BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg486431 Length=2146 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G59660.1 | Symbols: | C2 domain-containing protein / GRAM d... 3136 0.0 > AT3G59660.1 | Symbols: | C2 domain-containing protein / GRAM domain-containing protein | chr3:22034171-22038658 REVERSE LENGTH=2214 Length=2214 Score = 3136 bits (1698), Expect = 0.0 Identities = 1957/2076 (94%), Gaps = 41/2076 (2%) Strand=Plus/Plus Query 90 TTTTT-ACTCCGTTGATCGAGATGGTACAGTCAGCGGTGGAAGTTCTATTACCGTCGTCG 148 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 154 TTTTTAACTCCGTTGATCGAGATGGTACAGTCAGCGGTGGAAGTTCTATTACCGTCGGCG 213 Query 149 TGGGAGATTGAGGTTGCGGTGGTCGCTTCTGTATTTTTGATTGCTTCTTATTGGTTATTC 208 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||| Sbjct 214 TGGGAGATTGAGGTCGCGGTGGTCGCTTCTGTGTTTTTAATCGCTTCCTATTGGCTATTC 273 Query 209 GCTTACAGAGGAGGCGGAGATGACGATGTCGTTGGTGTTGGATTTGATCGGTCTCGTCTC 268 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 274 GCTTACAGAGGAGGCGGAGATGACGATGTCGTCGGTGTTGGATTTGATCGGTCTCGTCTC 333 Query 269 ATGCAGAATCTCGATTCCGGTGACGCCATCTTTGACAAAGACAAGATAGGACAGTTGAGA 328 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 334 ATGCAGAATCTCGATTCCGGTGACG-C--CTTTGACAAAGACAAGATAGGACACTTGAGA 390 Query 329 GGAGACACTCAAACTAATGCTGCTTATATAATCAAGGTGGAACTGTTGGCTGCTAAGAAT 388 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 391 GGAGACACTCAAACTAATGCTGCTTATATAGTCAAGGTGGAACTCTTGGCTGCTAAGAAT 450 Query 389 CTAATTGGTGCAAACTTAAATGGAACATCCGATCCTTATGCTATTGTTAATTGTGGATCA 448 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 451 CTAATTGGTGCTAACTTAAATGGAACATCAGATCCTTATGCTATTGTTAATTGTGGATCA 510 Query 449 GAAAAGCGATTCAGTTCTATGGTCCCTGGCTCGAGAAATCCAATGTGGGGTGAAGAGTTC 508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 511 GAAAAGCGATTCAGTTCTATGGTCCCTGGCTCGAGAAATCCAATGTGGGGTGAAGAGTTC 570 Query 509 AATTTTCCCACAGATGAGCTTCCTGTTAAGATCAATGTAACAATTCATGATTGGGATATC 568 ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 571 AATTTTCCCACAGATGAACTTCCTGCTAAGATTAATGTAACAATTCATGATTGGGATATC 630 Query 569 ATTTGGAAAAGTACTGTTCTTGGCTCAGTAACTATTAATGTTGAACGTGAAGGCCAAACG 628 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 631 ATTTGGAAAAGTACTGTTCTTGGCTCAGTAACTATTAATGTTGAACGTGAAGGCCAAACG 690 Query 629 GGTCCAGTGTGGCACTCATTAGACAGCCCATCTGGGCAGGTTTGCCTTAATATTAATGCA 688 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 691 GGTCCAGTGTGGCACTCATTAGACAGCCCGTCTGGGCAGGTTTGCCTTAACATTAATGCA 750 Query 689 ATCAAACTACCTATAAACGCTCCTAGGGCTGTAACTGGATATGCTGGAGCCGGTAGAAGA 748 ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 751 ATCAAACTACCCGTGAATGCTCCTAGGGCTGTAACTGGATATGCTGGAGCCGGTAGAAGA 810 Query 749 AGGGTCACATTGGATCAGCAAGGCCCAACAATTGTACATCAAAAACCAGGGCCTCTGCAG 808 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 811 AGGGTCACATTGGATCAGCAAGGCCCAACAATTGTACATCAAAAGCCAGGGCCTCTGCAG 870 Query 809 ACGATATTTGATCTCCTCCCGGATGAGGTTGTTGAGCACAGTTATTCATGTGCCCTGGAG 868 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 871 ACGATATTTGATCTCCTCCCGGATGAGGTTGTCGAGCACAGTTATTCATGTGCCCTGGAG 930 Query 869 AGGTCATTCCTGTATCATGGCCGAATGTATGTTTCCGCGTGGCACATATGTTTTCACTCC 928 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 931 AGGTCATTCCTGTATCATGGCCGAATGTATGTTTCCGCGTGGCACATATGTTTCCACTCC 990 Query 929 AATGTTTTCTCTAAGCAAATGAAGGTTGTTGTCCCTCTGGGAGATATAGATGAGATCCGT 988 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 991 AATGTTTTCTCTAAGCAAATGAAGGTTGTTGTCCCTCTCGGAGATATAGATGAGATTCGT 1050 Query 989 AGAAGTCAACACGCATTGATAAACCCAGCTATAACAATCATTCTACGGATGGGTGCTGGT 1048 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1051 AGAAGTCAACACGCGTTGATAAACCCAGCTATAACAATCATACTACGGATGGGTGCTGGT 1110 Query 1049 GGACATGGTGTTCCCCCTCTTGGGACTCCTGATGGTAGAGTGAGGTATAAATTTGCGTCG 1108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1111 GGACATGGTGTTCCCCCTCTTGGGACTCCTGATGGTAGAGTGAGGTATAAATTTGCATCA 1170 Query 1109 TTTTGGAACAGGAACCATACACTAAAAGCATTGCAACGTGCAGTTAATAATTATCATGCA 1168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 1171 TTTTGGAACAGGAACCATACACTAAAAGCATTGCAACGTGCGGTGAATAATTATCATGCA 1230 Query 1169 ATGTTAGAAGTTGAAAAGAAGGAGAGAGCAGAGTCTGCTTTACGTGCTCATAGTAGCTCT 1228 ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1231 ATGTTAGAAGTCGAAAAGAAGGAGAGAGCACAGTCTGCTTTGCGTGCTCATAGTAGCTCT 1290 Query 1229 GTGAAAGGAGGTGGTAAAGTACAGGTCAAAGCTCCTGAAGATACTGCAGCTGTACCTGTA 1288 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1291 GTGAAAGGAGGTGGTAAAGTACAAGTGAAAGCTCCTGAAGATACTGCAGCTGTACCTGTA 1350 Query 1289 AAGTTTCAGGCTTTCATCAAGGAAGAAGTCCTTGTCAACATCTACAATGATGTTTTTGCC 1348 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1351 AAGTTTCAGGCTTTCATCAAAGAAGAAGTCCTTGTTAACATCTACAATGATGTTTTTGCC 1410 Query 1349 AGCACACCTGAGCAAGTCCTGAACGTCTTGTTGGCTGATGATTCCACTTATACTAATGAG 1408 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1411 AGTACACCTGAGCAAGTCCTGAACGTCTTGTTGGCTGATGATTCCACTTATACTAATGAG 1470 Query 1409 TACAGATCTGCACGGAAGGATAAAAATCTCAATATTGAGCCGTGGCATACTGCTGAAGAA 1468 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1471 TACAGATCTGCACGGAAGGATAAAAATCTTAATATTGAGCCGTGGCATACTGCTGAAGAA 1530 Query 1469 TATGATGGTCAAGTTAGAGAGATTAAGTTCAGATCCATTTGTAATAGTCCGATGTGTCCA 1528 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1531 TATGATGGTCAAGTTAGAGAGATTAAGTTTAGATCCATTTGTAATAGTCCGATGTGTCCA 1590 Query 1529 CCAGACACTGCTGTGACGGAATGGCAGCACGTTGTTCTATCACCAGATAAGAAAGTGCTG 1588 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1591 CCAGACACTGCTGTGACGGAATGGCAGCATGTTGTTCTATCACCAGATAAGAAAGTGCTG 1650 Query 1589 GTTTTTGAAACTGTGCAACAGCCACATGATGTTCCTTTTGGTTCTTACTTTGAGGTCCAC 1648 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1651 GTTTTTGAAACAGTGCAACAGCCACATGATGTTCCTTTTGGTTCTTACTTTGAGGTCCAC 1710 Query 1649 TGTCGATGGCGCTTGGAAGCTAAAGACGAGACTTCATCTGTTATAGATATAAGAGTCGGT 1708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1711 TGTCGATGGCGCTTGGAAGCTAAAGACGAGACTTCATCTGTTATAGATATAAGAGTCGGT 1770 Query 1709 GTACATTTCAAAAAATGGTGTTTGATGCAATCGAAGATTAAAGCAGGGGCAATTGACGAG 1768 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1771 GTACATTTCAAGAAATGGTGTTTGATGCAATCGAAGATTAAAGCAGGGGCAATTGACGAG 1830 Query 1769 GCGTCATTTTTGTCTGATGCATTTGTTTTTGACACTTTACACAAAGTGGCATTGTCGTAT 1828 || | | || | || | | | | | | | ||||||||||||||| Sbjct 1831 TA--CAAGAAAGAA-G-TGGAAGTGAT---G-C--T--AGA-A--GTGGCATTGTCGTAT 1875 Query 1829 CTCTCAAGTCACACTCATCCTCAAGTAGCCTTGGTGATATAGACAAGTCTGCTCTATCAT 1888 ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1876 CTC--AAGTCACACTCTTCCTCAAGTAGCCATGGTGATATAGACAAGTCTGCTCTATCAT 1933 Query 1889 CTCCAACACCAGAAAACATCAGCTAAAACCTAATTTACCAAAATCAAGAAGCTTCTCAAA 1948 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1934 CTCCAACACCAGAAAACATCAGCTAAAACCTAATTTACCAAAATCAAAAAGCTTCTCAAA 1993 Query 1949 GTTTCATTCTCCAGCCAGC----------CA---A--AT-ATTTTTCTTCCTT-TTTTAC 1991 ||||||||||||||||||| || | || |||||||||| || |||||| Sbjct 1994 GTTTCATTCTCCAGCCAGCTAATTAAGATCATCCACCATCATTTTTCTTC-TTCTTTTAC 2052 Query 1992 ATGTGAAAGTGTATATGCGGTAACGGTAATTA-GAATGAATATTTACAGGGGCTTGTCTG 2050 |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 2053 ATGTTAAAGTGTATATGTGGTAACAGTAATTATGAATGGATATTTACAGAGGCTTGTCTG 2112 Query 2051 ATTTCTGGTACTTCCGACAGATAACAAAAGAAAACTTTGAGTTCTCTCACAACTCTATCT 2110 ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | Sbjct 2113 ATTTCTGGTACTTGTGACA-ATAACAAAGGAAAAGTTTGGGTTCTCTCACAACTCTATTT 2171 Query 2111 ATATTGGCAAATACTAAGTATGTAACAATTCCAATT 2146 ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct 2172 GTATTGGCAAATACAAAGTAAGTGACAATTCCAATT 2207 Score = 143 bits (77), Expect = 8e-33 Identities = 86/90 (96%), Gaps = 2/90 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTTCTTCTTCTTCTAAAGAAGGCGAAGTTTCTTCTCTCCAGAATAATGTTGATTCTCTGT 60 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 22 CTTGTTCTTCTTCTAAAGAAGGCGAAGTTTCTTCTCTCCAGAATAATGTTGATTCTCTGT 81 Query 61 CGT-GTGATCCTCCATAGGATTAATCCCTA 89 || ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 82 -GTTGTGATCCTCCATAGGATAAATCCCTA 110 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 106425155400 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5