BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485509
Length=3588
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G51570.1 | Symbols: | Disease resistance protein (TIR-NBS-L... 4464 0.0
> AT3G51570.1 | Symbols: | Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR
class) family | chr3:19126358-19130456 FORWARD LENGTH=3681
Length=3681
Score = 4464 bits (2417), Expect = 0.0
Identities = 2655/2772 (96%), Gaps = 7/2772 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGAGGCCTC-T--TCTTCCCAGGTCAAAGCACTTCCCTTGCCACCGCAGCATCAA 57
|||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAGGCCTCTTCCTCTTCCGAGGTAAAAGCACTTCCTTTGCCGCCGCAGCATCAA 60
Query 58 GTGTTTGTCAATTTCAGAGGAGAAGAGCTGCGGAACAGCTTCGTTAGCCATCTCAGAAGT 117
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTGTTTGTAAATTTCAGAGGAGAAGAGTTGCGGAACAGCTTTGTTAGCCATCTCAGAAGT 120
Query 118 GCATTGGTTAGGCATGGGGTCAACATCTTCATAGACACGAATGAGCAGAAAGGTAAACCT 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 121 GCATTGGTTAGGCATGGGGTCAACATCTTCATAGACACGAATGAGGAAAAAGGTAAACCT 180
Query 178 TTACATGTCTTTTTCGAGAGGATTGAAGAGTCGAGGATCGCTTTGGCCATTTTTTCTC-T 236
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 181 TTACATGTGTTTTTCCAGAGGATTGAAGAGTCGAGGATCGCTTTGGCCATTTTTTC-CGT 239
Query 237 TAGGTACACCGAGTCGAAATGGTGCTTGAACGAGCTGGTGAAGATGAAGGAATGCATGGA 296
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TAGGTACACCGAATCGAAATGGTGCTTGAACGAGCTAGTGAAGATGAAGGAATGCATGGA 299
Query 297 CAAGGGAAAACTCCTCATCATTCCCATCTTCTACAAGGTTAAAGCATACGAAGTTCGGTA 356
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CAAGGGAAAGCTCCTCATCATTCCCATTTTCTACAAGGTTAAAGCATACGAAGTTCGGTA 359
Query 357 TCAGAAGGGACGGTTCGGTTATGTATTCAAAAATTTGCGCAATGCTGATGTTCACCAGAA 416
||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 360 TCAGAAGGGACGGTTTGGTTGTGTTTTCAAGAATTTGCGCAATGTTGATGTTCACAAGAA 419
Query 417 AAACCAGTGGTCTGAAGCTTTGAGCTCTGTTGCAGACCGGATCGGCTTCCCCTTCGATGG 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 420 AAACCAGTGGTCTGAAGCTTTGAGCTCTGTTGCAGACCGGATCGGCTTCTCCTTTGATGG 479
Query 477 AAAGAGCGACGAGAACAACTTCATCAATGGTATTGTTGAAGAGGTTAAAGAAGCGCTGAG 536
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 AAAGAGCGACGAGCACAACTTCATCAATGGTATTGTTGAAGAGGTTAAAGAAGCGCTGAG 539
Query 537 CAAAATTTTGTTGGACAAAACCAAAGATGCTTTCTTCTATCATTCGAAAAACACTTCAAT 596
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 540 CAAGATTTTGTTGGACAAAACCAAAGATGCTTTCGTCTATCATTCGAAAAACAATTCAAT 599
Query 597 GTCCTTAGGAAGAGAAAAGCATGAGATTTATGGACTCAAACAACGGTTAGAAGAATTGAA 656
|||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 600 GTCCGTAGGAAGAGAAAAGCACGAGATTTATGGACTCAAACAACGGTTAGAAGAATTAAA 659
Query 657 GGAGAAGCTAGATCTTGATTGTGAGGAGACTCGGATTTTGGGAGTTGTTGGGATGCCCGG 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GGAGAAGCTAGATCTTGATTGTGAGGAGACTCGGATTTTGGGAGTTGTTGGGATGCCCGG 719
Query 717 TATTGGTAAAACTACTCTTGCAAGGGAGATATATGAATCTTTGCGGTGCAAGTTCTTAAG 776
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TATTGGTAAAACCACTCTTGCAAGGGAGATTTATGAAACTTTGCGGTGCAAGTTCTTAAG 779
Query 777 GCATGGGTTAATCCAAGATATTCGTAGAACATCGAAGGAGCTCGGGTTGGATTGCTTGCC 836
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 780 GCATGGATTAATCCAAGATATTCGTAGAACATCGAAGGAGCACGGGTTGGATTGCTTGCC 839
Query 837 TGCATTACTCTTGGAAGAGTTACTCGGTGTGAGAATTCCAGACATAGAATCTACTCGATG 896
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGCATTACTCTTGGAAGAGTTACTCGGTGTGACAATTCCAGACATAGAATCTACTCGATG 899
Query 897 TGCATATGAATCTTACAAGATGGAACTATATACGCATAAAGTTCTTGTTGTTCTCGACGA 956
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TGCATATGAATCTTACAAGATGGAACTACATACACATAAAGTTCTTGTTGTTCTCGACGA 959
Query 957 TGTGAGTGACAAGGAACAGATAGATGTTCTTCTGGGGAGATGCGACTGGATTAGGCAGGG 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 960 TGTGAGTGACAAGGAACAGATAGATGTTCTTCTGGGGAGATGCAACTGGATTAGGCAGGG 1019
Query 1017 AAGTAGGGTTGTCATTGCAACAAGCGACAAATCACTAATCCAAGATGTGGCTGACTATAC 1076
||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 AAGCAGGATTGTCATTGCAACAAGCGACAAATCACTAATACAAGATGTGGCTGACTATAC 1079
Query 1077 TTATGTTGTCCCACAGTTGAACCACAAAGACGGCTTAGGCCACTTTGGGCGTTATGCCTT 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TTATGTTGTCCCACAGTTGAACCACAAAGACGGCTTAGGTCACTTTGGGCGTTATGCCTT 1139
Query 1137 CGATCATCATTCCAACATACACAACAATGAAGTCATCATGAAGCTATCAAAAGAGTTTGT 1196
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1140 TGATCGTCATTCCAACATACACAACAATGAAGTCATCATGAAGCTATCGAAAGAGTTTGT 1199
Query 1197 GCATTATGGTAGAGGTCATCCACTTGTTCTAAAGTTGTTGGGGGCAGATCTTAATGGGAA 1256
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GCATTATGGTAGAGGTCATCCACTCGTTCTAAAGTTGTTGGGGGCAGATCTTAATGGGAA 1259
Query 1257 AGACGAGGACCATTGGAAAACAAAATTGGCTACACTTGCAGAAAATTCCAGCCAGAGTAT 1316
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1260 AGACGAGGACCATTGGAAAACAAAATTGGCTACACTAGCAGAAAATTCCAGCCATAGTAT 1319
Query 1317 TCGAGATGTGTTACAAGTAAGTTATGATGAGCTGAGTCAAGAGCATAAAGATATATTTCT 1376
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TCGAGATGTGTTACAAGTAAGTTATGATGAACTGAGTCAAGTGCATAAAGATATATTTCT 1379
Query 1377 CGACATAGCTTGTTTTAGATCGGAAGATGAGAGTTACATTGCTAGTCTACTGGATTCATC 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CGACATAGCTTGTTTTAGATCGGAAGATGAGAGTTACATTGCTAGTCTACTGGATTCATC 1439
Query 1437 TGAAGCTGCAAGTGAAATAAAAGCTCTCATGAATAAATTCATGATTAATGTTTCTGAGGA 1496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1440 TGAAGCTGCAAGTGAAATAAAAGCTCTCATGAATAAATTCATGATTAATGTTTCCGAGGA 1499
Query 1497 CCGAGTAGAGATGCATGATTTGCTATATACTTTCGCCAGGGAACTTTGCCGAAGAGCATA 1556
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CCGAGTAGAGATGCATGATTTGCTATATACTTTCGCTAGGGAACTTTGCCGAAGAGCATA 1559
Query 1557 CACTCAAGATAGAAGGGGGCCACATAGGTTGTGGCACCACCAAGACATAACGGATGTGCT 1616
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1560 TGCTCAAGATGGAAGGGAGCCACATAGGTTGTGGCACCACCAAGACATAACTGATGTGCT 1619
Query 1617 AAAGAACATAGAGGAAGGCGCAGAAGTCAGAGGGATTTTCCTAAACATGAATGAAATGAA 1676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 AAAGAACATAGAGGAAGGCGCAGAAGTCAGAGGGATTTTCCTAAACATGAATGAAATGAA 1679
Query 1677 GAGAGAGATGAGCTTAGACAGTTGCACTTTCAAACCAATGCACGGTCTCCGATACCTCAA 1736
||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||
Sbjct 1680 GAGGGAGATGAGCTTAGACAGTTGCACTTTCAAATCGATGTGTGGTCTCCGATACCTCAA 1739
Query 1737 GATCTATAGCTCTCATTGCCCTCAGCAATGTAAACCTAACAATAAGATAAACCTTCCTGA 1796
|||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1740 GATCTATAGCTCACATTGTCCTCAGCAATGTAAGCCTAACAATAAGATAAACCTCCCTGA 1799
Query 1797 TGGACTAAACTTCCCACTGAACGAGGTCCGATATCTCCACTGGCTACAGTTCCCATTGAA 1856
||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1800 TGGGCTAAACTTCCCACTGAAAGAGGTTCGCTATCTCCACTGGCTAGAGTTCCCATTGAA 1859
Query 1857 GGAAATTCCACCAGATTTCAACCCTCGAAATCTTGTCGACCTTAAGCTTCCCCACAGCAA 1916
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 GGAAATTCCACCAGATTTCAACCCGCAAAATCTTGTCGACCTTAAGCTTCCCCACAGCAA 1919
Query 1917 GATTGAACGAATCTGGAGTAATGATAAGGATAAGGATACACCAAAATTAAAGTGGGTCAA 1976
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 GATTGAACGAATCTGGAGTGATGATAAGCATAAGGATACACCAAAATTAAAGTGGGTCAA 1979
Query 1977 TCTCAATCATTCAAGTAACTTGTGGGAC-TTGTCGGGGTTATCAAAGGCTCAAAGTCTTG 2035
||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1980 TCTCAGTCATTCAAGTAACTTGTGGGACATT-TCGGGGTTATCAAAGGCTCAACGTCTTG 2038
Query 2036 TTTTCCTAAATCTAAAAGGGTGCACAAGTCTCAAGTCTCTTCCGGAGATAAATTTAGTCT 2095
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTTTCCTAAATCTAAAAGGGTGTACAAGTCTCAAGTCTCTTCCGGAGATAAATTTAGTCT 2098
Query 2096 CTTTGGAAATTCTCATCCTCAGCAACTGCTCAAACCTTAAAGAATTCCGGGTGATCTCAC 2155
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2099 CTTTAGAAATTCTCATCCTCAGCAACTGCTCAAACCTTAAGGAATTCCGGGTGATCTCAC 2158
Query 2156 AAAATCTAGAAACTCTATACTTGGATGGCACTTCAATAAAAGAACTTCCTTTGAACTTCA 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 AAAATCTAGAAACTCTATACTTGGATGGCACTTCAATTAAAGAACTTCCTTTGAACTTCA 2218
Query 2216 ATATACTCCAGAGACTTGTTATATTGAATATGAAAGGATGCACGAAGCTGAAGGAGTTTC 2275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2219 ATATACTCCAGAGACTTGTTATATTGAATATGAAAGGATGCGCGAAGCTGAAGGAGTTTC 2278
Query 2276 CGGATTGTCTCGATGACTTGAAAGCTCTTAAAGAATTGATACTCTCAGATTGTTCGAAGC 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2279 CGGATTGTCTCGATGACTTGAAAGCTCTTAAAGAACTGATACTCTCAGATTGTTGGAAGC 2338
Query 2336 TCCAAAAATTTCCTGCAATCCGCGAAAGCATTATGGTTTTAGAGATATTACGATTGGATG 2395
||||||| ||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2339 TCCAAAATTTTCCGGCAATCTGTGAAAGAATCAAGGTTTTAGAGATATTAAGATTGGATA 2398
Query 2396 CTACAACCATAACAGAGATTCCAATGATATCGTCGTTACAATGTTTATGCTTCAGTAAGA 2455
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2399 CTACAACCATAACAGAGATTCCGATGATATCGTCGTTACAATGTTTATGCTTAAGCAAGA 2458
Query 2456 ATGATCAGATCAGCTCCCTTCCAGATAACATCAGCCAACTTTTTCAACTAAAATGGTTGG 2515
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2459 ATGATCACATCAGCTCCCTTCCAGATAACATCAGCCAACTTTCTCAACTAAAATGGTTGG 2518
Query 2516 ACTTGAAGTATTGTAAGAGACTTACATCTATTCCAAAGCTTCCACCAAATCTTCAACACT 2575
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 ACTTGAAGTATTGTAAGAGTCTTACATCTATTCCAAAGCTTCCACCAAATCTTCAACACT 2578
Query 2576 TAGATGCACACGGCTGTTGCTCACTTAAGACAGTCTCGAATCCACTGGCATGCCTTACTA 2635
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2579 TAGATGCACACGGCTGTTGCTCACTTAAGACAGTCTCGAATCCACTGGCATGTCTTACTA 2638
Query 2636 CAACTCAACAGATTTATTCAACATTCATTTTCTCTAACTGCAACAAACTCGAAAGGAGTG 2695
| |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 CGGCTCAACAGATTTATTCTACATTCATCCTCACGAACTGCAACAAACTCGAAAGGAGTG 2698
Query 2696 CAAAAGAAGAAATATCTTCCTTTGCTCAAAGGAAATGTCAGCTACTTTTAGATGCACAAA 2755
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 CTAAAGAAGAAATATCTTCCTTTGCTCAAAGGAAATGTCAGCTACTTTTAGATGCACAAA 2758
Query 2756 AGCGCTGCAATG 2767
||||||||||||
Sbjct 2759 AGCGCTGCAATG 2770
Score = 1267 bits (686), Expect = 0.0
Identities = 781/826 (95%), Gaps = 9/826 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2769 TTCTGATTCGGAGCCTTTGTTCAGTATTTGCTTTCCTGGAAGTGAACTACCTTCATGGTT 2828
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859 TTCTGATTCGGAGCCTTTGTTCAGTATATGCTTTCCTGGAAGTGAACTACCTTCATGGTT 2918
Query 2829 CTGTCATGAAGCTGTTGGACCTGTATTAGAGCTCAGAATGCCTCCACATTGGCACGAAAA 2888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2919 CTGTCATGAAGCTGTTGGACCTGTATTAGAGCTCAGAATGCCTCCACATTGGCATGAAAA 2978
Query 2889 TAGGCTTGCCAGTGTAGCTTTATGTGCTGTTGTCTCGTTTCCAAAATCTGAAGAACAAAT 2948
|||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2979 TAGGCTTGCCGGTGTAGCTCTATGTGCTGTTGTCACATTTCCAAAATCTCAAGAACAAAT 3038
Query 2949 CAACTGTTTTTCGGTGAAATGCACATTCAAACTAGAAGTAAAAGAAGGGTCGTGGATCGA 3008
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3039 CAACTGTTTTTCAGTGAAATGCACATTCAAACTAGAAGTAAAAGAAGGGTCGTGGATCGA 3098
Query 3009 ATTTTCATTCCCAGTTGGAAGATGGAGTAATCAGGACAATATAGTTGAGACTATTGCATC 3068
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||
Sbjct 3099 ATTTTCATTCCCAGTTGGAAGATGGAGTAATCAGGGCAATATAGTTGCGAATATTGCATC 3158
Query 3069 AGAGCATGCCTTTATTGGGTATATCAGTTGTTCAAAGATCTTTAAACGTCTTGAAAACCA 3128
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3159 AGAGCATGTCTTTATTGGGTATATCAGCTGTTCAAAGATCTTTAAACGTCTTGAAAACCA 3218
Query 3129 GCATTTTAGCAGCTCTAATCCTACAAAATCCACGCAATCTAGTAAATGTAGTCCTACTAA 3188
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3219 GTATTTTAGCAGCTCTAATCCTACAAGATCCACGCAATCTAGTAAATGTAGTCCTACTAA 3278
Query 3189 GGCCTCCCTTAATTTTATGGTCATAGATGGTAAGAGTGAGATACCGAGAATCGAAGTGCT 3248
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3279 GGCCTCTCTTAATTTTATGGTCATAGATGGTACGAGTGAGCTACCGAGAATCGAAGTGCT 3338
Query 3249 CAAGTGCGGCTTAAGGTTTTTTGAAGGTGCTGGGAGCAGTGGAAATTATTTAAAGAAGTT 3308
|||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3339 CAAGTGTGGCTTAAGGTTTTTCAAAGGTGTTGGGAGCAGTGGAAATTATTTAAAGAAGTT 3398
Query 3309 GGAAGTGAAAGAAGCTGAACAAAATCTAAGTGCTGTAAAAGTGTCAGAAGATTGGACGTA 3368
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3399 GGAAGTGAAAGAAGCTGAACAAAATCTAAGTGCTGAAAAAGTGTCAGAAGATTGGACGTA 3458
Query 3369 TGGATCAAGTAGTAGATGCACCCATGTTGTCAAAACATGTCCAGAACAGAGCCAAGAGAC 3428
|||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 3459 TGGATCAAGTAGCAGATGCAACCATGCTGTCAAAACATGTCCAGAACAGAGGCAAGTGAC 3518
Query 3429 AGTTACCACAGAGGTTGAAGCTTCACCTGAAAAAGCTGACAATGCAGAATTTCAAATCAA 3488
||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3519 AGTCACCGCAGAGGTTGAAGCTTCTCCTGAAAAAGCTGACAATGCAGAATTTCAAATCAA 3578
Query 3489 TATCATCACCCCACGTGAAGCTCAACCACAACCAC------GCCCATGTGCGAAAACTTC 3542
|||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||
Sbjct 3579 GATCA-C-CCC-ACGTGAAGCTCAACCACAACCACAACCACGCCCATGTTCAAAAACTTT 3635
Query 3543 GAAATGGGTATGTTTTACTTGTTGTGACTTCCAAAAACATCTATGA 3588
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3636 GAAATGGGCATGTTTTACTTGTTGTGACTTCCAAAAACATCTATGA 3681
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 178644484023
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5