BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486635
Length=2360
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G28460.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 3627 0.0
AT3G61520.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 3622 0.0
AT5G28370.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 3397 0.0
> AT5G28460.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr5:10374899-10377304 FORWARD LENGTH=2406
Length=2406
Score = 3627 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 2235/2366 (94%), Gaps = 17/2366 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTATCGTGCTATCGATTTCCCGGCGCCGGAACTCTTATATTCTGCTCAACCATTTC 60
||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 29 ATGAGTATCATGCTATCAATTTCCCGGCGCCAGAACTCTTATATTCTGCTCAACCA-TTC 87
Query 61 -CGATTAATCCGCCGTTTTTCTGATGAAGTTGACCCACGGCCAGAAATCAAATCGGAGAG 119
||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 88 TCGATTCCTCCGGCGTTTTTCTTATGATGTTGACCCACGGCCGGAAATCAAATCGGAGAG 147
Query 120 CCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTTTGAAAAATCTTCAAAAAACCCCGCAACATGATTG 179
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 148 CCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTGTGAAAACTCTTCAAAATACCCCGCAACATGATTG 207
Query 180 GGCGTCGAGTGAGTCGCTAAGTTCGCTACTCGTATCTTCTTCTTCT-CATTCTCCTCTAG 238
||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||
Sbjct 208 GGCGTCGAGCGAGTCGCTAAGTGCGCTTGTCGTATCTTCTTCTTCTGC-TTCTCCTTTAG 266
Query 239 TATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTGGGATCGTACTCTTTGGCAATCTCTTTCTTCGAGT 298
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||
Sbjct 267 TATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTAGGATCGTATTCTCTAGCAATCTCGTTCTTCGAGT 326
Query 299 ACCTGGACT-CGAAATCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCTT 357
||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 ACCTGGA-TGCGAAGTCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCTT 385
Query 358 CAGTCGGTTATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCTGACTCGCGAGATAAACTTCTCCGTCTC 417
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 386 CAGTCGGTCATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCGGACCCGCGTGATAAACTTCTCCGTCTC 445
Query 418 TACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCGCTTACTGTCGTTGCCACTAAGCTTCTGATC 477
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 TACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCTCTTACTATCGTTGCCACTAAGCTTCTGATC 505
Query 478 CGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAACGACTCGAT 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 506 CGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAAAGACTCGAT 565
Query 538 TCGAATATGAAAAACTCGCAAGTTCGTAATGTTGTGATCGACGTCTTGCTAAGAAATGGA 597
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 566 TCGAATATGAAAAACTCGCAGGTTCGTAATGTTGTGGTAGACGTCTTGCTAAGAAATGGA 625
Query 598 CTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCCT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 CTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCCT 685
Query 658 CCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGCTCCACGAGGTTTGGAAGGGAAGGCTTTTGACA 717
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 686 CCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGTTACACGAGGTTTGGAAGGAAAGGCTTTTGACA 745
Query 718 GAAGAAAAGATTATTGGGTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTCT 777
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 746 GAAGAAAAGATAATTGCTTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTCT 805
Query 778 GTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCACCAATGTTGCTTGG 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 806 GTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCGCCAATACTGCTTGG 865
Query 838 GATATTTTGAGTGACTTGATGAAGAACAAAGCCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGCG 897
||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 GATATTTTGAGCGACCTGATGAAGAACAAAACCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGCG 925
Query 898 CTTTTGTCATGCTTAGGAAGGAATATGAACATTGGTAGAATGAATGCTTTAGTCTTGAAG 957
|||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 926 CTTTTGTCTTGCTTAGGAAGGAATATGGACATTAGTAGAATGAATGATTTAGTCTTGAAG 985
Query 958 ATGGATGAGATGAAAATTCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATCAACACTTTG 1017
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 986 ATGGATGAGGTGAAAATCCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATTAACACTTTA 1045
Query 1018 TGCAAATCAAGGAGGGTCGATGAAGCTCTCCAAGTTTTTGAACAAATGTGTGGAAAGAGA 1077
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1046 TGCAAATCAAGAAGGGTAGATGAAGCTCTCGAAGTTTTTGAACAAATGCGTGGAAAGAGA 1105
Query 1078 ACTGATGATGGGAATGTTATCAAAGCTGATTCGATTCACTTTAATACTCTCATCGACGGG 1137
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1106 ACTGATGATGGAAATGTGATTAAAGCTGATTCGATTCATTTTAATACTCTCATTGACGGG 1165
Query 1138 CTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAAATGGAA 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1166 CTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAACTGGAA 1225
Query 1198 GAGAGATGTGTGCCCAATACAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCCGAGCT 1257
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1226 GAGAGATGTGTGCCCAATGCAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCAGAGCT 1285
Query 1258 GGAAAGCTTGAGACTGCTAAAGAAGTTGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGGGATTAAACCT 1317
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1286 GGAAAGCTTGAGACGGCTAAAGAAGTCGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGAGATTAAACCT 1345
Query 1318 AATGTGGTTACTGTTAATACAATTGTCGGTGGGATGTGCAGGTACCATGGATTGAACATG 1377
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1346 AATGTGGTAACTGTTAATACAATCGTTGGTGGGATGTGCAGGCACCATGGATTGAACATG 1405
Query 1378 GCGGTTCTTTTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTAT 1437
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GCGGTTGTTTTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTAT 1465
Query 1438 ATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAACATAGAAAAGGCTATGCATTGGTTT 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 1466 ATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAATGTAGAGAAGGCTATGTATTGGTAT 1525
Query 1498 GATAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTCT 1557
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 GAAAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTCT 1585
Query 1558 GGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGATGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAGAGAG 1617
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1586 GGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGACGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAAAGAA 1645
Query 1618 GGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAAG 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 GGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAAG 1705
Query 1678 AACAATGCAGAGAAAGTCTACGAGATGCTAACCGATATGGAGAAAGAAGGGATGAAACCC 1737
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1706 AATAATGCAGAGAAAGTCTATGAGATGCTAACCGATATGGAAAAAGAAGGGAAGAAACCT 1765
Query 1738 GATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAGT 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766 GATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAGT 1825
Query 1798 GTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGAGTTAGACCCGACTGTTGCAACATAT 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1826 GTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGGGTTAGACCCGACTGTCACGACATAT 1885
Query 1858 GGAGCGGTAATTGAAGCTTATTGCTCAGTCGGGGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTTT 1917
|||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886 GGAGCGGTGATTGACGCTTATTGCTCAGTCGGCGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTTT 1945
Query 1918 AAGGACATGGGTTTGCGCTCAAAGGTCAATCCCAACACTGTGATATACAACATTCTCATA 1977
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1946 AAGGACATGGGTTTGCACTCAAAGGTCAATCCGAACACTGTAATATACAACATTCTCATA 2005
Query 1978 AACGCCTTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGACAAGCGCTGTCTCTGAAAGAGGAAATGAAG 2037
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2006 AACGCATTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGGCAAGCGCTCTCTCTGAAAGAGGAAATGAAG 2065
Query 2038 ATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAAAGAG 2097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2066 ATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAACGAG 2125
Query 2098 AAGAACC-AAGCG-GAAACATTGCTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACAGTCCTGTG 2155
|| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2126 AA-AACCCAAG-GAGAGACATTACTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACAGTCTTGTG 2183
Query 2156 AACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAATGGAGCGTCTCTCGGGTTCTGATGAGTTAG 2215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2184 AACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAATGGAGCGTCTCTCAGGTTCTGATGAGTTAG 2243
Query 2216 TGAAGCTGAGGAAGTTTATGCAAGGTTACTCTGTTGCTTCTCCGACCGAGAAAGCTTCAC 2275
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2244 TTAAGCTGAGGAAGTTTATGCAAGGCTACTCTGTTGCTTCGCCGACCGAGAAAGCTTCAC 2303
Query 2276 CTTTCGATGTCTTTAGCTTGGGATAATGTTGGTTCAGAGT-CAGTAACCTAAAGATTAGT 2334
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| | ||| |
Sbjct 2304 CTTTCGATGTCTTTAGCTTGGGATAATGTTCTTTTAGA-TACAGTAACC-A----TTACT 2357
Query 2335 ATAATGTTTCTAATCATTTCTTGATT 2360
||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2358 ATAATGTTTTTAATAATTTCTTGATT 2383
> AT3G61520.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr3:22768917-22771274 REVERSE LENGTH=2358
Length=2358
Score = 3622 bits (1961), Expect = 0.0
Identities = 2235/2367 (94%), Gaps = 19/2367 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTATCGTGCTATCGATTTCCCGGCGCCGGAACTCTTATATTCTGCTCAACCATTTC 60
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGAGTATCATGCTATCAATTTCCCGGCGCCGGAACTCTTATATTCTGCTCAACCA-TTC 59
Query 61 -CGATTAATCCGCCGTTTTTC-TGATGAAGTTGACCCACGGCCAGAAATCAAATCGGAGA 118
||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 60 TCGATTCCTCCGTCGTTTTTCAT-ATGATGTTGACCCACGGCCGGAAATCAAATTGGAGA 118
Query 119 GCCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTTTGAAAAATCTTCAAAAAACCCCGCAACATGATT 178
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 GCCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTGTGAAAACTCTTCAAAAAACCCCGCAACATGATT 178
Query 179 GGGCGTCGAGTGAGTCGCTAAGTTCGCTACTCGTATCTTCTTCTTCT-CATTCTCCTCTA 237
|||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||
Sbjct 179 GGGCGTCGAGCGAGTCGCTAAGTGCGCTTGTCGTATCTTCTTCTTCTGC-TTCTCCTTTA 237
Query 238 GTATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTGGGATCGTACTCTTTGGCAATCTCTTTCTTCGAG 297
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||
Sbjct 238 GTATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTAGGATCGTATTCTCTAGCAATCTCGTTCTTCGAG 297
Query 298 TACCTGGACT-CGAAATCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCT 356
|||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 TACCTGGA-TGCGAAGTCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCT 356
Query 357 TCAGTCGGTTATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCTGACTCGCGAGATAAACTTCTCCGTCT 416
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 357 TCAGTCGGTCATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCGGACCCGCGTGATAAACTTCTCCGTCT 416
Query 417 CTACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCGCTTACTGTCGTTGCCACTAAGCTTCTGAT 476
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 417 CTACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCTCTTACTGTCGTTGCCACTAATCTTCTGAT 476
Query 477 CCGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAACGACTCGA 536
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 477 CCGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAAAGACTCGA 536
Query 537 TTCGAATATGAAAAACTCGCAAGTTCGTAATGTTGTGATCGACGTCTTGCTAAGAAATGG 596
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTCGAATATGAAAAACTCGCAGGTTCGTAATGTTGTGGTAGACGTCTTGCTAAGAAATGG 596
Query 597 ACTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCC 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 ACTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCC 656
Query 657 TCCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGCTCCACGAGGTTTGGAAGGGAAGGCTTTTGAC 716
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TCCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGTTACACGAGGTTTGGAAGGGAAGGCTTTTGAC 716
Query 717 AGAAGAAAAGATTATTGGGTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTC 776
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 AGAAGAAAAGATAATTGCTTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTC 776
Query 777 TGTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCACCAATGTTGCTTG 836
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||
Sbjct 777 TGTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCGCCAATGCTGCTTG 836
Query 837 GGATATTTTGAGTGACTTGATGAAGAACAAAGCCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGC 896
|||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 GGATATTTTGAGCGACCTGATGAAGAACAAAACCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGC 896
Query 897 GCTTTTGTCATGCTTAGGAAGGAATATGAACATTGGTAGAATGAATGCTTTAGTCTTGAA 956
||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 897 GCTTTTGTCTTGCTTAGGAAGGAATATGGACATTAGTAGAATGAATGATTTAGTCTTGAA 956
Query 957 GATGGATGAGATGAAAATTCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATCAACACTTT 1016
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 957 GATGGATGAGGTGAAAATCCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATTAACACTTT 1016
Query 1017 GTGCAAATCAAGGAGGGTCGATGAAGCTCTCCAAGTTTTTGAACAAATGTGTGGAAAGAG 1076
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1017 ATGCAAATCAAGAAGGGTAGATGAAGCTCTCGAAGTTTTTGAAAAAATGCGTGGAAAGAG 1076
Query 1077 AACTGATGATGGGAATGTTATCAAAGCTGATTCGATTCACTTTAATACTCTCATCGACGG 1136
|||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1077 AACTGATGATGGAAATGTGATTAAAGCTGATTCGATTCATTTTAATACTCTCATTGACGG 1136
Query 1137 GCTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAAATGGA 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1137 GCTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAACTGGA 1196
Query 1197 AGAGAGATGTGTGCCCAATACAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCCGAGC 1256
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1197 AGAGAGATGTGCGCCCAATGCAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCAGAGC 1256
Query 1257 TGGAAAGCTTGAGACTGCTAAAGAAGTTGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGGGATTAAACC 1316
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1257 TGGAAAGCTTGAGACGGCTAAAGAAGTCGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGAGATTAAACC 1316
Query 1317 TAATGTGGTTACTGTTAATACAATTGTCGGTGGGATGTGCAGGTACCATGGATTGAACAT 1376
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1317 TAATGTGGTAACTGTTAATACAATCGTTGGTGGGATGTGCAGGCACCATGGATTGAACAT 1376
Query 1377 GGCGGTTCTTTTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTA 1436
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 GGCGGTTGTATTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTA 1436
Query 1437 TATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAACATAGAAAAGGCTATGCATTGGTT 1496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||
Sbjct 1437 TATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAATGTAGAGAAGGCTATGTATTGGTA 1496
Query 1497 TGATAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTC 1556
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497 TGAAAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTC 1556
Query 1557 TGGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGATGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAGAGA 1616
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1557 TGGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGACGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAAAGA 1616
Query 1617 GGGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAA 1676
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 AGGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAA 1676
Query 1677 GAACAATGCAGAGAAAGTCTACGAGATGCTAACCGATATGGAGAAAGAAGGGATGAAACC 1736
||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1677 GAATAATACAGAGAAAGTCTATGAGATGCTAACCGATATGGAAAAAGAAGGGAAGAAACC 1736
Query 1737 CGATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAG 1796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 TGATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAG 1796
Query 1797 TGTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGAGTTAGACCCGACTGTTGCAACATA 1856
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1797 TGTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGGGTTAGACCCGACTGTCACGACATA 1856
Query 1857 TGGAGCGGTAATTGAAGCTTATTGCTCAGTCGGGGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTT 1916
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 TGGAGCGGTGATTGACGCTTATTGCTCAGTCGGCGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTT 1916
Query 1917 TAAGGACATGGGTTTGCGCTCAAAGGTCAATCCCAACACTGTGATATACAACATTCTCAT 1976
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1917 TAAGGACATGGGTTTGCACTCAAAGGTCAATCCGAACACTGTAATATACAACATTCTCAT 1976
Query 1977 AAACGCCTTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGACAAGCGCTGTCTCTGAAAGAGGAAATGAA 2036
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 AAACGCATTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGGCAAGCGCTCTCTCTGAAAGAGGAAATGAA 2036
Query 2037 GATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAAAGA 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2037 GATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAACGA 2096
Query 2097 GAAGAACC-AAGCG-GAAACATTGCTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACAGTCCTGT 2154
||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2097 GAA-AACCCAAG-GAGAGACATTACTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACAGTCTTGT 2154
Query 2155 GAACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAATGGAGCGTCTCTCGGGTTCTGATGAGTTA 2214
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2155 GAACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAATGGAGCGTCTCTCAGGTTCTGATGAGTTA 2214
Query 2215 GTGAAGCTGAGGAAGTTTATGCAAGGTTACTCTGTTGCTTCTCCGACCGAGAAAGCTTCA 2274
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GTTAAGCTGAGGAAGTTTATGCAAGGCTACTCTGTTGCTTCGCCGACCGAGAAAGCTTCA 2274
Query 2275 CCTTTCGATGTCTTTAGCTTGGGATAATGTTGGTTCAGAGT-CAGTAACCTAAAGATTAG 2333
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| | |||
Sbjct 2275 CCTTTCGATGTCTTTAGCTTGGGATAATGTTCGTTTAGA-TACAGTAACC-A----TTAC 2328
Query 2334 TATAATGTTTCTAATCATTTCTTGATT 2360
|||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2329 TATAATGTTTTTAATAATTTCTTGATT 2355
> AT5G28370.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr5:10332375-10334571 REVERSE LENGTH=2197
Length=2197
Score = 3397 bits (1839), Expect = 0.0
Identities = 2075/2190 (95%), Gaps = 11/2190 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGTATCGTGCTATCGATTTCCCGGCGCCGGAACTCTTATATTCTGCTCAACCATTTC 60
||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 14 ATGAGTATCATGCTATCAATTTCCCGGCGCCAGAACTCTTATATTCTGCTCAACCA-TTC 72
Query 61 -CGATTAATCCGCCGTTTTTCTGATGAAGTTGACCCACGGCCAGAAATCAAATCGGAGAG 119
||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 73 TCGATTCCTCCGGCGTTTTTCTTATGATGTTGACCCACGGCCGGAAATCAAATCGGAGAG 132
Query 120 CCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTTTGAAAAATCTTCAAAAAACCCCGCAACATGATTG 179
||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 133 CCAGGAATTTGTAGTAGTCAAATTTGTGAAAACTCTTCAAAATACCCCGCAACATGATTG 192
Query 180 GGCGTCGAGTGAGTCGCTAAGTTCGCTACTCGTATCTTCTTCTTCT-CATTCTCCTCTAG 238
||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||
Sbjct 193 GGCGTCGAGCGAGTCGCTAAGTGCGCTTGTCGTATCTTCTTCTTCTGC-TTCTCCTTTAG 251
Query 239 TATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTGGGATCGTACTCTTTGGCAATCTCTTTCTTCGAGT 298
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||
Sbjct 252 TATTCTCGCAAATCACGCGGCGGCTAGGATCGTATTCTCTAGCAATCTCGTTCTTCGAGT 311
Query 299 ACCTGGACT-CGAAATCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCTT 357
||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 ACCTGGA-TGCGAAGTCTCAGTCTCTGAAACGCCGTGAAGAATCTCTCTCCTTGGCGCTT 370
Query 358 CAGTCGGTTATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCTGACTCGCGAGATAAACTTCTCCGTCTC 417
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGTCGGTCATTGAATTCGCCGGTAGTGAACCGGACCCGCGTGATAAACTTCTCCGTCTC 430
Query 418 TACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCGCTTACTGTCGTTGCCACTAAGCTTCTGATC 477
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 TACGAGATCGCCAAAGAGAAGAACATTCCTCTTACTATCGTTGCCACTAAGCTTCTGATC 490
Query 478 CGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAACGACTCGAT 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 491 CGATGGTTTGGGCGTATGGGTATGGTGAATCAGTCGGTTCTTGTATACGAAAGACTCGAT 550
Query 538 TCGAATATGAAAAACTCGCAAGTTCGTAATGTTGTGATCGACGTCTTGCTAAGAAATGGA 597
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct 551 TCGAATATGAAAAACTCGCAGGTTCGTAATGTTGTGGTAGACGTCTTGCTAAGAAATGGA 610
Query 598 CTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCCT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 611 CTTGTGGATGATGCCTTCAAGGTGCTCGACGAAATGCTTCAGAAAGAATCTGTTTTTCCT 670
Query 658 CCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGCTCCACGAGGTTTGGAAGGGAAGGCTTTTGACA 717
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 671 CCTAATAGAATCACAGCGGATATTGTGTTACACGAGGTTTGGAAGGAAAGGCTTTTGACA 730
Query 718 GAAGAAAAGATTATTGGGTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTCT 777
||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 GAAGAAAAGATAATTGCTTTGATTTCAAGATTTAGCTCTCATGGTGTCTCCCCAAACTCT 790
Query 778 GTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCACCAATGTTGCTTGG 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 791 GTTTGGTTGACTCGGTTTATATCAAGTCTATGCAAAAATGCTCGCGCCAATACTGCTTGG 850
Query 838 GATATTTTGAGTGACTTGATGAAGAACAAAGCCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGCG 897
||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 851 GATATTTTGAGCGACCTGATGAAGAACAAAACCCCACTTGAAGCTCCTCCCTTCAATGCG 910
Query 898 CTTTTGTCATGCTTAGGAAGGAATATGAACATTGGTAGAATGAATGCTTTAGTCTTGAAG 957
|||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 911 CTTTTGTCTTGCTTAGGAAGGAATATGGACATTAGTAGAATGAATGATTTAGTCTTGAAG 970
Query 958 ATGGATGAGATGAAAATTCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATCAACACTTTG 1017
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 971 ATGGATGAGGTGAAAATCCGGCCTGATGTTGTGACTTTAGGGATTCTTATTAACACTTTA 1030
Query 1018 TGCAAATCAAGGAGGGTCGATGAAGCTCTCCAAGTTTTTGAACAAATGTGTGGAAAGAGA 1077
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1031 TGCAAATCAAGAAGGGTAGATGAAGCTCTCGAAGTTTTTGAACAAATGCGTGGAAAGAGA 1090
Query 1078 ACTGATGATGGGAATGTTATCAAAGCTGATTCGATTCACTTTAATACTCTCATCGACGGG 1137
||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1091 ACTGATGATGGAAATGTGATTAAAGCTGATTCGATTCATTTTAATACTCTCATTGACGGG 1150
Query 1138 CTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAAATGGAA 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1151 CTCTGCAAGGTGGGGAGGTTGAAAGAAGCAGAGGAGTTATTGGTAAGGATGAAACTGGAA 1210
Query 1198 GAGAGATGTGTGCCCAATACAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCCGAGCT 1257
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1211 GAGAGATGTGTGCCCAATGCAGTTACTTACAATTGCTTGATTGATGGGTATTGCAGAGCT 1270
Query 1258 GGAAAGCTTGAGACTGCTAAAGAAGTTGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGGGATTAAACCT 1317
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1271 GGAAAGCTTGAGACGGCTAAAGAAGTCGTTTCTCGGATGAAAGAGGACGAGATTAAACCT 1330
Query 1318 AATGTGGTTACTGTTAATACAATTGTCGGTGGGATGTGCAGGTACCATGGATTGAACATG 1377
|||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1331 AATGTGGTAACTGTTAATACAATCGTTGGTGGGATGTGCAGGCACCATGGATTGAACATG 1390
Query 1378 GCGGTTCTTTTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTAT 1437
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 GCGGTTGTTTTCTTTATGGATATGGAAAAGGAAGGCGTGAAAGGGAATGTGGTTACTTAT 1450
Query 1438 ATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAACATAGAAAAGGCTATGCATTGGTTT 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
Sbjct 1451 ATGACATTGATTCATGCTTGTTGCAGCGTCAGTAATGTAGAGAAGGCTATGTATTGGTAT 1510
Query 1498 GATAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTCT 1557
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511 GAAAAAATGTTGGAAGCTGGTTGTTCTCCTGATGCAAAGATCTATTATGCTTTGATCTCT 1570
Query 1558 GGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGATGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAGAGAG 1617
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1571 GGATTGTGCCAAGTTAGACGGGATCATGACGCCATTAGAGTGGTGGAGAAACTGAAAGAA 1630
Query 1618 GGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAAG 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631 GGAGGGTTTTCTCTTGACTTATTGGCTTACAACATGCTTATTGGGTTGTTTTGTGATAAG 1690
Query 1678 AACAATGCAGAGAAAGTCTACGAGATGCTAACCGATATGGAGAAAGAAGGGATGAAACCC 1737
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
Sbjct 1691 AATAATGCAGAGAAAGTCTATGAGATGCTAACCGATATGGAAAAAGAAGGGAAGAAACCT 1750
Query 1738 GATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAGT 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 GATTCCATCACTTACAACACTCTGATTTCGTTTTTCGGTAAACACAAGGACTTCGAGAGT 1810
Query 1798 GTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGAGTTAGACCCGACTGTTGCAACATAT 1857
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1811 GTTGAGAGAATGATGGAGCAGATGAGAGAAGACGGGTTAGACCCGACTGTCACGACATAT 1870
Query 1858 GGAGCGGTAATTGAAGCTTATTGCTCAGTCGGGGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTTT 1917
|||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1871 GGAGCGGTGATTGACGCTTATTGCTCAGTCGGCGAATTAGACGAAGCATTGAAGCTCTTT 1930
Query 1918 AAGGACATGGGTTTGCGCTCAAAGGTCAATCCCAACACTGTGATATACAACATTCTCATA 1977
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1931 AAGGACATGGGTTTGCACTCAAAGGTCAATCCGAACACTGTAATATACAACATTCTCATA 1990
Query 1978 AACGCCTTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGACAAGCGCTGTCTCTGAAAGAGGAAATGAAG 2037
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 AACGCATTTTCTAAGCTGGGGAATTTCGGGCAAGCGCTCTCTCTGAAAGAGGAAATGAAG 2050
Query 2038 ATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAAAGAG 2097
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2051 ATGAAGATGGTGAGACCTAATGTTGAAACTTACAATGCCTTGTTTAAGTGTCTTAACGAG 2110
Query 2098 AAGAACC-AAGCG-GAAACATTGCTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACAGTCCTGTG 2155
|| |||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 2111 AA-AACCCAAG-GAGAGACATTACTTAAACTGATGGATGAGATGGTCGAACA-TCTTGTG 2167
Query 2156 AACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAA 2185
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 AACCAAATCAGATCACAATGGAGATTCTAA 2197
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 117168072030
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5