 4199
Query 4008 TCATTCTTCTGGGGGCCTTGATCTTGATCTAAACAAAGTTGATGATTCAACTGATATGAA 4067
|||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4200 TCATTCTTCTGGAGGCCTTGATCT--A---AA-CAAAGTTGATGATTTAACTGATATGAA 4253
Query 4068 CAACTACA-ATATGAGCAGTAGTCATCGGCTAGATTCATCTTTTCAGCACGTTAAATTAT 4126
|| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4254 CAGCTACACA-ATGAACAGTAGTCATCGGCTAGATTCATCTTTTCAGCAGGTTAAATTAC 4312
Query 4127 CATCGACTGGTGGTCGTAGAGATTTTGATTTAAATGATGGACCTGCGGGTGATGATGCGG 4186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4313 CATCGACTGGTGGTCGTAGAGATTTTGATTTAAATGATGGACCTGTGGGTGATGATGCAG 4372
Query 4187 CTGTTGAGCCATCTATGGTTCTAAATCAACATTCACGAAGTGGCTTGCCCTCACAACCAT 4246
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4373 CTGTTGAGCCATCGATGGTTCTAAATCAACATTCACGAAGTGGCTTGCCATCACAACCAT 4432
Query 4247 CTCTCTCTGGAATACGAGTGAATGGCGAAAACATGGCTAGTTTCTCAACTTGGTTTCCTG 4306
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4433 CTCTCTCTGGAATTCGAGTGAATGGCGAAAACATGGCTAGTTTCTCAACTTGGTTTCCTG 4492
Query 4307 CTGCTAACGCTTATTCAGCAGTGAGCATTCCTCCAATTATGCCTGAGAGAGGTGATCAGC 4366
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4493 CTGCTAACGCTTATTCAGCTGTGAGCATGCCTCCAATTATGCCTGAGAGAGGTGATCAGC 4552
Query 4367 CTTTTCCAATGATTGCCAATCGTGGACCACAGAGAATGTTGGGTCCAACAACTGGTGTTT 4426
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4553 CTTTTCCAATGATTGCCACTCGTGGCCCACAGAGAATGTTGGGTCCAACAACTGGTGTTT 4612
Query 4427 CCTCATTTGCCCCTGAAGGGTACAGGGGTCCGGTTTTGTCGTCGTCTCCTGCCATGCCAT 4486
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4613 CCTCATTTTCCCCTGAAGGGTACAGGGGTCCTGTTTTGTCGTCGTCTCCAGCCATGCCAT 4672
Query 4487 TTCAGTCCACAACGTTCCAGTATCCTGTCTTTCCTTTTGGAAACAGCTTCCCCATTACCT 4546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 4673 TTCAGTCCACAACGTTCCAGTATCCTGTCTTTCCTTTTGGAAATAGCTTCCCCGTTACCC 4732
Query 4547 CAGCGAATTTCTCTGGTGCTTCTACAACACACATGGATTCTTCTTCAAGTGGGAGAGCTT 4606
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4733 CAGCGAATTTCCCTGGTGCTTCTACAGCACACATGGATTCTTCTTCAAGCGGGAGAGCTT 4792
Query 4607 GCTTCCCCGGTGTGAACTCTCAAATATTGGGTCCTGGAGTACCAGTTCCGTCTAATTACC 4666
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4793 ACTTCCCCGGTGTCAACTCTCAAATATTGGGTCCTGGAGTTCCAGTTCCGTCTAATTACC 4852
Query 4667 CAAGACCTTATATCGTTGGCCTCCCAAATGGTGGTAGCAATGGTGGAGTTTTGGACAATA 4726
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||
Sbjct 4853 CAAGACCTTATATAGTTGGCCTCCCAAACGGTGGTAGCAATGGCGGTGTTTTGGACAATA 4912
Query 4727 GTGCGAAATGGTTTAGGTCAGGACTTGACTTAAATTCTGGTCCTGGAGGTCATGAAACGG 4786
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4913 GCGCGAAATGGTTTAGGTCAGGACTTGACTTAAATTCTGGTCCTGGAGGTCATGAAACAG 4972
Query 4787 AGGGAAGAGACGAATCAACACTTGTGGCAAGGCAATTATCCTCATCTGCTTCCTTACCGT 4846
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 4973 AGGGAAGAGACGAATCAACACTTGTATCAAGGCAATTATCTTCATCTGCTTCCGTACCGT 5032
Query 4847 TGAAGGAGGATCAAGCAAGAATGTATCAAATGTCAGGTGGTGTTCTGAAGAGGAAAGAAC 4906
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5033 CGAAGGAGGATCAAGCAAGAATGTATCAAATGTCAGGTGGTGTTCTGAAGAGGAAAGAAC 5092
Query 4907 CGGAAGGTGGATGGGATGGATATAGGCAATCCTCATGGCAATAACAATAACACATTTTTG 4966
||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| |
Sbjct 5093 CGGAAGGAGGATGGGATGGATATAGGCAGTCCTTATAACAATAACAATAACACACTTTAG 5152
Query 4967 GTCATTTTTCATGCATGTGTGT--ATCTCTATACACCGGCACAAAAGACTAGAGATAAAA 5024
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 5153 GTCATTTTTCATGCATGTGTATCTATCTCTATACACCGGCTCAAAAAACTAGCGATAAAA 5212
Query 5025 CGAATGTTGGTGGCTTTTGAGTGTGTTCAAAAT 5057
| |||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5213 CAAATGTTAGTGGCTTTTGAGTGTGTTCAAAAT 5245
> AT3G48050.1 | Symbols: | BAH domain ;TFIIS helical bundle-like
domain | chr3:17733533-17739412 REVERSE LENGTH=5482
Length=5482
Score = 7821 bits (4235), Expect = 0.0
Identities = 4647/4850 (96%), Gaps = 12/4850 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 109 ATGCATGGGAGGGTTTGTGAGCGGAGGCACAAAAGTCGTCGCCGGCACATGTTGATATCT 168
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCATGGGAGGGTTTGTGAGCGGAGACACAAAAGTCGTCGTCGGCACATGTTGATATCT 60
Query 169 TCCTCGCGTGTAATTGCGACTGTGGAAGGTGGTGGTTCTTCTTGTTTGTCATTATCTTCA 228
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 TCCTCTCGTGTAATTGCGACTGTGGAAGGTGGTGGTTCTTCTTGTTTGTCCTTATCTTCA 120
Query 229 TCTACCTCGTTTTCTAAGGACGGGCGCAAAATTAGTGTTGGTGACTGTGCTCTTTTTAAG 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 TCTACCTCGTTTTCTAAGGACGGGCGCAAAATTAGTGTTGGTGACTGTGCTCTGTTTAAG 180
Query 289 CCACCACAGGATTGTCCACCGTTCATTGGGATAATTCGCTTGATCATTGCTGAGAAAGAA 348
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 CCACCACAGGATTGTCCACCGTTCATTGGGATAATTCGCTTGATCATTGCTGAGGAAGAA 240
Query 349 GATAAGTTGAAGTTGGGTGTTAATTGGCTGTATCGACCCACAGAATTAAAACTTGGCAAA 408
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 241 GATAAGTTGAAGTTGGGTGTTAATTGGCTTTATCGACCCACTGAATTAAAACTTGGCAAA 300
Query 409 GGCATCCTTCTAGAGGCTGAGCCGAACGAACTCTTTTATTCCTTTCACGAGGATAATATA 468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 301 GGCATCCTTCTAGAGGCTGAGCCGAACGAACTCTTTTACTCCTTTCACGAGGATAATATA 360
Query 469 CCTGCTGCATCTCTATTGCATCCGTGTAAAGTTGCCTTCCTTCCAAGAGGTGTTGAACTG 528
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 CCTGCTGCATCTTTACTGCATCCGTGTAAAGTTGCCTTCCTTCCAAGAGGTGTTGAACTG 420
Query 529 CCATCTGGTATCTGCTCGTTTGTGTGTCGGCGAGTTTACGACGTTACAAACGAGCGCATA 588
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 421 CCATCTGGTATCAGCTCGTTTGTGTGTCGGCGAGTTTACGACGTTACAAACGAGCGCTTA 480
Query 589 TGGTGGCTGACAGATCAAGACTATATTGATGATCGACAACTAGAAGTAGACAAGTTATTG 648
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TGGTGGCTGACTGATCAAGACTATATTGATGATCGACAACTAGAAGTAGACAAGTTATTG 540
Query 649 TGTAAGACTCGTTCAGAAATGCATACAACATTACAGCAGGGTGGTCGTTCTCCCAAGTCC 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 541 TGTAAGACTCGTTCAGAAATGCATACAACATTACAGCAGGGTGGTCGGTCTCCCAAGTCC 600
Query 709 ATGAATAGTCCAACAACATCACAAGCGAAAGATGGCATACAGAACAATAACTCTTTTCTT 768
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 601 ATGAATAGTCCAACAACATCACAACCGAAAGATGGCATCCAGAACAGTAACTCTTTTCTC 660
Query 769 TCTCAGGGTAAGGGAAGGAAAAGAGAGCGTATGGATCATGGTTCCGAGTCTGTTAAACGG 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 661 TCTCAGGGTAAGGGAAGGAAAAGAGAGCGTATGGATCATGGTTCCGAGTCTGTTAAAAGG 720
Query 829 GAACGTTCTTCTCGAGTAGATGACAGTGGTTCTGGCCCCCTCAGAACAGAAAGCGGTTTA 888
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GAACGTTCTAGTCGAGTAGATGACAGTGGTTCTGGTCCCCTCAGAACAGAAAGCGGTTTA 780
Query 889 AAGTCTGAGATTTCAAAATTTACAGAGAAAGGTGGTCTGGTGGATTCGGAAGGAGTTGAA 948
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 781 AAGTCTGAAATTTTAAAATTTACAGAGAAAGGTGGTCTGGTGGATTCTGAAGGAGTTGAA 840
Query 949 AAATTGGTGCAGCTCATGCTACCTGAGAGGAATGAGAAGAAAATAGACTTAATTGGCCGT 1008
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 841 AAATTGGTTCAGCTCATGCTGCCTGAGAGGAATGAAAAGAAAATAGACTTAGTTGGCCGT 900
Query 1009 GCGATTCTTGCAGGGGTTGTAGCGGCAACAGACAAGTTTGATTGCCTTAGTCGTTTTGTC 1068
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GCAATTCTTGCAGGGGTTGTAGCGGCAACAGACAAGTTTGATTGCCTTAGTCGTTTTGTC 960
Query 1069 CAGCTCAGGGGATTACCCGTGTTTGATGAGTGGCTGCAGGAAGTTCATAAAGGGAAAGTT 1128
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CAGCTCAGGGGATTACCTGTGTTTGATGAGTGGCTGCAGGAAGTTCATAAAGGGAAAGTT 1020
Query 1129 GGAGATGGGGGCAGTCCCAAGGACAGTGATAGGTTAGTAGACGATTTCCTCTTAGTCTTA 1188
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 GGGGATGGGGGCAGTCCCAAAGACAGTGATAGGTTAGTAGACGATTTCCTCTTAGTCTTA 1080
Query 1189 CTTCGTGCTCTTGACAAGCTACCTGTGAATCTCAACGCTCTTCAGACTTGTAACATTGGA 1248
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTTCGGGCTCTTGATAAGCTACCTGTGAATCTCAACGCGCTACAGACTTGTAACATTGGA 1140
Query 1249 AAGTCTGTTAATCATCTACGGTCACATAAAAATTCAGAGATTGGGAAAAAAGCAAGGAGC 1308
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 AAGTCTGTTAATCATCTACGCTCACATAAAAATTCAGAGATTGGGAAAAAAGCAAGGAGC 1200
Query 1309 TTGGTTGACACATGGAAGAAACGAGTTGAGGCAGAAATGGATGCGAAGTCTGGATCCAAC 1368
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 TTGGTTGACACTTGGAAGAAACGAGTTGAGGCAGAAATGGATGCGAAGTCTGGATCCAAC 1260
Query 1369 CAGGGTGTTTCCTGGCCTGGAAGACTGAGTCATGGGGGAAGGCATTCAGGTGGTTCCGCG 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CAGGGTGTTTCCTGGCCTGGAAGACTGAGTCATGGGGGAAGGCATTCAGGTGGTTCCGCG 1320
Query 1429 GAGGCAAACAAGACATCATCATCACATTTACATGCTTCTAAGTCAGTCTCGGTCAAACAA 1488
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1321 GAGGCAAACAAGACATCATCATCACACCTACATGCTTCTAAGTCTGTCTCGGTCAAACAA 1380
Query 1489 CAGGTGGAAAATAACCTGAAATGTGTAGCCACGTCGCCAGGCTCTACAAGATCAGCCCCA 1548
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1381 CAGGTGGAAAACAACCTGAAGTGTGTAGCCACGTCGCCAGGCTCCACAAGATCAGCTCCT 1440
Query 1549 TCTCCGGGATCTGGTGGTACTGTTTCTAAAGATGGACAGCAACGAAATGCTGGGGCTGGT 1608
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1441 TCTCCGGGATCAGGTGGTAATGTTTCTAAAGATGGACAGCAGCGAAATGCTGGGGCTGGT 1500
Query 1609 GGTGTATCTGAAGTCCTAGCTGCAGTAAAGGATGAGAAAAGTAGCAGCTCCAGTCAGTCC 1668
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 GGTGTATCTGAAGTCCTAGCTGCAGTAAAGGATGAGAAAAGTAGCAGCTCCAGTCAGTCG 1560
Query 1669 CACAATAATAGTCAGTCTTGCTCGAGCGAGCATGCTAAAACAGGCAATTTATGTGGGAAA 1728
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1561 CACAATAATAGTCAGTCTTGCTCGAGCGAGCATGCTAAAACAGGCAATTTATGTGGAAAA 1620
Query 1729 GAGGATGCAAGAAGCTCAACTGCTGGTTCAACTTTGAAGAAGTGCTCTGGTGGCTCTTCA 1788
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1621 GAAGATGCAAGAAGCTCTACTGCTGGTTCAACTTTGAAGAAGTGTTCCGGTGGCTCTTCA 1680
Query 1789 AGGCATCGGAAATCAAACAATGTGTTTCAAGGTTCATCTTCGTCAGCATCCCCTAGGGAA 1848
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1681 AGGCATCGGAAGTCAAACAATGTGTTTCAAGGTTCGTCTTCGTCAGCATCCCCTAGGGGA 1740
Query 1849 GCTGGTTTTAGTAGAAGCTTCTCATCGCAAAGGAATGTCCCTTCTGAGAAAATTTCTCAA 1908
|||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GCTGGTTTGAGTAGAAGCTTCTCATCACACAGGAATGTCCCTTCTGAGAAAATTTCTCAA 1800
Query 1909 TCAAGTTTGACATCTGAAAAAACTCTTGAGGTTCCTCTGACTGAGAGTTCCGGTAATAAA 1968
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1801 TCAAGTTTGACATCTGAAAAGACTCTTGAGGTTCCTCTGACTGAGGGTTCCGGTAATAAA 1860
Query 1969 TTGATTGTGAAGCTGCCTAATCGGGGTCGCAGTCCTGCTCAAAGTGTGAGTGGAGGCTCT 2028
||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861 TTGATTGTGAAGCTGCCGAATCGTGGTCGAAGTCCTGCTCAAAGTGTGAGTGGAGGCTCT 1920
Query 2029 TTGGAGGACCCTGCGCCGGTGAATAGCAGAGTTTCTTCACCTGTGCATGCGGTGAAGCAG 2088
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 TTGGAAGACCCTGCACCGGTGAATAGCAGAGTTTCTTCACCTGTGCATGCGGTGAAGCAG 1980
Query 2089 GAACTGTGTGACAATAATGTGAGAGaaaaaaaTCATTCTTATCGAGCTAACGTGAGCTCT 2148
||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1981 GAACTATGTGACAATAACGGGAGAGAAAAAAATCATTCTTATCGACCTAATGTGAGCTCT 2040
Query 2149 GTCTTGAATGCCGATTCTTGGCAAAGCAATGAATTAAAAGATATTTTGACAGGCTCGCAA 2208
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041 GTCTTGAATGCTGAGTCTTGGCAAAGCAATGAATTAAAAGATATTTTGACAGGCTCGCAA 2100
Query 2209 GAGGCAGCTGGTTCACCACTTGTTGTTGCTGGTGATGAGCGCGGAGGGGCTCTTAAAGAT 2268
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2101 GAGGCAGCTGGTTCACCAC---TTGTTGCTGGTGATGAGCGCGGAGGGGATCTTAAGGAT 2157
Query 2269 TCTGATAAAGCAGCTGGGAATGTTAAAGGCACATCTTCCTTAGGAAATGAGATCAAATCT 2328
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2158 TCTGATAAAGCATCTGGGAATGTTAAAGGCACATCTTCCTTAGGAAATGAGTTCAAATCT 2217
Query 2329 GGAGAAAGGCATGGCGGAACACTCAGTTCGATGAATGCTTTGATTGAAAGTTGTGTCAGA 2388
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 GGAGAGAGGCATGGCGGAACACTCAGTTCGATGAATGCTTTGATTGAAAGTTGTGTCAGA 2277
Query 2389 TACTCCGAGACAAATGCGTCTTTGGCTGGTTCGGATGATGTTGGAATGAATCTTCTTGCT 2448
||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 TACTCTGAGACGAATGCCTCTTTGGCTGGTTCGGATGATGTTGGAATGAATCTTCTTGCT 2337
Query 2449 AGCGTTGCTGCTGATGAGATGTCTAAATCGCCTGTTGCATCACCCTCAGTATCTCAGCCT 2508
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2338 AGTGTTGCTGCTGATGAGATGTCTAAATCGCCTGTTGCATCTCCCTCAGTATCTCAGCCT 2397
Query 2509 CCAAATTCCTTGATGAATGAAAATTCTACTGTAGGGAACAATACAAAGCTAATCGCTTCG 2568
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2398 CCAAATTCCGTGATGAATGAAAATTCTACTGTAGGGAACAATACAAAGCTAATGGCTTCG 2457
Query 2569 GATGGCTTGCCTCACGAGCAACATCAAGCTGCTCGCACCACTGTCAGTAATGAGCAAGGT 2628
||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 2458 GATGGCTTGCCTCACGAGCAACATCAAGCTGTTTGTACCTCTGTCAGTACTGAGCAAGGT 2517
Query 2629 GAGCAACATGTTAGCAGTAGTGGCACACAGTTGGAGTCAGAGATAAAAAATGAGTCTAAG 2688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2518 GAGCAACATGTTAGCAGTAGTGGCACACAGTTGGAGTCAGAAATAAAAAATGAATCTAAG 2577
Query 2689 ACCGGAGATCGTGATAAGATCTCGAATTCAGACACCGAAGATCTGCAAAGGTTGGTGGAT 2748
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 ACCGGAGATCGTGATAAGAGCTCGAATTCAGACACTGAAGATCTGCAAAGGTTGGTGGAT 2637
Query 2749 CAGCACCTAGAGAACAATGACAATTCAGATGGTGCCGTTGCTTCGCCTGCTTTGCCCACT 2808
||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2638 CAGTGCTTAGAGAGCAATGACAATTCAGATGGTGTTGTTGCTTCGCCTGCTTTACCCACT 2697
Query 2809 AAAGCCATCAAGGAAAAGATTTTGGATGATAGTGACTCTGGGGAAGTAAAGGATATAAAG 2868
|||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 2698 AAAGCCGTTAAGGAAAAGATTTTGAATGATAGTGACTCTGGGGAACTGAAGGATATAAAG 2757
Query 2869 GCTGATGTTAAATCAGAGGCTGATTGCACATCTGACTCAACAAAAAGACTAGCAAGCTCA 2928
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 2758 ACTGATGTTAAATCAGAGGCTGATTGCACATCTGACTCAACGAAAAGAGTAGCAAGCTCA 2817
Query 2929 ATGCTAACTGAATGTAGAGATGTAAGTCAAAAGGTAGATTCTGTTGCTGTTGAACACACT 2988
|||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2818 ATGCTAACCGAATGTAGAGATGTAAGTAAAAAGGTAGATTCTGTGGCTGTTGAACAGACT 2877
Query 2989 CCTTTGGACCGTG-T--TGATGATAAGAAAGAAGAGAAACCCCCAACGGCGTTGAGTTCT 3045
|| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 CCCTTGGAAGGTGTTGATGATGATAAGAAAGAAGAGAAACCCCCAACGGCGTTGAGTTCT 2937
Query 3046 GAGCTAGTTAAAAAAGTGGAAGAAGATGTACCAGTTTCTTCTGGGATTTCAAGCGG-TAT 3104
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2938 GAGCTAGTTAAAAAAGTGGAAGAAGATGTACCCGTTTCTTCTGGGATTTCAAG-GGATAT 2996
Query 3105 GGATGCAGTAAGCATTGATAGACCTATAACTGAAATGGTCAATAATATAGCGGTTAATCA 3164
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||
Sbjct 2997 GGATGCTGTAAGCATTGGTAGACCTATAACTGAAATGGTCAATAATGTTGCGTTTAATCA 3056
Query 3165 TACAGACCAAAAAGATATAAAGAAGATTAAGCAGGATTGTGATGCCTT-TGTGGGTGCTA 3223
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 3057 TATGGACCAAAAAGATGTAAAGAAGATTAAGCAGGATTGTGAT-ACTTCTGTGGGAGCTA 3115
Query 3224 TAAAGGATGCCTCAGCCAGTTTGGACTCATCTGTAACTAAAGGTAAAGTTGAGCCTGTGG 3283
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 TAAAGGATACCTCAGCCGGTTTGGACTCATCTGTAACTAAAGGTAAAGTTGAGCCTGTGG 3175
Query 3284 AGGGGAATCTAGAAAATATTGAAGTCAAGGAACGGTACTCAGGATTAAAAGCTACTCCAG 3343
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3176 AGGGGAATCTGGAAAATAGTGAAGTCAAGGAACGGTACTCAGGATTAAGAGCTACTCCAG 3235
Query 3344 GAGTATCACCTAAAGATGCAGAGGATCTTAAGAGACCGAATGGGCCTAAAACTAGTGATG 3403
|| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3236 GATTATCACCTAAAGAAGCTGAGGATCTTGAGAGACCGAATGGGCCTAAAACCAGTGATG 3295
Query 3404 CTGATGGAGATGAAGCGGAGGAATGTACGTCTGCTGCCAGAGATGCTTCTTCCGTTTCAG 3463
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3296 CTGATGGAGATGAAGCGGGGGAATGTACGTCTGCTGCCAGAGATGCTTCTTCTGTTTCAG 3355
Query 3464 CTGCAGCTTCAGCTGGCTCTGAGATGGATGCCAGAGTTGAATTTGATCTAAATGAAGGTT 3523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3356 CTGCAGCTTCAGCTGGCTCTGAGATGGATGCCAGAGTTGAATTTGATCTAAATGAAGGTT 3415
Query 3524 TTGATGGAGACGATGCAAAACATGGGGACTCAAATAACTTCTCTGGATCTGTATTTTTGA 3583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 TTGATGGAGACGATGCAAAACATGGGGACTCAAATAACTTCTCTGGATCTGTATTTTTGA 3475
Query 3584 CGCCTACTCCTCTACAACCAGTTAATACCTTGCCTTTTCCTGTGGCTCCTGTATCTAGTG 3643
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3476 CGCCTACTCCTCTACAACCAGTTAAGACCTTACCTTTTCCGGTGGCTCCTGTATCTAGTG 3535
Query 3644 GAATTCCTGCATCCATTACTGTTGCTGCTGCTGCCAAAGGTCCGTTTGTTCCACCCGAAG 3703
||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3536 GAACTCGTGCATCTATTACTGTTGCTGCTGCTGCCAAAGGTCCGTTTGTTCCACCTGAAG 3595
Query 3704 ATCTGTTGAGAAATAAAGGGGCTGTTGGTTGGAGAGGATCTGCTGCCACTAGTGCCTTCC 3763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 ATCTGTTGAGAAATAAAGGGGCTGTTGGTTGGAGAGGATCTGCTGCCACTAGTGCCTTCC 3655
Query 3764 GCCCAGCTGAGCCAAGAAAAGCTCAGGATGTGTTACTGAGCATTAACAATACCTCTACAT 3823
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3656 GCCCAGCTGAGCCAAGAAAACCTCAGGATGTGTTACTGAGCATTAACAACACCTCTACAT 3715
Query 3824 CTGATGCATCTACATCTGCTGGCAAACAGACAAGGACGTTTCTGGATTTTGACTTGAATG 3883
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 CTGATGCATCTACTTCTGCTGGCAAACAGACAAGGACGTTTCTGGATTTTGACTTGAATG 3775
Query 3884 TACCTGACGAGAGAGTCCTTGAAGATTTGGCTTCCCAAAGAACTGGAAATGCCACAAATT 3943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3776 TACCTGACGAGAGAGTCCTTGAAGATTTGGCTTCCCAAAGATCTGGAAATCCCACAAATT 3835
Query 3944 GTACATCTGGTATCACCAATAGTTTTGACCAAGCACGTTCTGGGGTCATGGGTTCCGCGC 4003
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3836 GTACATCTGATATCACCAATAGTTTTGACCAAGTACGTTCTGGGGTCATGGGTTCCGCCC 3895
Query 4004 TTGATCATTCTTCTGGGGGCCTTGATCTTGATCTAAACAAAGTTGATGATTCAACTGATA 4063
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3896 TTGATCATTCTTCTGGAGGCCTTGATCTTGATCTAAACAAAGTTGATGATTCAACTGATA 3955
Query 4064 TGAACAACTACA-ATATGAGCAGTAGTCATCGGCTAGATTCATCTTTTCAGCACGTTAAA 4122
||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3956 TGATCAGCTACACA-ATGAACAGTAGTCATCGGCTAGATTCATCTTTTCAGCAGGTTAAA 4014
Query 4123 TTATCATCGACTGGTGGTCGTAGAGATTTTGATTTAAATGATGGACCTGCGGGTGATGAT 4182
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4015 TTACCATCGACTGGTGGTCGTAGAGATTTTGATTTAAATGATGGACCTGTGGGTGATGAT 4074
Query 4183 GCGGCTGTTGAGCCATCTATGGTTCTAAATCAACATTCACGAAGTGGCTTGCCCTCACAA 4242
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4075 GCAGCTGTTGAGCCATCTATGGTTCTAAATCAACATTCACGAAGTGGCTTGCCATCACAA 4134
Query 4243 CCATCTCTCTCTGGAATACGAGTGAATGGCGAAAACATGGCTAGTTTCTCAACTTGGTTT 4302
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4135 CCATCTCTCTCTGGAATTCGAGTGAATGGCGAAAACATGGCTAGTTTCTCAACTTGGTTT 4194
Query 4303 CCTGCTGCTAACGCTTATTCAGCAGTGAGCATTCCTCCAATTATGCCTGAGAGAGGTGAT 4362
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4195 CCTGCTGCTAACGCTTATTCAGCTGTGAGCATGCCTCCAATTATGCCTGAGAGAGGTGAT 4254
Query 4363 CAGCCTTTTCCAATGATTGCCAATCGTGGACCACAGAGAATGTTGGGTCCAACAACTGGT 4422
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4255 CAGCCTTTTCCAATGATTGCCACTCGTGGCCCACAGAGAATGTTGGGTCCAACAACTGGT 4314
Query 4423 GTTTCCTCATTTGCCCCTGAAGGGTACAGGGGTCCGGTTTTGTCGTCGTCTCCTGCCATG 4482
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4315 GTTTCCTCATTTACCCCTGAAGGGTACAGGGGTCCTGTTTTGTCGTCGTCTCCAGCCATG 4374
Query 4483 CCATTTCAGTCCACAACGTTCCAGTATCCTGTCTTTCCTTTTGGAAACAGCTTCCCCATT 4542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4375 CCATTTCAGTCCACAACGTTCCAGTATCCTGTCTTTCCTTTTGGAAACAGCTTCCCCGTT 4434
Query 4543 ACCTCAGCGAATTTCTCTGGTGCTTCTACAACACACATGGATTCTTCTTCAAGTGGGAGA 4602
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4435 ACCTCAGCGAATTTCCCTGGTGCTTCTACAGCACACATGGATTCTTCTTCAAGCGGGAGA 4494
Query 4603 GCTTGCTTCCCCGGTGTGAACTCTCAAATATTGGGTCCTGGAGTACCAGTTCCGTCTAAT 4662
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4495 GCTTGCTTCCCCGGTGTCAACTCTCAAATATTGGGTCCTGGAGTTCCAGTTCCGTCTAAT 4554
Query 4663 TACCCAAGACCTTATATCGTTGGCCTCCCAAATGGTGGTAGCAATGGTGGAGTTTTGGAC 4722
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 4555 TACCCAAGACCTTATATAGTTGGCCTCCCAAACGGTGGTAGCAATGGCGGTGTTTTGGAC 4614
Query 4723 AATAGTGCGAAATGGTTTAGGTCAGGACTTGACTTAAATTCTGGTCCTGGAGGTCATGAA 4782
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4615 AATGGCGCGAAATGGTTTAGGTCAGGACTTGACTTAAATTCTGGTCCTGGAGGTCATGAA 4674
Query 4783 ACGGAGGGAAGAGACGAATCAACACTTGTGGCAAGGCAATTATCCTCATCTGCTTCCTTA 4842
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4675 ACAGAGGGAAGAGACGAATCAACACTTGTGGCAAGGCAATTATCCTCATCTGCTTCCTTA 4734
Query 4843 CCGTTGAAGGAGGATCAAGCAAGAATGTATCAAATGTCAGGTGGTGTTCTGAAGAGGAAA 4902
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4735 CCTTTGAAGGAGGATCAAGCAAGAATGTATCAAATGTCAGGTGGTGTTCTGAAGAGGAAA 4794
Query 4903 GAACCGGAAGGTGGATGGGATGGATATAGGCAATCCTCATGGCAATAACA 4952
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4795 GAACCGGAAGGAGGATGGGATGGATATAGGCAGTCCTCATGGCAATAACA 4844
Score = 158 bits (85), Expect = 7e-37
Identities = 98/104 (94%), Gaps = 1/104 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4955 AACACA-TTTTTGGTCATTTTTCATGCATGTGTGTATCTCTATACACCGGCACAAAAGAC 5013
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 5153 AACACACTTTTAGGTCATTTTTCATGCATGTGTGTATCTCTATACACCGGCTCAAAAAAC 5212
Query 5014 TAGAGATAAAACGAATGTTGGTGGCTTTTGAGTGTGTTCAAAAT 5057
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5213 TAGCGATAAAACAAATGTTGGTGGCTTTTGAGTGTGTTCAAAAT 5256
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 252339723290
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5