BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486408
Length=3761
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G59410.2 | Symbols: GCN2 | protein kinase family protein | c... 6215 0.0
> AT3G59410.2 | Symbols: GCN2 | protein kinase family protein |
chr3:21950188-21959266 FORWARD LENGTH=4300
Length=4300
Score = 6215 bits (3365), Expect = 0.0
Identities = 3545/3633 (98%), Gaps = 7/3633 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 131 TCTCCGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAATTGTTTCAGATTCGCGTTCCCCTCCGCAAA 190
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 584 TCTCTGCAATATTTCAAGAGGACTGCAAAGTTGTTTCTGATTCGCGTTCGCCTCCGCAAA 643
Query 191 TTGTAATCAAGCTCAGGTTTTCGTACTCGAAA-GATATGGGATATGAGGACATCGACATC 249
| | ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 644 TAGCAATCAAGCTCAGG---CCGTACTC-AAAGGACATGGGATATGAAGACACCGACATA 699
Query 250 TCTGCTATGCTTGTAGTGAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 309
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 TCTGCTATGCTTATAGTTAGGTGCTTACCAGGATATCCTTACAAGTGCCCCAAGCTTCAG 759
Query 310 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 ATTACTCCAGAACAAGGGTTGACAACAGCTGATGCTGAGAAGCTTTTATCTCTTCTCGAG 819
Query 370 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 820 GACCAGGCAAATTCCAATGCTCGTGAAGGTCGGGTTATGATATTCAACCTGGTGGAGGCT 879
Query 430 GCCCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCACGATGAGGAACCTGTTCCATGC 489
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct 880 GCTCAAGAGTTTTTATCAGAAATCATTCCGGAAAGTCATGATGAGGAATCTGTTCCATGC 939
Query 490 TTGACTGCACATCGAAGCGCTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATAAAGCAAAA 549
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 940 TTGACTGCACATCGAAGCACTCAGTTCATTGAGCAACCTATGCTTTCAAATATAGCAAAA 999
Query 550 TCCTGTACTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 609
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 TCCTGTTCTGGTGGACCTTTTGTGTATGGTTTTATAGACCTATTTAGTGGCTTGGAAGAT 1059
Query 610 GCAAGGAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 669
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 GCAAGAAATTGGAGTCTGACTCCAGATGAAAATAGGGGAATCGTATCTTCAGTACAATCT 1119
Query 670 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATGAGAAGTCGGACAAGAATCTTAAGCGATTT 729
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1120 CACCCACTAGACACTTCAAGAATTTTGCATCAGAAGCCAGACAAGAATCTGAAGCGATTT 1179
Query 730 GAGGACCATGCTAAAGAAGAAATTGCACTGCCTGCTCCCACTGCCAAACTAAATACTGTT 789
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 1180 GAAGACCATGCTAAAGAAGAAGTTGCACTGCCTGCTCCCATTGCCAAACTGAATACTGTT 1239
Query 790 CAAGAGGATAATGTTGATGATACAAGCATCTCCTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 849
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240 CAAGAGGAGAATGTTGATGATACAAGCATCTCTTCTTTTGACTCAAGTAAATCTACTGAC 1299
Query 850 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300 GATGTGGAATCTGGATTATTCCAAAATGAGAAGAAGGAATCAAATCTTCAAGATGATACA 1359
Query 910 GCTGAAGATGACAGCAGTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 969
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 GCTGAAGATGACAGCACTAACTCCGAAAGTGAGTCGCTGGGGTCATGGTCTTCTGATTCC 1419
Query 970 TTATCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGACCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1029
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1420 TTAGCTCAAGATCAAGTGCCTCAGATTAGCAAGAAAGATCTGTTGATGGTCCATTTACTT 1479
Query 1030 CGAGTAGCTTGCACTTCCAGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1089
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CGAGTAGCTTGCACTTCCCGAGGACCTTTGGCTGATGCATTACCTCAGATAACTGATGAA 1539
Query 1090 CTGCATCAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGCGTTGGATTTAGCTTCGAAATCATCTCCA 1149
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1540 CTGCATGAGCTTGGTATATTGTCTGAAGAAGTGTTGGATTTAGCTTCCAAATCATCTCCA 1599
Query 1150 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGTCTCAACCAGTGTTCCT 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1600 GACTTTAATAGAACCTTTGAACATGCATTCAATCAAAACATGGCCTCAACCAGTGTTCCT 1659
Query 1210 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTGGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1269
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 CAGTTTTGGGAGCCACCTTCTGATTCTTGCGAGCCAAATGCATCACTCCCAAGCTCGCGA 1719
Query 1270 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGACAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 TATCTCAATGATTTTGAAGAGTTGAAACCCCTTGGCCAAGGTGGTTTCGGCCACGTTGTG 1779
Query 1330 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAG 1389
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780 TTGTGCAAAAATAAACTGGATGGAAGACAATATGCAGTGAAGAAAATTCGACTGAAGGAC 1839
Query 1390 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGAATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1449
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 AAAGAGATACCTGTCAACAGTCGGATAGTTCGAGAAGTAGCAACACTTTCCCGTTTGCAG 1899
Query 1450 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCTTTT 1509
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1900 CATCAGCATGTTGTACGTTACTATCAGGCCTGGTTCGAAACAGGAGTTGTTGATCCCTTT 1959
Query 1510 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960 GCTGGCGCAAATTGGGGATCAAAAACTGCAGGGAGTTCAATGTTCAGCTACTCAGGTGCA 2019
Query 1570 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAACAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 1629
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2020 GTGTCAACTGAAATTCCTGAGCAGGACAATAATCTTGAGTCGACTTATCTATATATTCAA 2079
Query 1630 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2080 ATGGAATATTGTCCCAGGACTCTCCGCCAGGTTTTTGAATCATATAACCACTTCGACAAA 2139
Query 1690 GATTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 1749
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140 GACTTTGCATGGCATTTAATTCGCCAAATTGTGGAAGGCTTAGCTCATATCCATGGACAA 2199
Query 1750 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATC 1809
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200 GGAATAATTCATCGGGATTTTACACCTAACAATATTTTCTTTGACGCTCGGAATGATATT 2259
Query 1810 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2260 AAAATTGGGGATTTTGGTCTTGCAAAGTTCTTGAAGCTGGAACAGTTGGATCAAGATGGG 2319
Query 1870 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 1929
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2320 GGTTTCTCTACGGATGTGGCTGGAAGCGGAGTCGATAGTACTGGTCAAGCTGGTACTTAC 2379
Query 1930 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 1989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2380 TTTTACACAGCACCTGAAATTGAGCAAGATTGGCCTAAGATTGATGAAAAGGCCGACATG 2439
Query 1990 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTCGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2049
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 TATAGCTTAGGGGTTGTGTTCTTTGAACTTTGGCATCCTTTTGGAACCGCCATGGAGAGA 2499
Query 2050 CACGTTATTTTAACTGACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGATAAATGAA 2109
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2500 CACGTTATTTTAACTAACCTGAAGCTGAAAGGGGAGCTACCTCTCAAATGGGTAAATGAA 2559
Query 2110 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCGTCTGATCGTCCC 2169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2560 TTTCCCGAACAGGCGTCTCTACTGCGGCGTTTGATGTCTCCAAGTCCATCTGATCGTCCC 2619
Query 2170 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAT 2229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2620 TCTGCCACAGAACTTCTTAAGCATGCATTTCCTCCCAGAATGGAATCTGAGTTACTGGAC 2679
Query 2230 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2680 AATATTCTAAGAATAATGCAAACTTCTGAAGATTCAAGTGTTTATGATAGAGTAGTAAGT 2739
Query 2290 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGTCATCAGTCTAGTAGTTCGAGACTC 2349
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2740 GTGATATTTGATGAAGAAGTATTAGAGATGAAAAGCCATCAGTCTAGTAGATCGAGACTC 2799
Query 2350 TGCGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2409
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800 TGTGCAGATGATAGTTATATTCAATACACAGAGATAAATACAGAGCTTCGTGATTATGTT 2859
Query 2410 GTTGATATCACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATCCCA 2469
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2860 GTTGAAATAACAAAAGAAGTCTTTAGGCAGCATTGTGCGAAGCATCTAGAGGTCATACCA 2919
Query 2470 ATGCGTTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2529
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2920 ATGCGCTTACTTAGTGATTGCCCCCAGTTTAGCAGGAAAACTGTAAAGCTTTTGACCAAT 2979
Query 2530 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGT-CAATTGGATAAG 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2980 GGAGGAGATATGCTTGAACTATGCTATGAGCTACGACTGCCTTTTGTGC-ATTGGATAAG 3038
Query 2589 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 2648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3039 CGTAAATCAGAAATCCTCATTCAAGCGATATGAAATATCTCATGTCTACAGGAGAGCAAT 3098
Query 2649 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACC 2708
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 TGGCCATTCTCCACCAAATCCGTGTCTTCAGGCGGACTTTGACATTGTTGGAGGCACACT 3158
Query 2709 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTCGACATCACAACCCACATCTTTCA 2768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3159 ATCCCTGACAGAGGCAGAAGTTCTCAAGGTGATAGTAGACATCACAACCCACATCTTTCA 3218
Query 2769 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 2828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3219 TCGCGGATCTTGTGACATTCATTTGAATCATGGAGATTTGCTGGATGCGATTTGGTCCTG 3278
Query 2829 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 2888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3279 GGCAGGAATTAAGGCAGAGCATAGACGAAAGGTTGCAGAGCTTCTTTCCATGATGGGATC 3338
Query 2889 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 2948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3339 CTTGCGTCCTCAGTCATCTGAGCGGAAGCTAAAATGGGTTTTCATAAGGCGTCAACTTCT 3398
Query 2949 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3399 TCAGGAGTTGAAGTTACCTGAAGCTGTTGTCAATAGACTGCAGACTGTTGCTTCAAGGTT 3458
Query 3009 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3459 TTGTGGAGATGCAGATCAAGCACTTCCTCGTTTAAGAGGGGCTCTGCGTGCTGATAGACC 3518
Query 3069 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3519 TACCCGCAAAGCACTCGATGAGTTGTCAAACCTCTTAACCTACCTGAGAGTCTGGAGGAT 3578
Query 3129 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCTACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3579 AGAAGAGCATGTTCATATTGATGTTCTGATGCCACCAACTGAAAGTTATCACCGGAATTT 3638
Query 3189 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCGAGTGATGGCGTTTT 3248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 3639 GTTTTTTCAGGTTTTCTTAACCAAAGAAAATAGCTCTGGGACATCTAATGATGGCGTTTT 3698
Query 3249 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTTTTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAATATAA 3308
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3699 ACTTGCTGTTGGTGGTCGTTATGATTGGTTGGTGCAGGAAGTGTGTGATCGTGAACATAA 3758
Query 3309 AATGAATCTCCCTGGTGCTGTTGGCGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAACATCT 3368
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3759 AATGAACCTCCCTGGTGCTGTTGGAGTTAGTCTTGCACTGGAGACAATATTTCAGCATCT 3818
Query 3369 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3819 TCCTATGGATCTAAGGCCTATTAGAAATGAAGTCAGCACCAGTGTACTTGTTTGTTCAAG 3878
Query 3429 AGGAGGTGGCGGTTTACTGGTCCAGCGTATGGAACTAGTTGCGGAACTGTGGGAAAAAAG 3488
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3879 AGGAGGTGGTGGTTTACTGGTCCAGCGCATGGAACTAGTTGCGGAACTATGGGAAAAAAG 3938
Query 3489 CATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTGACAGAGCAGTACGAATATGC 3548
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3939 TATAAAGGCTGAGTTTGTTCCAACACCTGATCCAAGTCTTACTGAGCAGTACGAATATGC 3998
Query 3549 AAACGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCGCAGAGTCTGGAGTGGCTCAAAATCA 3608
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3999 AAATGAACATGAAATCAAATGTCTAGTGATCATCACAGAGTCTGGAGTAGCTCAAAATCA 4058
Query 3609 AATAGAGTTTGTAAAGGTTAGGCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 3668
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4059 AATAGAGTTTGTAAAGGTTCGTCACCTTGAACTGAAGAAGGAGAAAGTGGTAGGAAGAGA 4118
Query 3669 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAGTTTAGAAACCCCTCTGTTTG 3728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4119 AGAACTTGTCAAATTTCTGCTGGATGCAATGGCTGTTCAATTTAGAAACCCCTCTGTTTG 4178
Query 3729 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 3761
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4179 GAGCTAAAGAGAGTAAATAAAGAGCCACTTTTT 4211
Score = 226 bits (122), Expect = 1e-57
Identities = 128/131 (98%), Gaps = 0/131 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGTGGAAGAAGG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 382 GAGGAAATGGGTCGCAGCAGTTCGAAGAAAAAGAAGAAACGAGGAGGTAGCGGAAGAAGG 441
Query 61 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTTTATCGGAGGAG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 442 GGTCAGCTGAAAGACCATGGATCTAATGCTGATGAAGATAATGAACTTCTATCTGAGGAG 501
Query 121 ATCACTGCTCT 131
|||||||||||
Sbjct 502 ATCACTGCTCT 512
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187323365162
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5