BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486188
Length=2679
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G57430.1 | Symbols: OTP84 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-l... 3973 0.0
> AT3G57430.1 | Symbols: OTP84 | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr3:21255635-21258480 REVERSE LENGTH=2846
Length=2846
Score = 3973 bits (2151), Expect = 0.0
Identities = 2521/2699 (93%), Gaps = 28/2699 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCATGTCCTCTTGCCTTCACCTTCTCTCTCCCG------------TTTCCTTCTCAA 48
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 78 ATGTCATGTCCTCTTGCCTTCACCTTCTCTCTCCCGTCTATTTTCCCCTTTCCTTCTCAA 137
Query 49 CCGCTTCCATTTTCCCGCCAGAAACATCCTTACCTTCTTCGTGCCACACCAACCTCTGTA 108
| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 138 CTGCTTCCATTTTCCCGCCATAAACATCCTTATCTTCTTCGCGCCACACCAACCTCTGCA 197
Query 109 ACCGACGATGTTGCCTCCACCGTTTATGGCGCACCTTCGAA-ATTTATCTCTCAATCACA 167
||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 198 ACCGAAGATGTTGCCTCCGCCGTTTCTGGCGCACCTTC-AATATTTATCTCTCAATCACG 256
Query 168 CTCTCCGGAGTGGTGGATTGACTTGCTCCGGTCCAAAGTTCGATCTAATTTGCTCCGTGA 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 CTCTCCGGAGTGGTGGATTGACTTGCTCCGGTCCAAAGTTCGATCTAATTTGCTCCGTGA 316
Query 228 AGCCGTCTTGACTTACATTGACATGATTGTTTTGGGTATAAAACCCGATAATTTTGCGTT 287
||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 317 AGCTGTTTTGACTTACGTTGACATGATTGTTTTGGGTATAAAACCCGATAATTATGCGTT 376
Query 288 CCCTGCTTTGCTAAAGGCTGTCGCTGATCTTCAGGACATGGATTTGGGGAAACAGATTCA 347
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 377 CCCTGCTTTGCTAAAGGCTGTAGCAGATCTTCAGGACATGGAACTGGGGAAACAGATTCA 436
Query 348 TGCCCATGTATATAAATTTGGGTATGGAGTGGATTCCGTGACTGTAGCTAATACCCTAGT 407
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 437 TGCCCATGTGTATAAATTTGGGTACGGTGTGGATTCCGTGACTGTGGCTAATACCCTTGT 496
Query 408 GAATTTGTATAGAAAGTGTGGAGATTTCGGGGCTGTGTATAAGGTGTTCGATAGAATATC 467
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 GAATTTGTATAGAAAGTGTGGAGATTTCGGAGCTGTCTATAAGGTGTTCGATAGAATATC 556
Query 468 TGAGAGAAACCAAGTCTCTTGGAATTCTTTGATTTCTTCTTTGTGTAGTTTTGAGAAGTG 527
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TGAGAGAAACCAAGTCTCTTGGAATTCTTTAATTTCTTCTTTGTGTAGTTTTGAGAAGTG 616
Query 528 GGAAATGGCGTTAGAAGCATTTCGGTGTATGTTGGATGAAAATGCGGAGCCTAGTTCGTT 587
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 617 GGAAATGGCGTTAGAGGCATTTCGGTGTATGTTGGATGAAAATGTGGAACCTAGTTCGTT 676
Query 588 TACCTTGGTGAGTGTGGCT-CTTGCTTGCTCGAATTTGCCTATGCCCGAGGGATTATTGA 646
||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 677 TACCTTGGTGAGTGTGGTTAC-TGCTTGTTCGAATTTGCCTATGCCTGAGGGATTAATGA 735
Query 647 TGGGTAAGCAGGTTCACGCCTATAGTTTGAGAAAGGGTGAATTGAATTCGTTTATTATCA 706
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 736 TGGGTAAGCAGGTTCACGCCTATGGTTTGAGAAAGGGTGAATTGAATTCGTTTATAATCA 795
Query 707 ACACACTGGTGGCTATGTATGGTAAAATGGGAAAATTAGCATCTTCCAAAGTCTTGCTTG 766
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 796 ACACATTGGTGGCTATGTATGGTAAACTGGGAAAATTAGCATCTTCTAAAGTCTTACTTG 855
Query 767 GATCTTTTGAAGGCCGTGACTTGGTCACATGGAACACTGTGTTGAGCTCGTTATGTCAGA 826
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 856 GTTCTTTTGGAGGCCGTGACTTGGTCACATGGAACACTGTGTTGAGCTCGTTATGTCAGA 915
Query 827 ACGAGCAGTTTCTTGAAGCATTGGAGTATTTGCGGGAAATGGTGCTTGAAGGTGTTGAAC 886
|||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 ACGAGCAGTTGCTTGAAGCATTGGAATATTTGCGTGAAATGGTGCTTGAAGGTGTTGAAC 975
Query 887 CAGATG-GCTTCACTATTTCAAGTGTTCTTCCTGCTTGTTCACACTTGGAGATGCTTCGC 945
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 CAGATGAG-TTCACTATTTCAAGTGTTCTTCCTGCTTGTTCACACTTGGAGATGCTTCGC 1034
Query 946 ACAGGGAAAGAATTGCATGCCTATGCTTTGAAAAATGGCTCTTTGGATGAGAATTCTTTT 1005
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1035 ACAGGGAAAGAATTGCATGCTTATGCTTTGAAAAATGGCTCTTTGGATGAGAATTCCTTT 1094
Query 1006 GTTGGCAGTGCTTTGGTTGACATGTATTGCAATTGCAAGCAAGTGTTGAGTGGTTGTCGA 1065
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1095 GTTGGTAGTGCTTTGGTTGACATGTATTGCAATTGCAAGCAAGTGTTGAGTGGTCGTCGA 1154
Query 1066 GTATTTGATGGAATGTTTGATAGAAAGATTGGTCTATGGAATGCTATGATCACTGGTTAT 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1155 GTATTTGATGGAATGTTTGATAGAAAGATTGGTCTGTGGAATGCTATGATCGCTGGGTAT 1214
Query 1126 GCCCAGAACGAGTATGACGAGGAAGCGTTGTTGCTGTTT-ATTGAAATGGAAGAAAGTGC 1184
||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1215 TCCCAGAATGAGCATGACAAGGAAGCGTTGTTGCT-TTTCATTGGAATGGAAGAAAGTGC 1273
Query 1185 TGGGCTTCTGGCTAACTCAACCACAATGGCAGGTGTTGTTCCTGCTTGTGTTCGTTCTGG 1244
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1274 TGGGCTTCTGGCTAACTCTACCACAATGGCAGGTGTTGTTCCTGCTTGTGTCCGTTCTGG 1333
Query 1245 TGCGTTCTCCAAAAAGGAAGCTATCCATGGATTTGTTGTAAAAAGAGGTTTAGATAGAGA 1304
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1334 TGCGTTCTCTAGAAAGGAAGCTATCCATGGATTTGTTGTGAAGAGAGGTTTAGATAGAGA 1393
Query 1305 CAGGTTTGTGCAGAATGCACTGATGGATATGTATTCTAGGCTGGGAAAGATCGATATCGC 1364
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 CAGGTTTGTGCAGAATACACTGATGGATATGTATTCTAGGCTGGGAAAGATCGATATCGC 1453
Query 1365 CAAGCGTATATTCGGTAAAATGGAAGATAGAGATTTAGTTACATGGAACACAATGATTAC 1424
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1454 CATGCGGATATTCGGTAAAATGGAAGATAGAGATTTAGTTACGTGGAACACGATGATTAC 1513
Query 1425 GGGTTATGTATTCTCAGAACTCCATGAGGACGCGCTTCTTATGCTACACAAGATGCAAAT 1484
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1514 GGGTTATGTATTCTCAGAACACCATGAGGACGCACTTCTCCTGCTACACAAGATGCAAAA 1573
Query 1485 CCTCGAAAGGAAAGCAAGCGAGCGAGCTAGCCGAGTTGGTCTTAAACCTAATTCCATCAC 1544
||| ||||| |||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 CCTTGAAAGAAAAGTGAGCAAGGGGGCTAGCCGAGTTAGTCTTAAACCTAATTCCATCAC 1633
Query 1545 TCTGATGGCAATCCTTCCCAGTTGTGCTGCACTATCAGCATTAGCAAAAGGAAAAGAAAT 1604
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634 TCTGATGACAATCCTTCCCAGTTGTGCTGCACTATCAGCATTAGCAAAAGGAAAAGAAAT 1693
Query 1605 CCATGCTTACGCCATCAAGAACAATTTGGCAACTGATGTGGCTGTAGGAAGCGCTTTAGT 1664
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1694 TCATGCTTATGCCATCAAGAACAATTTGGCAACTGATGTGGCTGTCGGAAGCGCTTTAGT 1753
Query 1665 TGACATGTACGCAAAATGCGGGTGCCTACAGATGTCGAGAAAAGTTTTTGATCAGATTCC 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1754 TGACATGTACGCAAAATGCGGGTGCCTACAGATGTCGAGAAAAGTGTTTGATCAGATTCC 1813
Query 1725 TATC--AGAAATGTTATAACCTGGAATGTGATTATAATGGCTTATGGGATGCACGGGAAC 1782
| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||
Sbjct 1814 -A-CAAAAAAATGTTATTACTTGGAATGTGATTATAATGGCTTACGGGATGCATGGAAAC 1871
Query 1783 AGCCAAGATGCCATAGATATGCTAAGAATGATGATGGTTCAGGGAGTAAAACCAAACGAT 1842
| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 GGTCAAGAAGCCATAGATCTGCTAAGAATGATGATGGTTCAGGGAGTAAAACCAAACGAG 1931
Query 1843 GTTACATTCATTTCAGTATTTGCAGCTTGTAGCCACTCAGGCATGGTGAATGAAGGATTA 1902
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1932 GTTACATTCATCTCAGTATTTGCAGCTTGTAGCCACTCAGGCATGGTGGATGAAGGATTA 1991
Query 1903 AAGATTTTCTACAATATGAAGA-AGGACTACGGTGTTGAGCCTAGCTCAGATCATTATGC 1961
| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1992 AGGATATTCTATGTTATGAA-ACCCGACTACGGGGTTGAACCAAGCTCAGATCATTATGC 2050
Query 1962 TTGTGTTGTAGATTTGCTAGGAAGGGCAGGTAGAGTCAAAGAAGCTTATCAACTCATCAA 2021
|||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 2051 TTGTGTTGTAGATTTGCTTGGAAGGGCTGGTAGAATTAAAGAAGCATATCAACTCATGAA 2110
Query 2022 CCTGATTCCTCGAAATTTCGACAAAGCTGGAGCTTGGAGTAGCCTCCTTGGTGCTTGTCG 2081
|||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2111 TATGATGCCTCGTGATTTCAACAAAGCTGGAGCATGGAGTAGCCTCCTTGGTGCCAGTCG 2170
Query 2082 GATTCACAATAACCTAGAAATTGGAGAAATTGCTGCTCAGAACCTCATTCAATTGGAACC 2141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||
Sbjct 2171 GATTCACAATAACCTAGAAATTGGAGAAATTGCTGCTCAAAATCTCATTCAACTGGAACC 2230
Query 2142 AAATGTAGCTAGTCACTATGTACTACTTGCCAATATATATTCATCAGCAGGCCTCTGGTA 2201
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2231 AAATGTAGCTAGTCACTATGTGTTACTTGCCAATATTTATTCATCAGCAGGCCTCTGGGA 2290
Query 2202 TAAAGCAACAGAGGTAAGGAGAAATATGAAAGCGCAAGGCGTGAGAAAAGAACCTGGATG 2261
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291 TAAAGCAACAGAGGTAAGAAGAAATATGAAAGAGCAAGGCGTGAGAAAAGAACCTGGATG 2350
Query 2262 TAGCTGGATTGAGCATGGCGATGAAGTACATAAATTCGTAGCCGGTGACTCATCTCACCC 2321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2351 TAGCTGGATTGAGCATGGCGATGAAGTACATAAATTTGTAGCCGGTGACTCATCTCACCC 2410
Query 2322 GCAAAGCGAAAAGCTCCGTGGATATCTAGAGACCTTGTGGGAGAGAATGAGAAAAGAAGG 2381
|||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2411 GCAAAGCGAAAAGCTCAGTGGATATCTCGAGACATTGTGGGAGAGAATGAGAAAAGAAGG 2470
Query 2382 ATATGTACCTGACACATCTTGTGTGCTTCACAATGTAGAAGAAGATGAAAAAGAGATTCT 2441
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2471 ATATGTACCTGACACATCTTGTGTACTCCACAATGTAGAGGAAGATGAAAAAGAGATTCT 2530
Query 2442 GCTTTGTGGACACAGTGAGAAGCTAGCAATTGCGTTTGGGATACTTAACACATCTCCGGG 2501
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2531 GCTTTGTGGACACAGTGAGAAGCTAGCAATTGCGTTTGGGATACTTAACACATCACCCGG 2590
Query 2502 TACGGTTATTAGGGTGGCTAAAAACCTCAGGGTTTGTAATGACTGTCATCTTGCAACAAA 2561
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2591 TACAATTATTAGGGTGGCTAAAAACCTCAGGGTTTGTAATGATTGTCATCTTGCAACCAA 2650
Query 2562 GTTTATCTCAAAGGTTGTTGACAGAGAAATCATCTTGAGAGATGTTAGGAGGTTCCATCA 2621
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2651 GTTTATCTCAAAGATTGTTGATAGAGAAATCATCTTGAGAGATGTTAGGAGGTTTCATCG 2710
Query 2622 TTTCAAGAATGGAAGTTGCTCCTGTGGAGACTATTGGTGAAAGACTA-GCTGCATAAAA 2679
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||
Sbjct 2711 TTTCAAGAATGGAACTTGCTCCTGTGGAGACTATTGGTGAAAGA-TAAGCTCCATAAAA 2768
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 133042732836
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5