BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485388
Length=7106
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G50370.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecu... 1.098e+04 0.0
> AT3G50370.1 | Symbols: | unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function
unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown;
LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 26
plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; Has
27734 Blast hits to 16708 proteins in 1259 species: Archae -
81; Bacteria - 3434; Metazoa - 10876; Fungi - 2514; Plants
- 987; Viruses - 212; Other Eukaryotes - 9630 (source: NCBI
BLink). | chr3:18676059-18684346 REVERSE LENGTH=7163
Length=7163
Score = 1.098e+04 bits (5945), Expect = 0.0
Identities = 6758/7138 (95%), Gaps = 106/7138 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 4 TTTT-CCGACGATTCGTTCCCTCGCGCTTCGTCGTCTGACATCAGCGCACGTTAGCCACC 62
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 TTTTCCCGACGATTCGTTCCCTCGCGCTTCGTCGTCTGACATCAGCGCACGTTAGCCACC 71
Query 63 GTCGTCGATATCATACGCCCACCACCGCCGGAGGTAATCTTATTCGTGTATTGA--TTCC 120
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||
Sbjct 72 GTCGTCGATATCATACGCCCACCACCGCCGTAGGGGA---GATTCTTGGATTGATTTTCC 128
Query 121 A-ATTTTGATCAATTCGTCACTGTAGTAGATCTGA-G---------GC--A-AAATTTGA 166
| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||
Sbjct 129 AGTTTTTGATCAATTCGTCACTCTAGTAGATCTGAGGCAATACACTGCGAACAAATTTGA 188
Query 167 CT-GG-G-AGAACCAGATCTAGGTTTAGGGTTTGATGCGTTGGCGATGTTCAGTGATCGG 223
|| || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 189 CTGGGAGAAGAATCAGATCTAGGTTTAAGGTTTGATGCGTTGGGGATGTTCAGTGACCGG 248
Query 224 CGGAAGCGGGATATGGCTAATCATGGAGATGGAAACAAGTACGCGTCTGTGAATCTGAAT 283
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 249 CGGAAGCGGGAAATGGCTAATCATGGAGATGGAAACAAGTACGCGTCTGTGAATCTGAAT 308
Query 284 AAGTCTTATGGATATCAATCTCATCATCAGTATAATCAATCTGGAGGTTATGGGCGGGGG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 309 AAGTCTTATGGATATCAATCTCATCATCAGTATAATCAATCTGGAGGTTATGGGCGGGGG 368
Query 344 AGAGGAGGTGGTGGATATGGCGGTGAAGCTATCTGTTCCACCCCCCTTGA-ACCT-TCCT 401
||||||||||||||||||||||||| ||| | || | | |||| | | | |
Sbjct 369 AGAGGAGGTGGTGGATATGGCGGTGGAGC-A--TG----A-GCGAGTTGATTCGTCTGGT 420
Query 402 TC-ACTCCCTTTCATTCCGGTGGAGGAATCGCTGGGAGTGGAACGAGACCTGCTTCATCT 460
|| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 421 TCGAGT---TTTCATTCCGGTGGAGGGATCGCTGGGAGTGGAACTAGACCTGCTTCATCT 477
Query 461 GGTATGGGGTGGAGTAAGCCTGCTGCTACAGCTACTGATGGTGATATTGCTAACCATACT 520
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 478 GGTATTGGGTGGAGTAAGCCTGCTGCTACAGCTACTGATGGTGATATTGGTAACCATACT 537
Query 521 GCTGAAGGTGTTACCGGGGGGAGTAATGGGTTGAATACGTCTCTTACTTCTCGGGTTGGT 580
| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 538 GGTGAAGGTGTTACTAGGGGGAGTAATGGGTTGAATACGTCTCTTGCTTCTCGGGTTGGT 597
Query 581 GCAGCTGAGCCTATGGAGCGGGCTTTTCAGCATGTAGAGAAAGTTGCAACTTTGAGGGGT 640
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 598 GCAGCTGAGCCTATGGAACGGGCTTTTCATCATGTAGAGAAAGTGGCAACTTTGAGGGGT 657
Query 641 GAAGATTTTCCGTCCCTTAAGGCTTCTTTGCCTTCAGCTTCTGTGTCTGGGCAGAAACAG 700
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 GAAGATTTTCCGTCCCTAAAGGCTTCTTTGCCTTCAGCTTCTGTGTCTGGGCAGAAACAG 717
Query 701 AAGGAGGGTTTGAATCAGAAGCAGAAGCAAGCTGCAAGTGAAGAATTTTCAAAAGAGCCG 760
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||
Sbjct 718 AAAGAGGGTCTGAATCAGAAGCAGAAGCAAGCTGCAGGTGAGGATTTTTCAAAAGAGCCG 777
Query 761 AGAGGTGTCTCTGGTATGAGCAGTTCGCTTGTAGATATGAGACCTCAAAACCAGTCTGGG 820
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 778 AGAGGTGTCTCTGGTATGAGCAGTTCACTTGTAGATATGAGACCCCAAAACCAGTCTGGG 837
Query 821 CGTAGCCGGCTCGGTAATGAGCTCGGCGAGAGTCCTAGTTTCTCAGATGGATTACATTCA 880
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 838 CGTAGCCGGCTTGGTAATGAGCTCAGCGAGAGTCCTAGTTTCTCTGATGGATTACATTCA 897
Query 881 TCTGAACAGGTGAGGAAAAGGGAGTATTTTCCAGGGCCACTGCCTCTTGTTCGTTTGGCC 940
|||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 TCTGAACATGTGAGGAAAAAGGAGTATTTTGCAGGGCCACTGCCTCTTGTTCGTTTGGCC 957
Query 941 CCACGATCTGATTGGGCTGATGATGAGCGTGACACTAGTCATGGCTTAAGAGATCGGGAC 1000
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 CCACGATCTGATTGGGCTGATGATGAACGTGATACTAGTCATGGCTTAAGAGATCGGGAC 1017
Query 1001 AGGGATCATGGCTATTCAAAGAATGAACCATTTTGGGATAGGGGTTTCGATCATCCGAGG 1060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||
Sbjct 1018 AGGGATCATGGCTATTCAAAGAATGAACCATTTTGGGATAGGGGTTTTGATC-T--GAGG 1074
Query 1061 CCTCATGTCCTACCCCAGAAGCATACTGCTCCTAGTCTTTTTGATAAACCAGGACAGCGT 1120
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1075 CCTCATGTCCTGCCCCAGAAGCATGCTGCTTCTAATGTTTTTGACAAACCAGGACAGCGT 1134
Query 1121 GAAAACGAAATTGCAAAGTCCTCTTTGACTCAAGTAAGACCACTCAGTGGAGGAGGAAGG 1180
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1135 GAAAATGAAATTGCAAAGTCCTCTTTGACTCAAGTAAGACCTGTCAGTGGAGGAGGAAGG 1194
Query 1181 GAGGCCAACGCTTGGAGAGTCTCCCCACCACTCCAAAATGAAGGTGCAAATAATAATAAA 1240
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1195 GAGGCCAACGCTTGGAGAGTCTCCTCACCACTCCAAAATGAAGGTGCAAATCATAAT--- 1251
Query 1241 AATGTTTATGGAGCAAGGCCGTCTAGTCGGGGCAGAGAAACTACTAAGAAAAGTAATTAC 1300
|| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||
Sbjct 1252 AA---TTATGGAGCAAGGCCCTCTAGTAGGGGCAGAGAAGCTGCTAAGAAAAGTAACTAC 1308
Query 1301 GTCTTGTCATCATCAAGGGAAAATGTTTGGAATAATAGTGGAGCTAGAGAGGCTCCATAT 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GTCTTGTCATCATCAAGGGAAAATGTTTGGAATAATAGTGGAGCTAGAGAGGCTCCATAT 1368
Query 1361 CAGCATGGAGGAAGACAGCCATGGAATAATAATATGGATAGTTCCAGCAACAGGGGAACT 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369 CAGCATGGAGGAAGACAGCCATGGAATAATAATATGGATAGTTCCAGCAACAGGGGAACT 1428
Query 1421 TATAATCGGGATGGGTATGGAATTGAACATCAGAATAGGGACAAACGC-CCATTCTTCAA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||
Sbjct 1429 TATAATCGGGATGGGTATGGAATTGAACATCAGAATAGGGATAAACGCTCC-TTCTTCAA 1487
Query 1480 GAGTGACAAACCTCATGTGGAAGATCCTTTTATGAAAGACTTTGGTGACTCTGGTTTTGA 1539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GAGTGACAAACCTCATGTGGAAGATCCTTTTATGAAAGACTTTGGTGACTCTGGTTTTGA 1547
Query 1540 TGTCCATGATCCATTCCCAGTACTTGGTGTTGCTAAAAAGAAGAAAGAGGCTTTAAAGCA 1599
||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TGTTCATGATCCATTCCCAGTACTTGGTGTTACTAAGAAGAAGAAAGAGGCTTTAAAGCA 1607
Query 1600 AACAGAGTTTCACGATCCTGTCAGGGAATCATTTGAGGCTGAACTTGAGCGAGTTCAAAA 1659
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1608 AACAGAGTTTCATGATCCTGTCAGGGAGTCATTTGAGGCTGAACTTGAGAGAGTTCAAAA 1667
Query 1660 GATGCAGGAAGAGGAACGCCGGCGGATCATCGAGGAACAGGAAAGGGTGATAGAACTAGC 1719
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 GATGCAGGAAGAGGAACGCCGGCGGATTATTGAGGAACAGGAAAGGGTGATAGAACTAGC 1727
Query 1720 TCGAACAGAAGAAGAAGAGAGACTACGGCTGGCTCGCGAACAAGATGAGCGGCATAGAAG 1779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1728 TCGAACAGAAGAAGAAGAGAGACTACGGCTGGCTCGTGAACAAGATGAGCGGCAGAGAAG 1787
Query 1780 ATTAGAAGAAGAGGCCAGAGAAGCTGCTTTCAGAAACGAGCAGGAGAGACTAGAGGCTAC 1839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 ATTAGAAGAAGAGGCCAGAGAAGCTGCTTTCAGAAACGAGCAGGAGAGACTAGAGGCTAC 1847
Query 1840 AAGGAGGGCAGAAGAGTTGAGAAAGTCAAAAGAAGAGGAGAAACATAGGTTGTTCATGGA 1899
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 AAGGAGGGCAGAAGAGTTGAGGAAGTCAAAAGAAGAGGAGAAACATAGGTTGTTCATGGA 1907
Query 1900 AGAAGAAAGGAGGAAGCAGGCTGCTAAGCAAAAGCTTCTAGAGTTGGAAGAAAAGATTTC 1959
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908 AGAAGAAAGGAGGAAGCAAGCTGCTAAGCAAAAGCTTCTAGAGTTGGAAGAAAAGATTTC 1967
Query 1960 CAGGAGACAGGCTGAAGCTGCCAAAGGTTGCAGCAGCTCTTCAACTATTTCAGAGGAGAA 2019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1968 CAGGAGACAGGCTGAAGCTGCCAAAGGTTGCAGCAGCTCTTCAACTATTTCAGAGGATAA 2027
Query 2020 ATTCTTAGATATTGGTAAAGAAAAAGAATCTGCAGATGTTGTTGACTGGGAAGACAGCGA 2079
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2028 ATTCTTAGATATTGTTAAAGAAAAAGACTCTGCAGATGTTGTTGATTGGGAAGACAGCGA 2087
Query 2080 AAGAATGGTGGATAGAATTACTACCTCATCAAATTTAGATCTATCAGTACCCATTAGATC 2139
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2088 AAGAATGGTGGATAGAATTACTACGTCATCAACTTTAGATCTATCAGTACCCATGAGATC 2147
Query 2140 ATTTGAGAGCAGTGCAACGTCTCAATTTTCTAGAGATGGTTCTTTTGGGTTCCCTGGTAG 2199
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2148 ATTTGAGAGCAATGCCACGTCTCAATTTTCTAGGGATGGTTCTTTTGGGTTCCCTGATAG 2207
Query 2200 ACAAAAGCCTACTTGGAGAAAGGAAGATATTGAGAGTGGAAGCAATTCGAGGTTTATTCC 2259
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2208 ACAAAAGCCTACGTGGAGAAAGGAAGATATTGAGAGTGGAAGCAATTCAAGGTTTATTCC 2267
Query 2260 ACAAAATATGGAGAATGTTCCACCTAGCCCGCAGGAAGAATTCTTTGGAACAGCTGGATA 2319
||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2268 ACAAAATTTGGAGAATGTTCCACATAGCCCACAGGAAGAATTCTTTGGGACAGCTGGATA 2327
Query 2320 TCTCAGTGCCCCTTCCTACTTCAAACCAGGGTTCCCAGAGCATTCAGTTGATCAGAGTTG 2379
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2328 TCTCAGTGCCCCTTCCTACTTCAAACCAGGATTCCCGGAGCATTCAATTGATCAGAGTTG 2387
Query 2380 GAGAATTCCTGGAGATGGAAGGACCCATGGTAGGAACTATGGAATGGAATCTGAATCTCG 2439
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 GAGAATTCCTGGAGATGGAAGGACGCATGGTAGGAACTATGGAATGGAATCTGAATCTCG 2447
Query 2440 TGAAAATTTTGGAGAGCAATATGGTGATCCTGGATGGGGACAAAGCCAGGGCCGTCCACG 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 2448 TGAAAATTTTGGAGAGCAATATGGTGATCCTGGATGGGGGCAAAGCCAGGGCCGTCCTCG 2507
Query 2500 GCATGGTCCATATTCTCCTTATCCTGAAAAGTTGTATCAGAATCCCGAGGGGGATGACTA 2559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 TCATGGTCCATATTCTCCTTATCCTGAAAAGTTGTATCAGAATCCCGAGGGGGATGACTA 2567
Query 2560 TTACCCTTTTGGAAGATCAAGGTATTCAGTAAGGCAGCCGCGTGTTCTTCCCCCTCCCCA 2619
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 TTACCCTTTTGGAAGACCAAGATATTCAGTAAGGCAGCCACGTGTTCTTCCCCCTCCCCA 2627
Query 2620 GGAGTCTAGGCAAAAGGCATCCTTTAGAAGCGAGGTTGAGCATCCTGGTCCCTCAACTTC 2679
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2628 GGAGTCTAGGCAAAAGACTTCCTTTAGAAGCGAGGTTGAGCATCCTGGTCCCTCAACGTC 2687
Query 2680 TATTGGAGGGATTAACTACAGCCATAAAGGTAGGACTAATTCGACTGTTCTAGCCAATTA 2739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2688 TATTGGAGGGATTAACTACAGCCATAAAGGTAGGACTAATTCGACTGTTCTAGCCAATTA 2747
Query 2740 TATAGAGGATCTTCAAGATCATCATGTGCTGCCCGGAAGTGGTATTGATGAACATCATCG 2799
||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2748 TATTGA-G--------GATCATCATGTGCTGCCTGGAAGTGGTATCGATGAACATCGCCG 2798
Query 2800 GTTCGATAGCAAGCTGACTGGAAGATGTGACTCTCAATCTTCACTTTCCGTTACTAGCCC 2859
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2799 GTTCGATACCAAGCTGACTGGAAGATGTGACTCTCAATCTTCACTTTCCGTTACTAGCCC 2858
Query 2860 ACCTGATTCCCCTGTTCATCTCTCTCATGATGACTTGGATGAATCAGCAGATTTATCTGT 2919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2859 ACCTGATTCCCCTGTTCATCTCTCTCATGATGACTTGGATGAATCAGCAGATTCAACTGT 2918
Query 2920 CTTAGCTGCTTCCAGAATGGGAGAAGATGCTGGTTTGTTAGAGAAGGGGGGAGCACCAAT 2979
| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2919 CCTACCTACTTCCAGAATGGGAGAAGATGCTGGTTTACTAGAGAAGGGGGGAGCACCAAT 2978
Query 2980 TACCTCTAGTGATACTGGAAAGGATAGTTTGATGATTGCTACAGGCTCTGTGTCTTGCTG 3039
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2979 TATTTCTAGTGATATTGGAAAGGATAGTTTGATGATGGCGACAGGCTCTGTGTCTTGCTG 3038
Query 3040 GGATAATGAAGAATGGACTCTTGACAGTAATGAACGGTTGCAGGAACAAGAAGAATACGA 3099
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3039 GGATAATGAAGAGTGGACTCTTGACAGTAATGAACGGTTGCAGGAACAAGAAGAATACGA 3098
Query 3100 CGAAGATGAAGATGGATACCAGGAGGAGGATAAAATACACGGGGTTGATGAGAACATAGA 3159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 CGAAGATGAAGATGGATACCAGGAGGAGGATAAAATACACGGGGTTGATGAGAACATAGA 3158
Query 3160 TCTCGCCCAAGAGTTAGAAGAAATGCATCTCGAGGATAAAGACTCTAATCTAGTCTTAGG 3219
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3159 TCTCGCCCAAGAGTTAGAAGAAATGCATCTCGATGATAAAGACTCTAATCTAGTCTTAGG 3218
Query 3220 ATTTAATGAAGGAGTGGAGGTTGAAATACCCAGCGATGACTTTGAAAAATGTCAACGGAA 3279
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3219 CTTTAATGAAGGAGTGGAGGTTGAAATACCCAGCGATGACTTTGAAAAATGTCAACGGAA 3278
Query 3280 CTCCGAAGCTACATTTCCACTTCATCAGCATACTGTCGATTCTTTAGATGATGAAAGACC 3339
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3279 CTCCGAATCTACATTTCCACTTCATCAGCATACTGTCGATTCTTTAGATGATGAAAGACC 3338
Query 3340 TTCTATTGAGACAAGCCTTGGTGAACAAGTCGCCCAACCTGCTGACGTTTCTGATCCGTT 3399
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 3339 TTCTATTGAGACAAGCCGTGGTGAACAAGCCGCCCAACCTGCTGTCGTTTCTGATCCCTT 3398
Query 3400 GAGCATGCATAATGCATCTAGGAGCTTCCAGGCTGCTGAAACCACGATGCAGAACATGAC 3459
| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3399 GGGCATGCATAATGCGTCTAGGACCTTCCAGGGTGCTGAAACCACGATGCAGAACTTGAC 3458
Query 3460 AATTCACCCAAATAGTGGTCGGCAGTCATTTGAGGTGGGCAATAAAGTAGACTCCATAAG 3519
| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 3459 AGTTCACCCAAATATTGGTCGCCAGTCATTTGAGGTGGCCAGTAAAGTAGACTCCACAAG 3518
Query 3520 TAACTCTACCGTTTCTACTCATCCTGTCATACCACCTCACAGCACTGGTCTGCAT-C--C 3576
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |
Sbjct 3519 TAACTCTACCGTTTCTACTCATCCTGTCATACCACTTCACAGCGCTGCTCTGCATCCATC 3578
Query 3577 ATCTCTTCAGACAGCTATTCCTCCTGTA--T-CTACTTCAGCACAGATGGAGGAGCCTGT 3633
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3579 ATCTCTTCAGACAGCTATTCCTCCTGTATCTACTACTTCAGCACAGATGGAGGAGCCTGT 3638
Query 3634 TAAGTTTCAGTTTGGTTTGTTTTCTGGTCCTTCGCTGATACCTTCTCCTTTCCCTGCCAT 3693
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3639 CAAGTTTCAGTTTGGTTTGTTTTCTGGTCCTTCGCTGATACCTTCTCCTTTCCCTGCCAT 3698
Query 3694 ACAGATTGGTTCCATCCAAATGCCTCTTCCTCTTCATCCCCAATTTGGTTCCTCGCTTAC 3753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3699 ACAGATTGGTTCCATCCAAATGCCTCTTCCTCTTCATCCCCAATTTGGCTCCTCGCTTAC 3758
Query 3754 CCATATCCAACAGCCCCAATCTCCTCTCATTCAGTTTGGTCAACTA-CGATATACATCCC 3812
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 3759 CCATATGCAACAGCCCCAGCCTCCTCTCATTCAGTTTGGTCAACTACCG-TATACATCCC 3817
Query 3813 CAATATCCCAAGGGGTGCTGCCACCGCCACATCATTCAGTTGTCCAAGCGAATGGTTTAC 3872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3818 CAATATCCCAAGGGGTGCTGCCACCGCCACATCATTCAGTTGTCCAAGCGAATGGTTTAT 3877
Query 3873 CAACTTATGCTTTGAATCAGAATCCTGGATCCTCGGTGAC---T--G-TTGGTCAAGGAA 3926
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||
Sbjct 3878 CAACTTATGCTTTGAATCAGAATCCTGGATCCTTGGTGACTGTTCAGCTTGGTCAAGGAA 3937
Query 3927 ATTCGGCTAACCTGCTTGCTAGAAACGCAGCAACCTCTGTCTCACACCCTCAGCTTAGTG 3986
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3938 ATTCGGCTAACCTGCTCGCTAGAAACGCAGCAACCTCTGTCTCACACCCTCAGCTTAGTG 3997
Query 3987 TTCTTAGAAGGCCAACGAATGTTTCTGATGGGGGCACACTGAAGAATGCTAATCTACCTC 4046
|||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3998 TTCTTAGAAGACCGACAAATGTTTCTGATGAGGGCACACTGAAGAATGCTAATCTACCTC 4057
Query 4047 CAGCGAGAGCAAGCATTGAGGCTGCTGTGTCACCTCAAAAGCAACCAGAGTTGTCTGGTA 4106
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4058 CAGCGAGAGCGAGCATTGAGGCTGCTGTGTCACCTCAAAAGCAACCAGAGTTGTCTGGTA 4117
Query 4107 ATTCGCTATTACCTTCTCGAAAGATGAGTCATGGAAAATCAAATTTTGTTGAAAGACAAT 4166
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4118 ATTCGCAATTACCTTCTCGAAAGATGAGTCATGGAAAATCAAATTTTGCTGAAAGACAAT 4177
Query 4167 CAGGATACCAAGTCCAAACTGACACAAATGCAGTTAGAAATTCTGGCTTGCGCTCATCAG 4226
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4178 CAGGATACCAAGTCCAAACTGACACAAGTGCAGTAAGAAATTCTGGCTTGCGCTCATCTG 4237
Query 4227 GTACTGCTGAGGTTTCTCGGGTAGATTCTGGTGGTAATAGAAGATATCGGCGTCAGAGGG 4286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4238 GTACTGCTGAGGTTTCTCGGGTAGATTCTGGTGGTAATAGAAGATATCGTCGTCAGAGGG 4297
Query 4287 TTGAATTTAGAGTTCGGGAATCAAACTGGCCATCTTCCGAGGAGAATCGAAATGGCAATG 4346
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 4298 TTGAATTTAGAGTTCGGGAATCAAACTGGCCATCTTCCGATGAAAATCGAAATGGAAATG 4357
Query 4347 GAAGGGCACAAAATTCTACAAAAAATGGGAGTAGAAAATATGTTGTGTCCAACAAGTCCC 4406
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4358 GAAGGGCACAAACTTCTACAAAAATTGGGAGTAGAAAATATGTTGTGTCCAACAAGTCCC 4417
Query 4407 AGAAACAACCCTTAGACAGCTCAGCTTCTGGTTTGAATGCTATGCAGAAAACAGTTAGTG 4466
|||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4418 AGAAACAAGCCTTAGACAGCTCAGCGTCCGGTTTGAATGCTATGCAGAAAACAGTTAGTG 4477
Query 4467 GGGGTTCATTTGAGAATAGACTTGGGAAAGATGCTGTCGTGAAGAATCCACTCAGTCCAA 4526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4478 GGGGTTCATTTGAGAATAGACTTGGGAAAGATGCTGTCGTGAAGAATCCACTCAGTCCAA 4537
Query 4527 ATTCTGGACAAGCAAACCTTAAAAGGAATATGATATCTGAAAAGGAAATTGATGCACCTT 4586
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4538 ATTCTGGACAAGCAAACCTTAAAAGGAATATGGTATCTGAAAAGGAAATTGATGCACCTT 4597
Query 4587 TGCAGAGTGGAATTGTTCGTGTCTTTGAGCAACATGGTATTGAAGTTCCTAGTGACGATG 4646
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4598 TGCAGATTGGAATTGTTCGTGTCTTTGAGCAACAAGGTATTGAAGCTCCTAGTGACGATG 4657
Query 4647 ATGATTTTATTGAGGTAAGATCAAAAAGGCAAATGCTTAATGATCGCCGTGAACAGAGAG 4706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4658 ATGATTTTATTGAGGTAAGATCAAAAAGGCAAATGCTTAATGATCGCCGTGAACAGAGAG 4717
Query 4707 AAAAGGAAATTAAAGAGAAGTCTCAGGCAGCCAAGGCATTCCGAAAACCTCGTTCAACTT 4766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4718 AAAAGGAAATTAAAGAGAAGTCTCAGGCAGCCAAGGCATTCCGAAAACCTCGTTCAACTT 4777
Query 4767 TCCAGAACAGTACTACTGCAGCCAGGTCCAACAAAAGCCCACCAGCTAGCCGAGTTGCGA 4826
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4778 TCCAGAACAATACTACTGCAGCCAGGTCCAACAGAAGCCCACCAGCTAGCCGAGCTGCGA 4837
Query 4827 ACAATAAGCAGTTTAATCCCGTTTCCAACAGACAGACGTTAGCCCCAATTGGCACACCTT 4886
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4838 ACAATAAGCAGTTTAATCCAGTCTCCAACAGACAGACGTTAGCCCCAATTGGCACACCTT 4897
Query 4887 CCCCTAAAACAGATTCCCATGCTGATGAAAAATCTGGGAGCAACAAGTCCACCCAGGCAA 4946
| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 4898 CACCTAAAATAGATTCCCATGTTGATGAAAAATCTGGGAGCAACAAGTCCACTCAGGAAA 4957
Query 4947 GTAATGCTCTTCCAGTTATACCCAAAAATGATCAGAATCCAGCGTCAGGTTTTGTATTCA 5006
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4958 GTAGTGCTCTTCCAGTTATACCCAAAAATGATCAGAATCCAGCGTCAGGTTTTGTATTCA 5017
Query 5007 GCAACAAAAATAAGGTTCTGGATAACAGTCATACACCTGTGGGGACTTGGGGTAACCAAC 5066
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5018 GCAACAAAAATAAGGTTCTCGATAACAGTCATACACCTGTGGGGACTTGGGGTAACCAAC 5077
Query 5067 TCACCTATCAGCCGGTTATGGCCCTAACCCAGAGTCAGCTTGATGAAGCCATGAAACCCG 5126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5078 TCACCTATCAGCCGGTTATGGCCCTAACCCAGAGTCAGCTTGATGAAGCCATGAAACCCG 5137
Query 5127 TATCTC-TACTTTCATGTGTTTCTGTTGAGAATGGTGCTAACCGAATCAGTGAGGCAAAT 5185
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||
Sbjct 5138 TATCTCAT-CTTTCATGTGTTTCTGTTGAGAATGGTGCCAACCGAATTAGCGAGTCAAAT 5196
Query 5186 TCGACATCAACGTCTGTTGTGCCAAAGAACAGTACTTTTTCAAGCAGCACAAGTCCAATA 5245
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5197 TCGACATCAACGTCTGTTGTGCCAAAGAACAATACTTTTTCAAGCAGCACAAGTCCAATA 5256
Query 5246 AATTCATTGCTTGCCGAGGGCAAAATTCAATTTGGTGCAGTTACATCTTCCACTGTTATC 5305
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5257 AATTCATTGCTTGCTGAGGGCAAAATTCAATTTGGTGCAGTTACATCTTCCACTGTTATC 5316
Query 5306 CTTCCATGTGGTGGGCGTACGGAGAACGATAGCTCTTTATATTTTGAAAAAGATAATAAA 5365
| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5317 CCTCCCTGTGGTGGGCGTACAGAGAAGGATAGCTCTTTATATTTTGAAAAAGATAACAAA 5376
Query 5366 CATCGAAATCCATCATCCACTGGCATGGAGATTTGTGAAGCAGAAGCAGAAGCTGCTGCT 5425
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5377 CATCGAAATCCATCATCCACTGGCATAGAGATTTGTGAAGCAGAAGCAGAAGCTGCTGCT 5436
Query 5426 TCAGCTATAGCTGTGGCAGCCATAACTAATGATGAAACCAGTGGGAATGCCTTGAGTACT 5485
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5437 TCAGCTATTGCTGTGGCAGCCATAACTAATGATGAAACCAGTGGGAATGCCTTGAGTACT 5496
Query 5486 GGCTCTGTATTACCTGTTGAAACCAAAATTTATGGAGGAACAGAGTTAGATGATGGGGCA 5545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5497 GGCTCTGTATTACCTGTTGAAACCAAAATTTATGGAGGAACAGAGTTAGATGATGGGGCA 5556
Query 5546 GCAAGTGGTGCTGTTGGTGGGCAGCCTAGTCTATCAAAAGCTGAGGAGTCTCTCATTGTT 5605
||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5557 GCAAGTGGTACTGTTGGTGGGCAGACTAGTCGATCAAAAGCTGAGGAATCTCTCATTGTT 5616
Query 5606 TCTCTCCCAGCAGATCTTTCAGTGGACACCCCAATCTCTGTGTGGCCACAATTACCAAGT 5665
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5617 TCTCTACCAGCAGATCTTTCAGTGGACACCCCAATCTCTCTGTGGCCACAATTACCAAGT 5676
Query 5666 CCACACAACTCAAACCAAATGATCACTCACTTCCCTCCAGGCCCTCCTCATTACCCTTTC 5725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5677 CCACACAACTCAAACCAAATGATCACTCACTTCCCTCCAGGCCCTCCTCATTACCCTTTC 5736
Query 5726 TATGATGTGAACCCCATGTTAAGAGGACCCATCTTTGCTTTTGGCCCGCACCATGACGCA 5785
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5737 TATGATGTGAATCCCATGTTAAGAGGACCCATTTTTGCTTTTGGCCCGCACCATGACGCA 5796
Query 5786 GGAGCAACCCAGTCACAGTCCCAGAAAGGTCCAGTAACAGTTTCTGGTCCACCTACAACC 5845
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 5797 GGAGCAACCCAATCACAGTCCCAGAAAGGTCCAGTAACAGTATCTGGTCCACCTACGACC 5856
Query 5846 TGGCAGCAGCAGAATCATCCTGGAGTAGATTCCTTCTATGCCCCTCCTGCCGGTTTCACG 5905
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5857 TGGCAGCAGCAGGGTCATTCTGGAGTAGATTCCTTCTATGCCCCTCCTGCCGGTTTCACG 5916
Query 5906 GGTCCTTTCCTAACCCCACCCGGTGCTATTCCTGGCGTTCAGGGTCCTCCTCACATGTTC 5965
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5917 GGTCCTTTTCTAACCCCACCCGGTGCTATTCCTGGCGTTCAGGGACCTCCTCACATGTTT 5976
Query 5966 GTTTATAACCACTTTGCACCCGTTGGACAGTTTGGAGGGTTGAGTTTCATGGGGACAACT 6025
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5977 GTTTATAACCACTTTGCACCTGTTGGACAGTTTGGAGGGTTGAGTTTCATGGGAACAACT 6036
Query 6026 TACATCCCATCTGGAAAACAACCAGATTGGAAACACAACCCAAACGTGTCTTCTTCTCCG 6085
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6037 TACATCCCATCTGGAAAGCAACCAGATTGGAAACACAACCCAAACGTATCTTCTTCTCCG 6096
Query 6086 GTTGGAGGAGATAGTGATGTAAACAATCCAAATGTGGCTTCTATGCAATGTAACATTGTA 6145
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6097 GTTGGAGGAGATGGTGATGTAAACAATCCTAATGTGGCTTCCATGCAATGTAACATTGTA 6156
Query 6146 CCTGCGTCTCTTCAGCACCTTCCTATGCCAATGTTTGATCCATCCCCTTTCCAGTCTTCT 6205
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6157 CCTGCGTCTCTTCAGCACCTTCCTATGCCAATGTTTGATCCATCTCCTTTCCAGTCTTCT 6216
Query 6206 TCTCAGGAGATGCCTGTTCGAGCACGGTGGCCTTACATGCCATTTTCAGGTCCTCCAACG 6265
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6217 TCTCAGGAGATGCCTATTCGAGCACGGTGGCCTTACATGCCATTTTCGGGTCCTCCAACG 6276
Query 6266 ATGCAAATGCAGAAACAGCAGGAAGCAACAGATGGCTCCAATCTTCCATCACCTCAGTTC 6325
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6277 ATGCAAATGCAGAAACAGCAGGAAGGAACAGATGGCTCCAATCTTCCATCACCTCAGTTT 6336
Query 6326 ATCAACAACATGCTTCCTCCTCCTCCTCCTAACAGATATCCCAACGTTCAAGCATCCACA 6385
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6337 AACAACAACATGCTTCCTCCTCCTCCTCCTAACAGATATCCCAACGTTCAAGCATCCACA 6396
Query 6386 GTTGTAGATGCAATGGTGGACTCTTCAAACGCGTACAGTTCCACCACTTGTGCTCCACCA 6445
|||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 6397 GTTGTAGACGCAATGGTGGACTCCTCAAACGCTTACAGTTCCACCACTGGTGCTCCACCA 6456
Query 6446 GCAAAGCCCACCACCACCTTACCCGATCCCAACAGCAACAACACTCAGAATCCAAGTGGT 6505
|||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6457 GCAAAGCCCACCTCCACGTTATCTGATCCCAACAGCAACAACACTCAGAATCCAAATGGT 6516
Query 6506 CCTGGCTTCAAGCCACCacaacaacaacaacaacaacaacaacaaTCTTCTCAGGAGAAG 6565
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6517 CCTGGCTTCAAGCCACCACAACAACAACAACAACAA---------TCTTCTCAGGAGAAG 6567
Query 6566 AACTCGCAGTCTCAGCATGTTGGTGGGTCCAGCCACCACCACCAACACCAGCACCAGCAA 6625
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6568 AACACGCAGTCTCAGCATGTTGGTGGGCCCAGCCACCACCACCAACACCAGCACCATCAA 6627
Query 6626 CACCGGAGGTCAGCCTTCCATGGAAGAAACCAACCCATGGCCAGAGAGAGAGGCTTTCCG 6685
||||||| || | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6628 AACCGGAGATCGGGCTACCATGGCAGAAACCAACCCATGGCCAGAGAGAGAGGCTTTCCG 6687
Query 6686 AATAACCCAAAGGTCAAGCAAATCTATGTGGCTAAGCAGACTGGTAACAGCAATGCCTCT 6745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6688 AATAACCCAAAGGTCAAGCAAATCTATGTGGCTAAGCAGACTGGTAACAGCTGTGCCTCT 6747
Query 6746 GCTTccaccaccaccaccaccaccTCCCCCTCAATTTGATGATTCTTCACCATCCAGGTC 6805
|||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6748 GCTTCCTCTACTACCACCACCACTTCCCCCTCAATTTGATGATTCTTCACCATCCAGGTC 6807
Query 6806 CGTTCAGATATAAACTT-TCC-AATAACCCAACCAGCTTTGGCTTCATAAGAAGATCTGG 6863
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6808 CGTTCAGATATAAACTCATCCCAATAACCCAACCAGCTTTGGCTTCATAAGAAGATTTGG 6867
Query 6864 ttttttttttttttctttcaattttcccatatatcaattagcttcttttttttatacctt 6923
||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||
Sbjct 6868 ACTTTTTTTC----CTTTCAATTTTCCCATATATCAGTTAGCTTCCTTTTTTTCTTC-TT 6922
Query 6924 tttATTCTCATTAGATAATTAGATTTTGTCTCTTCTTTACTCGTTTGGGGGTTCATTATA 6983
||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6923 TTTATCCTCGTTAGATAATTAGATTTTGT-TCT-CTTTACTCGTTTGGGGATTCATTATA 6980
Query 6984 TGGGGACTTTGGTAATG---------GT--TGGT----AAAAATATTGCCGTGAGGTTTT 7028
||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||
Sbjct 6981 TGGGGACTTTGGTAATGCTTAATTTCGTCATGGTTGGTAAAAATATTGTCGTGAGGTTTT 7040
Query 7029 CGGTGTAGAATACCCAATTCACGGCTCCAATGTATCTGTTGTCAACATTATCTTTATA 7086
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7041 CGGTGTAGAATACCCAATTCACGGCCCCAATGTATCTGTTGTCAACATTATCTTTATA 7098
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 354843787598
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5