BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486740
Length=3801
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G62360.1 | Symbols: | Carbohydrate-binding-like fold | chr3... 6115 0.0
> AT3G62360.1 | Symbols: | Carbohydrate-binding-like fold | chr3:23072786-23080563
REVERSE LENGTH=4026
Length=4026
Score = 6115 bits (3311), Expect = 0.0
Identities = 3662/3829 (96%), Gaps = 33/3829 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATCGGTCCGATATTTTGGATCCGTGCTCCATTGACGAACAAACAA-CA--C-TC---TTC 53
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || | || |||
Sbjct 1 ATCGGTCCGATATCTTGGATCCGTGCTCCATTGACGAAC-AATAATCATTCTTCTTTTTC 59
Query 54 -----TT------TTTTAGCTCCTTCACCGGAGCTTCACATCGGGAACAATGGCGGCCAG 102
|| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 60 TTAAGTTCAACCATTTTAGCTCCTTCACTGGAGCTTCACGTCGGGTACAATGGCGGCCAG 119
Query 103 TAGGAAGATTTGTCATTCTCTGATCGTCTTCCTTATAGCGATTTCTACAGTTTACGGTGT 162
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 120 TAGGAAGATTTGTCATTCTCTGATCGTTTTCCTCATAGCGATTTCTACAGTCTACGGTGT 179
Query 163 TTCCGCGGATTCGATAAAAGGCTGCGGTGGTTTTGTCGAGGCGAGTTCGTCTTTGGTCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTCCGCGGATTCGATAAAAGGCTGCGGTGGTTTTGTCGAGGCGAGTTCGTCTTTGGTCAG 239
Query 223 CTCTCGGAAAGGATCCGATGGGAAACTGGATTATTCTCATATCACAGTTGAGCTTCAAAC 282
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 GTCTCGGAAAGGATCCGATGGGAAACTGGATTTTTCTCATATCACAGTTGAGCTTCAAAC 299
Query 283 AGTAGATGGATTGGTAAAAGACAGTACACAGTGTGCCCCAAATGGTTACTATTTCATCCC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 AGTAGATGGATTGGTAAAAGACAGTACACAGTGTGCCCCAAATGGTTACTATTTCATCCC 359
Query 343 AGTATATGACAAGGGCTCATTCATTCTCAAGATAAATGGACCAGAGGGATGGTCATGGAA 402
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 360 AGTATATGACAAGGGCTCATTCATTCTCAAGATAAATGGACCTGACGGATGGTCATGGAA 419
Query 403 TCCAGATAAGGTTACTGTCGTTGTTGACGACTCTAGTTGCAACAACAATGAGGATATTAA 462
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 420 TCCAGATAAGGTAACTGTTGTTGTTGACGACTCTAGTTGCAACAACAATGATGATATTAA 479
Query 463 CTTCCGCTTCACGGGTTTTACATTATCCGGTAAAGTCCTT-GGAGCTGTTGGTGGGGAGA 521
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 480 CTTCCACTTCACGGGTTTTACATTATCCGGTAAAGT-CTTGGGAGCTGTTGGTGGGGAGA 538
Query 522 GTTGTGTGATTAAGAATGGAGGTCCAGCTGATGTCAATGTTGAATTGTTGTCTTCTGAT- 580
||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 GTTGTCTGATTAAGAATGGAGGCCCAGCAGATGTCAATGTTGAATTGTTGTCTTCTGATG 598
Query 581 G----G-AGATCCCGTTGCTTCTGTTCTCACATCGTCAGATGGGAGCTACTTATTCAAGA 635
| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 GATCAGAAGATCCTGTCGCTTCTGTTCTCACATCGTCAGATGGGAGCTACTTATTCAAGA 658
Query 636 ATATTATTCCAGGAAAATACAATATCCGTGCATCCCATCCAGAGCTGCAGGTTGAAGTTC 695
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 659 ATATTATTCCAGGAACATACAATATCCGTGCATCCCATCCAGAGCTGCAAGTTGAAGTTC 718
Query 696 GCGGTTCAATAGAGGTGGAACTTGGATTTGCAAATGGCATGGTGGATGACATATTCTTCG 755
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 719 GCGGTTCAACAGAGGTGGAACTTGGATTTGCAAATGGCATGGTTGATGACATATTCTTCG 778
Query 756 TCCGTGGTTATGATCTCAAGGGGTCTGTTGTTGCTCAGGGAAATCCAATCCTGGGTGTTC 815
||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 779 TCCTTGGTTATGATCTTAAGGGGTCGGTTGTTGCTCAGGGGAATCCAATCCTGGGTGTCC 838
Query 816 ATATATATTTGCATTCAGATGATGTTTCCATGGTAGATTGCCCCCAAGGATTTGGTGACG 875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 839 ATATATATTTGCATTCAGATGATGTTTCCATGGTAGATTGTCCCCAAGGATCTGGTGACG 898
Query 876 CTGCTGGAGAAAGGAAGCCTCTCTGCCATGCTGTATCTGATGCGGAAGGAATTTTCAGTT 935
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 899 CTGCTGGAGAAAGGAAATCTCTTTGCCATGCTGTATCCGATGCAGAAGGAATTTTCAGTT 958
Query 936 TCAAGTCCATCCCTTGTGGAAAATACGAATTGGTGCCACATTATAAGGGTGAGAATACGG 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 TCAAGTCCATCCCTTGTGGAAAATACGAATTGGTGCCGCATTATAAGGGTGAGAATACGG 1018
Query 996 TCTTTGATGTTTCACCTCCTGTTATGCCTGTTTCTGTAGAGCATCAACATGTCACCGTTC 1055
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1019 TCTTTGATGTTTCACCTCCTGTTATGCCTGTATCTGTAGAGCATCAACATGTCACTGTTC 1078
Query 1056 CCCAAAAATTTCAGGTAACAGGATTCTCCATTGGGGGTCGTGTAGTTGACGGTAATTCAG 1115
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1079 CCCAAAAATTTCAGGTAACAGGATTCTCCATTGGGGGTCGCGTAGTTGACGGTAATTCAG 1138
Query 1116 TGGGAGTTGAGGGCGTTAAAATCTTAGTAGATGGTAGTCTAAGATCTGTCACGGACAAGG 1175
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1139 TGGGAGTTGAGGGCGTTAAAATCTTAGTAGATGGTAGTCTAAGATCTGTCACAGACAAGG 1198
Query 1176 AAGGCTATTACAAGCTTGACCAGCCTGCTAAATTAGTTGTTACTCAACCTCTCCTAGTGA 1235
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAGGCTATTACAAGCTTGACCAGCCTGCTAAATTGGTTGTTACTCAACCTCTCCTAGTGA 1258
Query 1236 ATTTTTGGAGGCTTTTAGAGTCTAGAGTAAAGAATATGGCTAGATTTCTGAAGGTTACGT 1295
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1259 ATTTTTTGAGGCTTCTAGAGTCTAGAGTAAAGAATATGGCTAGATTTCTGAAGGTTACCT 1318
Query 1296 CAAATCAGTATACAATTGATGCAGTCAAGGAGCATTACAAGTTCGACAAACTGAAGAAGT 1355
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 CAAACCAGTATACAATTGATGCAGTCAAGGAGCATTACAAGTTCGACAAACTGAAGAAGT 1378
Query 1356 TCATGGTTTTACCAAATATGGCTTCACTTCCAGACATCAGTGCTGTATCCTATGAGATCT 1415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1379 TCATGGTTTTACCAAATATGGCTTCACTTCCAGACATCAATGCTGTATCCTATGATATCT 1438
Query 1416 GTGGTGTGGTGCGAATGTTTGGTTCTCGTCACAAAGCAAAGGTAGCTTTGACTCATGGAC 1475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 GTGGTGTGGTGCGAATGTTTGGTTCTCGTCACAAAGCAAAGGTAGCTTTGACTCATGGAC 1498
Query 1476 CCACAAATGTCAAACCACAAATGAAGCTAACAGATGAGACCGGAACTTTCTGCTTTGAGG 1535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1499 CCACAAATGTCAAACCACAAATGAAGCTAACAGATGAGACCGGAGCTTTCTGCTTTGAGG 1558
Query 1536 TTCCACCAGGCGAATATAGGCTGTCAGCTTTGGCTGCTACACCAAAGGGTGCTTCTGAGC 1595
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 TTCCACCAGGCGAATATAGGCTGTCTGCTTTGGCTGCTACACCAAAGGGTGCTTCTGAGC 1618
Query 1596 TTCTGTTTTTGCCAGCTTAT-TTGGATGTTGCCGTTAAAAGCCCATTGTTGAACATAGAA 1654
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 1619 TTCTGTTTTTGCCAGCTTATGTT-GATGTTGCCGTTAAAAGTCCTTTGTTGAACATAGAA 1677
Query 1655 TTCTCTCAGGCCAAAGTCAATGTGCATGGTTCTGTTACTTGCAAGGAGAAATGTGGTCCG 1714
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678 TTCTCTCAGGCCAGAGTCAATGTGCATGGTTCTGTTACTTGCAAGGAGAAATGTGGTCCT 1737
Query 1715 TCTGTGTCAGTGGTGCTTGTGGGAGCGGCTGGTGATCGTGACAAGAAGACTGTTGTTTTA 1774
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1738 TCTGTCTCAGTGGTGCTTGTGGGAGCTGCTGGTGATCGTGACAAGAAGACAGTTGTTTTA 1797
Query 1775 ACCGACGAGAGCAGTCAATTTCTTTTTTCAGACATACTGCCTGGAAAATATAGAGTTGAG 1834
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 ACCGACGAGAGCAGTCAATTTCTATTTTCAGACATATTGCCTGGAAAATATAGAGTTGAG 1857
Query 1835 GTGAAAAGCATTTCACCGGAAGCCGCATCTGATGAAGACAGTTGGTGCTGGGACCGTAGC 1894
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 GTGAAAAGTATTTCACCGGAAGCCGCATCTGATGAAGACAGTTGGTGCTGGGACCGTAGC 1917
Query 1895 TCCATTGATGTGAATGTCGAAACTGAGGATATCAAAGGGATTGAATTTGTCCAGAAAGGT 1954
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918 TCCATTGATGTGAATGTCGGAACTGAGGATATCAAAGGGATTGAATTTGTCCAGAAAGGT 1977
Query 1955 TACTGGATTAATATTATCTCCACCCATGAGGTGGACGCTAGAATCGCTCATCCTAATGGA 2014
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1978 TACTGGATTAATATTATCTCCACTCATGAGGTGGACGCTAGAATCGCTCATCCTGATGGA 2037
Query 2015 TCACCTACTAGTTTGAAAATCAAGAAAGGTTCGCAGAAAATATGCGTTGAGTCACCTGGA 2074
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2038 TCGCCTACTAGTTTGAAAATCAAGAAAGGTTCACAGAAAATATGCATTGAGTCACCTGGA 2097
Query 2075 GGGCATGAGCTTCAGCTTTCTGACTCATGCATGTCCTTTGGGAGCAATTCAATAAAGATA 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2098 GGGCATGAGCTTCAGCTTTCTGACTCATGCATGTCCTTTGGGAGCAATTCAATAAAGATA 2157
Query 2135 GATGTCTCAAATCCACAGCCTATTCATCTGAAAGCAGAGAAGTACCTCCTCAAAGGTCTG 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 GATGTCTCAAATCCACAGCCTATTCATCTGAAAGCAGAGAAGTACCTCCTCAAAGGTCTG 2217
Query 2195 ATTAATGTGGAGTCTAGTTCAACTATTGAGTCTGAATTGCCAGAAAATTTCATTGTTGAT 2254
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2218 ATAAATGTGGAGTCTAGTTCAACTATTGAGTCGGAATTGCAAGAGAATTTCATTGTTGAC 2277
Query 2255 ATTCAAGACAAGAAAGGAAATGTTATCAACAGTATTACTGCCAAACTTGCATCTGATGGA 2314
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 ATTCAAGACAAGAAAGGGAATGTTATCAACACTATTGCTGCCAAACTTGCATCTGATGGA 2337
Query 2315 AGTGGGGTTTATGAGTACTATACCTGGGCAAATCTTGGTGAAAAGATTAGCTTTGTTCCT 2374
||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 AGTGGCGTTTATGAGTACTACACCTGGGCTAGTCTTGGTGAAAAGATTAGCTTTGTTCCT 2397
Query 2375 CGAGATTCTAGGGGTAATGTGGAGAAGAAGATTTTGTTTTATCCTAAAGTGCTTCATGCT 2434
| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||
Sbjct 2398 CAAGATTCTAGGGGTAATGTAGAGAAGAAGATGTTGTTTTACCCTAAAGAGATTCATGCT 2457
Query 2435 GTAGTGTCAAATGATGGATGCCAAGCTTCAGTTTCTCCATTTACTGGTCGGCTTGGTCTT 2494
||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 GTAGTGTCAAAAGATGGATGTCAAGCTTCTGTTTCTCCATTTACTGGTCGGCTTGGTCTT 2517
Query 2495 TACATAGAAGGATCAGTCTCTCCTCCTCTTCTTGGTGTTCATATTAAGGTTTCCGCTGCA 2554
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||
Sbjct 2518 TACATACAAGGATCAGTCTCTCCTCCTCTTCCTGGTGTTAATATTAAGATTTTTGCGGCA 2577
Query 2555 AAAGACAGCCTTATTTCTTCACTTAAGAAAGGTGAAGTAGCTATTGAAACAAGCACTTCA 2614
|| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2578 AAGGACAGCCTTATTTCTTCACTTAAGAAAGGGGAAATAGCTATTGAAACAAGCACTTTA 2637
Query 2615 CCAGCTGGTTCATTTGTTGCTGGGCCTTTGTATGATGATATACCATATGATACCGAGGCT 2674
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||
Sbjct 2638 TCAGCTGGTTCATTTGTTGCTGGGCCTTTGTATGACGATATACCATATGCCACTGAAGCT 2697
Query 2675 TCAAAGGCTGGCTACCATATTAAAAGGCTAGGACCATATTCCTTCTCTTGCCAGAAGCTT 2734
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2698 TCAAAGCCTGGCTACCATATTAAAAGGTTAGGACCATATTCCTTCTCCTGCCAGAAGCTT 2757
Query 2735 GGTCAGATCTCTGTGCGTGTAAACTCAAAGGACAATGCCGAGACATCAATACCTCCGCTG 2794
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2758 GGTCAGATCTCTGTGCGTGTAAACTCAAAGGACAATGCTGAGACATCAATACCTCCACTG 2817
Query 2795 TTGTTATCATTAAGTGGCGATCATGGTTACAGAAATAATTCCATATCTGGTGCTGGTGGA 2854
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2818 TTGTTATCATTAAGTGGCGATCATGGTTACAGAAATAATTCCATATCTGGCGCTGGTGGA 2877
Query 2855 CTCTTTGTGTTTGATAGCTTATTCCCTGGAAATTTCTACTTGCGTCCCCTTCTGAAGGAA 2914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2878 CTCTTTGTGTTTGATAGCTTATTCCCTGGAAATTTCTACTTGCGTCCCCTTCTTAAGGAA 2937
Query 2915 TATTCTTTCAAACCCTCAACACTGGCTATAGAACT-AAGTTCTGGGGAGTCCAGTGAAGC 2973
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||
Sbjct 2938 TATTCTTTCAAACCTTCAACACTGGCTATAGAACTGAA-TTCTGGGGAATCCAGTGAAGC 2996
Query 2974 TGTCTTTGAGGCTACTCGTGTTGCCTACAGTGCAATGGGTAGAGTCGCTCTCCTATCGGG 3033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2997 TGTCTTTGAGGCTACTCGTGTTGCCTACAGTGCAATGGGTAGAGTCGCTCTTCTATCGGG 3056
Query 3034 CCAGCCACAAGAAGGTGTTGCAATTGAAGCTCGCTCTGACTCCAAAGGATACTATGAGGA 3093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 CCAGCCACAAGAAGGTGTTGCAATTGAAGCTCGCTCTGACTCCAAAGGATACTATGAGGA 3116
Query 3094 GACTACAAGCGATATTAATGGAAATTATCGACTGAGAGGGTTACATCCAGATGCAACATA 3153
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 3117 GACTACAAGCGATATTAATGGAAATTATCGACTGAGAGGGTTACATCCAGATACAGCATA 3176
Query 3154 TGTAATTAAAGTGTCGAAGAAAATTGGTTCAGGCAACAATAAAATTGAACGTGCATCTCC 3213
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3177 TGTAATTAAAGTGTCGAAGAAAATTGGTTCAGCCAACAATCAAATTGAACGTGCATCTCC 3236
Query 3214 AGAGTCAGTTTCTCTTCAGATTGGTTATGAAGATATCAATGGGCTCGACTTTTTGGTATT 3273
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 AGAGTCGGTTTCTCTTCAGATTGGTTATGAAGATATCAATGGGCTCGACTTTTTGGTATT 3296
Query 3274 TGAACAACCAGAAACGACCATATTGACGTGCCATGTCGAAGGAAAACAAAACGAAGATCT 3333
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3297 TGAACAACCAGAAACGACCATATTGACATGCCATGTCGAAGGAAAACAAAACGAAGATCT 3356
Query 3334 AAACTCGAATCTGCTAGTGGAGATCAAATCAGCCATTGACAAATCTAAGATAGAGAATGT 3393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 AAACTCGAATCTGCTAGTGGAGATCAAATCAGCCATTGATAAATCTAAGATAGAGAATGT 3416
Query 3394 CTTTCCACTACCACTCTCCAACTTCTTCCAAGTAAAAGGTTTACCCAGAGGTAAACACCT 3453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||
Sbjct 3417 CTTTCCACTACCACTCTCCAACTTCTTCCAAGTAAAAGGCTTACCCAAAGGTAAGCACCT 3476
Query 3454 TGTGCAGCTTAAATCCAGTCGTCCTCTAATCTCCCACAAAGTAGAATCAGAGATTATTGA 3513
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 TGTGCAGCTTAAATCCAGTCGTCCTTTGATCTCCCACAAAGTAGAATCAGAGATTATTGA 3536
Query 3514 AGTTGATTTCGAGACAAATGCCCAAATCCATATCGGTCCACTTCGATACAGCATCGTGGC 3573
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3537 AGTTGATTTCGAGACCAATGCCCAAATCCATATTGGTCCACTTCGATACAGCATTGTGGC 3596
Query 3574 AGACCATCAGAGTCAGGAAGTGACACCTGCAGCTATATTGCCACTGGTTATTGGAGTTTC 3633
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 AGATCATCAGAGTCAGGAAGTGACACCTGCAGCTATATTGCCACTGGTTATTGGAGTTTC 3656
Query 3634 GGCAATTGCTCTGTTCCTCAGCATCCCCAGGTTGAAAGACATCTACCAAGCCACGGTTGG 3693
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 GGCAATTGCTCTATTCCTCAGCATCCCCAGGTTGAAAGACATCTACCAAGCCACGGTTGG 3716
Query 3694 GATTTCGTCTCCCGGGTTCACTACATCTGCCAAGAGAGAACCTCGAAAAGCTATTGCTAG 3753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3717 AATTTCGTCTCCCGGGTTCACTACATCTGCCAAGAGAGAACCTCGAAAAGCTGTTGCTAG 3776
Query 3754 AAAGAAGACGTTCTGAAGAATTTATTCATCTTCGGTCtt-tttttGTTT 3801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3777 AAAGAAGACGTTCTGAAGAATTTATTCATCTTCGGTCTTCTTTTT-TTT 3824
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189330042882
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5