BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg485955
Length=4627
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G55320.1 | Symbols: PGP20 | P-glycoprotein 20 | chr3:205069... 7590 0.0
AT2G39480.1 | Symbols: PGP6 | P-glycoprotein 6 | chr2:16477792-... 4626 0.0
> AT3G55320.1 | Symbols: PGP20 | P-glycoprotein 20 | chr3:20506992-20513393
REVERSE LENGTH=4626
Length=4626
Score = 7590 bits (4110), Expect = 0.0
Identities = 4468/4640 (96%), Gaps = 27/4640 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCACTAACTCCA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCATTAACTCCA 60
Query 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCACCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
Query 121 TCTGGTGGTGGCACAGGTGC-C-GCGGCGGCGCAAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATG 178
|||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCTGGTGGTGGCAC-GG-GCACGGCGGCGGCGCTAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATG 178
Query 179 AGCAAGACGAGGTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCG 238
| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 ATCAAGATGAGCTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCG 238
Query 239 CTGACCGGTTCGATTGGGGGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTA 298
||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 CTGACCGCTTTGATTGGGTGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTA 298
Query 299 CTGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAGGATTGTTGATGTTCTTGCTTTCTCTA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 CTGCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAAGATTGTTGATGTTCTTGCTTTCTCTA 358
Query 359 CTGATTCGAGTCAGCAGAGATCTGAACATCAGTTTGACCGACTCGTTGAGCTTTCGTTGA 418
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 359 ATGATTCTAGTCAGCAGAGATCTGAACACCAGTTTGACCGACTCGTCCAGCTTTCGTTGA 418
Query 419 CTATTGTGTACATTGCCGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 478
| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CGATCGTGTACATTGCTGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 478
Query 479 TACTGACGGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTGA 538
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TACTGACTGGAGAAAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTGA 538
Query 539 ATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACGTATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTGC 598
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 ATCAAGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTGC 598
Query 599 TAAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCATA 658
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TGAGCGATGTCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCATA 658
Query 659 ACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCAT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 ACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCAT 718
Query 719 TGATTACACTAGCCACCGGCCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTTC 778
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 719 TGATTACACTAGCCACTGGTCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATTTTTC 778
Query 779 TTCACAGACTTGCTGAGAACATACAAGACGCATATGCTGAAGCAGCCGGTATTGCTGAAC 838
| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 779 TACACAGACTTGCTGAGAACATACAGGATGCATATGCTGAAGCAGCCGGCATTGCTGAAC 838
Query 839 AGGCGATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAATATT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AGGCGATCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAATATT 898
Query 899 CATATGCAACTTCCCTTCAAGCAACCTTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGCAAG 958
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CATATGCAACCTCCCTTCAAGCAACCCTGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGCAAG 958
Query 959 GCCTTGGACTTGGGTTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTTGGA 1018
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 GCCTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTTGGA 1018
Query 1019 TTGGACGATTCTTTGTTCACAATGGAAGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAGCTCTTT 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 TTGGACGATTCTTTGTTCACAATGGAAGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAGCTCTTT 1078
Query 1079 TTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTAGGATTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTATTCTTTTG 1138
|||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1079 TTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTGGGGTTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTACTCTTTTG 1138
Query 1139 ATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTTCTGTGG 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 ATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTTCTGTGG 1198
Query 1199 CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAGGGAAATATTGAGTTCCGGAATGTAT 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAAGGAAATATTGAGTTCCGGAATGTAT 1258
Query 1259 ATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTCACGGTTC 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTCACGGTTC 1318
Query 1319 CTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTC 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 CTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGCATCATTC 1378
Query 1379 CTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCAACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGAGAAAATA 1438
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 CTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCGACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGAGAAAATA 1438
Query 1439 TTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGCTGGTTACCCAGGAGCCTG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1439 TTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGTTGGTTACCCAGGAGCCTG 1498
Query 1499 CTCTGCTAAGCTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCGTATGGTCGTGATGCTACTCTTGATC 1558
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 CTCTGCTTAGCTTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATATGGTCGTGATGCTACTCTTGATC 1558
Query 1559 AGATAGAGGAGGCAGCTAAAATTGCGCATGCACACACATTTATCAGCTCACTTGCAAAAG 1618
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1559 AGATAGAGGAGGCAGCTAAAAATGCGCATGCGCACACATTTATCAGCTCACTTGAAAAAG 1618
Query 1619 GATATGAAACGCAGGTTGGGAGAGCAGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGAAAATTAAAC 1678
|||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 GATATGAAACACAGGTCGGGAGAGCCGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGAAAATTAAAC 1678
Query 1679 TTTCGATTGCTAGAGCTGTGCTTTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGATGAAGTAACTG 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 TTTCGATTGCTAGAGCTGTGCTTTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGATGAAGTAACTG 1738
Query 1739 GAGGATTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTGG 1798
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 GAGGACTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCTTCTGATGTTGG 1798
Query 1799 GACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGCTGACTATATTG 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGCTGACTATATTG 1858
Query 1859 CCGTGATGGAGGAGGGTCAGCTCGTTGAAATGGGTACACACGATGAATTGATAAATCTTG 1918
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 CTGTGATGGAGGAGGGTCAGCTCGTTGAAATGGGTACACACGATGAATTGATAAATCTTG 1918
Query 1919 GTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTCCAAGAAGGATGC 1978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTCCAAGAAGGATGC 1978
Query 1979 CAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTCAGGTCGAGAGAGACTCTTCAGCTGGCT 2038
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 CAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTGAGGTCGAGAGAGACTCTTCAGCTGGCT 2038
Query 2039 GTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATCAAGTCTCCATCTCTTCAAAGAGGTA 2098
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAATGATTAAGTCTCCATCTCTTCAAAGAGGTA 2098
Query 2099 ATGGTGTGTTCCGTCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAATCACCTAAAGATCATA 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2099 GTGGTGTGTTCCGTCCCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAATCACCTAAAGCTCATA 2158
Query 2159 GCCCTGCACCTGAGAAAATGGGGGAAAATGGCTTGCCTCTGGAC-GATGCTGATAAAGAG 2217
|||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2159 GCCCTGCATCTGAGAAAACAGGGGAAGATGGCATGTCTCTGGATTG-TGCTGATAAAGAG 2217
Query 2218 CCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTACCAGACCTTCCGAAAATTGAC 2277
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||
Sbjct 2218 CCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTGCCACACCTTCCTAAAGTTGAC 2277
Query 2278 GTTCAGTGTCCCCGACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAGAGTCCCCTGTTTCACCCCTT 2337
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GTTCAGTGTCCCCAACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAGAGTCCCCTGTTTCACCCCTT 2337
Query 2338 TTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGACGTTTATTCGTCCTCTTAGT 2397
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2338 TTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGACGTTTAGTCGTCCTCTTAGT 2397
Query 2398 TCTCCAGATGACACTACTGCAAATGGTAAGGCGTCTAAGGATGCTCAACACAAGGAGTCA 2457
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 TCTCCTGATGACACTAAAGCAAATGGTAAGGCGTCTAAGGATGCTCAACACAAGGAGTCA 2457
Query 2458 CCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAGTGGCTTTATGCTGTATTAGGA 2517
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 CCTTCGTTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAGTGGCTTTATGCTGTATTAGGG 2517
Query 2518 AGTCTCGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTGGCTTATGTCATTGCGTTG 2577
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518 AGTCTTGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTTCTGGCTTATGTCATTGCGTTG 2577
Query 2578 GTAGTGACGGCATATTATAAAAGCAAAGGAGTCCACCTGCGCGAGGAGGTTGACAAATGG 2637
||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578 GTAGTTACGGAATATTATAAAAGCAAAGGAGGCCACCTGCGCGAGGAGGTTGACAAATGG 2637
Query 2638 TGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCACTTC 2697
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2638 TGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGTTGCCAATTTCTTGCAGCATTTC 2697
Query 2698 TATTTTGGGATAATGGGGGAGAAAATGACAGAGAGAGTTCGGAGGATGATGTTCTCAGCA 2757
|||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 TATTTTGGCATAATGGGAGAGAAAATGACGGAGAGAGTTAGGAGGATGATGTTCTCAGCA 2757
Query 2758 ATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTTCGATGATGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCC 2817
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 ATGCTGCGTAACGAAGTTGGATGGTTCGATGATGAAGAGAACAGTCCAGATACATTATCC 2817
Query 2818 ATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTGCGTTCAGCAACAGGCTTTCAATA 2877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 ATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTGCCTTCAGCAACAGGCTTTCAATA 2877
Query 2878 TTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATAGTTGCTCTTCTTATCGGGTTGGC-GCTTGGTTG 2936
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||
Sbjct 2878 TTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATTGTTGCTCTTCTGATTGGGTTG-CTGCTTGGTTG 2936
Query 2937 GCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAATTCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCA 2996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937 GCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAATTCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCA 2996
Query 2997 GAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACAGGAGATGCATAGAAAGGCATCTTT 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 2997 GAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACAGGAGATGCACAGAAAAGCATCTTT 3056
Query 3057 AGTCCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGTTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAA 3116
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 AGTTCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGTTGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAA 3116
Query 3117 AGTGATGGAACTGTACAGGATGCAACTCCAGCGGATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGG 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3117 AGTGATGGAACTGTACAGGATGCAACTCCAGCGGATACTCAGACAGAGCTATCTCCATGG 3176
Query 3177 GATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGTTTCTTCTTTTCGCCTGCAATGCGCT 3236
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3177 GATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGTTTCTTCTTTTCGCCTGCAACGCGCT 3236
Query 3237 CCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTCAACCGTGGATATATGAAGTTATCAACAGCTAT 3296
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3237 CCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTTAACCGTGGATATATGAAATTATCGACAGCTAT 3296
Query 3297 AACAGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTCGCCCTTGTCGAGCCATTTGGATTAGC 3356
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3297 AACGGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTCGCCCTTGTGGAGCCATTTGGATTAGC 3356
Query 3357 ACCGTATATTCTCAAGCGACGCAAGTCTCTGATTTCAGTGTTTGAAATCA-TAGATCGAG 3415
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 3357 ACCGTATATCCTCAAGCGACGTAAGTCTCTGATATCAGTGTTTGAAAT-AGTCGATCGAG 3415
Query 3416 TCCCTACAATTGAACCAGATGATAACTCTGCTCTCAAACCGCCTAATGTCTACGGAAGCA 3475
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3416 TCCCTACGATTGAACCAGATGATAACTCTGCTCTCAAACCTCCTAATGTCTACGGAAGTA 3475
Query 3476 TTGAATTGAAAAACATAGACTTCTGCTACCCAACTCGACCCGA-AGTACTAGTGCTGAGC 3534
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3476 TTGAATTGAAAAACGTAGACTTCTGCTACCCAACTCGACCCGAGA-TACTAGTGCTGAGC 3534
Query 3535 AACTTCAGTCTCAAAGTCAGTGGCGGACAGACAGTAGCTGTGGTTGGCGTTTCAGGTTCT 3594
||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3535 AACTTTAGTCTCAAAATCAGTGGCGGACAGACTGTAGCTGTTGTTGGCGTTTCAGGTTCT 3594
Query 3595 GGAAAAAGCACAATAATCTCACTGGTAGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGTCAAGTC 3654
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3595 GGAAAGAGCACGATAATCTCACTAGTAGAGAGATACTACGACCCAGTTGCTGGCCAAGTC 3654
Query 3655 CTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAATTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGT 3714
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3655 CTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAACTTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGT 3714
Query 3715 TTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACGACGATCAGAGAGAATATCATATATGCA 3774
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3715 TTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACAACAATCAGAGAGAATATCATATATGCA 3774
Query 3775 AGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCTAATGCTCACCAT 3834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3775 AGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAAGCAGCAAGAATTGCAAATGCTCACCAT 3834
Query 3835 TTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTATGACACACATATCGGGATGAGAGGGGTAGAACTT 3894
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3835 TTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTACGACACACATATTGGGATGAGAGGCGTAGAACTT 3894
Query 3895 ACCCCGGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCACGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCCATT 3954
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3895 ACCCCTGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCACGCGTAGTACTGAAGAATGCTCCCATC 3954
Query 3955 ATCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGGCTATCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAG 4014
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3955 ATCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGTCTATCGAATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAG 4014
Query 4015 GCTCTTGACACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCGCATAGAGCGGCT 4074
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4015 GCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACAAAACAACAATTCTGATAGCACATAGAGCGGCT 4074
Query 4075 ATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTGCTCAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGT 4134
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4075 ATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTACTTAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGT 4134
Query 4135 ACACATGATTCTTTAGCAGCAAAGAATGGATTGTATGTACGTTTGATGCAACCACATTTT 4194
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4135 ACACATGATTCTTTAGCAGCAAAAAATGGGTTGTATGTACGTTTGATGCAACCACACTTT 4194
Query 4195 GGTAAAGGTCTACGCCAACATCGACTGATATAGAGTTTTGAGGCTCCATAAATGATCGTG 4254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 4195 GGTAAAGGTCTACGCCAACATCGACTGATATAGAGTTTTGAGGCTCCATCAATGATAATG 4254
Query 4255 ATTTTGGCATCTCTGATCAATGATTCTCGGGAGTCGGGAGGGAT-ACACGATGTTCaaaa 4313
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||||
Sbjct 4255 ATTTTGGCATCTCTGATCAATGATTCTC------CGG-AGG-ATTACAAGATGTTCAAAA 4306
Query 4314 aaaaC--TATACAACCACGGTTAGTTCTCTAGCAGATAGGGCCTGTAGATGTAGATTTCC 4371
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4307 AAAACCCTATACAACCACGGGTAGTTCTCTAGCAGATAGGGCCTGTAGATGTAGATTTCC 4366
Query 4372 ATGGTCTTCGAGCTGCTTATTCTTTTTT-GGAAACGAAGCATCAGAAGTAGGTCATGGTC 4430
|| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4367 ATAGTCTTCGAGCTGCTTATTCTTTTTTTGGAGACGAAGCATCAGAAGTAGGTCATGGTC 4426
Query 4431 ATTGCTTCGTTCTCCAAAGTATATCGATTTTGTCTATTGAATCTGAAGATTTTAGGAGGT 4490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4427 ATTGCTTCGTTCTCCAAAGTATATCGATTTTGTCTATTGAATCTGAATATTTTAGGAGGT 4486
Query 4491 TGGTAAATCATTTTGGAGGCTGTTTATTTATCTTTCCTTTAT-T-TGTCTGTGCTGGTTT 4548
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 4487 TGGTAAATCATTTTGGAGGCTGTTTATTTGCCTTTCCTTTATATGTGTCTGTGCTGGTTT 4546
Query 4549 GTTGTTGCAAAAACATGGATGATGTATGTAAAGCTTTA-AAAATTGTAGAGAATGTGTAA 4607
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||
Sbjct 4547 GTTCTTGCAAAAACATGGATGATGTATGTAAAGCTTAAGAAAATAGTTGAGAATGTGTAA 4606
Query 4608 ATGTATTCACTTATTATTGC 4627
||||||||| |||| |||||
Sbjct 4607 ATGTATTCATTTATCATTGC 4626
> AT2G39480.1 | Symbols: PGP6 | P-glycoprotein 6 | chr2:16477792-16485039
REVERSE LENGTH=4893
Length=4893
Score = 4626 bits (2505), Expect = 0.0
Identities = 3687/4259 (87%), Gaps = 75/4259 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATGATCTCTAGAGGTTTATTCGGATGGTCTCCGCCTCATATGCAACCACTAACTCCA 60
|||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 213 ATGATGATTTCGAGAGGTTTGTTTGGTTGGTCTCCGCCGCATATACAACCGTTAACTCCT 272
Query 61 GTCTCTGAAGTCTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCTTCTCCTTATCTCGACCCTGGTGCTGAG 120
|| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 273 GTTTCTGAAGTTTCCGAGCCTCCTGAGTCTCCATCTCCTTACCTTGATCCTGGTGCTGAG 332
Query 121 TCTGGTGGTGGCACAGGTGCCGCGGCGGCGCAAGCGGAGGCTGATGAAGAGATGGATGAG 180
| ||||| ||| | | | |||||||||||||| | ||| || || ||||| |||
Sbjct 333 -C--ACGGTGGTACA-G-G-AACAGCGGCGCAAGCGGATGATGAGGAGGAAATGGAGGAG 386
Query 181 CAAGACGAGGTTGAACCACCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTCTTCGCTTGCGCT 240
| || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 387 CCGGAGGAGATGGAGCCTCCTCCTGCTGCTGTTCCTTTCTCTCAGCTATTTGCTTGTGCT 446
Query 241 GACCGGTTCGATTGGGGGCTTATGATTGTTGGCTCTGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTACT 300
|| || || ||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 GATCGCTTTGATTGGGTTCTTATGGTTTTTGGATCCGTTGCTGCTGCTGCTCATGGTACT 506
Query 301 GCGCTTATTGTCTACTTGCATTACTTCGCCAGGATTGTTGATGTTCTTGC-TTTCTCTAC 359
||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| | ||
Sbjct 507 GCGCTTATTGTTTACTTGCACTACTTCGCCAAAATTGTTCAGGTTCTTGCATTTC-CCAC 565
Query 360 TGATTC-GAGTCAGCAGAGATCTGAACATCAGTTTGACCGACTCGTTGAGCTTTCGTTGA 418
|||||| || ||| | || | ||| ||||||| | || ||| | ||||||||| |||
Sbjct 566 TGATTCGGA-TCATCTGATAAGTGATGATCAGTTCAATCGTCTCCTCGAGCTTTCGCTGA 624
Query 419 CTATTGTGTACATTGCCGGAGGTGTTTTCATTTCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 478
| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 CCATTGTATATATCGCTGGAGGTGTTTTCATATCTGGTTGGATTGAGGTGTCTTGCTGGA 684
Query 479 TACTGACGGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCCAAGTATGTCCAAGTATTATTGA 538
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | |
Sbjct 685 TACTGACTGGAGAGAGGCAGACTGCTGTGATCAGGTCAAAGTACGTCCAAGTGCTACTAA 744
Query 539 ATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACGTATGGTAATAATGGAGATATTGTGAGCCAAGTGC 598
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |
Sbjct 745 ATCAGGATATGAGTTTCTTTGATACATATGGGAATAACGGGGATATAGTAAGCCAAGTAC 804
Query 599 TAAGCGATG-TCTTACTCATTCAGTCAGCTTTAAGCGAGAAAGTTGGAAATTATATTCAT 657
| || |||| || |||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 805 TGAGTGATGTTC-TACTTATTCAGTCGGCTCTAAGTGAAAAAGTTGGGAATTACATTCAT 863
Query 658 AACATGGCTACGTTTATCAGTGGACTTGTTATTGGATTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCA 717
|||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 AACATGGCGACATTTATCAGTGGTCTTATTATTGGTTTTGTCAACTGCTGGGAAATTGCC 923
Query 718 TTGATTACACTAGCCACCGGCCCTTTCATCGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTT 777
| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 CTCATTACGTTAGCCACCGGTCCTTTCATTGTTGCTGCTGGAGGCATATCAAATATATTT 983
Query 778 CTTCACAGACTTGCTGAGAACATACAAGACGCATATGCTGAAGCAGCCGGTATTGCTGAA 837
|| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 984 CTCCACAGACTTGCTGAGAATATTCAAGATGCATATGCTGAAGCAGCCAGCATTGCTGAA 1043
Query 838 CAGGCGA-TCTCTTACATTAGGACTTTATATGCCTTTACAAATGAAACTCTAGCAAAATA 896
||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1044 CAGGC-AGTCTCTTATGTTAGGACTTTGTATGCCTTTACAAATGAAACTCTTGCAAAATA 1102
Query 897 TTCATATGCAACTTCCCTTCAAGCAACCT-TGAGATACGGCATATTAATTAGTCTTGTGC 955
|| ||||||||||| || ||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||
Sbjct 1103 CTCTTATGCAACTTCTCTCCAAGCAA-CTCTGAGATATGGTATATTGATTAGTCTTGTGC 1161
Query 956 AAGGCCTTGGACTTGGGTTTACTTATGGGCTTGCTATATGCTCGTGTGCGCTGCAACTTT 1015
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 1162 AAGGACTTGGACTTGGATTTACTTATGGGCTTGCTATATGTTCATGTGCTATGCAACTTT 1221
Query 1016 GGATTGGACGATTCTTTGTTCA--CAATGGA-AGGGCAAATGGTGGAGAAATCATAGCAG 1072
||||||| || ||||||||| | | || | || |||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1222 GGATTGGTCGGTTCTTTGTT-ATTC-AT-CATAGAGCAAATGGTGGAGAGATCATAACAG 1278
Query 1073 CTCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGCCTAGGATTAAATCAAGCTGCTACGAACTTCTATT 1132
| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 1279 CCCTTTTTGCTGTTATTTTAAGTGGGCTGGGTTTAAATCAAGCGGCTACAAACTTTTATT 1338
Query 1133 CTTTTGATCAAGGAAGGATTGCTGCGTATAGACTTTTTGAGATGATAACTCGTTCATCTT 1192
| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 1339 CATTTGATCAAGGAAGAATTGCGGCGTATAGGCTTTTTGAGATGATAAGTCGTTCATCCT 1398
Query 1193 CTGTGG-CTAACCAAGAAGGAGCTGTGCTGGCTTCTGTTCAGGGAAATATTGAGTTCCGG 1251
||| || |||| ||||| ||| | | || || |||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 1399 CTG-GGACTAATCAAGAGGGAATTATTTTGTCTGCTGTCCAAGGAAATATTGAGTTTCGG 1457
Query 1252 AATGTATATTTCAGTTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGCGGATTTTACCTC 1311
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1458 AATGTATATTTCAGCTATTTGTCACGACCTGAAATTCCAATCTTGAGTGGATTTTACCTT 1517
Query 1312 ACGGTTCCTGCTAAAAAAGCAGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGC 1371
|| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 ACTGTGCCGGCTAAAAAAGCTGTTGCACTTGTTGGTAGAAATGGTTCTGGAAAAAGCAGT 1577
Query 1372 ATCATTCCTTTAATGGAACGGTTTTATGATCCAACATTAGGAGAAGTTCTTCTTGATGGA 1431
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1578 ATCATTCCTCTAATGGAACGGTTTTATGATCCTACACTAGGAGAAGTTCTACTTGATGGA 1637
Query 1432 GAAAATATTAAAAATCTAAAACTGGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGGCTGGTTACCCAG 1491
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||
Sbjct 1638 GAAAATATTAAAAATCTAAAATTAGAGTGGCTGAGAAGCCAAATAGGCCTGGTGACACAG 1697
Query 1492 GAGCCTGCTCTGCTAAGCT-TGAGCATAAGAGAGAATATTGCGTATGGTCGTGATGCTAC 1550
||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||
Sbjct 1698 GAGCCTGCTTTGCTTAG-TCTGAGCATAAGAGAGAATATTGCATACGGCCGAGATGCTAC 1756
Query 1551 TCTTGATCAGATAGAGGAGGCAGCTAAAATTGCGCATGCACACACATTTATCAGCTCACT 1610
||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 TCTGGATCAGATAGAGGAAGCAGCTAAAAAAGCACATGCACACACATTTATCAGCTCACT 1816
Query 1611 TGCAAAAGGATATGAAACGCAGGTTGGGAGAG-CAGGTTTAGCAATGACAGAGGAGCAGA 1669
|| ||||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1817 TGAAAAAGGATATGAAACTCAGGTT-GGAAAGACTGGTTTAACGTTGACAGAGGAGCAGA 1875
Query 1670 AAATTAAA-CTTTCGATTGCTAGAGCTGTGCT-TTTGAATCCAACAATTCTTCTGCTTGA 1727
||| |||| || |||||||||||||| || || || | |||||||||||||| |||||||
Sbjct 1876 AAA-TAAAGCTATCGATTGCTAGAGCCGTACTCTTAG-ATCCAACAATTCTTTTGCTTGA 1933
Query 1728 TGAAGTAACTGGAGGATTAGACTTCGAAGCTGAAAGAATTGTGCAGGAAGCTCTTGATCT 1787
|| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1934 CGAGGTCACTGGAGGACTAGACTTTGAAGCTGAAAGAGTTGTCCAAGAAGCCCTTGATCT 1993
Query 1788 TCTGATGTTGGGACGGTCAACCATAATAATAGCCCGACGATTAAGTTTGATAAAAAATGC 1847
||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||
Sbjct 1994 TCTAATGTTAGGAAGGTCTACCATAATAATAGCCCGACGACTAAGTCTGATAAGAAATGC 2053
Query 1848 TGACTATATTGCCGTGATGGAGGAGGGTCAGCT-CGTTGAAATGGGTACACACGATGAAT 1906
|||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2054 TGACTATATTGCTGTAATGGAGGAGGGCCAGCTAC-TTGAAATGGGTACGCATGATGAAC 2112
Query 1907 TGATAAATCTTGGTGGGCTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTTC 1966
| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2113 TAATCAACCTTGGTAATTTGTATGCTGAGCTTCTGAAGTGTGAAGAAGCAACAAAGCTAC 2172
Query 1967 CAAGAAGGATGCCAGTTAGGAACTACAAGGAGTCTGCGGTGTTTCAGGTC-GAGAGAGAC 2025
| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| | ||||| ||
Sbjct 2173 CCAGACGGATGCCAGTTAGGAACTACAACGATTCTGCTGCGTTTCAGG-CTGAGAGGGAT 2231
Query 2026 TCTTCAGCTGGCT-GTGGCGTCCAAGAACCATCATCACCCAAAAT-GATCAAGTCTCCAT 2083
||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||
Sbjct 2232 TCTTCAGCTGG-TCGTGGCTTCCAAGAACCATCATCGCCCAAAATGGCT-AAGTCTCCAT 2289
Query 2084 CTCTTCAAAGAGGTAATGGTGTGTTCCGTC-CCCAGGAACTGTGTTTTGATACTGAAGAA 2142
||||||| |||||| || ||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||| |||||||
Sbjct 2290 CTCTTCAGAGAGGTCATAATGTTTTCCG-CTCCCAGGAATTGTGCTTTAATAGTGAAGAA 2348
Query 2143 TCACCTAAAGATCATAGCCCTGCACCTGAGAAAATGGGGGAAAATGGCTTG-CCTCTGGA 2201
|| || || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | | | ||||
Sbjct 2349 TCGCCCAATGATCATAGCCCTGCACCAGAGAAACTGGGAGAAAATGGCTCGTCGT-TGGA 2407
Query 2202 CGATGCTGATAAAGAGCCAACTATCAAAAGGCAAGATAGTTTCGAGATGAGGTTACCAGA 2261
| || ||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2408 TGTTGGTGAGAAGGAACCCACCATCAAAAGACAAGATAGTTTCGAGATGCGGTTACCAGA 2467
Query 2262 CCTT-CCGAAAATTGACGTTCAGTGTCC-C--CGACAAAAATCAAACGGCTCAGAGCCAG 2317
|| || ||||||||| |||||||||| | || || |||||||| || ||||| || |
Sbjct 2468 -ATTACCAAAAATTGACATTCAGTGTCCACAACGTCAGAAATCAAATGGTTCAGATCCGG 2526
Query 2318 AGTCCCCTGTTTCACCCCTTTTGACATCAGATCCTAAAAACGAGCGTTCCCATTCGCAGA 2377
|||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||
Sbjct 2527 AGTCCCCTATATCACCCCTTTTGATATCAGATCCCCAAAATGAGCGCTCTCATTCACAGA 2586
Query 2378 CGTTTATTCGTCCTCTTAGTTCTC-CAGATGACACTACTGCAAATGGTAAGGCGTCTAAG 2436
| |||| || |||||| | || | ||||||||||| | |||| || ||||| | | |||
Sbjct 2587 CTTTTAGCCGCCCTCTT-GGTCACTCAGATGACACTTCAGCAAGTGTTAAGGTGGCCAAG 2645
Query 2437 GATGCTCAACACAAGGAGTCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTCCCAGAG 2496
|| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2646 GACGGTCAACACAAGGAGCCACCTTCATTTTGGAGGTTGGCACAGCTTAGTTTTCCAGAG 2705
Query 2497 TGGCTTTATGCTGTATTAGGAAGTCTCGGTGCTGCCATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTT 2556
||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2706 TGGCTATACGCTGTATTAGGGAGTATTGGTGCTGCAATCTTTGGTTCTTTCAATCCTCTT 2765
Query 2557 CTGGCTTATGTCATTGCGTTGGTAGTGACGGCATATTATAAAAGCAAAGG-AGTCCACCT 2615
|| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| || || ||||||
Sbjct 2766 CTAGCTTATGTTATTGCATTAGTAGTGACGACATACTATACGAGCAAGGGAAG-CCACCT 2824
Query 2616 GCGCGAGGAGGTTGACAAATGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGGATTGTGACAGTTGT 2675
||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2825 GCGTGAAGAGGTTGACAAGTGGTGTTTGATCATTGCCTGCATGGGAATAGTGACAGTTGT 2884
Query 2676 TGCCAATTTCTTGCAGCACTTCTATTTTGGGATAATGGGGGAGAAAATGACAGAGAGAGT 2735
|||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2885 TGCCAATTTCTTACAGCACTTCTACTTTGGTATTATGGGGGAGAAAATGACTGAGAGAGT 2944
Query 2736 TCGGAGGATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGT-TCGATGATGAAG 2794
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||
Sbjct 2945 GCGGCGAATGATGTTCTCAGCAATGCTGCGTAATGAAGTTGGATGGTAT-GACGAAGAAG 3003
Query 2795 AGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGTTTAGCAAATGATGCTACTTTTGTCCGAGCTG 2854
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3004 AGAACAGTCCAGATACATTATCCATGCGCCTAGCAAATGATGCCACTTTTGTCCGAGCTG 3063
Query 2855 CGTTCAGCAACAGGCTTTCAATATTTATTCAAGATAGTTTTGCTGTTATAGTTGCTC-TT 2913
| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 3064 CCTTCAGCAACAGGCTTTCCATATTTATTCAGGATAGTTTTGCTGTTATCGTTGC-CATT 3122
Query 2914 CTTATCGGGTTGGC-GCTTGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTGGCAACTCTGCCAAT 2972
||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |
Sbjct 3123 CTTATTGGGCT-GCTGCTCGGTTGGCGTTTGGCCCTTGTTGCATTAGCGACTTTGCCAGT 3181
Query 2973 TCTCACTCTTTCTGCCATTGCTCAGAAACTGTGGCTTGCCGGATTCTCAAAAGGCATACA 3032
|| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||
Sbjct 3182 ACTTACTCTTTCTGCCATTGCCCAGAAACTTTGGCTTGCTGGATTCTCAAAGGGCATCCA 3241
Query 3033 GGAGATGCATAGAAAGGCATCTTTAGTCCTCGAGGATGCTGTTAGAAACATCTACACTGT 3092
|||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 3242 GGAGATGCATCGAAAGGCGTCCTTAGTACTCGAGGATGCTGTCAGAAACATATATACTGT 3301
Query 3093 TGTTGCTTTCTGTGCTGGTAACAAAGTGATGGAACTGTACAGGA-TGCAACTCCAGCGGA 3151
||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||
Sbjct 3302 TGTCGCGTTCTGTGCCGGCAACAAGGTGATGGAACTCTACA-GACTGCAACTCCAACGGA 3360
Query 3152 TACTCAGACAGAGCTATCTCCATGGGATGGCTATTGGTTTTGCGTTTGGTTTTTCACAGT 3211
||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||
Sbjct 3361 TACTCAGGCAGAGCTTTTTCCATGGGATGGCTATTGGCTTTGCGTTTGGCTTCTCACAGT 3420
Query 3212 TTCTTCTTTTCGCCTGCAATGCGCTCCTCCTATGGTGCACTGCGTTATCTGTCA-ACCGT 3270
||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| || | ||||
Sbjct 3421 TTCTTCTCTTCGCCTGTAATGCGCTCCTCCTGTGGTACACCGCGTTATCAGT-AGACCGC 3479
Query 3271 GGATATATGAAGTTATCAACAGCTATAACAGAGTACATGGTTTTCTCATTTGCTACATTC 3330
|||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3480 AGATATATGAAATTGTCTACAGCTCTAACCGAGTACATGGTCTTCTCCTTTGCTACATTT 3539
Query 3331 GCCCTTGTCGAGCCATTTGGATTAGCACCGTATATTCTCAAGCGACGCAAG-TCTCT-GA 3388
|| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |
Sbjct 3540 GCTCTTGTGGAGCCATTCGGATTAGCACCTTACATTCTCAAGCGCCG-TAGATCTCTCG- 3597
Query 3389 TTTCAGTGTTTGAAATCATAGATCGAGTCCCTACAATTGAACCAGATGATAACTCTGCTC 3448
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||
Sbjct 3598 CTTCAGTTTTTGAAATAATAGATCGAGTTCCTACAATCGAACCTGATGATACCTCGGCTC 3657
Query 3449 TCAAACCGCCTAATGTCTACGGAAGCATTGAATTGAAAAACATAGACTTCTGCTACCCAA 3508
| | |||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3658 TTAGTCCGCCTAACGTGTATGGAAGCATTGAACTGAAAAACATCGACTTCTGCTACCCAA 3717
Query 3509 CTCGACCC-GAAGTACTAGTGCTGAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAGTGGCGGACAGACA 3567
| || ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 3718 CCCG-CCCGGAAGTGTTAGTACTAAGCAACTTCAGTCTCAAAGTCAATGGCGGACAAACA 3776
Query 3568 GTAGCTGTGGTTGGCGTTTCAGGTTCTGGAAAAAGCACAATAATCTCACTGGTAGAGAGA 3627
|||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||
Sbjct 3777 GTAGCTGTGGTTGGTGTTTCTGGTTCTGGAAAGAGCACAATAATATCGTTGATCGAGAGA 3836
Query 3628 TACTACGACCCAGTTGCTGGTCAAGTCCTACTAGATGGGAGAGACTTAAAGTTATATAAT 3687
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||
Sbjct 3837 TACTACGACCCAGTTGCTGGTCAGGTCTTATTAGATGGGCGAGACTTGAAGTCATATAAT 3896
Query 3688 TTGAGATGGTTGAGAAGCCACATGGGTTTGGTTCAGCAAGAACCCATAATCTTTTCCACG 3747
||||||||||| |||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3897 TTGAGATGGTTAAGAAGCCATATGGGTCTGATTCAACAGGAACCCATAATCTTTTCCACA 3956
Query 3748 ACGATCAGAGAGAATATCATATATGCAAGGCATAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAA 3807
||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3957 ACGATCAGAGAAAACATTATATACGCAAGGCACAATGCAAGTGAAGCTGAGATGAAGGAA 4016
Query 3808 GCAGCAAGAATTGCTAATGCTCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGTTATGACACA 3867
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4017 GCAGCAAGGATTGCAAATGCCCACCATTTCATCAGCAGCTTACCTCACGGATACGACACA 4076
Query 3868 CATATCGGGATGAGAGGGGTAGAACTTACCCCGGGACAGAAACAGAGAATAGCAATAGCA 3927
||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 4077 CATATCGGGATGAGAGGTGTTGAGCTTACCCAAGGACAAAAACAGAGAATCGCTATAGCT 4136
Query 3928 CGGGTAGTGCTGAAGAATGCTCCCATTA-TCTTAATAGATGAAGCCAGCTCGGCTATCGA 3986
||||||||||||||||||||| ||| || | || || || ||||| || || |||||||
Sbjct 4137 CGGGTAGTGCTGAAGAATGCT-CCAATACTGTTGATTGACGAAGCGAGTTCATCTATCGA 4195
Query 3987 ATCTGAATCGAGTCGGGTTGTGCAGGAGGCTCTTGACACATTGATAATGGGGAACAAAAC 4046
||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4196 ATCCGAGTCGAGCCGTGTTGTGCAGGAAGCTCTTGATACATTGATAATGGGGAACAAAAC 4255
Query 4047 AACAATTCTGATAGCGCATAGAGCGGCTATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTGCT 4106
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4256 AACAATTCTGATAGCGCATAGAGTAGCGATGATGAGACATGTGGATAACATTGTGGTTCT 4315
Query 4107 CAATGGAGGGAGGATAGTAGAGGAAGGTACACATGATTCTTTAGCAGC-AAAGAATGGAT 4165
||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| || ||||
Sbjct 4316 CAATGGAGGCAAAATAGTAGAGGAAGGTACGCATGATTGTTTAGCGGGTAAA-AACGGAT 4374
Query 4166 TGTATGTACGTTTGATGCAACCACATTTTGGTAA-AGGTCTACGCCAACATCGACTGAT 4223
||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||| ||||||
Sbjct 4375 TGTATGTCCGTTTAATGCAACCACATTTTGGCAAGAA-TCTACGGCGACATCAACTGAT 4432
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 230767937800
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5