BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486657
Length=4912
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G61690.1 | Symbols: | nucleotidyltransferases | chr3:228278... 7733 0.0
> AT3G61690.1 | Symbols: | nucleotidyltransferases | chr3:22827884-22834048
FORWARD LENGTH=4948
Length=4948
Score = 7733 bits (4187), Expect = 0.0
Identities = 4705/4950 (95%), Gaps = 56/4950 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCATCTTCTTCCGCACGATTTCAGTCCGCCAGTGTTAACCTTGATCAATCTCGCATTTG 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATCATCTTCTTCCGCACGATTTCAGTCCGCCAGTGGTAACCTTGATCAATCTCGCATTTG 60
Query 61 CCTCTCGATTCGTCGATACTGCTAGATTTTCTCTCGATTTAT--TCTAGGGTTCTTATTG 118
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 CCTCTCGATTCGTCGATACTGCTAGATTTTCTCTCGATTTATCCTCTAGGGTTCTTATTG 120
Query 119 ATTTCCGCCACCCACTCTCTGTTTTTAGAATCTAACTTCCGTCTCCTTCG-TT--TGCTC 175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||
Sbjct 121 ATTTCCGCCACCCACTCTCTGTTTTTAGAATCTAACTCCCGTCTCCTTCGTTTCCTCCTC 180
Query 176 CTAGGGTTACCTTCTTCTTCAATTC-ATCTGCGATTCCTTC--TTTTGCATTTTGATTC- 231
|||||||| |||||||||||||||| || | | || || | ||| | | ||||||||
Sbjct 181 CTAGGGTTTCCTTCTTCTTCAATTCGATTTCCCCTT-CTCCGATTTCG-A-TTTGATTCT 237
Query 232 TTGCAAATTTGTATGTTTGGGGTTATCGGATTAGCCACG-CAGATCGAAGGtttttttA- 289
|| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||
Sbjct 238 TTACAAATTTGTCTGTTTGGGGTTATTGGATTAGCCA-GATAGATCCAAGG-TTCTTTAG 295
Query 290 GCTTCGTAGCTATTAGA--T-TTTT-CCCATTCCCGGCGACTTTGAAGCCACGATATAAT 345
|| ||||||||||| || | |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 296 GC-TCGTAGCTATTTGATTTGTTTTCCCCATTTCCGGTGACTTTGAAGCTACGAT-TCAT 353
Query 346 CAGGGAGGTTGCTTATTAGCAACCGTTGAAGAAAACGTAACGGTTGG-TTAAGGTCTTTG 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 354 CAGGGAGGTTGCTTATTAGCAACCGTTGAAGAAAACGTAACGGTTGGTTTAAGGTCTTTG 413
Query 405 TTTGGATTTGA-GGGTAAGGTTTCGTCCGTGACTGTGACGGGAGAGATTTGCATGGGTGA 463
|||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 414 TTTGGATTAGAGGGGTAAGCTTTCGTCGGTGACTGTCACGGCAGAGATTTGCATGGGTGA 473
Query 464 GCATGAATCATGGGCGGCTTCTCCGCCGTCACCCACTCTCTTATATCCCAACGGTTTATT 523
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||
Sbjct 474 GCATGAATCATGGGCGGCTTCTCCGCCGTCACCCTCTGGCTTACATCCCAACGGTTTATT 533
Query 524 GCCAGGCAAGGCTGCATCTGTGACAAGG-CAGCTCGATGCGGAGCGATGGGCCAAGGCTG 582
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 534 ACCAGGCAAGGCTGCATCTGTGACTAGGCCA-CTCGATGCTGAGCGATGGGCCAAGGCGG 592
Query 583 AGGATAGAACTGCTAAGCTCATTGCTTGTATCCAGCCAAATCCTCCTTCCGAAGATCGCC 642
||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGATCGAACTGCCAAGCTCATTGCTTGCATCCAGCCAAATCCACCTTCCGAAGATCGCC 652
Query 643 GCAATGCTGTTGCCAGTTACGTGAGGAGGCTTATCATGGAATGCTTCCCTCAGGTTCAGA 702
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GTAATGCTGTTGCCAGTTACGTCAGGAGGCTTATCATGGAATGCTTCCCTCAGGTTCAGA 712
Query 703 TCTTTATGTTTGGATCTGTACCTCTGAAGACTTATTTGCCTGATGGAGATATCGACTTAA 762
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 TCTTTATGTTTGGATCTGTACCTCTCAAGACTTATTTGCCTGATGGAGATATCGACTTAA 772
Query 763 CGGCTTTTAGCGCTAACCAAAACCTGAAGGATTCTTGGGCGAATTTGGTTCGCGATATGC 822
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 773 CGGCTTTTAGCGCTAACCAAAATCTGAAGGATTCTTGGGCTAATTTGGTTCGTGATATGC 832
Query 823 TGGAAAAGGAAGAGAAGAACGAGAATGCTGAATTCCATGTCAAAGAAGTCCAGTATATTC 882
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 833 TTGAAAAGGAAGAGAAGAATGAGAATGCTGAATTCCATGTCAAAGAAGTCCAGTATATAC 892
Query 883 AGGCAGAAGTAAAGATAATTAAGTGTCTGGTGGAGAATATTGTGGTGGATATATCTTTCA 942
| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 893 AAGCAGAAGTGAAGATAATTAAGTGTCTGGTAGAGAATATTGTGGTAGATATATCTTTCA 952
Query 943 ACCAGATTGGAGGGCTGTGTACATTATGCTTCCTTGAGGAGGTTGATCACTATATAAACC 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 ACCAGATTGGAGGGCTGTGTACATTATGCTTCCTTGAGGAGGTTGATCACTATATAAACC 1012
Query 1003 AGAACCATTTATTCAAGCGTAGTATTATATTGATTAAAGCCTGGTGTTACTACGAGAGCC 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 AGAACCATTTATTCAAGCGTAGTATTATATTGATTAAAGCCTGGTGTTACTACGAGAGCC 1072
Query 1063 GTATATTGGGAGCTCACCATGGGCTTATTTCGACATATGCCCTAGAAACCTTGGTTCTTT 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1073 GTATATTGGGAGCTCACCATGGGCTTATTTCGACATATGCCCTGGAAACCTTGGTTCTTT 1132
Query 1123 ACATATTTTATCTTTTCAACAACTCATTTTCGGGACCCCTTGAGGTCCTCTATCGATTTC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1133 ACATATTTTATCTTTTCAACAACTCATTTTCGGGACCTCTTGAGGTTCTCTATCGTTTTC 1192
Query 1183 TTGAGTTCTTTAGTAAGTTTGACTGGCAGAATTTTTGTCTTAGCCTCTGGGGACCTGTTC 1242
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1193 TTGAGTTCTTTAGTAAGTTTGACTGGCAGAATTTTTGTCTTAGCCTCTGGGGCCCTGTTC 1252
Query 1243 CAGTTAGTTCACTACCAGATGTAACAGCGGCGCCTCCTCGAAAGGATGTTGGAGAGTTAC 1302
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1253 CAGTTAGTTCACTACCAGATGTAACAGCGGAGCCTCCACGAAGGGATGTTGGAGAGTTAC 1312
Query 1303 GAGTTAGTGAAGCGTTTTATAGAGCTTGTAGTAAAGTTTATGCAGTTAATATTGCTCCTC 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GAGTTAGTGAAGCGTTTTATAGAGCTTGTAGTAGAGTTTATGCAGTTAATATTGCTCCTC 1372
Query 1363 AAGAGATACAGGGCCAGCCTTTTGTTTCCAAACATTTCAATGTTATAGACCCTTTGCGTG 1422
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 AAGAGATACAGGGCCAGCCTTTTGTGTCCAAACATTTCAATGTTATAGACCCTTTGCGTG 1432
Query 1423 AAAACAACAACCTTGGACGCAGTGTCAGTAAAGGTAACTTCTTTAGGATACGAAGTGCAT 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1433 AAAACAACAACCTTGGACGCAGTGTCAGTAAAGGTAACTTCTTTAGGATACGAAGCGCAT 1492
Query 1483 TTACCCTTGGTGCCAAGAAGTTGGCTAGGTTACTTGAATGCCCTAAGGAGAATTTGATCC 1542
||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 TTACCCTGGGTGCCAAGAAGTTGACCAGGTTACTTGAATGCCCTAAGGAGAATTTGATCC 1552
Query 1543 ATGAGGTTAACCAATTTTTTATGAACACATGGGAAAGACACGGCAGTGGTCGACGTCCTG 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 ATGAGGTTAACCAATTTTTTATGAACACATGGGAAAGACACGGCAGTGGTCGACGTCCTG 1612
Query 1603 ATGCTCCTGGAAATGACTTATGGCTATCAAGACTGGGAGATCCTGAGTCATATCATCAAG 1662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1613 ATGCTCCTGGAAATGACTTATGGCTATCAAGACTGGGAGATCCTGAGCCATATCATCAAG 1672
Query 1663 CTGAAAATGTTAGTAATTCTTCAAGCAACAAAAGAAACCAAAATGCCATCCGTCTTGGTG 1722
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 CTGAAAATGTTAGTAATTCTTTAAACAACAAAAGAAACCAAAATGCCATCCGTCTTGGTG 1732
Query 1723 GGGTTCACGGAGCTCGGAGTATGCCCTCTCAACAGAATAACTGTGGAACAGAAATTATAT 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1733 GGGTTCACGGAGCTCGGAGTATGCCCTCTCAACAGAATAACTGTGGAACAGAAATTACAT 1792
Query 1783 CTAGAGTAACATATCAAACGCAAAAGAGTCGAGGCAACTCTTACCAACCTGCTCAGGATG 1842
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1793 CTAGAGTAACATATCAAACGCAAAAGAGTCGAGGCAACTCTTACCAACCTGCTCAGGAAG 1852
Query 1843 TCATTTCCAATCAAAGTGCTTCAAATGATAAGCTTCAGCAAACTGCTAAGCCAGAAACTC 1902
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1853 TCAATTCCAATCAAAGTGCTTTAAATGATAAGCTTCAGCAAACTGTTAAGCCAGAAACTC 1912
Query 1903 TGGTTAATAATTTTCATGGTACGCATATTTTTGCCAGAACCCGGTCTAGCCCTGAGCTTA 1962
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1913 TGGTTAACAATTTTCATGGTAGGCATATTTTTGCCAGGACCCGCTCTAGCCCTGAGCTTA 1972
Query 1963 CTGAGACATATGATGAAGCTCTTTTACAATCACGTCGTAGTAGA---GCCCCAGAAGCTG 2019
|||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1973 CTGAGACACATGGTGAAGCTCTTTTACAATCTCGTCGTAGTAGAGCCGCCCCAGATGCTG 2032
Query 2020 GGAAACGCCAAACTAATTCTACCAGGGTTGATAATATCAGGAAAATGAA-TATGGAGTCT 2078
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||
Sbjct 2033 GGAAACGCCAAACTAATTCTACCAGGGTTGATAGTATCAGGAAAA-AAAGTCTTGAGTCT 2091
Query 2079 GAAACTTTGTCAAGCAGTGTTCGATATTCGGCCGACTCATCGTCAGTTAGGCATACTCCA 2138
|||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2092 GAAACTTTGTCAAGTGGTGTTAGATATTCAGCCGACTCTTCGTCAGTTAGGCATACTCCA 2151
Query 2139 TCCCCTCGAAGTCCTGATAGTACTGCTGACATGAGCAGTGCAGTGAATAGTTACTATGAT 2198
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2152 TCCCCTCAAAGTCCTGATAGTACTGCTGACATGAGCAGTGCAGTGAACAGTTACTATGAT 2211
Query 2199 GAATTAGGGTCAGTTTCCGTGAATGAAGACTTCTCTGTTGCAGGGGAACAGGAAGAGCAA 2258
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212 GAAGTAGGGTCCGTTTCCGTGAATGAAGACTTCTCTGTTGCAGGGGAACAGGAAGAGCAA 2271
Query 2259 GATCTTGTTAACTCGATGACATCTGCTGCTGGGCAAGGTTTTAATGGACATTTTCCTTTC 2318
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2272 GATCTTGTTAACTCGATGACATCTGTTACTGGGCAAGGTTTTAATGGACACTTTCCTTTC 2331
Query 2319 CCTTTTAATTTTTCAACGGGTCACTTACCGTTTCCAATTACACCTTCTATCTTAGCTTCA 2378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 CCTTTTAATTTTTCAACGGGTCACTTACCGTTTCCAATTACACCTTCTATCTTAGCTTCA 2391
Query 2379 ATGGGATATGGTCAGAGGAATATGCCTGGTATTATTCCTTCTAACCTTCCTTTCATCGAC 2438
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 ATGGGATATGGTCAGAGGAATATGCCTGGTATTGTTCCTTCTAACCTTCCTTTCATCGAG 2451
Query 2439 ACACCTTGGAGTACTAATGTGCAATTTCCACAAAACTTTGTGTCGCCACCGTTTACCCAT 2498
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct 2452 GCACCTTGGAGTACTAATCTGCAATTTCCGCAAAACTTTGTTTCTTCACCATTTACCCAT 2511
Query 2499 TATTTTCCCAGTGGAGCCCACCCAATTTCAGAAAAGCCGAGCAAAACTGGTAGTGATGAC 2558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 TATTTTCCCAGTGGAGCCCACCCAATTTCAGAAAAGCCGAGCAAAACTGGTAGTGATGAC 2571
Query 2559 ATGGGGTCTTCAGAAGTGAATGTCGATGAGTCTGACAATGATCTCTGGCACGAGCCAGAA 2618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 ATGGGGTCTTCAGAAGTGAATGTCGATGAGTCTGACAATGATCTCTGGCACGAGCCAGAA 2631
Query 2619 AGGGGAACTCATAGTTTTGGACTTGAAAATGGTGGTTATGGAATGCATCAGGCAGATGAT 2678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632 AGGGGAACTCATAGTTTTGGACTTGAAAATGGTGGTTATGGAATGCATCAGGCAGATGAT 2691
Query 2679 AAACATCAGTCATCTTTTGCAGAGCACAGTTTTGTACCCTCAAGTAGGAAAAATCGACTG 2738
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2692 AAACATCAGTCATCTTTTGCAGAGCACAGTTTTGTACCTTCAAGAAGGAAAAATCGGCTG 2751
Query 2739 ACAAGGGGAGATGGTTTCGAAAATTCCCACTCTCCAGTCAGAGGAAGCAGTCAGATTCAG 2798
|||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2752 ACAAGGGGGGATGATTTAGAAAATTCCCACTCTCCAGTCAGAGGAAGCAGTCAGATTCAG 2811
Query 2799 AGTGAGGAGAGAACTGCAGGCTCTAGATCTGTGTCTGGTGCTAGTTCCGTTCGAAGCAGG 2858
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 AGTGAGGAGAGAACTGTAGGCTCTAGATCTGTGTCTGGCGCTAGTTCCGTTCGAAGCAGG 2871
Query 2859 ACTTCATCTGAAAGCTCTTGGGATGGGTCAACCACAAGGGGGTCAAAGCCAGCTAAGGAT 2918
||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2872 ACTTCATCTGAAAGCTCCTGGGATGGATCAACTACAAGGGGGTCAAAGCCAGCTAAGGAT 2931
Query 2919 AGACGGAATAGGAAAGTTGTGTCTGGGGCTGCATCTACACTGTATGGAAAAGGAAAGAGT 2978
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 AGACGGAATAGGAAAGTTGTGTCTGGGGCCGCATCTACACTGTATGGAAAAGGAAAGAGT 2991
Query 2979 GTTCCTGAGCACTCAATCCAGATTGATGATGATAACAGAGAATGGATTCCTGTATCTAGC 3038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 GTTCCTGAGCACTCAATCCAGATTGATGATGATAACAGAGAATGGATTCCTGTATCTAGC 3051
Query 3039 AATGAAATAATCGATAGAGATCTGGAGCCTCGTCCTACTGTCCCTTCATTTCAAGTACAG 3098
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3052 AATGAAATAATAGATAGAGATCTGGGGCCTCGTCCTACTGTCCCTTCATTTCAAGTTCAG 3111
Query 3099 AGGCATCAAATACATGGTCATGAACTAGCTCAGGCAAGTGGATCAGAGTCCACAGTGTCT 3158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3112 AGGCATCAAATACATGGTCATGAACTAGCTCAGGCAAGTGGATCAGAGTCCACAGTGTCT 3171
Query 3159 CTTGCTCCTTTTCTCCTTGGCCATGGCATGCAACAAAATGAGGTTGATAATTCTGGATAC 3218
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 CTTGCTCCGTTTATCCTTGGCCATGGCATGCAACAAAACGAGGTTGATAATTCTGGATAT 3231
Query 3219 ACGTTTTATCCCACAGGGCCACCTGTTCCGATTGTTGCAATGCTCCCAATGTACAATTAC 3278
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3232 ACGTTTTATCCCACAGGACCACCTGTTCCGATTGTTGCAATGCTTCCAATGTACAATTAC 3291
Query 3279 CAAGCTGGTGGTAATGCGACATCGGATACTCTGGCAAGCCACCACAGTGTGGATGAAGGA 3338
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 CAAGCTGGTGGTAATGCAACATCAGATGCTCTGGCAAGCCACCACAGTGTGGATGAAGGA 3351
Query 3339 GTAGAGAATCATGATCCCTGTAAAAGTTTTGACTCGTCCAGGGGACTTGATCAGTCTGAG 3398
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3352 GTAGAGAATCATGAACCCTGTAAAAGTTTCGACTCGTCCAGGGGACTTGATCAGTCTGAG 3411
Query 3399 ATAGTAGTTTCTTCGCACGCCACTAGAATTGGCTCTTCTGCAGAACAGGTGGAGCATAAG 3458
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3412 ATAGTAGTTTCTTCGCACTCCACTAGAATGGGCTCTTCTGCAGAACAGGTGGAGCGTAAG 3471
Query 3459 AATGATATCCTCAATGGTGATTTTATAAGCCATTGGCAAAATTTGCAGTATGGCCGCTCT 3518
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 AATGATATACTCAATGGTGATTTTATAAGCCATTGGCAAAATTTGCAGTATGGCCGCTCT 3531
Query 3519 TGCCAGAATTCTCAACATCCGCCTGTGTTGTATCCTGCCCCTGTTGTAGTGCCACCTGCT 3578
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3532 TGCCAGAATTCTCAACATCCGCCTGTGTTGTATCCTGCTCCTGTTGTAGTGCCACCTGCT 3591
Query 3579 TATCTCCAGGGGCGTTTACCATGGGATGGTCCTGGAAGACCTCTTGCTTACACCAATGTT 3638
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 3592 TATCTCCAGGGGCGTTTACCATGGGATGGTCCTGGAAGACCTCTGGCTTACACCAATGCT 3651
Query 3639 GTGAATCAACTCATGACCTACGGACCTCGTCTTGTACCGGTTGCTCCTGTACAACCTGTT 3698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3652 GTGAATCAACTCATGACCTACGGACCTCGTCTTGTACCGGTTGCTCCTGTACAACCTGTT 3711
Query 3699 TCAACCAGGCCACCCAACATTTACCCTCGTTATGCTAATGAAACTCCCAGATACCGAAGT 3758
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3712 TCAACCAGGCCACCCAACATTTACCCTCGTTACGCTAATGAAACTCCCAGATATCGAAGT 3771
Query 3759 GGGACGGGGACCTATTTTCCAAATCCTAAGATTTCTCCTAGGGAGCAGCGGCCTACATCT 3818
|| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3772 GGAACAGGGACCTATTTTCCAAATCCAAAGATTTCTCCTAGGGAGCAGCGGCCTACTTCT 3831
Query 3819 GGCATGAGGCGTGGGAATTATGGGCATGACAGAACCGACCATCATAGTGATAGAGAAGGG 3878
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3832 GGCATGAGGCGTGGAAATTATGGGCATGACAGAACCGACCATCATAGCGATAGAGAAGGG 3891
Query 3879 AATTGGAATGCTGGTACAAAGACACGAGGTTCTGGACGTAACCACAACAATCGTAACCAA 3938
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3892 AATTGGAATGCTGGTTCAAAGACACGAGGTTCTGGACGTAACCACAACAATCGTAACCAA 3951
Query 3939 GCTGACAATAAGCCAAGCTCAAGGCAAGACCGATCTGATAGGCATTGGGGGTCGTCGTAT 3998
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3952 GCTGACAATAAGCCAATTTCAAGGCAAGACCGATCTGATAGGCATTGGGGGTCGTCGTAC 4011
Query 3999 AGGCATGAGTCGTCCTCCTATTCTTCTCATCATTCTCAAAACGGTCCAATTCGCTCAAAC 4058
|| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4012 AGACATGAATCGTCCTCCTATTCTGCTCATCATTCTCAAAACGGTCCAATTCGCTCAAAC 4071
Query 4059 ACTTCACAAGATGCTTCTGGAAATATTGCATATGGTATGTACCGATTGCCGCCGGGCATG 4118
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 4072 ACTTCACAAGATGCTTCTGGAAATATTGCTTATGGTATGTACCGATTACCACCGGGGATG 4131
Query 4119 AAGCAAAACAGTGTGACTTCTTCAGAGGGACACAACGTTCCATCTGTGATGATGTTTTAT 4178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4132 AAGCAAAACAGTGTGACTTCTTCAGAGGGACACAACGTTCCATCTGTCATGATGTTTTAT 4191
Query 4179 CCATATGACCATAATAATGTTTACAATTCACCATCTGAACACCATGAGTATGGGTCTCTT 4238
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4192 CCATATGGCCATAATAATGTTTACAATTCACCATCTGAACACAATGAGTATGGGTCTCTT 4251
Query 4239 GGACCAGCG-GGTGAAGCGCCACATTTAAATGACGAGGATCAGCCAAGGTTTCGTGGTGC 4297
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4252 GGACCAG-GTGGTGAAGCGCCACATTTAAATGACGAGGATCAGCCAAGGTTTCGTGGTGC 4310
Query 4298 TGCTGCTTCTGCTCATATGTCTTCACCTGACGATCCTTCCTCGCCTCACTTCCCCAGGGG 4357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4311 TGCTGCTTCTGCTCATATGTCTTCACCTGACGATCCTTCCTCGCCTCACTTCCCCAGGGG 4370
Query 4358 AAAGTAACATCAATGGTTGCTCAAGTTTAGCTGCAATAAACTCAAGAACTTAGAAGAATA 4417
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4371 AAAGTAACATCGATGGTTGCTCAAGTTTAGCTGCAATAAACTCAAGAACTTAGAAGAATA 4430
Query 4418 CTGTACGATCACATCACTAGGGTCTTGGAAATCTAAAGAAGGCAAAAGGTTGTGAAGCCG 4477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4431 CTGTACGATCACATCACTAGGGTCTTGGAAATCTAAAGAAGGCAAAAAGTTGTGAAGCCG 4490
Query 4478 TGAAAGAAGAGTCAAGACTTGATAGACCTCAGACCAATCTCGATTTTTCTGTTCAAGTGT 4537
|||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4491 TGAAAG--GAG--A-GACTTGATAGAGCTCAGACCAATCTGGATATTTCTGTTCAAGTGT 4545
Query 4538 GCTCTTGAGAGCAACAAAGAAGGAAACCAAGTCAAAGAGGAATCGGTTAGCGACCCAAGC 4597
| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4546 GGTCTGGAGAGCAGCAAAGAAGGAAGCCAAGTCAAAGGGGAATCGGTAAGCGACCCAAGC 4605
Query 4598 CTGGTTTGTTCTTTGTATGTACACTACAATCAAGCCAATTACCGCTCATGATCATCGGTT 4657
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4606 CTGGATTGTTCTTTGTATGTACACTACAATCAAGCCA-TTACCGCCCATGATCATCGGTT 4664
Query 4658 TTAATCATCGTTTTCACGGAGACTGCTGCTTGGTTTTAATAGGCCAGATGGATGaaaaaa 4717
| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 4665 T-AATCATCATTTTCACGGAGATTGCTGTTTGGTTTTGATAGCCCAGATGGATGAAAAAA 4723
Query 4718 aCGCAGGAACTCTTTCTCAGATCTAGTACGGTTAGGTAACTTTACTCT-T---------C 4767
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
Sbjct 4724 -CGCAGGAACTCTTTCTCAGATCTAGTTCGGTTAGGTAACTTTTCTCTGTTTTTTGTTTC 4782
Query 4768 TTTT---TT-CCCTTAGCATTTTATTTCCATAGAAAATGTAGTCTTTTT-GCCCACATAG 4822
|||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 4783 TTTTCGCTTTCCCTTAGCATTTTATTTCCATAGAAAATGTAGCCTTTTTTGCCCACATAG 4842
Query 4823 AAACTATTAGAATCCAGGGCTTATCGTCAACCATGTTTCTAAAAATTCAAGAAATAATTC 4882
|||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4843 AAACTAATAGAATCCAGGGCTTATCGTCAATCTTGTTTCTAAAAATTCAAGAAAGAATTT 4902
Query 4883 CTCTACTATTTTCAGAAAAAGAAAACAGTA 4912
|||||||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 4903 CTCTACTATTTTTAGAAAAAGAAAACTGTA 4932
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 245065516555
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5