BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486151
Length=4200
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G57060.2 | Symbols: | binding | chr3:21114867-21121113 REVE... 6239 0.0
> AT3G57060.2 | Symbols: | binding | chr3:21114867-21121113 REVERSE
LENGTH=4521
Length=4521
Score = 6239 bits (3378), Expect = 0.0
Identities = 3694/3847 (96%), Gaps = 19/3847 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTCCTCCCTTTGTTTTCCCTCAAATTCTACGAGCCCTAGAAGAAGATCCGGAAGAC 60
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 63 ATGGCTCCTCCCTTTGTATTCCCTCAAATTCTACGAGCCCTAGAAGAAGATCCGGAGGAT 122
Query 61 AATCATCGTTTGTTCGCTCAGAATCCCGTCGATGTGACCTCTCTTCGTCCTTCCGATCTG 120
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 123 AATCACCGTTTGTTCGCTCAGAATCCCGTCGATGTAACCTCTCTTCGCCCTTCCGATCTG 182
Query 121 GAAGAATTCGTCAAAGGTGTATCCTTTGACCTTTCTGATAGAGAACTCTTCTGTATCGAA 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 183 GAAGAATTCGTCAAAGGTGTATCCTTTGACCTTTCTGATAGAGAACTCTTTTGTGTCGAG 242
Query 181 GATCAAGATGTTTTTGATCGTGTCTACTCTTTGGTCAGGAGCTTTTTTAGTCTTCCTCCA 240
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 243 GATCAAGATGTATTTGATCGTGTCTACTCTTTGGTCAGGAGCTTCTTTAGTCTTCCTCCA 302
Query 241 TCTTGCAAGTGTAATCTTGTAGAAAGCCTCCGGTCCAATCTAAGTGTTCTTCTTCCCAAT 300
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 303 TCTTGCAAGTGTAATCTTGTAGAAAGCCTTCGGTCCAATCTAAGCGTTCTTCTTCCCAAT 362
Query 301 GTCGATTCGATCTCCCGATCTGTCCAAGATCAGGAGGATGATGTTCCAATCATTGATAGG 360
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 GTCGATTCGATATCCCGGTCTGTCCAAGATCAGGAGGATGATGTTCCAATCATTGATAGG 422
Query 361 ATCACATCACATCGCAATGCCTTGAAAATATACACTTTCTTTCTCCTCACTATTATTATG 420
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 423 ATCACATCACATCGCAATGCCTTGAAGATATACACTTTCTTTCTCCTCACTGTTGTTATG 482
Query 421 ACTGAAGAATCACACATCAGCTCAGTTGACAGC-ACAAAGGTTGCAGCACGAGGGAGGAA 479
| ||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 AATGAGGAATCACACATCAGCTCAGTCGAGA-CTACAAAGGTTGCAGCACGAGGGAGGAA 541
Query 480 AAAGCAAGTTATCCAGTCATGGAACTGGGAACCTCAGAGGGGTAGGATGCTCAATTTGGT 539
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 542 AAAGCAAATCATCCAGTCATGGAACTGGGAACCTCAGAGGGGTAGGATGCTCAATTTGAT 601
Query 540 CGCAAATTCTCTTGAGATCAACCTATCCTTGCTCTTTGGATCATCAGACCTAGATGAAAA 599
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 602 CGCAAATTCTCTTGAAATCAACCTATCCTTGCTCTTTGGATCATCAGACCTAGACGAAAA 661
Query 600 CTACCTGTCTTTCATTGTCAAAAACTCGTTCACTCTTTTTGAGAATGCCACAATCTTAAA 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 662 CTACCTGTCTTTCATTGTCAAAAACTCGTTCACTCTTTTTGAAAATGCCACAATCTTAAA 721
Query 660 AGATGCTGAGGCAAAAGATGCACTGTGCCGAATCATTGGAGCCTCTGCTACAAAATACCA 719
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 722 AGATGCCGAGACAAAAGATGCACTGTGCCGAATCATCGGAGCATCTGCTACAAAATACCA 781
Query 720 TTACATTGTGCAGTCATGTGCCTCAATCATGCACTTGATACACAAGTATGATTTTGCTGT 779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 CTACATTGTGCAGTCATGTGCCTCAATCATGCACTTGATACACAAGTATGATTTTGCTGT 841
Query 780 TGTACATGTTGCTGATGCAGTTGCTAGAGCTGAAAGTAAGTATGCAGATGGTACGTTGGC 839
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
Sbjct 842 TGTACACATTGCTGATGCAGTTGCTAGAGCTGAAAGCAAGTATTCAGATGGTACGTTGGC 901
Query 840 CGTGACAATCATTAGAGATATTGGGAGGACTGACCCAAAAGCCTACGTTAAAGATACTGC 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 902 AGTGACAATCATTAGAGATATTGGGAGGACTGACCCAAAGGCCTACGTTAAAGATACTGC 961
Query 900 TGGGGCTGATAATGTGGGGCGTTTCCTGGTCGAGCTTGCTGATCGTTTGCCAAAACTAAT 959
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 962 TGGGGCTGATAATGTGGGACGTTTCCTGGTCGAGCTTGCTGATCGTTTGCCAAAATTAAT 1021
Query 960 GTCGACAAATGTTGGAGTAT-TGGTCCCTCATTTTGGCGGTGAATCATACAAGATAAGAA 1018
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 GTCGACAAATGTTGGAGT-TCTGGTCCCTCATTTTGGTGGTGAATCATACAAGATAAGAA 1080
Query 1019 ACGCACTAGTTGGTGTTCTT-GGAAAGTTAGTTGCAAAAGCATTTAATGATGTCGAGGGA 1077
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ACGCACTAGTTGGTGTTCTTGGGAAA-TTAGTTGCAAAAGCATTTAATGATGTCGAGGGA 1139
Query 1078 GATATGAGTTCCAAGTCCCTTCGTTTGCGAACTAAGCAAGCTATGTTGGAAATTTTGCTC 1137
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GATATGAGTTCCAAGTCCCTTCGTCTGCGAACTAAGCAAGCTATGTTGGAAATTTTGCTC 1199
Query 1138 GAACGATGTAGAGATGTTTCAGCCTATACAAGGAGCCGAGTTCTTCAGGTGTGGGCTGAA 1197
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1200 GAACGCTGTAGAGATGTTTCAGCCTATACAAGGAGCCGTGTTCTTCAAGTGTGGGCTGAA 1259
Query 1198 CTGTGTGAAGAGCATTCTGTTTCAATTGGCCTATGGAATGAGGTTGCATCAATATCTGCT 1257
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 1260 CTCTGTGAAGAGCATTCTGTTTCAATTGGCCTATGGAATGAAGTTGCATCACTATCTGCT 1319
Query 1258 GGAAGACTGGAAGATAAGAGTGCAATTGTTAGAAAATCCGCATTGAATTTACTGATCACG 1317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1320 GGAAGACTGGAAGATAAGAGTGCAATTGTTAGAAAATCCGCATTGAATTTACTGATCATG 1379
Query 1318 ATGTTGCAACATAACCCCTTTGGTCCACAGCTGCGGATAGCTTCATTTGAAGCAACCCTG 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 ATGTTGCAACATAACCCCTTTGGTCCACAGCTGCGGATAGCTTCATTTGAAGCAACCCTG 1439
Query 1378 GAGCAGTATAAAAGAAAACTGAACGAACTTGAACCAAGCCTCCCTACTGAGCATGCATCA 1437
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1440 GAGCAGTATAAAAGAAAACTGAACGAACTTG----AA-----CCTACTGAGCATGCATCA 1490
Query 1438 AAAGAGTCAACTTCAGATGGTGACTCCTGTAGTGGAGATGGTGAAATCGATGACTTGCAT 1497
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 AAAGAGTCAACTTCAGATGGTGAATCCTGTAATGGAGATGGTGAAATCGATGACTTGCAT 1550
Query 1498 CTTGAAACGACAAATAAGATGCATCAAGATAGTCTATCTGATAGCTGTCAGCCAGAGAAT 1557
|||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 CTTGAAACTACAACTAAGATTCATCAAGATAGTCTATCTGATAGCTGTCAGCCAGAGAAT 1610
Query 1558 GGAGAAGGCATCAGTGAGAAGGATGTTTCTGTTCCAGATATTGGTAACCTTGAGCAGACC 1617
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1611 GGAGAAGAAATCAGTGAGAAGGATGTTTCTGTTCCAGATATTGGTAACGTTGAGCAAACC 1670
Query 1618 AAGGCCTTGATTGCTTCCCTTGAGGCTGGATTGAGGTTCTCGAAGTGCATGTCAGCCAGT 1677
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 AAGGCTTTGATTGCTTCCCTAGAGGCTGGATTGAGGTTCTCGAAGTGCATGTCAGCCAGT 1730
Query 1678 ATGCCGATCCTCGTTCAATTAATGGCTTCATCTTCTGCCACTGATGTTGAGAATGCTATT 1737
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 ATGCCAATCCTCGTTCAATTAATGGCTTCATCTTCTGCCACTGATGTTGAGAATGCTATT 1790
Query 1738 CTTTTGTTGATGAGGTGTAAGCAGTTCCAAATTGATGGTGCAGAAGCTTGTCTCCGTAAA 1797
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 CTTTTGCTGATGAGGTGTAAGCAGTTCCAAATTGACGGTGCAGAAGCTTGTCTCCGTAAA 1850
Query 1798 ATTCTGCCTCTGGCCTTTTCTCAGGATAAGTCTATCTATGAAGCAGTAGAGAATGCCTTC 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATTCTGCCTCTGGCCTTTTCTCAGGATAAGTCTATCTATGAGGCAGTAGAGAATGCCTTC 1910
Query 1858 ATCTCAATCTACATAAGGAAAAATCCAGTTGAAACGGCGAAACAGCTGTTGAACCTTGCC 1917
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 ATCTCAATCTACATAAGGAAAAATCCAGTTGACACGGCGAAACAGCTGTTGAACCTTGCC 1970
Query 1918 ATAGATTCGAATATAGGAGATCAGGCAGCACTAGAGTTTATTGTTAATGCTTTAGTGTCA 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 ATAGATTCGAATATAGGAGATCAGGCAGCACTAGAGTTTATTGTTAATGCTTTAGTGTCA 2030
Query 1978 AAAGGTGAAATATCTAGCAGCACGACATCGGCTCTATGGGACTTCTTTGGCTTTAACATC 2037
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2031 AAAGGTGAAATATCTAGCAGCACGACATCAGCTCTATGGGACTTCTTTTGCTTTAACATC 2090
Query 2038 AATGGGACAACTGCAGAGCAAAGTCGTGGGGCTCTATCTATCCTTTGCATGGCTGCAAAG 2097
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 AATGGGACAACTGCTGAGCAAAGTCGTGGGGCTCTATCTATCCTTTGCATGGCTGCAAAG 2150
Query 2098 TCGTCCCCTAGGATTCTTGGGTCACACATACAGGATATTATCGATATTGGGTTTGGCCGT 2157
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2151 TCGTCCCCTAGGATTCTTGGATCACACATACAGGATATTATTGATATTGGGTTTGGCCGT 2210
Query 2158 TGGGCAAAAGTAGAACCTCTACTTGCCAGAACTGCATGCACTGCTATTCAGCGGCTT-TC 2216
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||
Sbjct 2211 TGGGCAAAAGTGGAACCTCTACTTGCCAGAACTGCATGTACTGTTATTCAGCGG-TTCTC 2269
Query 2217 CGAGGAAGATAGGAAAAAGTTATTGCTCAGCAATGGCAGCCGATTGTTTGGTATTCTTGA 2276
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 CGAGGAAGATAGGAAAAAGTTATTGCTCAGCAGTGGCAGCCGATTGTTTGGTATTCTTGA 2329
Query 2277 AAGCTTGATCACTGGGAACTGGCTTCCAGAAAACATATATTATGCAACTGCTGATAAAGC 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 AAGCTTGATCACTGGGAACTGGCTTCCAGAAAATATATATTATGCAACTGCTGATAAAGC 2389
Query 2337 CATAAGTGCCATATACATGATCCACCCAACTCCAGAAGCATTGGCTTCTACTATTATTAA 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2390 CATAAGTGCCATATACATGATCCACCCAACTCCAGAAACATTGGCTTCTACTATTATTAA 2449
Query 2397 AATGTCCGTGAGCACTGTGTTTGATGTAGTTGGACAAGATGAAGCACAGACTGATACCGT 2456
|| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2450 AAAGTCCCTGAGCACTGTGTTTGACGTAGTTGAACAAGAGGAAGCACAGACTGATACCGA 2509
Query 2457 TAATAATAAAGTTGATATTCTGACTCCAATTCAAGTAACAAAACTCAGTAGATTCTTGTT 2516
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 2510 AAATAATAAAGTTGATATTTTGACTCCAGTTCAAGTGGCTAAACTCAGTAGATTTTTGTT 2569
Query 2517 CGCTATCAGTCACATTGCCATGAACCAGTTGGTGTATATAGAATCCTGTATCCAGAAGAT 2576
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 CGCTGTCAGTCACATTGCCATGAACCAGTTGGTGTATATAGAATCCTGTATCCAGAAGAT 2629
Query 2577 CCGGAGACAGAAGACTAAAAAGGACAAATCGGCTGCTGAAAGTCAGGATACAGACGAAAA 2636
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||
Sbjct 2630 CCGGAGACAGAAGACTAAAAAGGACAAACCGGCTGCTGAAAGTCAGAACACAGAAGAAAA 2689
Query 2637 CCTTGGGGCCACGCAAGAGAACAATAACATAAATGCTGAGCTAGGACTTGCTGCCTCTGA 2696
||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2690 CCTTGAGGCCACCCAAGAGAACAATGGCATAAATGCTGAGCTAGGACTTGCTGCCTCTGA 2749
Query 2697 TGATGCACTGCTTGATACACTCGCTGAAAAAACAGAGAAAGAAATTGTTTCTGGTGGTTG 2756
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 2750 TGATGCACTGCTTGATACACTCGCTGAAAGAGCAGAGAGGGAAATTGTTTCTGGGGGTTC 2809
Query 2757 TGGCGAGAAGAATCTGATTGGGGAGTGTGCAACTTTTCTCTCAAAGCTTTGCAGAAATTT 2816
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2810 TGTTGAGAAGAATCTGATTGGGGAGTGTGCAACTTTTCTCTCTAAGCTTTGCAGAAATTT 2869
Query 2817 TACTCTGCTGCAAAAGCATCCTGAATTACAAGCTTCCGCAATGCTTGCATTATGCAGGTT 2876
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 TTCTCTGCTGCAAAAGCATCCTGAACTACAAGCTTCCGCAATGCTTGCATTATGCAGGTT 2929
Query 2877 TATGATTATTGATGCAAGTTTCTGCGAATCCAATCTTCAGCTTCTCTTCACAGTTGTTGA 2936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2930 TATGATTATTGATGCAAGTTTCTGCGAATCCAATCTTCAGCTTCTCTTCACAGTTGTTGA 2989
Query 2937 AAATGCACCGTCTGAAGTAGTCCGGTCAAATTGCACCCTTTCCCTTGGAGATTTGGCGGT 2996
|||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 2990 AAATGCACCGTCTGAAGTTGTACGATCGAATTGCACCCTTTCCCTTGGAGACTTGGCTGT 3049
Query 2997 TCGTTTTCCAAATCTTTTAGAACCTTGGACAGAAAATATGTATGCCAGGTTACGGGATGC 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 TCGTTTTCCAAATCTTTTAGAACCTTGGACAGAAAATATGTATGCCAGGTTACGGGATGC 3109
Query 3057 TTCAGTTTCTGTCAGGAAAAATGCTGTCCTGGTCCTTTCACATCTTATATTGAATGATAT 3116
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 TTCAGTTTCTGTCAGGAAAAATGCTGTCCTGGTCCTCTCACATCTTATATTGAATGATAT 3169
Query 3117 GATGAAGGTGAAAGGGCATATAAATGAAATGGCTATATGTATAGAAGATGATGTGGAGAG 3176
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3170 GATGAAGGTGAAAGGTTATATATATGAAATGGCTATATGTATAGAAGATGATGTGGAGAG 3229
Query 3177 GATCTCTAGTCTCGCAAAACTATTTTTCCATGAACTGTCTAAGAAAGGATCGAATCCCAT 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3230 GATCTCTAGTCTCGCAAAACTATTTTTCCATGAACTGTCTAAGAAAGGATCGAATCCCAT 3289
Query 3237 ATACAATCTACTTCCTGATATACTTGGACAGTTATCCAACCGGAATTTAGAGAGGGAGTC 3296
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 ATACAATCTACTTCCTGATATACTTGGGCAGTTATCCAACCGGAATTTAGAGAGGGAGTC 3349
Query 3297 ATTCTGTAATGTCATGCAATTCTTGATCGGCTCCATCAAAAAGGACAAACAGATGGAGGC 3356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3350 ATTCTGTAATGTCATGCAATTCTTGATCGGCTCCATCAAAAAGGACAAACAGATGGAGGC 3409
Query 3357 TCTGGTTGAGAAGCTTTGCAATAGGTTTAGCGGAGTCACAGATGGAAAACAGTGGGAATA 3416
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3410 TCTAGTTGAGAAGCTTTGCAATAGGTTTAGCGGAGTCACAGATGGAAAACAGTGGGAATA 3469
Query 3417 CATTTCGTATTCTCTTTCGCTTCTGACATTCACAGAAAAGGGAATCAAAAAGCTTATTGA 3476
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3470 CATTTCGTATTCTCTTTCGCTGCTGACATTCACAGAAAAGGGAATCAAAAAGCTTATTGA 3529
Query 3477 GTCATTCAAGTCTTACGAGCACGCTTTAGCAGAGGATTTGGTGACCGAGAACTTTAGAAG 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3530 GTCATTCAAGTCTTACGAGCACGCTTTAGCAGAGGATTTGGTGACCGAGAACTTTAGAAG 3589
Query 3537 CATAATCAATAAGGGAAAGAAGTTTGCGAAACCAGAACTCAAAGCGTGCATCGAAGAGTT 3596
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 3590 CATAATCAATAAGGGAAAGAAGTTTGCGAAGCCAGAACTGAAAGCGTGTATCGAAGAGTT 3649
Query 3597 TGAAGAGAAGATCAACAAGTTCCACATGGAGAAGAAAGAACAAGAAGAAACCGCAAGAAA 3656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 TGAAGAGAAGATCAACAAGTTCCACATGGAGAAGAAAGAACAAGAAGAAACCGCAAGAAA 3709
Query 3657 TGCCGAGGTTCATAGAGAGAAAACCAAGACCATGGAATCTCTTGCTGTCCTCAGCAAAGT 3716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3710 TGCCGAGGTTCATAGAGAGAAAACCAAGACCATGGAATCCCTTGCTGTCCTCAGCAAAGT 3769
Query 3717 GAAAGAAGAACCTGTAGAAGAATATGATGAAGGTGAAGGTGTTTCAGATAGTGAAATTGT 3776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3770 GAAAGAAGAACCTGTAGAAGAATATGATGAAGGTGAAGGTGTTTCAGATAGTGAAATTGT 3829
Query 3777 GGATCCATCAATGGAAGAATTAGGTGATAATTTGAAT-GCAACTGGGTCCGAGGAAGAGC 3835
|||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | | ||||| ||| ||||||||||
Sbjct 3830 GGATCCATCAATGGAAGAATCAGGCGATAATTT-AGTTGAAACTGAGTCAGAGGAAGAGC 3888
Query 3836 AATCTGA 3842
||||||
Sbjct 3889 CATCTGA 3895
Score = 228 bits (123), Expect = 4e-58
Identities = 145/155 (94%), Gaps = 4/155 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 3895 GGGGAAGAAGGCGAATCAGAAAGCGAGAGTAGAGAGTCATCGAGCAGCATCAGGAGAAAC 3954
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4227 GGGGAAGAAGGCGAATCAGAAAGCAAGAGTACAGAGTCATCGAGCAGCATCAGGAGAAAC 4286
Query 3955 CTGAGGTCAGGAAGTAGGAGTTaaaaaaaCATTGTGTAGATGCAGAGAGAGA---AACTG 4011
||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 4287 CTGAGGTCAGGAAGTAGAAGTTAAAGAACCATTGTGTAGATGCAGAGAGAGAGCGAA-TG 4345
Query 4012 TCTGTTCAAGTTGCTCGACATCTCGAGAGCTATCT 4046
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4346 TCTGTTCAAGTTGCTCAACATCTCGAGAGCTATCT 4380
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 209346653139
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5