BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485847
Length=4303
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G54460.1 | Symbols: | SNF2 domain-containing protein / heli... 6761 0.0
> AT3G54460.1 | Symbols: | SNF2 domain-containing protein / helicase
domain-containing protein / F-box family protein | chr3:20161942-20167293
REVERSE LENGTH=4352
Length=4352
Score = 6761 bits (3661), Expect = 0.0
Identities = 4101/4308 (95%), Gaps = 51/4308 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 31 AGAAAGATGCGAtttttttAGAGAAAATCTATAAAGCCTTAT-ACTTTCTGCATTC-CGT 88
||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| | ||| | ||| |
Sbjct 45 AGAAAGATGAGATTTTCCTAAAGCAAATCTACAAAGCCTTATAAATTT-TTTTTTCTGGC 103
Query 89 GGTCGAGGGCCGATGATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 148
|| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 GG-CGATGGCC---GATGATCACAAACTCTGTGGTTTTCTCTGTACCGTTCTTTCCGTCG 159
Query 149 ATTCGCCTGGTCTTCTTCAATTGGGCTCTTCCTGTTTCATCTTCAATGA--------T-- 198
||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
Sbjct 160 ATTCGCCTGATCTTCTTCAATCGGGCTCGTCTTGTTTCATCTTCAATGATGGTTCCGTCA 219
Query 199 --GGTTTCAAATCCGACAATGGCTTGATCTTATCCCTCATC-AATCCCATCTCTAATCTC 255
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 220 CCGGTTTCAAATCCGAAAATGGCTTGATCTTATCCCTCA-CTAATCCCATCTCTAATCTC 278
Query 256 AAATCCCTAATTTCGTCTGAAGGAGATCA-GA-ATT--G---T--GG------TGAAGAC 300
|||||||||||||||| |||||||||| || || | | || |||||||
Sbjct 279 CAATCCCTAATTTCGTCAAAAGGAGATCATGATGTTGAGAATTCCGGAACAATTGAAGAC 338
Query 301 GGTGGATTGCAGACTCCACAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTCGTACA 360
||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 339 GGTCGATTGGAGACTCCGCAGAAACGCCGTAAGTGCGTTGAGGGAGAGAGTAGTGGTA-A 397
Query 361 -CGAAAGTCTCCGAAGTCGAAGAGCCGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACCGTACA 419
|||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 398 GCGAAAGACTCCGAAATCGAAGAGACGAGTTTTATCCGGGAGCAAGGAGAAGACTGTACA 457
Query 420 GGGGAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGCATGGTGAATGGAAGCATAAGTGTAGTGCAGCA 479
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 458 GGGAAGGAAGAGGGTAAAGAGTATAGGTATGGTGAATGGAAGTATAAGTGTAGTGCAGCA 517
Query 480 GCTTCACGCTTTGGTTGCCAACAAATGTTTGAAGA-TATTTTCTCAAGTGGTGAAGATTG 538
|||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||||||| |||
Sbjct 518 GCTTCATGCTTTGGTTGCTAATAAATGCTTGAAGATTA-TATGTCGTGTGGTGAAGGTTG 576
Query 539 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGCTAGTTGATGTTTACTTACCTATTG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||
Sbjct 577 ATAAAGGTGAGAATGGAGAAGAAAGAGCTGTGGTGTTAGTTGATGTTTACCTGCCTATTG 636
Query 599 CATTGTGGTCCGGGTGGCAATTTCCCAAATCCCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTCAAGC 658
|||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 637 AATTGTGGTCCGGATGGCAATTTCCTAAATCTCAAGCTACTGCTGCTGCATTGTTTAAGC 696
Query 659 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGGGAAAGTGTTTGGGAAG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 697 ACTTGAGCTGTGACTGGGGACTGAGAGTCTCAATCCTTGACGGAAAAAGTATTTGGGAAG 756
Query 719 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCCGACTGTCATGTGTTTAATTGCA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||
Sbjct 757 AGGCCAATGGAAGAATAAAGGCCATCTGGGATCTATCTGACTGTCATGTGTTTGACTGCA 816
Query 779 AATTACTCTGTAATGCCCCAGATTCTCCAAAAAGACGATTGTTCAAACTACATGAAATCT 838
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |
Sbjct 817 AATTACTCTGTAATGCCCCAAATTCTCCAAAAAGACGGTTATTTAAACTACATGAAATTT 876
Query 839 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTGTTCTTCTAGAGTATTACCGT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 877 TTAAGAGCTTGCCCAGTCCAGGAAATCATGATGTGTCTTATTCTTCTAGAGTATTGCCGT 936
Query 899 CTACTGACTCTTGTGCATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 958
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 CTACTGACTCTTGTGTATCTGGTGTATGGGATCTCTCAGATGACGTTTTGATTAGCATAC 996
Query 959 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTTCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 TGATGAAACTTGACACGAAGGATCTTTTTAGCATTGCAGCAGTCTGCCGTCTCTTCAGAT 1056
Query 1019 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 CATTGACCTCTCTAATTGTGCCATGTATGAATCTAAAACTCTTTCCTCATCAGCAGGCAG 1116
Query 1079 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 CAGTTGGTTGGATGCTGGAGCGTGAGAGGAAAGCTGAAGTTTCCTCGCATCCCCTTTACT 1176
Query 1139 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTATGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 TGAGTTTTGATACTGAGGATGGGTTTAGTTTCTACGTAAATGCTGTGACTGGTGATATAA 1236
Query 1199 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTTCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 TCACTGAGGCAGCTCCCATGGTCAAGGATTTCCGTGGGGGAATGTTCTGCGATGAACCAG 1296
Query 1259 GTCTCGGAAAGACGATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1318
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 GTCTCGGAAAGACAATAACAGCATTATCCCTTATCCTAAAGACGCAGGGAACAATGGCTG 1356
Query 1319 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACACATAAAAGTGACAAAAAATGCGCCT 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1357 ATCCGCCTGAGGGACTTCCTATCGTTTGGTGTACCCACAAAAGTGACAAAAAATGTGCCT 1416
Query 1379 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTTTGCTGTAAAGAGGTTTC 1438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1417 ATTATGAGTACACGAGTGACCAGTTCACTTCTAACAGCATGTCTGCTGTAAAGAGGTTTC 1476
Query 1439 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGTTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1498
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 AAAGTCCAAGTAGCTGTCGAAACCAGGTTTCTTTTGAAGCCTTTCGTCCGCTGCTGGAGT 1536
Query 1499 CGAAATCGTTGCCACTTAAGCAAGCTAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1558
| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1537 CAAAATCGTTGCCATTTAAGCAAGCGAGGCTGATGGATCCAGATGATCAAACATTGGAGT 1596
Query 1559 CTAAGAACTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACCCACATCCCTGCGTCCCTGGATGTAA 1618
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1597 CTAAGAATTCAAACTTTGAAAACGAATTTGAAACTCACATCCCTGCGTCCCTGGATTTAA 1656
Query 1619 AAGCTCAATGTAGAAAGCCCTTGGGTAATGTCAGGAAAAATCTCTTGCATGTATATGATG 1678
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||
Sbjct 1657 AAGCTCAATGTAGAAAGAGCTTGGGTAATGTCAGAAAAAATCTCTTGCCTGCATATAATG 1716
Query 1679 GCGCATCTGAGCTCTCCAAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCGGTAATTGGAAGAAATGTG 1738
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1717 GCGCATCTGAGCTCTCTGAAGTGATGGAAGCTAAAAGAATCAGTAATTGGAAGAAATGTG 1776
Query 1739 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTATGATAACAGGTTGCAAGAGAAAGGGTCTTACTGATTCGGATGTGGAAAGCGATATTT 1836
Query 1799 GGATACAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1858
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 GGATGCAGTGTGATTCTTGCTCAAAGTGGCGGAGAATAATAGATGAAGGTGTATCTGTTA 1896
Query 1859 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATGCTGACCCTGCATATCAGAGTTGTAATGATC 1918
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1897 CTGGTTCTGCATGGTTTTGTAGCAACAATAATGACCCTGCATATCAAAGTTGTAATGATC 1956
Query 1919 CTGAAGAATTATGGGATAGATCTCAACCTATAAAATTCTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 1978
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 CTGAAGAATTATGGGATAAATCTCAACCTATAAAATACTTGCAAGGGTTTTATACTAAGG 2016
Query 1979 GAGCCTCTGGTGAAGAAAATGATAATATCTCTTTCTTCACCAGTGTCCTTCGGGAACACA 2038
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2017 GAGCCTCTGGGGAAGAAAGTGATAATATCTCTTTCTTCACGAGTGTCCTTCGGGAACACA 2076
Query 2039 AGTCTTCAGTAAACTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2098
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 AGTCTTCAGTAAGCTCAACCGTAAAGAAAGCCTTAATTTGGCTTGCTAAACTCCCTCTTG 2136
Query 2099 AGAAACTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTTGAATAA-- 2156
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2137 AGAAGCTCTCACAGATGGAAACAGTTGGCTTACCTGGTCCAGTGTTGGGTTT-AA-AATT 2194
Query 2157 AGATGCCCTTGGGTTCCAGACAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAA 2216
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 AGATGCCCTTGGGTTCCAGAGAATATTTCGAGCATTTGGTCTTAAGAGTAGAGTTGAAAA 2254
Query 2217 GGGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGC 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2255 GGGTGTCACCAAATGGTTTTACCCGAAGTTTCTTGAGAACTTAGTATTTGATGTACCTGC 2314
Query 2277 CCTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAAC 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 CCTCAAAGTTGCTCTCTGTCAGCCGCTGGATACATTTAGACTGTATTTGTCAAAAGCAAC 2374
Query 2337 TCTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGACAACACAAATCCAAAAACATGT 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2375 TCTAATCGTCGTCCCCACAAATTTAGTTAATCATTGGTTAACACAAATCCAAAAACATGT 2434
Query 2397 TTGCTCTGATCAGCTTCGCCTTCTTGTTTGGACTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAG 2456
|||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 TTGCTCTGATCAGCTTCGTATTCTCGTTTGGGCTGACCATATAGAGCTTTCTCCACACAG 2494
Query 2457 CTTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 CTTGGCTTGGGATTATGATGTTGTGATCACAACTTTTAGTCGCTTAAGTGCGGAATGGAA 2554
Query 2517 TCCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGG 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2555 TCCCCGGAAGAAAAGCCCATTGATCCAAGTGCATTGGCTTAGGGTCATGCTAGATGAAGG 2614
Query 2577 ACACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTTTGAC 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2615 ACACACTCTTGGTTCTAGTGTCAGTTTGACTAATAAATTTCAGATGGCTGTTTCTCTGAC 2674
Query 2637 AGCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCT 2696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2675 AGCTTGTAATCGTTGGCTATTGACAGGAACACCAACCCCTAACACACCAAATAGCCAGCT 2734
Query 2697 TTCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGAAAGTATATGGAGAAAATCCAAA 2756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 2735 TTCACATATCCAACCTCTTTTAAAGTTTCTTCACGAGGAAGTCTATGGAGAAAATCCAAA 2794
Query 2757 GTTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCG 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2795 GTTTTGGGAAGCTGGCATCCTTAGACCATTTGAAGCAGAAATGGAGGAGGGTCGTTTGCG 2854
Query 2817 TTTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGAAGATGAT 2876
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2855 TTTACTTCAGCTGCTTCAGAGATGCATGATAAGCTCTAGAAAGAAAGATCTGCAGATGAT 2914
Query 2877 TCCTCCGTGTATCAAGAAGTTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGTCATGCAAGAAGCTA 2936
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2915 TCCTCCGTGTATCAAGAAGGTGACATACCTTAATTTCCTTCCAGGGCATGCAAGAAGCTA 2974
Query 2937 CAATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTC 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2975 CAATGAACTAGTGGAGACAGTTAGGCGTAATATCTTATTAGCTGATTGGAATGATCCGTC 3034
Query 2997 TCATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGAAGCATTACCATCAGTAA 3056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 3035 TCATGTAGAAAGTCTGCTTAACTCTAAACAGTGGAAATTTCGGAGCATTACCATTAGTAA 3094
Query 3057 TGTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATTAAAATGACTGACGCTGGTCATGATAT 3116
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3095 TGTCAGACTATCTTGCTGTGTGGCTGGGCATATAAAAATGACCGACGCTGGTCATGACAT 3154
Query 3117 CAAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGGTCTGGATCTTTCGACAGAGGAGTATTC 3176
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||
Sbjct 3155 TAAAGAGACAATGGATGCTTTACTTGAAAATGATCTGGATCTTTGGACGGAGGAGTACTC 3214
Query 3177 TTTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCG 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3215 TTTTATTCAAGATAGCCTTATTGGTGGCTGTAACTGTAAAAGATGTGGGGAATGGTGCCG 3274
Query 3237 ACTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGCTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAG 3296
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3275 ACTTCCTGTTATCACTCCATGTAGACACCTGTTGTGCCTTGATTGTGTTGCTCTTGATAG 3334
Query 3297 CGAAAGGTGTACTATTCCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAAGTCCTGAAACGTT 3356
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 3335 CGAAAGGTGTACTATTTCTGGTTGTGGATATTTATATGAGATGCAAACTCCTGAAACTTT 3394
Query 3357 GGCTCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACA 3416
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395 GGCGCGACCAGAAAATCCAAATCCAAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTTATTGAGTTACA 3454
Query 3417 GCCTTCATATAAACAGGACGACTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGT 3476
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455 GCCTTCATATAAGCAGGACGATTGGAATCCTGACTGGCAATCTACGTCCAGCAGTAAAGT 3514
Query 3477 CAGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATAGAAAAAGCATTTTGTC 3536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3515 CAGTTATCTCGTAGACAGGCTGAGGAAGTTACATGAGGGTAATAAAAAAAGCATTTTGTC 3574
Query 3537 TTTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCGCTGGTACCTCAGGAA-CCT 3595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||
Sbjct 3575 TTTCAACAAGACTGACAATGACAACCTGGAAGACAATCCCCCAGGTACCTC-GGAAGCCT 3633
Query 3596 TTTTGGGGAAAGAATCCCATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAG 3655
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3634 TTTTGGGGAAAGAATTACATGGACAGGATTGTGGATCTCAGATGGTATTTGTTGATAAAG 3693
Query 3656 TATTGATTTTCTCTCAATTTCTTGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTG 3715
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3694 TATTGATTTTCTCTCAATTTCTGGAGCATATTCACGTGATTGAACAACAGTTGACAACTG 3753
Query 3716 CTGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCATTCATGTAATAAGATGAAATCTC 3775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||
Sbjct 3754 CTGGCATCAAGTTTGGTAAAATGTACAGTCCAATGCAGTCGTATAATAAGATGAAAGCTC 3813
Query 3776 TGGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGCGGCCC 3835
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3814 TGGCAATGTTCCAGAACGATGCTGATTGCATGGCACTTTTGATGGATGGAAGTGGGGCCC 3873
Query 3836 TTGGTCTTGATTTGAGCTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAA 3895
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3874 TTGGTCTTGATTTGAGTTTTGTAACACATGTTTTCCTGATGGAACCAATCTGGGATAAAA 3933
Query 3896 GCTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTG 3955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3934 GCTTGGAAGAGCAAGTCATCAGTCGTGCTCATCGGATGGGCGCAAAGCGCCCTATTTTTG 3993
Query 3956 TAGAAACCTTAACCATGTGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATG 4015
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3994 TAGAAACCTTAACCATGCGTGGCACGATTGAAGAACAAATGATGAGATTCCTAGAGGATG 4053
Query 4016 CAGAAAAGAGTGATAGATTATTCAGTGGAGATTACATAGAAGTGAAGCAGGAGACAACAC 4075
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4054 CAGAAAAGAGTGATAGATTATTGAGTGGAGATTACATAGAAGCGAAGCAGGAGACAACAC 4113
Query 4076 GGTGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGCAGAAAGCAATTACCTGTCTCGTCTTAGCTTTG 4135
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4114 GGAGCCGCCGAACGCTACATGATTTGGTAGAAAGCAATTACCTGTCTCATCTTAGCTTTG 4173
Query 4136 TCCGATGCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGGTCACC 4195
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4174 TCCGATCCGATGGCAAAATGGAATTTGCAGCTTCGCAGCTTGCAGGTTTAAAAGATCACC 4233
Query 4196 AATTAGCTTAAGAAAAGTAGGtttttttttGTAATCACAACAAATAATTGTTACACATTT 4255
|||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 4234 AATTAGCTTAAGAAAAGTAGGTTTATTTT-GTAATCACAACAGTTCATTGTTACATATTT 4292
Query 4256 TTAAGTTTGGATATAAACTAGGATAAATATAAGGCCGATCATTGCAAA 4303
|| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 4293 TT---TT-GGATATAAACTAGGATAAATATAAAGCCGATCATTTCAAA 4336
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214513848268
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5