BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486708
Length=4239
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G62010.1 | Symbols: | unknown protein; LOCATED IN: cellular... 7059 0.0
> AT3G62010.1 | Symbols: | unknown protein; LOCATED IN: cellular_component
unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED
DURING: 15 growth stages; Has 553 Blast hits to 216 proteins
in 93 species: Archae - 0; Bacteria - 124; Metazoa -
193; Fungi - 58; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes
- 70 (source: NCBI BLink). | chr3:22964677-22971384 FORWARD
LENGTH=4268
Length=4268
Score = 7059 bits (3822), Expect = 0.0
Identities = 4116/4254 (97%), Gaps = 36/4254 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTCAAACTTCGATTTTCC-TTTTCTCGCGCGAGATATTTTCTGGATTTTGTCTGCGAAT 59
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 TCTCTAACTTCGATTTTCCTTTTTCTCGCGCGAGAAAATTTCTGGATTTTGTCTGCGAAT 69
Query 60 CACGAATATTCCAGCGTTTCTTCGTCCCGCATTGGCGCACGATTTTTGTCGTTTTTCCGG 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||
Sbjct 70 CACGAATATTCCAGCGTTTCTTCGTCCCGCATTGGCGTAGGATTTTTGTCGTGTTTCCGG 129
Query 120 GATTCGAAGAACAGTTTATAGAGTGAAGAAGA----AGAAGAG--TCGAGAGGTTTTTCG 173
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||| || | | || |
Sbjct 130 GATTCGAAGAACAGTTTAAAGAGTGAAGAAGAGTCGAGAGGTGTTTCG-GA-G-TCTT-G 185
Query 174 G-AG-----TCGATATC--GttttttttGAATCGAATCTGCAAGTTTTTGAAGTTTCTCG 225
| || ||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct 186 GAAGAACAAGCGAGATCGTGTTTTTTTTGCATAGAATCTGCGAGGTTTCGAAGTTTCTC- 244
Query 226 GTGGTGTGTGGGGTTTTTTGTTGGATGAGATATGTCGATACCGAAGGAGCCAGAGCAGGT 285
||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 ------TGTGGAG-TTTTTGTTGGATGAGAGATGTCGATACCGAAGGAGCCAGAGCAGGT 297
Query 286 GATGAAGCTGAGAGATGGATCGGTACTTGGTAAGAAGACGATTCTCAAGAGTGACCATTT 345
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 298 GATGAAGATGAGAGATGGATCGGTACTTGGTAAGAAGACGATTCTTAAGAGTGACCATTT 357
Query 346 TCCAGGTTGTCAAAATAAGCGTATGACTCCTCAGATCGAAGGCGCTCCCAATTACCGTCA 405
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 358 TCCAGGTTGTCAGAATAAGCGTATGACTCCTCAGATCGAAGGCGCTCCTAATTACCGTCA 417
Query 406 GGCTGATTCATTACGTGTACATGGGGTTGCAATTCCAACTGCTGTTGGGATACGAAACGT 465
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 418 GGCTGATTCACTACGTGTACATGGGGTGGCAATTCCAACTGCTGTGGGGATACGAAACGT 477
Query 466 TCTTAGGCATATTGGAGCTCACAAAGACGGGAAACAAGCAAAAGTTCTTTGGATTAGTCT 525
|||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 478 TCTTAGACACATTGGAGCTCACAAGGACGGTAAACAAGTAAAAGTTCTTTGGATTAGTCT 537
Query 526 CAGGGAGGAACCGGTAGTATACATAAACGGGCGACCTTTTGTTCTACGTGATGTGGAGAA 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CAGGGAGGAACCGGTAGTATACATAAACGGGCGACCTTTTGTTCTACGTGATGTGGAGAA 597
Query 586 ACCTTTCACTAATCTTGAGTACACGGGAATCAACAGGGTAAGGGTAGAGCAAATGGAAGC 645
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 ACCTTTCACCAATCTTGAGTACACGGGAATCAACAGGGTAAGGGTAGAGCAAATGGAAGC 657
Query 646 CCGGTTAAAAGAAGATATTCTCATGGAGGCGTCGAGATATGGGAATAAGATACTTGTCAC 705
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ACGATTAAAAGAAGATATTCTCATGGAGGCGTCGAGATATGGGAATAAGATACTTGTCAC 717
Query 706 CGATGAACTGCCAGATGGTCAGATGGTGGACCAGTGGGAGCCAGTCTCAACTGATTCTTT 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 CGATGAACTGCCAGATGGTCAGATGGTGGACCAGTGGGAGCCAGTCTCAACTGATTCTTT 777
Query 766 GAAGACACTACTTGAGGTTTACGAAGAACTGCAAGCTGAAGGCTACCTTCTCGATTATGA 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 778 GAAGACACTACTTGAGGTTTACGAAGAACTGCAAGCTGAAGGCTACCTTGTCGATTATGA 837
Query 826 ACGTGTTCCTATAACGGATGAAAAGTCGCCAAAAGAAACAGATTTTGATCTGTTGATTAG 885
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 ACGTGTTCCTATAACGGATGAAAAGTCACCAAAAGAAACAGATTTTGATCTGTTGATTAG 897
Query 886 GAAGATATCTCAGGCTGACATTAATACGGAGATCATTTTCAATTGTCAAATGGGACGTGG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GAAGATATCTCAGGCTGACATTAATACGGAGATCATTTTCAATTGTCAAATGGGACGTGG 957
Query 946 ACGTACGACGACTGGAATGGTGATTGCAACCCTGGTCTATTTCAAACGTACTGGGGCATC 1005
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 ACGCACGACGACTGGAATGGTGATTGCAACCCTGGTCTATTTCAAACGTACTGGGGCATC 1017
Query 1006 AGATCAAGGATTCCCAAGAAACAACTCTTTTGGGAGAATCTTTAAAGCTGGTGAAAATAT 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 AGATCAAGGATTCCCAAGAAACAACTCTTTTGGGAGAATCTTTAAAGCTGGTGAAAATAT 1077
Query 1066 TACTGTTAATCTGCCGAATTCGGAGGAGGCAATCCGTAGAGGGGAATACGCGGTCGTTAG 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1078 TACTGTTAATCTGCCGAATTCGGAGGAGGCAATCCGTAGAGGGGAATATGCGGTCGTTAG 1137
Query 1126 AAGTTTAATTAGAGTCTTAGAGGGTGGTGTAGAAGGTAAAAGGCAAGTTGATAAAGTCAT 1185
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 AAGTTTAATTAGAGTCTTAGAGGGTGGTGTAGAAGGAAAAAGGCAAGTTGATAAAGTCAT 1197
Query 1186 CGACAAATGTGCATCCATGCAGAATTTACGAGAGGCAATTGCAACCTATCGCAGTAGTAT 1245
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 CGACAAATGTGCATCCATGCAGAATCTACGAGAGGCAATTGCAACCTATCGCAGTAGTAT 1257
Query 1246 TTTGCGTCAACCCGATGAAAAGAAGAGAGAGGCAGCACTCTCATTTTTTGTTGAGTACTT 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TTTGCGTCAACCCGATGAAAAGAAGAGAGAGGCAGCACTCTCATTTTTTGTTGAGTACTT 1317
Query 1306 GGAAAGATATTACTTCCTTATATGCTTTGCAGTATATCTTCATTCAGAGGGTGCTTTTCT 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1318 GGAAAGATATTACTTCCTTATATGCTTTGCAGTATATCTTCATTCGGAGGGTGCTTTTCT 1377
Query 1366 CCAATCTGGTTCGCTTGGCCATGTCAGTTTTGCTGATTGGATGCGAGCTAGGCCAGAGCT 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CCAATCTGGTTCGCTTGGCCATGTCAGTTTTGCTGATTGGATGCGAGCTAGGCCAGAGCT 1437
Query 1426 CTATAGCATTCTTCGCAGGTTGCTCAGGAGAGATCCTATGGGTGCCCTTGGATATGCAGC 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CTATAGCATTCTTCGCAGGTTGCTCAGGAGAGATCCTATGGGTGCCCTTGGATATGCAGC 1497
Query 1486 TATGAAGCCTTCTTTGACAAAGATTGCAGAATCTACCGACGGGCGCCCTCACGAGATGAG 1545
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TATGAAGCCTTCTTTGATAAAGATTGCAGAATCTACCGACGGGCGCCCTCACGAGATGAG 1557
Query 1546 TGTCGTTGCTGCGCTTAGAAGTGGGGCAGTTCTGGGAAGTCAAACTGTTCTAAAGAGCGA 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1558 TGTCGTTGCTGCGCTTAGAAGTGGGGCAGTTCTGGGAAGTCAAACTGTTCTAAAGAGTGA 1617
Query 1606 TCATAGTCCTGGCTGTCAAATTTTAAGTCTACCAGAGAGGGTGGAAGGAGCTCCGAATTT 1665
||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618 TCACAGTCCTGGCTGTCAAATTTTAAATCTACCAGAGAGGGTGGAAGGAGCTCCGAATTT 1677
Query 1666 TAGGGAGGTTCCAGGATTTCCTGTATATGGTGTTGCGAATCCAACTATAGATGGTATTCG 1725
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 TAGGGAGGTTCCAGGATTTCCTGTGTATGGTGTTGCAAATCCAACTATAGATGGTATTCG 1737
Query 1726 ATCTGTCATTGAAAGGGTTGGGAGTTCCAGAGGTGGTCGGCCAGTTTTTTGGCACAATAT 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 ATCTGTCATTGAAAGGGTTGGGAGTTCCAGAGGTGGTCGGCCAGTTTTTTGGCACAATAT 1797
Query 1786 GAGAGAAGAACCTGTTATATATATCAACGGGAAACCATTTGTTCTACGTGAAGTTGAAAG 1845
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1798 GAGAGAAGAACCTGTTATATATATCAACGGGAAACCATTTGTTCTACGAGAAGTTGAAAG 1857
Query 1846 GCCATATAAGAACATGCTAGAATATACGGGAATTGATCGAGATAGAGTGGAAGGAATGGA 1905
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1858 GCCATATAAGAACATGCTAGAATATACGGGAATTGATCGAGATAGAGTTGAAGGGATGGA 1917
Query 1906 GGCTCGTCTAAAAGAGGATATTCTGAGAGAAGCTAAGCGATATGACGGTGCGATAATGGT 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 GGCTCGTCTAAAAGAGGATATTCTGAGAGAAGCTAAGCGATATGACGGTGCGATAATGGT 1977
Query 1966 CATTCATGAAACCAAAGATGGACAGATTTTTGATTTATGGGAAAATGTGGATGCTGATTC 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1978 CATTCATGAAACCAAAGATGGACAGATTTTTGACTTATGGGAAAATGTAGATGCTGATTC 2037
Query 2026 TGTTCAAACACCCCTCGAGGTCTACAAATGTTTAGAGGCTGATGGGTTTCCTATTAAGTA 2085
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2038 TGTTCAAACACCCCTCGAGGTTTACAAATGTTTAGAGGCTGATGGTTTTCCTATTAAGTA 2097
Query 2086 TGCACGTGTACCTATAACTGATGGTAAAGCGCCCAAAAGCTCAGACTTTGACACATTGAC 2145
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 TGCACGTGTACCTATAACTGATGGTAAAGCCCCCAAAAGCTCAGACTTTGACACATTGAC 2157
Query 2146 ATCTAATATTGCTTCTGCTTCCAAAGACACTGCTTTTGTCTTCAATTGCCAGATGGGGAG 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 ATCTAATATTGCTTCTGCTTCCAAAGACACTGCTTTTGTCTTCAATTGCCAGATGGGGAG 2217
Query 2206 AGGTAGAACAACCACTGGAACTGTCATTGCCTGTCTAGTGAAGCTCCGCATCAATTATGG 2265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2218 AGGTAGAACAACCACTGGAACTGTCATTGCCTGTCTAGTGAAGCTCCGCATTAATTATGG 2277
Query 2266 GAGACCTATCAAGGTTCTTTATGACGTTCTGACCCATGACATTGTGGATGAAGATTCCTC 2325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 GAGACCTATCAAGGTTCTTTATGACGTTCTGACCCATGAAATTGTGGATGAAGATTCCTC 2337
Query 2326 AAGTGGTGGTGAAGAAACTGGAAGTAATAACGCTGAAGCAAGACCTCGTAATTCAGGACG 2385
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 AAGTGGTGGTGAAGAAACTGGAAGTAATAATGCTGAAGCAAGACCTCGTAATTCAGGACG 2397
Query 2386 AAGAACTGAGGAGGAACAAGGTCGTGCATTTGGAATGGATGACATCCTTTTGCTGTGGAA 2445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 AAGAACTGAGGAGGAACAAGGTCGTGCATTTGGAATGGATGACATCCTTTTGCTGTGGAA 2457
Query 2446 AATCACTAGGTTATTCGATAATGGAGTTGAATCCCGTGAGGCTTTAGATGCTGTGATTGA 2505
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2458 AATCACTAGGTTATTCGATAATGGAGTTGAATCACGTGAGGCGTTAGATGCTGTGATTGA 2517
Query 2506 TAGATGTTCTGCATTGCAAAATATTCGTGAAGCTGTTCTGCAGTACAGAAAGGTTTTCAA 2565
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2518 TAGATGTTCTGCATTGCAAAATATTCGTGAAGCTGTTCTGCAGTACAGGAAGGTTTTCAA 2577
Query 2566 CCAACAACATGTTGAGCCACGAGTAAGGAGTGCTGCCTTGAAACGTGGCGCTGAATATTT 2625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2578 CCAACAACATGTTGAGCCACGAGTAAGGAGTGCTGCCTTGAAACGTGGCGCTGAATACTT 2637
Query 2626 GGAGAGATACTTCCGCTTGATTGCCTTTGCAGCCTATCTAGGAAGCAAAGCTTTTGATGG 2685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 GGAGAGATACTTCCGCTTGATTGCCTTTGCAGCCTATCTAGGAAGCAAAGCTTTTGATGG 2697
Query 2686 ATTCTTTGTGGAAGGAGAATCTAAGGTGACGTTCAAGAATTGGTTGAATCAGAGGCCTGA 2745
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2698 ATTCTTTGTGGAAGGAGAATCTAAGGTGACGTTCAAGAATTGGTTGCATCAGAGGCCTGA 2757
Query 2746 GGTGCAAGCAATGAAGTGGAGCATAAGGCTAAGACCTGGACGATTTTTTACCATTCCTGA 2805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 GGTGCAAGCAATGAAGTGGAGCATAAGGCTAAGACCTGGGCGATTTTTTACCATTCCTGA 2817
Query 2806 GGAATTGCGGGCACAACATGAATCGCAACACGGAGATGCAGTCATGGAGTCAATTGTCAA 2865
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2818 GGAATTGCGGGCACAACATGAATCACAACACGGAGATGCAGTCATGGAGTCAATTGTCAA 2877
Query 2866 CGAACGTAGTGGTTCTGTCTTGGGAAAAGGTTCTATACTTAAAATGTACTTTTTCCCTGG 2925
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878 CGAACGTAGTGGTTCTGTCTTGAGCAAAGGTTCTATACTTAAAATGTACTTTTTCCCTGG 2937
Query 2926 CCAAAGAACTTCAAGTCGTTTGCAAATTAACGGTGCACCTCACGTATACAAGGTCGATAG 2985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 CCAAAGAACTTCAAGTCGTTTGCAAATTAACGGTGCACCTCACGTATACAAGGTCGATAG 2997
Query 2986 ATATCCTGTGTATAGCATGGCAACTCCCACAATTTCAGGCGCTAAAAAGATGCTCGCCTA 3045
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2998 ATATCCTGTGTATAGCATGGCAACTCCCACAATTTCAGGCGCTAAAAAAATGCTCGCCTA 3057
Query 3046 TTTAGGCACCAAACTAAAGGAAGAAGGTGGGGTTTCAACAGAAAGAATAGTAGTAACAGA 3105
||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3058 TTTAGGCACCAAACTTAAGGAAGAAGGTGGGGGTTCAACAGAAAGAATAGTGGTAACAGA 3117
Query 3106 CTTGAGAGAAGAAGCGGTTGTTTATATCAATGGAACTCCATTTGTCTTGAGAGAATTGAG 3165
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3118 CTTGAGAGAAGAAGCGGTTGTTTACATCAATGGAACTCCATTTGTGTTGAGAGAATTGAG 3177
Query 3166 TAAACCTGTTGATACGCTTAAGCATGTTGGAATAACTGGTGCAGTGGTAGAAAGCATAGA 3225
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3178 TAAACCTGTTGATACGCTTAAGCATGTTGGAATAACCGGTGCAGTGGTAGAAAGCTTAGA 3237
Query 3226 ATCACGGTTAAAAGAAGATATATTGGCTGAAGTTCGAGAGACTGGAGGCCGAATGCTATT 3285
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3238 AACACGGTTAAAAGAAGATATATTGGCTGAAGTTCGAGAGACTGGAGGCCGAATGCTATT 3297
Query 3286 GCATCGTGAAGAATACAGCCCGGCATCTAATCAATCTCGGGTTATTGGATATTGGGAGAA 3345
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298 GCATCGTGAAGAATACAGCCCGGCATCAAATCAATCTCGGGTTATTGGATATTGGGAGAA 3357
Query 3346 TATTCAACCAGATAATGTGAAGACACCTGCAGAAGTATATGCTGCACTGAAAGATGAAAA 3405
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3358 TATTCAACCAGAAAATGTGAAGACACCTGCAGAAGTATATGCTGCTCTGAAAGATGAAAA 3417
Query 3406 TTACAACATATCTTACCGCAGAATACCTTTAACCAGAGAAAAAGATGCATTAGCTTCCGA 3465
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3418 TTACAATATATCTTACCGGAGAATACCTTTAACCAGAGAAAAAGACGCATTAGCTTCCGA 3477
Query 3466 TGTAGACGCGATCCAGTACTGTAAAGACGATTCCGCTGGGAGTTACTTGTTTGTATCGCA 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3478 TGTAGACGCGATCCAGTACTGTAAAGACGATTCCGCTGGGAGTTACTTGTTTGTATCGCA 3537
Query 3526 CACCGGTTTTGGAGGAGTTTCTTATGCAATGGCCATAACTTGTCTCCTACTTCAACCTGG 3585
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3538 CACCGGTTTTGGAGGAGTTTCTTATGCAATGGCTATAACTTGTCTCCTACTTCAACCTGG 3597
Query 3586 TCAGAACTTCACAGCTACACCAACCACAGATTCTTCTACCTTAGAAGAAGATGATTCGCC 3645
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 TCAGAACTTCACAGCTACACCAACCACAAATTCTTCTACCTTAGAAGAAGATGATTCGCC 3657
Query 3646 TTCACGGGTTTGTGATGAAGAAGCGTTGAGTATGGGAGACTACCGCGACATACTGAGTCT 3705
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3658 TTCAGGGGCTTGTGATGAAGAAGCGTTGAGTATGGGAGACTACCGCGACATACTGAGTCT 3717
Query 3706 CATAAGAGTGCTTTCTCATGGTCCTCAGAGCAAATCAGACGTAGATGGAATAGTCGAACT 3765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3718 CATAAGAGTGCTTTCTCATGGTCCTCAGAGCAAATCAGACGTAGATGGAATAGTCGAACT 3777
Query 3766 GTGTGCTGGTGCAGGACATTTGAGAGAAGACATCGTTTACTACAGTAAAGAACTCAACAA 3825
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 3778 GTGTGCTGGTGCAGGACATTTGCGAGAAGACATCGTTTACTACAGTAAAGAGCTGAACAA 3837
Query 3826 GCTTCCTATTACAAAAGATGAAAACCGTTCATACATCATGGACATGGGTGTTAAAGCCTT 3885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3838 ACTTCCTATTACAAAAGATGAAAACCGTTCATACATCATGGACATGGGTGTTAAAGCCTT 3897
Query 3886 AAGGCGTTACTTTTACCTGATAACATTCAGATCATACCTCTATTGCACGTCACCGGAAGA 3945
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 3898 AAGGCGCTACTTTTACCTGATAACATTCAGATCATACCTCTATAGCACGTCGCCGGAAGA 3957
Query 3946 AATGAAATTCTTGGATTGGATGAAGTCACGGCCGGAACTTGGACATCTCTGTAATAACCT 4005
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3958 AATGAAATTCTTGGATTGGATGAAGTCACGGCCGGAACTTGGACATCTCTGTCATAACCT 4017
Query 4006 CAGGATAGATAAGTAAAAGTGTGATTTTGGGTTTCAGTGTCCATACATATATATGTATAA 4065
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4018 CAGGATAGATAAATAAAAGTGTGATTTTGGGTTTCAGTGTCCATACATATAT--GTATAA 4075
Query 4066 -TCTAGGCAAAGTTATGTTGTTTGGTTTATACAGAGCTTTTAGTGTATAAAAAATTGTAC 4124
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4076 ATCTAGGCAAAGTTATGTTGTTTGGTTTATACAGAGCTTTTAGTGTATAAAAAATTGTAC 4135
Query 4125 AGCTTTCTCTCCCTCGT-CTGTTTGCTTTGTAGAGAGATCTCTGTTTATAGGTTTGTGCT 4183
||| |||||| | || | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4136 AGCCTTCTCTTC-TCCTTC-GTCTGCTTTGTAGAGAGATCTCTGTTTATAGGTTTGTAC- 4192
Query 4184 CTTCTTATATGGATTGCTTAAAACCCTCCAGCTGATTCAGCAGGTTACTCTAAT 4237
||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4193 CTT-T-ATATGCATTGCTTAAAACCCTCCAGCTGATTCAGCAGGTTATTCTAAT 4244
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 211303163916
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5