BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486626
Length=3572
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G28350.1 | Symbols: | Quinoprotein amine dehydrogenase, bet... 5840 0.0
AT3G61480.1 | Symbols: | Quinoprotein amine dehydrogenase, bet... 5201 0.0
AT5G28442.1 | Symbols: | BEST Arabidopsis thaliana protein mat... 340 4e-92
> AT5G28350.1 | Symbols: | Quinoprotein amine dehydrogenase, beta
chain-like; RIC1-like guanyl-nucleotide exchange factor
| chr5:10320139-10326946 FORWARD LENGTH=3711
Length=3711
Score = 5840 bits (3162), Expect = 0.0
Identities = 3438/3571 (96%), Gaps = 19/3571 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 TAGCCAAAGATGTATATGGCTTACGGATGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCTAGAAGGATCG 66
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 154 TAGCCAAAGATGTATATGGCTTACGGGTGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCTACCTGGATCG 213
Query 67 TGTCCGTCTTCTCAGCGAGTCGTGTACCTTAAGCTCGCCGGCCGGCTATTGCTGGTTGTT 126
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 214 TGTCCGTCTTCGCAGCGAGTCGTGTACCTTAAGCTCGCCGGCCGGCTATTGCTGGTAGTT 273
Query 127 TCTCCGTCTCACTTGGAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTAT 186
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 TCTCCGTCTCACCTGGAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTAT 333
Query 187 ATGAGAGATGACAGGTCGGTGCGAGAAGAAGGAGAGAATTTGCAAGCTGTGTGGAGTCCA 246
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATGAGAGATGACAAGTCTGTGCGAGAAGAAGGAGAGAATTTGCAAGCTGTGTGGAGTCCA 393
Query 247 GACTCCAAATTGATTGCTCTTCTTACATCATCATTCTTCCTTCATATATATAAAATTAAG 306
||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 394 GACGCCAAATTGATTGCTGTTCTTACATCATCGTTCTTTCTTCATATATATAAAATTAAG 453
Query 307 TTTACTGATAAACGAGTAAAACCCGGAGAGAGACAACCCTCGGAGTTGTCTTTTGCGACC 366
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 454 TTTACCGATAAAAGAGTAAAACCCGGAGAGAGACAACCCTCGGAGTTGTGTTTTGCAACC 513
Query 367 ATATCTCTTTTGCTAAGTGAGCAGGTCCCTTTTGCTGGGAAGGACTTGTCTGTGAGCAAT 426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 514 ATATCTCTTTTGCTAAGTGAGCAGGTCCCTTTTGCTGGCAAGGACTTGTCTGTGAGCAAT 573
Query 427 TTTGTGAGGGACAGCAAAACTATGCTTTTGGGACTTTCTGATGGATGTTTATATAGTATT 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||
Sbjct 574 TTTGTGAGGGACAGCAAAACTATGCTTTTGGGACTCTCCGATGGATCTTTATATAGTATT 633
Query 487 TCCTGGAAAGGAGAGTTTGGTGGAGCTTTCAGTATTGGCTCCCACCCTTCTGATAGCAAC 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 634 TCCTGGAAAGGAGAGTTTGGTGGAGCTTTCAGTATTGGCTCCCACCCTTCTGATAGCAAC 693
Query 547 GATGATAGACTCTTGTCCTACACTCTTGGTAATGGGCTAGTCTCTGGAGTTGCTTCAGCA 606
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 694 GATGATAGACTCTTGTCCTACACTCTCGGTAATGGGCTAGTCTCTGGAGTAGCTTCACCA 753
Query 607 GCACTTGCATCTGATGATGAATTCTCAACAAAAT-CGGCTATTGTTCAGCTGGAACTCTG 665
||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 754 ACACTTGCATCTGATGATAAATTCTCTAC-AAATCCGGCTATTGTTCAGCTGGAACTTTG 812
Query 666 CACTCGCTCGAAGTTATTGTTTGTGTTAAATTCTGATGGGCAGCTAGTAGTATGCTCTGT 725
|||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 CACTCGTTCCAAGTTATTGTTTGTGTTAAATTCGGATGGGCAGCTAGTAGTATGCTCTGT 872
Query 726 GAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACTGAGAGCATTAAAGCTGAGAAGAA-GTTGGGTGGTG 784
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 873 GAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACGGAGAGTATTAGAGCTGAGAAGAAGGTT-GGTGGTG 931
Query 785 ATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCAGAGCAACAAATTCTTGCTGTGGGTACAAGAAAAG 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 ATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCAGAGCAACAAATTCTTGCTGTGGGTACAAGAAAAG 991
Query 845 GGATGGTGGAATTATATGATCTGTCACAATCGATCTCTCTCTTACGAACGGTTTCTTTGC 904
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 992 GGATGGTGGAATTATATGATCTATCACACTCGATCTCTCTCTTGCGAACAGTTTCTTTGC 1051
Query 905 ATGACTGGGGTTATTCAGCGGATTACACTGGGCCTGTCAATAACATTGCATGGACGCCTG 964
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052 ATGATTGGGGTTATTCAGCGGATTACACTGGGCCTGTAAATAACATTGCATGGACGCCTG 1111
Query 965 ATAATTCTGCTTTTGCAGTTGGGTGGAAGTCGAGAGGACTTGCAGTTTGGTCTGTTTCTG 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 ATAATTCTGCTTTTGCAGTTGGGTGGAAGTCGAGAGGACTTGCAGTTTGGTCTGTTTCTG 1171
Query 1025 GATGTCGATTGATGTCAACTGTCCGCCAAATTGGATTGAGTTCTACATCTTCCCCTAAAA 1084
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 GATGTAGATTAATGTCAACTGTCCGCCAAATTGGACTGACTTCTACATCTTCCCCTAAAA 1231
Query 1085 TTAATCCAAAACAAGACAGTAAATACGAACCACTGATGAATGGTACTTCAGCCATCCAGT 1144
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 TTAATCCAAAACAAGACTGTAAATACGAACCACTGATGAGTGGTACTTCAGCCATCCAGT 1291
Query 1145 GGGATGAATATGGATATAGACTATTTGCTACAGAGGAGGCATCA-AGTGATAGAATTCTT 1203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 1292 GGGATGAATATGGATATAGACTATTTGCTACAGAGGAGGCATCATA-TGATAGAATTCTT 1350
Query 1204 GCATTTTCTTTTGGGAAATGTTGCTTAAATAGAGGAGTTTCAGGAAAAACTTATGTTCGT 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 GCATTTTCTTTTGGGAAATGTTGCTTAAATAGAGGAGTTTCAGGAAAAACTTATGTTCGT 1410
Query 1264 CAGGTAATGTATGGTGATGATAGACTACTGATGGTTCAGGCGGAGGACACTGACGAGCTT 1323
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 CAGGTAATGTATGGTGATGATAGACTACTCATGGTTCAGGCGGAGGACACTGACGAGCTT 1470
Query 1324 AAGCTTTTACATCTAAAACTTCCAGTTTCTTATATTACCCAAAATTGGCCTGTTCAACAT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 AAGCTTTTACATCTAAAACTTCCAGTTTCTTATATTAGCCAAAATTGGCCTGTTCAACAC 1530
Query 1384 GTGGCAGCTAGCGAGGATGGGAAATACTTGGCGGTTGCTGGTTTACATGGCCTGATTTTG 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 GTGGCAGCTAGCGAGGATGGGAAATACTTGGCGTTTGCTGGTTTACATGGCCTGATTTTG 1590
Query 1444 TATGACGTTAGGTTTAAGAAGTGGAGGGTATTTGGAGATGTCAGTCAAGAACAACAGATT 1503
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591 TATGACATTAGGTTTAAGAAGTGGAGGGTATTTGGAGATGTCAGTCAAGAACAACAGATT 1650
Query 1504 CATTGCAAGGGTTTGTTATGGTTGGGGAAGATAGTCGTAATCTGTAACTACATCGAAGCT 1563
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1651 CATTGCAAGGGTTTGTTATGGTTGGGGAAGATTGTCGTAATCTGTAACTACATTGAAGCT 1710
Query 1564 TCTGAGACATATGAACTGCTTTTCTATCCAAGATATCACCTTGATCAGAGCTCTTTACTT 1623
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 TCTGAGACATATGAGCTGCTTTTCTATCCAAGATATCACCTTGATCAGAGCTCTTTACTT 1770
Query 1624 TGTCGTAAAGTGCTGCTTGGCAAACCAATGGTGATGGATGTGTACCAGGATTATATACTT 1683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1771 TGTCGTAAAGTGCTGCTTGGCAAACCAATGGTGATGGATGTTTACCAGGATTATATACTT 1830
Query 1684 GTATCTTATCTTCCGTTTGTCATCCACGTCTACCATGTGAAGATATATGGCGAATTGACA 1743
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1831 GTATCTTATCTTCCGTTTTTCATCCACGTCTACCATGTGAAGATATATGGTGAATTGACA 1890
Query 1744 CCTTCAAGCAAAGCAGATCTACAGCTTTCCACAGTAAGAGAGTTGTCCATCATGACTGCA 1803
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891 CCTTCAAGCAAAGCAGATCTGCAGCTTTCCACAGTAAGAGAGTTGTCCATCATGACTGCA 1950
Query 1804 AAGAGCCATCCAGCAGCAATGCGATTTGTTCCTGACCAGCACCCGAGAGAAGGCGAGTTG 1863
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1951 AAGAGCCATCCAGCAGCAATGGGATTTGTTCCTGATCAGCACCTGAGAGAAGGCGAATTG 2010
Query 1864 GATAATGATAATTTGTCTTCTGATTTGTCAGACAGGGAACCCTCAAGATGTCTTATACTG 1923
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 GATAATGATAATTTGTCTTCTGATTTGTCGGACAGGGAACCCTCAAGATGTCTTATACTG 2070
Query 1924 AGGGGAAACGGGGAGCTTTCACTTCTTGATTTGGTTGATGGACGAGAGAGGGAACTTACA 1983
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 AGAGGAAATGGGGAGCTTTCACTTCTTGATTTGGTTGATGGACGAGAGAGGGAACTTACA 2130
Query 1984 GACTCAGTTGAACTATTTTGGGTGACATGTGGTCAATCGGAGGAGAAGACAAATCTTGTC 2043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131 GACTCAGTTGAACTATTTTGGGTGACATGTGGTCAATCGGAGGAGAAGACAAATCTTGTC 2190
Query 2044 GAGGAAGTATCTTGGCTAGATTATGGACACCGAGGAATGCAGGTTTGGTATCCTTCTCTA 2103
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 GAGGAAGTTTCTTGGCTAGATTATGGACACCGAGGAATGCAGGTTTGGTATCCTTCTCTA 2250
Query 2104 GGGGATGATCCTTTTATGCAAGAGGATTTCCTGCAGTTGGATCCAGAGTTGGAATTTGAT 2163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2251 GGGGATGATCCTTTTATGCAAGAGGATTTCCTGCAGCTGGATCCAGAGTTGGAATTTGAT 2310
Query 2164 CGTGAGGTGTATCCCTTGGGACTTTTACCAAACGTGGGTGTCGTTGTCGGAGTTTCTCAA 2223
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2311 CGCGAGGTGTATCCCTTGGGACTTTTACCAAACGTGGGCGTCGTTGTCGGAGTTTCTCAG 2370
Query 2224 AGAATGTCATTTTCGGCAAGCGCAGAGTTTCCCTGTTTTGAGCCTACACCCCAGGCTCAG 2283
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2371 AGAATGTCATTTTCGGCAAGCGCAGAGTTTGCGTGTTTTGAGCCTACACCCCAGGCTCAG 2430
Query 2284 ACTATACTACATTGCCTGCTCCGCCACCTCCTTCAGAGAGATAAAAATGAAGAGGCGTTA 2343
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 ACTATACTACATTGCCTGCTCCGTCACCTCCTTCAGAGAGATAAAAATGAAGAGGCGTTA 2490
Query 2344 CTCTTAGCACAATTATCGGCAGAGAAACCTCACTTCTCCCATTGTCTGGAGTGGCTTCTT 2403
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 CTCTTAGCACAATTATCGGCAGAGAAACCCCACTTCTCCCATTGTCTGGAGTGGCTTCTT 2550
Query 2404 TTCACTGTTTTTGATGCAGATATTTCTAGGCCAAATCCAAACAGGAACCAGATTTCAGGA 2463
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2551 TTTACTGTTTTTGATGCAGAGATTTCTAGGCCAAATCCAAATAGGAACCAGATTTCAGGA 2610
Query 2464 CCTGGATATATTAAAAAGTTGTCCCTTTTGAAAAAAGCCTGTGATTTAATAAAAAATTTC 2523
|||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2611 CCTGGACATCTTAAAAAGTTATCCCTTTTGAGAAAAGCCTGTGATTTAATAAAAAAATTC 2670
Query 2524 CCTGAGTACTATGATGTGGTTGTGAATGTAGCCAGAAAAACCGATGCCCGTCACTGGGCT 2583
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 CCGGAGTACTATGATGTGGTTGTGAATGTAGCCAGAAAAACCGATGCCCGTCACTGGGCT 2730
Query 2584 GATTTATTTTCTGCTGCTGGGATATCAACAACGTTGTTTGAGGACTGCTTCCAGCGAAGA 2643
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2731 GATTTATTTTCTGCTGCTGGGATATCAACAACGTTATTTGAGGACTGCTTCCAGCGAAGA 2790
Query 2644 TGGTATCGAACCGCAGCTTGCTATATACTTGTGATTGCCAAACTAGAAGGTGTTGCTGTC 2703
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 TGGTATCGAACTGCAGCTTGCTATATCCTTGTGATTGCCAAACTAGAAGGTGTTGCTGTC 2850
Query 2704 AGTCAGTACTGTGCATTACGGCTATTGCAGGCGACACTTGATGAGTCCCTCTATGATCTT 2763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 AGTCAGTACTGTGCATTACGGCTATTGCAGGCGACACTTGATGAGTCCCTCTATGATCTT 2910
Query 2764 GCTGGAGAACTAGTGAGGTTCTTACTAAGATCTGGAAGAGACATCGAGCAGGCGCCAACA 2823
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2911 GCTGGAGAGCTAGTGAGGTTCTTACTAAGATCTGGAAGAGACATTGAGCAGGCGCCAACA 2970
Query 2824 GAATCAGATTCATTGTCACCTAAGCTTCTCGGGTTTC-TTATTTTCGGTTCCAGCCATAA 2882
|||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||
Sbjct 2971 GAATCAGATTCATTATCGCCTAAGCTTCTCGG-TTTCCTTATTTTTGGCTCCAGCCACAA 3029
Query 2883 GAAATCATCACTTGATAAGAGCTCCTCATTCAAAGAGCAAAGTCCTCATGTTGCTTCTGT 2942
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3030 GAAATCATCACTCGATAAGAGCTCCTCGTTCAAAGAGCAAAGTCCTCATGTTGCTTCTGT 3089
Query 2943 AAAGAGCATACTTGAAAGTCATGCCAGTTACTTGATGTCTGGTAAAGAAATTTCAAAGCT 3002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3090 AAAGAGCATACTTGAAAGTCATGCCAGTTACTTGATGTCTGGTAAAGAACTTTCAAAGCT 3149
Query 3003 TGTTGCATTCGTCAAAGGCACCCAGTTTGATATCGTGGATTTTCTTCAACGAGAAAGATA 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3150 TGTTGCATTCGTCAAAGGCACCCAGTTTGATATTGTGGATTTTCTTCAACGAGAAAGATA 3209
Query 3063 TGGTTGTGCGCAGCTGCAGAATTTCGCTGCAGGACTTGAACTGATTGGGCAAAAGCTGCA 3122
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3210 TGGTTGTGCGCAGCTGCAGAATTTTGCTGCAGGACTTGAACTGATTGGGCAAAAGCTGCA 3269
Query 3123 AATGAGTGAGCTACAGAACAGGTTAGATGCAGAGTTTCTATTGGCTCAGATGTGTTCTGT 3182
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3270 AATGAGTGAGCTACAGAACCGGTTAGATGCAGAGTTTCTATTGGCTCAAATGTGCTCTGT 3329
Query 3183 CAAATTCAAAGAATGGATAGTTGTTCTTGCCACTCTTTTACAACGGTCCGAGGTTCTTTA 3242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3330 CAAATTCAAAGAATGGATAGTTGTTCTTGCCACTCTTTTACAACGGTCTGAGGTTCTTTA 3389
Query 3243 TGATATTTTCCGGTATGATCTACGGTTGTGGAAAGCATATAGCATGACATTAGAGTCTCA 3302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3390 TGATATTTTCCGGTATGATCTACGGTTGTGGAAAGCATATAGCGTGACATTAGAGTCTCA 3449
Query 3303 CTTGGCTTTCGCTCAGTACCATGACTTGCTTCAGATTTTAGAGGAAAAACTCTCAGCGAC 3362
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3450 CTTGGCTTTCGCTCATTACCATGACTTACTTCAGATTTTAGAGGCAAAACTCTCAGCGAC 3509
Query 3363 CTCACGAGAAGAAAGCAATAGAGGTTCCATCTCTTGATAAATCACTATATTTTTGAAGCT 3422
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 3510 CTCACGAGAAGAAAGCAATAGAGGTTCCATCTCTTGATAAATCATTTTATTTTTGAAGCT 3569
Query 3423 TTTTCACATTAAACATTTTCTGCCTGAGTTTTCGCATTCGTGTAGATAA-CATTAATTTT 3481
||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 3570 TTTTCACATCAAACATTTTCTGCCTGAGTTTTCACGTTCGTGTAGATAAACAT-AATTTG 3628
Query 3482 CAGAAGAAATAAGAAATACATCACCTCACATACTTTTACTATTTATTTAGTTATTTTGGT 3541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 3629 -AGAAGAAATAAGAAATACATCACCTCACATACTTTTACTATTTATTT--T------GGT 3679
Query 3542 CTCAATAGAAAGGAAAAGAAATGTAGAAGTC 3572
| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3680 CACAATAGAAAGGAAAAGAAATGTATAAGTC 3710
> AT3G61480.1 | Symbols: | Quinoprotein amine dehydrogenase, beta
chain-like; RIC1-like guanyl-nucleotide exchange factor
| chr3:22749984-22756584 FORWARD LENGTH=3351
Length=3351
Score = 5201 bits (2816), Expect = 0.0
Identities = 3020/3120 (97%), Gaps = 8/3120 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 391 GTCCCTTTTGCTGGGAAGGACTTGTCTGTGAGCAATTTTGTGAGGGACAGCAAAACTATG 450
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 238 GTCCCTTTTGCTGGCAAGGACTTGTCTGTGAGCAATTTTGTTAGGGACAGCAAAACTATG 297
Query 451 CTTTTGGGACTTTCTGATGGATGTTTATATAGTATTTCCTGGAAAGGAGAGTTTGGTGGA 510
||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CTTTTGGGACTCTCCGATGGATCTTTATATAGTATTTCCTGGAAAGGAGAGTTTGGTGGA 357
Query 511 GCTTTCAGTATTGGCTCCCACCCTTCTGATAGCAACGATGATAGACTCTTGTCCTACACT 570
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GCTTTCAGTATTGGCTCCCACCCTTCTGCTAGCAACGATGATAGACTCTTGTCCTACACT 417
Query 571 CTTGGTAATGGGCTAGTCTCTGGAGTTGCTTCAGCAGCACTTGCATCTGATGATGAATTC 630
|||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 418 CTTGGTAATGGGCTAGTCTCTGGAGTAGCTTCACCAACACTTGCATCTGATGATAAATTC 477
Query 631 TCAACAAAATCGGCTATTGTTCAGCTGGAACTCTGCACTCGCTCGAAGTTATTGTTTGTG 690
|| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 478 TCTACAAAACCGGCTATTGTTCAGCTGGAACTTTGCACTCGTTCCAAGTTATTGTTTGTG 537
Query 691 TTAAATTCTGATGGGCAGCTAGTAGTATGCTCTGTGAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACT 750
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 TTAAATTCGGATGGGCAGCTAGTAGTATGCTCTGTGAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACT 597
Query 751 GAGAGCATTAAAGCTGAGAAGAAGTTGGGTGGTGATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCA 810
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GAGAGTATTAGAGCTGAGAAGAAGTTGGGTGGTGATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCA 657
Query 811 GAGCAACAAATTCTTGCTGTGGGTACAAGAAAAGGGATGGTGGAATTATATGATCTGTCA 870
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 658 GAGCAACAAATTCTTGCTGTGGGTACAAGAAAAGGGATGGTGGAGTTATATGATCTGTCA 717
Query 871 CAATCGATCTCTCTCTTACGAACGGTTTCTTTGCATGACTGGGGTTATTCAGCGGATTAC 930
|| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CACTCGATCTCTCTCTTGCGAACAGTTTCTTTGCATGACTGGGGTTATTCAGCGGATTAC 777
Query 931 ACTGGGCCTGTCAATAACATTGCATGGACGCCTGATAATTCTGCTTTTGCAGTTGGGTGG 990
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 ACTGGGCCTGTAAATAACATTGCATGGACGCCTGATAATTCTGCTTTTGCAGTTGGGTGG 837
Query 991 AAGTCGAGAGGACTTGCAGTTTGGTCTGTTTCTGGATGTCGATTGATGTCAACTGTCCGC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 838 AAGTCGAGAGGACTTGCAGTTTGGTCTGTTTCTGGATGTAGATTAATGTCAACTGTCCGC 897
Query 1051 CAAATTGGATTGAGTTCTACATCTTCCCCTAAAATTAATCCAAAACAAGACAGTAAATAC 1110
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 898 CAAATTGGACTGACTTCTACATCTTCCCCTAAAATTAATCCAAAACAAGACTGTAAATAC 957
Query 1111 GAACCACTGATGAATGGTACTTCAGCCATCCAGTGGGATGAATATGGATATAGACTATTT 1170
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 GAACCACTGATGAGTGGTACTTCAGCCATCCAGTGGGATGAATATGGATATAGACTATTT 1017
Query 1171 GCTACAGAGGAGGCATCAAGTGATAGAATTCTTGCATTTTCTTTTGGGAAATGTTGCTTA 1230
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GCTACAGAGGAGGCATCATGTGATAGAATTCTTGCATTTTCTTTTGGGAAATGTTGCTTA 1077
Query 1231 AATAGAGGAGTTTCAGGAAAAACTTATGTTCGTCAGGTAATGTATGGTGATGATAGACTA 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 AATAGAGGAGTTTCAGGAAAAACTTATGTTCGTCAGGTAATGTATGGTGATGATAGACTA 1137
Query 1291 CTGATGGTTCAGGCGGAGGACACTGACGAGCTTAAGCTTTTACATCTAAAACTTCCAGTT 1350
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CTCATGGTTCAGGCGGAGGACACTGACGAGCTTAAGCTTTTACATCTAAAACTTCCAGTT 1197
Query 1351 TCTTATATTACCCAAAATTGGCCTGTTCAACATGTGGCAGCTAGCGAGGATGGGAAATAC 1410
|||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 TCTTATATTAGCCAAAATTGGCCTGTTCAACACGTGGCAGCTAGCGAGGATGGGAAATAC 1257
Query 1411 TTGGCGGTTGCTGGTTTACATGGCCTGATTTTGTATGACGTTAGGTTTAAGAAGTGGAGG 1470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TTGGCGGTTGCTGGTTTACATGGCCTGATTTTGTATGACGTTAGGTTTAAGAAGTGGAGG 1317
Query 1471 GTATTTGGAGATGTCAGTCAAGAACAACAGATTCATTGCAAGGGTTTGTTATGGTTGGGG 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 GTATTTGGAGATGTCAGTCAAGAACAACAGATTCATTGCAAGGGTTTGTTATGGTTGGGG 1377
Query 1531 AAGATAGTCGTAATCTGTAACTACATCGAAGCTTCTGAGACATATGAACTGCTTTTCTAT 1590
||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1378 AAGATTGTCGTAATCTGTAACTTCATTGAAGCTTCTGAGACATATGAGCTGCTTTTCTAT 1437
Query 1591 CCAAGATATCACCTTGATCAGAGCTCTTTACTTTGTCGTAAAGTGCTGCTTGGCAAACCA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CCAAGATATCACCTTGATCAGAGCTCTTTACTTTGTCGTAAAGTGCTGCTTGGCAAACCA 1497
Query 1651 ATGGTGATGGATGTGTACCAGGATTATATACTTGTATCTTATCTTCCGTTTGTCATCCAC 1710
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1498 ATGGTGATGGATGTTTACCAGGATTATATACTTGTATCTTATCTTCCGTTTATCATCCAC 1557
Query 1711 GTCTACCATGTGAAGATATATGGCGAATTGACACCTTCAAGCAAAGCAGATCTACAGCTT 1770
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 GTCTACCATGTGAAGATATATGGTGAATTGACACCTTCAAGCAAAGCAGATCTACAGCTT 1617
Query 1771 TCCACAGTAAGAGAGTTGTCCATCATGACTGCAAAGAGCCATCCAGCAGCAATGCGATTT 1830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TCCACAGTAAGAGAGTTGTCCATCATGACTGCAAAGAGCCATCCAGCAGCAATGCGATTT 1677
Query 1831 GTTCCTGACCAGCACCCGAGAGAAGGCGAGTTGGAT-AATGATAATTTGTCTTCTGATTT 1889
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 GTTCCTGATCAGCACCCGAGAGAAGGCGAATTGGATGAA-GATAATTTGTCTTCTGATTT 1736
Query 1890 GTCAGACAGGGAACCCTCAAGATGTCTTATACTGAGGGGAAACGGGGAGCTTTCACTTCT 1949
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1737 GTCAGAAAGGGAACCCTCAAGATGTCTTATACTGAGAGGAAATGGGGAGCTTTCACTTCT 1796
Query 1950 TGATTTGGTTGATGGACGAGAGAGGGAACTTACAGACTCAGTTGAACTATTTTGGGTGAC 2009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797 TGATTTGGTTGATGGACGAGAGAGGGAACTTACAGACTCAGTTGAACTATTTTGGGTGAC 1856
Query 2010 ATGTGGTCAATCGGAGGAGAAGACAAATCTTGTCGAGGAAGTATCTTGGCTAGATTATGG 2069
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 ATGTGGTCAATCGGAAGAGAAGACAAATCTTGTCGAGGAAGTATCTTGGCTAGATTATGG 1916
Query 2070 ACACCGAGGAATGCAGGTTTGGTATCCTTCTCTAGGGGATGATCCTTTTATGCAAGAGGA 2129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 ACACCGAGGAATGCAGGTTTGGTATCCTTCTCTAGGGGATGATCCTTTTATGCAAGAGGA 1976
Query 2130 TTTCCTGCAGTTGGATCCAGAGTTGGAATTTGATCGTGAGGTGTATCCCTTGGGACTTTT 2189
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 TTTCCTGCAGCTGGATCCAGAGTTGGAATTTGATCGTGAGGTGTATCCCTTGGGACTTTT 2036
Query 2190 ACCAAACGTGGGTGTCGTTGTCGGAGTTTCTCAAAGAATGTCATTTTCGGCAAGCGCAGA 2249
|||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2037 ACCAAACGTGGGCGTCGTTGTTGGAGTTTCTCAGAGAATGTCATTTTCGGCAAGCGCAGA 2096
Query 2250 GTTTCCCTGTTTTGAGCCTACACCCCAGGCTCAGACTATACTACATTGCCTGCTCCGCCA 2309
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2097 GTTTCCGTGTTTTGAGCCTACACCCCAGGCTCAGACTATACTACATTGCCTGCTCCGTCA 2156
Query 2310 CCTCCTTCAGAGAGATAAAAATGAAGAGGCGTTACTCTTAGCACAATTATCGGCAGAGAA 2369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2157 CCTCCTTCAGAGAGATAAAAATGAAGAGGCGTTACTCTTAGCACAATTATCGGCAGAGAA 2216
Query 2370 ACCTCACTTCTCCCATTGTCTGGAGTGGCTTCTTTTCACTGTTTTTGATGCAGATATTTC 2429
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2217 ACCCCACTTCTCCCATTGTCTGGAGTGGCTTCTTTTTACTGTTTTTGATGCAGAGATTTC 2276
Query 2430 TAGGCCAAATCCAAACAGGAACCAGATTTCAGGACCTGGATATATTAAAAAGTTGTCCCT 2489
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||
Sbjct 2277 TAGGCCAAATCCAAACAGGAACCAGATTTCAGGACCTGGACATCTTAAAAAGTTATCCCT 2336
Query 2490 TTTGAAAAAAGCCTGTGATTTAATAAAAAATTTCCCTGAGTACTATGATGTGGTTGTGAA 2549
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2337 TTTGAGAAAAGCCTGTGATTTAATAAAAAATTTCCCCGAGTACTATGATGTGGTTGTGAA 2396
Query 2550 TGTAGCCAGAAAAACCGATGCCCGTCACTGGGCTGATTTATTTTCTGCTGCTGGGATATC 2609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2397 TGTAGCCAGAAAAACCGATGCCCGTCACTGGGCTGATTTATTTTCTGCTGCTGGGATATC 2456
Query 2610 AACAACGTTGTTTGAGGACTGCTTCCAGCGAAGATGGTATCGAACCGCAGCTTGCTATAT 2669
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2457 AACAACATTGTTTGAGGACTGCTTCCAGCGAAGATGGTATCGAACTGCAGCTTGCTATAT 2516
Query 2670 ACTTGTGATTGCCAAACTAGAAGGTGTTGCTGTCAGTCAGTACTGTGCATTACGGCTATT 2729
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2517 CCTTGTGATTGCAAAACTAGAAGGTGTTGCTGTCAGTCAGTACTGTGCTTTACGGCTATT 2576
Query 2730 GCAGGCGACACTTGATGAGTCCCTCTATGATCTTGCTGGAGAACTAGTGAGGTTCTTACT 2789
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2577 GCAGGCGACACTTGACGAGTCCCTCTATGATCTTGCTGGAGAGCTAGTGAGGTTCTTACT 2636
Query 2790 AAGATCTGGAAGAGACATCGAGCAGGCGCCAACAGAATCAGATTCATTGTCACCTAAGCT 2849
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2637 AAGATCTGGAAGAGACATTGAGCAGGCGCCAACAGAATCAGATTCATTATCGCCTAAGCT 2696
Query 2850 TCTCGGGTTTCTTATTTTCGGTTCCAGCCATAAGAAATCATCACTTGATAAGAGCTCCTC 2909
|||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2697 TCTCGGTTTTCTTATTTTTGGCTCCAGCCACAAGAAATCATCACTCGATAAGAGCTCCTC 2756
Query 2910 ATTCAAAGAGCAAAGTCCTCATGTTGCTTCTGTAAAGAGCATACTTGAAAGTCATGCCAG 2969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 GTTCAAAGAGCAAAGTCCTCATGTTGCTTCTGTAAAGAGCATACTTGAAAGTCATGCCAG 2816
Query 2970 TTACTTGATGTCTGGTAAAGAAATTTCAAAGCTTGTTGCATTCGTCAAAGGCACCCAGTT 3029
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 TTACTTGATGTCTGGTAAAGAACTTTCAAAGCTTGTTGCATTCGTCAAAGGCACCCAGTT 2876
Query 3030 TGATATCGTGGATTTTCTTCAACGAGAAAGATATGGTTGTGCGCAGCTGCAGAATTTCGC 3089
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2877 TGATAT--TG-ATTTTCTTCAACGAGAAAGATATGGTTGTGCGCAGCTGCAGAATTTTGC 2933
Query 3090 TGCAGGACTTGAACTGATTGGGCAAAAGCTGCAAATGAGTGAGCTACAGAACAGGTTAGA 3149
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2934 TGCAGGGCTTGAACTGATTGGGCAAAAGCTGCAAATGAGTGAGCTACAGAACCGGTTAGA 2993
Query 3150 TGCAGAGTTTCTATTGGCTCAGATGTGTTCTGTCAAATTCAAAGAATGGATAGTTGTTCT 3209
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2994 TGCAGAGTTTCTATTGGCTCAGATGTGCTCCGTCAAATTCAAAGAATGGATAGTTGTTCT 3053
Query 3210 TGCCACTCTTTTACAACGGTCCGAGGTTCTTTATGATATTTTCCGGTATGATCTACGGTT 3269
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 TGCCACTCTTTTACAACGGTCTGAGGTTCTTTATGATATTTTCCGGTATGATCTACGGTT 3113
Query 3270 GTGGAAAGCATATAGCATGACATTAGAGTCTCACTTGGCTTTCGCTCAGTACCATGACTT 3329
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 GTGGAAAGCATATAGCGTGACATTAGAGTCTCACTTGGCTTTCGCTCAGTACCATGACTT 3173
Query 3330 GCTTCAGATTTTAGAGGAAAAACTCTCAGCGACCTCACGAGAAGAAAGCAATAGAGGTTC 3389
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 ACTTCAGATTTTAGAGGCAAAACTCTCAGCGACCTCACGAGAAGAAAGCAATAGAGGTTC 3233
Query 3390 CATCTCTTGATAAATCACTATATTTTTGAAGCTTTTTCACATTAAACATTTTCTGCCTGA 3449
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3234 CATCTCTTGATAAATCATTTTATTTTTGAAGCTTTTTCACATCAAACATTTTCTGCCTGA 3293
Query 3450 GTTTTCGCATTCGTGTAGATAA-CATTAATTTTCAGAAGAAATAAGAAATACATCACCTC 3508
|||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3294 GTTTTCACGTTCGTGTAGATAAACAT-AATTTG-AGAAGAAATAAGAAATACATCACCTC 3351
Score = 327 bits (177), Expect = 3e-88
Identities = 227/249 (91%), Gaps = 12/249 (5%)
Strand=Plus/Plus
Query 22 ATGGCTTACGGATGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCTAGAAGGATCGTGTCCGTCTTCTCAG 81
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || | || |||
Sbjct 1 ATGGCTTACGGGTGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCT------A-CCTG---G--ATCGCAG 48
Query 82 CGAGTCGTGTACCTTAAGCTCGCCGGCCGGCTATTGCTGGTTGTTTCTCCGTCTCACTTG 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 49 CGAGTCGTGTACCTTAAGCTCGCCGGCCGGCTATTACTGGTCGTTTCTCCGTCTCACCTG 108
Query 142 GAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTATATGAGAGATGACAGG 201
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 109 GAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTATATGAGAGATGACAAG 168
Query 202 TCGGTGCGAGAAGAAGGAGAGAATTTGCAAGCTGTGTGGAGTCCAGACTCCAAATTGATT 261
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 TCGTTGCGAGAAGAAGGAGAGAATTTGCAAGCTGTGTGGAGTCCAGACTCCAAATTGATT 228
Query 262 GCTCTTCTT 270
||| |||||
Sbjct 229 GCTGTTCTT 237
> AT5G28442.1 | Symbols: | BEST Arabidopsis thaliana protein match
is: Quinoprotein amine dehydrogenase, beta chain-like;
RIC1-like guanyl-nucleotide exchange factor (TAIR:AT5G28350.1).
| chr5:10368385-10369186 REVERSE LENGTH=712
Length=712
Score = 340 bits (184), Expect = 4e-92
Identities = 217/232 (94%), Gaps = 5/232 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 TAGCCAAAGATGTATATGGCTTACGGATGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCTAGAAGGATCG 66
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 158 TAGCCAAAGATGTATATGGCTTACGGGTGGCCGCAGGTGATCCCGCTTCTACCTGGATCG 217
Query 67 TGTCCGTCTTCT-CAGCGAGTCGTGTACCTTAAGCTCGCCGGCCGGCTATTGCTGGTTGT 125
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||
Sbjct 218 TGTCCGTCTT-TGCAGCGAGTCGTGTACCTTAAGCTCTCCGGCCAGCTATTGCTGGTCGT 276
Query 126 TTCTCCGTCTCACTTGGAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTA 185
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 TTCTCCGTCTCACCTGGAGCTTTGGGGTTCTTCTCAGCAACGAGTGAGGTTGGGAAAGTA 336
Query 186 TATGAGAGATGACAGGTCGGTGCGAGAAGAAGGAGAGAATTTGCAAGCTGTG 237
|||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 337 TATGAGAGATGACAAGTCGTTGCGAGAAG--G-AGAGAATTTGCAAGCTGTG 385
Score = 296 bits (160), Expect = 9e-79
Identities = 177/185 (96%), Gaps = 1/185 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 653 AGCTG-GAACTCTGCACTCGCTCGAAGTTATTGTTTGTGTTAAATTCTGATGGGCAGCTA 711
||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 379 AGCTGTGCACTTTGCACTCGTTCCAAGTTATTGTTTGTGTTAAATTCGGATGGGCAGCTA 438
Query 712 GTAGTATGCTCTGTGAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACTGAGAGCATTAAAGCTGAGAAG 771
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 439 GTAGTATGCTCTGTGAATAAGAAAGGTTTAAAGTACACTGAGAGTATTAGAGCTGAGAAG 498
Query 772 AAGTTGGGTGGTGATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCAGAGCAACAAATTCTTGCTGTG 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 AAGTTGGGTGGTGATGCTGTTTGTGCATCAGTGGCTTCAGAGCAACAAATTCTTGCTGTG 558
Query 832 GGTAC 836
|||||
Sbjct 559 GGTAC 563
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 177841812935
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5