BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486795
Length=4164
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G62900.1 | Symbols: | CW-type Zinc Finger | chr3:23248129-2... 6324 0.0
> AT3G62900.1 | Symbols: | CW-type Zinc Finger | chr3:23248129-23254810
REVERSE LENGTH=4939
Length=4939
Score = 6324 bits (3424), Expect = 0.0
Identities = 3733/3881 (96%), Gaps = 26/3881 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 100 GATGAGAAGCTTCAACACATCCTTGGACACTTCCAGAAAGACTTTGAGGGCGGTGTTTCA 159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130 GATGAGAAGCTTCAACACATCCTTGGACACTTCCAGAAAGACTTTGAGGGCGGTGTTTCA 189
Query 160 GCTGAGAATCTTGGGGCGAAATATGGTGGCTATGGCTCTTTCTTACCAACTTATCAACGA 219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 190 GCTGAGAATCTTGGGGCGAAATATGGTGGCTATGGCTCTTTCTTGCCAACTTATCAACGT 249
Query 220 TCTCCTGTTTGGTCTCACCCGAAGACACCAGCAAAACCTCAGAGTTCTACAGGGACTAGA 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 TCTCCTGTTTGGTCTCACCCGAAGACACCAGCAAAACCTCAGAGTTCTACAGGGACTAGA 309
Query 280 TCTCCCAACAACTTACTAGGGGAGAGTGGCAATGCAGCTTCGTCTAGTGTTCCTAAAAAG 339
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 TCTCCAAACAACTTACTAGGGGAGAGTGGCAATGCAGCTTCGTCTAGTGTTCCTAAAAAG 369
Query 340 GCAAAATCTGGGCTTGCTTCCTCTGGAAACCCCAAAAAATCAGTGAAATCCAAGAAACCC 399
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 370 GCAAAATCTGGTCTTGCTTCCTCTGGAAACCCCAAAAAATCAGTGAAATCTAAGAAACCT 429
Query 400 AGTTCCAGTGCCAGAATGGAATCTGCAACTAAGAAACCTGGTGTCTTTAGTAAACAGAAT 459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||
Sbjct 430 AGTTCCAGTGCCAGAATGGAATCTGCAACTAAGAAACCTTGTGTCTTCAGTAAGCAGAAT 489
Query 460 TCTCTGAAGCTTCGGATAAAGATGGTACCAGATGGTTTATCTACCGAAAAGAATGCTGCT 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 TCTCTGAAGCTTCGGATAAAGATGGTACCAGATGGTTTATCTACCGAAAAGAATGCTGCT 549
Query 520 GCGATATACAGTGGCCTTGGGCTTGATGTATCACCTTCTTTGTCCTTAGATAATAATAGT 579
|| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 550 GCAATATACAGTGGCCTTGGACTTGATGTGTCACCTTCTTTGTCCTTAGATAACAATAGT 609
Query 580 CTTTCAGGTAGTGAAGGGATGAATGGGGAGCCTCAGGGTTATTCTCCAATGGAGTCTCCC 639
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 610 CTTTCAGGTAGTGAAGGGATGAATGAGGAGCCTCAGGGTTATTCTCCAACGGAGTCTCCC 669
Query 640 ACCAGTATTCTGAATGTAATGACTTCACTTCCTGTGGATCATCGTCAGTTGCTATCTCCT 699
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 670 ACCAGTATTCTTAATGTAATGACTTCACTTCCTGTGGATCATTGTCAGTTCCTATCTCCT 729
Query 700 CTCTCTGATGATCTGATTCGATTCATT-ACAAGGGAAAAATCCGAAAAGGGATATAAGTA 758
|||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 CTCTCTGAGGATCTGATTCGATTCATTGA-AAGGGAAAAATCCGAAAAGGGATATAAGTA 788
Query 759 TACATCTCCATCCAGGCTTTTCACTGAGAGTTCTTTTGCTATGGCGA-ACGATTTGGAAC 817
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 789 TACATCTCCATCCAGGCTTTTCACTGCGAGTTCTTCTGCTATGGC-ATACGGTTTGGAAC 847
Query 818 CTCAGAAGGCTGGAGAAAAACCATCAGTAGAGAAGaaaaaaaaGATGGTGGAGAGGAGCA 877
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 CTCAGAAGTCTGGAGAGAAACCATCAGTAGAGAAGAAAAAAAAGATGGTGGAGAGGAGCA 907
Query 878 GCTTTTCTGCAGAGACAAATGTCCGCAGTAAGAAGGGCCTATTTGATGCAACTGATGCCA 937
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 908 GCTTTTCTGCTGAGACAAATGTCCGCAGTAAGAAGGGCCTGTTTGATTCAACTGATGCCA 967
Query 938 CTGTCAAGGAGTCAATGGAAGCAAACACATCATATTCTAC-TGCTGCGGAGAAAGAAACA 996
| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||
Sbjct 968 TTACCAAGGAGTCAATGGAAACAAACACATTATATCCTACAT-TTGCGGAGAAAGAAACA 1026
Query 997 GCCACTAGTAAATTATTTGATGCATCCAAGGAAAACTACAATGGCACTGTTAGGGGCGAA 1056
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GCCAGTAGTAAATTATTTGATGCATCCAAGGAAAACTACAATGGCACTGTTAGGGGCGAA 1086
Query 1057 ATGGTGGGTGATGTCGACAGAAGGTTGTGGGGTCTAACTCGTCATAAAGATCTTGGGGTG 1116
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1087 ATGGTGGGTGATGTCGACAGAAGGTTGTGGGGTCTAACTCGTCATAAAGATCTTGGGGCG 1146
Query 1117 CATCATGAGAATCCAAAGACTATTTCTGCTGGAAGTGTTCGGGAAGAGAAAAAGGCTAAA 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1147 CATCATGAGAATCCAAAGACTATTTCTGCTGGAAGTGTTCGTGAAGATAAAAAGGCTAAA 1206
Query 1177 TTTGGTGATGATGAGGCTTCAGGATACCCAAGGAAAGTTGGCAAATACAAAGGAAGCAAA 1236
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1207 CTTGGTGATAATGAGGCTTCAGGATACCCAAGGAAAGTTGGCAAATACAAAGGCAGCAAA 1266
Query 1237 GCTTTTGATTCAGTCAAAAAAGAATCGAGTGCGTCAAAGGTGAAAAGTGGTCATAAAGTG 1296
|||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1267 GCTTCTGATTCAGTCAAAAAGGAATCGAGTGCATCAAAGGCGAAAAGTGGTCATAAAGTG 1326
Query 1297 GAGCCAGAACATCCT-TTGAGAAAGCAGAAGTATGACCAGATAGAACAGGAGCCACCGTC 1355
|||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GAGCTAGAACATCCTCTT-AGAAAGCAGAAGTATGACCAGATAGAACAGGAGCCACCGTC 1385
Query 1356 TTTAACAAAGTTCAAGGAACAGCAAACCTCTGTTGTTTTTGAGACTAAGCTGAATGGTCA 1415
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 TTCATCAAAGTTCAAGGAACAGCAAACCTCTGTTGTTTTTGAGACTAAGCTGAATGGTCA 1445
Query 1416 AGCTGAGAAGAAAGAAGTGGTAGCCTTGAAACCACAAAGTGATAGCAAAAAAGCTGAGGA 1475
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1446 AGCTGAGAAGAAGGAAGTGGTAGCCGTGAAACCACAAAGTGATAGCAAAAAAGCCGAGGA 1505
Query 1476 CACTTACAAAGACTTTTTTGGAGACATAGGGGACTCTGAAGAAGAAGAGGAACAGAATTG 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1506 CACTTACAAAGACTTTTTTGGAGACATAGGGGACTCTGAAGAAGAAGAGGAAC--AA--- 1560
Query 1536 TTCGTTGGACGTAAAAGATTTGCGGATTTCAGAAAAGGGACTTCCGCCCTTAGAAGATAT 1595
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 -------GACGTAAAAGATTTGCGGATTTCAGAAAAGGGACTTCCGCCCTTAGAAGATAT 1613
Query 1596 GCCTGAAAAATCGAGCTTCCCACTGGTAGAACCTCAGAACGTTGGTCCTGAACCCATGTT 1655
|||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 GCCTGAAAAATCGAGCTTGCCGCTAGTAGAACCTCAGAACGTTGGTCCTGAACCCATGTT 1673
Query 1656 GAGAAAACTTGGTTCTGATGCTTCTCTTCCGAAAGCAAATCCCGTGATCATACAAGAACA 1715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 GAGAAAACTTGGTTCTGATGCTTCTCTTCCGAAAGCAAATCCCGTGATCATACAAGAACA 1733
Query 1716 TTGGGTTGCTTGTGACAAGTGTGGAAAGTGGCGGCTTCTTCCTTTTGGCGTCGTCCCAGA 1775
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1734 TTGGGTTGCTTGTGACAAATGTGGAAAGTGGCGGCTTCTTCCTTTTGGCGTCTTCCCAGA 1793
Query 1776 AGACCTTCCTGAGAAATGGATGTGCACAATGCTTAATTGGCTGCCTGGAGTCAACTATTG 1835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1794 AGACCTTCCTGAGAAATGGATGTGCACAATGCTTAATTGGCTGCCTGGAGTGAACTATTG 1853
Query 1836 CAATGTTCCTGAAGATGAAACAACGAAAGCACTGTATGCAATGTATCAGATCCCTGTCCC 1895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854 CAATGTTCCTGAAGATGAAACAACGAAAGCACTGTATGCAATGTATCAGATCCCTGTCCC 1913
Query 1896 TGAGAGCCAGGCTTCAATGCAGAGTAATCCCAGTGGCCCTAAGCCTCAGTTTAACCAGGG 1955
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1914 TGAGAACCAGGCTTCGATGCAGAGTAATCCCAGTGGCCCTAAGCCTCAGTTTACCCAGGG 1973
Query 1956 AGATGACAACACAAAGAAGAAGAAAAAGGGTTTTAAAAAGATAGACAATGGTATGTATAA 2015
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 1974 AGATGACAACACAAAGAAGAAGAAAAAGGGTTTCAAAAAGATAGACAATGGAATGGATAA 2033
Query 2016 AGAAGGTTCTCGAACTGCCGAAACTAACAAGACCATCCAAACATCGTCAAGAAATGGTAT 2075
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 AGAAGGTGCTCGAACTGCAGAAACTAACAAGACCATCCAAACATCGTCAAGAAATGGTAT 2093
Query 2076 TCAAAATTCGCATGGACTTGGCAACTTGGCCGAGGATGAGAGGCAAATACATAAACAGAA 2135
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 TCAAAATTCGCAGGGACTTGGCGACTTGGCCGAGGATGAGAGGCAAATACATAAACAGAA 2153
Query 2136 AGAGAAAGGAAAATCAGTGGATCACCTCTCTGATGAGTCGAAGAGCTTGAAGGCGAATAA 2195
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2154 AGAGAAAGGAAAAGCAGTGGATCACCTCTCTGATGAGTCGAAGAGCTTGAAGGCGAATAA 2213
Query 2196 CAAAAGAAAATCAGATCTAGAGAGTTCTATGCTGGCCaaaaaaaTGAAGATTGAAAGTTT 2255
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2214 CAAAAGAAAAACAGATCTAGAGAGTTCTATGCTGGCCAAAAAAATGAAGATCGAAAGTTT 2273
Query 2256 TCTGTTTCCTGATGAATCCGAACATGGAAATGGACGTCCTACCTCGAGTAGTGGTGTCCC 2315
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274 TCTGTTTCCTGATGAATCTGAATATGGAAATGGACGTCCTACCTCGAGTAGTGGTGTCCC 2333
Query 2316 TATCACGTCAGCAGATATAAAGCCTAAGCCTCGAGTGTCCTCCAAAATGCCAAAAGAGGA 2375
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2334 TATCACGTCAGCAGATATAAAGCCAAAGCCCCGAGTCTCCTCCAAAATGCCAAAAGAGGA 2393
Query 2376 AGGAGGAGCTTCAGACACTGGAAATAGCAATAGCACAGGGGGGATTAAAAAGAGGAAAAT 2435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2394 AGGAGGAGCTTCAGACACTGGAAATAGCAATAGCACTGGGGGGATTAAAAAGAGGAAACT 2453
Query 2436 GAGAGAAAGCCATGGTTCTAGGATTTACAGTGAGAACGAAAATCATGAACGTAAGAAAGC 2495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2454 GAGAGAAAGCCATGGTTCTAGGATTTACAGTGAGAACGAAAATCATGAACGAAAGAAAGC 2513
Query 2496 TCGAGTTCGTAAAGAAGAGAAGGAGCCTAGTTATTCTCAAGGCAATGGGAAGTTGGAAAA 2555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 TCGAGTTCGTAAAGAAGAGAAGGAGCCTAGTTATTCACAAGGCAATGGGAAGTTGGAAAA 2573
Query 2556 GAAAAATAGAAGTCATTCGAAAAGAGAGTATGCACATGTTCAGAACTCAATCGCGGCCAC 2615
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2574 GAAAAATAGAAGTCATTCGAAAATAGAGTATGCAAATGTTCAGAACTCAATCGCGGCAAC 2633
Query 2616 CTCGAGTTCTTCTAAGATTTCTGATTCTCATAAACCCAGAAACAGCTCCCACGAAGCTAA 2675
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2634 CTCAAGTTCTTCTAAGATTTCTGATTCTCATAAACCCAGAAACAGCTCCCGCGAAGCTAA 2693
Query 2676 ATGTTCGCCTGTTGAGTCGGTGTCTTCCTCACCTATGAGGCTTTCCAACATGGAGAAAAG 2735
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 2694 ATGTTCTCCTGTTGAGTCGGTGTCTTCCTCACCTATGAGGCTTTCCAACCCGGAGAAACG 2753
Query 2736 TACATCTGCGAGAAAAAAGAAAGAAGAATCTTATGATGCTAATGTCTTTGCAGCAGGTAG 2795
|| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2754 TATATCTGTGAGTAAAAAGAAAGAAGAATCTTATGATGCTAACGTCTTTGCAGCAGGTAG 2813
Query 2796 TTTGAGAAAATTCTCAGATGGTGAAGGTGAAGATGGTGGTGGGAGTGATAGATCGCAGTC 2855
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2814 TTTGAAAAAATTCTCAGATGGTGAAGGTGAAGATGATGGTGGGAGTGATAGATCGCAG-A 2872
Query 2856 G-CGGATGAAGGACAAACATGGATCCCATGAGTCTTCTGTGCTTGATATTTGGGATAATA 2914
| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 GTCAGATGAAGGATAAACATGGATCCCATGAGTCTTCTGTGCTTGATATTTGGGATAATA 2932
Query 2915 AAGGATCTTTGAAAGCCAAAGAGCGCGCTGATCCTTCTCTCGATGCCAGTTTTGAGAAA- 2973
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2933 AAGGATCTTTGAAAGCGAAAGAGCGCGCTGATCCTTCTCTCGATGCCAATTTTGA-AAAT 2991
Query 2974 GGTGGCCACAAGGA-TTTACCGCGGAAACTGGATCATATTCTCGGTGAAGGAAAACAGTC 3032
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2992 GGTGGCCACAA-GACTTTACCGCGGAAACTGGATCATATTCTCGGTGAAGGAAAACAGTC 3050
Query 3033 TAGCGATCATCATCGACGTAGCAATGATTACCTGGCAAAGAAGTCAGGAAAAGGTTCATC 3092
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 TAGCGATCATCATCGACGTAGCAATGATTCCCTGGCAAAGAAGTCAGGAAAAGGTTCATC 3110
Query 3093 TTCTCGGTCCAAAGAAAAGAGCCAAAGCATTAGGTCTGATTCACGGGATGGCCCGAGACA 3152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3111 TTCTCGGTCCAAAGAAAAGAGCCAAAGCATTAGGTCTGATTCACGGGATGGTCCGAGACA 3170
Query 3153 TATTGAAAAGAAGATATACGATGGTAGTCCTGACAGTAGAGCGGATATGATCGCGAGACC 3212
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3171 TATTGAAAAGAAGATATATGATGGTAGTCCTGACAGTAGAGCGGATATGATCGTGAGACC 3230
Query 3213 AAACATTCCAAAACCTTACGACTCCGAAAGAATATCAGAGAGGAGTAATAGAGCAGATTT 3272
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3231 AAACATTCCAAAACCGCACGACTCCGAAAGAATACCAGAGAGGAGTAATATAGCAGATTT 3290
Query 3273 AGCTTCTCCATCACGGCCACCATCTAGAGGTATCCAAGGGGATTCTTCTATGCTTTCTGT 3332
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3291 AGCTTCTCCATCACGGCCACCATCTAGAGGTGTCCAAGGGGATTCCTCTATGCTTTCTGT 3350
Query 3333 CCGTAAGAAAGTCGATAAATGTAGCACATCAGCTGGAAACAATAATATTCAAGCTGATGA 3392
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 3351 CCGTAAGAAAGTCGATAAATGCAGCACATCAGCTGGAAATAATAATATCCAAGCTGATGA 3410
Query 3393 TGTGACAAAGGCAACAGCCCAAATAAGAAGGAAAAGCGAGCCTTCTCCAAGCCCCTTGCG 3452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 TGTGACAAAGGCAACAGCCCAAATAAGAAGGAAAAGCGAGCCTTCTCCAAGCCCCTTGCG 3470
Query 3453 AAAGGAAGTAACATCTGCGCAGGCCGCCCATAATACTTTAAAAGAAGCTAAAGACTTGAA 3512
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 AAAGGAAATAACATCTGCGCAGGCCGCCCATAATACTTTAAAAGAAGCTAAAGACTTGAA 3530
Query 3513 ACATACAGCTGACCGTCTCAAGAGTTCTGTATCAAACCTCGAGCACATTGAGCTCTACTT 3572
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 ACATACAGCTGACCGTCTCAAGAATTCTGTATCAAACCTTGAGCACATTGAGCTCTACTT 3590
Query 3573 CCAGGCTTGCCTTAAGTTTCTTCATGGTGCTTTTCTCTTGGAGATGAGTAGCAACGAGAG 3632
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 CCAAGCTTGCCTTAAGTTTCTTCACGGTGCTTTTCTTTTGGAGATGAGTAGCAACGAGAG 3650
Query 3633 TGTTAGACAAGGAGAAACAATGGTCCAATCTATGAAGATTTATAGTAGCACAGCGAATCT 3692
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3651 TGCTAGACAAGGAGAAACAATGGTCCAATCTATGAAGATTTATAGTAGCACTGCGAATCT 3710
Query 3693 TTGCGGATTTTGTGCCCATGAGTATGAGAAGTCTAAAGATATGGGAGCTGCTGCCCTGGC 3752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 TTGCGGATTTTGTGCCCATGAGTATGAGAAGTCTAAAGATATGGGAGCTGCTGCCCTGGC 3770
Query 3753 TTACAAATGCATGGAGGTCGCGTATATGAGAGTGGTTAATTCCTCCTACACCAGTGCTAA 3812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 TTACAAATGCATGGAGGTCGCGTATATGAGAGTGGTTAATTCCTCCTACACCAGTGCTAA 3830
Query 3813 TAGATATCGAAATGAATTGCAGACTTCTCTGCAAATGATTCCGCCAGGTGAATCTCCTTC 3872
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3831 TAGATATCGAAATGAATTGCAGACTTCTCTACAAATGGTTCCGCCAGGTGAATCTCCTTC 3890
Query 3873 TTCATCTGCCTCGGATGTTGATAACGTGAACCATCCAGCAGCAGTAGACAGAGTTGGTAC 3932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 TTCATCTGCCTCGGATGTTGATAACGTGAACCATCCAGCAGCAGTAGACAGAGTTGGTAC 3950
Query 3933 CTCAAGGGGCATCAGTTCTCCTTTAGTTGCTGGGAACCACG 3973
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3951 CTCAAGGGGCATCAGTTCTCCTTTAGTTGCTGGGAACCACG 3991
Score = 263 bits (142), Expect = 1e-68
Identities = 150/154 (97%), Gaps = 0/154 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3973 GACGTAAATCTGTCAATGGATGCCTCGAGGAAATCACGTGTGGCATTAGCAGCTTGTATT 4032
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4045 GACGTAAATCTGTCAATGGATGCCTCGAGGAAATCACGTGTGGCATTAACAGCTTGTATT 4104
Query 4033 GAAAACTTGGGGGAGGCCCAACAACAAGGAGAGGGTATTATATCTATTAAAAGCGCCCTT 4092
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4105 GAAAACTCAGGGGAGGCCCAACAACAAGGAGAGGGTATAATATCTATTAAAAGCGCCCTT 4164
Query 4093 GATTATAACTTCCAAGACATGGAGGGATTGCTAC 4126
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4165 GATTATAACTTCCAAGACATGGAGGGATTGCTAC 4198
Score = 182 bits (98), Expect = 3e-44
Identities = 103/105 (98%), Gaps = 1/105 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAGGAGTCTGAACTTGAAGAAGGAGAGGCTTGCTCTTACAATATTACTAACGAATAC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGAGTCTGAACTTGAAGAAGGAGAGGCTTGCTCTTACAATATTACTAACGAATAC 60
Query 61 TCTGGAAGCATAGACCCTGATAACGATCTCTCTTACATTGATGAG 105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 61 GCTGGAAGCATAGACCCTGATAACGATCTCTCTTACATTG-TGAG 104
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 207540643191
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5