BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg485317

Length=3612
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT3G49600.1 | Symbols: UBP26, SUP32, ATUBP26 | ubiquitin-specif...  3947    0.0  


> AT3G49600.1 | Symbols: UBP26, SUP32, ATUBP26 | ubiquitin-specific 
protease 26 | chr3:18380549-18387128 REVERSE LENGTH=3719
Length=3719

 Score = 3947 bits (2137),  Expect = 0.0
 Identities = 2386/2500 (95%), Gaps = 41/2500 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1129  AGTCTTCTCAAAACAAGTTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAATCCACAAAGGAAGCG  1188
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1205  AGTCTTCTCAAAACAAATTGACATACGATCTCTCTGCTGTGTTAATCCACAAAGGAAGCG  1264

Query  1189  CTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGACTGGCTTGTGGTGGG  1248
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1265  CTGTTAACAGCGGACATTATGTTGCTCACATAAAAGATGAAAAGACTGGCTTGTGGTGGG  1324

Query  1249  AATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAACGTCCAT-TCAATGAAGCTTCTTCT  1307
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  1325  AATTTGATGATGAACATGTGTCAGAACTGGGTAAACGTCCATGT-AATGAAGCTTCTTCT  1383

Query  1308  TCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACGGCTAGTAGTGAGAATATCACAGATGTCATT  1367
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct  1384  TCAACTCCACAATCTGAGAGTAATGGTACGGCTAGTAGTGGGAATATCACAGATGGCATT  1443

Query  1368  CAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTTTCTCATCCAGTGAT  1427
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1444  CAATCAGGCTCTTCAGACTGTAGGTCTGCTATTAAGTCAGAGGTTTTCTCATCCAGTGAT  1503

Query  1428  GCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATCAGGAAGGACAGAAA  1487
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1504  GCTTATATGCTGATGTATAGTCTTAGATGCGATAAACAGGAAAATCAGGAAGGACAAAAA  1563

Query  1488  GAAAATCCTATTGACA-TATCTAAAGGAGAAGTTGATAGTGTTCAACAGCTTAAAGGTGG  1546
             |||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||      ||||||||||||||||
Sbjct  1564  GAAAATCCTATTGACATTA-CTAAAGGAGAAG-T--TA------AACAGCTTAAAGGTGG  1613

Query  1547  TTATCTTCCGTTACATCTTTATGAATGGATCAATAATATGAATGCAGTATTCCTTGAGAG  1606
             |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1614  TTATCTTCCAAAACATCTTTCTGAATGGATCAATAACATGAATGCAGTATTCCTTGAGAG  1673

Query  1607  TTGCAAGCAATATGATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAGTGCTTTGACTGAAAGGAGGCA  1666
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1674  TTGCAAGCAATATAATTTAAGAAAGGAAAAAGAATTGAATGCTTTGACTGAAAGGAGGCA  1733

Query  1667  AGAAGTACGGACTATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAAGAACAATATTTTTG  1726
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1734  AGAAGTACGGACAATCCTTTCAGAAGCTGCTGTTCAGTCACTTGAAGAACAATATTTTTG  1793

Query  1727  GATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTGCCTCCCGCTTTGGACAA  1786
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1794  GATCTCCACAGATTGGCTTCGTCTATGGGCTGATACCACTTTACCTCCCGCTTTGGACAA  1853

Query  1787  CACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCTTGCCTCAAAAGTGAATTGCATGAAGCG  1846
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1854  CACCCCTTTACTGTGTTCCCATGGGAAAGTTCATGCCTCAAAAGTGAATTGCATGAAGCG  1913

Query  1847  GATATCTGAACTTGCATGGACCAAATTAGAATCAAAGTTCAATGGTGGACCAAAGTTAGG  1906
             |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1914  GATATCTGAACTTGCATGGATCAAGTTAGAATCAAAGTTCAATGGCGGACCAAAGTTAGG  1973

Query  1907  GAAAGGGGACTACTGCAGGGACTGCCTTATGGATGGTGCTCGCATGGTTGTGTCTTCTGA  1966
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1974  GAAAGGGGACTACTGCAGGGACTGCCTTATGGATGGTGCTCGCATGGTTGTGTCTTCTGA  2033

Query  1967  CAGTTATAGGGATCGAAGAACTTTCATGAAAAGCATAGCAAATGATGTTCTTTCGGGAAA  2026
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2034  CAGTTATAGGGATCGAAGAACATTCATGAAAAGCATAGCAAATGATGTTCTTTCGGGAAA  2093

Query  2027  GTGTGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTGCAGCAATGGATAAAAAGGAA  2086
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2094  GTGCGAGGACGGAATGTATTATATCTCTAGAGCATGGTTACAGCAATGGATAAAAAGGAA  2153

Query  2087  AAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGCTATTACGTGCAATCA  2146
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2154  AAATCTTGATGCTCCTACTGAAGCAGATGCGGGGCCCACAAATGCTATTACGTGCAATCA  2213

Query  2147  TGGAGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAATTGTAGTTCCAGAGAATTT  2206
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2214  TGGTGAGCTGATGCCAGAGCAAGCACCAGGGGCCAAAAGAGTTGTAGTTCCAGAGAATTT  2273

Query  2207  CTGGTCATTCCTTGTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGCCAGAAGATGCTTCGGATTGTAC  2266
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||
Sbjct  2274  CTGGTCATTCCTTTTTGAAGATGCTCTAAAAGTGATGTCAGAAGATACTTTGGATTGTAC  2333

Query  2267  TTGTTTCCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGAACTTTCTGAGGTTGC  2326
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2334  TTGTTTTCCTGTGGACTCCAGCCAATGTTGTCATTGCACAGAGGTACTTTCTGAGGTTGC  2393

Query  2327  ATGCCTT-GAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCCAAAATCACGAGAAGT  2385
             ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2394  ATG-CTTCGAGGATTCACTAAGAACATTGAAGGTCAAGCAGCGCCAAAATCACGAGAAGT  2452

Query  2386  TAGCCACAGGAAAGAATATACCCTTAACGCCACAAAGCCGATATTTCTTGTTGCCTTCTC  2445
             ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2453  TAGCCACGGGAAAGGGTATACCATTAACGCCACAAAGCCGATATTTCTTGTTGCCTTCTC  2512

Query  2446  CGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAAATAGTTCTTCAGCAC  2505
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2513  CGTGGCTAGTGCAATGGAGAATCTATATTAACATGACTGGAAAAAATAGTTCTTCAGCAC  2572

Query  2506  CAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCAAAAAGCACACACGAC  2565
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2573  CAGAGCCTGAACGTCTTGATGGAGTCATTAATACTCTCAAATGCAAAAAGCATACACGAC  2632

Query  2566  TCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTTGTATTTTCAGAAAAATCCAT  2625
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2633  TCCTTGAAAGGCTCCCTGAACTTGTCTGCAGACGTGGCTCGTATTTTCAGAAAAATCCAT  2692

Query  2626  CTACAGACAAGCTGACAATCATCCCTGAGATTGATTGGAAATATTTCTGTGAGGAGTGGG  2685
             ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2693  CTACAGACAAGCTAACAATCATCCCTGAGCTTGATTGGAAATATTTCTGTGACGAGTGGG  2752

Query  2686  GAGGGCTCATGGAGAATGGAATATCTGCTCTTATTGAGGTTGGTAACAATACAGACCAAA  2745
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||
Sbjct  2753  GAGGGCTCATGGAGAATGGAATATCTGCTTTTATTGAGGTTGG---CAATACAGACCAAA  2809

Query  2746  GTTCATCCCCAGACATCATTGACCTTGAGAAGCATTCTTCTCCGGATGATAATATGGAGG  2805
             |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2810  GTTCATCCCCAGACGTCATTGACCTTGAGAAGGATTCTTCTCCGGATGATAATATGGACG  2869

Query  2806  TTGATGCTCAGCAGCTTATTCTCAGGGCATCCCCAGAGATTTGCGAGGAATGCATAGGAG  2865
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2870  TTGATGCTCAACAGCTTATTCTCAGGGCATCCCCAGAGATTTGCGAGGAATGCATAGGAG  2929

Query  2866  ACAGAGAAAGCTGTGAGTTGATGCAGAAACTTAGTTACTCTGAGGGAGATGTATTTGTCT  2925
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2930  AGAGAGAAAGCTGTGAGTTGATGCAGAAACTTAGTTACTCTGAGGGAGATGTATTTGTCT  2989

Query  2926  GTCTTGTGCGTGGAAAGGAAGCTCCAAAAGCAATGTTAGAGGCATCTGACTCTAGCTTTG  2985
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2990  GTTTTGTGCGTGGAAAGGAAGCTCCAAAAGCAATGTTAGAGGCATCTGACTCTAGCTTTG  3049

Query  2986  AGGTGGATCGGCGTACTTCAAAGCGATCTCGGAGGACAAATTATGGAAACCTGACAAGTC  3045
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3050  AGGTGGATCGGCGTACTTCAAAGCGATCTCGGAGAACAAATTATGGAAACCTGACAAGCC  3109

Query  3046  TGAAAGTGTCAGCGACAACGACTGTGTACCAATTAAAGATGATGATATGGGAGTTACTTG  3105
             |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3110  TGAAAGTGTCTGCGACAACGACTGTATACCAATTAAAGATGATGATATGGGAATTACTTG  3169

Query  3106  GGGTGATGAAGGAAAACCAAGAACTTCACAAAGGCACAAAAGTTATTGATCAGGAATCTG  3165
             ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  3170  GGGTGATGAAGGAAAACCAGGAACTCCACAAAGGCTCAAAAGTGATTGATCAGGAATCTG  3229

Query  3166  CTACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCTGGCGACAAGCTTTGGGTGAGAGATACCGAGA  3225
             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3230  CAACCCTTGCAGACATGAACATATTCCCCGGCGACAGGCTTTGGGTGAGAGATACAGAGA  3289

Query  3226  TGCATGAACACCGTGATATTGCTGATGAGTTATGCGAAAAGAAAACGGGGGCTCAAGATA  3285
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3290  TGCATGAACACCGCGATATTGCTGATGAGTTATGTGAAAAGAAACCGGGGGCTCAAGATA  3349

Query  3286  TCGAAGAAGGGTTTCGAGGGACGCTATTGACTGGGGATATCTCTTCTGAAGCCTGCTAGA  3345
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3350  TCGAAGAAGGGTTTCGAGGGACGCTATTGACTGGGAATATCTCTTCTGAAGCCTGCTAGA  3409

Query  3346  AATTGTAT-TTTGAGATCAGAGTGTAAAAACAAAATGCGTGAGAA---AGA--G--TCAT  3397
             |||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||  |  ||||
Sbjct  3410  AATTGTAACTTTGTGATCAAAGTGTAAAAACAGAATGCGTGAGAACTGAGAAAGAGTCAT  3469

Query  3398  TGGCGGATCATCTAGAG---TAGTTGTGCAGGAGACGGATGACACATTTTTTGGGTCAGT  3454
             |||   | |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3470  TGG---ACCATCTAGAGGAGTAGTTGTGCAGGAGACGGACGACACATTTTTTGGGTCAGT  3526

Query  3455  TTTTT-GTAAAGGCAGGCAAGGCAAGGCTTTGGAGCTTCATTTTGTGTAAAAAACAAACG  3513
             ||||| |||||||||||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3527  TTTTTTGTAAAGGCAGGCAAGGC-----TTTGGAGCTTTATTTTGTGTAAAAAACAAACG  3581

Query  3514  CTATGATTTGGA-ACAAGCTTTTGCACAAGCTGAATTTGTGTAGATTCAAAGGCTTATTG  3572
             | | |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  3582  CAAAGATTTGGAGA-AAGCTTA-GCACAAGCTGAATTTGTGTAGATGCAAAGGCTTATTG  3639

Query  3573  TGGATGGCTATTTGAAGCTGACTTTTGTGTGTGTATTTTT  3612
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  3640  TGGATGGCTATTTGAAGCTGACTTTTGTGTGTGTGTTTTT  3679


 Score = 1770 bits (958),  Expect = 0.0
 Identities = 1078/1134 (95%), Gaps = 15/1134 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     aaaaaaaaaagtgaaatagaattaagaa--aaaaaaaaaaaaaaaTTCGCTGTGGagaag  58
             ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  9     AAAAAAAAAGGTGAAATAGAATTAACAAGGAAAAAAAAAAAAGATTTCGCTGTGGAGAAG  68

Query  59    aagaagacgaaggagttgaagaagaaagaagacggagaagCTTGAGCTTGTGAAGCTCTC  118
             ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  69    AAGAAGACGAAGGAG-T-AA-AAG-AAGAAGACGGAGAAGTTTGAGCTTGTGAAGCTCTC  124

Query  119   TCTACTTGCTAAACTGGTTC-TTGTAGATTCTCAGGTTAGGGTTTTCGATTGTTACTGGG  177
             |||||||||||||||  ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||
Sbjct  125   TCTACTTGCTAAACT-TTTCTTTGTAGATTCTC---TCAGGGTTTTCGATTGTTACTGGG  180

Query  178   GAAATTT-TGTTGGTGGTGACACAATGAGTAGACCTAACACCCGAAACAAGAACAAAAGG  236
             ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || 
Sbjct  181   GAAATTTCTGGTGGTGGTGACACAATGAGTAGACCTAACACCCGAAACAAAAACAAGAGA  240

Query  237   CAAAGACCAGACGCTGTTGATTCTTCTTCTCAGATTCTCCGGAAAATTCACGAGGCTAAT  296
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241   CAAAGACCAGACGCTGTTGATTCTTCTTCTCAGATTCTCCGGAAAATTCACGAGGCTAAT  300

Query  297   GATGTAACTGATGATGACATAAACCAACTTTTCATGATATGGAAGCCAGTTTGTCAAGGC  356
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
Sbjct  301   GATGTAACTGATGATGACATTAACCAACTTTTCATGATTTGGAAGCCAGTTTGTCAAGGT  360

Query  357   TGTCGTGTAAACTCTCGTGACAATCCTAACTGCTTTTGTGGGTTGGTTCCACCGGTTAAT  416
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct  361   TGTCGTGTAAACACTCGTGACAATCCTAACTGCTTTTGTGGCTTGGTTCCACCGCTTAAT  420

Query  417   GGAAGCCGGAAATCGGGTTTGTGGCAGAAAACGTCTGAAATTATTTTGTCTCTAGGTCCA  476
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||
Sbjct  421   GGAAGCCGGAAATCTGGTTTGTGGCAGAAAACGTCGGAGATTATTCAGTCTCTTGGTCCA  480

Query  477   GATCCGACCTTGGACCGTCGTGATTCTGACTCTACACCGGCTGGTCTGACCAATTTGGGT  536
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct  481   GATCCGACCTTGGACCGTCGTGATTCTGAATCTACACCCGCTGGTCTGACTAATTTGGGT  540

Query  537   GCTACTTGTTATGCCAACAGTATACTTCAGTGTTTGTACATGAATACTGCTTTTCGAGAA  596
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  541   GCTACTTGTTATGCCAACAGTATACTTCAGTGTTTGTACATGAATACTGCTTTCCGAGAA  600

Query  597   GGAGTTTTTTCTGTTGAGGTTGATGTCTTGAAGCAGTATCCAGTTTTGGATCAGATTGCT  656
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
Sbjct  601   GGAGTTTTTTCTGTTGAGGTTCATGTCTTGAAGCAGAATCCAGTCTTGGATCAGATTGCT  660

Query  657   CGGCTTTTTGCACAGTTGCATGCTAGCAAAAAGTCTTTTGTTGATTCAGATGCTTTTGTC  716
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  661   CGGCTTTTTGCACAGTTGCATGCTAGCCAAAAGTCCTTTGTTGATTCTGATGCTTTTGTC  720

Query  717   AAGACGTTGGAGTTGGATAATGGGGTTCAACAGGATACCCATGAGTTCTTGACATTGCTT  776
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   AAGACGTTGGAGTTGGATAATGGGGTTCAACAGGATACCCATGAGTTCTTGACATTGCTT  780

Query  777   CTGTCCTTGCTTGAGCGTTGCTTACGCCATTCTGGAGTTTACAAAGCCAAAACAATAGTT  836
             || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||
Sbjct  781   CTTTCCTTGCTTGAGCGTTGCTTACTCCATTCTGGAG--T-CAAAGCCAAAACAATAGTT  837

Query  837   CAAGATCTCTTCAGTGGTAGTGTCTCGCATGTGACCACGTGCTCAAAATGTGGGAGGGAT  896
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838   CAAGATCTCTTCAGTGGTAGTGTCTCGCATGTCACCACGTGCTCAAAATGTGGGAGGGAT  897

Query  897   TCCGAAGCCTCGTCAAAGGTGGAGGATTTCTATGCCCTTGAGTTGAATGTTAAGGGCCTC  956
             |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898   TCCGAAGCTTCGTCAAAGATGGAGGATTTTTATGCCCTTGAGTTGAATGTTAAGGGCCTC  957

Query  957   AAAACTTTGGATGCTAGTTTGAATGATTACCTTAGCTTGGAGCAGCTTAATGGCGATAAT  1016
             ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958   AAATCGTTGGATGCTAGTTTGAATGATTACCTTAGCTTGGAGCAGCTTAATGGCGATAAT  1017

Query  1017  CAATATTTTTGTGGAAGCTGCAATGCTAGAGTAGATGCCACACGCTGCATTAAGCTGCGC  1076
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1018  CAATATTTTTGTGGAAGCTGCAATGCTAGAGTAGATGCCACACGCTGCATTAAGCTGCGC  1077

Query  1077  ACACTACCTCCGGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAAG  1130
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1078  ACACTACCTCCGGTTATCACTTTTCAGCTCAAACGATGCATTTTCCTTCCTAAG  1131



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 179848490655


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5