BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486846
Length=3526
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G63380.1 | Symbols: | ATPase E1-E2 type family protein / ha... 5605 0.0
> AT3G63380.1 | Symbols: | ATPase E1-E2 type family protein /
haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein | chr3:23406611-23410360
REVERSE LENGTH=3750
Length=3750
Score = 5605 bits (3035), Expect = 0.0
Identities = 3273/3387 (97%), Gaps = 20/3387 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 CCTTCTAAAAACTCTCTTTCTTTTACACACAAATTAAGCATGAGAGACCTCAAGGAATAT 60
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 111 CCTTCTAAAAACTCTCTTTC-TTT-CACACAAATAAAGCATGAGGGACCTCAAGGAATAT 168
Query 61 GGTTACAGTGCTCTTTTGCTCAACCTTACCACCTCCAGCCTCAACAAGGCCCAGAGGCGT 120
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 169 GATTACAGTGCACTTTTGCTCAACCTTACCACCTCCAGCCTCAACAAGGCCCAGAGGCGT 228
Query 121 TGGCGTTTTGCCTACGCTGCCATCTACTCTGTGAGGGCTATGCTCTCTCTCGTTAAGGAG 180
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 229 TGGCGTTTTGCCTACGCTGCCATCTACTCTATGAGGGCTATGCTCTCTCTTGTTAAGGAG 288
Query 181 ATTGTTCCCGCAAGGATTGATCCCAAAACCTCAGATGCCCctctctctctctcCTACACA 240
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 289 ATAGTTCCCGCAAGGATTGATCCCAAAACCTCAGATGCCTCTCTCTCTCTCTCCTACACA 348
Query 241 GCCCTCGAGTCCGGTGATGGAGCAAAGATCAACTCTATGCCTCTCTCTTACGTTCCTGAC 300
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 349 GCCCTCGAGTCCGGTGAGGGAGCAAAGATCAACTCTATGCCTCTCTCTTACGTTCCTGCC 408
Query 301 ATCGATCAAGAGCAACTTGTGGAGATCATGAAGGGTAAGGACTTGCCGCGCATCCTAGCG 360
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 409 ATTGATCAAGAACAACTTGTGGAGATCATGAAGGGTAAGGACTTACCGGGCATCCAAGCG 468
Query 361 CTGGGCGGCCTGGAGGGTGTGGCCGCTTCCCTAAGGACAAACGCCACCAAAGGGATCCAT 420
||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 469 CTGGGCGGCGTGGAGGGTGTCGCCGCTTCCCTTAGGACTAACCCCACCAAAGGGATCCAC 528
Query 421 GGGAATGAGCAAGAAGTCAGTAGACGCCGTGACCTCTTTGGCTCTAACACCTACCATAAG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529 GGGAATGAGCAAGAAGTCAGTAGACGCCGTGACCTCTTTGGCTCTAACACCTACCATAAG 588
Query 481 CCACCGCCTAAAGGACTTCTCTTCTTTGTGTATGAAGCTTTCAAAGATCC-AACCATCTT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 589 CCACCGCCTAAAGGACTTCTCTTCTTTGTGTATGAAGCTTTCAAAGA-CCTAACCATCTT 647
Query 540 GATCTTGTTGGTCTGCGCCACTTTCGCCCTTGGCTTCGGTATCAAAGAAAATGGCATCAA 599
|||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 648 GATCTTGTTGGTCTGCGCTATTTTCTCCCTTGGCTTCGGTATCAAAGAACATGGCATCAA 707
Query 600 AGAAGGTTGGTATGAAGGCGGAAGCATCTTCGTAGCAGTCTTCTTGGTTATAGTTGTCTC 659
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 708 AGAAGGTTGGTATGAAGGCGGAAGCATCTTTGTAGCAGTCTTCTTGGTCATAGTTGTCTC 767
Query 660 TGCTCTCAGCAACTTCAGGCAGGAGAGACAGTTCGACAAGCTGTCCAAGATAAGCAATAA 719
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TGCTCTCAGCAACTTTAGGCAGGAGAGACAGTTCGACAAGCTGTCCAAGATAAGCAATAA 827
Query 720 TATCAAAGTGGAAGTCCTTAGGGACAGCAGGCGGCAACATATCTCCATCTTTGACGTTGT 779
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 CATCAAAGTGGAAGTCCTTCGGGACAGCAGGCGGCAACATATCTCCATCTTTGACGTTGT 887
Query 780 TGTTGGTGATGTTGTCTTCTTGAAGATCGGAGATCAGATTCCTGCTGATGGTCTGTTCTT 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 888 TGTTGGTGATGTTGTCTTCTTGAAGATCGGAGATCAGATTCCCGCTGATGGTCTGTTCTT 947
Query 840 GGATGGGCATTCACTTCAGGTGGACGAGTCTAGTATGACAGGAGAGAGTGACCATCTTGA 899
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 GGAAGGGCATTCACTTCAGGTGGACGAGTCTAGTATGACAGGAGAGAGTGACCATCTTGA 1007
Query 900 AGTGAATCACAAGGATAATCCCTTCTTGTTCTCTGGGACAAAGATAGTCGACGGGTTTGC 959
|||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1008 AGTGGACCACAAGGATAATCCCTTCTTGTTCTCAGGGACAAAGATAGTCGATGGGTTTGC 1067
Query 960 TCAGATGCTGGTTGTCTCTGTGGGTATGAGCACAACCTGGGGACAGACGATGAGCTCCAT 1019
||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 TCAAATGCTCGTTGTCTCTGTGGGTATGAGTACAACCTGGGGACAGACGATGAGCTCCAT 1127
Query 1020 AAACCAAGATTCCAGCGAGAGAACACCTTTGCAGGTCCGTCTTGACACGCTGACCTCTAC 1079
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1128 AAATCAAGATTCCAGCGAGAGAACACCTTTGCAAGTCCGTCTTGACACGCTGACCTCCAC 1187
Query 1080 CATCGGAAAAATTGGTCTTACGGTGGCAGCACTTGTTCTGGTAGTTTTATTAGTCCGTTA 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1188 CATCGGAAAAATTGGTCTTACGGTGGCAGCACTTGTTCTGGTAGTTCTATTAGTCCGTTA 1247
Query 1140 CTTCACTGGAAACACAGAGAAAGAGGGCAAAAGAGAATACAACGGGAGCAAAACACCTGT 1199
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248 CTTCACTGGGAACACAGAGAAAGAGGGCAAAAGAGAATACAACGGGAGCAAAACACCTGT 1307
Query 1200 GGACACTGTGGTCAATTCCGTTGTGCGAATCGTGGCAGCTGCTGTAACCATTGTCGTAGT 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1308 GGACACTGTGGTCAATTCCGTTGTGCGAATCGTGGCAGCTGCAGTAACCATTGTCGTAGT 1367
Query 1260 AGCTATCCCAGAAGGCTTGCCATTGGCCGTGACTCTGACGCTGGCTTACTCCATGAAAAG 1319
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1368 AGCTATCCCAGAAGGCTTGCCATTGGCTGTGACTCTGACGCTGGCTTACTCCATGAAGAG 1427
Query 1320 AATGATGTCTGATCAAGCTATGGTCAGAAAGCTCTCGGCTTGCGAGACGATGGGCTCGGC 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1428 AATGATGTCTGATCAAGCTATGGTCAGAAAGCTCTCGGCATGCGAGACGATGGGCTCAGC 1487
Query 1380 GACAGTGATATGCACAGACAAAACAGGTACTTTAACACTGAACGAGATGAAGGTTACCAA 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GACAGTGATATGCACAGACAAAACAGGTACTTTAACACTGAACGAGATGAAGGTTACCAA 1547
Query 1440 GTTTTGGCTTGGCCAAGAGTCAATCCATGAAGACTCTACCAAAATGATCTCACCTGACGT 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1548 GTTTTGGCTTGGCCAAGAGTCAATCCATGAAGACTCTACCAAAATGATCTCACCAGACGT 1607
Query 1500 TCTTGATCTGCTTTACCAAGGCACCGGTCTGAACACAACGGGAAGTGTCTGTGTATCAGA 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1608 TCTTGATCTGCTTTACCAAGGCACCGGTCTGAACACAACGGGAAGTGTCTGTGTGTCAGA 1667
Query 1560 CTCAGGATCAACGCCTGAGTTCTCGGGCAGTCCAACAGAGAAGGCCCTCTTGTCTTGGAC 1619
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1668 CTCAGGATCAACGCCTGAGTTCTCAGGCAGTCCAACAGAGAAGGCCCTCTTGTCTTGGAC 1727
Query 1620 TGTGCTAAATCTGGGTATGGATATGGAGTCAGTAAAGCAGAAACATGAAGTTCTCCGTGT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1728 TGTGCTAAATCTGGGTATGGATATGGAGTCAGTAAAGCAGAAACATGAAGTTCTCCGCGT 1787
Query 1680 TGAAACTTTCAATTCAGCGAAGAAACGAAGCGGAGTTTTGGTCCGAAGAAAATCTGACAA 1739
||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1788 TGAAACTTTCAGTTCAGCAAAGAAAAGAAGCGGAGTTTTGGTCCGAAGAAAATCTGACAA 1847
Query 1740 TACAGTCCATGTACACTGGAAAGGAGCCGCTGAAATGGTCCTAGCTATGTGTTCTCACTA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TACAGTCCATGTACACTGGAAAGGAGCCGCTGAAATGGTCCTAGCTATGTGTTCTCACTA 1907
Query 1800 CTACACAAGCACTGGGTCAGTTGACTTAATGGACTCCACCGGAAAGAACAGAATTCAGGC 1859
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1908 CTACACAAGCACTGGGTCTGTTGACTTAATGGACTCCACCGCAAAGAGCAGAATTCAGGC 1967
Query 1860 AATAATCCAAGGTATGGCGGCCAGTAGCCTCAGATGCATAGCATTCGCTCATAAAGTAGC 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1968 AATAATCCAAGGTATGGCGGCCAGTAGCCTCAGATGCATAGCATTCGCTCATAAAATAGC 2027
Query 1920 GTCAAATGACTCGGTATTAGAGGAAGATGGCTTGACCTTGATGGGAATAGTGGGTCTGAA 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 GTCAAATGACTCGGTATTAGAGGAAGATGGCTTGACCTTGATGGGAATAGTGGGTCTGAA 2087
Query 1980 AGATCCTTGTCGACCTGGTGTTTCAAAAGCGGTAGTAACTTGCAAACTTGCAGGAGTCAC 2039
||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088 AGATCCTTGTCGACCTGGTGTCTCAAAAGCTGTGGAAACTTGCAAACTTGCAGGAGTCAC 2147
Query 2040 CATTAAGATGATAACAGGAGATAATGTTTTCACTGCAAAAGCTATCGCTTTTGAATGCGG 2099
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2148 CATTAAGATGATAACGGGAGATAATGTTTTCACTGCAAAAGCTATCGCTTTTGAATGCGG 2207
Query 2100 AATCCTCGACCACAACGACAAAGATGAAGAAGATGCTGTTGTAGAAGGTGTTCAATTCAG 2159
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 AATCCTCGACCACAATGACAAAGATGAAGAAGATGCTGTTGTAGAAGGTGTTCAATTCAG 2267
Query 2160 AAATTATACCGACGAAGAGAGAATGCAGAAAGTTGATAAGATCAGGGTCATGGCAAGGTC 2219
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2268 AAATTATACGGACGAAGAGAGAATGCAGAAAGTTGATAAGATCCGGGTCATGGCAAGGTC 2327
Query 2220 CTCTCCCTCCGACAAGCTTCTAATGGTAAAGTGTCTGAGACTTAAAGGCCACGTGGTAGC 2279
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2328 CTCTCCCTCCGACAAGCTTCTAATGGTCAAGTGTCTGAGACTTAAAGGCCATGTGGTAGC 2387
Query 2280 CGTCACAGGGGATGGCACCAACGATGCACCTGCACTAAAAGAAGCAGATATTGGACTTTC 2339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2388 CGTCACAGGGGATGGCACCAACGATGCACCTGCACTAAAAGAAGCAGATATTGGACTCTC 2447
Query 2340 TATGGGAATTCAGGGCACTGAAGTGGCAAAAGAAAGCTCAGACATTGTAATTCTAGATGA 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2448 TATGGGAATTCAGGGCACTGAAGTGGCAAAAGAAAGCTCAGACATTGTAATTCTAGATGA 2507
Query 2400 TAACTTTGCATCCGTTGCCACAGTCTTAAAATGGGGAAGGTGTGTCTACAACAATATCCA 2459
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2508 TAACTTCGCATCCGTTGCCACAGTCTTAAAATGGGGAAGGTGTGTCTACAACAATATCCA 2567
Query 2460 GAAATTCATTCAGTTTCAGCTAACAGTGAACGTAGCAGCTCTTGTGATCAATTTTATCGC 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2568 GAAATTCATTCAGTTTCAGCTAACAGTGAACGTTGCAGCTCTTGTGATCAATTTTATCGC 2627
Query 2520 AGCAATTTCAGCCGGTGAGGTCCCTTTGACAGCAGTTCAACTGCTGTGGGTAAACCTCAT 2579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628 AGCAATTTCAGCCGGTGAGGTCCCTTTGACAGCAGTTCAACTGCTGTGGGTAAACCTCAT 2687
Query 2580 CATGGACACATTGGGAGCTCTGGCTCTCGCCACAGAGCGACCCACCAACGAGCTCCTGAA 2639
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2688 CATGGACACATTGGGAGCTCTGGCTCTCGCCACGGAGCGACCCACTAACGAGCTCCTGAA 2747
Query 2640 GAGAAAGCCAGTTGGCCGAACAGAGGCCCTGATAACAAATGTCATGTGGAGGAATCTCCT 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2748 GAGAAAGCCAGTTGGCCGAACAGAGGCCCTGATAACAAATGTCATGTGGAGGAATCTCCT 2807
Query 2700 GGTTCAGTCATTATATCAAATAGCCGTACTCTTGATCTTACAATTCAAGGGTATGTCAAT 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 GGTTCAGTCATTATATCAAATAGCCGTACTCTTGATCTTACAATTCAAGGGTATGTCAAT 2867
Query 2760 ATTCAATGTGCGCAAGGAAGTGAAGGACACACTCATATTCAACACTTTCGTGCTCTGCCA 2819
||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2868 ATTCAGTGTTCGCAAGGAAGTGAAGGACACGCTCATATTCAACACTTTCGTGCTCTGTCA 2927
Query 2820 AGTTTTTAACGAATTCAATGCTAGGGAGATGGAGAAGAAAAATGTGTTCAAAGGCCTTCA 2879
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928 AGTTTTTAACGAATTCAATGCGAGGGAGATGGAGAAGAAAAATGTGTTCAAAGGCCTTCA 2987
Query 2880 CAGAAACAGGTTGTTCATTGGAATCATAGCGATAACTATCGTGCTTCAAGTCATTATGGT 2939
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2988 CAGAAACAGGTTGTTCATTGGAATAATAGCGATAACTATTGTGCTTCAAGTCATTATGGT 3047
Query 2940 GGAATTCCTAAAGAAGTTTGCGGATACAGTAAGGCTTAACGGGTGGCAATGGGGAACTTG 2999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3048 GGAATTCCTAAAGAAGTTTGCGGATACAGTAAGGCTTAACGGGTGGCAATGGGGAACTTG 3107
Query 3000 CATAGCAATTGCATCCCTTTCATGGCCGATCGGCTTTTTCACAAAATTCATACCTGTTTC 3059
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 CATAGCACTTGCATCCCTTTCATGGCCGATCGGCTTTTTCACAAAATTCATACCTGTTTC 3167
Query 3060 TGAGACACCGTTCCTCAGTTACTTTAAGAATCCAAGATCCTTAATTAAGGGTTCAAGAAG 3119
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3168 TGAGACACCATTCCTCAGTTACTTTAAGAATCCAAGATCCTTATTTAAGGGTTCAAGAAG 3227
Query 3120 CCCATCTCTCAAGAAACCTTAAGAAGCCAACCATAGCAGATGCAGTTCTCTACGGATGGC 3179
|||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 CCCATCTCTCAAGAAACCTTGAGAAGCCTACCATAGCAGATGCAGTTCTCTACGGATGGC 3287
Query 3180 TTGATAATTGATGATCAGGAGCACAGAGTGGGACTCGTCTGATAAGATAACTTTACAGCT 3239
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3288 TGGATAATTGATGATCAGGAGCACAGAGTGGGACTCGTCTGATAAGATAACTTC-CAGCT 3346
Query 3240 CCCTTGAACGATCAAAAGATTCAAATCTTAAACCTTGATGGTTCCCCACCAA----T-CT 3294
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 3347 CCCTTGAACGATCAAAAGGGTCAAATCTGAAACCTTGATGGTTCCCCACCAAGAGATGCT 3406
Query 3295 ---G------ATCAAAAGAGTCGTTGAACACGAGGTTATGGTCACTGGCTTCAAAGTTCT 3345
| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3407 TCTGCTTCTGATCAAAAGAGTCGTGGAACACGAGGTTATGTTCACTGGCTTCAAAGTTCT 3466
Query 3346 TTCAAACTGCTGCAACAAGTTGG-TTT 3371
||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3467 TTCAAACTGCTGCAACAAGTTGGCTTT 3493
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175534133557
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5