BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg485847 Length=4303 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G54460.1 | Symbols: | SNF2 domain-containing protein / heli... 6761 0.0 > AT3G54460.1 | Symbols: | SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / F-box family protein | chr3:20161942-20167293 REVERSE LENGTH=4352 Length=4352 Score = 6761 bits (3661), Expect = 0.0 Identities = 4101/4308 (95%), Gaps = 51/4308 (1%) Strand=Plus/Plus Query 31 AGAAAGATGCGAtttttttAGAGAAAATCTATAAAGCCTTAT-ACTTTCTGCATTC-CGT 88 ||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| | ||| | ||| | Sbjct 45 AGAAAGATGAGATTTTCCTAAAGCAAATCTACAAAGCCTTATAAATTT-TTTTTTCTGGC 103 Query 89 GGTCGAGGGCCGATGATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 148 || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 104 GG-CGATGGCC---GATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 159 Query 149 ATTCGCCTGGTCTTCTTCAATTGGGCTCTTCCTGTTTCATCTTCAATGA--------T-- 198 ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | Sbjct 160 ATTCGCCTGATCTTCTTCAATCGGGCTCGTCTTGTTTCATCTTCAATGATGGTTCCGTCA 219 Query 199 --GGTTTCAAATCCGACAATGGCTTGATCTTATCCCTCATC-AATCCCATCTCTAATCTC 255 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 220 CCGGTTTCAAATCCGAAAATGGCTTGATCTTATCCCTCA-CTAATCCCATCTCTAATCTC 278 Query 256 AAATCCCTAATTTCGTCTGAAGGAGATCA-GA-ATT--G---T--GG------TGAAGAC 300 |||||||||||||||| |||||||||| || || | | || ||||||| Sbjct 279 CAATCCCTAATTTCGTCAAAAGGAGATCATGATGTTGAGAATTCCGGAACAATTGAAGAC 338 Query 301 GGTGGATTGCAGACTCCACAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTCGTACA 360 ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 339 GGTCGATTGGAGACTCCGCAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTGGTA-A 397 Query 361 -CGAAAGTCTCCGAAGTCGAAGAGCCGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACCGTACA 419 |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 398 GCGAAAGACTCCGAAATCGAAGAGACGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACTGTACA 457 Query 420 GGGGAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGCATGGTGAATGGAAGCATAAGTGTAGTGCAGCA 479 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 458 GGGAAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGTATGGTGAATGGAAGTATAAGTGTAGTGCAGCA 517 Query 480 GCTTCACGCTTTGGTTGCCAACAAATGTTTGAAGA-TATTTTCTCAAGTGGTGAAGATTG 538 |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||||||| ||| Sbjct 518 GCTTCATGCTTTGGTTGCTAATAAATGCTTGAAGATTA-TATGTCGTGTGGTGAAGGTTG 576 Query 539 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGCTAGTTGATGTTTACTTACCTATTG 598 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| Sbjct 577 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGTTAGTTGATGTTTACCTGCCTATTG 636 Query 599 CATTGTGGTCCGGGTGGCAATTTCCCAAATCCCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTCAAGC 658 |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 637 AATTGTGGTCCGGATGGCAATTTCCTAAATCTCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTTAAGC 696 Query 659 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGGGAAAGTGTTTGGGAAG 718 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 697 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGAAAAAGTATTTGGGAAG 756 Query 719 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCCGACTGTCATGTGTTTAATTGCA 778 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| Sbjct 757 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCTGACTGTCATGTGTTTGACTGCA 816 Query 779 AATTACTCTGTAATGCCCCAGATTCTCCAAAAAGACGATTGTTCAAACTACATGAAATCT 838 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| | Sbjct 817 AATTACTCTGTAATGCCCCAAATTCTCCAAAAAGACGGTTATTTAAACTACATGAAATTT 876 Query 839 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTGTTCTTCTAGAGTATTACCGT 898 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| Sbjct 877 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTATTCTTCTAGAGTATTGCCGT 936 Query 899 CTACTGACTCTTGTGCATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 958 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 937 CTACTGACTCTTGTGTATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 996 Query 959 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTTCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1018 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 997 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTGCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1056 Query 1019 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1078 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1057 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1116 Query 1079 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1117 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1176 Query 1139 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTATGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1198 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1177 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTACGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1236 Query 1199 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTTCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1258 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1237 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTCCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1296 Query 1259 GTCTCGGAAAGACGATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1318 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1297 GTCTCGGAAAGACAATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1356 Query 1319 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACACATAAAAGTGACAAAAAATGCGCCT 1378 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| Sbjct 1357 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACCCACAAAAGTGACAAAAAATGTGCCT 1416 Query 1379 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTTTGCTGTAAAGAGGTTTC 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1417 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTCTGCTGTAAAGAGGTTTC 1476 Query 1439 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGTTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1498 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1477 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGGTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1536 Query 1499 CGAAATCGTTGCCACTTAAGCAAGCTAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1558 | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1537 CAAAATCGTTGCCATTTAAGCAAGCGAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1596 Query 1559 CTAAGAACTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACCCACATCCCTGCGTCCCTGGATGTAA 1618 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1597 CTAAGAATTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACTCACATCCCTGCGTCCCTGGATTTAA 1656 Query 1619 AAGCTCAATGTAGAAAGCCCTTGGGTAATGTCAGGAAAAATCTCTTGCATGTATATGATG 1678 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| Sbjct 1657 AAGCTCAATGTAGAAAGAGCTTGGGTAATGTCAGAAAAAATCTCTTGCCTGCATATAATG 1716 Query 1679 GCGCATCTGAGCTCTCCAAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCGGTAATTGGAAGAAATGTG 1738 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1717 GCGCATCTGAGCTCTCTGAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCAGTAATTGGAAGAAATGTG 1776 Query 1739 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1777 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1836 Query 1799 GGATACAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1858 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1837 GGATGCAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1896 Query 1859 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATGCTGACCCTGCATATCAGAGTTGTAATGATC 1918 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1897 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATAATGACCCTGCATATCAAAGTTGTAATGATC 1956 Query 1919 CTGAAGAATTATGGGATAGATCTCAACCTATAAAATTCTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 1978 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1957 CTGAAGAATTATGGGATAAATCTCAACCTATAAAATACTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 2016 Query 1979 GAGCCTCTGGTGAAGAAAATGATAATATCTCTTTCTTCACCAGTGTCCTTCGGGAACACA 2038 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2017 GAGCCTCTGGGGAAGAAAGTGATAATATCTCTTTCTTCACGAGTGTCCTTCGGGAACACA 2076 Query 2039 AGTCTTCAGTAAACTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2098 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2077 AGTCTTCAGTAAGCTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2136 Query 2099 AGAAACTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTTGAATAA-- 2156 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 2137 AGAAGCTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTT-AA-AATT 2194 Query 2157 AGATGCCCTTGGGTTCCAGACAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAA 2216 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2195 AGATGCCCTTGGGTTCCAGAGAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAA 2254 Query 2217 GGGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGC 2276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2255 GGGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGC 2314 Query 2277 CCTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAAC 2336 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2315 CCTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAAC 2374 Query 2337 TCTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGACAACACAAATCCAAAAACATGT 2396 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2375 TCTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGTTAACACAAATCCAAAAACATGT 2434 Query 2397 TTGCTCTGATCAGCTTCGCCTTCTTGTTTGGACTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAG 2456 |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2435 TTGCTCTGATCAGCTTCGTATTCTCGTTTGGGCTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAG 2494 Query 2457 CTTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAA 2516 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2495 CTTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAA 2554 Query 2517 TCCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGG 2576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2555 TCCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGG 2614 Query 2577 ACACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTTTGAC 2636 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2615 ACACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTCTGAC 2674 Query 2637 AGCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCT 2696 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2675 AGCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCT 2734 Query 2697 TTCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGAAAGTATATGGAGAAAATCCAAA 2756 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 2735 TTCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGGAAGTCTATGGAGAAAATCCAAA 2794 Query 2757 GTTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCG 2816 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2795 GTTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCG 2854 Query 2817 TTTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGAAGATGAT 2876 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2855 TTTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGCAGATGAT 2914 Query 2877 TCCTCCGTGTATCAAGAAGTTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGTCATGCAAGAAGCTA 2936 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2915 TCCTCCGTGTATCAAGAAGGTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGGCATGCAAGAAGCTA 2974 Query 2937 CAATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTC 2996 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2975 CAATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTC 3034 Query 2997 TCATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGAAGCATTACCATCAGTAA 3056 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 3035 TCATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGGAGCATTACCATTAGTAA 3094 Query 3057 TGTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATTAAAATGACTGACGCTGGTCATGATAT 3116 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || Sbjct 3095 TGTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATAAAAATGACCGACGCTGGTCATGACAT 3154 Query 3117 CAAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGGTCTGGATCTTTCGACAGAGGAGTATTC 3176 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || Sbjct 3155 TAAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGATCTGGATCTTTGGACGGAGGAGTACTC 3214 Query 3177 TTTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCG 3236 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3215 TTTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCG 3274 Query 3237 ACTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGCTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAG 3296 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3275 ACTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGTTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAG 3334 Query 3297 CGAAAGGTGTACTATTCCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAAGTCCTGAAACGTT 3356 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || Sbjct 3335 CGAAAGGTGTACTATTTCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAACTCCTGAAACTTT 3394 Query 3357 GGCTCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACA 3416 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3395 GGCGCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACA 3454 Query 3417 GCCTTCATATAAACAGGACGACTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGT 3476 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3455 GCCTTCATATAAGCAGGACGATTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGT 3514 Query 3477 CAGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATAGAAAAAGCATTTTGTC 3536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3515 CAGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATAAAAAAAGCATTTTGTC 3574 Query 3537 TTTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCGCTGGTACCTCAGGAA-CCT 3595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| Sbjct 3575 TTTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCCCAGGTACCTC-GGAAGCCT 3633 Query 3596 TTTTGGGGAAAGAATCCCATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAG 3655 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3634 TTTTGGGGAAAGAATTACATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAG 3693 Query 3656 TATTGATTTTCTCTCAATTTCTTGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTG 3715 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3694 TATTGATTTTCTCTCAATTTCTGGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTG 3753 Query 3716 CTGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCATTCATGTAATAAGATGAAATCTC 3775 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| Sbjct 3754 CTGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCAGTCGTATAATAAGATGAAAGCTC 3813 Query 3776 TGGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGCGGCCC 3835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3814 TGGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGGGGCCC 3873 Query 3836 TTGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAA 3895 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3874 TTGGTCTTGATTTGAGTTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAA 3933 Query 3896 GCTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTG 3955 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3934 GCTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTG 3993 Query 3956 TAGAAACCTTAACCATGTGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATG 4015 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3994 TAGAAACCTTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATG 4053 Query 4016 CAGAAAAGAGTGATAGATTATTCAGTGGAGATTACATAGAAGTGAAGCAGGAGACAACAC 4075 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4054 CAGAAAAGAGTGATAGATTATTGAGTGGAGATTACATAGAAGCGAAGCAGGAGACAACAC 4113 Query 4076 GGTGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGCAGAAAGCAATTACCTGTCTCGTCTTAGCTTTG 4135 || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4114 GGAGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGTAGAAAGCAATTACCTGTCTCATCTTAGCTTTG 4173 Query 4136 TCCGATGCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGGTCACC 4195 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4174 TCCGATCCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGATCACC 4233 Query 4196 AATTAGCTTAAGAAAAGTAGGtttttttttGTAATCACAACAAATAATTGTTACACATTT 4255 |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||| Sbjct 4234 AATTAGCTTAAGAAAAGTAGGTTTATTTT-GTAATCACAACAGTTCATTGTTACATATTT 4292 Query 4256 TTAAGTTTGGATATAAACTAGGATAAATATAAGGCCGATCATTGCAAA 4303 || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 4293 TT---TT-GGATATAAACTAGGATAAATATAAAGCCGATCATTTCAAA 4336 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 214513848268 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5