BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg486363 Length=3664 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G59020.2 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3... 5906 0.0 > AT3G59020.2 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr3:21810260-21817555 REVERSE LENGTH=3943 Length=3943 Score = 5906 bits (3198), Expect = 0.0 Identities = 3519/3671 (96%), Gaps = 34/3671 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GACcttcttctcttata-c-ctctctctctttcgtcttcgtcgtctcttcttcctcttga 58 ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1 GACCTTCTTCTCTTATACCTCTCTCTCTCTTTCGTCTTCGTCGTCTCTTCTTCCTCCTGA 60 Query 59 tttga--ctctc--gtctcgtcgATTTCCTCCGGGAGGAGACTCGAAATTCGTGACTTGC 114 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 61 TTTGACTCTCTCGAGTCTCGTCGATTTCCTCCGGGAGGAGACTTGAAATTCGTGACTTTC 120 Query 115 CGATTGTGAATTTCCCGATGGATCTGCCTAGCCTTGCCTTAATCGTTGGCGCGGCTGCTT 174 |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 121 CGATTGTGAATTCCCCGATGGATCTGCCTAGCCTCGCTTTAATCGTTGGCGCGGCTGCTT 180 Query 175 TCAGTCCCAATCCCGATGAGCGTAGAGCTGCTGAGCAGAGCCTTAATCAGTTGCAGCACA 234 ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCAGTCCCAATCCTGACGAGCGCAGAGCTGCTGAGCAGAGCCTTAATCAGTTGCAGCACA 240 Query 235 CTCCACAGCATTTGATAAGGATACTGCAAATAATTGTTGATGGTGGCTCTGATCTTTCTG 294 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCCACAGCATTTGATAAGGATATTGCAAATAATTGTTGATGGTGGCTCTGATCTTTCTG 300 Query 295 TACGCCAATCTGCTAGTATCCATTTCAAGAATTTCATTGCTAAGCACTGGGAACCTCATT 354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TACGCCAATCTGCTAGTATCCATTTCAAGAATTTCATTGCTAAGCACTGGGAACCTCATT 360 Query 355 CTGGTGATCAGAACAAAATCTTGCCTAGTGATAAGAATGTTGTCAGGGACCAGATTCTTG 414 ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 361 CTGGTGACCAGAACATAATCTTGCCAAGTGATAAGAATGTTGTCAGGAACCAGATTCTTG 420 Query 415 TATATGTCTCTCAAGTTCCTCCGATTTTGAGAGTTCAGATGGGAGAGTGCCTGAAGACCA 474 ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TATTTGTCTCTCAAGTGCCCCCGATTTTGAGAGTTCAGATGGGAGAGTGCCTGAAGACCA 480 Query 475 TAATTTACGCTGACTATCCTGAGCAATGGCCCCATCTCCTCGACTGGGTGAAGCACAACT 534 |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 481 TAATTTACGCTGACTATCCTGAGCAATGGCCCGAACTCCTGGACTGGGTGAAGCAAAACT 540 Query 535 TGCAAGAACAAGAAGTTTATGGAGCGCTATTTGTCTTGAGGATACTATCTTCAAAATACG 594 ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TGCAAAAACCACAAGTTTATGGAGCGCTATTTGTCTTGAGGATACTATCTTCAAAATACG 600 Query 595 AGTTTAAGTCAGATGAAGATAGGGCACCCATTCACCGAGTAGTCGAGGAGACGTTTCCGC 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 601 AGTTTAAGTCAGATGAAGATAGGGCACCCATTCACCGAGTAGTCGAGGAGACTTTTCCCC 660 Query 655 ACCTTTTGAATATATTTAACAAACTTGTCCATGTTGAAAATCCTTCTCTCGAAGTGGCAG 714 |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 ACCTGTTGAACATATTTAACAATCTTGTCCATGTTGAAAATCCTTCTCTCGAAGTGGCAG 720 Query 715 ACCATATCAAGCTTATTTGCAAGATATTCTGGTCATGTATTTATCTAGAGCTTCCGAGAC 774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ACCATATCAAGCTTATTTGCAAGATATTCTGGTCATGTATTTATCTAGAGCTTCCGAGAC 780 Query 775 CATTGTTTGATCCAAACTTTTTTAATGCTTGGATGGGTCTGTTCCTAAACATTTTGGAAC 834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CATTGTTTGATCCAAACTTTTTTAATGCTTGGATGGGTCTGTTCCTAAACATTTTGGAAC 840 Query 835 GTCCTGTTCCCGTAGAAGGTCAGCCTGAAGACCTTGAGCTTAGAAAATCCTGGGGATGGT 894 ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 GTCCTGTTCCCGTAGAAGGCCAGCCTGAAGACCCTGAGCTTAGAAAATCCTGGGGATGGT 900 Query 895 GGAAGGCCAAGAAGTGGGTTGCTCATATCTTAAACAGGCTATACACTCGGTTTGGAGATC 954 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GGAAGGCCAAGAAGTGGATTGCTCATATCTTAAACAGGCTATACACTCGGTTTGGAGATC 960 Query 955 TGAAACTCCAGAATCCAGATAACAAAGCCTTCGCCCAAATGTTCCAGATGAACTACGCAG 1014 ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 961 TGAAACTCCAGAATCCAGATAACAAAGCCTTTGCTCAAATGTTCCAGATAAACTATGCAG 1020 Query 1015 CCAAGATATTAGAGTGCCACCTGAAATTATTGAATGCCATTCATATTGGTGGATATCTTC 1074 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 1021 CCAAGATATTAGAGTGCCACCTGAAATTGTTGAATGCCATTCGTATAGGTGGATATCTTC 1080 Query 1075 CGGATAGAGTCATCAATCTAATTCTTCAATATCTAAGCAACAGTATCTCGAAGAATAGCA 1134 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1081 CGGATAGAGTCATCAACCTAATTCTTCAATATCTAAGCAACAGTATCTCGAAGAGTAGCA 1140 Query 1135 TGTACAACTTACTGCAGCCCCACCTTGACACTCTATTATTTGAAATAGTTTTCCCACTAA 1194 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 1141 TGTACAACTTACTGCAGCCCCACCTTAACACTCTCCTATTTGAAATAGTTTTCCCACTTA 1200 Query 1195 TGTGTTTCAATGACAATGATCAAATGCTTTGGGATGAAGACCCACATGAGTATGTAAGGA 1254 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1201 TGTGTTTCAATGATAATGATCAAATGCTTTGGGATGAAGACCCGCATGAGTATGTAAGGA 1260 Query 1255 AGGGTTATGATATAATTGAAGATTTATACAGTCCCAGGACTGCGTCTATGGACTTTGTGA 1314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGGGTTATGATATAATTGAAGATTTATACAGTCCCAGGACTGCGTCTATGGACTTTGTGA 1320 Query 1315 CTGAGCTGGTCAGAAAGCGTGGAAAAGACAACTTCCCAAAATTTATACAGTTCATCGTGG 1374 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1321 CTGAGCTGGTCAGAAAGCGTGGAAAAGAAAACTTCCCAAAATTTATACAGTTCGTTGTGG 1380 Query 1375 ACATTTTTAAGAGATATACTGAAGCACCTCTGGAAGATAAGCCTTATCGCCTTAAGGATG 1434 |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 ACATTTTTAAGAGATATAATGAAGCATCTCTGGAAAACAAGCCTTATCGCCTTAAGGATG 1440 Query 1435 GTGCTCTGCTTGCTGTTGGGACACTTTGTGATAAACTTAGGCAAAATGAACCCTACAAAT 1494 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1441 GTGCTCTGCTTGCTGTTGGGACACTTTGTGATAAACTTAGGCAAACTGAACCCTACAAAT 1500 Query 1495 CTGAACTGGAGAATATGTTAGTGCAACATGTTTTTCCTGAATTTAGCAGCCCGGCTGGTC 1554 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1501 CTGAGCTGGAGAATATGTTAGTGCAACATGTTTTTCCTGAATTTAGCAGCCCAGCTGGTC 1560 Query 1555 ATCTTAGAGCTAAGGCTGCATGGGTTGCAGGGCAGTACGCCCATATCAATTTCTCAGACC 1614 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1561 ATCTTAGAGCTAAGGCTGCGTGGGTTGCAGGGCAGTACGCCAATATCGATTTCTCAGACC 1620 Query 1615 AGAGCAATTTTTCAAAGGCATTGCATTGTGTTATCTCCGGAATGCGTGATCCAGAACTTC 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| Sbjct 1621 AGAGCAATTTTTCAAAGGCATTGCATTGTGTTATCTCCGGAATGTGTGATCTAGAACTTC 1680 Query 1675 CTGTTCGGGTGGATTCAGTTTTTGCTTTGCGTTCCTTTATTGAAGCCTGCAAAAATTTAG 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1681 CTGTTCGGGTGGATTCAGTTTTTGCTTTGCGTTCATTTATTGAAGCCTGCAAAGATTTAG 1740 Query 1735 ATGAAATCCGCCCAGTTCTTCCCCAACTTCTTGATGAATTTTTCAAGCTAATGAATGAAG 1794 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1741 ATGAAATCCGCCCAGTTCTTCCTCAACTTCTTGATGAATTTTTCAAGCTAATGAAGGAAG 1800 Query 1795 TTGAAAACGAAGACCTTGCTTTTACTTTAGAGACTATCGTGTATAAGTTTGGAGAGGAGA 1854 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 TTGAAAACGAAGACCTTGCTTTTACATTAGAGACTATTGTGTATAAGTTTGGAGAGGAGA 1860 Query 1855 TTTCTCCTTATGCTTTGGGTTTGTGCCAAAACTTGGCCAGTGCATTCTGGAGGTGTATCG 1914 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1861 TTTCTCCGTATGCTTTGGGTTTGTGCCAAAACTTGGCCAGTGCTTTCTGGAGGTGTATCG 1920 Query 1915 ACACTGACAATGGTGATGATGAAGCTGATGATGCTGGTGCATTGGCTGCAGTGGGATGTC 1974 |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 ACACTGACAACGGTGATGATGAAACTGATGATGCTGGTGCATTGGCTGCAGTGGGATGTC 1980 Query 1975 TCCGTGCCATTAGTACCATTCTTGAATCTATCAGTAGTCTCCCTCATCTTTATGGTCAGA 2034 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 TCCGTGCCATCAGTACCATTCTTGAATCTATCAGTAGTCTCCCTCATCTTTATGGTCAGA 2040 Query 2035 TTGAACCACAGTTGCTGCCAATAATGCGGAAAATGCTGACAACTGATGGTCAAGATGTGT 2094 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 TTGAACCACAGTTACTGCCAATAATGCGGAAAATGCTGACAACTGATGGTCAAGATGTGT 2100 Query 2095 TTGAAGAGGTTCTGGAGATCGTCTCATATATTACTACTTTTTCACCTACAATATCATTGG 2154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 TTGAAGAGGTTCTGGAGATCGTCTCATATATTACTACTTTTTCACCTACAATATCATTGG 2160 Query 2155 ACATGTGGAGTCTATGGCCTTTAATGATGGAAGCACTCGTGGATTGGGCTATTGACTTTT 2214 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 AGATGTGGAGTCTATGGCCTTTAATGATGGAAGCACTCGTGGATTGGGCTATTGACTTTT 2220 Query 2215 TCCCAAATATATTGGTCCCGCTGCACAACTATATATCCAGGGGGACTGGGCATTATCTCA 2274 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2221 TCCCAAATATATTGGTCCCGTTGCACAACTATATATCCAGGGGGACTGGGCATTATCTTA 2280 Query 2275 CTTGCAAGGAACCAGATTACCAGCAAAATCTTTGGAATGTGATCTCTGTGCTTATGGCAA 2334 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2281 CTTGCAAGGAACCAGATTACCAGCAAAATCTTTGGAATGTGATATCTGTGCTTATGGCGA 2340 Query 2335 ATAAAAATATTGATGACAGTGACCTTGAGCCAGCTCCGAAGCTATTAGGGATAGTGCTTC 2394 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2341 ATAAAAATATTGATGACAGTGACCTCGAGCCAGCTCCGAAGCTATTAGGGATAGTGCTTC 2400 Query 2395 AGACATGCAAGGGCCAGGTGGATCAATGGGTAGAGCCCTACCTGAGAATCACACTTGATC 2454 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 AGACATGCAAGGGCCAGGTGGATCAATGGGTAGAACCCTACCTGAGAATCACACTTGATC 2460 Query 2455 GGCTACGCGGTGCTGAGAAATCTTCCTTCAAGTGCCTTCTGGTTGAAGTGGTTGCAAATG 2514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2461 GGCTACGCGGTGCTGAGAAATCTTCCTTCAAGTGCCTTCTGGTTGAAGTGGTTGCAAATG 2520 Query 2515 CCTTTTACTACAATGCCCCTTTGGCACTTGGCATACTGCAACGATTTGGTATCGCAACAG 2574 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2521 CCTTTTACTACAATACCCCTTTGGCACTTGGCATACTGCAACGATTTGGTATCGCAACAG 2580 Query 2575 AAATTTTTACTCTATGGTTCCAAATGCTGCAAGAAAAGAAGAAGAGTGGCGCACGTTCTA 2634 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2581 AAATTTTTACTCTATGGTTCCAAATGCTGCAAGAAAAGAAGAAGAGTGGTGCACGTTCTA 2640 Query 2635 ACTTCAAGAGAGAAAATGATAAGAAAGTTTGCATCTTGGGGTTGACATCACTTTTCAATC 2694 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2641 ACTTCAAGAGAGAACATGATAAGAAAGTTTGCATCTTGGGGTTGACATCACTTTTCAGCC 2700 Query 2695 TTCCAGCTGGTCAATTACCCGGAGAGGTTTTGCCACATGTATTCAGGGCTCTTCTCGAGC 2754 |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2701 TTCCAGCTGGTCAATTGCCTGGAGAGGTCTTGCCACATGTATTCAGGGCTCTTCTCGAGC 2760 Query 2755 TTTTAGTGGCATACAAGGATCAACTTGCTGAAGCTGCAAAGGCagaagaggaagaagaag 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2761 TTTTAGTGGCATACAAGGATCAACTTGCTGAAGCGGCAAAGGCAGAAGAGGAAGAAGAAG 2820 Query 2815 aagaagaTGGTGATGACGACGACATGGATGAATTCCAGACAGATGATGAAGATGAGGACG 2874 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2821 ATGAAGATGGTGATGATGACGACATGGATGAATTCCAAACAGATGATGAAGATGAGGACG 2880 Query 2875 GCGATGACGAGAATCCAGATGAGACTGATGGAAGTACACTCCGCAAGTTAGCAGCACAGG 2934 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2881 GCGATGACGAGAATCCAGATGAAACTGATGGAAGTACACTCCGCAAGTTAGCAGCACAGG 2940 Query 2935 CAAAGGACTTCCGCTCTTACAGCGACGATGATGACTTTTCAGACGATGATTTTAGCGATG 2994 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2941 CAAAGGACTTCCGCTCTTACAGCGATGATGATGACTTTTCAGACGATGATTTTAGCGATG 3000 Query 2995 ACGAGGAATTAGACTCTCCAATTGATGAAGTGGATCCTTTCGTACTCTTCATGGATGCAG 3054 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3001 ACGAGGAATTAGAATCTCCAATTGATGAAGTGGATCCTTTCGTACTCTTCATGGATGCAG 3060 Query 3055 TCACAGCAATGCAAGTATCTGACTCGCCAAGGTTCCAAAGCCTTACCCAGACACTAGACC 3114 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3061 TCACAGCAATGCAAGTATCAGACTCGCCAAGGTTCCAAAGCCTTACCCAGACACTAGACC 3120 Query 3115 CGCACTACCATGGACTCGCAAGCACAATAGCTCAGCACACGGAGCTGAGAAGATCCGAGA 3174 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| Sbjct 3121 CGCACTACCATGGACTCGCAAGCACAATAGCTCAACACACGGAGCTGAGAAGAGCAGAGA 3180 Query 3175 TTCTAAAGGAGAAACTTGAGAAGCAATCTTCTGCAACGGTTGCTTCCTAATTTC-TCCAC 3233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| Sbjct 3181 TTCTAAAGGAGAAACTTGAGAAGCAATCTTCTGCAACGGTTGCTTCCTGATTTTATCCAC 3240 Query 3234 GGCTCAGTCCTTGAAAAAACAAATCGTTGGCGCTCTCATTTGGCTGCATTTTTTCATAAG 3293 |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3241 GGCTCAGTCCTTGAAAAACCAA-TCGTTGGCGCTCTCAATTGGCTGCATTTTTTCATAAG 3299 Query 3294 CCTCTTTATATCCCTCAAAAGTAGAGAGGCTTGTAGAGGTGAGTCTGGTCGACTCTCATT 3353 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3300 CCTCTTTATATTCCTCAAAAGTAGAGAGGCTTGTAGAGGTGAGTCTGGTCGACTCTCATT 3359 Query 3354 AGTCTGT-CATGTCTTAAGAGAGACCAATCTCTACCATCTCCAGTTTTGCATTTCTTCAT 3412 |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3360 AGTCAGTTCATGTCTTAAGAGAGACCAATCTCTGCCATCTCCAGTTTTGCATTTCATCAT 3419 Query 3413 CATCATCATCATTCTTTCtttttttttttAATCATCCAAAAGACCAGCAAGACAAAAGAC 3472 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 3420 CATCATCATCATTCTTT-TTTTTTGTTTTAATCATCCATAAGACCAACAAGACAAAAGAC 3478 Query 3473 TAAACCCATTTCGGGTTC-CTTT-TTT-ATTT--T---AGACAGAACAGAGAT-CCCTTT 3523 ||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| ||| |||||| Sbjct 3479 TAAACCCATTTCGGGTTTTCTTTATTTTATTTCATTTCAGACAGAACACAGAAACCCTTT 3538 Query 3524 GGGGGGTTTTATGTTCTCCGATTCGGATTTTGGAGGCAGATATaaaaaaa--GCACATAG 3581 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 3539 GGGGGGTTTTATGTTCTCCGATTGGGATTTTGGAGGCATATATAAAAAAAAAGCACATAG 3598 Query 3582 tttttttttAT-------------GTTTGTCACATTTATTATTGCTTGATATGAGTCGTT 3628 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3599 TTTTTTTTTATTACTATTATCTATGTTTGTCACATTTATTATTGCTTGATTTGAGTCGTT 3658 Query 3629 CTTTGCACTGT 3639 |||| |||||| Sbjct 3659 CTTTACACTGT 3669 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 182457171691 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5