BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg486909
Length=3533
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G01630.1 | Symbols: BRCA2B, BRCA2(V), ATBRCA2(V) | BRCA2-lik... 5550 0.0
AT4G00020.2 | Symbols: MEE43, EDA20, BRCA2(IV), BRCA2A | BREAST... 5247 0.0
> AT5G01630.1 | Symbols: BRCA2B, BRCA2(V), ATBRCA2(V) | BRCA2-like
B | chr5:234851-240911 REVERSE LENGTH=3734
Length=3734
Score = 5550 bits (3005), Expect = 0.0
Identities = 3327/3481 (96%), Gaps = 28/3481 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 73 ATGTCGACGTGGCAATTATTTTCCGATTCCAGCGGCGATGGTTTCCGGTGGGAAGTCGCT 132
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGACGTGGCATTTATTTTCCGATTCCAGCGGCGATGGTTTCCGGTGGGAAGTCGCT 60
Query 133 GGCCGGATTCTCCAGTCCGACTCGGATTCTACTCCAACCAAGGCGCTCGAATCCACAGCT 192
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 GGCCGGATTCTTCAGTCCGTCTCGGATTCTACGCCAACCAAGGCGCTCGAATCGACAGCT 120
Query 193 CCTCTACCTTCCATGGCCGATCTCTTGCTCCAAGGATGCTCGAAGCTTATAGAACGGGAG 252
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CCTCTACCTTCCATGGCCGATCTCTTGCTCCAAGGATGCTCGAAGCTTATAGAACGGGAA 180
Query 253 GAAGCGCTGCCTGGGGAAATCCCAATGTTCAGGACTGGTCTGGGGAAGTCTGTACCTCTA 312
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 181 GAATCGATGCCTGGGGAAATCCCAATGTTCAGGACTGGGCTGGGGAAGTCTGTAGTTCTT 240
Query 313 AAAGAATCTTCCATTGCTAAAGCCAAATCCCTTTTAGCAGATTCA-GGTACTTTTTTAGA 371
||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | | ||| || |||
Sbjct 241 AAAGAGTCTTCGATTGCTAAAGCCAAATCCATTTTAGCAGA-GAATGTTGCTTATTCAGA 299
Query 372 TTTGCAGAACACTAATTGCTCAAATCCCCAAATGAGACAAGTGGATTCAGCTGAAACTTT 431
|||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 300 TTTGCAGAACACAAATTGCTCAATTCCCCAAACGAGACAAGTGGATACAGCTGAAACTAT 359
Query 432 GCCTATGTTCAGGACGGCCTTGGGGAAATCTGTCCCTTTGAAAGAGTCTTCAATTGCCAA 491
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCCAATGTTCAGGACGGCCTTGGGGAAAACTGTCCCTTTGAAAGAGTCTTCAATTGCCAA 419
Query 492 AGCTTTGTCTATTCT-GGCAAGTGATAAGATTATTGACTCAGACTACGTTCTTCCCAGGG 550
| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 420 ACCTTTGTCTATTCTAGG-AAGTGATATGATAATTGACTCAGACAACGTTCTTCCCAGGG 478
Query 551 AGAGTGGGTTTGGTGTGCCCAACACG-CTTTTTCAAACAGCTTCTAACAAGAAGGTTAAT 609
|||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 479 AGAGTGGGTTTGGTGTTCCCAACA-GTCTTTTTCAGACAGCTTCCAACAAAAAGGTTAAT 537
Query 610 GTATCTTCTGCCGGTTTAGCAAGAGCCAAGGCATTGCTAGGACTAGAAGAAGATGATTTG 669
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GTATCTTCTGCCGGTTTAGCAAGAGCCAAGGCATTGTTAGGACTAGAAGAAGATGATTTG 597
Query 670 AATGGATTTAACCATGTGAACCAGTCGTCTTCTTCCCTCCAGCAACATGGGTTGTCCGTT 729
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 598 AATGGATTTAACCATGTGAACCAGTCGTCTTCTTCCCTCCAGCAACATGGGTGGTCCGGT 657
Query 730 TTAAAAACTCATGAGGAGTTTGACGCTACAGTGGTTAAGCATCATTCAGGAACTCCAGGA 789
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 TTAAAAACTCATGAGGAGTTTGATGCTACAGTGGTTAAGCATCATTCAGGAACTCCAGGA 717
Query 790 CAATATGAGGATTATGTATCTGGGAAGAGACCTGAAATCTTAAATCCATCTTTAAAGGTG 849
||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 718 CAATATGAGAATTATGTATCTGGGAAGAGATCTGAAATCTTAAATCCATCGTTAAAGGTG 777
Query 850 CCTCCAACAAAGTTTCAGACTGCTGGTGGAAAATCATTGTCAGTGTCTGCTGAGGCGTTG 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 778 CCTCCAACAAAGTTTCAGACTGCTGGTGGAAAATCATTGTCAGTGTCAGCTGAGGCGTTG 837
Query 910 AAACGTGCCAGAAACCTTCTTGGTGACCCTGAGTTAGGGTCTTTCTTTGATGATGTGGCT 969
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 838 AAACGTGCCAGAAACCTTCTTGGTGACCCTGAGTTAGGGTCTTTCTTTGATGATGTAGCT 897
Query 970 GGAGGTGATCAATTTGTTACACCACAGAAAGATGAAAGGTTAGGTGATATTGCTATAAAC 1029
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 898 GGAGGTGATCAATTTTTTACACCACAGAAAGATGAAAGGCTAAGTGATATTGCTATAAAC 957
Query 1030 AATGGAAGTGCCAACACAGGTTATATTGCTCATGAAGAAAAGTCAAGCAACAAACATACG 1089
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 958 AATGGAAGTGTCAACACAGGTTATATTGCTCATGAAGAAAAGACAAGCAACAAACATACG 1017
Query 1090 TCAAATAGTTTTGTATCTCCTCTTCGGTCATCTTCAAAGCAATTTAGATCAGTCAACTTG 1149
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1018 TCAAATAGTTTTGTATCTCCTCTTCATTCATCTTCAAAGCAATTTAGATCAGTTAACTTG 1077
Query 1150 GAGAACCTAGCTTCAGGGGGTAATTTGATCAAGAAATTTGATGCAGCTGTTGATGAGA-C 1208
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
Sbjct 1078 GAGAACCTAGCTTCAGGGGGTAATTTGATCAAGAAATTTGATACGGCTGTTGATGAGACC 1137
Query 1209 AGACTGTGCTC------T--G--AA--TGCTACACATGGACTATCAAATAACAAGCCTAT 1256
| | ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1138 A-ATTGTGCTCTGAATATCAGTAAACCTGCTACACATGGACTATCAAATAACAGGCCTTT 1196
Query 1257 AGCATCTA-ATATGGCAGTGACTAATTCCAAGGAAAACGGTTTCATTCCAAGAGGTAGGC 1315
|||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1197 AGCATC-AGATATGGCAGTGAATAATTCCAAGGGAAACGGTTTCATTCCAAGAGCTAGGC 1255
Query 1316 AATTTGGAAGGCCAGCTGACCAGCCGCTTGTCGATATAACAAATCGCAGTGATACAGCTT 1375
|| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1256 AACTTGGAAGGCCTGCTGATCAGCCACTTGTTGATATAACAAATCGCAGAGATACAGCTT 1315
Query 1376 ATGCAAACATTAAACAAGATAGTACCCAAAAGAAAAGGCTGGGAAAGACAGTCTCCGTTT 1435
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ATGCAAACAATAAACAAGACAGTACCCAAAAGAAAAGGCTGGGAAAGACAGTCTCCGTTT 1375
Query 1436 CTCCTTTCAAAAGGCCAAGGATTTCATCCTTTAAAACTCCTTTAAAGAAAAATGCTCAGC 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CTCCTTTCAAAAGGCCAAGGATTTCATCCTTTAAAACTCCTTTAAAGAAAAATGCTCAGC 1435
Query 1496 AAGCTTCAAGTGGTTTGTCTGTCGTATCGTGTGATACACTTACTTCCGAAAAGGTGCTTT 1555
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 1436 AAGCTTCAAGTGGTTTGTCTGTTGTATCGTGTGATACACTTACTTCCAAAAAGGTACTTT 1495
Query 1556 CTACAAGATACCCAGAAAAGTCTCCAAGAGTATATATCAAGG-GtttttttGGAATGCAT 1614
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1496 CTACAAGATATCCAGAAAAGTCTCCAAGAGTATATATCAAGGAG-TTTTTTGGAATGCAT 1554
Query 1615 CCAACAGCTACGACCAAGATGGATAATGTGCCAGACCATGTCAGAAGAATCAAATCAAGT 1674
|| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCGACAGCTACGACCAGGATGGATTATGTGCCAGACCATGTCAGAAGAATCAAATCAAGT 1614
Query 1675 AATGCAGATAAATATGTATTCTGTGATGAGTCTTCTTCAAACAAGGTTGGAGCTGAAACT 1734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 AATGCAGATAAATATGTATTCTGTGATGAGTCTTCTTCAAACAAGGTTGGAGCTGAAACT 1674
Query 1735 TTTCTTCTAATGTTGGCTGAGTCTGGTGCTTCCTTACAACATGCATCCAGAAAGTGGGTC 1794
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 TTTCTTCAAATGTTGGCTGAGTCGGGTGCTTCCTTACAACATGCATCCAGAAAGTGGGTT 1734
Query 1795 ACTAATCACTACAGGTGGATAGTCTGGAAACTTGCATGCTATGACATATACTACCCAGCC 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1735 ACTAATCACTACAGGTGGATAGTCTGGAAACTTGCATGCTACGACATATACTACCCAGCC 1794
Query 1855 AAATGCAGAGGAAACTTTCTGACAATCACCAATGTTCTTGAGGAACTAAAATACAGATAT 1914
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 AAATGCAGAGGAAACTTTCTAACAATCACCAATGTTCTTGAGGAACTAAAATACAGATAT 1854
Query 1915 GAGAGAGAGGTCAATCATGGTCATTGCTCTGCAATCAAGAGGATTCTGAGTGGTGATGCT 1974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GAGAGAGAGGTCAATCATGGTCATTGCTCTGCAATCAAGAGGATTCTGAGTGGTGATGCT 1914
Query 1975 CCAGCTTCTTCAATGATGGTGCTCTGCATATCAGCTATTAATCCAAAGACCGATAATGAT 2034
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1915 CCAGCTTCTTCAATGATGGTCCTCTGCATATCAGCTATTAATCCAAGGACCGATAATGGT 1974
Query 2035 TCTCAGGAAGCACATTGTTCTGATATTTGCAGCAATGTGAAAGTAGAACTCACTGATGGG 2094
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1975 TCTCAGGAAGCACATTGTTCTGATAATTGCAGCAATGTGAAAGTCGAACTCACTGATGGG 2034
Query 2095 TGGTACTCGATGAATGCTGCTCTGGATGTCGTGCTAACAAAGCAGCTGAATGCTGGCAAA 2154
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 TGGTACTCGATGAATGCTGCTCTGGATGTCGTGCTAACCAAGCAGCTGAATGCTGGCAAA 2094
Query 2155 TTGTTTGTCGGGCAGAAGCTTCGAATCATCGGGGCAGGACTTTCTGGCTGGGCTACCCCA 2214
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 TTGTTTGTGGGGCAGAAGCTTCGAATCCTCGGGGCAGGACTTTCTGGCTGGGCTACCCCA 2154
Query 2215 ACATCACCACTTGAGGCAGTGATTTCAAGTACAATCTGTTTGTTGTTGAATATTAATGGG 2274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 ACATCACCACTTGAGGCAGTGATTTCAAGTACAATCTGTTTGTTGTTGAATATTAATGGG 2214
Query 2275 ACATACAGAGCTCACTGGGCGGACCGACTAGGCTTCTGTAAAGAAACTGGTGTCCCTCTG 2334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2215 ACATACAGAGCTCACTGGGCGGACCGACTAGGCTTCTGTAAAGAAATTGGTGTCCCTCTG 2274
Query 2335 GCTTTCAACTGTATCAAGTGCAATGGGGGTCCAGTGCCTAAAACGCTAGCTGGCATCACA 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 GCTTTCAACTGTATCAAGTGCAATGGGGGTCCAGTGCCTAAAACGCTAGCTGGCATCACA 2334
Query 2395 CGAATATACCCCATCCTATACAAGGAAAGGTTAGGTGAAAAGAAGTCAATAGTTCGATCA 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 CGAATATACCCCATCCTATACAAGGAAAGGTTAGGTGAAAAGAAGTCAATAGTTCGATCA 2394
Query 2455 GAGAGAATGGAAAGTAGAATTATACAGCTGCATAATCAGAGGCGCTCAGCTCTTGTTGAG 2514
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 GAGAGAATAGAAAGTAGAATTATACAGCTGCATAATCAGAGGCGCTCAGCTCTTGTTGAG 2454
Query 2515 GGTATTATGTGTGAGTACCAGAGAGGAATTAATGGTGTTCACAGCCAGAACGACACTGAC 2574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 2455 GGTATTATGTGTGAGTACCAGAGAGGAATTAATGGTGTTCACAGCCAAAACGATACTGAC 2514
Query 2575 AGCGAAGAAGGAGCCAAGGTCTTTAAGCTGTTAGAGACGGCTGCTGAACCTGAACTTCTT 2634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 AGCGAAGAAGGAGCCAAGGTCTTTAAGCTGTTAGAGACGGCTGCTGAACCTGAACTTCTT 2574
Query 2635 ATGGCAGAAATGAGCCCAGAGCAGTTGACATCTTTCACAACATATAAAGCAAAATTTGAG 2694
||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 ATGGCTGAAATGAGCCTAGAGCAGTTGACATCTTTCACTACATATAAAGCAAAATTTGAG 2634
Query 2695 GCAGCCAAGCAAATGCAGATGGAAAAATCAGTGGCAAAAGCTCTGGAAGACGCTGGTTTA 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 GCAGCCAAGCAAATGCAGATGGAAAAATCAGTGGCAAAAGCTCTGGAAGACGCTGGTTTA 2694
Query 2755 GGTGAAAGGAATGTCACCCCATTCATGAGGATTAGGCTTGTTGGCCTGACGAGCTTAAGT 2814
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 GGTGAAAGGAACGTCACCCCATTCATGAGGATTAGGCTTGTTGGCCTGACGAGCTTAAGT 2754
Query 2815 TATGAAGGAGAGCACAATCCAAAAGAAGGCATTGTAACAATCTGGGATCCCACGGAGAGA 2874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 AATGAAGGAGAGCACAATCCAAAAGAAGGCATTGTAACAATCTGGGATCCCACGGAGAGA 2814
Query 2875 CAGAGAACCGAGCTGACAGAGGGAAAAATATACATAATGAAAGGGCTAGTACCAATGAAC 2934
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 CAGAGAACCGAGCTGACGGAGGGGAAAATATACATAATGAAAGGGCTAGTACCAATGAAC 2874
Query 2935 TCAGATTCAGAAACACTTTACTTACATGCCAGAGGGTCTAGCTCAAAATGGCAGCCTTTG 2994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct 2875 TCAGATTCAGAAACACTTTACTTACATGCCAGAGGGTCAAGCTCAAGATGGCAGCCTTTG 2934
Query 2995 TCTC-AGAAAGATTCTGAAAATTTTCAGCCCTTTTTCAACCCTCGTAAACCAATCTCTTT 3053
|||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 TCTCCA-AAAGATTCTGAAAATTTTCAGCCTTTTTTCAACCCTCGTAAACCAATCTCTTT 2993
Query 3054 GTCAAATCTTGGTGAAATTCCTTTTTCAAGTGAATTTGATATCGCTGCATACGTTGTATA 3113
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2994 GTCAAATCTTGGTGAAATTCCTCTGTCAAGTGAATTTGATATCGCTGCGTACGTTGTATA 3053
Query 3114 TGTTGGAAATGCATACACGGATGTTCAACAAAAGAAGCAGTGGGTGTTTGTGACAGATGG 3173
||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3054 TGTTGGAGATGCATACACAGATGTTCTACAAAAGAAGCAGTGGGTGTTTGTGACAGATGG 3113
Query 3174 ATCCACTCAACATTCAGGGGAAATCTCAAACAGTCTTCTTGCTATAAGCTTCAGCACCCC 3233
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3114 ATCCACACAACATTCAGGGGAAATCTCAAACAGTCTTCTTGCTATAAGCTTCAGCACCCC 3173
Query 3234 ATCCATGGAAGATAGCTCTATTTCCCACATTAGCCATAATTTGGTTGGATCCGTGGTCGG 3293
|| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174 ATTCATGGATGATAGCTCTGTTTCCCACATCAGCCATAATTTGGTTGGATCCGTGGTCGG 3233
Query 3294 ATTCTGCAATCTAATTAAAAGAGCAAAGGATGCGAAAAACAAAATGTGGGTTGGTGAGGC 3353
||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |
Sbjct 3234 ATTTTGCAATCTAATTAAAAGAGCAAAGGATGCGACAAACGAAATGTGGGTTGCTGAGAC 3293
Query 3354 AACAGAGAACTCAGTCTACTTCATAAACGCAGAAGCTGCCTACTCTTCTCACCTCAAAAC 3413
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3294 AACAGAGAACTCAGTCTACTTCATAAACGCAGAAGCTGCCTACTCTTCTCACCTTAAAAC 3353
Query 3414 CAGCAGTGCCCATATCCAAGCCTGGGCTAAGCTCTCTTCTTCCAACA-CCGTCATCCATG 3472
| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 3354 CCGCAGTGCCCATATCCAAACATGGGCTAAGCTCTATTCTTCCAA-ATCCGTCATCCATG 3412
Query 3473 AACTTCGGCAAACAGTCCTATCTATAATCGGTGCTTGTAAATCACCTTCATGCTGAAGAT 3532
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3413 AACTTCGGCAAAGAGTCCTATTTATAATCGGTGCTTGTAAATCACCTTCATGCTGAAGAT 3472
Query 3533 A 3533
|
Sbjct 3473 A 3473
> AT4G00020.2 | Symbols: MEE43, EDA20, BRCA2(IV), BRCA2A | BREAST
CANCER 2 like 2A | chr4:2895-10364 REVERSE LENGTH=3564
Length=3564
Score = 5247 bits (2841), Expect = 0.0
Identities = 3215/3394 (95%), Gaps = 31/3394 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 73 ATGTCGACGTGGCAATTATTTTCCGATTCCAGCGGCGATGGTTTCCGGTGGGAAGTCGCT 132
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGACGTGGCAATTATTTCCCGATTCCAGCGGCGATGGTTTCCGGTGGGAAGTCGCT 60
Query 133 GGCCGGATTCTCCAGTCCGACTCGGATTCTACTCCAACCAAGGCGCTCGAATCCACAGCT 192
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 61 GGCCGGATTCTTCAGTCCGTCTCGGATTCTACGCCAACCAAGGCGCTCGAATCGACAGCT 120
Query 193 CCTCTACCTTCCATGGCCGATCTCTTGCTCCAAGGATGCTCGAAGCTTATAGAACGGGAG 252
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 CCTCTACCTTCTATGGCCGATCTCTTGCTCCAAGGATGCTCGAAGCTTATAGCACGGGAA 180
Query 253 GAAGCGCTGCCTGGGGAAATCCCAATGTTCAGGACTGGTCTGGGGAAGTCTGTACCTCTA 312
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||
Sbjct 181 GAAGCGATGCCTGGGGAAATCCCAATGTTCAGGACTGGGCTAGGGAAGTCTGTAGTTCTT 240
Query 313 AAAGAATCTTCCATTGCTAAAGCCAAATCCCTTTTAGCAGATTCAGG-TACTTTTTTAGA 371
||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||
Sbjct 241 AAAGAGTCTTCGATTGCTAAAGCCAAATCCATTTTAGCAGA-GAAGGTTACTTACTCAGA 299
Query 372 TTTGCAGAACACTAATTGCTCAAATCCCCAAATGAGACAAGTGGATTCAGCTGAAACTTT 431
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 300 TTTGCGGAACACAAATTGCTCAATTCCCCAAATGAGACAAGTGGATACAGCTGAAACTTT 359
Query 432 GCCTATGTTCAGGACGGCCTTGGGGAAATCTGTCCCTTTGAAAGAGTCTTCAATTGCCAA 491
||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 GCCAATGTTCAGGACGGCCTCGGGGAAATCTGTCCCTTTGAAAGAGTCTTCAATTGCCAA 419
Query 492 AGCTTTGTCTATTCT-GGCAAGTGATAAGATTATTGACTCAGACTACGTTCTTCCCAGGG 550
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 420 AGCTATGTCTATTCTAGG-AAGTGATAAGATTATTGACTCAGACAACGTTCTTCCCAGGG 478
Query 551 AGAGTGGGTTTGGTGTGCCCAACACG-CTTTTTCAAACAGCTTCTAACAAGAAGGTTAAT 609
||||||| ||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 479 AGAGTGGATTTGGAGTTTCCAACA-GTCTTTTTCAGACAGCTTCCAACAAAAAGGTTAAT 537
Query 610 GTATCTTCTGCCGGTTTAGCAAGAGCCAAGGCATTGCTAGGACTAGAAGAAGATGATTTG 669
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 GTATCTTCTGCCGGTTTAGCAAGGGCCAAGGCATTGTTAGGACTAGAAGAAGATGATTTG 597
Query 670 AATGGATTTAACCATGTGAACCAGTCGTCTTCTTCCCT-CCAGCAACATGGGTTGTCCGT 728
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 598 AATGGATTTAACCATGTGAACCAGTCGTCTTCTT-CCTCCCAGCAACATGGGTGGTCCGG 656
Query 729 TTTAAAAACTCATGAGGAGTTTGACGCTACAGTGGTTAAGCATCATTCAGGAACTCCAGG 788
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 ATTAAAAACTCATGAGGAGTTTGATGCTACAGTAGTTAAGCATCATTCAGGAACTCCAGG 716
Query 789 ACAATATGAGGATTATGTATCTGGGAAGAGACCTGAAATCTTAAATCCATCTTTAAAGGT 848
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 ACAATATGAGGATTATGTATCTGGGAAGAGATCTGAAGTCTTAAATCCATCTTTAAAGGT 776
Query 849 GCCTCCAACAAAGTTTCAGACTGCTGGTGGAAAATCATTGTCAGTGTCTGCTGAGGCGTT 908
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 777 GCCTCCAACAAAGTTTCAGACTGCTGGTGGAAAATCATTGTCAGTGTCAGCTGAGGCGTT 836
Query 909 GAAACGTGCCAGAAACCTTCTTGGTGACCCTGAGTTAGGGTCTTTCTTTGATGATGTGGC 968
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 837 AAAACGTGCCAGAAACCTTCTTGGTGACCCTGAATTAGGGTCTTTCTTTGATGATGTAGC 896
Query 969 TGGAGGTGATCAATTTGTTACACCACAGAAAGATGAAAGGTTAGGTGATATTGCTATAAA 1028
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 897 TGGAGGTGATCAATTTTTTACACCAGAGAAAGATGAAAGGTTAAGTGATATTGCTATAAA 956
Query 1029 CAATGGAAGTGCCAACACAGGTTATATTGCTCATGAAGAAAAGTCAAGCAACAAACATAC 1088
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 957 CAATGGAAGTGCCAACAGAGGTTATATTGCTCATGAAGAAAAGACAAGCAACAAACATAC 1016
Query 1089 GTCAAATAGTTTTGTATCTCCTCTTCGGTCATCTTCAAAGCAATTTAGATCAGTCAACTT 1148
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1017 GCCAAATAGTTTTGTATCTCCTCTTTGGTCATCTTCAAAGCAATTTAGTTCAGTCAACTT 1076
Query 1149 GGAGAACCTAGCTTCAGGGGGTAATTTGATCAAGAAATTTGATGCAGCTGTTGATGAGAC 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1077 GGAGAACCTAGCTTCAGGGGGTAATTTGATCAAGAAATTTGATGCGGCTGTTGATGAGAC 1136
Query 1209 AGACTGTGCTCTGAATGCTACACATGGACTATCAAATAACAAGCCTATAGCATCTA-ATA 1267
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| | |||
Sbjct 1137 CGATTGTGCTCTGAATGCTACACATGGACTATCAAATAACAGGTCTTTGGCATC-AGATA 1195
Query 1268 TGGCAGTGACTAATTCCAAGGAAAACGGTTTCATTCCAAGAGGTAGGCAATTTGGAAGGC 1327
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1196 TGGCAGTGAATAATTCCAAGGTAAACGGTTTCATTCCAAGAGGTAGGCAACCTGGAAGGC 1255
Query 1328 CAGCTGACCAGCCGCTTGTCGATATAACAAATCGCAGTGATACAGCTTATGCAAACATTA 1387
| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 1256 CTGCTGATCAGCCACTTGTTGATATAACAAATCGCAGAGATACAGCTTATGCATACAATA 1315
Query 1388 AACAAGATAGTACCCAAAAGAAAAGGCTGGGAAAGACAGTCTCCGTTTCTCCTTTCAAAA 1447
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 AACAAGACAGTACCCAAAAGAAAAGGCTGGGAAAGACAGTCTCCGTTTCTCCTTTCAAAA 1375
Query 1448 GGCCAAGGATTTCATCCTTTAAAACTCCTTTAAAGAAAAATGCTCAGCAAGCTTCAAGTG 1507
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1376 GGCCAAGGATTTCATCCTTTAAAACTCCTTCAAAGAAACATGCTCTGCAAGCTTCAAGTG 1435
Query 1508 GTTTGTCTGTCGTATCGTGTGATACACTTACTTCCGAAAAGGTGCTTTCTACAAGATACC 1567
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1436 GTTTGTCTGTTGTATCGTGTGATACACTTACTTCCAAAAAGGTGCTTTCTACAAGGTATC 1495
Query 1568 CAGAAAAGTCTCCAAGAGTATATATCAAGGGtttttttGGAATGCATCCAACAGCTACGA 1627
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 CAGAAAAGTCTCCAAGAGTATATATCAAGGACTTTTTTGGAATGCATCCAACAGCTACGA 1555
Query 1628 CCAAGATGGATAATGTGCCAGACCATGTCAGAAGAATCAAATCAAGTAATGCAGATAAAT 1687
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 CCAGGATGGATTATGTGCCAGACCATGTCAGAAGAATCAAATCAAGTAATGCAGATAAAT 1615
Query 1688 ATGTATTCTGTGATGAGTCTTCTTCAAACAAGGTTGGAGCTGAAACTTTTCTTCTAATGT 1747
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1616 ATGTATTCTGTGATGAGTCTTCTTCAAACAAGGTTGGAGCTGAAACTTTTCTTCAAATGT 1675
Query 1748 TGGCTGAGTCTGGTGCTTCCTTACAACATGCATCCAGAAAGTGGGTC-ACT-AATCACTA 1805
|||||||||| || | || | | | || || || | || | |
Sbjct 1676 TGGCTGAGTC---TG-------A-AA-AAGTGT-GTGACCGT---TCTTTTGAAGC-TTG 1718
Query 1806 CAGGTGGATAGTCTGGAAACTTGCATGCTATGACATATACTACCCAGCCAAATGCAGAGG 1865
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719 CATGTGGATAGTCTGGAAACTTGCATGCTACGACATATACTACCCAGCCAAATGCAGAGG 1778
Query 1866 AAACTTTCTGACAATCACCAATGTTCTTGAGGAACTAAAATACAGATATGAGAGAGAGGT 1925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1779 AAACTTTCTGACAATCACCAATGTTCTTGAGGAACTAAAATACAGATATGAGAGAGAGGT 1838
Query 1926 CAATCATGGTCATTGCTCTGCAATCAAGAGGATTCTGAGTGGTGATGCTCCAGCTTCTTC 1985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 CAATCATGGTCATTGCTCTGCAATCAAGAGGATTCTGAGTGGTGATGCTCCAGCTTCTTC 1898
Query 1986 AATGATGGTGCTCTGCATATCAGCTATTAATCCAAAGACCGATAATGATTCTCAGGAAGC 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899 AATGATGGTGCTCTGCATATCAGCTATTAATCCAAAGACCGATAATGATTCTCAGGAAGC 1958
Query 2046 ACATTGTTCTGATATTTGCAGCAATGTGAAAGTAGAACTCACTGATGGGTGGTACTCGAT 2105
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1959 ACATTGTTCTGATAGTTGCAGCAATGTGAAAGTAGAACTCACTGATGGGTGGTACTCGAT 2018
Query 2106 GAATGCTGCTCTGGATGTCGTGCTAACAAAGCAGCTGAATGCTGGCAAATTGTTTGTCGG 2165
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2019 GAATGCTGCTCTGGATGTCGTACTAACAAAGCAGCTGAATGCTGGCAAATTGTTTGTCGG 2078
Query 2166 GCAGAAGCTTCGAATCATCGGGGCAGGACTTTCTGGCTGGGCTACCCCAACATCACCACT 2225
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079 GCAGAAGCTTCGAATCCTCGGGGCAGGACTTTCTGGCTGGGCTACCCCAACATCACCACT 2138
Query 2226 TGAGGCAGTGATTTCAAGTACAATCTGTTTGTTGTTGAATATTAATGGGACATACAGAGC 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 TGAGGCAGTGATTTCAAGTACAATCTGTTTGTTGTTGAATATTAATGGGACATACAGAGC 2198
Query 2286 TCACTGGGCGGACCGACTAGGCTTCTGTAAAGAAACTGGTGTCCCTCTGGCTTTCAACTG 2345
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2199 TCACTGGGCGGACCGACTAGGCTTCTGTAAAGAAATTGGTGTCCCTCTGGCTTTAAATTG 2258
Query 2346 TATCAAGTGCAATGGGGGTCCAGTGCCTAAAACGCTAGCTGGCATCACACGAATATACCC 2405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2259 TATCAAGTGCAATGGGGGTCCAGTGCCTAAAACGCTAGCTGGCATCAAACGAATATACCC 2318
Query 2406 CATCCTATACAAGGAAAGGTTAGGTGAAAAGAAGTCAATAGTTCGATCAGAGAGAATGGA 2465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2319 CATCCTATACAAGGAAAGGTTAGGTGAAAAGAAGTCAATAGTTCGATCAGAGAGAATAGA 2378
Query 2466 AAGTAGAATTATACAGCTGCATAATCAGAGGCGCTCAGCTCTTGTTGAGGGTATTATGTG 2525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2379 AAGTAGAATTATACAGCTGCATAATCAGAGGCGCTCAGCTCTTGTTGAGGGTATTATGTG 2438
Query 2526 TGAGTACCAGAGAGGAATTAATGGTGTTCACAGCCAGAACGACACTGACAGCGAAGAAGG 2585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439 TGAGTACCAGAGAGGAATTAATGGTGTTCACAGCCAGAACGACACTGACAGCGAAGAAGG 2498
Query 2586 AGCCAAGGTCTTTAAGCTGTTAGAGACGGCTGCTGAACCTGAACTTCTTATGGCAGAAAT 2645
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2499 AGCCAAGATCTTTAAGCTGTTAGAGACGGCTGCTGAACCTGAATTTCTTATGGCAGAAAT 2558
Query 2646 GAGCCCAGAGCAGTTGACATCTTTCACAACATATAAAGCAAAATTTGAGGCAGCCAAGCA 2705
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2559 GAGCCCAGAGCAGTTGAGATCTTTCACTACATATAAAGCAAAATTTGAGGCAGCCCAGCA 2618
Query 2706 AATGCAGATGGAAAAATCAGTGGCA-AAAGCTCTGGAAGACGCTGGTTTAGGTGAAAGGA 2764
||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2619 AATGCGGAAGGAAAAATCAGTGGCAGAAA-CTCTGGAAGACGCTGGTTTAGGTGAAAGGA 2677
Query 2765 ATGTCACCCCATTCATGAGGATTAGGCTTGTTGGCCTGACGAGCTTAAGTTATGAAGGAG 2824
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2678 ACGTCACCCCGTTCATGAGGATTAGGCTTGTTGGCCTGACGAGCTTAAGTTATGAAGGAG 2737
Query 2825 AGCACAATCCAAAAGAAGGCATTGTAACAATCTGGGATCCCACGGAGAGACAGAGAACCG 2884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 AGCACAATCCAAAAGAAGGCATTGTAACAATCTGGGATCCCACGGAGAGACAGAGAACCG 2797
Query 2885 AGCTGACAGAGGGAAAAATATACATAATGAAAGGGCTAGTACCAATGAACTCAGATTCAG 2944
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2798 AGCTGACAGAGGGGAAAATATACATGATGAAAGGGCTAGTACCAATAAACTCAGATTCAG 2857
Query 2945 AAACACTTTACTTACATGCCAGAGGGTCTAGCTCAAAATGGCAGCCTTTGTCTCAGAAAG 3004
||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2858 AAATACTTTACTTACATGCGAGAGGGTCAAGCTCAAGATGGCAGCCTTTGTCTCCTAAAG 2917
Query 3005 ATTCTGAAAATTTTCAGCCCTTTTTCAACCCTCGTAAACCAATCTCTTTGTCAAATCTTG 3064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2918 ATTCTGAAAATTTTCAGCCCTTTTTCAACCCTCGTAAACCAATCTCTTTGTCAAATCTTG 2977
Query 3065 GTGAAATTCCTTTTTCAAGTGAATTTGATATCGCTGCATACGTTGTATATGTTGGAAATG 3124
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2978 GTGAAATTCCTCTTTCAAGTGAATTTGATATCGCTGCGTACGTTGTATATGTTGGAAATG 3037
Query 3125 CATACACGGATGTTCAACAAAAGAAGCAGTGGGTGTTTGTGACAGATGGATCCACTCAAC 3184
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3038 CATACACGGATGTTCTACAAAAGAAGCAGTGGGTGTTTGTGACAGATGGATCCGCACAAC 3097
Query 3185 ATTCAGGGGAAATCTCAAACAGTCTTCTTGCTATAAGCTTCAGCACCCCATCCATGGAAG 3244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
Sbjct 3098 ATTCAGGGGAAATCTCAAACAGTCTTCTTGCTATAAGCTTCAGCACCTCATTCATGGATG 3157
Query 3245 ATAGCTCTATTTCCCACATTAGCCATAATTTGGTTGGATCCGTGGTCGGATTCTGCAATC 3304
|||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3158 ATAGCTCTGTTTCCCACATCAGCCATAATTTGGTTGGATCCGTGGTCGGATTTTGCAATC 3217
Query 3305 TAATTAAAAGAGCAAAGGATGCGAAAAACAAAATGTGGGTTGGTGAGGCAACAGAGAACT 3364
||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 3218 TAATTAAAAGAGCAAAGGATGTGACAAACGAAATTTGGGTTGCTGAGGCAGCAGAGAACT 3277
Query 3365 CAGTCTACTTCATAAACGCAGAAGCTGCCTACTCTTCTCACCTCAAAACCAGCAGTGCCC 3424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 CAGTCTACTTCATAAACGCAGAAGCTGCCTACTCTTCTCACCTCAAAACCAGCAGTGCCC 3337
Query 3425 ATATCCAAGCCTGGGCTAAGCTCTCTTCTTCCAA 3458
|||||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3338 ATATCCAAACATGGGCTAAGCTCTCTTCTTCCAA 3371
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 175885302158
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5